Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00035_1A_022456.fasta |
contig | u00000crpx_c_022456 |
start | 3520689 |
length | 9039 |
strand | + |
type | noncore |
seq | acaatcggcgaaagccgtaggcttccatgtataaaagcaggagcagggcaggaaagaggg ggatttaaccaatcacgccctgctggtatctgcttattcttcttcggtttctatatctat atcaatctcaaagtctaaaatcattttgattaaggcttctcgaatacgtccctttaattc catatcaacaacaatataaacattgccgtattcatcatataaaggacgtaaacaacactt tgatatgtacgggtcatagaataccagtaatttctcaatcgcagtttcatccccgtccat agctgatgaaatcaaataataagacgggtgcttgtactttttcttcatttctatttcttc tcctttagtatctctttcatagtttctagggcacggtgtctgtgtttgaacacagcccct ctggtataattcataatatctgcaatctctgtatcactcatttccaagaagtaatacatc aatacattgttacgttttttttcgggtagctgtttgagagcttctgcaagttcatcatca aggactttaatatctatgccacacacattaaaaattgtgtagtttgtttcgtagtcgtcc catgttgccagactttctaccgtaatgtctggtaattcgctaaaagatatttccttgttt tttcttcgttttaattctttacggtagttccagataatacctttgacaacttttttcagc ttacattcaaactgacactgaattgttttttggaagtcagacggtttcataatctcacct cctttccagctatgaattgaaaagtgtttatccctctttccgcaccatatctgtacagca aggtgtgatttgcttccaaaaaaatgaaaataattaaaaaaacttttcgggtattaaaaa agcccgcacaaaatataaattttgtacgagctactggtatagcgtatttaattgtaaata gtatgctgttaaattgggcttgaatatactgaattgtacataaagcgtttcatacggcaa gccccctttacaacatttaaaccttaacctttgtctttttggtaatcgtataaatatatt cctctggtgttgggcgcttatttccaaagtatcgtttaaaatttgcctgcacgtctgggt ctgtactttccatagttttgtctatggtatcttgtagcatagccctaaattcagatacag aaacaccttgagctttagcaccaactttcataatataattcatatttcgtcttttaagtc ctatcattagaaccaactccctaaaataagttaatcttctttttcaaaaattaaatctat ctttcgcatacagccttttgcgtcaatttctgtgggtacaaaccctgcgtagtgataccc cgtttttgcgtaactgtcaataatttctttgtgtttatcagtacaaaggaatacaactcc tttcgcattatagttaatttctacatactcatattttttcatttttcaaaactcctttca aatacaaatttatctttggatttattgacttttacaaactggaattattcttctattttc aaatcattaccctcaaaaataaaattattgatgtcaatcggtaaacatattagaacgcaa attatagtgtttggttctaaagaatttactttttttgtagaattatagcaataaaattca gataatctccaccgccagcttctattgccttacggtcatttattgcatattcattatttt gctttatccaatccgaccaaacttccgaattactttccatttcatatattgaaattaaat ctgcctttttacaatgactaattatgttagaccaatatgttatatcatgtatataatcaa gttcttctggtgtccatgataacaataactcttctggaagtttctcatggcaatctttct tcatgccaggaactgtgatataaacaaacccacctttcttaacaaatggaagcaattttt catctaaatatatagggtcacgtccaaaataattatatgaatctgtacttactacagcat caaaaaactctttctcaaatttaagttcattggcgtcagcttttacagatttaatttgtg cagaagataatcccatttttttgaaaaattcttcattttcttttggctcactccataagt caactgcaaaaacaacaaatccatattcttttgcaagaaatacagaagttaaaccttgtc cacttccaaggtcacagacatagctgccagacgggattttatgattttgtaatagttcct cttgtaattttataggattcggtcccataatttttgtctgtaagtcgggtgtaaaatatt ttttactgcgaatatattccattttctcatctccattattgtaatattttaatagttaat atttgtgacttataacaatattcattttgagttcctctgctgaaattaaaaagttatgtt tgcattcaggacagaatatgattattttactttttcaattgtaatatatttcttgacaaa ttgattaacatgtgtggttaattgagattttaaatcccaacaattttcaactgcgtctgc tacacttatcaatagaaataatggcgcataatattcaatagcaagctgttttgtatcaca ctcttgaagaacaccttttttaatcatttcattaaatatatcttctatataactgatagg accatttacaagacatttttgataaagcacattcatttttaaatttctatattgctctag tattaacattttgcgaaaattagacgcaaattcatcagtcacccaaaaatcgtattgtgc aagagtaaatgttattagacttccaatagttgtatttctgtatgcattaggggttacctc tattgtgctttctggtacttgataatccttagctcgcttattatcaatttgatacatacg ttctacgatacagtcaaaaatatcttgcttatttttataatgtttatataatgctccttt tgtcattcccaaggcttccgcaatcatactaacagaaacagcctcataaccattcactgc aaataagtgtagtgcaatttttaatatattttcttttgtgtcagacatttacaacctcct tctttagtaaacgaacgtttacttctgtaaaccattatagtaaacgctcgtttacttgtc aagtagtataaaatgtagtgtgcctttggttcataggttgatctctcgatcgctggtgct ttatgccttgcaccatatttcctacatacatttctctatgcaaaagactgttgattgtaa agaattgtactcaaagctttccttaacgttagcccccccttaaagcactttctagtatct aaaaacatcattctacaacataacagatttcaataaaccttaatacatcttgtcgtcctc gctatcttttgaacgattgttagaatttctcctttggttatacttcttcataattacaat tttaagtaagccaacgacaatcaaaaccacaacaatgataatccaccagtattgttccat aacctacttccctcctttccctttcaatagccttaaatcatcttccctgtcctatgcaga atagagaagttcattcgtattaacatgtaccatacaatgcttacattgtggaaagttgtt ttcaatcgtttgatggactccctcagcaattctatgagcgtcataaagagctaaattacc atcagctaatatttcaatatctacatacattttcgctccaaacatgcgggtttttaattc atcaataccatcaaccccttgctgctgaagcacaacttccctaatctttgtttcagtagc attgtcacaactatggtctaccattttgttaatgctttctttgaaaatgtccaaagcagc ttttaagatacaaccgcaaatcacaacgcttgcaatagggtcgagaatagcatagcctaa acgcgctcctaaaatgccaattaaggaaccaaccgacgagagtgcatcagagcggtggtg ccatgcgtcagccataagtgcgtcagaatttgtatgctttgcagcatttcttgtaaacca gtacatccactcttttataacaatggataagactgccgccgtaagtgcgattccactagg gacagaaagcgtattgtactgtcctgaaaagattttcttgatacctgaatatcctattcc agcacccgttatagccaatgcaacagagagaataatggaagccacacattccatacgttc atgcccataaggatgttctctatcaggctgtttttctgatattttaattccaaccatcac aacgattgtgcttaatacatcagaagccgagtgtacagcgtccgacagcatggcacttga ctttcctatatatccggcagcgaatttaagtaacgataaacttaggttgataaatagtgt gattttggaaacctgaatagctctatttacttttccgttttgcagaagtctacccttttc cataatatgcctccttatcctgccagcttccgaaacagacgttttgtaaggaagtagtac cagactaaagctaccaccaatcctatagagaaataaagaaccgcctcattctgcatggct ttcgctacccaaaatgatggaaggaagccaaccgcgaactggtagtaactatcaataaaa aagggggctggtattcccagcaatgtaagtgcagctagttttgtaactgccataccctct aatttattgcttgataatgtaataatcataagtgaaacaataattgcctgtactgagccg agaagcgccaaacatattgtcattccaatggacaacttttctaatgaaaaaagtaacagt acaataaaagcgatgaccgccgaaataattgagggtactcccaaccttgtaaagagatac cccgacttaccaagaggggtaatcgaaaagtaccgtgacactttatcgtcgatttcctct aatgtaatcattgcaaatgcaaagcagagtaatacaggagccatgatagaaagtagtaaa tcaaaaatcggatagtatgctcgcaaagaaaaatctgttattctttcaagaaagggaata cctaatttaatcaaagctcccatgacaaaaggcgtaaaacaagctgcaaacatcataggg tcgctcttgatttgtctaaatacctgtatggtactggataatatccttttcatagcttta cacctcctaaacttttccacatatgcttaactgtatgtcgcgcaactatgtagaggataa tcaacgtagcaattacaagtaccatatcaaacgatagtaaaacgctttttccagttataa gattcatgcaagctgtgaatggaaaaaagcggaacagatatggtaacttcacaaacagac caacaataggtggtgcaaagcaaacaatttctatcggcataatcacaatgagaaattggt tcaagtttgaaatttttgtagctgcaataattccaagcatagtaaagattgctgaggtca aagccgtaccaactgtgataccaagtaaatgattgctgccggaaactacccctaatatca atgcgattaccgtagaaatagcaatcaacgcaactgtttttgaaagtatatattccgata tttttacaggggataccaccatagcatttaataccttttgacttttttccaaaagaacaa tcgctcccatgaaaaacaatcccattgctgccgggtcagagtagatcataatagaagcaa tatccgttttccaatgttccggcaaagcggcaatcccgcacacatataaaactgttaata taaagtagataaaatagaaaccatatttccattggaaatgtatatcaccacgaattaaac gtcccaatctcattgaagtgtcctccctgtaatatcaacaaaaatatcatttaatgtagg ctcactactatgaatagaaagcaaacggttttcggaaattaaactttttaacagcttatc ttctgtggttctatcaagcagacattctccggttttctcgcctttatcatagtaggtata ttgtattttggcagctcctcttgacataatcaaattatgcgggctatccaatgcactgac ttttccggcaacgataaaggctacttggtcacatagctctgttgcgtcaaacatattgtg agtagtaatgataatcgtttttccgcgtttcttttccgcaagaataatatctttcattaa acgactatttgtagggtcaagaccgcttgtaggttcatcaaggaataatatatcagggtc atggactaacgctttaatgaaattcaagcgagaacgcatacctttggaaaagtcagcaac ttttttgtccccgtcattttccaagcctaccatatgcaataattcatcaatagaccgagg ttgcttttcatatagagaagcaaaataggcgagattttgtcgtgctgtgaatttctcgta gcaggttgaaaattcaaagtctaccccaatattttcataaaactgatttgtatgttccct tatttctgtacctgcaacttttacgctgcctttatatcttgtattaagcccagttaaaac tttttgaatagttgattttccagcaccagagggtcctaaaaaaccaaaaatttctcctct cccaacatggaaacttacattctccacaaacggtttgtcagtatagctaaaatacagttt ttttacatcaatcattattcattcctcctttaactttatgacgtttatagatatatagtc atataaactgtaaaaaatttgtttggctacctgcctgtcaaataaccaaacaaaattgtt actctgctactacttgctgaataataccattcactaaaagattttgtatcatattcagtt cttcgtcctctttgaattgttccaaacaggataaaacagaatacagggattttatgataa ctgtatgcggaaccaaaaatataacccctaaatcttccagtatctccaatatacgaatat cactgtacatatgattttcaaaaatatctgacgatatttttctttgcagatagtccatta aagataaatcaatctgcgaaagaataggcgaagtaatcacccccgttaaacttagcataa taacgtcctttgctaaatctctatggttcttatactttttctttttaatggttgtttcta tacttgtaaataactctttttgtaagcgaaaattgatttcaacatatagatgttctttac tgggataaaaagcatagaaagaaccttttgatatgtttacagcagctactaaatcatcaa ctgttactttttttaagccgtgtaatgcaaacagcttttctccctctatcaaaagtttac tgtttatgatttctttttcttgttccgtaaatcgtggcaaactcataacctccttatgac taaaatatttatatcgtcatgaaaagtataacatttactgattatataatcaatatgcta tccaagatatttatgcaaggtagcttccaatgcgtttattgtagtgtccgtgtcctcatt aaaaatcatgtgacgattaagctctaaagcaagtaattccttttgcggtacatgaattaa atcaaatactttgttggtataatcaaagctaaaaagcgggtcgcctttggcagtaattaa aataacaggacattgtatagccccattctccaggcacgataagtcagcattaaataagct ggcgacaaatcttaaaggataatagggtaaaagcatagggtcatttaagcaatcttgttt tgcctgttcactataaaatactctgtcatagtctaaataagcgtctcctggaaccttgta gttaggcagcaattttccacctacacgaaacccccactgtatcagccccataaaacggtg cgaccatgcgggatattttgttaagctcatagtttcttttaatgtagtcagcatgatatt atgtggaaaaacggcttttaaccttgtgtccctacctgccgccattgcagctaaaatccc gccttgactggaacccatgacagctatgttttcaccgaaagtttctattccgtaagttgt tgcgtcatatacattatgcaacatatcttccattatataattttttttgattttagggct ttttccgtgtgaaagatagtgaacacctattatattaaaccctctttcgctcaatccaca tagaaaattctcatacatgagagggtgtgacatagtacctggcaaaaaaacaatggtagg actacttctttctgtataccaaatagaaagtgttatcggaacattatttgaagaaatgcc aacttctttatacatacaccatgcctcctatatgactgatttaattttatagtcatatta tagcttattgcaagcagaaagtcaatagctataaatatatgatttaaggtaaaattgtca agaaagattccattgcttaaaatacaatgaaatagcttgtcagtgcagtacatttgctac agaaaaggcagactatatccgaaaatagagcctgccaacaaaatgtcttacataataatc ttccagttactatccttatatagtacaagctcatactgcgaaactaaagttgcctttgtc tgattatcaaggaatttcacggctactttgactttcacattgtccccgtcctttgtaaat actgggtttaccagttcagaataaaggtagtccctgccgataggttcaagcacatttccc gttacataataagcaagctctttttctgttgctgtcgggtacagattaaagaaagtttcc aaaaatgcggtagcgtcattgacggtatctgcgtccacgcttgcgtcggcttcttgtgcc tttggctcatagtctgatttttcaatcgctggtgcaagggtagggttctgaacgataacc atatcgcctctttatctacatggattttaacggtataggttgctttgacattcgttgtct gttcgccctcttttatctgctgatctacttcgtaggtagt |