Block details
fasta C_difficile_CD00121_1A_020916.fasta
contig u00000crpx_c_020916
start 3442614
length 10399
strand +
type noncore
seq atacttctagttcatattaataaatcatttattatgtaagatttattactctttaaaatg
ctatatactcatttttatataacatttttattaataatttaattagatagtatttgtatt
attttaattaaacgtaacctcttgatataaatttgagctataaatctatatcaagaggtg
ctattttatttttaatataattaatattctattacgcaaaaaatacatatatttcattat
tttatggaaaatattacttcatttaactctatatcaaactcattaagtaaaaatctaatt
atatttaatttagcctctgtatttaaatttgtttctaaatatatattttctgatatttta
ataccttttcttaatttatatgcatctctagacttaatattatctataaaatctctttta
taagtcttgtctacaatactgttaaaccttacagaatccaaatcatataaagtaagagca
acttgttcataaaattctgtccaatttttagccttatatgactctcctaatatactaaat
gatactatactttcatttgtaaaattaacatcatcatcctctaacgtaaatatattttca
ctgttacttggaggttcatatgtaacacttggatatttccaaatttctacagctctatct
agtaatatcttagttctattttttatttcttcttcattccatttatctatagatgaaata
tatttatttagataaagcctactatctttaaatccatcttccatttctttcttttcttca
aatgttttattacttagttttgaattatatcctgtcaaagttaaatttccaattgtatgt
aaatatttatcatgtatctccttatagttatctcctagtgattccttccatttatttgtt
aatgtctgtggcattatatgctctatatttagcatattattattgattaaattttctaaa
tcaacaatttctttattattataattctctaacctctcaagtatatataacttattcttt
gacttagtattatatatatctttagtttcaaaagcatttgaaaattcactgtcagtagga
aatctttgagatgatttcttatttataaaaatatatcttaatatattagaatagttttct
ttataatcactaaattttttaatttcccttcctaagttcataaatactttattcagtgca
ttaggaggtacatcacatactattcttcttaatataaaacattctactaaattaagggat
tctacaagtacttttttatttattataccttcattataatcatcaaataattctaatata
aacggatatgatacaaatatttcaagtttgtttatccttttcaaaactttgtttacatca
ttatcatcagtacatgaataagatatctctctataatagttagaaaatttaagtaaatct
tttaataaaatttctatatctataccattatctgatacataccttttaaaactaaaatat
actttatttttattcggtatacttctctcctttatagtcaaatagtctcttataaaacta
cttacgttgctacttgtatttttttcaattttataccaataattattataaaattcctct
tgtaacttagagcttctacccattaacacaaagtttcttactctatcagcttcacttaaa
tctaagccagttgaatttagactttcaaagattaattgagggtcatcttcaccatttttt
aactctatttctactatagttaatttctgtatagcatcaaacaaatcatctattgatata
ttatcttcttttattctattataaaaatataaataatttgaaactatattagaatttcta
tctgtattcatttcttcttcaaatagttcatagtacgcttttctatcttctgctattggt
tttaactttatttttccatctttatctcttgagtgcttgtttataagataacactcctta
atctgttcttctgttgtaataattccttttgattccccaaactcttttattatttgacac
atggcaatcaataatattgacacagtagtcactctttgttgtccatctattattaaatat
tcttttcccatactatatatagatacaactgaccctaagaaatgagttctaaatccagaa
tctattatatcctctaaatcatcaaacaatcttttacattgttctttcttccagttataa
tttctttgatatacaggtactacaaaacttttgtttgacccctctaaataactaagaaat
tcaatttctcctgctttcatattaactccccctataagttaaataaattccattcataac
tccatgtatctatatattatatcaaaattttgactcataaatgtatatgaaagccttatt
atatacctttttatacctgtttttattttattaaagtaaatacatgattattctataaaa
tatacaaatacttaattttaaaaattattatttaatcttcttcatgagtaattcatagtt
atttatcaattaaaaagagatattgcataattattcaatacctctctttgtatatttaca
ttatccatatctagttatctatttcaacccaatattagactacctactaataaatttatt
ctctacatcattaacaataattttgcactaaataacatcattagcctatctctgatgcat
tttctttaattttatttatagttttaatcaatttatttctctcttcaatatgattttcaa
ataaatcaattatacttccaacagttctaaatgggtcttccatcaacactttgttatcct
ctataaatccattcttgactacataatcgactataagtttaacaaaatgtatttgcttag
tattaaagctcttattatttaaaaactctgaaaaagcttcatttgcagcttctctatcca
atcccactagtcttctcactaattggcttactggagtatctccaaactccttcttataat
catcacaattacctaactgttttaagagtatttcctccaacgtttcaacatcttgctttg
ttatctttttattatttcttaatttaaatattgctaattcatctttatggctatttaaat
aatactctaccttctttttataattcttaagattgtttgcattatatacagaatcatttc
tatcttctgctacaatcatatcttcaaaacttgtataatatatcttttgactagactttt
caagatacttaataagctctcttaatgatatacgtacttcttctacctcaaatatatctg
aatcttcccaaaaatcctctgtcattgctttttcaatagtatatttttgttgctgaatct
gtggtatagtcccaagttttgaaagtttttctgctgtagccattacatgccttatacctt
tacttgcattattattttgtaagtatgcaagttgtatattatacataactacatcaaatc
ttttagccaattcatcatcactatatgaagttatgagtggtgatatatattctcttatct
cattttgtgctactgctccaatattgctccaaacattttcatttttatacttatgtacat
aacttaaattcatcctaactatataactatcctcatttaaagcttttacagaagttataa
gttcttctaacaattcttttctaagttctgcatactcaccttctatatatttaatatctt
gaagttctttaaccatacttacctttatattaaataatttttcagtaagtgtttctgttt
tatttccctcaaatcctttaggattaaatttaaaaaattcaaaattattacaaaaatcaa
atattaagaatctttccttatccatatcaacacctaataaatctggacataatctagttc
ctctacctatcatttgccaaaacttagtcttacttctcactttcttgaaaaaaacaagat
ttagtatttcaggtatgtcaattcctgtatcaagcatatctactgaaactgctatttgag
gtaatttattcttatcagaaaaatcatctattatagaatctacataatttatactatagt
caactgcttttacaaagttcccaccatactttggatacagtttattaaatctttcaacta
ttgccctagcatgctttgtattctttgcaaaaattatagtcttaccaatcttttcttctc
cttctattttcaacccctctgtcattagcttatttaaaactaaatctattgtgtcagaat
taaatagccactcatttactgcattattccctatttcgtctccaatactctcatcatcat
taaatgtattttcatattcttccttctcttcatcagaaagctcatcatacttaattccat
cttccataatcttagtcttaaactcaatactagtataatctactaaatatccatcctcga
ctgccttattatactcataagcatatgtaggtactccattttccatgtcaaaaactgaat
aagtatttttatctatctcatcctttggtgtagcagtaagacccattaagtaagaatcaa
aataatcaaagattgacttatactttttataaatacttctatgcgattcatctattataa
ttaaatcaaaatgaccaggtgtaaacaatctctttccatccttagacttcgtatcatcaa
ttgcattcatcattgttggatatgtagaaaatatcatcctagcatcttctgggctgtctt
tgctatccaataaattacataacgccaagttaggtaatagcttagtaaaactttttttag
cttgctttaccaatgcttttctatctgctagaaataatatatttttaatccaattatgtc
ttgaaagtacatcaactatagatatagcaattcttgtttttcctgtaccagtagcacata
ccaaaagagttttgcgttgcttattttcaagagcctcacatacagccctaatagcttctt
tttgataatatctattggatatttcatcatttattgttacagaacttaaagacttcttac
tctttcttctatctatcataagttgtaattctgattttttataaaatccataaactttcc
tatctgaatagtcatcccaaatatacatatcaaaaccattagtcaaaaatattaccggtc
tttgactatatctcttttccaaacaatctgcatataatttagcttgttgttgaccaattt
tcgggtctttactcgttcttttcgcctcaactactgctaatggcttaccattttcaccat
aaagaacataatctacatatcccacaccactttcattaggcataccttgtacttctattt
cttcccatatatcttttccaaattcccaacctgcaagctttaattctatatttatatatc
tttttcttgtctcaaattcgcttacttcgtctatcttgaaatcatagtttacagtattaa
cttttctcttttcagttagtgactttcttaattcctcattttcttttattacttcttcaa
gctttttatcttttgaacttaatctctcataaagatttttaagttcgtctggtctcgtcc
ttttctcttccccatgaagtaataaatcttcattaaagtcttctgctgtatattcatctg
aataacaatagtctatccaactaacaaattgatgcaaattgttaagtgaaagtattgctt
ctcctctctctatgttcgcactagtatgtacagataaattacctaatttaactatatatt
ttaataaaggtaacatatcatagtctataagttctataaaactattattatgaatcaacg
tactaagattatcttgataaggcaatactaaatcactatcattagcatatagccatttta
ctgcaagctctaaagctcttcttgttatagttgcacaagtagatgggctaactagtatac
ttttttctgcttctaagcaagcagtattaaaactattgaaatttttcttcttttgtaaaa
aatcaaaattacccaaggcttttatcccccttttgtcccttagttaaaataaatctctct
aaaaactatttcttacagctgtttcttatactaacaaatacttcttcattttctgtaaac
aattcgtacatatcttcaaactgtggtatatcatatccatgagaatcatcatttctcaat
tttctaagtgtttctataactatagaagaatttttaggtaataaattgtgatactcacaa
gctaaaaggtagtcataaaagtttttagattttatgtttaaatcaattgatttataatac
aacattgcttttgttaattctagaaatgataccatatagcttttaaagccttcttttatg
tatctagcccataactcaggcatttcttccttatcatataagattttgaagttttgcagg
tcatacaagcaagaaccaaaatccctatttacttcttctattgagttccaagataatttg
tttctaattaccatacatatccctccaatctaagatatctattacatcactgttttcaaa
atagaatttatttatataatccttaaaatctttagatttataaataacttcaccttctaa
aatagcttttttaagtgctattgtataattatctgtaacaatttttaggtctacatcaat
gtctaatatatttcttagagcttctgtcttagttgcaagttctgtaattggtactttttt
gatgggaatccaagctatgtctatatcactttctgatgtatgtttatctgttccataact
accaaatattatgattgctagagtattttcttttggaaatacatttattattgagttttt
aatctcatttggtatatttctcatttaatcacctcttgtttattaggtaatattgcttaa
ttgaatttatatccataatcttttaatctatttatacatatttctctttcttcatcagta
aacaactctttatacttttcttttaatactaatacttctaatgataaatctaatctctta
cactcccatagccttgtaaatccttcagtagctccttctttattgattaattctttagca
gctaataaggctcctttgttatttatcagttgtaaaaatcttgttggcttatagttacat
tgtaaatcagcttctttatagatatttaccatgttatggtataaatctagctctatttga
ttcatagattttattcccccattttaataattgtattttagttgaataactatcctttaa
aagctttttgcattaatgagttaaagttgtcttctagttcttttagacttgtttttattc
ctactttcaatttgtctacttgattaacaaactcttcaaacttattttgaagttctattg
atggtactggtattaatattttttgaagttctttgcttctaattccttgtgcagagctac
cagttttatatttatctatttctaccctaaaagcttttgtttgcatatattgtgctaaaa
aagcattatttaaaatttttttatctccctgaattgttataatcctttgacccatagcaa
acttttttaaatcctttggtatcctacatacatttccaaatgtatgaccttctgtaacaa
aaagtacatctccagctactggaaaacctcttttcatccaagaattataggtgttttcag
atatatattcattaatatatttaaatacaccattccctacagattttgcatttattattc
taattccattctctgaaagaattggagttttaccacgataatcaataaaatttgtacaat
ctttcaataatacaaacttttgttccttaaaatttccaaacatttcaataaatcttgatt
taactaattcatccaatgcttctatttgctcttttcttttatctattaactcttgagctt
tatctaaaacttttgatatatctttttgagcttccatttcaggtaaatctacttttaaat
tttttaaatcattaactgaaaaacttgcttgattaactgatttttttattatccttggta
actgtcttctaaattcattactattaaaaaaataatttaaatactttggataacaaactt
ctttatctggtcgtaaacataaaagattcattccatgtataatttttttatttatatctt
catatattgcacttttccctaaatgtttttcactattaatatgtgacattagtatatctc
catttttcaataaatagtcttctaattttcctaactcttttatgtcagcatatcccattt
tattagtatcaatataagagtttgctatagtttctattcttgtaattggatatccaaatt
ttgtatcaaattgtttaatactagccccatttctaataaattcaaaaacttcattcaatc
tatattccatactctacacctcaagcattctttctaattcctctaatccatctacgattt
ccttctctaactccctaactctacctataataacactaggagcatcataaactacttcct
catacactacctctttatacttattaatagataaatcatacccattctctcttatctctt
ccacatcaacaaaaaagctttgctctgttctttttctatctacttcaccatcaagattat
caaatctcttaataatatcctctatatcactatcctttatctcatttctcttatcatcca
aagaataaccatcagctttcatatcatagaaccataccttatcagttccacctgttcctg
ttttagtaaatatcattatagctgtagatactcctgcataaggcttaaacactccacttg
gcattgatattatagcttccaatttatgattatcaactatttcttttcttatcgatttat
gtccacctgttgaaccaaacaatactccatctggcactatacatgcgcatcttccaccaa
tttttaaaactcttaaaaaaagtgccaagaataataactctgttttctttgtcttagtca
cttttaataaatctgctgacactgcttcataatctaaacttcccttaaaaggaggatttg
ctaacaccaatgtaaacttatctttatctgtattaacctccgataaagaatccttatact
ctatattaggattgtcaacgccatgcaacatcatattcatagcacctattctaagcatag
ttctatccatatcaaatccatagaacataccattattaaaatgctccttcagcccttgca
ctaagaaaagacttgaatgattatcccttaagtattgttgtgatgatactaaaaaacctg
ccgaacctgctgccgggtctactataatatcttctggtgttggtttaataagtcttacta
tcatatctattatgtgtcttggagtcctaaattgaccattagtacctgctgtagccactt
tggataataaatactcatacaaatctccctttgtatctctatccttacttaattctaaat
tactaataccatcaactattttagataacataagaggcgtaggaattttaaatattgcat
ctcccatgtactttgcataagctgattctttatttccatgtaatttttttatgaaaggga
acacttcattttgtactatttcatacattttttctgaatttccttcattagaaaacttac
tccaccttaaatgttgatgttcatcatcaaatatcttttcaaaagaaacacccaaaagag
ttgcttctgcttcattttttgtttctacttcatccaatcctttaataaataaaagatatg
taaattgttctataacttctaatggattagttaatccaccagtccaaaaagtctcccaaa
tcttgtccactttactccttaattctcctgtaatcatatatgactttccctccagtgttc
ataaaataatttaaatatatattttagtcgtacgccttaatagttagtgtcttatgttaa
atccaagtttttactacacaattattaaattatttttcctatttacatattttagctaaa
aaactaatgcaatactcttattttatgattattatatataccatacaaaattattttatc
atatatccatcatagaagtcatctacctggataactcttaccatattataactttttaat
attaatttaaacttagaaagaaattttttatttaattatatcatcttccttatttcaaat
ttctcaattacaatcttaatcaaaaaataaaataagatgctgtctcaaaatagatataat
cttcttttttattgtcggaatgatgaaaatatatttaatttcatacaaaaaagagtgcct
catgaactaaaagttcattttgagacaccccttaatttaatcttacttattctttccctt
tattattaacacttcactat