Block details
fasta C_difficile_CD00111_1A_020922.fasta
contig u00000crpx_c_020922
start 628886
length 12385
strand +
type core
seq atgggtatttatgtataataaaaagcaagaactttaataggtttttgctttttttgtaaa
tatatataaattaaattcttattttgtatgttttatatattgatgtttatttttttgttg
atatgattaaactatttataaatagcgttttataaattggtattttgaagggggataatt
atgaaaaatgtaaatctaaaagagataaatgaaaaagatgtaattttggaagaagagata
aataaaaaaggaatggataagaaaaatataattgagaaggaagagataaataaaaaagga
atagataagaaagatataattgagaaggaagagataaataaaaaaggaatagataagaaa
gatataattgagaagaaagagataaataaaaaaggaatagataagaaagatataattgag
aagaaagagataaataaaaaagaaatggataagaaagatataattgagaaggaagagata
aataaaaaaggaatgaataagaaagatataattgagaaggaagagataaatgaaaaagaa
atagataaaatgattggtaaaaaagatgagataattgatgagaaagatatagagaatttt
atggatattgaagaagataaaaaaagtatcaaagtaagtaaaaaaagtactaaaaaaggt
gaaacggagaaaaaaacaaagaagagtagttctaataaggctacacaaaaaacaagtaaa
gaaactaaaagtaagtttaaaattaaaaatgagtcagcaaatgaaaaagacgtaaataag
attttagacgagttagaaaaactgtacccagatgctaaatgtgagttaaattatgggaca
gcctttgaacttttaatagcaactattttatcagcacaatgtactgatgtaagagtgaat
aaagttacttcagagttgtttaaaaagtacaacacagctagagactttgctaatttgagc
attgaagaaattagtaaagagataaagagttgtggtctttacaaaagcaagtctcaaaaa
ataaaggatacatctgaacagctatgtgaattatatgatggtgaagtacctgatagctta
gaaaagcttataaaattacctggtgttggaagaaaaacggcaggggttgtacttagtaac
gcttttaatcatccagcaatagctgtagatactcatgtatttagagttagcaatagaata
ggaatagtggacgagccaaatcctcaaaaaacagaatttgcacttatggaagctatacca
aaagaaagatggtcacactcacatcatgtattaatttttcatggaagaagaatgtgtaaa
gctagaaatccagaatgtgcaagttgcccaataaaagaagattgtaattattataaagaa
cttaatgaaacgaaataacttttagaaagtaagttgtacaagagggattttctgatataa
taatacttgtgaaaatgttagataaaaaactattatatacatgaaataaaaattattatt
aacattattttatataatagtataatattattgttattctgtttataaaataaaatttga
taaataaaagcgatacttagggaggattaaaatgtcattaaatatagtattagtagaacc
agaaatacctcaaaatacaggaaatataataagaacctgtgcagcaacaggttcaacttt
acatttagtaaaaccactgggtttttcattggatgataaacacctaaaaagatgtgggct
tgactattgggatatagctgatatacaatattacgatagctttgaagaattacaagaaaa
gtatccaaatagtaaatactttttttctacaacaaaggctaaacagtcacattcagatgt
gaaatatgaagaaaattgttttatagtatttgggaaagaaacaaagggattaccagaacc
tttgttgaaagcaaatatggatacttgtattagagtgcctatgttggatgttgaaaaagc
taggtcattaaatttatcaaattcagttgctattgtagtgtacgaggctttaagacaaat
aggatacccaaatatgaggtagtttcaacaagcctaaatgagaaaggagcatacttaatg
aaaaatctaaagataatctgtgacagtttatcggacgtgccaaaagatttgttagataaa
tatgatatagatatagtttcattaacagttatactggaggaaagagaatacaaggataga
attgatatatctggagatgaattttataaaaggcttagagaagaaaatgtatatccaaaa
acttctcaagctacttatgcccaatttaaggaaatttttgagaaatatacaaatgaggat
agagagatactttatatagcagggtctgccacagctacaggtacgtatcaaagtgctgta
atggcaaagaatgatgtagatggtaaaatatatacatatgactctaacttgctttgtatg
ggaactggtttacttgtaataaaagcaggagaacttgcaagtgaaggaaagtctgttgct
gaaatattgcctgttttggatgaattaaaagagaaggcttttgttatattttcagtagat
acattggaatatttacaaaagggaggtagaatatcatctactaaggcagcaataggaagt
atattaaatataaaaccgattcttgaaataagagatggattagtttcgcaaatatctcaa
gtaagaggaaagaagaatgtaatttctaagatgatggaattgataaaatcaaattgtggt
gatgatttatcagaccaaattgtgtatataggatatagtgatgattttaaggaaaaggaa
caattatctaaggttatgcaagatgaattaagacctaaagaaattagatttttccaaatt
ggtgtgtgtataggtgcacatgctggtcctggtgttactggtatcatatgcttaaaaaat
aaataatatatttttgggtgacattatttatttttttattaaattaggatagaatattaa
ttattgagatgttaaattggatttattttggatgaaattaagtgttgatatattagattt
agtttgtagggaagtgtgtaaatagataagaatctattgcacacttttttatagtaagat
ttattaaaaaaatttcaaaatgtacttgtaaattgtatataaaaaaattataaataggat
gtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagta
aataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatg
taaaagtaagtaggatgtaaaaataaataggatataaaaatatcgtaaatgtatgaggag
tgaaatttaatgcgtttcaaaagaatattgatattgatgttaactgtagcaatgatagct
ggaatgttggttgggtgtgctaataacccaagcaataatcctagctctagcaaagataat
aaaagtgatataagcgataaaagtaattcaaaaaaatctgtatcaatgatactagatatt
gaaggaacaaataatgaagctatgaataattcagctttattagcattaaacaatgctcaa
aagaaacttaatatagatacaaacaaagtggaatcagatgattcctcaactttttctaat
agtatagatattttatgtaatgacaattacgatttaattatagctgtaggagctagattt
gcaaaaccattggagatggtagccaagaaatatccaaagcaacaatttgcaattatagac
tatgagtatgacaagcaaccttctaatataacttcaatttcttatgaagataataaatct
ggatacctagttggattaattgctggaaaaatgactgaaagcgataaggttggttttata
ggaggagtaaagagctctagtagggataaatttgaatcaggttttagagagggtgttaaa
ttttctaatagtagtataagggatatttcagttgagtatgcagatgtttttaaagatagc
aaatcagtagaatctatagctaaaaaaatgatggataatggagtggatattattttttct
actactgaagatgattcaaaagctgtaatagatgcagtaagggcaaaaaataaaaaagtt
atagcaacgaataaagaccaacatgagttagctccagaaaatgttataagctctattgta
aaagattttgagaatcctacttataatctgatacaaagctttgtaaaaggaaattataaa
ggcggaaaagttatagaaaacacagttaagtctggaagtactgggcttgcccaaaatagt
tctcaaaatattcctccagatgtgttagaatatgttaataagaacaataaataatctact
ataatatccaagaatacttatgactttagttatgaggtgaattggatgttataatagaca
tatatagaaagacatatgcagaggtaggttagacctatctaaatcagggagtgaattttg
tgaaaataaaaaggatattgatggcttgctttgtagtagtttttacaatttttatattag
ctatatgtaattttgattttggatttgataaagtaaataagaataattctaatatagata
gtgctgaatcgaaacagaatgagtctaaaagtttgccaacttcagcagaaaaggataaat
caaatagcaaaagtaagaataaagaagatgacacagaagatgattcatatgtaagaaaaa
ctattggagtattgttagataccgaaaacttaaataacgaatcatataataacaatgtac
tatcagccttaaaaagggctgacgaagattttgatgttaggataaaacttgaaaaaccaa
agacttctaaaagttttaaagagagtatagaaaaactgcataagtatgaaccagatttga
taatagcagttggagccagatttgcagagccaattaaagaagctgctactaaatatccca
aacagcaatttgcaatagttgactatacttataaagttcagccagctaatgtaatttctg
tatcatttcaagataatgttactggatatttagcaggacttattgcaggtaaaatgactg
atactgggaaggtcggttttataggaggagttgagggttctagtagagataagtatgaat
ctggatttagaaaggggcttaaaacttcaaataaagatgctgagttactagttaagtatt
caaatatatttgaaaaccctgaatcagctagaactattgcaaaggaaatgagagattctg
atagagatgttgtattttcagctacagaagatgatagtaaaagagctattcaggtagcaa
gagaaaatggtggtaaagttatagctattaataaagaccaatacgatatggctccagata
atgtaataagttcaattataaaagatatagaacaacctgtatatgaactgataaagaacg
ttgcaaaagatggttttaagggaagtaaagtaatggaatttaaaataaaagatggggaac
ttggcttgacttcaaagagcagtagaaatataccaccagatgttttggaatacataaaaa
aagagtataacaaagtgaaagatacatattaattattgatgtagaagattataaaaatat
attgcttaagtttagattagcaataaaaagatatatttattaaatttgtgctaactgtac
aaaatatattgattaagtttagattggtgataaaaggatatatttattaaatttagtcta
actgtacaaaatatattgattgagtttagattagcaataaaaagatatatttattaaatt
tgtgctaactgtacggaatatactgcttaagtttagattagtgataaaaagatatattta
ttaaatttgaaccaactgtacaaagctatactaattaagcttagattaactatataaaat
tataacaataagtgtgtgggcagaaaaattctgctacacactttatttatattcacataa
aaaatttatcaaaaaaaagaaaaaggagtaaaaaatggaatttacaagagaaccatttat
actagatgacgatttgtgtctagctttggtggacaaaagaattagttatctaatggaaaa
tgaattaaaattaagaaatatagagataataaaaacaatagaatgtaaagaattatatga
aagcataaaatatcacccggatatatgtatttgtaatttaggaaaaggagatataattgt
tgcgccgaatgtatataatcaatacaaagagttattaagtagatataaatttaatataat
taagggagaagctaatttattaaatagatacccttatgatataccttacaatattgcgat
agttggtgactatgctatacacaattttaagtatactgacaaagcaatattagattatat
tgaaaataataaacttaaaaagataaatatagagcagggctattctaaatgctcaatctg
tatagtagatagaacgtctataataacatcagataaaggtatttggaaaagtatgaagaa
tacagaaatagagtgtttattgatagaaaaaggtcacataaatttatttgagatgaatta
tggatttataggtggatgtacagggttgatttctaaggataaactagctttttgtggaga
tgttaaaaaacatcctgactatgaacgtataaaaagttttgtagaaagtaaaaacaagga
gatagttacacttagctgtgaaaatttactagatataggttctatagttcctctcatgac
aagaaaggagcgataactttggttgagaaggataatatttcttccatgaaatttttgagg
aataataatgtaaacgatagattaatatatacgaatgacattgtagaagtagtgatagat
tctgcaaagcaagaagtgttaaataaaaaaatacttaatggtactaaagctgaacaaaga
gctttaaatattgatgagatatcaacggaaataactagtatgataataagtataatgaaa
gagaaacttttgaaagaatacattctaaaatgctatgggcgtacatatcctgaagataaa
aataatatatacatatattcactgaacatatttgctaaaaaagagatttttatgagagaa
acagtatttactagggtgagaaattatatagaagaaaatgattttataaatgtagaaggt
tttattagatttagaatgagagaatttatgaaatatatttctgctataggtgatattgca
gttgaggagtatttaataaagaaagaccaagatgaatttataagagttttaaaatacttt
atagatactcaagaagaaaagattgatttgcttaaagttcatataatggaagataataca
tttgttttatacgataaaaatggaaataagatagacagtatagatgatgaagaaattata
aatatggtaataagagaaaatttaaattatgaggactttttaataagtaccttattaact
ctatgtcccaaaaaaatagaaatattggatttgttaaataataattgctcaaaggaaatt
atagatactgtagaagcaatttttgaaaataaagttagtataattatggaaaactagaat
ctaagcatataaaagctatccatataaaattaaaaaaattctttttaaatcgacacaaaa
gacttataattgtatataaagctatagtataactagtgttattaagtataaagaatatct
acttgattaatacaatatagctggcaaatatacaattgataaggagtaattttataatgg
ataatttaattaggatactgatattagctgttattggtggatttataggttatgttacga
atgtagttgctataagactgatatttagaccaatagagcctattaaaatacctattttaa
atatagaaatagtaggtcttataccaaagagaagagcagaaatagcagcaaatgtaggag
aaataattcaagaagaatttctttctatggacgaaatacttgcaaatatcattactgacg
aagataaggaagaagttgtaagatacataaaagcaagggtaaaaattataatacatgaga
aagtttcatttatcccgagtggtataaaaaacatgatacaagattatctaggagagataa
ttgagtctgaagttaagcaaagtatagatgaattgagtaaaaatataataaataaagcaa
atgaacgtatagatatacaaaaaatggtcgaagataagattaatgaactagatttatatg
aattggaagagataataataagaatagctaagaaagaattaaaacatatagagtttttgg
ggcttgtcttagggtttttaataggtatagctcaagggttaattactatgtttatttaaa
tatatgagaagtagcatttatttaagtattaattgtatttacctatttgagtgagttact
tattaatagtatttagatattaattgtatttacctatttgagtgaattacttattaatag
catttagatattaattgtatttacctatttgagtgaattacttattaatagcatttagat
attaattgtatttatttgattgtgttacttattaatagtatttaagtatttactgtacta
cttattaactatattaagtattgattgtatttaagtatacaaaacctaaaaagagtacaa
aaattagaagttagttttaataaaaattagttttagtatttatctagtcatatctatcat
gcatgtggatacgttttaaaaattttaaatttatgaaaatattataatatcactataaat
caagagattaatttaatataaaaatataagaatattggtttacagctgattgagatgaaa
aataatgggtaattaatatattacattaatgttgattgatgtataactatctgttataat
gaaaatatattaaaaatcatagtgttgaagaggaagagtagagtagaaaccattctcaga
gaatttgggtctatggctgagagcccatgtaataggtctatttgaaaactaccttggagc
tgagcttattagcagtatttgttttgtactatacgtgaaagtgctcgggtgacgacctta
tagtcatcaagagggttgtatatacttgtatacgccaacttgggtggaaccgcgaattaa
tatcgtcccaaacatatttggggcgattttttattacaaaaaatctaaaaattatttcaa
taaggaggaaaaaacaatgattaaagttgctttaaaagatggctcaataaaagaatttga
aaatgctatttctgttatggatgtagctaaatccattagtgaaggattagctagaaatgt
ggtagcagcgtctgtgaacggagaggttgtaggtctggaccacattatagatactgattg
tgacttgaatttatttaagtttgaagataaagaaggtaaggaagtttttagacatacatc
agcacatatattagctcaagctataaaaagactttacccagaagcaaagcttgctatagg
accaagtatagaaaatggattctactatgatatagatttagaccatagattagttccaga
ggacctagagaaaatagaagctgaaatgaaaaaaatagctaaagaagatttaaaaataga
aagatttgaacttcctagaaatgaagctttagagcttatgaaagaacaaggagaagacta
taaggtagaacttatatctgatttacctgaaagtgaaataatatctttctacaagcaagg
tgattttactgatttatgtagaggaccacatttaccatctactaaaaaggtaaaagctgt
taaattacaaagtgtagcaggtgcatattggcgtggtgacgaaaataataagatgcttca
aagaatatatggaacttcttttgagaaaaacaaagacttagaagagtacttacatttact
agaagaagctaaaaagagagaccacagaaaattaggtaaagaattaggattatttatgat
acctgaagaaggtccaggattccctatgtttttaccaaaaggtatggaacttaaaaatga
attattaaaattctggagagaaatacacagaaaagctggatatattgagatagaatctcc
aatcatattaaatagaaaattatgggagacttcaggacactggtatcattacaaagaaaa
tatgtatacagttaaaatagatgatgaggattatgctataaaacctatgaactgtcctgg
tggattaatttattataactctcaactacattcatatagagatttcccaatgagagttgc
agagcttggtagagttcatagacatgagttatctggtgcattacaaggattaatgagagt
tagagcatttactcaagacgattcacatatattcatgttaccagagcaaattaaggacga
aataaaaggagtagctaacttaatagatggtatatacaaaacttttggatttgaatataa
tttagaattatctacaagaccagagaactctatgggaagcgacgaagagtgggaagcagc
agaaaatggattaagagaagctttagaagagttaggtctaccatatactattaatgaggg
tgatggagcattctatggtcctaagatagacttccatctaaaagattgtttaggaagaac
ttggcaatgtggtactatccaattagatatgcagcttccaagacaatttgataatactta
tattggtcaagatggtgaaaagcatagaccagttatgattcatagggttgcttttggtag
tatagaaagatttataggtatattaatagagcattatgctggtaaattcccagtttggtt
atctccaactcaagttaagatacttcctatatctgataaatttatggattatgcaaatga
agttaagaaagagttatttgataagggtataagagttgaattagatgatagagctgaaaa
aattggatttaagataagagaagctcagcttgaaaaagtgccatacatgctaatagtagg
tgaaaaagaagtagctgataataatgtttctgttagatcaagagataaaggtgaaatagg
tagtattaaattagatgaatttatagctagtatttcaaaagaaattgaatcaagagaaag
tattattaaagactaatatatattatattagtagctaagatattgttatataagataagt
ttaatcaatatgttgatatgttgatgcatagtgattaaatttatgaaaagatgagtataa
ttagaggtacagttaatcatatttttatgattaatgtacctctagttttttgtatggtag
atttattaataaatatatcatagaagtgttttgaacatggaaatatttatgtgcattctt
taaataaaagtttattttttgagtgataattaagtgcttgttggtaaggttatggctgta
aaaatcataactttattttcatatttgttccattttcataaaaattattatccctttaag
aaaatttcttaatcctcttgaaatatttcctttttagtctaaagttaaatttctttcttc
aaaatgaatatttaaatgaactaaaatttaagtacattttctaatcttatgagtctattt
ttcatagataattgccctataatagaagaatctatgttggtgctatgtggtgacaataac
agcattgtcagtgattaattaatgctttataaatgattaattagtgttttatgttatttt
tggacttaccctctatacatagattaatttatttaactttagatagagagagaatgtcaa
gtacatacacagacattagagtttaagaaagtgtttatggagcaagaacttttaaaagag
gtagtgacttagtttaatttcaagaaatgataaatacaaaagaggaaaaagagaggtgtt
gaaatgatagaaaaagtagaagaaaaatctaagattattaaaacatcaaaagaatataag
cgaactataattgaagaaaaagataaagaatggaccaaaaaattaaatgatatacttagt
agaagtagtttttctaatgatgaattagataaaatcaaggcattaattccaaaagagatt
ttgactaatgaaaatgttggagaagttgtgactgaagatggatatgctaagcctgagtat
gatgaggtatttaaatcattgttcactttaaataatgaatatgatttacttgtaaatttt
ataaatgatatcctaaaagatgctccatatgctaacaggaatatcaaaccgttcactcaa
ataaagagaataattagagttgaaactgacccaacaattaattacattggagagaaaaga
cctagacttgatattttggctgaaga