Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00108_1A_020476.fasta |
contig | u00000crpx_c_020476 |
start | 3410506 |
length | 10059 |
strand | + |
type | noncore |
seq | atacttctagttcatattaataaatcatttattatgtaaggtttattactctttaaaatg ctatatactcatttttatataacatttttattaataatttaattagatagtatttgtatt actttaattaaacgtaacctcttgatataaatttgagctataaatctatatcaagaggtg ctattttatttttaatataattaatattctattacgcaaaaaatgcatatatttcattat tttatggaaaatattacttcatttaactctatatcaaactcattaagtaaaaatctaatt atatttaatttagcctctgtatttaaatttgtttctaaatatatattttctgatatttta ataccttttcttaatttatatgcatctctagacttaatattatctataaaatctctttta taagttttgtctacaatactgttaaaccttacagaatccaaatcatataaagtaagagca acttgttcataaaattctgtccaatttttagccttatatgactctcctaatatactaaat gatactatactttcatttgtaaaattaacatcatcatcctctaacgtaaatatattttca ctgttacttggaggttcatatgtaacacttggatatttccaaatttctacagctctatct agtaatatcttagttctattttttatttcttcttcattccatttatctatagatgaaata tatttatttagataaagcctactatctttaaatccatcttccatttctttcttttcttca aatgttttattacttagttttgaattatatcctgtcaaagttaaatttccaattgtatgt aaatatttatcatgtatctccttatagttatctcctagtgattccttccatttatttgtt aatgtctgtggcattatatgctctatatttagcatattattattgattaaattttctaaa tcaacaatttctttattactataattctctaacctctcaagtatatataacttattcttt gacttagtattatatatatctttagtttcaaaagcatttgaaaattcactgtcagtagga aatctttgagatgatttcttatttataaaaatatatcttaatatattagaatagttttct ttataatcactaaattttttaatttcccttcctaagttcataaatactttattcagtgca ttcggaggtacatcacatactattcttcttaatataaaacattctactaaattaagggat tctacaagtacttttttatttattataccttcattataatcatcaaataattctaatata aacggatatgatacaaatatttcaagtttgtttatccttttcaaaactttgtttacatca ttatcatcagtacatgaataagatatctctctataatagttagaaaatttaagtaaatct tttaataaaatttctatatctataccattatctgatacataccttttaaaactaaaatat actttatttttattcggtatacttctctcctttatagtcaaatagtctcttataaaacta cttacgttgctacttgtatttttttcaattttataccaataattattataaaattcctct tgtaacttagagcttctacccattaacacaaagtttcttactctatcagcttcacttaaa tctaagccagttgaatttagactttcaaagattaattgagggtcatcttcaccatttttt aactctatttctactatagttaatttctgtatagcatcaaacaaatcatctattgatata ttatcttcttttattctattataaaaatataaataatttgaaactatattagaatttcta tctgtattcatttcttcttcaaatagttcatagtacgcttttctatcttctgctattggt tttaactttatttttccatctttatctcttgagtgcttgtttataagataacactcctta atctgttcttctgttgtaataattccttttgattccccaaactcttttattatttgacac atggcaatcaataatattgacacagtagtcactctttgttgtccatctattattaaatat tcttttcccatactatatatagatacaactgaccctaagaaatgagttctaaatccagaa tctattatatcctctaaatcatcaaacaatcttttacattgttctttcttccagttataa tttctttgatatacaggtactacaaaacttttgtttgacccctctaaataactaagaaat tcaatttctcctgctttcatattaactccccctataagttaaataaattccattcataac tccatgtatctatatattatatcaaaattttgactcataaatgtatatgaaagccttatt atatacctttttatacctgtttttattttattaaagtaaatacatgattattctataaaa tatacaaatacttaattttaaaaattattatttaatcttcttcatgagtaattcatagtt atttatcaattaaaaagagatattgcataattattcaatacctctctttgtatatttaca ttatccatatctagttatctatttcaacccaatattagactacctactaataaatttatt ctctacatcattaacaataattttgcactaaataacatcattagcctatctctgatgcat tttctttaattttatttatagttttaatcaatttatttctctcttcaatatgattttcaa ataaatcaattatacttccaacagttctaaatgggtcttccatcaacactttgttatcct ctataaatccattcttgactacataatcgactataagtttaacaaaatgtatttgcttag tattaaagctcttattatttaaaaactctgaaaaagcttcatttgcagcttctctatcca atcccactagtcttctcactaattgacttactggagtatctccaaactccttcttataat catcacaattacctaactgttttaagagtatttcctccaacgtttcaacatcttgctttg ttatctttttattatttcttaatttaaatattgctaattcatctttatggctatttaaat aatactctaccttctttttataattcttaagattgtttgcattatatacagaatcatttc tatcttctgctacaatcatatcttcaaaacttgtataatatatcttttgactagactttt caagatacttaataagctctcttaatgatatacgtacttcttctacctcaaatatatctg aatcttcccaaaaattctctgtcattgctttttcaatagtatatttttgttgctgaatct gtggtatagtcccaagttttgaaagtttttctgctgtagccattacatgccttatacctt tacttgcattattattttgtaagtatgcaagttgtatattatacataactacatcaaatc ttttagccaattcatcatcactatatgaagttatgagtggtgatatatattctcttatct cattttgtgctactgctccaatattgctccaaacattttcatttttatacttatgtacat aacttaaattcatcctaactatataactatcctcatttaaagcttttacagaagttataa gttcttctaacaattcttttctaagttctgcatactcaccttctatatatttaatatctt gaagttctttaaccatacttacctttatattaaataatttttcagtaagtgtttctgctt tatttccctcaaatcctttaggattaaatttaaaaaattcaaaattattacaaaaatcaa atattaagaatctctccttatccatatcaacacctaataaatctggacataatctagttc ctctacctatcatttgccaaaacttagtcttacttctcactttcttgaaaaaaacaagat ttagtatttcaggtatgtcaattcctgtatcaagcatgtctactgaaactgctatttgag gtaatttattcttatcagaaaaatcatctattatagaatctacataatttatactatagt caactgcttttacaaagttcccaccatactttggatacagcttattaaatctttcaacta ttgccctagcatgctttgtattctttgcaaaaattatagtcttaccaatcttttcttctc cttctattttcaacccctctgtcattagcttatttaaaactaaatctattgtgtcagaat taaatagccactcatttactgcattattccctatttcgtctccaatactctcatcatcat taaatgtattttcatattcttccttctcttcatcagaaagctcatcatacttaattccat cttccataatcttagtcttaaactcaatactagtataatctactaaatatccatcctcga ctgccttattatactcataagcatatgtaggtactccattttccatgtcaaaaactgaat aagtatttttatctatctcatcctttggtgtagcagtaagacccattaagtaagaatcaa aataatcaaagattgacttatactttttataaatacttctatgcgattcatctattataa ttaaatcaaaatgaccaggtgtaaacaatctctttccatccttagacttcgtatcatcaa ttgcattcatcattgttggatatgtagaaaatatcatcctagcatcttctgggctgtctt tgctatccaataaattacataacgccaagttaggtaatagcttagtaaaactttttttag cttgctttaccaatgcttttctatctgctagaaataatatatttttaatccaattatgtc ttgaaagtacatcaactatagatatagcaattcttgtttttcctgtaccagtagcacata ccaaaagagttttgcgttgcttattttcaagggcctcacatacagcccgaatagcttctt tttgataatatctattggatatttcatcatttattgttacagaacttaaagacttcttac tctttcttctatccatcataagttgtaattctgattttttataaaatccataaacttttc tatctgaatagtcatcccaaatatacatatcaaaaccattagtcaaaaatattactggtc tttgactatatctcttttccaaacaatctgcatataatttagcttgttgttgaccaattt ttgggtctttgctcgttcttttcgcctcaactactgctaatggcttaccattttcaccat aaagaacataatctacatatcctacaccactttcattaggcataccttgtacttctattt cctcccctatatcttttccaaattcccaacctgcaagctttaattctatatttatatatc tttttcttgtctcaaattcgcttacttcgtctatcttgaaatcatagtttacagtattaa cttttctcttttcagttagtgactttcttaattcctcattttcttttattacttcttcaa gctttttatcttttgaacttaatctctcgtaaagatttttaagttcgtctggtctcgtcc ttttctcttctccatgaagtaataaatcttcattaaagtcttctgctgtatattcatctg aataacaatagtctatccaactaacaaattgatgcaaattgttaagtgaaagtattgctt ctcctctctctatgttcgcactagtatgtacagataaattacctaacttaactatatatt ttaataaaggtaacatatcatagtctataagttctataaaactattattatgaatcaacg tactgagattatcttgataaggcaatactaaatcactatcattagcatatagccatttta ctgcaagctctaaagctcttcttgttatagttgcacaagtagatggactaactagtatac ttttttctgcttctaagcaagcagtattaaaactattgaaatttttcttcttttgtaaaa aatcaaaattacccaaggcttttatcccccttttgtcccttagttaaaataaatctctct aaaaactatttcttacagctgtttcttatactaacaaatacttcttcattttctgtaaac aattcgtacatatcttcaaactgtggtatatcatatccatgagaatcatcatttctcaat tttctaagtgtttctataactatagaagaatttttaggtaataaattgtgatactcacaa gctaaaaggtagtcataaaagtttttagattttatgtttaaatcaattgatttataatac aacattgcttttgttaattctagaaatgataccatatagcttttaaagccttcttttatg tatctagcccataactcaggcatttcttccttatcatataagattttgaagttttgcagg tcatacaagcaagaaccaaaatccctatttacttcttctattgagttccaagataatttg tttctaattaccatacatgtccctccaatctaagatatctattacatcactgttttcaaa atagaatttatttatataatccttaaaatctttagattcataaataacttcaccttctaa aatagcttttttaagtgctattgtataattatctgtaacaatttttaggtctacatcaat gtctaatatatttcttagagcttctgtcttagttgcaagttctgtaattggtactttttt gatgggaatccaagctatgtctatatcactttctgatgtatgtttatctgttccataact accaaatattatgattgctagagtattttcttttggaaatacatttattattgagttttt aatctcatttggtatatttctcatttaatcacctcttgtttattaggtaatattgtttag ttaaataattctcctttgaaagctttttgcattaatgaattaaagttatcttctaactct tttaagttggtttctatttttaattttaatttatccacttgcttaacaaactcagaaaac tgattttgaaattcaattggaggaaccattattaaatattcacctaacttactaactgat aactcaatttgattcgttgaaccattaacacattttctatatattgtgtcttgtatattt gtaaattcaaataacgctgcaaaataatctgaatttaagttatttgaaatacttcttaaa actgtaacatgactatctgctatatattcagaattatcaattttgttaaattttacacat cttcctaatgtcccagttccagtagaatttattaatatatcattttgtttcaaaaatata tcttctatcttctcttttaagttttcatcataatatttacaattttctaccttcaaattt ctccagtatatacatttttgatttataacttttatatttgattgctctacatatttagga gatacacctctttttaaatatatagaaatctctttaatcttcttcatatcaaattttttt gtattattaattggctccccaaacatctcaataaatcttgatttaactaattcatccaat gcttctatttgctcttttcttttatttattaactcttgagctttatttaaaacttctacc attttattttgtatacaaattgtgaaatatggtatttttatatcatttaacttgctttta tttaaagttgcacccataactgctctatcagtattattaaaatttaaagttctcaaagca taatataaatattcagatgttataagttcattattttttatttgaaagttagcaattgct tcatttgtaaacatgtcttcttttaatatggcaactctacctatagacaacttaaaactc attacaacggtatttttaggtactaatttcatattagctttttcaacagctaaatctgtt atctcttcttttgattttgatatatatttttctttcaaatcagaaattgataaccatcta ttaccacttccccaataatcagaagtatttctagatggtgttttgccaatatttatatag cacaattcatttaattttatatactccataccctatacctctaacattctttctaattct tctaatccaacagctatttccttctctaactccctaactctacctataatcacactagga gcatcataaactacttcctcatacactacctctttatacttattaatagataaatcatac ccattctctcttatctcttccacatcaacaaaaaagctttgttctgttctttttctatct acttccccatcaagattatcaaatctcttaataatatcctctatatcactatcctttatc tcatttctcttatcatccaaagaataaccatcagctttcatatcatagaaccatacctta tcagttccacctgtccctgttttagtaaatatcattatagctgtagatactcctgcataa ggcttaaacactccacttggcattgatattatagcttccaatttatgattatcaactatt tcttttcttatcgatttatgtccacctgttgaaccaaacaatactccatctggcactata catgcgcatcttccaccaatttttaaaactcttaaaaaaagtgccaagaataataactct gttttctttgtcttagtcacttttaataaatctgctgacactgcttcataatctaaactt cccttaaaaggaggatttgctaacaccaatgtaaacttatctttatctgtattaacctcc gataaagaatccttatactctatattaggattgtcaacgccatgcaacatcatattcata gcacctattctaagcatagttctatccatatcaaatccatagaacataccattattaaaa tgctccttcagcccttgcactaagaaaagacttgaatgattatcccttaagtattgttgt gatgatactaaaaaacctgctgaacctgctgccgggtctactataatatcttctggtgtt ggtttaataagtcttactatcatatctattatgtgtcttggagtcctaaattgaccatta gtacctgctgtagccactttggataataaatactcatacaaatctccctttgtatctcta tccttacttaattctaaattactaataccatcaactattttagataacataagaggcgta ggaattttaaatattgcatctcccatgtactttgcataagctgagtctttatttccatgt aatttttttatgaaaggaaacacttcattttgtactatttcatacattttttctgaattt ccttcattagaaaacttactccatcttaaatgttgatgttcatcatcaaatatcctttca aaagaaactcccaaaagagttgcttctgcttcattttttgtttctacttcatccaatcct ttaataaataaaagatatgtaaattgttctataacttctaatggattagttaatccacca gtccaaaatgtctcccaaatcttgtctactttgctccttaattctcctgtaatcatatat gactttccctccagtgttcataaaataatttaaatatatattttagtcgtacgccttaat aattagtgtcttatattaaattcaaaattttactacacagttattaaattatttttccta tttacatgttttagttaaaaaactaatgcaatactcttattttatgattattatacatcc catacaaaattattttatcatatatccagcatagaagtcatctacctggataactcttac catattataactttttaatattaatttaaacttagaaagaaattttttatttaattatat catcttccttatttcaaatttctcaattacaatctcaatcaaaaaataaaataagatgct gtctcaaaatagatataatcttcttttttattttcggaatgatgaaaatatatttaattt catacaaaaaagagtgcctcctgaactaaaaagttcattttgagacaccccttaatttaa tcttacttattctctccctttattattaacacttcactat |