Block details
fasta C_difficile_CD00075_1A_020265.fasta
contig u00000crpx_c_020265
start 599047
length 12232
strand +
type core
seq atgggtatttatgtataataaaaagcaagaactttaataggtttttgctttttttgtaaa
tatatataaattaaattcttattttgtatgttttatatattgatgtttattttttgttga
tatgactaaactatttataaatagtgttttataaattggtattttaaagggggataatta
tgaaaaatgtaaatctaaaagagataaatgaaaaagatgtaattgtggaagaagatataa
atctaaaaggaatggataagaaagatgtaattgagaaggaagaagtaaataaaaaaagta
tagataagaaagatataattgagaaagaagagatagataaaaaaaatgtaaagaaggttg
aggttcaaaaagaaatagataaaatgattagtaaaaaagatgagataattgatgagaaag
atatagagaattttaggtatattgaagaagataaaaaaagtatcaaagtaagtaaaaaaa
gtactaaaaaaggtgaaacggagaaaaaaacaaagaaaagtagttctaataaggctacac
aaaaacaaagcaaagaagttaaaagtaagtctaaaattaaaagtgaatcagccaataaaa
aagatgtaaataagattttagatgagttggaaaaattgtacccagatgctaaatgtgagt
taaattatgggacagcctttgaacttttaatagcaactattttatcagcacaatgtactg
atgtaagagtgaataaagttacttcagagttgtttaaaaagtacaacacagctagagact
ttgctaatttgagcattgaagaaattagtaaagagataaagagttgtggtctttacaaaa
gcaagtctcaaaaaataaaggatacatctgaacagctatgtgaattatatgatggtgaag
tacctgatagcttagaaaagcttataaaattacctggtgttggaagaaaaacggcagggg
ttgtacttagtaacgcttttaatcatccagcaatagctgtagatactcatgtatttagag
ttagcaatagaataggaatagtggacgagccaaatcctcaaaaaacagaatttgcactta
tggaagctataccaaaagaaagatggtcacactcacatcatgtattaatttttcatggaa
gaagaatgtgtaaagctagaaatccagaatgtgcaagttgcccaataaaagaagattgta
attattataaagaacttaatgaaacgaaataacttttagaaagtaagttgtacaagaggg
attttctgatataataatacttgtgaaaatgttagataaaaaactattatatacatgaaa
taaaaattattattaacattattttatataatagtataatattattgttattctgtttat
aaaataaaatttgataaataaaagcgatacttagggaggattaaaatgtcattaaatata
gtattagtagaaccagaaatacctcaaaatacaggaaatataataagaacctgtgcagca
acaggttcaactttacatttagtaaaaccactgggtttttcattggatgataaacaccta
aaaagatgtgggcttgactattgggatatagctgatatacaatattacgatagctttgaa
gaattacaagaaaagtatccaaatagtaaatactttttttctacaacaaaggctaaacag
tcacattcagatgtgaaatatgaagaaaattgttttatagtatttgggaaagaaacaaag
ggattaccagaacctttgttgaaagcaaatatggatacttgtattagagtgcctatgttg
gatgttgaaaaggctaggtcattaaatttatcaaattcagttgctattgtagtgtacgag
gctttaagacaaataggatacccaaatatgaggtagtttcaacaagcctaaatgagaaag
gagcatacttaatgaaaaatctaaagataatctgtgacagtttatcggacgtgccaaaag
atttgttagataaatatgatatagatatagtttcattaacagttatactggaggaaagag
aatacaaggatagaattgatatatctggagatgaattttataaaaggcttagagaagaaa
atgtatatccaaaaacttctcaagctacttatgcccaatttaaggaaatttttgagaaat
atacaaatgaggatagagagatactttatatagcagggtctgccacagctacagggacgt
atcaaagtgctgtaatggcaaagaatgatgtggatggtaaaatatatacatatgactcta
acttgctttgtatgggaactggtttacttgtaataaaagcaggagaacttgcaagtgaag
gaaagtctgttgatgaaatattacctgttttggatgaattaaaagagaaggcttttgtta
tattttcagtagatacattggaatatttacaaaagggaggtagaatatcatctactaagg
cagcaataggaagtatattaaatataaaaccgattcttgaaataagagatggactagttt
cgcaaatatctcaagtaagaggaaagaagaatgtaatttctaagatgatggaattgataa
aatcaaattgtggggatgatttatcagaccaaattgtgtatataggatatagtgatgatt
ttaaggaaaaagaacaattatctaaggttatgcaagatgaattaagacctaaagaaatta
gatttttccaaattggtgtgtgtataggtgcgcatgctggtcctggtgtcactggtatca
tatgcttaaaaaataaataatatatttttggatgacattatttatttttttattaaatta
ggatagaatattaattattgagatgttaaattggatttattttggatgaaattaagtgtt
gatatattagatttagtttgtagggaagtgtgtaaatagataagaatctattgcacactt
ttttatagtaagatttattaaaaaaatttcaaaatgtacttgtaaattgtatataaaaaa
attataaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaat
aggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaa
aagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaagtaaataggatgtaaaaatatcgt
aaatgtatgaggagtgaaatttaatgcgtttcaaaagaatattgatattgatgttaactg
tagcaatgatagctggaatgttggttgggtgtgctaataacccaagcaataatcctagct
ctagcaaagataataaaagtgatataagcgataaaagtaattcaaaaaaatctgtatcaa
tgatactagatattgaaggaacaaataatgaagctatgaataatgcagctttattagcat
taaacaatgctcaaaagaaacttaatatagatacaaacaaagtggaatcagatgattcct
caactttttctaatagtatagatattttatgtaatgacaattacgatttaattatagctg
taggagctagatttgcaaaaccattggagatggtagccaagaaatatccaaagcaacaat
ttgcaattatagactatgagtatgacaagcaaccttctaatataacttcaatttcttatg
aagataataaatctggatacctagctggattaattgctggaaaaatgactgaaagcgata
aggttggttttataggaggaataaagagttctagtagggataaatttgaatcaggtttta
gagagggtgttaaattttctaatagtagtataaaggatatttcagttgagtatgcagatg
tttttaaagatagcaaatcagtagaatctatagctaaaaaaatgatggataatggagtgg
atattattttttctactactgaagatgattcaaaagctgtaatagatgcagtaagggcaa
aaaataaaaaagttatagcaacgaataaagaccaacatgagttagctccagaaaatgtta
taagttctattgtaaaagattttgagaatcctacttataatctgatacaaagttttgtaa
aaggaaattataaaggcggaaaagttatagaaaacacagttaagtctggaagtactgggc
ttgcccaaaatagttctcaaaatattcctccagatgtgttagaatatgttaataagaaca
ataaataatctactataatatccaagaatacttatgactttagttatgaggtgaattgga
tgttataatagacatatatagaaagacgtatgcagaggtaggcagacctatctaaatcag
ggagtgaattttgtgaaaataaaaaggatattgatggcttgctttgtagtagtttttaca
atttttatattagctatatgtaactttgattttggatttgataaagtaaataagaataat
tctaatatagatagtgctaaatcgaaacagagtgagtctaaaagtgtaccaacttcagca
gaaaaggataaattaaatagtaaaagtaagaatgaagaagatgacacagaagatgattca
tatgtaagaaaaactattggagtattgttagataccgaaaacttaaataacgaatcatat
aataataatgtactatcagccttaaaaagggctgatgaagattttgatgttaggataaaa
cttgaaaaaccaaagacttctaaaagttttaaagagagtatagaaaaactacataagtat
gaaccagatttgataatagcagttggagctagatttgcagagccaattaaagaagctgct
actaaatatcccaaacagcaatttgcaatagttgactatacttataaagttcagccagct
aatgtaatttctgtatcatttcaagataatgttactggatatttagcagggcttattgca
ggtaaaatgactgatactgggaaagtcggttttataggcggagttgagggttctagtaga
gataagtatgaatctggatttagaaaggggcttaaaacttcaaataaagatgctgagtta
ctagttaagtattcaaatatatttgaaaaccctgaatcagctagaactattgcaaaggaa
atgagagattctgatagagatgttgtattttcagctacagaagatgatagtaaaagagct
attcaggtagcaagagaaaatggtggtaaagttatagctattaataaagaccaatacgat
atggctccagataatgtaataagttcaattataaaagatgtagaacaacctgtctatgaa
ctgataaagaacgttgcaaaagatggttttaagggaagtaaagtaatggaatttaaaata
aaagatggagaacttggcttgacttcaaagagcagtagaaatataccaccagatgttttg
gaatacataaaaaaagagtataacaaagtgaaagatacatattaattattgatgtagaag
attataaaaatatactgtttaagtttagattagcaataaaaagatatatttattaaattt
gtgctaactgtacaaaatatattgattaagtttagattggtgataaaaagatatatttat
taaatttagtctaactgtacaaaatatattgattgagtttagattagcaataaaaagata
tatttattaaatttgtgctaactgtacggaatatactgcttaagtttagattagtgataa
aaagatatatttattaaatttgaaccaactgtacaaagctatactaattaagcttagatt
aactatataaaattataacaataagtgtgtgggcagaaaaattctgctacacactttatt
tatattcatataaaaaaattatcaaaaaaaagaaaaaggagtaaaaaatggaatttacaa
gagaaccatttatactagatgacgatttgtgtctagctttggtggacaaaagaattagtt
atctaatggaaaatgaattaaaattaagaaatatagagataataaaaacaatagaatgta
aagaattatatgaaagcataaaatatcacccggatatatgtatttgtaatttaggaaaag
gagatataattgttgcgccgaatgtatataatcaatacaaagagttattaagtagatata
aatttaatataattaagggagaagctaatttattaaatagatacccttatgatatacctt
acaatattgcgatagttggtgactatgctatacacaattttaagtatactgacaaagcaa
tattagattatattgaaaataataaacttaaaaagataaatatagagcagggctattcta
aatgctcaatctgtatagtagatagaacgtctataataacatcagataaaggtatttgga
aaagtatgaagaatacagaaatagagtgtttattgatagaaaaaggtcacataaatttat
ttgagatgaattatggatttataggtggatgtacagggttgatttctaaggataaactag
ctttttgtggagatgttaaaaaacatcctgactatgaacgtataaaaagttttgtagaaa
gtaaaaacaaggagatagttacacttagctgtgaaaatttactagatataggttctatag
ttcctctcatgacaagaaaggagcgataactttggttgagaaggataatatttcttccat
gaaatttttgaggaataataatgtaaacgatagattaatatatacgaatgacattgtaga
agtagtgatagattctgcaaagcaagaagtgttaaataaaaaaatacttaatggtactaa
agctgaacaaagagctttaaatattgatgagatatcaacggaaataactagtatgataat
aagtataatgaaagagaaacttttgaaagaatacattctaaaatgctatgggcgtacata
tcctgaagataaaaataatatatacatatattcactgaacatatttgctaaaaaagagat
ttttatgagagaaacagtatttactagggtgagaaattatatagaagaaaatgattttat
aaatgtagaaggttttattagatttagaatgagagaatttatgaaatatatttctgctat
aggtgatattgcagttgaggagtatttaataaagaaagaccaagatgaatttataagagt
tttaaaatactttatagatactcaagaagaaaagattgatttgcttaaagttcatataat
ggaagataatacatttgttttatacgataaaaatggaaataagatagacagtatagatga
tgaagaaattataaatatggtaataagagaaaatttaaattatgaggactttttaataag
taccttattaactctatgtcccaaaaaaatagaaatattggatttgttaaataataattg
ctcaaaggaaattatagatactgtagaagcaatttttgaaaataaagttagtataattat
ggaaaactagaatctaagcatataaaagctagccatataaaattaaaaaaattcttttta
aatcgacacaaaagacttataattgtatataaagctatagtataactagagttattaagt
ataaagaatatctacttgattaatgcaatatagctggcaaatatacaattgataaggagt
aattttataatggataatttaattaggatactgatattagctgttattggtggatttata
ggttatgttacgaatgtagttgctataagactgatatttagaccaatagagcctattaaa
atacctattttaaatatagaaatagtaggtcttataccaaagagaagagcagaaatagca
gcaaatgtaggagaaataattcaagaagaatttctttctatggacgaaatacttgcaaat
atcattactgacgaagataaggaagaagttgtaagatacataaaagcaagggtaaaaatt
ataatacatgagaaagtttcatttatcccgagtggtataaaaaacatgatacaagattat
ctaggagagataattgagtctgaagttaagcaaagtatagatgaattgagtaaaaatata
ataaataaagcaaatgaacgtatagatatacaaaaaatggtcgaagataagattaatgaa
ctagatttatatgaattggaagagataataataagaatagctaagaaagaattaaaacat
atagagtttttggggcttgtcttagggtttttaataggtatagctcaagggttaattact
atgtttatttaaatatatgagaagtagcatttatttaagtactaattatatttacctatt
tgagtgaattacttattaatagtatttagatattaattgtatttacctatttgagtgaat
tacttattaatagtatttagatattaattgtatttacctatttgagtgaattacttatta
atagcatttagatattaattgtatttatttatttgattgtgttacttattaatagtattt
aagtatttactgtactacttattaactatattaagtattgattgtatttaagtatacaaa
acctaaaaagagtacaaaaattagaagttagttttaataaaaattagttttagtatttat
ctagtcatatctatcatgcatgtggatacgttttaaaaattttaaatttatgaaaatatt
ataatatcactataaatcaagagattaatttaatataaaaatataagaatattggtttac
agctgattgagatgaaaaataatgggtaattaatatattacattaatgttgattgatgta
taactatctgttataatgaaaatatattaaaaatcatagtgttgaagaggaagagtagag
tagaaaccattctcagagaatttgggtctatggctgagagcccatgtaataggtctattt
gaaaactaccttggagctgagcttattagcagtatttgtatttgtactatacgtgaaagt
gctcgggtgacgaccttatagtcatcaagagggttgtatatacttgtatacgccaacttg
ggtggaaccgcgaattaatatcgtcccaaacatatttggggcgattttttattacaaaaa
atctaaaaattatttcaataaggaggaaaaaacaatgattaaagttgctttaaaagatgg
ctcaataaaagaatttgaaaatgctatttctgttatggatgtagctaaatccattagtga
aggattagctagaaatgtggtagcagcgtctgtgaacggagaggttgtaggtctggacca
cattatagatactgattgtgacttgaatttatttaagtttgaagataaagaaggtaagga
agtttttagacatacatcagcacatatattagctcaagctataaaaagactttacccaga
agcaaagcttgctataggaccaagtatagaaaatggattctactatgatatagatttaga
ccatagattagttccagaggacctagagaaaatagaagctgaaatgaaaaaaatagctaa
agaagatttaaaaatagaaagatttgaacttcctagaaatgaagctttagagcttatgaa
agaacaaggagaagactataaggtagaacttatatctgatttacctgaaagtgaaataat
atctttctacaagcaaggtgattttactgatttatgtagaggaccacatttaccatctac
taaaaaggtaaaagctgttaaattacaaagtgtagcaggtgcatattggcgtggtgacga
aaataataagatgcttcaaagaatatatggaacttcttttgagaaaaacaaagacttaga
agagtacttacatttactagaagaagctaaaaagagagaccacagaaaattaggtaaaga
attaggattatttatgatacctgaagaaggtccaggattccctatgtttttaccaaaagg
tatggaacttaaaaatgaattattaaaattctggagagaaatacacagaaaagctggata
tattgagatagaatctccaatcatattaaatagaaaattatgggagacttcaggacactg
gtatcattacaaagaaaatatgtatacagttaaaatagatgatgaggattatgctataaa
acctatgaactgtcctggtggattaatttactataactctcaactacattcatatagaga
tttcccaatgagagttgcagagcttggtagagttcatagacatgagttatctggtgcatt
acaaggattaatgagagttagagcatttactcaagacgattcacatatattcatgttacc
agagcaaattaaggacgaaataaaaggagtagctaacttaatagatggtatctacaaaac
ttttggatttgaatataatttagaattatctacaagaccagagaactctatgggaagcga
cgaagagtgggaagcagcagaaaatggattaagagaagctttagaagagttaggtctacc
atatactattaatgagggtgatggagcattctatggtcctaagatagacttccatctaaa
agattgtttaggaagaacttggcaatgtggtactatccaattagatatgcaacttccaag
acaatttgataatacttatattggtcaagatggtgaaaagcatagaccagttatgattca
tagggttgcttttggtagtatagaaagatttataggtatattaatagagcattatgctgg
taaattcccagtttggttatctccaactcaagttaagatacttcctatatctgataaatt
tatggattatgcaaatgaagttaagaaagagttatttgataagggtataagagttgaatt
agatgatagagctgaaaaaattggatttaagataagagaagctcagcttgaaaaagtgcc
atacatgttaatagtaggtgaaaaagaagtagctgataataatgtttctgttagatcaag
agataaaggtgaaataggtagtattaaattagatgaatttatagctagtatttcaaaaga
aattgaatcaagagaaagtattattcaagactaatatataatatattagtagctaagata
ttgttatataagataagtttaatcaatatgttgatatgttgatacatagtgattaaattt
atgaaaagatgagtataattagaggtacagttaatcatatttttatgattaatgtacctc
tagttttttgtatggtagatttattaataaatatatcatagaagtgttttgaacatggaa
atatttatgtgcattctttaaataaaagtttattttttgaatgataattaagtgcttgtt
ggtaaggttatggctgtaaaaatcataactttatttttatatttgttccattttcataaa
aattattatccctttaagaaaatttcttaatcctcttgaaatatttcctttttagtctaa
agttaaatttctttcttcaaaatgaatatttaaatgaactaaaatttaagtacattttct
aatcttatgagtctatttttcatagataattgccctataatagaagaatctatgttgggg
ctatgtggtgacaataacagcattgtcagtgattaattaatgctttataaatgattaatt
agtgttttatgttatttttggacttaccctctatacatagattaatttatttaactttag
atatagagagaatgtcaagtacatacacagacattagagtttaagaaagtgtttatggag
caagaacttttaaaagaagtagtgacttagtttaatttcaagaaatgataaatacaaaag
aggaaaaagagaggtgttgaaatgatagaaaaagtagaagaaaaatctaagattattaaa
acatcaaaagaatataagcgaactataattgaagaaaaagataaagaatggaccaaaaaa
ttaaatgatatacttagtagaagtagtttttgtaatgatgaattagataaaatcaaggcg
ttaattccaaaagagattttgactaatgaaaatgttggagaagttgtgactgaagatgga
tatgctaagcccgagtatgatgaggtatttaaatcattgttcactttaaataatgaatat
gatttacttgtaaattttataaatgatattctaaaagatgctccatatgctaacaggaat
atcaaaccgttcactcaaataaagagaataattagagttgaaactgatccaacaattaat
tacattggagagaaaagacctagacttgattaaaaaatagctacgcacacttg