Block details
fasta C_difficile_CD00121_1A_020916.fasta
contig u00000crpx_c_020916
start 3535596
length 14975
strand +
type noncore
seq cttctaattaaatcatactatataaatcatatatatcccaatttttaaccttacctcttt
atatttactttttaataaaaaaagatattgactaaatagtcaatatcttttagtggattt
aaatacccacgattttaatctaatttttaatggtttccttaacataatcttataaatatt
aaaatttatctacctataaaatttctccattaaattttattacatttttataccaatcaa
aagatttctttttatatcttttaagagtcccacttccatcattatttttatctacatata
taaatccatatctttttttcatctctcctgttgtaaatgatactggatctatacatcccc
aaacagtataccctataacatcaacaccatcaatttcaatggcatttttcatttccctta
tatgactagccaaatactctattctataatcatcatctacagtattatctgattttaata
catcttctgctccaaatccattttcaacaatgaatataggaagttcatacttatcatata
gttgattaaggtaaaaccttagacctacagggtctatattccatccccaatcagaaattt
ttaagtatggattttcaactacatcagcctttcctgccgagtcattacctgttgttttca
tagttttatcagctgttactacagtagttaaataataactacatccaataaaatcaacta
ttccttcttttaggatttttttatcttcctctgtaatatctaaattataattttttcttt
cccataattttagtgtatgtcttggataatgacctcttacatgtacatcagtaaacataa
gttgttctctattagattctacaaatttaatcatatcctctggattgcaagaataaggat
aacttggcatagctgccaccatacatccaattttaaactcagggtttatttcatgaccta
tcttcacaacctttgcacttgctacaaattcataatgaactgcttgatacataacttctt
ctttgtcttcctgctcttcatagattattcccgagttagtaaatgcataaataggatttg
tagttatactttgattatttatttcattgaaagtcatccagtacttaactttatccttgt
atctattcattaccacttcacagaagtttacaaagaaatctattaattttctatttctcc
atccaccatagttttttactaaatgataaggcatttcaaaatgacttaaagttattactg
gctctatattgtattttaataattcatcaaataaatcatcataaaatttcaatccatctt
catttggagttgattcatcgccctttggaaaaattctagtccaagcaatacttgtcctaa
aacacttatatcccatttcagcaaataatctaatatcttctttataattttcataaaaat
taatggcttcatgattaggataatttaaaccctcaattactccatctgttatctttcttg
aaatagtatgagtacctgcagtcatcacatctgcaatacttattccttttccacctttat
tatatccaccttcaacttgatgggcagcaactgcccctccccataaaaattcttgattag
atttcatagaaatatctcctccagtataattaataaacaacttttattacaggcgttcca
attttaatatgtttattttctttaactattacatctgctaaatcatttgtgttagttagt
attattggtgtaacaatactatacccttcaccttctattttatccttatcgaaagaaaca
atcctatctccttttttaactttatctcctgcattcatatgagtagtataatactttcca
tctaacatagtagtgttaagacctacgtgtattaatatttctacacctttatcagaggta
attcctattgcatgctttgtaggaaaaatagttgttattgttccatttacaggagacaca
acttctccctttgaaggtattattgccatgccattacctatagttcctgatgcaaacact
tcatcttctacttcagataactctatttgtaagccttctattggagataatatctcctct
ataccatcatcttcatcaaaagcaacttcttcattaccttcttcacattcttctttactc
aatccaaagaaatatgacaatactgctcctagcactaatgctgttcctattcctaatata
tatcctaggaatggtgtataaactggcattgagaatatattatgaaatacatatgcatta
caagtaacaccaaatacaccacatataccaccaccaatacctcctgcaatagccaatact
ggaatcattcttctgtatcttaatataattccataaattataggttctgttactcctgct
aaaattcctgtaactgctgttgaacctgctaatacctttaattctgaattttttttagat
tttctaaccttcataaataaacctattgcaatacctatttgagcaaatactgctgcaaca
gctgcaccttctattgggtctccacccattgtagccaagttttgcaaagtaattggtgtg
aagccccagtgtagtcctaatactgctaagaatggcatagctatacctattgcagctcct
gcaattactctgttaaattcaaataatcccataaaaatattagatattatatcaccaaca
ttagttgctattggtccaaataaaatcacagttaaaggaaccatgactaataatgatatc
atcggtactaagaataattgtaaatcctttaatataatcttctttaaaagcttatcaaca
tagtaataaataaatatagcaacaaatatagggaatacaccaaaagaataatcaattgct
gttactggcatcccaaaaaagttagcaccaccttttgctccaattaaagctgtaaaatta
ggatctaacaaagctgctcctatcactccaccaacatatggatttgcactaagttttata
gctaaggtaatacctaagaatattggtaaaaagtaaaatacagcatttccagctgctgat
aatatagcataagtgctacttgtatcagacatccatttcatagtagttagtattgtaagc
agtgccttaatcattcctgctccagctagtgcaggtattaatggagaaaatgcacctgaa
attgattcaaatattttagaaactattgaaactttttctccctgttcttcagtattttgt
ccttgtaaaactgctttttttataatagtttcaaagtaatcagttactttatttccaatt
accacttggtattgtcctccactatttactacagatagtacatccttcatttttaataac
tcttctttgttagtttttgaagtatctttcagcttaaaacgtagcctagttgcacaatga
actaaactaataatattttcttttcctccgacatattttataatttcttcagactctctt
tcaaatttcatacaatctatcctccattttcataattttatgtataaaaatagacctaaa
tcaatacaattagatattaaaaactaattataccaacttaggtcatgcctgccaaacagt
aacaatcctacactatttactttatatttgataatctatttaaatgcaatgttaagtaca
acaattcattttcgctaattttccatttatacgtcttttcaagaaagttttttacttttt
ttgcacaattgtaatcacttttatatttcatttttattatatctaacaatgatgtgtcta
catttgtattctcaccacttaattgcctttttataaaacatcttaaatgacttataaacc
ttgtgtagtcaaaggaatattcatttatttcgattccatagtgatactttatgatatcta
atacattatcaattatcttagttaacaataaagtttcttgcatatcttttgtttctaact
gagcatttgcaaagtgtatcgtaataaatgctatttcagaatcaggaatatttttatcta
atttttttcttaaatattctacagctttcttactaaaattatattcattaggatatattt
gtcttatttcccattgaagcgggctttgaaatactaatccttcatccattctttttaaca
tataacttatatgttctgataatgtgattaatatactatcattaagattatcacccaatt
cttctcttcccatttgaataatttcacttacaagctcaacatcttttaaaggtatcctat
ctagtagtgaatgtaattcacttaatgattcctcattattgaatataaatttcttttcaa
ttttatctatttcaactaaatctttagtaaatttattaaatccaattccttttcccatta
atattacttcttgtcctgaattatctctggcaaatacaacattattattaaatactttct
ttataaccataaactacctccactgtaaacaaaaagagacctaaaaaagactaataatac
tttaagcatttactagaatttttaggtcacgcctgattacatctatctcagtaacgatcc
gtttatttatctgtatgataactttattttcattataaaataataactgtacttagtcaa
tatataatttcatgtatatctctactagattattgtcataagtattcactcattctactt
tttttatatgatttatataatctaaacatgctaaaataagttttgaagttatttcataac
aaaattaaggtcatatattttttattatatatactcgattatttatccatatataaggaa
atcctttattttgtaactacaataactgcctaagttttgattttcttttatcttttactt
ctccttattaaaaaataattcttttactgttgtatctaaggctctaaacagtttaatcat
caaatcattgtttggattattaaccttacctaacttactatatagctttttaactgtata
tctttaatagaccttttggtatgctaatccattttataacactaattcttgaatcaagca
tatattacccttacaaagcatatcttataccctctgtagagttatgatagttgatgaacc
tgaagaaattacccttacaagacatatctgatacaacctcacttattagtttatatgttt
cagaagtatataaataacacatacttacttccaaattcttaactgttttcttagaaaatt
ctaatatgatttccttacatagcgattataacagtgtcttattagatttcataaaattat
acatcctctttacatttaaactttaaatttttatctattgtttattaattaactgtatat
tcactattttttatcatttataatactcttcttattatcttaaaacaattataatctaac
cttaatcacatattatataaatatttttaataaacttaataattaaataactatatttca
ttatccatcttataaatgtttataaactttccactattcttcttcaataaattcaaacaa
attttctactgtagtatcgaatactttagcgatatccatagctaacttcaaagaaggatt
atatttcccattttctaagtgtacaatagtctcacgtcttaccccaaccaatttagcaag
ttcattttgcgtcataaggagtttttctctgtattctttaatttttgttttcatcaatat
tgccacttagttacatatcccccttttatcaaagtatatatacaacactaatttagataa
agactgtataaataaaactgcaatgaggattatacctgtatctaggtttgatatatttat
attacttgtataaggtgttgcaaagaaaatagatattattactatagaatatatcattat
ttttattgcaatcttattaacctttgatagtataaattcagatgattcatcaactaaatc
attatattttttattataaattgaataacatccaaaaactattaaccaactcaaccctgg
aagagaagcagtgcttggacctttaaaaatatatttagtagctaatacagctataaaaaa
ataagttattacaagtaattccaagatgagctttgatcttacaccagtttctgatttaga
catataaaatcactccttaaaagttatatattctctatattttttaatttttgttttcat
aaatattattacttagttacatattccctttttatcaaaatatatatacaaaattaattt
tgacaaagattgtatgaataaaactgctaagagcattatacctatatccaaatttgatat
gtccaaagctcttgtatgattaactgaaaagagaacagctattacaaacatagagtataa
cattatttttgatgcaatctgatcaacctttaacaacataagttttgatgcctcatcaac
taaatcattatattttttattatacatgagattgcacacccaaaaagctaataaaattat
aaaagtaaaccaaataccttctcctttaaaaataaacttttgtaataacaagtctataaa
aaaataggatagcatcattaactctgaaacaagatttgccttaacaccaagctctgattt
agacatataaaatcaccccttaaaagttatatatttataacaccttatgttataaatata
taacttttccaaataaattgcaatagaatattgaaaatattcaataatatcttcataaat
atattttataaaagattttataataaacattacaatacagtactaaattagtttatttca
tctatcatctcaatcatatcatttactaactattattctaatgagcatataacattgaaa
tttataattatacaacctaaatgcctcccaatgtaccctcaaaaacatcatttcctgtaa
ctgaagtataattggtatattttatcactgaaataaaaaaacactagtcaataaagacta
gtattttcaagtattttatcattctttttttaattattggagacgaatcatcagaataat
gcccataatttatctatatgcaaattctaaatttaaaataaagtttcagatgaatttact
attctatgctatgatacaacagaaaaaactgaaatctatgagtggtagcttcatataatc
ctagttcctacagtaatcaaaactgaggtttattctatatgtaactaatgataaatttta
ttataggagttattagctctatttgtgttactataagtagtaattatatatatgataatt
ttttaacacttttctgttggctatatagaaagtggtttagaatttaaatttaaataaaat
ttaaattcaccaaaaagaaatctatattagaaaccactactctattccaccagattgtaa
ttttttgttctttatatcacaatgctataccatattaaattgaaaaataaattttaaatt
tatttgttacaattcattaattcaaaaaaatattttgagtcatgagttttgtaaagattt
agccatgaatttaatgcttctgattcaaaaacatctaaaagtttcaatacttgaaacgta
aattccaacggagcgattcctgaagccgtaactaaattttcatcactaactacagattcc
gttttataatatttttctccagagtaatttggtattaccattttaagaaactctaagtca
ttacttgtatgatttctaacatctaatagcccttttttagctaggcctaatgtagctcca
catatggctgcaactatagaatcttgtattaaagcttctttaactttttctaatattatc
tcatgattcatggataaccaagtatttccccctggcaaaattaataaatccttactttcc
atattaaactcatcaactgtaatttcaggtaaaacttttaacccacccattgttataata
ggatttttatcaattcctacagtaattacttttagtggctttaatccttttttaaaatat
cttcctgtatttaattcagcagttaaatatgccacttcccaatctgacatagtatcaaat
acatacatatatacttttctatttttcatcttttttactccttatgtaattaatttatat
atctaattataaaataacttaactgacatattcagtcagttaagctattaaatttgataa
taatcaattaattctagtaaatcttcaattattttcttcctaaggcttagtggttcaatt
acttgtattgtctttctataaggtaaaagtatatttggtatgtacttgcatattacttcc
tcttcgagcataaatattattttattaggtgttctttctttcaagtagtgccctaaaaac
caatgttggcttaaactatctaaagaatctatactcccttctacaactaattgaattata
ttttgttcatcttttatttcaggtataattccttttataaaaaattcacttgctgaaaat
tctgtcggtctgttaaatgtatttgatgtttctatgatttcactaatcctatccactctg
aaactacgtacctcatttctcatattacaaaatgcaactacgtaccaattattattccag
tgaacaattccatatggatttataattctatattttgattttgctttacgacctgcatga
tagttgatttctacagatagctcctttaatatactattctccaattttttaagtactgat
tctatagacactttcccaattggttttattacttcaagggctcttaagtggtttgttaaa
atatcttcttggttttgatttgaatacatttttaactttaatatcgatttatctaatgct
tcgtctaagaagtatccttcttttttagcaaatagagctgcatgaagtagagatttttgc
tcttctatatcaaaaaaaagaggtgctttagtaaaattatttaaaaggctatacccacca
ttatgacctgtatctgaaattataggtactccactcgcagaaagtacatcaatatatcgg
tacactgttcttatatttatttctaatttttcagctatctgttttgctgtaatttttttg
tcagagtttaacatccacagtatagacatcatattgtcaattttagccatgtagtttcac
ctctttctatttgttatataaagttattatataactttttgattgattttttacaaaaaa
acattagtaaactgctaataatttatactaagatttatttcaaatatttatagatagtct
ttttctatagttaagttatccattaaattacatagtagtatatccattttagttgatata
ttttcagctacctcccttgaatattattacaataagtctaaatcttctttcttccataaa
tatattatgaggaaagactatcatctttaatggtttaatagtataaaagatattaattta
aaaaaatctatttttatatcagatgggtattgttttttataaaactgaaaaaatcaccta
atagaatctatgattttttaacataacctccataaattagtaccaattatcacttcaaat
tcaaatttttatctgaagaatatacaatcatatttccatactcaacataatattgagtgt
ttggcttgtatttacaaattattattctaacaaaaacaactatacatagattaaaatcac
cttctaaacataattattaaaatttaattaatgatatcaattccattaatctcttttaat
aaaaaattctcttttctatatgaaaattatttcaaaacttttaagttaaatacaaaaatg
actataaatagatttttatttacacaaatctatttatagtcactatagtttatccaataa
aataataaaataaatatgtacacaataaatgttatttacgtcttaagtatttatttgtta
gatttttaattaaaaaaaacaagctaatgaacattaatgctaaatctagcattatattac
tttgatctcctgtttgtacattttgacctacattactatctaaactttcatctgtatcta
tatttatatctggttttccattcccatctgtatctatatttatatccggctttccatccc
catctgtatctatatttatatccggttttccatctccatctatatctatatttatatctg
gttttccatctccatctatatctatatttatatctggttttccatctccatctatatcta
tatttatatctggttttccatctccatctgtatctatatttatatctggttttccatctc
catctatatctatatttatattcggttttccatccccatctgtatctatatctggtttgc
tatttcctccattatctgggtctggtttactatttccaccgttatctggatccggtttgc
tatttcctccattatctggatctggtttaccattgccaccgttatctggatctggtttgc
tatttcctccgttatctggatccggtttgctatttcctccattacctgaatccggtttgc
tatttcctccattacctgaatctggtttgctatttcctccattacctgaatccggtttgc
tatttcctccattacctgaatctggtttgctatttcctccattatctggatccggcttgc
tatttcctccattatctggatctggcttatttagatttggattacctgtatcataacctc
ctgagccagtatctacatttttatcaggcttccaataatcatctactccatcattatctg
tatctattgctggacgattataatctgtatcagggtttccatctccattggtatctatat
ttttatcaggtttccaaataccatctccatttccaccttctgtactaggcttccattcac
ctgtattatcagtatctatgttaatatctggcttccaatcaccactcgtatctatattga
tatctggccttccatcaccatcagtgtctatatttatatccggtattccatccccatcta
catctacatttgtcatatctaactttaacttcttttcatcctcactaccttcaatgtaat
ttatatcatctccaatatattttacagtaatagtttgttcagtagtaaaaatatgatgat
tgctatctaaaggtctccattcaatagatgcagtactataattatgactctcactaccct
tattatgagtttttaattctactggatctttatattcctttccattaatatagaattgta
cgtaacctcttggagaggcacaatctggtccttctttcttatctggtgaaatagtaacat
ttaatgtaaacgtatctgttggtttaaaaacatcagttttagctttagactcttctacaa
ctaatgaagtttctgtatcagcaggaataatttctgccttataatatgctctatgccccc
aataagcttcattaaaaggatatacatttgaaaactgtgttgatgtaatgcttaattgat
attttccagcatcaacttgctttgtaaggtcatcacttcctaaatttgtatctggttcca
ttgtttcctcatttaaacgttgagaactaatagtcataaattttttatctgtgagttttt
cacctttaggagtaattattggaatacccccatcttttaatatccaatctaaaaataatt
tttctacatcttcttcaaatggtaatccatcatatcttttaataatcaaatatggtggag
tatcatcaatagtaaattcttcatattgctttaaaaattgagaacctgaacctatatctt
taacataaaaatcatctggttttatatttcctccagtaattttatctataacaactaaat
taacagatacttcagatcccttaaattgatcagaaaaccataagtaaagaaccccttgat
catctgtataactaggtgctccataaggataaatttttccatcaattagcattttaaaat
catcaactaatgtagtactaactttatcttgtcctaaatactttaaagatattttattca
taaaaacttttgttttcttttctaaatcaccgtatgcaactgctccacctaaacttttga
atgttgttgcttttaatgaaccacctgttactataacatctcctgttgtagcacttaggt
caaaaatccaatctcccactcctgtcatataaggtaaaatcgttcctccagttacaagta
tacgatatcctctatttgttcctggattaacacatccatccccaaatgcactaccatgtg
cacctccatatgaataggaaagtccaccattaattgtaatatttccactataaccagaac
ctgtgctaggatctactactgagggacttaatgcattctttgttgttgtatagtatcctc
cacctattccagctccatggtatgcacctttagcagttatagtaccaccattgattgtga
tatctccaccactaccattaccgcctccacctattccagctccatatcctgtattacgac
tcgattcttgacctatagcagttatagcaccaccattaataataatatttcctccacttt
cagtatttccaccgccaatacctgcagaataataatttccaacaacttttaaacttcctc
tattattactatctagtagtgtaaggcgatctcctttttttaacttgtctccattttcta
gagttacatctctaggaatttttccaccctcaggaactataaactctccttcaatatctc
tatttacaacagaatcatcaatagttagagtagtaccttttcctgctctcatacctggat
aatatacatcacctgactctagcttgttttcactaccatcttgtaatataacatgtgcat
atgcaccaccatctttatctggtgttaaagtaaatgggctattagatgcagttttaatat
ttactccatcaaatattaattcagcttttacatctttaggtataacaatcctatgtgttg
ttggagtatttggattattattttgaattgtcatttgttttccactaagaatagttaaaa
cgccacttgcaaatttaaaatcgacatttatttctccaccactaattttaaagtctccta
cagatgtaggatcttctgcagtggcttcttccacaactaatgcattcatatcttcttctg
catttcctgcattagaatcttcttctgcatttcctgcattagcatcttcttctgcatttc
ctgcattagcatctccttctgcatttcctgcattagaatcttcttctgcatttcctgcat
tagcatcccctcctgcatttcctgcattagcatcccctcctgcatttcctgcattagcat
cccctcctgcatttcctgcattagcatcccctcctgcatttcctgcattagcatcccctc
ctgcatttcctgcattagtatctccttctgcatttcctgcattagtatctccttctgcat
ttcctgcattagtatctccttctgcatttcctgcattagtactttcttctatagtatctg
cgaaagtatttgacgcattaaatgatgctactgatccaagtcccattgagatacttaaaa
tcattgatagtgctttctttttacatttttgttgcataaattccccctccccttaataat
ttttaatatacactgtatacatccttatatacactctaataattcttaatatacactgta
tacatccttatatgcactctaataatttttaatatatacttaaaacttatatttgtcaat
gaatatactgtttttttcaaccttatatattataagtattcattatttgctaaataacta
caataaaaattttaattatataaaatttatttaattttttatataataatactaaggggt
aattaattgaaaaactagtaaaaatattaataaatattatttgcattattgcgctaactt
tctctagcctttcgatttacataaaattatctgaatataaaaaagctgatgaagtatata
cggaactcagagaaaacactatcaataatagcaaacatcaagaactttatgataaaaata
atgattatagattctggcttaaaataaacaacgtaaatataaactatcctgtagtacaag
gatataacaatgatttctacctaactcatgatttttataaaaattatcttcctttaggta
gtattttcatggattatagaaataattttgaaaatgataagagtttaatagtctatggtc
attatatgaaaaataaaactatgtttggtcaactagaaaactatactgatgaagtatttt
tcaaagaaaataacttagtagaaataaattataaagtacaaacttatacttatgaaattt
tttcagtatatactgctgacttaattaacagagattatttaagtatacactttaataata
atgatgagtttaaatattctttgaattatataacctaaaaatcagtacacaaatctgata
taaaggtagatatttcagataaaattataactttgtatacttgtaactatgaatttaaag
atgctcttactatagttcatgctaaattaatttcaaaaaagagacctataagtaggtttg
tgtaaatgcagacttatctacagtcttttttgaacgtaaaattggtaagtatggaataat
atttatattaaacttttgtaggcaaagaaatgaaaaatcaaagagaaataattattacag
atttagattaccaagctgaattaagaaagtgtaaaactatggaggatgtagttggtgaag
atagtatataatagcttaacttataaattatcttggtgatattaatgaagtttcaaagta
tatattatttattgatataaataaaattaaatctgtttctaatagatgtacctttgtttg
gagacaaactattgaagaaatataactaaaatgttgaagtagctacctgactttattttg
aaatgcgaacaagattttggcattaagataatttag