Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00005_1A_020472.fasta |
contig | u00000crpx_c_020472 |
start | 3611386 |
length | 15838 |
strand | + |
type | noncore |
seq | ttatatcctccatttatcatagaatataatcaagagtacataagcactcttgattataag ttatatttgaaagttctcaattatacttctttctatctgaagcattcttggtcttattgt tgtatatcctgttgaatcgctagcatcttttgtatgaatagtttttttaggagaatcatt gttagaatcaactttcacaattccactatctcttaactgtttcactagttgtctttgact tattcccaaatgtatacctctttttttattttcaaattctataaaagaatatactttatc tgtgtaaaagtaataatattccttatccttatatccacatatatattctaatttatcttc tataacttggttctggtcatttaatgttgctattcttattgactttgaatttattgattc ctttaatgtatttaaaaatatatctataggtgagtttctcgatattaattttatctgctc ttctattaatctttctacaactttaatcgctctatccatgtactcatcatcttcatactt atctataacacctttatctctaatataatttaacatacaactaaaacctactaatatcca tgcactagactcaatagttcttccatgtatatcatctttatattgttctctaatttcatc cctgtaagatttaaagttatataataatatattagataattcatcaatatttcccatttc agataataaccattctatatatcctctcattgcttctccaagcaaatgactattattctg taattcagttagtatatttaaatctactgaacttctatttaattctattgataataatct agcattagatgattctccacatatcacatcttcacctgttattaatatcattcctctagg tctcttagcatcctttatatctaacttattacttgagcgtcctttccctactctatctcc atacattcttataatggattctgcctttgagtcttgaatttttttatccctaaagtcttg tttaggtgcaaagtcatcacataagtataagctatcctttaacttattagcttttaattc aatagctgtaatcgtatcattaaatgtagctggaatttttttattaaaatcaccaaaatg acttaatacaacttttgatactgctgtttttcttgatcctgtttttccatatgtccatac tatattttccggtggtttaatttttctactgataatttcaataagtggagataggtaaac taatgaagagaatataatacctttatcatcttctattaagtctactagctttaaactcat ttcacatgctttatttatgtcactaattttatctggtagtatatagttatctattgattc atctaactcaacttgaacatctgaacctcctataactcctcctccatgtagatatatcca cttattgtcttgatatatccatcctgtatggtcatatatatacttagtttttatattcat acataagtgttgtatcaattcaataaagtcattaatatattttttatctatagaatattt aaaaccccaattttcaatcacccatgtagttctatttatggtattcgaatctaatattac ctctgataatagctctccattaatccccatagcatttatacataaatacatttttccatc tataaccctttgttctattatatttactaaaaaattacatatctttttattagatgaatt cataacggtgttattatctaaaacatttaatcctatttcctcatataatttaattaattc ttctctgtttattgccttgctcatttgtattcctcctatttatcccatttaacaatattc ggtactaaagatatacctctatatttaacatttgtatctttaagtaagttttcaattttc aagtgtaatctacttaatcgttgtaagtttttttcgtatgatcctcctgtattcataagt atgtaaatagcccttgcgttatcttcatactctgtactacctaatatagttaaactatat tctttttcatttaatacaccttcatcaatcataccttctaattcattacgatttccttct tcacattcaataagtagaattaattctacctttacacttttaaagtttgtcattaatata cctcctgttgtcaaagcccgaaaggccgtactttttcatcattaagctattgttcttaga ttttattaattagctcgttcctacaaatatgattatataataaataatgactactcatat cacctaaagataaacgttttcaccaaatattttttatttttttcaaaaaaaatagagaaa atctaattagattttctcttcttcttaattctatctacaattttcttcttactttctata tttattgcttttataacctctccatactttcttacatcatctatattataatctactttt attttatatttattttcaaatgactttcttccattatttatattataaatagatttaaac tcctctaattccttttcactaaaatttttataatagttgttcttactaactatatttaat aactccaaacattctatatttataattctcattataagactaacttctttagtaaatttt tctatatccttaccttcattagttgacaatatattaaataacttatcgcttagtttctct cttatcgttaaaactggaactatgtgtatataagcaatagtataagaaataaattttact tgattttctatgtctttaattttatttaagtttttaagagtacactttcttaattcattc gctaactttaattctaagctataaaaataaatatttttatattcttcattactatttata atctcattatttaaatattcatatatatttttataattcttatctgtcattttttcaagc atattagattttattttcttatgtgccttatttgcatcatgagtcagtttagtttcatac tcccacattttagtcaatgatttaagttctaatttacattttctactaatttttcttcct ttgtaatgttttactttattattcctgattcctgctaattttaatatttctttatcctgt gtagaatttgagagatccctacaaactttatcataaaacattttaaagttttgatcttct cctatccattcacttatattttccatatcatcatctgatatgtcgtcttcaaacctttct ttatcaaaaatatctatagccatctgctttaaatttgaattacctagctcatttttcttt gtttttgctactatataaaatttcaaaaatgatttaatctcatcaaaatattcttcgtct attactcctagatttatatattttctatactcaacatgtttcaaaaatttaattctaata tctattagactatataatgttttagcaatagtatcttcatcttcttcgtattcaaataaa ctatcatctaaatctaaataccagtatttatctttatctatatatgtgttatcagtattc tcttcaattatatgtaatttaaattcttgagtatctaaagtattgtcataatcatctaca tataagtaatctctctctctattttgtaatccttcatcttctaaaaacttatcaaatgtt attttacttaaatctatatcttttttgtttatattgcctttcatatttataaagtccttt caaatttataataatatatattatttaatttacataaatacaaactttactttaatataa cttatctgggctttaagggcttaaataaattatatatgaatctattaataatttaaatat aacttagtatattatggcatttttcgatatcagtatctctatactaatacatagtccaat tcctattatacttcctattataaatccaatcatactcatacctcctgtatactatttttt attttctaatacttgctttaatactgcactaaaaattgaaatcccaaacattactccact agtaaactcttctattgtcatattctacctcctaagctaaacctttaattagttcttgct tgaaatcatcatctagtacaccagcctttaatcctaccagtattaatgctacaaacttat ccatagttaaatctacaggccttggaataagtttattaattctatctcggcagtcacgat acaggcatattctaacctcgtatctttgtaatgacttaatatatattttctctattgcaa atctttcatctccatcttctactgttacacttcttattatcttgcaatatttagtttctt tttcaaatagttcctctttactttgcttcgccatgttaattcttcctttctttacaaaaa taatgccttgccacatttaactgtagcaaggcattatgtatcaatatttaattagttaat ataattaatttcaatataatttataaattttcctatttttcccattatatttaatgcttc aaatgacatattttcagaatctaatagtcctttcctatacttgtaattatatcagatatt tctaaccatccaacatttgataaattcaatttagatgattggtctatcaattagctacca tagtttgatagtgtatcaaatgttccttgaagtccactaaatgtatttgaattagttatc ttactataaacgttttaatttctctattagcttattcattatagcaaatactctatctag tgcctaaatagttttgaagttttatattcttcattattagtgtttttagatttaatatct acattatcctcttgtttatctgtttctatactgatcctttattagctagttacaaatttt tatttcttaaatctaatatatctttctctaagtaaattaacttatgattaaacctatcac tcaataatatatatactaagctactacatatgacaacaaataatattgacgccattatca tttttgtttatgttttaccaaatatacctttaaattttactttttccctataattaatct tatactttatcttgaattaattatttcttagataacattcctaattgatctttgtatgca tctttcattttttcagctatttcagtattattaacctcattacctttcatattctcattt agtatatattctaatacacttatatatgccattcctaatgctgtagttgttaatgccgct acagaaccacttatcgctccacctgctatagttccagctcctggtataaacttaagtata ttcgataccaatgtttttcctagtaaagtagctgatgtaacccctcctatagaacttaca attgccgttagtaaagctttatcaacttgtaacccaaatattactgttatatgagatatc atagcaacttgtgcggttgctaataatggagcatctgaaaatggtattggtgaaaatcct attgctcctgatcctcctacatatcctaaaacccattttctcgactcttcaacctttttt tttatatctaccttttgtacattaacaaaagctttcttgacctcttttggtattacttga tatgtaacttctactaatttatctaaaccatatgactttataactatctcatcctcttct tctactagttgctctgccaaaactggaattacattcttacagtttaaatttaaatcatca atactagattttaattctcttgctttttttcttgggaatccttgtgtcaatacaactatt actggtatcttttcacttaactcatttatccattttatatcagtttcttcacatctagct actgatgtatttatacaataccaacatacatgcattaactcacttttatcatttctttct aatgaatttctattacaattttctatttcatctaatatctctttttttatagtctcttgc acatcttcttctaactctaatccctttgtatcgtataaatttattggtaatccttctttg cttatttttttcaagtgttgtgttacaggtctaccaattccagtttctgctaattcttct ctaaatatattatttattaatgtacttttacctactcctgttttacctacaacaagtata tttaccttatccatgttttctaaatcggattgaaatttctttattgtctcacttataaaa tcaaaatcttgcataaaatattcctcctaatttataaactccaatgttttatattgtcat aatacaatataatatttaatttttttgtcattttttgtaataaataatatattttttgtt tagttaagttaaagattttaagtcatttatatttattcttctatcatgtaatgcctcaat atattaaataattattttatcaaaataatctacagtaatttaatcatttatcttattcgc tattaatcctattacaaatagtataatcaatcctattactatccactttaacaatcctaa aactataccacctaatgatgttaatattgcatatgacacaataaaacatccaaaccataa aaatcctattgggccacatccaaaatacgttatatctagcattgaattaatcagaaaaaa tatacctgtccccataagtattgctaatactgttaatatcatatctactgtcaatctcct tctctaattactttgaatttaatctatttttattaattaattgctttatccatccctctg tatatcctaactctctacacatttcttttattgtttttgttctataattcttcactatat atcgttccacatattcaatagaatatagtttcattggaaatgttatttgttgtccacgat aatacttatgtaatttaatgactatttcttcacccaaaacctcaaccatatctgcatata tgcccttataatcacaattattattgttgttagtcatcactccacctccttttctagcac taattaataataactagtatttgaaaaagtttcattctgattttctcttgtaaaatctat ggtattttcaaatatgtactttaatgtataagcccttaaagcccgtatttttcagtacat atacttattttattcttctttttctgagtatctatattctattccattagctaatgtaaa tgcatattctggagataaattcaatatatcttctatatcatcactcattaatatttcttc tattacttcttcttttgaagtattgtttaaccacatatctattaacatgtctttatgtag taatctatctatatgatgttccatgcttaacatagtttctaattcatcttcagcatactt ccttaaatctctttcatttgtatatattatatgattttctacttctatatagttacttgt agttaaatcatcgtagtactcacttgctttatctatagatattgtatttatagttaagtt gtaccaagcaaagaatatagcttcatctatgtttaaatcttcaagtttattgtatgtatt tactagctcttgtagcttacaattatctcttattaggtaattctttatttcttcatcttc tatacatgtaaatatcttttctattacatctacagttttatcatctatattgttgtattt atctattaactcttttaattcattgaaaaataacttattaattatttcagatttattatt tatcatattactctctctcctttaatcattaactaatattcatttgaaaacatcattgtt ctatattcaacattatctataacatatatttttaatttatctttaattttatcattctgt atatatatcctagcttcatattcaggtacttcttgcttatgaactatctcaactactcct aatcctataggatttatttcaaatagttgtagataatctttttctgtagttaagtcatct attaaattccatagtagtatagctatttcaattggtagattttcagctatctcttttgtc atatacctattttcttttttaaacatgttacaactcctatttagttttaaatttatatgt attatttttttcaagggctttccgggcttaacctaaatttgatttatttttaattgtttt ggaacatagaaaaagccttagcctaatttatttaagctaagactcttatatcctacagtt ttctttaaagctaaagtatttatcctcatctacaataactatatgtatctactaattcaa tgcataatatttctccacgcttctgtagcatattagttataactatcttccttgctaaag tcagtattacccattgggtgattgtgaaagcatatcatttcagatgaattggttaatata gctactttaaatatttctcttggatataccatagataaatttacagtgcctatacttaca acctctatgctactggccaattctttgtatctaaacataccactacaaacttttctctag cactatttataaaaaattctttgctaatctataagcatcataaagattacttatttttct agtttcatatagaacactacgttcttttactaatttaagtaaaactatatcaactctctt ggcaggagttctctttttattcattctgcttttctcctttatttattaaaattaaaataa gcatatacaccttatcaatgtatatgcttatttaagtaagtactcagtttcttcattttt agaaattacagtaacactataatcactagataacaagtatagtgttgaattatatgtatt aacttcatcttcatatattacatcactaaactcttctactaacccctttaatatatttga ttttaagttttctacttctttaatatcctcaattatacacacatatccaccatcatctgt taattttctgttacatccatagttttcatcaagaatattaatgacgttatcaacattttc aactacttcctttggatattctaataataaatttaaatcttctttcttccataatttaat catattaacttcctccttttaattttttgcactaaaaaagagatgttcgtatttctacca acatctctttttaatatttttggtattactacttactcaactatctatttaatatagatt cattaatataatatatatttataatttaattaaaaacagtttatctatatatggtaaaac tatatattatatatatatagttttttacaaataatgttatttttttctcttctttgatat aatttaaagtaaatacattatatttaatcaaaggagcaaaaatatgaataacgataaacc atttatagagtttgaagaagaagttgattttatacttactgagtgtaaaaaagaaggtgt ttctatagatagagatactatagagcttattcttgatttagacttaaagtttttagaatt aaaaggaattgctacacctttagaagatgaataatatacaatagctcataataaagtacc tatggagagttaattagctctctataggtatcttatctatttgcctcttcatatatcttt tcagctaaataatgaatcatataattttgtaaattattattagttaatatctccttaact aatctatcatttctatttttggttttaactatacctctcttaaaatacttcttaccaaaa gtgctaactaaatcttcataactattagctttagctatatccatgatatccttgtcattc ttaaacatctcttcataagtatttatcataattctatcatcttccgtaagtcctacacca aaaacatcatttatttttttaattatatcctctaaatactcttcatcagcttcacttaca cgagaagtcgcagtttcagatataccaactaactcaccttctccattatataaggatata tccgttccttttttatcatctaatccaagcttttgcaatttataataatcaaggcttaac atatcatcaaggtctattctttgtttactctttttaggtaacttctttaaaagtgctact aaataaacttgcaatcttaaaagatttaagttctttataggataaatctgaattaaaaaa ttataaaaagtaatatacttttgacattttttcttaaactcatcagattttttttcatca tcttcttctaaataacaatacctttcaactgccttatcaattaaattattcatcttagca tcttgagaagaagttcttttctctttatagaataatactgtaaaatcatttacttcctca tcagtatatactgcatattcatgtaactgataccaaaggtcatttactacatttggatct gttaccttatcaatattagtcatttcaaaatatggcttatatgcatcttgtatgtcttcc acactattttggaaatctaatataaatgtttgtttattaggataagttctattaagcctt gataaagtctgaacagttttaacaccatctagttttttatccacatacatagcacaaagt tttggttggtcaaatccagtttgatacttttctgcaactattaatagcttaaattcattt ttatcaaatatattaggtaaatttgaatcagtaatatctggtgctacttccttattcata cctacctctgtatactcatcatcaccatcttttacagtaccagaaaaagcaacaagtgct ttcatatcatatcctttttcttttatatattggtctatagctagtttatatctaacagca tgtaatctacttgcagtaactatcatacctttagctttaccttctaaccacatagaccta ttatctacaaaatcatctactatagtttcaaccttttgccttatattgtgctcatttaaa ctaacaaacttatttatagccctcttagcctctcccttatcaaactcagggttatcaata attttctttcctactttgtaataaacacttataggcataaagttttttagtacatctaat ataaatccttcctctatcgcttgtttcatagaatataaatgaaattcatgaggtagtcca tcttcacctatcctcccaaatacttgcatagtcttattcttaggagtagctgtaaaagca aagaaacttatatttcctaaatttgttcttttctctataagctcattcatcttatctata ctagacttttcattcttttcattttccgcatcaattaccttagcttcttctaaagtcttt cctgctaaagtttcttttaatgcattcatattttcaccagatgttgaagaatgtgcttca tctataattactgcataacgccttttatcaagttgttctatcttaggtagtgcatactgg aatttttgaatagtagttataataatctttgctctatttacaatagcatctgctaagtct gatgaatttttatcttcatctatcttaacaacaagtccgtttttgtgctctaattgatat atagcattttgtaattgtttatcaagtacctttctgtctgtaactacaattatagagtca aatatagcattattttcttcatcatgaagacttgataacctatgtgaagtccatgctata gtgttagtcttaccactaccagcactatgttggataagataatttttacctactttattt atctttaaatcttctactatcttccttactgcatctaattgatgaaatcttggaaatatt gctctttgattacctttatcatcttcttgaataaagtaaaatctttttataatatcaagt aaactatctttagtaagtatttcttcccaaagataagaagttttttcttttccttctact acaggatttcccttacctctattgttacctttattaaacggtaagaagaatgttttatct ccttttagctctgttgtcatataaacttcatcagtatctactgcaaaatatactaacact ctttgattaaatccaaataaagtttcttttgggtttctatcttttttgaattgctttata gcattatacacattttgattagtaaactgatttttaagttccattactataacgggaaat ccatttaaagataatactatatctaaagtattgttgtgctttgagctatattttaattgt cttgttattttgaatatattttgtttataattttcatacgctgttttattagtagttaga tttggtttgttgtagaataattgaaattttccgttcatcattatatcttctacaccattt ctaagtacacttataagacctcttcttttgatgtttgaatttaataaatctataaaagct tttttgtaattacttcccctgttgtatttaaactcatctagtaattctttttgagtattt tctaagaatctaaataaatcatctacaaataagcaattttcaaggtcaaattcttgtgaa tgaccttgttcatatccaattgaaactaaatgattttcaatagattcttctaggtgtttt tcttttggtaacataatatcctccctctccctattttattagctataattatttaatacg aaactttttatcattaggaacgttcttatttattaaacattcattttctaagcactctaa ataaagtgctagttttaccaatacataatgctcaaaatcactttgagctttatcaaatgt tacgtatctttctaaaaaaggcatcatatcatctatttgatcatatgcccattctctatc actccaacaactatcatagcttagatatgatgttttttctattgcatatctgtacttacg tctctcctcactaccactatttaatgaaattagctcttctagtaatgtagttgttatatt cacttgtggatataatattccattattcttataaccttcatttgtcatattttgaatact attatgctcaaatttgatagcatattttaaagcatttttatataagttcatcttctcttc attatcaggatttgataatggcaaatcaaataattctataaggtagtttaattcatgaaa agaatcattaccatatcttatttctatctctttttttagatttcttaaataatctatata actttcaaaatcttcttctttctttattggagtattcctaaaaatttcaattatttcttg ttgatacttttctatatgttctattatattttcaataaaatttactcttctttttacata ctcaaatatttgattcatatatatatgaattcttttgaaactatcattatctttacttgt gtataccactgcatataaatcgctagcatcattagtccatatacttttatcattccaaac tacataaggactacattcaaaactattttcttggtatattttgtgtctactagtttccat tggatggactgaacacaatgaacgtagatattcaaagtattttttatctgtacctttacc ctcttttccaagctcattaaaaatttcagttgaagtttcaacttcttcatatggtacttc aaatatttttgcaagatgtgttatacaatccattactacggaagcctgattcataaattc aaagaagtcaaatgcacttcgtctatatttacctgtatttaatttgagtttatttaaata atctacagtatcgtcaagcctatccattattgcacatattttatcccaagcgcgatgttt tttattatttttatcataaaattcttttctataagatatataatattcttcatttatttg attccttaatcttatcagtacatctgtatttatattaatttgaaatatatttttatccat taattctcccttttatttaactttgtatgtataatctatatctatattaagatactagaa gttaatctagtatctctatttttcctgttactgcttcacttattaaactttgtttagctt cttttagtttttctatttggtactttaacttattaatcgataaattaatgtagctaactt ttaattcaagtgcattatatatctcaacttgttcttcatacttaggcaatacaacagaaa gattatttaaaagattttgagataaagatgctctagttactaaattcatctcttttacaa aatattttctatttaaatcacatctaaagtaatatttagaaaatcctttgtatagtcttt tatcattcggtctaaaccttattaaaaatcctgcaaaagtagaattatcaatagttttca tacacgtagaagcaaaaccaatttcttctactgtttctgaagttcttgtaaagaatacat ctccttcttctactgaataaattttacgttcttcttcagttgaatttactagaccttcta ctatatgtggtaattctatatttctatatacattactataactaacaaatggataaccat aaccgaatgaatcactacttttacttataccgttttgtagttttcctaaaaatctaagtc tttttatatcccattccttaggtatctcacctaaccactcaactccactatccttcatct cttcactacttctctttataagctcatacccatcatcagtcttaacaaccttaaccttac cagtaacaacctcacttataaggcttttctttgcttcttctaatctttctattaactttt ctttcttagatataattgaatcaaactgtgaagtcttttcatcaagaaagtttgctattt tttcttgatctaagttaaaagcaattggtatctttactgaacttagtttttccattggaa ttctcattctgatcgtatttaacttacctgaagtttctgattgtttcatcattattccat tacctaatccttttaaactatcctggaataatttagatttaaaaatataattataaaatc ttatatcatcgttagcatttattttatataacatataatatgcaggactcgcacacccaa aatattttgatagtcctactgcaccaacaattacattcatactatttaatacaatatcat ttggatatactaatttgtattgtgttaaatcttctttagctttattaccaccagtacctt tttcagaatatggaataactcccttttctattgtcaatgacagtatattacttgttttta taggttcattattttcttttctatctgatagtaccctttttaattgtctgacttcccaat ccttaggaatcttccctaaccactcaactccactatcctttaactcatcatcacttctat atctgtatcccattaccctagcaccttccttatctttagtgctatctcactttctaaact ttctacttccttcataatctcagcaaaacttcttaactcttcatacttataaaaatgtct agtaaatggtatctcatatcctatattatttatactactttcatctatataagcatcatt aacatgaggctttacttccttttcaaaatactcatatacatcatctttaagacctatact ttcagtatcttttaatgaactatcactttctatattacctttgctatctttacaaacttc tgcatcttcatttcttacaccaatagtattaactatagcctttataagtcctgctgaaag ttgtatatcaaactcttttgatttagcttttaaatcttttataaatttatccctgtccat atactctaaagtattgtcaaagctttctaaaagttttattaacttatcttgttttatttt tccttcagcttcttctttttctttaacttctatatcttttttcttagaaactgcaagatt tataaattgagtagtattttttacattttctatagcttcttcgtttactttaaagctta |