Block details
fasta C_difficile_CD00005_1A_020472.fasta
contig u00000crpx_c_020472
start 3611386
length 15838
strand +
type noncore
seq ttatatcctccatttatcatagaatataatcaagagtacataagcactcttgattataag
ttatatttgaaagttctcaattatacttctttctatctgaagcattcttggtcttattgt
tgtatatcctgttgaatcgctagcatcttttgtatgaatagtttttttaggagaatcatt
gttagaatcaactttcacaattccactatctcttaactgtttcactagttgtctttgact
tattcccaaatgtatacctctttttttattttcaaattctataaaagaatatactttatc
tgtgtaaaagtaataatattccttatccttatatccacatatatattctaatttatcttc
tataacttggttctggtcatttaatgttgctattcttattgactttgaatttattgattc
ctttaatgtatttaaaaatatatctataggtgagtttctcgatattaattttatctgctc
ttctattaatctttctacaactttaatcgctctatccatgtactcatcatcttcatactt
atctataacacctttatctctaatataatttaacatacaactaaaacctactaatatcca
tgcactagactcaatagttcttccatgtatatcatctttatattgttctctaatttcatc
cctgtaagatttaaagttatataataatatattagataattcatcaatatttcccatttc
agataataaccattctatatatcctctcattgcttctccaagcaaatgactattattctg
taattcagttagtatatttaaatctactgaacttctatttaattctattgataataatct
agcattagatgattctccacatatcacatcttcacctgttattaatatcattcctctagg
tctcttagcatcctttatatctaacttattacttgagcgtcctttccctactctatctcc
atacattcttataatggattctgcctttgagtcttgaatttttttatccctaaagtcttg
tttaggtgcaaagtcatcacataagtataagctatcctttaacttattagcttttaattc
aatagctgtaatcgtatcattaaatgtagctggaatttttttattaaaatcaccaaaatg
acttaatacaacttttgatactgctgtttttcttgatcctgtttttccatatgtccatac
tatattttccggtggtttaatttttctactgataatttcaataagtggagataggtaaac
taatgaagagaatataatacctttatcatcttctattaagtctactagctttaaactcat
ttcacatgctttatttatgtcactaattttatctggtagtatatagttatctattgattc
atctaactcaacttgaacatctgaacctcctataactcctcctccatgtagatatatcca
cttattgtcttgatatatccatcctgtatggtcatatatatacttagtttttatattcat
acataagtgttgtatcaattcaataaagtcattaatatattttttatctatagaatattt
aaaaccccaattttcaatcacccatgtagttctatttatggtattcgaatctaatattac
ctctgataatagctctccattaatccccatagcatttatacataaatacatttttccatc
tataaccctttgttctattatatttactaaaaaattacatatctttttattagatgaatt
cataacggtgttattatctaaaacatttaatcctatttcctcatataatttaattaattc
ttctctgtttattgccttgctcatttgtattcctcctatttatcccatttaacaatattc
ggtactaaagatatacctctatatttaacatttgtatctttaagtaagttttcaattttc
aagtgtaatctacttaatcgttgtaagtttttttcgtatgatcctcctgtattcataagt
atgtaaatagcccttgcgttatcttcatactctgtactacctaatatagttaaactatat
tctttttcatttaatacaccttcatcaatcataccttctaattcattacgatttccttct
tcacattcaataagtagaattaattctacctttacacttttaaagtttgtcattaatata
cctcctgttgtcaaagcccgaaaggccgtactttttcatcattaagctattgttcttaga
ttttattaattagctcgttcctacaaatatgattatataataaataatgactactcatat
cacctaaagataaacgttttcaccaaatattttttatttttttcaaaaaaaatagagaaa
atctaattagattttctcttcttcttaattctatctacaattttcttcttactttctata
tttattgcttttataacctctccatactttcttacatcatctatattataatctactttt
attttatatttattttcaaatgactttcttccattatttatattataaatagatttaaac
tcctctaattccttttcactaaaatttttataatagttgttcttactaactatatttaat
aactccaaacattctatatttataattctcattataagactaacttctttagtaaatttt
tctatatccttaccttcattagttgacaatatattaaataacttatcgcttagtttctct
cttatcgttaaaactggaactatgtgtatataagcaatagtataagaaataaattttact
tgattttctatgtctttaattttatttaagtttttaagagtacactttcttaattcattc
gctaactttaattctaagctataaaaataaatatttttatattcttcattactatttata
atctcattatttaaatattcatatatatttttataattcttatctgtcattttttcaagc
atattagattttattttcttatgtgccttatttgcatcatgagtcagtttagtttcatac
tcccacattttagtcaatgatttaagttctaatttacattttctactaatttttcttcct
ttgtaatgttttactttattattcctgattcctgctaattttaatatttctttatcctgt
gtagaatttgagagatccctacaaactttatcataaaacattttaaagttttgatcttct
cctatccattcacttatattttccatatcatcatctgatatgtcgtcttcaaacctttct
ttatcaaaaatatctatagccatctgctttaaatttgaattacctagctcatttttcttt
gtttttgctactatataaaatttcaaaaatgatttaatctcatcaaaatattcttcgtct
attactcctagatttatatattttctatactcaacatgtttcaaaaatttaattctaata
tctattagactatataatgttttagcaatagtatcttcatcttcttcgtattcaaataaa
ctatcatctaaatctaaataccagtatttatctttatctatatatgtgttatcagtattc
tcttcaattatatgtaatttaaattcttgagtatctaaagtattgtcataatcatctaca
tataagtaatctctctctctattttgtaatccttcatcttctaaaaacttatcaaatgtt
attttacttaaatctatatcttttttgtttatattgcctttcatatttataaagtccttt
caaatttataataatatatattatttaatttacataaatacaaactttactttaatataa
cttatctgggctttaagggcttaaataaattatatatgaatctattaataatttaaatat
aacttagtatattatggcatttttcgatatcagtatctctatactaatacatagtccaat
tcctattatacttcctattataaatccaatcatactcatacctcctgtatactatttttt
attttctaatacttgctttaatactgcactaaaaattgaaatcccaaacattactccact
agtaaactcttctattgtcatattctacctcctaagctaaacctttaattagttcttgct
tgaaatcatcatctagtacaccagcctttaatcctaccagtattaatgctacaaacttat
ccatagttaaatctacaggccttggaataagtttattaattctatctcggcagtcacgat
acaggcatattctaacctcgtatctttgtaatgacttaatatatattttctctattgcaa
atctttcatctccatcttctactgttacacttcttattatcttgcaatatttagtttctt
tttcaaatagttcctctttactttgcttcgccatgttaattcttcctttctttacaaaaa
taatgccttgccacatttaactgtagcaaggcattatgtatcaatatttaattagttaat
ataattaatttcaatataatttataaattttcctatttttcccattatatttaatgcttc
aaatgacatattttcagaatctaatagtcctttcctatacttgtaattatatcagatatt
tctaaccatccaacatttgataaattcaatttagatgattggtctatcaattagctacca
tagtttgatagtgtatcaaatgttccttgaagtccactaaatgtatttgaattagttatc
ttactataaacgttttaatttctctattagcttattcattatagcaaatactctatctag
tgcctaaatagttttgaagttttatattcttcattattagtgtttttagatttaatatct
acattatcctcttgtttatctgtttctatactgatcctttattagctagttacaaatttt
tatttcttaaatctaatatatctttctctaagtaaattaacttatgattaaacctatcac
tcaataatatatatactaagctactacatatgacaacaaataatattgacgccattatca
tttttgtttatgttttaccaaatatacctttaaattttactttttccctataattaatct
tatactttatcttgaattaattatttcttagataacattcctaattgatctttgtatgca
tctttcattttttcagctatttcagtattattaacctcattacctttcatattctcattt
agtatatattctaatacacttatatatgccattcctaatgctgtagttgttaatgccgct
acagaaccacttatcgctccacctgctatagttccagctcctggtataaacttaagtata
ttcgataccaatgtttttcctagtaaagtagctgatgtaacccctcctatagaacttaca
attgccgttagtaaagctttatcaacttgtaacccaaatattactgttatatgagatatc
atagcaacttgtgcggttgctaataatggagcatctgaaaatggtattggtgaaaatcct
attgctcctgatcctcctacatatcctaaaacccattttctcgactcttcaacctttttt
tttatatctaccttttgtacattaacaaaagctttcttgacctcttttggtattacttga
tatgtaacttctactaatttatctaaaccatatgactttataactatctcatcctcttct
tctactagttgctctgccaaaactggaattacattcttacagtttaaatttaaatcatca
atactagattttaattctcttgctttttttcttgggaatccttgtgtcaatacaactatt
actggtatcttttcacttaactcatttatccattttatatcagtttcttcacatctagct
actgatgtatttatacaataccaacatacatgcattaactcacttttatcatttctttct
aatgaatttctattacaattttctatttcatctaatatctctttttttatagtctcttgc
acatcttcttctaactctaatccctttgtatcgtataaatttattggtaatccttctttg
cttatttttttcaagtgttgtgttacaggtctaccaattccagtttctgctaattcttct
ctaaatatattatttattaatgtacttttacctactcctgttttacctacaacaagtata
tttaccttatccatgttttctaaatcggattgaaatttctttattgtctcacttataaaa
tcaaaatcttgcataaaatattcctcctaatttataaactccaatgttttatattgtcat
aatacaatataatatttaatttttttgtcattttttgtaataaataatatattttttgtt
tagttaagttaaagattttaagtcatttatatttattcttctatcatgtaatgcctcaat
atattaaataattattttatcaaaataatctacagtaatttaatcatttatcttattcgc
tattaatcctattacaaatagtataatcaatcctattactatccactttaacaatcctaa
aactataccacctaatgatgttaatattgcatatgacacaataaaacatccaaaccataa
aaatcctattgggccacatccaaaatacgttatatctagcattgaattaatcagaaaaaa
tatacctgtccccataagtattgctaatactgttaatatcatatctactgtcaatctcct
tctctaattactttgaatttaatctatttttattaattaattgctttatccatccctctg
tatatcctaactctctacacatttcttttattgtttttgttctataattcttcactatat
atcgttccacatattcaatagaatatagtttcattggaaatgttatttgttgtccacgat
aatacttatgtaatttaatgactatttcttcacccaaaacctcaaccatatctgcatata
tgcccttataatcacaattattattgttgttagtcatcactccacctccttttctagcac
taattaataataactagtatttgaaaaagtttcattctgattttctcttgtaaaatctat
ggtattttcaaatatgtactttaatgtataagcccttaaagcccgtatttttcagtacat
atacttattttattcttctttttctgagtatctatattctattccattagctaatgtaaa
tgcatattctggagataaattcaatatatcttctatatcatcactcattaatatttcttc
tattacttcttcttttgaagtattgtttaaccacatatctattaacatgtctttatgtag
taatctatctatatgatgttccatgcttaacatagtttctaattcatcttcagcatactt
ccttaaatctctttcatttgtatatattatatgattttctacttctatatagttacttgt
agttaaatcatcgtagtactcacttgctttatctatagatattgtatttatagttaagtt
gtaccaagcaaagaatatagcttcatctatgtttaaatcttcaagtttattgtatgtatt
tactagctcttgtagcttacaattatctcttattaggtaattctttatttcttcatcttc
tatacatgtaaatatcttttctattacatctacagttttatcatctatattgttgtattt
atctattaactcttttaattcattgaaaaataacttattaattatttcagatttattatt
tatcatattactctctctcctttaatcattaactaatattcatttgaaaacatcattgtt
ctatattcaacattatctataacatatatttttaatttatctttaattttatcattctgt
atatatatcctagcttcatattcaggtacttcttgcttatgaactatctcaactactcct
aatcctataggatttatttcaaatagttgtagataatctttttctgtagttaagtcatct
attaaattccatagtagtatagctatttcaattggtagattttcagctatctcttttgtc
atatacctattttcttttttaaacatgttacaactcctatttagttttaaatttatatgt
attatttttttcaagggctttccgggcttaacctaaatttgatttatttttaattgtttt
ggaacatagaaaaagccttagcctaatttatttaagctaagactcttatatcctacagtt
ttctttaaagctaaagtatttatcctcatctacaataactatatgtatctactaattcaa
tgcataatatttctccacgcttctgtagcatattagttataactatcttccttgctaaag
tcagtattacccattgggtgattgtgaaagcatatcatttcagatgaattggttaatata
gctactttaaatatttctcttggatataccatagataaatttacagtgcctatacttaca
acctctatgctactggccaattctttgtatctaaacataccactacaaacttttctctag
cactatttataaaaaattctttgctaatctataagcatcataaagattacttatttttct
agtttcatatagaacactacgttcttttactaatttaagtaaaactatatcaactctctt
ggcaggagttctctttttattcattctgcttttctcctttatttattaaaattaaaataa
gcatatacaccttatcaatgtatatgcttatttaagtaagtactcagtttcttcattttt
agaaattacagtaacactataatcactagataacaagtatagtgttgaattatatgtatt
aacttcatcttcatatattacatcactaaactcttctactaacccctttaatatatttga
ttttaagttttctacttctttaatatcctcaattatacacacatatccaccatcatctgt
taattttctgttacatccatagttttcatcaagaatattaatgacgttatcaacattttc
aactacttcctttggatattctaataataaatttaaatcttctttcttccataatttaat
catattaacttcctccttttaattttttgcactaaaaaagagatgttcgtatttctacca
acatctctttttaatatttttggtattactacttactcaactatctatttaatatagatt
cattaatataatatatatttataatttaattaaaaacagtttatctatatatggtaaaac
tatatattatatatatatagttttttacaaataatgttatttttttctcttctttgatat
aatttaaagtaaatacattatatttaatcaaaggagcaaaaatatgaataacgataaacc
atttatagagtttgaagaagaagttgattttatacttactgagtgtaaaaaagaaggtgt
ttctatagatagagatactatagagcttattcttgatttagacttaaagtttttagaatt
aaaaggaattgctacacctttagaagatgaataatatacaatagctcataataaagtacc
tatggagagttaattagctctctataggtatcttatctatttgcctcttcatatatcttt
tcagctaaataatgaatcatataattttgtaaattattattagttaatatctccttaact
aatctatcatttctatttttggttttaactatacctctcttaaaatacttcttaccaaaa
gtgctaactaaatcttcataactattagctttagctatatccatgatatccttgtcattc
ttaaacatctcttcataagtatttatcataattctatcatcttccgtaagtcctacacca
aaaacatcatttatttttttaattatatcctctaaatactcttcatcagcttcacttaca
cgagaagtcgcagtttcagatataccaactaactcaccttctccattatataaggatata
tccgttccttttttatcatctaatccaagcttttgcaatttataataatcaaggcttaac
atatcatcaaggtctattctttgtttactctttttaggtaacttctttaaaagtgctact
aaataaacttgcaatcttaaaagatttaagttctttataggataaatctgaattaaaaaa
ttataaaaagtaatatacttttgacattttttcttaaactcatcagattttttttcatca
tcttcttctaaataacaatacctttcaactgccttatcaattaaattattcatcttagca
tcttgagaagaagttcttttctctttatagaataatactgtaaaatcatttacttcctca
tcagtatatactgcatattcatgtaactgataccaaaggtcatttactacatttggatct
gttaccttatcaatattagtcatttcaaaatatggcttatatgcatcttgtatgtcttcc
acactattttggaaatctaatataaatgtttgtttattaggataagttctattaagcctt
gataaagtctgaacagttttaacaccatctagttttttatccacatacatagcacaaagt
tttggttggtcaaatccagtttgatacttttctgcaactattaatagcttaaattcattt
ttatcaaatatattaggtaaatttgaatcagtaatatctggtgctacttccttattcata
cctacctctgtatactcatcatcaccatcttttacagtaccagaaaaagcaacaagtgct
ttcatatcatatcctttttcttttatatattggtctatagctagtttatatctaacagca
tgtaatctacttgcagtaactatcatacctttagctttaccttctaaccacatagaccta
ttatctacaaaatcatctactatagtttcaaccttttgccttatattgtgctcatttaaa
ctaacaaacttatttatagccctcttagcctctcccttatcaaactcagggttatcaata
attttctttcctactttgtaataaacacttataggcataaagttttttagtacatctaat
ataaatccttcctctatcgcttgtttcatagaatataaatgaaattcatgaggtagtcca
tcttcacctatcctcccaaatacttgcatagtcttattcttaggagtagctgtaaaagca
aagaaacttatatttcctaaatttgttcttttctctataagctcattcatcttatctata
ctagacttttcattcttttcattttccgcatcaattaccttagcttcttctaaagtcttt
cctgctaaagtttcttttaatgcattcatattttcaccagatgttgaagaatgtgcttca
tctataattactgcataacgccttttatcaagttgttctatcttaggtagtgcatactgg
aatttttgaatagtagttataataatctttgctctatttacaatagcatctgctaagtct
gatgaatttttatcttcatctatcttaacaacaagtccgtttttgtgctctaattgatat
atagcattttgtaattgtttatcaagtacctttctgtctgtaactacaattatagagtca
aatatagcattattttcttcatcatgaagacttgataacctatgtgaagtccatgctata
gtgttagtcttaccactaccagcactatgttggataagataatttttacctactttattt
atctttaaatcttctactatcttccttactgcatctaattgatgaaatcttggaaatatt
gctctttgattacctttatcatcttcttgaataaagtaaaatctttttataatatcaagt
aaactatctttagtaagtatttcttcccaaagataagaagttttttcttttccttctact
acaggatttcccttacctctattgttacctttattaaacggtaagaagaatgttttatct
ccttttagctctgttgtcatataaacttcatcagtatctactgcaaaatatactaacact
ctttgattaaatccaaataaagtttcttttgggtttctatcttttttgaattgctttata
gcattatacacattttgattagtaaactgatttttaagttccattactataacgggaaat
ccatttaaagataatactatatctaaagtattgttgtgctttgagctatattttaattgt
cttgttattttgaatatattttgtttataattttcatacgctgttttattagtagttaga
tttggtttgttgtagaataattgaaattttccgttcatcattatatcttctacaccattt
ctaagtacacttataagacctcttcttttgatgtttgaatttaataaatctataaaagct
tttttgtaattacttcccctgttgtatttaaactcatctagtaattctttttgagtattt
tctaagaatctaaataaatcatctacaaataagcaattttcaaggtcaaattcttgtgaa
tgaccttgttcatatccaattgaaactaaatgattttcaatagattcttctaggtgtttt
tcttttggtaacataatatcctccctctccctattttattagctataattatttaatacg
aaactttttatcattaggaacgttcttatttattaaacattcattttctaagcactctaa
ataaagtgctagttttaccaatacataatgctcaaaatcactttgagctttatcaaatgt
tacgtatctttctaaaaaaggcatcatatcatctatttgatcatatgcccattctctatc
actccaacaactatcatagcttagatatgatgttttttctattgcatatctgtacttacg
tctctcctcactaccactatttaatgaaattagctcttctagtaatgtagttgttatatt
cacttgtggatataatattccattattcttataaccttcatttgtcatattttgaatact
attatgctcaaatttgatagcatattttaaagcatttttatataagttcatcttctcttc
attatcaggatttgataatggcaaatcaaataattctataaggtagtttaattcatgaaa
agaatcattaccatatcttatttctatctctttttttagatttcttaaataatctatata
actttcaaaatcttcttctttctttattggagtattcctaaaaatttcaattatttcttg
ttgatacttttctatatgttctattatattttcaataaaatttactcttctttttacata
ctcaaatatttgattcatatatatatgaattcttttgaaactatcattatctttacttgt
gtataccactgcatataaatcgctagcatcattagtccatatacttttatcattccaaac
tacataaggactacattcaaaactattttcttggtatattttgtgtctactagtttccat
tggatggactgaacacaatgaacgtagatattcaaagtattttttatctgtacctttacc
ctcttttccaagctcattaaaaatttcagttgaagtttcaacttcttcatatggtacttc
aaatatttttgcaagatgtgttatacaatccattactacggaagcctgattcataaattc
aaagaagtcaaatgcacttcgtctatatttacctgtatttaatttgagtttatttaaata
atctacagtatcgtcaagcctatccattattgcacatattttatcccaagcgcgatgttt
tttattatttttatcataaaattcttttctataagatatataatattcttcatttatttg
attccttaatcttatcagtacatctgtatttatattaatttgaaatatatttttatccat
taattctcccttttatttaactttgtatgtataatctatatctatattaagatactagaa
gttaatctagtatctctatttttcctgttactgcttcacttattaaactttgtttagctt
cttttagtttttctatttggtactttaacttattaatcgataaattaatgtagctaactt
ttaattcaagtgcattatatatctcaacttgttcttcatacttaggcaatacaacagaaa
gattatttaaaagattttgagataaagatgctctagttactaaattcatctcttttacaa
aatattttctatttaaatcacatctaaagtaatatttagaaaatcctttgtatagtcttt
tatcattcggtctaaaccttattaaaaatcctgcaaaagtagaattatcaatagttttca
tacacgtagaagcaaaaccaatttcttctactgtttctgaagttcttgtaaagaatacat
ctccttcttctactgaataaattttacgttcttcttcagttgaatttactagaccttcta
ctatatgtggtaattctatatttctatatacattactataactaacaaatggataaccat
aaccgaatgaatcactacttttacttataccgttttgtagttttcctaaaaatctaagtc
tttttatatcccattccttaggtatctcacctaaccactcaactccactatccttcatct
cttcactacttctctttataagctcatacccatcatcagtcttaacaaccttaaccttac
cagtaacaacctcacttataaggcttttctttgcttcttctaatctttctattaactttt
ctttcttagatataattgaatcaaactgtgaagtcttttcatcaagaaagtttgctattt
tttcttgatctaagttaaaagcaattggtatctttactgaacttagtttttccattggaa
ttctcattctgatcgtatttaacttacctgaagtttctgattgtttcatcattattccat
tacctaatccttttaaactatcctggaataatttagatttaaaaatataattataaaatc
ttatatcatcgttagcatttattttatataacatataatatgcaggactcgcacacccaa
aatattttgatagtcctactgcaccaacaattacattcatactatttaatacaatatcat
ttggatatactaatttgtattgtgttaaatcttctttagctttattaccaccagtacctt
tttcagaatatggaataactcccttttctattgtcaatgacagtatattacttgttttta
taggttcattattttcttttctatctgatagtaccctttttaattgtctgacttcccaat
ccttaggaatcttccctaaccactcaactccactatcctttaactcatcatcacttctat
atctgtatcccattaccctagcaccttccttatctttagtgctatctcactttctaaact
ttctacttccttcataatctcagcaaaacttcttaactcttcatacttataaaaatgtct
agtaaatggtatctcatatcctatattatttatactactttcatctatataagcatcatt
aacatgaggctttacttccttttcaaaatactcatatacatcatctttaagacctatact
ttcagtatcttttaatgaactatcactttctatattacctttgctatctttacaaacttc
tgcatcttcatttcttacaccaatagtattaactatagcctttataagtcctgctgaaag
ttgtatatcaaactcttttgatttagcttttaaatcttttataaatttatccctgtccat
atactctaaagtattgtcaaagctttctaaaagttttattaacttatcttgttttatttt
tccttcagcttcttctttttctttaacttctatatcttttttcttagaaactgcaagatt
tataaattgagtagtattttttacattttctatagcttcttcgtttactttaaagctta