Block details
fasta C_difficile_CD01322_2A_024609.fasta
contig u00000crpx_c_024609
start 1393160
length 7713
strand +
type core
seq tatatcggaggtaattatatggaaattaagaaaaaattagtcatgagctttaaaaatgta
aaggataaacaagtttctttttctatagaaaatccaaaggatgatttaactgaagaaaat
ataaaatctgtcatggatttgatagtatctaaaaatattttttcggttggaggatttgac
ctagcttctgttgttgaagccaaggttgtggaaacaaataccactccttatgacttagtt
atagaatagggggctaattttatggatgatagtttacaactgttaataaccaatgttggt
tttcctatagctctatccatgtacttgttggttagaattgagggtaaattaaatacttta
tcaaacagtattgatacattatccaaaaatattttgatatttaagaagtaatttgacaat
atatgtaagtcataaaataggtctatttgtaaaataattagacatattctatgctaaata
ctaggatatttggataatttatccaaatatccatagtatttttttgaattttaccacctc
aaatttgaatttcactattttatttttgaatttcactatgcttaatttgaaatttagaac
gcatctagttggactcaataagatataatgctattctaatgacagtaataaaatgaggtg
atgattaatgaaaatacatgtcgaacaaggtattaattgtgatgatattgaaataaccat
aaaatgttctgctctagataataacattgaaaaaataatttcattattgagtacaccatt
acttgatataaaaggtaaaaaatcaggagagatttataaactcaatgtctgtgatatttt
atactttgaaacagttggaaataaaacatttgcttattatgaagatgatgtatttgaaat
tgatttaaaaatatataaattatcaaaattattagctaatacatccttctcacgaatatc
taaatccatgattttaaatatggactacataaaaagtataaaagtaatatcacataatcg
catgcaagctactttaaaaaacaacgaaaaagttattataaatcgtcgttatataaaaaa
tattaaagaaaagctaaacatttaataaaaatctaaagtaatttattaatatcactaatt
gcaaatttattgacctatttaataattaataataatataatatgttcaatattaaatact
aattaattatatttagtgtaaaaataattaatcaaaatataaaaaataggatattattat
aggcaataactaacatcaaacgataacttaatacatataaaaataaataaacaattaata
aaaattaaaacttcattataaaacggaaggatagtgaaaaaatgcaactatataacaccc
cctttaatacaaacaaacacttaatctatttctttacatctacgctagtattgaactgga
tattcagtcttacacctgcgttgctcggaattacaaatacaatacttggagaaatcattt
tttatcttgcatatacatcaccagctattgtaggtctattttttatttctacaatctatc
cacaaagtgcaaaacaagattttatttatagatacctaagctttaaagaaattagaataa
aatggatactattaacaatattattttttgctttaacttttattacttcgttaataatcg
gaaattactttaatgtaaaaacttctgatatagattggatacacatagcagtgtttagac
cttctaaaatagcttatatgctattagcaagttttatattgagtatacttagtcaagaag
ctggatggagaggatacgccattgacaaattattagttagatttggatttataggctctt
caattattttagggcttgtttgtggaatctggtatctagggtcgtattttacacctaatc
aaataccatataatttggcacaatactccctatttgatgcttttttatttataccaaaca
ttgtacttttaaactttataattaattttgtatatatcaatacaagtagaagcattttat
cagctgggttagttcatatgatgtactattttttcaacattcaattacttctacactacc
ctattaaattatgtgtaatagctcaatatgtacaaataatatttggtttaatatttcttg
tatatatgatttcttctaataaatttaaacagaaggtaaattctgaaattgaacagataa
agtcggatgattttgaatttgagttagactggtaattttaatatgaattataaattaaga
taatctatgatttgatacgattactacttaaatataatttactctctataatttattgca
acatctggaaaataattgtatttccacaatcgcttgaagtatataaaaacaaaatatata
ctaattataagtgaaaaggaggtcatattttcatgtttaaaataggagaggtttcaaaac
taacacaaatttctattcgtatgttgcgttattatgatgaacttggtattttaaagcctg
cagaaatagacaaatatacaggtcatagattatactcagttgaacagatttcaatattac
aaagaattgtattattgagagattcaaaatttagcgttgcagaaatagcaaatatcgtac
ataattggaatgatgaatttgtaattaaagaattgaatagaaaaaagaatgaaatacaaa
aggaaataaagcacgaacaacaaagaataaataaaattgataaatttatagaagctataa
actgtgataaagatgaaattcattacaatgttgtctttaaaaagattccaagttataaaa
tcatatcacttagagaggtagtcccagactaccaatctgaaggtatactctgggaaaagt
tatctaaatttattaaagaagaacatatagaagtatcacgtcaacccaacaataatatag
ctttttaccatgatgaagaagtcaaagataatggtgtagatattgaagttggaatggttg
taaagaagattggaaagaacaaatctggatttatatatcgtgagacagaagaaattgata
tgatggcatgtactatggtttatggtccatatgaaaatatagctggtgcatatgaatcgt
tctgttattggttagataaaaatagtgattatcaaatatcaggtataaatagacaaatcg
gtcataagggtgagcataatgaaataaatcctgaaaattatcttacagaaattcaaatcc
cccttataaaagtctaatcgattagtacttaaatacttaagtactaatcacccattgaca
tcccaaaattttcatgatagtatctaaacgtgtattaaacatgtttaatttttttatgga
gaaacttttaaggggaaaaattatgaaagcagattcaacaaaggaacaattaattaatgc
cacaatccagttactatcttcacatagagatgtttcaagcattacggctagagaaattgt
agctaaagcaaatgtcaatttagctatgattaattattattttaaatctaaagaggagtt
aattaatatttctattaaaaaatttttaaagcgtcatatggatgaatataaggctacaca
tgatactaaaaatttagcacctaaacagcaattaagggaaatactaattgcattttttga
ttttataggtgaacatagccaatttataaagatttctgtaccctatatattgatacaaga
agaaattgtttatccatttgagatactacctttaattaaggctcactatgaaaatcagaa
taacaaaaaaactgaagctgaatacagaactattgcgtatcaaataacttcatttattca
gttgctttttcttcgttctaatgcttttttcaagtatagtggtattgatattcttaatgt
tgaacagagaaatggtttaatagattttcaattagatttattattggtagatattacaaa
ataatactatattaattttttatgtacatttttttattttatggtaacgtttgaaaatat
tctcattgactaaaaatacttgcattaaataagggggaggaattttaatgttttttacat
ttataggagtaatatcagcaattttattgttgtgtacaattatatgtggtttatggataa
aacttaataatcgtaataatgactctaattctcactttactttttcaatactttcaattg
ctttttcactgttaattgtggtggcctttttagtaagaaattaatgtctttgttatgctg
gggtttattattatagatttttattattgcatgatttttactatattatagtatttttat
tatattacagggtcttatttattatagtgttttgttattacagcattttattatattaca
gagtcctatttattataggatttttattatattgtaaaatcttatttattataggatttt
gttatattacagacttttattatattacaatctcttatttattgcagtgttttgttatta
cagtatttctattatattgcaaactcttatttattatggtgttttgttattgcaacattt
ctattatattataaagtcttatttattacagttctttgttatactacagacttttattat
tacagcatttctattacaatctcttatttattacagttctttgctatactacagaccttt
attattgcaacatttctattacattgcaaagtcttatttattacagttctttattatact
acagacttttattattacaacatttctattatattacaatctcttatttattacagttct
ttattatactacagacttttattattacagcatttctattacattgcaaagtcttattta
ttacagttctttattatactacaaacctttattattacaacattttattattttaacgtc
tttactataatatagtaatattttaatatctcaaaatcatatcaatcacttttcagcata
gtctaaaatacttccactttctaaaattatctatcatacctatactaataatacttttta
acctttttattatacatttcaattgtttttaacgacctatttatttccaaaactccaata
tattttctcaattacattgtgttaataacccctaaatcctttcaaattatttacaataca
ttccattaaataatcttactgctctataattctttttttctttttaaccctactatacat
tatttacatcatttttttcaatacaacattcgttattctataacctttttacttttacta
tataccttttttctaactacaccttcaatgttccacatcatattactttagcacaacaat
taatacctaaaaataaccctctaaatcctccaataatataatcaatttaactataataat
aacctctcacactatccaaacaatatattttcaaacattacaaaaaaacatccaactatt
acaatattgctcatatccctcctcccctttcaaatgctatcattgacttacaagataaat
gaaagtgaggatgatatatatgcttaaagtaaaccaattatgtaaatcatataaaacagg
caataaaacatatcctgtattaaaaaatatttcttttgaaatcaacaaaggagagtttgt
cgcaatcatgggttcatcaggaagtggaaaaactactcttttaaattgtatttcatgttt
tatcccaattgataatggggaaataattcttggaaataataatataagaaatttaaaaga
aaaggaactttcagaagttagaaaccaacaactaggatttgtattccaagatttcatgct
atttgatggtcttagtgtctttgaaaatatatgtgttccacaaattatcaaaggtagtca
agtcttacaaatggaaaaccgtgcaattaatctatgcgagctatttggtattgaacatat
cagaaaaaaataccctgccgaaatatctggtggagaaaaacagcgtacagcagtagcaag
agcactcatgaacaacccagatttaatattagcagatgaaccaactggtaaccttgatag
taagtcttgtcgtacagtcattgaatcatttttaaaagcaaagcaagaattagatgctac
tatactcatggttacacacgatagctttgcagcaagcttctgcgaccgagttattgtgct
taaagatggaataatttataaagaagttgtaaaatcaaattcaagacataaattcctaga
tgaattactagaagttttaaaagaaatgggaggcgctcaagatgacaattaataaattat
acagcaaacttcgagcctataattggaagaactatacaactttattcttttgtataatac
tttctgtggtattagtaacttcatatgctctaatttattttagcccaacaatacaaaaca
tacttccaactggtggagatagcagaaaacaggctacaatgatattctcagttgctatat
taggatgcgctgtctttactacatacgcttcttccctctttttaaaatttaaaagcaagg
aaattggtattttcatggctctaggaacagataagaagaaattaaaaaaacttctatttt
cagagatattgttaatttcaatagtatgctgttttttaggtcttatattaagtattcctg
tatcttttggtatatggaaaatatttcaattagtgattattgataccagagaaatgacat
atcattttggaactcaaggattcatatatggatttatatttagtgtatttgtgacattat
gcatatttatactttctgtaaaatttattaatcgtacaaatataattgatatattaaatg
accagagaatatctgaaccaatacaggatgtaaaggactggtatggtatattaggtataa
tttttattatactaggtatttttctaggatatatcgtaccttcactaactataaacaaat
taaattatagactaccatctgtatggagctttacttatctactctctcttattggaatat
atatgattatgacatacatagttgtacatgctaaaagaggaaaacatccagaaaaatact
ataaaaacatcatatcaactagcatgatgagatttatgggaagacaaacagtaaaaaaca
tgtgtgttatttcatttttgattgcaggagcattatttgctgtattctatgttcctaata
tggttgcaggtatctatgatactcttaaaaataaccctatagattatacttttacctaca
atcaaagagataaacaggtatcaaaaaaagatattgaacaattagcagataaacacaata
taaaaattcaaaactatatggaaattccttctatagaattaattgttgatggtgtagaat
caatatatcataaagatggaactatcgaaagggtatatatgaaaaaaagctcctatgata
tgttctttaattctaaagatttttccaagctaattgacaaaccaataactataaaaaatg
gtgaatatcttgctgttgtaaataaaggaaatgaaaatcaagattataaatataccaaat
ttatatcaagcccagtcacagaaaaagaaatcccctttagatatgctggaaaaataatat
ttaatggttctttttttcaaaatagaagtatgaacgcctatgtccttaatgatgaggatt
ataaatcatttactaaagatttatccataaaaaa