| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00003_1A_021026.fasta |
| contig | u00000crpx_c_021026 |
| start | 3730333 |
| length | 15796 |
| strand | + |
| type | noncore |
| seq | agttgatcctttggatatttcttcacttgcttttgtcagaagctcttttaagtcggcatt ttctttcggcaggcacgcaagtgtgtttccaaatcttcctgaaacttcacgcattgtgcc gagtacctgctcaggatgatctacaaaatatttgttataggtaagaccattttcatcttc agcaaggtgaatccagtcctcatctctttctctgatactgtcccttttctttaggaatat aatatctgaggttacttctgttccggctatgcccttaaaggtatcatttggaagtctgat tgcccctaaaaactctgctcttgctgcaagatagcgtcttacactttcatcctttttatc cattgttccacttgatgtgataaaggcgataataccgccgtttctgactttatcaatgga tttcgcaaagaaataatcatggataaggaagttatttttgttatactccctgtcatttac cttatattctccaaagggtatattgccgataaccgcatcaaagaagttattggaaaagga ggtttcttccagtcctttaatctgcacttcactttcagggtatagtagttttccaattcg accgcttaccgagtcaagttctatgccataaaacttggacttattcatttcatcagggat attgcctataaagtttccgatgcccattgatggttctaaaatgtttccctgtttaaatcc catatccgaaagcgtcttatatattccgtcaattacggttttcggtgtataaaagctcgt taaagtagattctcttgcagcttcgtattctgcatgtgataagttctcatttagaaaagc ccttgcttctttccactgaccttccttgctttcatcaaagacttcggaaagtccgcccca gcctacataccttgctaaaacttcctgagctgtactgtcaagctctctttgtccgctctc cactctgttaagcatggaaattgcttcaaggttattatttaacctttcgcttggacttaa cttttcagggagcgtttcttctgtaattttaaagttatgagcttccgctttccttatttg agtttcctcagtagtctgctctggctgtttatatgtcaggttttcaaataccctctcaag gtcgctttccagacgataaggaatgacatcgaagcttgttatcatcccgccaaaatactc ggtgttgtccttcaccgttaccgtatttaggttctttctcatatcatcaaagcgtgttat ggtatggtttttgtccttgtatttaacttcatcaccgacaataaagttcggtctttcaag acttattttattcagcaagtcctcattatctgtaaagtctacaatcggaatttgatggtt tccacttcttaccggatcaagccacaaatcatatcttcctgtgatttcatttttagaaat ttctctgactttatattcttcatgattaaaatagacggtatcgcctgctttaactgcaaa ctcttctaaaaggctgtcctctttttcattcagttctacttcttctctttctttgaggta atcaaataaggtagcttgaactgtgccacgctttgtagcttcttctgtttcttcaggtgc ttcaagctctactttatcttcaaagctaagttctccattaaagacaaactgaagctcctg ctcatccatttgttttataagctctatatctttaagttctctaaaggtctttggaaaatc ctctaaaatgagcctctgggcatttaattctttcagttcctcaaggttaaaatatcccca ttcaggctctattccaagaacaagtccaaaggcatcaccgctttccctgtcatactccgt catataccaagtccaatttgaacgaaaaggaataatatatgctgcatgaacctgcttatc cgctaaatctacatcctcctgtgcgtaaatctctggcactctttcaagaatttcatcagg cattagatttccaggatcatttttagaataatattgcggttcttttacttcttctatctc tgccgtactttctgtttccttttcctcaaaataaagttttttagaaagcagctcatcaat atgctttgcaacacttgtccaagtaaggaacacatcattacaatcattcttctgtaattt aaaaccctttgcatcgtgccattcatcacttcccattgcacctgacacaacgtgagaatg tcctccgattccatattcatcttttaggaaattggctttttcctgcaaagtatgattttc tttaaaaaacttggtgattcgttcttttcctctatcaacgccgcttcctcttgaaaggct ttcaaggacttcatcttctgtaataaagagctttaccttcggaagttctgtcagattggt actatattcctttcgttgcagctcaagttcttgcaacttctgataaagactatctacctt gtgataatgataccttaatacatttctgctttctttgtatccttctaaaaacctgctata ttctttgattgtttctttcagatattcaggattttttaatgcttcagataatcttttcgt ttcttgcggaaagccaccacctctttcaaaagagttgaaatatccttgctctattccttc ttcgcttaaatcgtgcgttagataccataaggattctgaaattctatccctttcatagtc ctgtgcctctaaaagttctacatttgtagcaaactcacctctgtcaagaagttcatttat cctacttgctgcatcactccaacttaaaatttgtgtattatcctctcttgccgatgttcc ataagctaaatgaatacctttatccgaataccaggaagatacttctctttcatcaatgta aaatccgtttccgcctttaaaggtatctttgaggtattctcccaattcttctatgctctt gccttttgaaaactcagcaataacaggaagcctaccgccatcatgatttcctccgttaat aaggacggtatctatatccttctcagttagcggaatagtaaggcttatctgtccataaga attttcgggtaaagaaaaagaagccttttcagcttctattatccctttatccgtattgtc ttttaaatctccactacttccttgatggtcatttctttgagagctgaaatcatcgcccca tactgcggattgttctcgtcctctatcttccaagctgctatcaactttggcttctctgct ctcataaactctactgcctgtttctgaatatccatcaggtgtcctgtcagcttcttctcc ttgtatagatccaaaagcatctcgaagtggctctgctcctcgctctgtgaaaggtaattc agcctcatcactgcgtaggtcggattcggatacttccttataaagtccgtctgttcctcc aagctgtttagcgtattctccctgattttttctattatctcgtccgtactctccatttcg gagaactcgctcgttttcatttctttcctgatcatctcgtcgaaatacattttcttctac ctcctctaattcttctttaattttattatatcccgcttcttttcctattaaaacttcttt ttgaagctcaagctctttgcttttttgaatggtttcatcaataatctttccgctaatatc cgatacactttcaccaaggctcattaaggatatgctgtcaaatctttgaaaattttctct taaaagctcataatccatcggataatctaacttaaatcttgaagctaccgcatagcttac cgagtcccttacaaacttggtaaatgatattctatcctcatccgctactctaagttcatt cattaaggtatctattttttcatcaccgtagagtctgcttaaagaaaagatgttttcaag tgtgctttcactttcctcatagccctcgctttttatcatttcctttaagacatcttgatg ggcttctttatcaaatctccaaagattgacctcgttgacatccctgttttttgaaactgt ctggcttatatcaaagatatagtccacctttttatatgtgccgtaatcctctaaaattgg tatccctttctgccctcgcataaccgttcggttaaagcgttccctccagtagtcgaactt ggcacaggctgtcgcttcaggatttttatcatatatacttaattgacttctaaaatcata cctttgattgtttccgacaacttttaggagctttagatattctgcttcattatacaaaac atcttgttttattagctccaaaatgttatgaaaatcatttattcgcatttttacctcctt cttttttcaaacaaaaaaggcggttagattttactctaatcaccttcgctatataccaaa tattattactctatttcaattttttaattgattcactttcagatagtatcttcatttgtt caatagctattgcatttaatttttccaatctttcagattggctcatgccttcatttataa ataccgcattaagattctcaagattagaaaggcagacaagctgtgatatatccgcataat ctctaatattgccttttaaatccggattttcatcacgccactccttagctgttattccaa atagagaaacattaagaatatccgcttcacttgcataaataaaattgattttttcttttg aaagtttatccggtacaagtttgtttttaatggcatctgtgtgaattctataattgattt ttgccaaatttctcttaatatcccatcctaacttcttttgttcttcttcctttaggcgtt caaattccttgattaaatataatttaaagtatggcgatacccaagaagcaaactcaaacg ctatatctttatgagcataagttccaccatatcttcctgctctcgcaacgataccgatag aattagttttttccacccattgcttgaccgataatataaaacggttaaatcctgcttcat ttttaattccctcgaattcgggggaattaaaattcgtgttatacatttcttcccaaatac ctaaaaactctattgtattcttgtttctgagccacttttcaatcaaagcagaaccgttct caatatttctaaccatatccgttaaagaaatataatctctattgtctatggcaataatgc tgatttctgaaccttcaacatttattttagacatataatcacctctcaatcattaaattg attactttgcattatagcatttttagagcattttttccacgctgaaattagtgctgtctt acttgcgatatgtcaaaaccgcttcttttatctcattttcaatcgcatctaaaaattctt tcttagaggatttaccctgagcaatatcagataattccatttcccactttgctgtcgttt ctgccgacttaaaggtatctgctacaatcgttacaaggctgattcctttatgcgttgcaa ttagattcttcttatctctttcgacaaatctcttaaagattagattttcaataattcctg cccttgttgccggagtgccaagaccttttctttccacctctacacctttttctaaggcat catttcccgcaatctccatagactttaagagcgtatcttcagtaaagtgtttcggaggtt gggtaaatttttctttaacctctttattttcaacgctcaaaacatcaccaacacttacat cgggcaatacagcatcttcactcttttttgatttgtattctttaaggtatttgctaaagc cttcatccttaattaccttacctgaacttgtaaattcaaaaccgtcaaatgaagctacaa tctttgttgtattttcaataagcggatagcctacacttgcatgaaatttatcggatataa ggaagtaaacttttgcttcacttaaaggtaattcagaaacatcttcttttactgaactga ttgtcggtatgattgcatgatggtccgtaacctttttagagttaaatactaccttgatac gctctgtatcaaagtcatttttacccaaaatgttgttgactgtactcacaatcatatcct ctgttaaacatctgctgtctgttctggggtaagtaatcagtttcttttcatacaggcttt gagtatagtcaagtgtctgcttggcactatatccaaaatatttattgcactccctttgaa gcgtagttaggtcaaaaggtaaatcaggctttgtaattttttctttttgaataacatcag taatttcaatcttatcgcctactaaacttataagctgttcagcagcaacttcatcatcaa ttctgtctgtggagagtgtaaatccattcatagaaagctctactgtgtaatatttttctt tctgataatttgctatctcatcatctctttttacaatcatggcaagggtaggtgtctgca ctctgccaacactgtaattttgctgatacagacaagagtagagcctactaatattcattc cgactaaccaatccgcaatagctcttgcctgtgccgattcaaagagattatcatagtctt ttccgtctgttaggttatcaaaaccctctttaatggcactatcttccattgaagaaatcc aaaggcgtttcatcttctttttacaattcacttgattatatacaagtctaaaaatacttt ctccctcacgccctgcatcgcacgcattgataaccgtatcaacctccttatcattcatca gctttttaaggatgttaaactgcttcttggttgcctttgctacttcatacttgtagtcgc tcggaataatcggtaaatcagccatattccacttggcgtacttttcatcataagcatccg gatttgccatttgaattaggtgtccaacgcaccagctcaccctatatccgtttccttcat aatatccgtctttctttttatttgctccaataacctttgcaatggagattgcaacactcg gcttttctgcaataactaacttcatctgtgttttcctcctgttataaatcaaaatagggc gaaagatgttactctcccgccctaactttgcacccaaaataatatgtttttaggtgcgtt tattcttcatcttctacttcatctgcatcatttatttcttcctcgctttcagattcagaa aagaaatcatcatcttcctcctctaaggcttcaagttctttatcttctttctttttcaca accttaaaatagtagcctgctcctaatgcaccacctactacaagaagcaaaataatatag gttcctaaattactcttttcgtccttcttctcaggctttacttcttccttaacaggttct tcttttactacttcctgctttggtgcttcttttttctccaccatgttaagcaaatcatct tcagatacttccgtaagaagcattacattctcactatcttcatcatgattgatgattaaa tgaaaagtcttaccgtttttcgtttgaaaggtaataaactgccttgcatctgccgaatac tgatccgtttctttgttatcgctgctatctccatgatgaatcggatactccttatttgca ttatctttattctccgtaacggatgctctcgcctttgacggagatgaagctactcccttg ttggtgtttacactcttacttgcagaccccattgatgaatcctgactgttattcgcagga gcttttgccgtcaacttattgggatagcgaacttccttttctttctcctttacttccgtt ttgcctttaccggtatcctttgtagtattacctgagcttaccgaatccgatgagccttta ccggtactacttacagaagtctgtggtgtttgaggagaaatacctgaacttgtcttaatt ccggaaataggactaatcggtgtaactgattgtgatgttacaggagctttatttgtttca gttgcctttttctcaagctctttcaccttttccgtcagcttatctatttcctttttcata tcttctgataagtccttatttcccttatctttcttcattttttctttcaggctatcaatt tcatcttcaaggtctttaattttattcttttgcttatcacttaatttgtctttgtcctta agttcgcaatttaacttatcaagtttatcctgaagctcttttgcctctttttctattttt gaaatatcgtctttagaaagctctgtctgcgttcccttatcttctgtctgagtgcattca tcctgctttggcttttcttcttccgtctgcgtttccttatccttaacctccatctttgct accttacggataatctcatcttttccatctccctttacctcataaaacagaaattcatca atgaatttcatatcatctgggagcattggaagatctccgctatcaataagttgtcctttc tcagcctttatcttttcttccttaaagaccttttcatcttcaaagatataccttacattt acttcaacttccgtttgaacagcttcgttttttgttggagcttcagatttttgctcctgt gcataaacaaccgtccaaagacctaaaatacaactaatacttacaattaccgcaagtgct accgtccaaaacttattattctttttcaaactggttttcatttgttttctcctttttcat ttctgctttttgtctgtttacctttgctatcaaatcgctgattgtgatgttgttctttct gcaaatggcaatgatttcttcattttcaagctcttcttcacgaatgaataaaggctccaa ttcttcatcaatcagagcctttttatcctttaacttctttattctgttttttactgttgt aagttcctttttcaaattgttacctcctatttctttacatttggcggaaaaccgaatcct acgggatggtgcttacaaaatgttgctatccaatcatctaaggtagttactcttattcga ccgatgttatcaatcacttttccatctccaatgtaaatacctacatgaccataggtaagc cctgcactgcttccgctactgctgctttcaactgccacaagcattcccacttttagcttt gacctgtctgatgtaaaggtatagtttcggtacatatcacaggcattcccgcctatatat ccaagtcctgcattttgatagacctgtgatacccacatggcacaccagcctgcacccgga gatggcgtaatgtatgcagcattaacaatcttcttttgtacttccgtagatgcctcatac tcttttccaccgccgatacctccatttgcactgataaggtcagaattaccaaaggcttct ctcatattgccttgtgcaaggaacaaggcttcatagtgctttagattatcgggatagttt gcaaagacctttcggataatactgtccatctcttttttatgaagcgttacgatgagtttt ttatactcataaggttcttcgtggctttcggtatattcattgccatcttcatcggtatag gtttccgtaaccgtcctgtatctgatttcaatttcttccctatactcaaggtcatacatg gactcaaataattcttttaatatggattctacttccgatacactctttacctctccgcac cttgatgtaatgtaggataaaagctcatggacattatgaccgatgtattctgtattattt aagatatattcatcatatccaggataattttctttcacatagtcaacttcactttgaagc tcaccctccatatctgaaaatttctgattgatttcacttaggacatttggctttgataaa tagcttgttgtaagcacagagcttgtagagttcataaagcctgtcattcccgttcctgca aagttaatcacaaaagtccctaagataatgatacctatgaaaataagcattagtcctttt gcttttcggataatcatatcctttgagcttttcagtgttccgataagtccctctttaatt cgatctctaagccttgacttattctcacgagaaattgctgcctttacctgatttttcttt tgaaatcttttatatgcacttgctcttttatactcatccgtctttttcagttcctttttg gcatcacgaaattccaactttgacttacgctttctgattttatagtccttatttgtaagg tcatagcctcttttagctcttttcttatcagagtacttctttatgccatgaatgagcttg gagcttgtatctgctgtcttttctcctgcttccactccttgattttcatcacttccatga gacaagtaatctcttacagtttcacttcctttagcaagtcctgaaagggcagataccttt accatgtctttttttagctttttcttttggtcttttgataggctgctataaacttttccg ctgacagcatcttttcccgcctttttatcatcagccttatttccctttggtgcatcgtcc tttttccttgtataaaggctttcagaatagttcttcctcttgtacctgcttttttgagtc ttatgatttttaaaggaattttctaatgatttttctttatgggaaagattatcctccaca tcataggtcgattcaaaatagttgctgtctctaaagtcattatcgtatctgtctataatc ccgtcattatcaaggtcttttcctaaaggatcatagatttttccatccttaacctccgta atataatctgatcttcccgtttcaattgcggaatttacgtctcccttatctgaagttcta tatttttcgtttctcttggatgttccataagacttttcattatcagcacttaccttactt gttttttcatgcactttatcctgaaaccgttctttctcatgaacgattttacctctgtaa tcatcgttatgttttagcttactttcttcaggtatcgtatctgttttactatgaaacatc tctctttcaaggcttgccttatgcctttccttaaaatcctttttcagcttctttcccata ggctacctcacttcttccggcttggtagtcatcttctgatataaaattgtatctttcgga aacttatcaatgaaaggcacaatggtatttccaaagaataagagtccctcaccttcattt gaattagtaacatatctgagctgtggaagtgagattttaagttttcttgcaagtatctcc ctatctcctgatgcttgattaagcattaagacaaagtctgtattgtcaaagatattttct atctccttactcataagtaggtctttgacattctgcgtaatacctgttggaatacctccc catttacgaaatcttttccaaatctctacggaataggatgctgtctgctcatcttttaaa agcaaatggaactcgtcgatatagtaccttgtagccttgtttcctctgttttgtgacacc ttattccacacctgatcctgaataacaagcataccgattttctttaattgacttccaagc tccttaatatcaaaacaaaggagcttcttatttaaatccacatttgacctgtgattaaag acattgagagaccccgatacatagatttccatctctgttgccagcttcttaccgaccttt tcttcctgcccttttaacatatcgtataggtcttgaagtatcggcatattgtcaggagta ggatgttcaaaatacttttcatagattttaggaaggcacctatctataacggacttttct tctgctgtaagaccactaccgcctactacaagctcaagcatactcatgataaagtttgcc ttgtctttcagcggtgcatccccatcaccgtagttcatgtttatatcaagaggattcagg taatccttcgacttactgctgaccttaatgacttctcccttaaactgccttacgaggttt ccatactctccttccggatcgcagataatcacatcatcatctgttactaaaatcgcattt gccatttctcttttggcactaaaggacttaccgctgcccggagttccgaggattagaccg tttgggttctttaatttctttctatctgccataatcaggttatggcttagggcatttagt ccgtagtaaagactattacttgaattgataaaaagctcctctgtggtaaatggcataaat actgccgttgatgagcttgtcaatcctctatctatttcaatcttatttacaccaagaggc agcacgctcactaaaccttgttcctgagaatggtcaagtcttttcagcttacagttatgc ttatttgcaatggagcttatttgagcaattgtgttatcgagcttttgcactgtccttgca aagttcataaagacgatacttaccacaaacattcgctcatctcttgtctgcaagtctttt aagaggctctttacatcctcaccataggtaattaagtccgatggaagaatgtccatatca taaccgcttcttaccgccttcttattttcctcaattttcatcttatcaatatcagtgttt tttcgttttaccatcttaatggcttccgattggtcgattgccctaatatgaaaggaaata ttgatgttatcgtcaatatccaaaaactcggataacatcctatctgaaagctcactggca aggatttgaaaatgacttgttgctccgatgaatttgccgaacttaaagtatctactcggt gtaaagttaaactcatcaggcacaatatatgtctttgtgctttcccttttctttaggtct ttgtaggaaaatttaaatgttttatttggatttaaaacatcatgaagtatctttagcctt tcttctccgtttaggctttctgctcttactcccatacttttaagactcgataatatatct atctccagtctttcaagttttgatgttgcctgttctaaattatccgcttccactgtaaag gttacatactttgattttttcaatccgttatttccctttacaatctggcttttaagcatc tctctaaattcaaagcgtatatcgtcgaaaccgtcctttttatccggtatctgaattgcc gacttcatttcttcgtttcgtccgagctgattgatatatgaaaactcaatgctgatactt ggatcaaaagagtttaggaagtttgcaaattgattaaaaatcaagtccctatcttcatct aaggcaagctgatagttaatgtcctgaaaggctatacttttactgaagtgcttttcatca agctggcatattccgctttttaaaagccttagatagggaatggtatcttctaccgtatat cttttcggttctttcttaaagataaggtcaaggattcctcccttatcttttttgacttgc aattacttttctttaagtcccgcttttgacttctcaatgccttttcgttttgcatgagtt ttatttgctgaatttttcttttcttgttcaaggtaaacctcctttctcactctcttttgc ggttgataaaacttatgaagataaatgtacttaaagtatttctcaaatgtcagtccgtct ttttcaaatagtgtgatgaaaaagataggaagcgtggatacgataaggaatatgacagct atgtcatttggcacaaacttcctcataaataaatagactggtattccaaccagtcctgca agtgtgaagcctatgagctgccttttcgttaggttaaaagcaacctttgtctttacccta tttaagtctttagggattggtacatatgccatatcttacctcccatcttctttacccttt gacagctcctcaaagtgttcatatacagagccgatttcttcctgaatagtcgcaagctgt tcgtctgtgttcttgttatatctttgctgtattaggtaaaaatcgttatggcagcgacca atgtcctctgttttttcttccaattcttccaccttattatgaagcctgatcctatcaatt atcgccataatacctgctccaattactactataaatactgtttttcttttgttcatatta cccttcctttcttttagtgtgcatttaatacgcttttggccagtgttccgctctttaaca tcattaaccctagcaaaaccgcatatccaagtatcgtaaaggtacttgtgtgtatatctg ttatctgtattgtcttaactaatactgcgtatattccaagacaaaccattaaaaagagtc cttgtaaacctatggcaaacaatcctttgatatagtttgttccaatctgtccccactctt tgtttcccattgtggcaaatggaatggctgaaatggatgagtaaacataaatctcaaaca ttcttccgtaaaccacaagcataatcacaattgaaatgacctgtattgccacctttataa gcgaggtttcaaagagtatcatgacaagctctccaagacctttatcctttaatccatcta ccatttttactatctgatctccggagataacggcagaagtattgattacccctgccgctt tatttaccatgtgctgtgccacatcaaagaccgccattgaaaactcaaatgcatgtgata ctaaccatacagcaatccacatcttgatgatgtacttgaaaaattcaaaagtatctgtat cgtgcatattgttcttttgcattaccatattgataagctcgatacaaaggactgctgtga tgattagccctgctatgggaataatgacggaatcgttaatgcttttaataaaggcaaata catctccgttccaccccataggagtttttcctacatctgttgcaactgcaccaactttat cgttgatgtcaagaaacatggactctaagtttgcttgaataccgcccagtagaagctctt taaagaattcttctatcttgtcgaatattccaaacatctaagctctccttttcttattac ttgagtacatttgcaagaagcggaatcagcttaagtccgataaggacaatgcctcctccc gccataagctgcttgatgccctgagatttcgctcccggattatcattaccatatccttcc ataaggttaataactccccatgctccaagtccagcacctactgccataactaaaatcttt aatacatttactgcctgtgcgaaaaattccataatttattcctcctcattttcttctttc ttctcaatcttgttatatgacttcactacaaagtttttgtaagtctttccctctttttca cgcttcttaaagtagccgaatacatgaatcaaatcgcctttttcaaagtcctctgctttc tctgctttttctccgtaggctgcacaattgatgtactccttgccctttccatattttttt acaagcgtaaagtttacaacttctacttcttcaccctctttttcaaaacttgagaaagta ggttctgccactaagttggcgttgatgttaatcatttcttgtttcatctttttaaatttc tccttttcatttcaataaaaaaaacgactggagtttttcttttccaatcgctgatactct tactatttagttttcgtttaagtgggatttctgatccttatcatcttgcctcctgatttt gaataaaaaaacagcaaatctttttaagacttactgcattcttgtaataaccgtctctct atttaattttgcttttccttttcgcttcatatagctttctatgtcaaacaaattcttctt gtcataatcctcaagcagcttataattcttgtgctttgtaatatcgtatttatctgaaag aaaaggtctgacacctctaagctgaaatatacattttccaccgtccattacagtaatctc atcttgactcatcagtt |