Block details
fasta C_difficile_CD00084_1A_020911.fasta
contig u00000crpx_c_020911
start 683618
length 7525
strand -
type core
seq tttttatggataaatctttagtaaatgatttataatcctcatcattaaggacataggcgt
tcatacttctattttgaaaaaaagaaccattaaatattatttttccagcatatctaaagg
ggatttctttttctgtgactgggcttgatataaatttggtatatttataatcttgatttt
catttcctttatttacaacagcaagatattcaccattttttatagttattggtttgccaa
ttagcttggaaaaatctttagaattaaagaacatatcataggagctttttttcatatata
ccttttcgatagttccatctttatgatatattgattctacaccatcaacaattaattcta
tagaaggaatttccatatagttttgaatttttatattgtgtttatctgctaattgttcaa
tatctttttttgatacctgtttatctctttgattgtaggtaaaagtataatctatagggt
tatttttaagagtatcatagatacctgtaaccatattaggaacatagaatacagcaaata
atgctcctgcaatcaaaaatgaaataacacacatgttttttactgtttgtcttcccataa
atctcatcatgctagttgatatgatgtttttatagtatttctctggatgttttcctcttt
tagcatgtacaactatgtatgtcataatcatatatattccaataagagagagtagataag
taaagctccatacagatggtagtctataatttaatttgtttatagttagtgaaggtacga
gatatcctagaaaaataccgagtataataaaaattatacctaatataccataccagtcct
ttacatcctgtattggttcagatattctctggtcatttaatatatcaattatatttgtac
gattaataaattttacagaaagtataaatatgcataatgtcacaaatacactaaatataa
atccatatatgaatccttgagttccaaaatgatatgtcatttctctggtatcaataatca
ctaattgaaatattttccatataccaaaagatacaggaatacttaatataagacctaaaa
aacagcatactattgaaattaacaatatctctgaaaatagaagtttttttaatttcttct
tatctgttcctagagccatgaaaataccaatttccttgcttttaaattttaaaaagaggg
aagaagcgtatgtagtaaagacagcgcatcctaatatagcaactgagaatatcattgtag
cctgttttctgctatctccaccagttggaagtatgttttgtattgttgggctaaaataaa
ttagagcatatgaagttactaataccacagaaagtattatacaaaagaataaagttgtat
agttcttccaattataggctcgaagtttactgtataatttattaattgtcatcttgagcg
cctcccatttcttttaaaacttctagtaattcatctaggaatttatgtcttgaatttgat
tttacaacttctttataaattattccatctttaagcacaataactcggtcacagaagctt
gctgcaaagctatcgtgtgtaaccatgagtatagtagcatctaattcttgctttgctttt
aaaaatgattcaatgactgtacgacaagacttactatcaaggttaccagttggttcatct
gctaatattaaatctgggttgttcatgagtgctcttgctactgctgtacgctgtttttct
ccaccagatatttcggcagggtatttttttctgatatgttcaataccaaatagctcacat
agattaattgcacggttttccatttgtaagacttgactacctttgataatttgtggaaca
catatattttcaaagacactaagaccatcaaatagcatgaaatcttggaatacaaatcct
agttgttggtttctaacttctgaaagttccttttcttttaaatttcttatattattattt
ccaagaattatttccccattatcaattgggataaaacatgaaatacaatttaaaagagta
gtttttccacttcctgatgaacccatgattgcgacaaattctcctttgttgatttcaaaa
gaaatattttttaatacaggatatgttttactacctgttttatatgatttacataattgg
tttactttaagcatatatatcatcctcactttcatttatcttgtaagtcaatgatagcat
ttgaaaggggaggagggatatgagctatattgtaatagttggatgtttttttgtaatgtt
tgaaaatatattgtttggatagtgtgagaggttattattatagttaaattgattatatta
ttggaggatttagagggttatttttaggtattaattgttgtggtaaagtaatatgatgtg
gaacattgaaggtgtagttagaaaaaaggtatatagtaaaagtaaaaaggttatagaata
acgaatgttgtattgaaaaaaatgatgtaaataatgtatagtagggttaaaaagaaaaaa
agaattatagagcagtaagattatttaatggaatgtattgtaaataatttgaaaggattt
aggggttattaacacaatgtaattgagaaaatatattggagttttggaaataaataggtt
gttaaaaacaattgaaatttataataaaaaggttgaaaagtattattagtataggtatga
tagataattttagaaagtggaagtattttagactatgctgaaaagtgattgatattattt
tgagatattaaaatattactatattatagtaaagaagttaaaataataaaatgttgtaat
aataaaggtttgtagtataataaagaactgtaataaataagactttgcaatgtaacagaa
atgctgtaataataaaagtctgtagtataataaagaactgtaataaataagagattgtaa
taataaaagtctgtagtgtaataaagaactgtaataaataagactttacaatataataga
aatgttgcaataacaaaacaccataataaataagagtttgcaatataatagaaacactgc
aataaataagagattgtaatataacaaaatcctataataaataagattttacaatataat
aaaaatcctataataaataggactctgtaatataataaaatgctgtaacaacaaaacact
ataataaataagaccctgtaatataataaaaatactataatatagtaaaaatcatgcaat
aataaaaatctataataataaacctcagcataacaaagacattaatttcttactaaaaag
gccaccacaattaacagtgaaaaagcaattgaaagtattgaaaaagtaaaatgagaatta
gagtcattattacgattattaagttttatccataaaccacatataattgtacacaacaat
aaaattgctgatattactcctataaatgtaaaaaacattaaaattcctcccccttattta
atgcaagtatttttagtcaatgagaatattttcaaacgttaccataaaataaaaaaatgt
acataaaaaattaatatagtattattttgtaatatctaccaataataaatctaattgaaa
atctattaaaccatttctctgttcaatattaagaatatcaataccactatacttgaaaaa
agcattagaacgaagaaaaagcaactgaataaatgaagttatttgatacgcaatagttct
gtattcagcttcagtttttttgttattctgattttcatagtgagccttaattaaaggtag
tatctcaaatggataaacaatttcttcctgtatcaatatatagggtacagaaatctttat
aaattgactatgttcacctataaaatcaaaaaatgcaattagtatttcccttaattgctg
tttaggtgctaaatttttagtatcatgtgtagccttatattcatccatatgacgctttaa
aaattttttaatagaaatattaattaactcctctttagatttaaaataataattaatcat
agctaaattgacatttgctttagctacaatttctctagccgtaatgcttgaaacatctct
atgtgaagatagtaactggattgtggcattaattaattgttcctttgttgaatctgattt
cataatttttccccttaaaagtttccccataaaaaaattaaacatgtttaacacacgttt
agatactatcatgaaaattttgggatgtcaatgggtgattagtacttaagtatttaagta
ctaatctattagacttttataagggggatttgaatttctgtaagataattttcaggattt
atttcattatgttcacctttatgtccgatttgtctatttatacctgatatttgataatca
ctatttttatctaaccaataacagaacgattcatatgcaccagctatattttcatatgga
ccataaaccatagtacatgccatcatatcaatttcttctgtctcacgatatataaatcca
gatttgttctttccaatcttctttacaaccattccaacttcaatatctacaccattatct
ttgacttcttcatcatggtaaaaagctatgttattgttggattgacgtgatacttctata
tgttcttctttgataaatttagatagcttttcccagagtataccttcagattggtagtct
ggaattatctctctaagtgatatgattttataacttggaatctttttaaagacaacattg
taatgaatttcatctttatcacagtttatagcttctataaatttatcaattttatttatt
ctttgttgttcctgatttatttccttttgtatttcattcttttttctattcaattcttta
attacaaattcatcattccaattatgtacgatatttgctatttctgcaacgctaaatttt
gaatctctcaataatacaattctttgtagtattgaaatctgttcaactgagtataatcta
tgacctgtatatttgtctatttctgcaggttttaaaataccaagttcatcataataacgc
aacatacgaatagaaatttgtgttagttttgaaacctctcctattttaaacatgaaaata
tgacctccttttcacttataatcagtatatattttgtttttatatacttcaagcgtttgt
ggaaatacaattattttccagatgttgcaataaattatagagagtaaattatatttaagt
agtaatcgtatcaaatcatagattatcttaatttataattcatattaaaattaccagtct
aactcaaattcaaaatcatccgactttatctgttcaatttcagaatttaccttctgttta
aatttattagaagaaatcatatatacaagaaatattaaaccaaatattatttgtacatat
tgagctattacacataatttaatagggtagtgtagaagtaattgaatgttgaaaaaatag
tacatcatatgaactaacccagctgataaaatgcttctacttgtattgatatatacaaaa
ttaattataaagtttaaaagtacaatgtttggtataaataaaaaagcatcaaatagggag
tattgtgccaaattatatggtatttgattaggtgtaaaatacgaccctagataccagatt
ccacaaacaagccctaaaataattgaagagcctataaatccaaatctaactaataatttg
tcaatggcatatcctctccatccagcttcttgactaagtatactcaatataaaacttgct
aatagcatataagctattttagaaggtctaaacactgctatgtgtatccaatctatatca
gaagtttttacattaaagtaatttccgattattaacgaagtaataaaagttaaagcaaaa
aataatattgttaatagtatccattttattctaatttctttaaagcttaggtatctataa
ataaaatcttgttttgcactttgtggatagattgtagaaataaaaaatagacctacaata
gctggtgatgtatatgcaagataaaaaatgatttctccaagtattgtatttgtaattccg
agcaacgcaggtgtaagactgaatatccagttcaatactagcgtaaatgtaaagaaatag
attaagtgtttgtttgtattaaagggggtgttatatagttgcattttttcactatccttc
cgttttataatgaagttttaatttttattaattgtttatttatttttatatgtattaagt
tatcgcttgatgttagttattgcctataataatatcctattttttatattttgattaatt
atttttacactaaatataattaattagtatttaatattgaatatattatattattattaa
ttattaaataggtcaataaatttgcaattagtgatattaataaattactttagattttta
ttaaatgtttagcttttctttaatattttttatataacgacgatttataataactttttc
gttgttttttaaagtagcttgcatgcgattatgtgatattacttttatactttttatgta
gtccatatttaaaatcatggatttagatattcgtgagaaggatgtattagctaataattt
tgataatttatatatttttaaatcaatttcaaatacatcatcttcataataagcaaatgt
tttatttccaactgtctcaaagtataaaatatcacagacattgagtttataaatctctcc
tgattttttaccttttatatcaagtaacggtgtactcaataatgaaattattttttcaat
gttattatctagagcagaacattttatggttatttcaatatcatcacaattaataccttg
ttcgacatgtattttcattaatcatcacctcattttattactgtcattagaatagcatta
tatcttattgagtccaactagatgcgttctaaatttcaaattaagcatagtgaaattcaa
aaataaaacagtgaaattcaaatttgaggtggtaaaattcaaaaaaatactatggatatt
tggataaattatccaaatatcctagtatttcacatagaatatgtctaattattttacaaa
tagacctattttatgacttacatatattgtcaaattacttcttaaatatcaaaatatttt
tggataatgtatcaatactgtttgataaagtatttaatttaccctcaattctaaccaata
agtacatggatagagctataggaaaaccaacattggttattaacagttgtaaactatcat
ccataaaattagccccctattctataactaagtcataaggagtggtatttgtttccacaa
ccttggcttcaacaacagaagctaggtcaaatcctccaaccgaaaaaatatttttagata
ctatcaaatccatgacagattttatattttcttcagttaaatcatcctttggattttcta
tagaaaaagaaacttgtttatcctttacatttttaaagctcatgactaattttttcttaa
tttccatataattacctccgatataa