Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00058_1A_022457.fasta |
contig | u00000crpx_c_022457 |
start | 3997977 |
length | 15358 |
strand | - |
type | repeat |
seq | gataccgacgtgggttacatacgaaccagcgttataggtggaatggaaaaataccaaatc gccagcctttgcctgcgagagtggaagatgttgggtagcgtcatattgcatttgtgctgt tctaggtaaagagataccagcttttccatagcaccattgcgtaagtcccgaacagtcaaa ggaagtgttcggattactaccgccatatacatacttccagccttgatacttcaacgcttc attcattaccttttgtgccagctctcccaatacctgcggaacagttaaatactgattgac taattccacataaaattgattgccatactggtaacgccagccaccatttttcacaacagc tatcgggttggtgtaggttactttcttaccacccgatttctcacgggcgaagctctctgc aagattgtatgtatgtttctttccttttcctgccacatatcccacataaccaccgccata gttataggactgtatcgctacattcaaatcgtcgataccttgatttttgcaggaagaaag cagggacgcaaaatatttacacccctgcttgattgagctttccatatctaaagagttagg cggtagtcccagactttcgctggactgcatgacatcttctgccgtaccgccactttctac ttgaatgatagccagcaacacattgacatactcggagataccgttttctctggcgtattt ttccaccataggctgatgtttcaaaacttctgcggataaattcatacccgtaatacccga agaaaagttgctgttctcgtcgtcgctgtccgcactaatcaacaccccaaagaaaagcac cagagaaaagaggataggaaacagactgccaatgagagcgatatgtttcagtttcatttt ttcttctgtcctttcttcgttacaagattacggattttctctgtggtctgctggttcttc tggacagtctgggtctgctgaacctttgtcctgcggtctttggtgtaattttggcgtgtt tcctttgacaccgtaaccttttctacattctgcctatgtgctggctgtgccgactgggtc gctttcacatcagaaacacccaaagataacggacgctctttcacagtatttgtcttgact ggctcacttactttagaagtcggagctgtggtaggacgtttgacttcctgcattttttca acactcggctttggaatggttgaagctgtggctggtcgctcatggggacgggtagctccc gttgtcgctgatccgtcagcctttcgctgtgcctgccttgattcttgtgccttttgaagt tccatacgcttgtcagcgatattctgtctatgctgttcttgcttttccaaacgtcccgtc tgtctggactgctgttcctgcaccatgccacgtttgaagtcggacacgctggattttgcc ttttcctttgcagaatacaccgcataagcggtctgcgtcggcatatccttgatattctct ttgacagcgtttgccttgtctttgaccttattttttgtatctaagacagcacccaccttt gagcctgcacgctatcccatgctggaagtggtattgccccgattttccttagaagctgta ttttttctttccgccctcttgccagcaacagaacttccagccaccgcaccagcgacaccg ccagccgtaaccgcaccagcaagccgtctttccatacgcctagctctatgtgccaagtat agatatggtctgcggaatatgcgtcgtcccatgctttgactgtcgttagcgttcagagag aacatactcattaagtcgcccagcttcatgtagataccagcgaaacatactatctgcaaa aacgccaccataaagaacgggtagtctgtggagatattataaaacatactggaaatgctg aacgccaccgttacaatgagggtaattcctgcccttgtcattatggtattaaataccctt acgattgcctgctttgccatgctctcatagctcggtatcatggaaagtaaaaagctgata ggtaaaaacattgcaaagataataaaaagtatctggctaaacaacatcatgcccataagc aagaatacaaatatcgttatccctaagttgaagaacagtaggaaaaacaccatacctaaa cggtttacgacctgcggtatcgtcagattgttgttgtcgttgtcctcgatttctgttttc acgacttcctctctggtcttgccgtcctcgtcctctgggcttgccgataccagagcttcg acacggtctgtcccgatttcctctgcgttgctgtttccaaattgtaagagtagccacggc tgttccacttgaatagaaaataaactgtcccgtatcaagtccacgctgtccttgccctcg ctgtcagagttggggagcatgatttttgttcccaagtcaagtgaagcggtactgatgtct gatgaaaattcatttatcttcttgatgtagtcgggagcataggcaataaacgaagcggac agcacgaataccaccacaaagttgataacggcgtgaagtgccttgctggtttcccttttt atcagtcccgtataggcaacatatattcccactactaagataatgagaagcaggaaacca acatagaagcccgtagaagaaaagccgttctgtgttacgcctgcaagggtctgtatgctt ttgccgatactgtctgccatatcgttgatgaagtccagcttgtaggcttcctgcaccaca tagcccgtggcattgcttaaataaaggcttattgtccagacaaagttggtaatgcagtaa agcccgtactgcaccgattttccgataccgtccagccagttccacggcaaccacgaccag ctattgtctacatagaaatcaagctggtagttggaaagcggatattttgagtaaagattt tctgcgtttatggtatcatccacaagccccgttgcatgagccaccgtccccagaagtgaa agcaggataagggagagtgccaccacgaacagagtcattttgagaacgtgaaatatcttc ttttttatgaacgcaccttttatcctttctttcatcactccacctcatttctctgtacgg gcggtctggtatcaaaggcgtgtagtaattcttcaaagactgggtgtatctgcaccacac cgacacgcccgtataagtcctgcaacaaacattgtccgttctccaaatcacgcaagcgtt tctggttgttctcgtcgtccttgtcgataccgaaaaattctaaggtctgctttatctcgt taatatcagtagaacggaaagcgaatttcaaaccgatattgtttttcagactttcttttg acacatcataggcagactgggtaacaaaatatacgcctgcctgcatagctcgtccagcac gaaccagtttattagaaagcgtttcaccttgtgccacatttaagaacgcccacgcttcgt ccaaatcgacaatcttaaaaatgcttctgtccgaatggataaaatcaagggcaaaggtac taatcacaatcagcatagacaccgacaacaattcaatggtcgtgtattcctcaaaagtgg tatctttatctggtaatactaagtccgctacttgaatgatattgagctggttatccagac tgatagcattttccaccgtaccgtctgaaaacagcagatgtgcaaaatcatagtccgtga agctgtcgatatggtctgcgatattgcgtgagattgcggtatcttcttttctaagttcct ctatcacatgaagcaagccccttgtttcactctgggtaacggaacgcaccgccttacgaa gtacggggaatttttcgccgtccctagaggaaatacccgtaaggaatgtcaagatgtcga ttgccagactttcagcgtctttgacattcttcataatcacgaatgggtcaagaagtcctg cattgtccttgtcgctggtcaggtttacgatattgatttcattggcgatttctgggagcg tttctttccagttgcctctctcggctttggggtctaaaatgactgcttgaccgccaaaca gcaccgcataatacaccagaagattgttgcagaacgactttccaccgccaagacttccga caaaggcagaagctaaagcattggtaactgtcccctttacgccctgcgaagctaaagacg gttgcaggtacacatttcttcccgtatcaacggaatagccgatatagatacccgtagttt cccctaactgctgtgtcgctccaaagccaagcccagccaagaagtctgattttacatact gcacataatcattgatatatcgcctgctggcaggaagaaattcagagtgaagccccagca tatccccagcaggacgtaccagctttacattgaggtcgtcgtaaaagtcctttacttcat cacaacggcgttttaattcgtccaaatcatcagcacagacacggataacataagagagct tatacatactttcttttgtctggtctaaatcggtttccagctcgtccacgctgtctaatg cgtccaccacatttgagctggtttcacttccagcttgataggcgtgattatccaaatctt tcaattcctttttcttgttgcggactgtcgttaatgcttttcggttttccacgatttcta cattcatgctcgtatcaacgggaaaggtaaattgctgttgctggaagtagaatatttcac ttgacggaaaatcaagctccccaacaatcgcattgacggtaaagtaagacacatagcttt ccttgtcctcatgttccaagcgtaaataccgctggctttcctcaatcacacatcttgtcg gacggataaggtcgtaatattttatcagcgtttctttcttgtatttcttttttggtaact ggtactcataatcttcataagcgacaccgtccctgccgtaaagatgttccatgagatacc caaaatcattgatttccaagcgacgcaccttaaagcgacgggagattttattttccagta acttttccattttcatgtaacggttaatttcatcattcggcatggaaacaaagtcgttca tcaacgtgtggttcacttcatggagaaattccttgaacgtcagccacgccgattttttga tgttcttcagattgagctgttcttccgtaaccatgagcttaaagccaagaaaaaagcggt agtccacttgattgtccccaatcatagatactaacgcttcggtctgttcgtctatcttct ggactgccacctcacgaagtttccccgtaaccagcttctttgactgttcctgcatacttc taattgagctttccgtcgcaatctgcaacgcatgaattttaccctcacgggactgtgcga taagctgtcggaaactgtcatgcacgataaatttctgctctgtggataagaaagaatagt tgtacggtatcagctcatagtaagcgaacacctcattgtccttgttccagacaaggttgt tgtcaatatattttatcgggaacatagttcacactccttactgccgtgattgtttcattc aaggtttgcttatgcagttttacggcttttcctgcataagtgatttttggtcgcagggca taggttatctgtgatttcaaaaagctgtacggcttctttccgtcaaaggttttctgcgac ataaaccaagtgagagcaacgggaataccaaagtatttgagaaatgctccctcaatcatg gaaagtgggggcatatccccaaacagaatgatgataaattccgtaatcacaaaccatgta atctgtgtaaaggtaacgggaaagggcaagttaaagtcattgattgcatacaagactttt tccacgttccagatacccgtgtagcttttaatctttttcaagttctttcagctcctttcg taagtttctaaatggaaaaggacagccatgtttcagactgtcccgtaaagagaaatacgc tgtcagtagcaacaatccttgtcgctgatcttccagcgttaatatggtatctcgcacata cctcggcttgtttcaatgaagcaaccacccatatccaaatctcgcccgtaggcttcatag tcaatgtaattttgtaagctgggtggaatatcccccagtacctgcaattcgtctatgtag taataggcaacatctgtcatgctttcacagtcgggataataataaatatcgtccttgtgt tccatgacttcttccagcgtcccatagtggctgataaattcgtccagacactctacaata tagtcgggaagttcctctatcatttcatacatctcattgagttcttcaatggaaatatac tcgccaatcgcaatggggaagttgtcggtatcatggattgcgtattcctcatactgttca ttcaagccgattttttcttttgcatcttcctcgtcaatgggaaatgtgaaccaagcaccg actaaatagccctcattgtatttgccgagattagcaatataaaccgccatatcatcaatc ataagcaccacctcatttcttactctggcagttcaaagataccgtgttctgttactaaaa acttcccgtgttcctgcaagtgcaaagcgtaggcttcaaagtcaaaatagtattcttgac agtcctcggataaatgcttgaatgtcgggtcattcatcagcttttgccttgcaacatcaa tcatgcttttgcagtcgggataaaccgtaatcacgttcctgcaaatataaagtgcttcta aattttcatacacggaaagaagcgttgtatattcttcctgcatatcgcttgaaagctggt ggtacataaaatctaattcgttgagctggtacacgctggtatgttcatggacttcatcag caaagggcagtaccttttcgataatgcggtactcttgactttctgcaccaatacctaatt tttcttcaaactcggcaacatctatcggcaggtcgaaccagtatgatgttgtttcttcgc cagttgttcctctcgtttccaccagcacccttgtttcctgcattgttcttcacgtccttt ctgttgtttcatcacatcttttaaggtctggtatgacataccaaacacatatttagaaaa atcttctaactgtttttcttcataattggcaaggttcagccgtttcatttcatgccacac cttacgcttgtaagagggcaggtcggaaatataatcacaaccgacttttacctgcatatc cttaaaaatatcgttcatttcatcactccaatctgattttaggtaagaaaaaagcagtca atcctaagactaactgctttatgtgtaagtatgaatttgtttaagtgtaactgatttgcc atgtgtactcgtaaagtttactgtatgtttgacttttaaataaatatatacaatcaatca tttgtaacttgccgtctttttcaaatttacttattatcagattatcttcatagatatatg ctaagaaagtatcatactctgcatagtatttttctctaaaaagatttgactctctaaaat ctttttctaaagcaattcttatactatctaaagcatatttaaagttataacgagtattaa aactaaacttgtatggaaaaaagaaaaataagtttttcttgaaagtaagcaatttcacat aggtttgtacatcaaattcaatcgttccatactcatatttctctgtaagacaagaatgta aactttcacaatcataatcccgcaacgaagcaaataacctagttacagtcatttgtgtat ttggtcttctcggtggacacttaccaattacaccatcacagaatttctgtatttgaccag taagttcttttgaagcatgaagtcttgttgtgctttcaagtaatttaaagtccatttgat aattaggtgagttacaatcacattctccatgattttcagatttaggtggtacatattctg caaaatttgatttttctctaaaatagattgatttattaactaattccaacaagtattttt cataattacaattttcttcatctttaataaaatttttgtttatgaatactgcatgtaaaa tatccactctcatttcatctgaaatcataagcacttttattcctttcaaaaaataattta tcgtacccacattataacattctcatattacagcaacaataaaattcgttatgctccaat aatcttattgaacagctctaacagtacatctttcacaccgccagcattgaataccaatcc gacagcaatcaaggcaactaccaagaagccgataagttttgaaaactcacgcttgaaccc taagtagataccaataaccacaatcgccataagcactaagctctgtgcgttgcttaaaaa ccaagtgtaaagattttgtccgaaattcatttaattgtcctcgctttcttttaattgttt catttcatagtcagcttctttgccgacactcataatacacatcaagactacgccgatccc attcccagagataccagcaggaagtcttttactaattcccacattttttataactcctaa ctttttactaaatcttttgcaggggtcgtctgctgtttgattatcatttcatgcttttct gtgagctttgcctgctgttcgattgtttccatgtagtctgtaccgtttcctttatcaatc tttttcagcattttcaaggtcggtgctacctgcctttgtacccaacgcaatgtacggtct aaggtataaggctctggctttgtcgtcagtttcagactttgccgattatctccaataaac cacgcccagcggtcattgagtttccagtcattttttcgtttgtcgggttcttcatcaaca aaccgcacatactggttgatgacagaaaaggcggtctgctctgcgtcataataggtcagc aaatcccgtactgcataataggcacgttcattccgaagccgtatctcaaaacgattgata atgtccgcttcttccagcggtatccctaacttgacatactgctcatagtccttttcatag atacagaaatacacatcagatttcagcgaaccaagataaagggtacgtcccatatattcg tcctctctgtgcttgataagctcgcccgactggtaaaacttataacttctagactttccg atatattcccgtttcctgcatttttccgcaagctctggaatatccaaaatgcccgtatgg tcgttgatagcaaggtcgatacgcttcatcacgccaccgtctacgagtgcgtccatgagg aagtcataccagcttctttgttgtgccagcaggtaactttcaaactgtcggcaaccacgc ccctttaactctaaaaggacacctttttcttcatcagccgaagtataaataaagatgtcc cctaaagagtaatgctccgtataactgtaatgtccgtaatcttcatggagcatataattg atattcagttttaatatatctttgatgatatgctgtatatccagcgtgggaaaacgaatt ttcacataatcaaacagcatggtaagcggtgtttctggattgaaccttgccagttcctta tgcagagtatgaagaagttcctttgacggcttcatttttccgctttctatcttgttgaga tattcccttgtgataccagaagccaccgccagcctgccttgtgagataccgtaagcaatc cgtttttcccgtaattcttttatccattgttcttcattcagaaccatacctccaatctgt aatgtgtgaagttttttaaggcgacttcacaactgaattttgctaggaaaccatgcgata agccctatgtttcctatgtttttcgtctattgtctatttgtaaacgtacccctctgttag ataccgaggggttttacctgctggcgtggcttacgccacaccagcaacggctagtccgtg ccgtcgcctttcgcttcgcacgttgccgtcccgtcctgccttgcttgtgcaagagaaccg attgtctgcaaaaaatcatgtcctttcgggactaaaggcgtgtaaaattcacttatgacg cttgttcccacatcacaatatccacgccctttgatacgcttctggaaaaactgctttttc acatctgaaccaaacagcataccatatcctaactcgctgatacgccccaatcccacacgg aaattgaagttatctctgataccgtccgagaaatattttgcgtctggtcgctggcaggca acgataaggaaataacctgcttgtcgtcctaacatgacgattttctttaactggctaagt aagcccacactttcttttgtccccagcatttcaaaaaacgccacatattcatcaaagata agaaagcaggggggcagtcccagataggcgtagttttcgcccgtcttatagtctgggtat cgcttcatttcctcgcttcgctgtaccattccctcataaaaggaattgacgcagtctatc atttcttctttggtgtgatacacatttcccatgactgtccccaagtccgcaaggtcagcg ttcttcgggtctaagatgtaaaggacagcgttggtgtgcagtagggcttcaatgagcgtc agcagaaagtaagtcttaccgccaccagtcccaccagcgataagggcgtgagggagtgcg tcatattcccagacaagatttttcatcagcctaagacagccgttttctgcccgtacttca tcaatggtaatacggtttgctatcatgtcataaagcagggtatattcaatatagccgtca tgtaaggtcttgtcggtcagctcacaatacaaaccactttccagtttatcctctaaccgt aagagctggtcttgatatttccccagcgtgatttcacagcggatatgaagcaagcctttt tccatttgataataaatctttggaaaccagacgattttttcccttgatctgctttgcagg tcagtaaaaaaaccgtcgtcttgtatggtatcagcttcataccacttattttccagtatc attcttgccagcttttgacggtgcaggagcttcttgaaactgtcgtaacataaacggtaa tacagaaaagcgactaatgcacaaacaccagtcgctatcagtacggttatgaagttgtaa ggggaaagcgtcaagccgttttctaacaagctgaaatgctcccaatcggtacgcatgagc tgttttgtatttaatagcagtataaccgccacgaacacaaacagaagcgtccttatggaa aagtgatagacaaggtgcttatcgctggctctgatacgctttcccttatattttaatcgt tccatgcttgctccttattgcttattttttcggctgtccctgcggtgcatggttctgtgg attgcctgcgttctgattgcctttattcttcaacacaatatcctctgcctttacatacca gtccacctctgcacccgtataagtctttcttgatacggtatcggctactggattgacaag ctccacaactgcattgtacggaaattctcttaacggtacttctggcggtacagacacggg gataattcccccatgcagactgcacttcaaatcatagatacgctttttaagctgggtact cggtgtcccgtcctcattctgcaagaacacatcacgcaccgctgtaaattttaattctcc aaatgttttctctttgtcaataacaaaaccgtttgataatctcataatttcttcactcct ttacttttcttcaacagctacaatatcatcagcaaacaacacataatcagtatgtcccat atccccgattgcgtaacccctgccgtgtaacttcggattgacaagttttactttctgttc atacttgaaatgtttttcgccagcctgcacgggaatttccaccaccacattttcgccttt ctgtacgtcagaataaaggttatagcttcgtttggctacgaccttgcggttatttttatc cctttcaaagataggctcgctttctcctgcaaattcaagagttccaaaagactgtgccat atctggcacgacatatttcatttccatattgttttacctcatttctttctatttttgatt agttaattgattgtgatttcttattctggcaattagggaagtaccagcaagccctcagat agtaaagggtaaaataaatgctcacgcacccttgactatccgtgttcttgcaggtatatg gcagacaagccagaataagcggaagtctgccgtttgacagcttcggaggagagcgtgatt tttcttttctcataccgttaccaccttatgatttcttcattttacggcgtttataaagat atgttccagccagtccaccaccagacacaagcaacatcacgataaaagccataaggtttg tactgtcgcccgttttgggactgtcgctaggtctgctaggcttttctggtgtctgtggct gttcgggcttctctggaacttctggtttttccttaaaggtaatcgtctgtccctcgtcct caatgtccttatgttcagtaactttcttcggctcgtctgtattgcttaagtcgtacaatt cttcaaaagttacaagctgtttgccgtcaagggaggtagcgtcaaaagtaaaggcaactt ccactttcatattttcgctgtcagcgataaaggtgtaatcactttccacacgttttccat tgacaagaagctctgcattttcttctttcaacatctgccagcccacaagtttgtactgtg ttccgacttctaagccctctaaggttacggtatcaatgattgtaacgtcttttcctgctt caagctctttgttgccgtccttgtcggtagcagttgtatgaattttgatgatacgctctg tgataagtaccgtctgcccgtcgtcctcaatgtccttgtgttccgcaactttcacgggtt cgtctggattgcttaaatcatacaattcttcaaaggtaacaaggttcttgccacctaaag cagacgcattaaatgtataggaaatttccactttcatttcttcctcatcagcgataaagg tatagtcgttttccacacgtttcccgtcaatgattagctcggcgttttcttcctttaaca tctgccagccttttaactggtattttgtaccttttgtaagtccgtccaatttgactgtat caacgattgttacctcttttcctgcaaggatagtcttttcgccgtctttgctggtcgctg tggtatggatagagatttctttttcgtattcatcagtcaaagtccctaaatcaatcacaa ggttatttcttgatactacgatttcaaaaggcgggataagttcaaagcctttgttgcttt cacatttcaattcttcaatgatgtaagcatcgtaaggcaatgcacccttgctgtcgtctg gttcagaagctccaaaccatacaccgtcctcgctggtctttcctgcgttggtattgtgct tgtgagaagcccagtcagcagaagtggaaaattgcccgttatcatcagttaccacaacat gactttccccagtcgtcttacttgtgatcctaaaaggaacatcagcaagacgcttgtgtg tgcctgcaccgattttcacgccctcaatatctccacgcttaatctgattgtagatagaat gggcttcatcggttaagtccacgatttttccgttttctgtgattgcaaagtcaatcggct tcgcaccgtctgtcaaatatccgtcgggagcttcactctcaacgatacggaattttccat aaggtaaaaggtcggcagaagtagaagccacaccctcaaggtctgtatgaatggttttta cgacttcatttttcttgtatagcttgccctcaaccaataccgcattatcatttaaggaaa tgatgtcaaaggcagtatctttcaatgtggcacttccttgtggctttgtgtcacccgttt ctaaatctcgtttctgaattttcacaccgccacggataaccttatctgatacagaaaact ggttacttccagtcaatacggcaaggtcgccgtcctcggtaatctgtgtaagatataagc ccttaatctgttcggacttgtcgccagcctgcatatatgcaccgtctaacaagtagccgt ttggagctttcgtttcctcaacggttaatgttcctaaaggaagaacggcttttccgtcct gcatatagaagctgtcgccagataccttgtatgcgtccgctaattttgtgatgtagtggg ttgtcccgtcgctgtctgtttcagcgattgtctttgtaacccatgtacgagtagcttcgg caggaagattgtctttattgtagaagccagcataatatttccatgtaaattccgcacctg ctagagaagcgttcccctgcggattgtctttctgtgtttccatgtcaatcttgaaaagct caactaaagtgtctgttacttttggcgtatctgatactttcaaggtcgctgtttcgccag ctttgattgtcaatggatagattgttttatccactttatatcctgctggtgcagataatt ccttgatatagactgtgccagcttttacctctataacatctgtatttccgtttttatcag tcgtaagggtggcaagctgttttgtgcagtccttatcagaaaagacaccgtaggttgcac cagcgatagagtaattcccgttaccgtctgtaatgctggtattactggaggttttttgca gttttgcatttccaacattcagcttcgcccagaattgtcccaattcctgcccctcgccag agtagatataaccgccacattcatagcgtcctttattttctttgacaaaggcttttgcac cagcaaaaacttcgtcctgcgttgcctttggaatttcatcataagaagctcgcacgttgt cgcattgccagccaagatgtacgcttaatctctgccagacaacacattgttccaacagat agacttgtttgtagttcaattccttgtgagcttcgccatactgtttgacatactctaagg ataacgccacatctgaaatctggtcggcactcatgcgtgagcttgcgtcagctctggtct tgtaaccattcttaaagtcagtattgatgtcaatacaataggcagtttcgccctcaactt tcatcatgccctcattgaatgtagaaccgatagaaccgtcattcattactttttcaatga taccgactcgctctgcactttccgtccagtattgcttactttctgcatgaacgggtgtac tcggtaaagcggtaacgacagttgcaaaagctaagaagcccgtacacaatcgttttaat |