| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00249_1A_020695.fasta |
| contig | u00000crpx_c_020695 |
| start | 3780431 |
| length | 15799 |
| strand | + |
| type | noncore |
| seq | agttgatcctttggatatttcttcacttgcttttgtcagaagctcttttaagtcggcatt ttctttcggcaggcacgcaagtgtgtttccaaatcttcctgaaacttcacgcattgtgcc gagtacctgctcaggatgatctacaaaatatttgttataggtaagaccattttcatcttc agcaaggtgaatccagtcctcatctctttctctgatactgtcccttttctttaggaatat aatatctgaggttacttctgttccggctatgcccttaaaggtatcatttggaagtctgat tgcccctaaaaactctgctcttgctgcaagatagcgtcttacactttcatcctttttatc cattgttccacttgatgtgataaaggcgataataccgccgtttctgactttatcaatgga tttcgcaaagaaataatcatggataaggaagttatttttgttatactccctgtcatttac cttatattctccaaagggtatattgccgataaccgcatcaaagaagttattggaaaagga ggtttcttccagtcctttaatctgcacttcactttcagggtatagtagttttccaattcg accgcttaccgagtcaagttctatgccataaaacttggacttattcatttcatcagggat attgcctataaagtttccgatgcccattgatggttctaaaatgtttccctgtttaaatcc catatccgaaagcgtcttatatattccgtcaattacggttttcggtgtataaaagctcgt taaagtagattctcttgcagcttcgtattctgcatgtgataagttctcatttagaaaagc ccttgcttctttccactgaccttccttgctttcatcaaagacttcggaaagtccgcccca gcctacataccttgctaaaacttcctgagctgtactgtcaagctctctttgtccgctctc cactctgttaagcatggaaattgcttcaaggttattatttaacctttcgcttggacttaa cttttcagggagcgtttcttctgtaattttaaagttatgagcttccgctttccttatttg agtttcctcagtagtctgctctggctgtttatatgtcaggttttcaaataccctctcaag gtcgctttccagacgataaggaatgacatcgaagcttgttatcatcccgccaaaatactc ggtgttgtccttcaccgttaccgtatttaggttctttctcatatcatcaaagcgtgttat ggtatggtttttgtccttgtatttaacttcatcaccgacaataaagttcggtctttcaag acttattttattcagcaagtcctcattatctgtaaagtctacaatcggaatttgatggtt tccacttcttaccggatcaagccacaaatcatatcttcctgtgatttcatttttagaaat ttctctgactttatattcttcatgattaaaatagacggtatcgcctgctttaactgcaaa ctcttctaaaaggctgtcctctttttcattcagttctacttcttctctttctttgaggta atcaaataaggtagcttgaactgtgccacgctttgtagcttcttctgtttcttcaggtgc ttcaagctctactttatcttcaaagctaagttctccattaaagacaaactgaagctcctg ctcatccatttgttttataagctctatatctttaagttctctaaaggtctttggaaaatc ctctaaaatgagcctctgggcatttaattctttcagttcctcaaggttaaaatatcccca ttcaggctctattccaagaacaagtccaaaggcatcaccgctttccctgtcatactccgt catataccaagtccaatttgaacgaaaaggaataatatatgctgcatgaacctgcttatc cgctaaatctacatcctcctgtgcgtaaatctctggcactctttcaagaatttcatcagg cattagatttccaggatcatttttagaataatattgcggttcttttacttcttctatctc tgccgtactttctgtttccttttcctcaaaataaagttttttagaaagcagctcatcaat atgctttgcaacacttgtccaagtaaggaacacatcattacaatcattcttctgtaattt aaaaccctttgcatcgtgccattcatcacttcccattgcacctgacacaacgtgagaatg tcctccgattccatattcatcttttaggaaattggctttttcctgcaaagtatgattttc tttaaaaaacttggtgattcgttcttttcctctatcaacgccgcttcctcttgaaaggct ttcaaggacttcatcttctgtaataaagagctttaccttcggaagttctgtcagattggt actatattcctttcgttgcagctcaagttcttgcaacttctgataaagactatctacctt gtgataatgataccttaatacatttctgctttctttgtatccttctaaaaacctgctata ttctttgattgtttctttcagatattcaggattttttaatgcttcagataatcttttcgt ttcttgcggaaagccaccacctctttcaaaagagttgaaatatccttgctctattccttc ttcgcttaaatcgtgcgttagataccataaggattctgaaattctatccctttcatagtc ctgtgcctctaaaagttctacatttgtagcaaactcacctctgtcaagaagttcatttat cctacttgctgcatcactccaacttaaaatttgtgtattatcctctcttgccgatgttcc ataagctaaatgaatacctttatccgaataccaggaagatacttctctttcatcaatgta aaatccgtttccgcctttaaaggtatctttgaggtattctcccaattcttctatgctctt gccttttgaaaactcagcaataacaggaagcctaccgccatcatgatttcctccgttaat aaggacggtatctatatccttctcagttagcggaatagtaaggcttatctgtccataaga attttcgggtaaagaaaaagaagccttttcagcttctattatccctttatccgtattgtc ttttaaatctccactacttccttgatggtcatttctttgagagctgaaatcatcgcccca tactgcggattgttctcgtcctctatcttccaagctgctatcaactttggcttctctgct ctcataaactctactgcctgtttctgaatatccatcaggtgtcctgtcagcttcttctcc ttgtatagatccaaaagcatctcgaagtggctctgctcctcgctctgtgaaaggtaattc agcctcatcactgcgtaggtcggattcggatacttccttataaagtccgtctgttcctcc aagctgtttagcgtattctccctgattttttctattatctcgtccgtactctccatttcg gagaactcgctcgttttcatttctttcctgatcatctcgtcgaaatacattttcttctac ctcctctaattcttctttaattttattatatcccgcttcttttcctattaaaacttcttt ttgaagctcaagctctttgcttttttgaatggtttcatcaataatctttccgctaatatc cgatacactttcaccaaggctcattaaggatatgctgtcaaatctttgaaaattttctct taaaagctcataatccatcggataatctaacttaaatcttgaagctaccgcatagcttac cgagtcccttacaaacttggtaaatgatattctatcctcatccgctactctaagttcatt cattaaggtatctattttttcatcaccgtagagtctgcttaaagaaaagatgttttcaag tgtgctttcactttcctcatagccctcgctttttatcatttcctttaagacatcttgatg ggcttctttatcaaatctccaaagattgacctcgttgacatccctgttttttgaaactgt ctggcttatatcaaagatatagtccacctttttatatgtgccgtaatcctctaaaattgg tatccctttctgccctcgcataaccgttcggttaaagcgttccctccagtagtcgaactt ggcacaggctgtcgcttcaggatttttatcatatatacttaattgacttctaaaatcata cctttgattgtttccgacaacttttaggagctttagatattctgcttcattatacaaaac atcttgttttattagctccaaaatgttatgaaaatcatttattcgcatttttacctcctt cttttttcaaacaaaaaaggcggttagattttactctaatcaccttcgctatataccaaa tattattactctatttcaattttttaattgattcactttcagatagtatcttcatttgtt caatagctattgcatttaatttttccaatctttcagattggctcatgccttcatttataa ataccgcattaagattctcaagattagaaaggcagacaagctgtgatatatccgcataat ctctaatattgccttttaaatccggattttcatcacgccactccttagctgttattccaa atagagaaacattaagaatatccgcttcacttgcataaataaaattgattttttcttttg aaagtttatccggtacaagtttgtttttaatggcatctgtgtgaattctataattgattt ttgccaaatttctcttaatatcccatcctaacttcttttgttcttcttcctttaggcgtt caaattccttgattaaatataatttaaagtatggcgatacccaagaagcaaactcaaacg ctatatctttatgagcataagttccaccatatcttcctgctctcgcaacgataccgatag aattagttttttccacccattgcttgaccgataatataaaacggttaaatcctgcttcat ttttaattccctcgaattcgggggaattaaaattcgtgttatacatttcttcccaaatac ctaaaaactctattgtattcttgtttctgagccacttttcaatcaaagcagaaccgttct caatatttctaaccatatccgttaaagaaatataatctctattgtctatggcaataatgc tgatttctgaaccttcaacatttattttagacatataatcacctctcaatcattaaattg attactttgcattatagcatttttagagcattttttccacgctgaaattagtgctgtctt acttgcgatatgtcaaaaccgcttcttttatctcattttcaatcgcatctaaaaattctt tcttagaggatttaccctgagcaatatcagataattccatttcccactttgctgtcgttt ctgccgacttaaaggtatctgctacaatcgttacaaggctgattcctttatgcgttgcaa ttagattcttcttatctctttcgacaaatctcttaaagattagattttcaataattcctg cccttgttgccggagtgccaagaccttttctttccacctctacacctttttctaaggcat catttcccgcaatctccatagactttaagagcgtatcttcagtaaagtgtttcggaggtt gggtaaatttttctttaacctctttattttcaacgctcaaaacatcaccaacacttacat cgggcaatacagcatcttcactcttttttgatttgtattctttaaggtatttgctaaagc cttcatccttaattaccttacctgaacttgtaaattcaaaaccgtcaaatgaagctacaa tctttgttgtattttcaataagcggatagcctacacttgcatgaaatttatcggatataa ggaagtaaacttttgcttcacttaaaggtaattcagaaacatcttcttttactgaactga ttgtcggtatgattgcatgatggtccgtaacctttttagagttaaatactaccttgatac gctctgtatcaaagtcatttttacccaaaatgttgttgactgtactcacaatcatatcct ctgttaaacatctgctgtctgttctggggtaagtaatcagtttcttttcatacaggcttt gagtatagtcaagtgtctgcttggcactatatccaaaatatttattgcactccctttgaa gcgtagttaggtcaaaaggtaaatcaggctttgtaattttttctttttgaataacatcag taatttcaatcttatcgcctactaaacttataagctgttcagcagcaacttcatcatcaa ttctgtctgtggagagtgtaaatccattcatagaaagctctactgtgtaatatttttctt tctgataatttgctatctcatcatctctttttacaatcatggcaagggtaggtgtctgca ctctgccaacactgtaattttgctgatacagacaagagtagagcctactaatattcattc cgactaaccaatccgcaatagctcttgcctgtgccgattcaaagagattatcatagtctt ttccgtctgttaggttatcaaaaccctctttaatggcactatcttccattgaagaaatcc aaaggcgtttcatcttctttttacaattcacttgattatatacaagtctaaaaatacttt ctccctcacgccctgcatcgcacgcattgataaccgtatcaacctccttatcattcatca gctttttaaggatgttaaactgcttcttggttgcctttgctacttcatacttgtagtcgc tcggaataatcggtaaatcagccatattccacttggcgtacttttcatcataagcatccg gatttgccatttgaattaggtgtccaacgcaccagctcaccctatatccgtttccttcat aatatccgtctttctttttatttgctccaataacctttgcaatggagattgcaacactcg gcttttctgcaataactaacttcatctgtgttttcctcctgttataaatcaaaatagggc gaaagatgttactctcccgccctaactttgcacccaaaataatatgtttttaggtgcgtt tattcttcatcttctacttcatctgcatcatttatttcttcctcgctttcagattcagaa aagaaatcatcatcttcctcctctaaggcttcaagttctttatcttctttctttttcaca accttaaaatagtagcctgctcctaatgcaccacctactacaagaagcaaaataatatag gttcctaaattactcttttcgtccttcttctcaggctttacttcttccttaacaggttct tcttttactacttcctgctttggtgcttcttttttctccaccatgttaagcaaatcatct tcagatacttccgtaagaagcattacattctcactatcttcatcatgattgatgattaaa tgaaaagtcttaccgtttttcgtttgaaaggtaataaactgccttgcatctgccgaatac tgatccgtttctttgttatcgctgctatctccatgatgaatcggatactccttatttgca ttatctttattctccgtaacggatgctctcgcctttgacggagatgaagctactcccttg ttggtgtttacactcttacttgcagaccccattgatgaatcctgactgttattcgcagga gcttttgccgtcaacttattgggatagcgaacttccttttctttctcctttacttccgtt ttgcctttaccggtatcctttgtagtattacctgagcttaccgaatccgatgagccttta ccggtactacttacagaagtctgtggtgtttgaggagaaatacctgaacttgtcttaatt ccggaaataggactaatcggtgtaactgattgtgatgttacaggagctttatttgtttca gttgcctttttctcaagctctttcaccttttccgtcagcttatctatttcctttttcata tcttctgataagtccttatttcccttatctttcttcattttttctttcaggctatcaatt tcatcttcaaggtctttaattttattcttttgcttatcacttaatttgtctttgtcctta agttcgcaatttaacttatcaagtttatcctgaagctcttttgcctctttttctattttt gaaatatcgtctttagaaagctctgtctgcgttcccttatcttctgtctgagtgcattca tcctgctttggcttttcttcttccgtctgcgtttccttatccttaacctccatctttgct accttacggataatctcatcttttccatctccctttacctcataaaacagaaattcatca atgaatttcatatcatctgggagcattggaagatctccgctatcaataagttgtcctttc tcagcctttatcttttcttccttaaagaccttttcatcttcaaagatataccttacattt acttcaacttccgtttgaacagcttcgttttttgttggagcttcagatttttgctcctgt gcataaacaaccgtccaaagacctaaaatacaactaatacttacaattaccgcaagtgct accgtccaaaacttattattctttttcaaactggttttcatttgttttctcctttttcat ttctgctttttgtctgtttacctttgctatcaaatcgctgattgtgatgttgttctttct gcaaatggcaatgatttcttcattttcaagctcttcttcacgaatgaataaaggctccaa ttcttcatcaatcagagcctttttatcctttaacttctttattctgttttttactgttgt aagttcctttttcaaattgttacctcctatttctttacatttggcggaaaaccgaatcct acgggatggtgcttacaaaatgttgctatccaatcatctaaggtagttactcttattcga ccgatgttatcaatcacttttccatctccaatgtaaatacctacatgaccataggtaagc cctgcactgcttccgctactgctgctttcaactgccacaagcattcccacttttagcttt gacctgtctgatgtaaaggtatagtttcggtacatatcacaggcattcccgcctatatat ccaagtcctgcattttgatagacctgtgatacccacatggcacaccagcctgcacccgga gatggcgtaatgtatgcagcattaacaatcttcttttgtacttccgtagatgcctcatac tcttttccaccgccgatacctccatttgcactgataaggtcagaattaccaaaggcttct ctcatattgccttgtgcaaggaacaaggcttcatagtgctttagattatcgggatagttt gcaaagacctttcggataatactgtccatctcttttttatgaagcgttacgatgagtttt ttatactcataaggttcttcgtggctttcggtatattcattgccatcttcatcggtatag gtttccgtaaccgtcctgtatctgatttcaatttcttccctatactcaaggtcatacatg gactcaaataattcttttaatatggattctacttccgatacactctttacctctccgcac cttgatgtaatgtaggataaaagctcatggacattatgaccgatgtattctgtattattt aagatatattcatcatatccaggataattttctttcacatagtcaacttcactttgaagc tcaccctccatatctgaaaatttctgattgatttcacttaggacatttggctttgataaa tagcttgttgtaagcacagagcttgtagagttcataaagcctgtcattcccgttcctgca aagttaatcacaaaagtccctaagataatgatacctatgaaaataagcattagtcctttt gcttttcggataatcatatcctttgagcttttcagtgttccgataagtccctctttaatt cgatctctaagccttgacttattctcacgagaaattgctgcctttacctgatttttcttt tgaaatcttttatatgcacttgctcttttatactcatccgtctttttcagttcctttttg gcatcacgaaattccaactttgacttacgctttctgattttatagtccttatttgtaagg tcatagcctcttttagctcttttcttatcagagtacttctttatgccatgaatgagcttg gagcttgtatctgctgtcttttctcctgcttccactccttgattttcatcacttccatga gacaagtaatctcttacagtttcacttcctttagcaagtcctgaaagggcagataccttt accatgtctttttttagctttttcttttggtcttttgataggctgctataaacttttccg ctgacagcatcttttcccgcctttttatcatcagccttatttccctttggtgcatcgtcc tttttccttgtataaaggctttcagaatagttcttcctcttgtacctgcttttttgagtc ttatgatttttaaaggaattttctaatgatttttctttatgggaaagattatcctccaca tcataggtcgattcaaaatagttgctgtctctaaagtcattatcgtatctgtctataatc ccgtcattatcaaggtcttttcctaaaggatcatagatttttccatccttaacctccgta atataatctgatcttcccgtttcaattgcggaatttacgtctcccttatctgaagttcta tatttttcgtttctcttggatgttccataagacttttcattatcagcacttaccttactt gttttttcatgcactttatcctgaaaccgttctttctcatgaacgattttacctctgtaa tcatcgttatgttttagcttactttcttcaggtatcgtatctgttttactatgaaacatc tctctttcaaggcttgccttatgcctttccttaaaatcctttttcagcttctttcccata ggctacctcacttcttccggcttggtagtcatcttctgatataaaattgtatctttcgga aacttatcaatgaaaggcacaatggtatttccaaagaataagagtccctcaccttcattt gaattagtaacatatctgagctgtggaagtgagattttaagttttcttgcaagtatctcc ctatctcctgatgcttgattaagcattaagacaaagtctgtattgtcaaagatattttct atctccttactcataagtaggtctttgacattctgcgtaatacctgttggaatacctccc catttacgaaatcttttccaaatctctacggaataggatgctgtctgctcatcttttaaa agcaaatggaactcgtcgatatagtaccttgtagccttgtttcctctgttttgtgacacc ttattccacacctgatcctgaataacaagcataccgattttctttaattgacttccaagc tccttaatatcaaaacaaaggagcttcttatttaaatccacatttgacctgtgattaaag acattgagagaccccgatacatagatttccatctctgttgccagcttcttaccgaccttt tcttcctgcccttttaacatatcgtataggtcttgaagtatcggcatattgtcaggagta ggatgttcaaaatacttttcatagattttaggaaggcacctatctataacggacttttct tctgctgtaagaccactaccgcctactacaagctcaagcatactcatgataaagtttgcc ttgtctttcagcggtgcatccccatcaccgtagttcatgtttatatcaagaggattcagg taatccttcgacttactgctgaccttaatgacttctcccttaaactgccttacgaggttt ccatactctccttccggatcgcagataatcacatcatcatctgttactaaaatcgcattt gccatttctcttttggcactaaaggacttaccgctgcccggagttccgaggattagaccg tttgggttctttaatttctttctatctgccataatcaggttatggcttagggcatttagt ccgtagtaaagactattacttgaattgataaaaagctcctctgtggtaaatggcataaat actgccgttgatgagcttgtcaatcctctatctatttcaatcttatttacaccaagaggc agcacgctcactaaaccttgttcctgagaatggtcaagtcttttcagcttacagttatgc ttatttgcaatggagcttatttgagcaattgtgttatcgagcttttgcactgtccttgca aagttcataaagacgatacttaccacaaacattcgctcatctcttgtctgcaagtctttt aagaggctctttacatcctcaccataggtaattaagtccgatggaagaatgtccatatca taaccgcttcttaccgccttcttattttcctcaattttcatcttatcaatatcagtgttt tttcgttttaccatcttaatggcttccgattggtcgattgccctaatatgaaaggaaata ttgatgttatcgtcaatatccaaaaactcggataacatcctatctgaaagctcactggca aggatttgaaaatgacttgttgctccgatgaatttgccgaacttaaagtatctactcggt gtaaagttaaactcatcaggcacaatatatgtctttgtgctttcccttttctttaggtct ttgtaggaaaatttaaatgttttatttggatttaaaacatcatgaagtatctttagcctt tcttctccgtttaggctttctgctcttactcccatacttttaagactcgataatatatct atctccagtctttcaagttttgatgttgcctgttctaaattatccgcttccactgtaaag gttacatactttgattttttcaatccgttatttccctttacaatctggcttttaagcatc tctctaaattcaaagcgtatatcgtcgaaaccgtcctttttatccggtatctgaattgcc gacttcatttcttcgtttcgtccgagctgattgatatatgaaaactcaatgctgatactt ggatcaaaagagtttaggaagtttgcaaattgattaaaaatcaagtccctatcttcatct aaggcaagctgatagttaatgtcctgaaaggctatacttttactgaagtgcttttcatca agctggcatattccgctttttaaaagccttagatagggaatggtatcttctaccgtatat cttttcggttctttcttaaagataaggtcaaggattcctcccttatctttttttgacttg caattacttttctttaagtcccgcttttgacttctcaatgccttttcgttttgcatgagt tttatttgctgaatttttcttttcttgttcaaggtaaacctcctttctcactctcttttg cggttgataaaacttatgaagataaatgtacttaaagtatttctcaaatgtcagtccgtc tttttcaaatagtgtgatgaaaaagataggaagcgtggatacgataaggaatatgacagc tatgtcatttggcacaaacttcctcataaataaatagactggtattccaaccagtcctgc aagtgtgaagcctatgagctgccttttcgttaggttaaaagcaacctttgtctttaccct atttaagtctttagggattggtacatatgccatatcttacctcccatcttctttaccctt tgacagctcctcaaagtgttcatatacagagccgatttcttcctgaatagtcgcaagctg ttcgtctgtgttcttgttatatctttgctgtattaggtaaaaatcgttatggcagcgacc aatgtcctctgttttttcttccaattcttccaccttattatgaagcctgatcctatcaat tatcgccataatacctgctccaattactactataaatactgtttttcttttgttcatatt acccttcctttcttttagtgtgcatttaatacgcttttggccagtgttccgctctttaac atcattaaccctagcaaaaccgcatatccaagtatcgtaaaggtacttgtgtgtatatct gttatctgtattgtcttaactaatactgcgtatattccaagacaaaccattaaaaagagt ccttgtaaacctatggcaaacaatcctttgatatagtttgttccaatctgtccccactct ttgtttcccattgtggcaaatggaatggctgaaatggatgagtaaacataaatctcaaac attcttccgtaaaccacaagcataatcacaattgaaatgacctgtattgccacctttata agcgaggtttcaaagagtatcatgacaagctctccaagacctttatcctttaatccatct accatttttactatctgatctccggagataacggcagaagtattgattacccctgccgct ttatttaccatgtgctgtgccacatcaaagaccgccattgaaaactcaaatgcatgtgat actaaccatacagcaatccacatcttgatgatgtacttgaaaaattcaaaagtatctgta tcgtgcatattgttcttttgcattaccatattgataagctcgatacaaaggactgctgtg atgattagccctgctatgggaataatgacggaatcgttaatgcttttaataaaggcaaat acatctccgttccaccccataggagtttttcctacatctgttgcaactgcaccaacttta tcgttgatgtcaagaaacatggactctaagtttgcttgaataccgcccagtagaagctct ttaaagaattcttctatcttgtcgaatattccaaacatctaagctctccttttcttatta cttgagtacatttgcaagaagcggaatcagcttaagtccgataaggacaatgcctcctcc cgccataagctgcttgatgccctgagatttcgctcccggattatcattaccatatccttc cataaggttaataactccccatgctccaagtccagcacctactgccataactaaaatctt taatacatttactgcctgtgcgaaaaattccataatttattcctcctcattttcttcttt cttctcaatcttgttatatgacttcactacaaagtttttgtaagtctttccctctttttc acgcttcttaaagtagccgaatacatgaatcaaatcgcctttttcaaagtcctctgcttt ctctgctttttctccgtaggctgcacaattgatgtactccttgccctttccatatttttt tacaagcgtaaagtttacaacttctacttcttcaccctctttttcaaaacttgagaaagt aggttctgccactaagttggcgttgatgttaatcatttcttgtttcatctttttaaattt ctccttttcatttcaataaaaaaaacgactggagtttttcttttccaatcgctgatactc ttactatttagttttcgtttaagtgggatttctgatccttatcatcttgcctcctgattt tgaataaaaaaacagcaaatctttttaagacttactgcattcttgtaataaccgtctctc tatttaattttgcttttccttttcgcttcatatagctttctatgtcaaacaaattcttct tgtcataatcctcaagcagcttataattcttgtgctttgtaatatcgtatttatctgaaa gaaaaggtctgacacctctaagctgaaatatacattttccaccgtccattacagtaatct catcttgactcatcagttct |