Block details
fasta C_difficile_CD00058_1A_022457.fasta
contig u00000crpx_c_022457
start 3997977
length 15358
strand -
type repeat
seq gataccgacgtgggttacatacgaaccagcgttataggtggaatggaaaaataccaaatc
gccagcctttgcctgcgagagtggaagatgttgggtagcgtcatattgcatttgtgctgt
tctaggtaaagagataccagcttttccatagcaccattgcgtaagtcccgaacagtcaaa
ggaagtgttcggattactaccgccatatacatacttccagccttgatacttcaacgcttc
attcattaccttttgtgccagctctcccaatacctgcggaacagttaaatactgattgac
taattccacataaaattgattgccatactggtaacgccagccaccatttttcacaacagc
tatcgggttggtgtaggttactttcttaccacccgatttctcacgggcgaagctctctgc
aagattgtatgtatgtttctttccttttcctgccacatatcccacataaccaccgccata
gttataggactgtatcgctacattcaaatcgtcgataccttgatttttgcaggaagaaag
cagggacgcaaaatatttacacccctgcttgattgagctttccatatctaaagagttagg
cggtagtcccagactttcgctggactgcatgacatcttctgccgtaccgccactttctac
ttgaatgatagccagcaacacattgacatactcggagataccgttttctctggcgtattt
ttccaccataggctgatgtttcaaaacttctgcggataaattcatacccgtaatacccga
agaaaagttgctgttctcgtcgtcgctgtccgcactaatcaacaccccaaagaaaagcac
cagagaaaagaggataggaaacagactgccaatgagagcgatatgtttcagtttcatttt
ttcttctgtcctttcttcgttacaagattacggattttctctgtggtctgctggttcttc
tggacagtctgggtctgctgaacctttgtcctgcggtctttggtgtaattttggcgtgtt
tcctttgacaccgtaaccttttctacattctgcctatgtgctggctgtgccgactgggtc
gctttcacatcagaaacacccaaagataacggacgctctttcacagtatttgtcttgact
ggctcacttactttagaagtcggagctgtggtaggacgtttgacttcctgcattttttca
acactcggctttggaatggttgaagctgtggctggtcgctcatggggacgggtagctccc
gttgtcgctgatccgtcagcctttcgctgtgcctgccttgattcttgtgccttttgaagt
tccatacgcttgtcagcgatattctgtctatgctgttcttgcttttccaaacgtcccgtc
tgtctggactgctgttcctgcaccatgccacgtttgaagtcggacacgctggattttgcc
ttttcctttgcagaatacaccgcataagcggtctgcgtcggcatatccttgatattctct
ttgacagcgtttgccttgtctttgaccttattttttgtatctaagacagcacccaccttt
gagcctgcacgctatcccatgctggaagtggtattgccccgattttccttagaagctgta
ttttttctttccgccctcttgccagcaacagaacttccagccaccgcaccagcgacaccg
ccagccgtaaccgcaccagcaagccgtctttccatacgcctagctctatgtgccaagtat
agatatggtctgcggaatatgcgtcgtcccatgctttgactgtcgttagcgttcagagag
aacatactcattaagtcgcccagcttcatgtagataccagcgaaacatactatctgcaaa
aacgccaccataaagaacgggtagtctgtggagatattataaaacatactggaaatgctg
aacgccaccgttacaatgagggtaattcctgcccttgtcattatggtattaaataccctt
acgattgcctgctttgccatgctctcatagctcggtatcatggaaagtaaaaagctgata
ggtaaaaacattgcaaagataataaaaagtatctggctaaacaacatcatgcccataagc
aagaatacaaatatcgttatccctaagttgaagaacagtaggaaaaacaccatacctaaa
cggtttacgacctgcggtatcgtcagattgttgttgtcgttgtcctcgatttctgttttc
acgacttcctctctggtcttgccgtcctcgtcctctgggcttgccgataccagagcttcg
acacggtctgtcccgatttcctctgcgttgctgtttccaaattgtaagagtagccacggc
tgttccacttgaatagaaaataaactgtcccgtatcaagtccacgctgtccttgccctcg
ctgtcagagttggggagcatgatttttgttcccaagtcaagtgaagcggtactgatgtct
gatgaaaattcatttatcttcttgatgtagtcgggagcataggcaataaacgaagcggac
agcacgaataccaccacaaagttgataacggcgtgaagtgccttgctggtttcccttttt
atcagtcccgtataggcaacatatattcccactactaagataatgagaagcaggaaacca
acatagaagcccgtagaagaaaagccgttctgtgttacgcctgcaagggtctgtatgctt
ttgccgatactgtctgccatatcgttgatgaagtccagcttgtaggcttcctgcaccaca
tagcccgtggcattgcttaaataaaggcttattgtccagacaaagttggtaatgcagtaa
agcccgtactgcaccgattttccgataccgtccagccagttccacggcaaccacgaccag
ctattgtctacatagaaatcaagctggtagttggaaagcggatattttgagtaaagattt
tctgcgtttatggtatcatccacaagccccgttgcatgagccaccgtccccagaagtgaa
agcaggataagggagagtgccaccacgaacagagtcattttgagaacgtgaaatatcttc
ttttttatgaacgcaccttttatcctttctttcatcactccacctcatttctctgtacgg
gcggtctggtatcaaaggcgtgtagtaattcttcaaagactgggtgtatctgcaccacac
cgacacgcccgtataagtcctgcaacaaacattgtccgttctccaaatcacgcaagcgtt
tctggttgttctcgtcgtccttgtcgataccgaaaaattctaaggtctgctttatctcgt
taatatcagtagaacggaaagcgaatttcaaaccgatattgtttttcagactttcttttg
acacatcataggcagactgggtaacaaaatatacgcctgcctgcatagctcgtccagcac
gaaccagtttattagaaagcgtttcaccttgtgccacatttaagaacgcccacgcttcgt
ccaaatcgacaatcttaaaaatgcttctgtccgaatggataaaatcaagggcaaaggtac
taatcacaatcagcatagacaccgacaacaattcaatggtcgtgtattcctcaaaagtgg
tatctttatctggtaatactaagtccgctacttgaatgatattgagctggttatccagac
tgatagcattttccaccgtaccgtctgaaaacagcagatgtgcaaaatcatagtccgtga
agctgtcgatatggtctgcgatattgcgtgagattgcggtatcttcttttctaagttcct
ctatcacatgaagcaagccccttgtttcactctgggtaacggaacgcaccgccttacgaa
gtacggggaatttttcgccgtccctagaggaaatacccgtaaggaatgtcaagatgtcga
ttgccagactttcagcgtctttgacattcttcataatcacgaatgggtcaagaagtcctg
cattgtccttgtcgctggtcaggtttacgatattgatttcattggcgatttctgggagcg
tttctttccagttgcctctctcggctttggggtctaaaatgactgcttgaccgccaaaca
gcaccgcataatacaccagaagattgttgcagaacgactttccaccgccaagacttccga
caaaggcagaagctaaagcattggtaactgtcccctttacgccctgcgaagctaaagacg
gttgcaggtacacatttcttcccgtatcaacggaatagccgatatagatacccgtagttt
cccctaactgctgtgtcgctccaaagccaagcccagccaagaagtctgattttacatact
gcacataatcattgatatatcgcctgctggcaggaagaaattcagagtgaagccccagca
tatccccagcaggacgtaccagctttacattgaggtcgtcgtaaaagtcctttacttcat
cacaacggcgttttaattcgtccaaatcatcagcacagacacggataacataagagagct
tatacatactttcttttgtctggtctaaatcggtttccagctcgtccacgctgtctaatg
cgtccaccacatttgagctggtttcacttccagcttgataggcgtgattatccaaatctt
tcaattcctttttcttgttgcggactgtcgttaatgcttttcggttttccacgatttcta
cattcatgctcgtatcaacgggaaaggtaaattgctgttgctggaagtagaatatttcac
ttgacggaaaatcaagctccccaacaatcgcattgacggtaaagtaagacacatagcttt
ccttgtcctcatgttccaagcgtaaataccgctggctttcctcaatcacacatcttgtcg
gacggataaggtcgtaatattttatcagcgtttctttcttgtatttcttttttggtaact
ggtactcataatcttcataagcgacaccgtccctgccgtaaagatgttccatgagatacc
caaaatcattgatttccaagcgacgcaccttaaagcgacgggagattttattttccagta
acttttccattttcatgtaacggttaatttcatcattcggcatggaaacaaagtcgttca
tcaacgtgtggttcacttcatggagaaattccttgaacgtcagccacgccgattttttga
tgttcttcagattgagctgttcttccgtaaccatgagcttaaagccaagaaaaaagcggt
agtccacttgattgtccccaatcatagatactaacgcttcggtctgttcgtctatcttct
ggactgccacctcacgaagtttccccgtaaccagcttctttgactgttcctgcatacttc
taattgagctttccgtcgcaatctgcaacgcatgaattttaccctcacgggactgtgcga
taagctgtcggaaactgtcatgcacgataaatttctgctctgtggataagaaagaatagt
tgtacggtatcagctcatagtaagcgaacacctcattgtccttgttccagacaaggttgt
tgtcaatatattttatcgggaacatagttcacactccttactgccgtgattgtttcattc
aaggtttgcttatgcagttttacggcttttcctgcataagtgatttttggtcgcagggca
taggttatctgtgatttcaaaaagctgtacggcttctttccgtcaaaggttttctgcgac
ataaaccaagtgagagcaacgggaataccaaagtatttgagaaatgctccctcaatcatg
gaaagtgggggcatatccccaaacagaatgatgataaattccgtaatcacaaaccatgta
atctgtgtaaaggtaacgggaaagggcaagttaaagtcattgattgcatacaagactttt
tccacgttccagatacccgtgtagcttttaatctttttcaagttctttcagctcctttcg
taagtttctaaatggaaaaggacagccatgtttcagactgtcccgtaaagagaaatacgc
tgtcagtagcaacaatccttgtcgctgatcttccagcgttaatatggtatctcgcacata
cctcggcttgtttcaatgaagcaaccacccatatccaaatctcgcccgtaggcttcatag
tcaatgtaattttgtaagctgggtggaatatcccccagtacctgcaattcgtctatgtag
taataggcaacatctgtcatgctttcacagtcgggataataataaatatcgtccttgtgt
tccatgacttcttccagcgtcccatagtggctgataaattcgtccagacactctacaata
tagtcgggaagttcctctatcatttcatacatctcattgagttcttcaatggaaatatac
tcgccaatcgcaatggggaagttgtcggtatcatggattgcgtattcctcatactgttca
ttcaagccgattttttcttttgcatcttcctcgtcaatgggaaatgtgaaccaagcaccg
actaaatagccctcattgtatttgccgagattagcaatataaaccgccatatcatcaatc
ataagcaccacctcatttcttactctggcagttcaaagataccgtgttctgttactaaaa
acttcccgtgttcctgcaagtgcaaagcgtaggcttcaaagtcaaaatagtattcttgac
agtcctcggataaatgcttgaatgtcgggtcattcatcagcttttgccttgcaacatcaa
tcatgcttttgcagtcgggataaaccgtaatcacgttcctgcaaatataaagtgcttcta
aattttcatacacggaaagaagcgttgtatattcttcctgcatatcgcttgaaagctggt
ggtacataaaatctaattcgttgagctggtacacgctggtatgttcatggacttcatcag
caaagggcagtaccttttcgataatgcggtactcttgactttctgcaccaatacctaatt
tttcttcaaactcggcaacatctatcggcaggtcgaaccagtatgatgttgtttcttcgc
cagttgttcctctcgtttccaccagcacccttgtttcctgcattgttcttcacgtccttt
ctgttgtttcatcacatcttttaaggtctggtatgacataccaaacacatatttagaaaa
atcttctaactgtttttcttcataattggcaaggttcagccgtttcatttcatgccacac
cttacgcttgtaagagggcaggtcggaaatataatcacaaccgacttttacctgcatatc
cttaaaaatatcgttcatttcatcactccaatctgattttaggtaagaaaaaagcagtca
atcctaagactaactgctttatgtgtaagtatgaatttgtttaagtgtaactgatttgcc
atgtgtactcgtaaagtttactgtatgtttgacttttaaataaatatatacaatcaatca
tttgtaacttgccgtctttttcaaatttacttattatcagattatcttcatagatatatg
ctaagaaagtatcatactctgcatagtatttttctctaaaaagatttgactctctaaaat
ctttttctaaagcaattcttatactatctaaagcatatttaaagttataacgagtattaa
aactaaacttgtatggaaaaaagaaaaataagtttttcttgaaagtaagcaatttcacat
aggtttgtacatcaaattcaatcgttccatactcatatttctctgtaagacaagaatgta
aactttcacaatcataatcccgcaacgaagcaaataacctagttacagtcatttgtgtat
ttggtcttctcggtggacacttaccaattacaccatcacagaatttctgtatttgaccag
taagttcttttgaagcatgaagtcttgttgtgctttcaagtaatttaaagtccatttgat
aattaggtgagttacaatcacattctccatgattttcagatttaggtggtacatattctg
caaaatttgatttttctctaaaatagattgatttattaactaattccaacaagtattttt
cataattacaattttcttcatctttaataaaatttttgtttatgaatactgcatgtaaaa
tatccactctcatttcatctgaaatcataagcacttttattcctttcaaaaaataattta
tcgtacccacattataacattctcatattacagcaacaataaaattcgttatgctccaat
aatcttattgaacagctctaacagtacatctttcacaccgccagcattgaataccaatcc
gacagcaatcaaggcaactaccaagaagccgataagttttgaaaactcacgcttgaaccc
taagtagataccaataaccacaatcgccataagcactaagctctgtgcgttgcttaaaaa
ccaagtgtaaagattttgtccgaaattcatttaattgtcctcgctttcttttaattgttt
catttcatagtcagcttctttgccgacactcataatacacatcaagactacgccgatccc
attcccagagataccagcaggaagtcttttactaattcccacattttttataactcctaa
ctttttactaaatcttttgcaggggtcgtctgctgtttgattatcatttcatgcttttct
gtgagctttgcctgctgttcgattgtttccatgtagtctgtaccgtttcctttatcaatc
tttttcagcattttcaaggtcggtgctacctgcctttgtacccaacgcaatgtacggtct
aaggtataaggctctggctttgtcgtcagtttcagactttgccgattatctccaataaac
cacgcccagcggtcattgagtttccagtcattttttcgtttgtcgggttcttcatcaaca
aaccgcacatactggttgatgacagaaaaggcggtctgctctgcgtcataataggtcagc
aaatcccgtactgcataataggcacgttcattccgaagccgtatctcaaaacgattgata
atgtccgcttcttccagcggtatccctaacttgacatactgctcatagtccttttcatag
atacagaaatacacatcagatttcagcgaaccaagataaagggtacgtcccatatattcg
tcctctctgtgcttgataagctcgcccgactggtaaaacttataacttctagactttccg
atatattcccgtttcctgcatttttccgcaagctctggaatatccaaaatgcccgtatgg
tcgttgatagcaaggtcgatacgcttcatcacgccaccgtctacgagtgcgtccatgagg
aagtcataccagcttctttgttgtgccagcaggtaactttcaaactgtcggcaaccacgc
ccctttaactctaaaaggacacctttttcttcatcagccgaagtataaataaagatgtcc
cctaaagagtaatgctccgtataactgtaatgtccgtaatcttcatggagcatataattg
atattcagttttaatatatctttgatgatatgctgtatatccagcgtgggaaaacgaatt
ttcacataatcaaacagcatggtaagcggtgtttctggattgaaccttgccagttcctta
tgcagagtatgaagaagttcctttgacggcttcatttttccgctttctatcttgttgaga
tattcccttgtgataccagaagccaccgccagcctgccttgtgagataccgtaagcaatc
cgtttttcccgtaattcttttatccattgttcttcattcagaaccatacctccaatctgt
aatgtgtgaagttttttaaggcgacttcacaactgaattttgctaggaaaccatgcgata
agccctatgtttcctatgtttttcgtctattgtctatttgtaaacgtacccctctgttag
ataccgaggggttttacctgctggcgtggcttacgccacaccagcaacggctagtccgtg
ccgtcgcctttcgcttcgcacgttgccgtcccgtcctgccttgcttgtgcaagagaaccg
attgtctgcaaaaaatcatgtcctttcgggactaaaggcgtgtaaaattcacttatgacg
cttgttcccacatcacaatatccacgccctttgatacgcttctggaaaaactgctttttc
acatctgaaccaaacagcataccatatcctaactcgctgatacgccccaatcccacacgg
aaattgaagttatctctgataccgtccgagaaatattttgcgtctggtcgctggcaggca
acgataaggaaataacctgcttgtcgtcctaacatgacgattttctttaactggctaagt
aagcccacactttcttttgtccccagcatttcaaaaaacgccacatattcatcaaagata
agaaagcaggggggcagtcccagataggcgtagttttcgcccgtcttatagtctgggtat
cgcttcatttcctcgcttcgctgtaccattccctcataaaaggaattgacgcagtctatc
atttcttctttggtgtgatacacatttcccatgactgtccccaagtccgcaaggtcagcg
ttcttcgggtctaagatgtaaaggacagcgttggtgtgcagtagggcttcaatgagcgtc
agcagaaagtaagtcttaccgccaccagtcccaccagcgataagggcgtgagggagtgcg
tcatattcccagacaagatttttcatcagcctaagacagccgttttctgcccgtacttca
tcaatggtaatacggtttgctatcatgtcataaagcagggtatattcaatatagccgtca
tgtaaggtcttgtcggtcagctcacaatacaaaccactttccagtttatcctctaaccgt
aagagctggtcttgatatttccccagcgtgatttcacagcggatatgaagcaagcctttt
tccatttgataataaatctttggaaaccagacgattttttcccttgatctgctttgcagg
tcagtaaaaaaaccgtcgtcttgtatggtatcagcttcataccacttattttccagtatc
attcttgccagcttttgacggtgcaggagcttcttgaaactgtcgtaacataaacggtaa
tacagaaaagcgactaatgcacaaacaccagtcgctatcagtacggttatgaagttgtaa
ggggaaagcgtcaagccgttttctaacaagctgaaatgctcccaatcggtacgcatgagc
tgttttgtatttaatagcagtataaccgccacgaacacaaacagaagcgtccttatggaa
aagtgatagacaaggtgcttatcgctggctctgatacgctttcccttatattttaatcgt
tccatgcttgctccttattgcttattttttcggctgtccctgcggtgcatggttctgtgg
attgcctgcgttctgattgcctttattcttcaacacaatatcctctgcctttacatacca
gtccacctctgcacccgtataagtctttcttgatacggtatcggctactggattgacaag
ctccacaactgcattgtacggaaattctcttaacggtacttctggcggtacagacacggg
gataattcccccatgcagactgcacttcaaatcatagatacgctttttaagctgggtact
cggtgtcccgtcctcattctgcaagaacacatcacgcaccgctgtaaattttaattctcc
aaatgttttctctttgtcaataacaaaaccgtttgataatctcataatttcttcactcct
ttacttttcttcaacagctacaatatcatcagcaaacaacacataatcagtatgtcccat
atccccgattgcgtaacccctgccgtgtaacttcggattgacaagttttactttctgttc
atacttgaaatgtttttcgccagcctgcacgggaatttccaccaccacattttcgccttt
ctgtacgtcagaataaaggttatagcttcgtttggctacgaccttgcggttatttttatc
cctttcaaagataggctcgctttctcctgcaaattcaagagttccaaaagactgtgccat
atctggcacgacatatttcatttccatattgttttacctcatttctttctatttttgatt
agttaattgattgtgatttcttattctggcaattagggaagtaccagcaagccctcagat
agtaaagggtaaaataaatgctcacgcacccttgactatccgtgttcttgcaggtatatg
gcagacaagccagaataagcggaagtctgccgtttgacagcttcggaggagagcgtgatt
tttcttttctcataccgttaccaccttatgatttcttcattttacggcgtttataaagat
atgttccagccagtccaccaccagacacaagcaacatcacgataaaagccataaggtttg
tactgtcgcccgttttgggactgtcgctaggtctgctaggcttttctggtgtctgtggct
gttcgggcttctctggaacttctggtttttccttaaaggtaatcgtctgtccctcgtcct
caatgtccttatgttcagtaactttcttcggctcgtctgtattgcttaagtcgtacaatt
cttcaaaagttacaagctgtttgccgtcaagggaggtagcgtcaaaagtaaaggcaactt
ccactttcatattttcgctgtcagcgataaaggtgtaatcactttccacacgttttccat
tgacaagaagctctgcattttcttctttcaacatctgccagcccacaagtttgtactgtg
ttccgacttctaagccctctaaggttacggtatcaatgattgtaacgtcttttcctgctt
caagctctttgttgccgtccttgtcggtagcagttgtatgaattttgatgatacgctctg
tgataagtaccgtctgcccgtcgtcctcaatgtccttgtgttccgcaactttcacgggtt
cgtctggattgcttaaatcatacaattcttcaaaggtaacaaggttcttgccacctaaag
cagacgcattaaatgtataggaaatttccactttcatttcttcctcatcagcgataaagg
tatagtcgttttccacacgtttcccgtcaatgattagctcggcgttttcttcctttaaca
tctgccagccttttaactggtattttgtaccttttgtaagtccgtccaatttgactgtat
caacgattgttacctcttttcctgcaaggatagtcttttcgccgtctttgctggtcgctg
tggtatggatagagatttctttttcgtattcatcagtcaaagtccctaaatcaatcacaa
ggttatttcttgatactacgatttcaaaaggcgggataagttcaaagcctttgttgcttt
cacatttcaattcttcaatgatgtaagcatcgtaaggcaatgcacccttgctgtcgtctg
gttcagaagctccaaaccatacaccgtcctcgctggtctttcctgcgttggtattgtgct
tgtgagaagcccagtcagcagaagtggaaaattgcccgttatcatcagttaccacaacat
gactttccccagtcgtcttacttgtgatcctaaaaggaacatcagcaagacgcttgtgtg
tgcctgcaccgattttcacgccctcaatatctccacgcttaatctgattgtagatagaat
gggcttcatcggttaagtccacgatttttccgttttctgtgattgcaaagtcaatcggct
tcgcaccgtctgtcaaatatccgtcgggagcttcactctcaacgatacggaattttccat
aaggtaaaaggtcggcagaagtagaagccacaccctcaaggtctgtatgaatggttttta
cgacttcatttttcttgtatagcttgccctcaaccaataccgcattatcatttaaggaaa
tgatgtcaaaggcagtatctttcaatgtggcacttccttgtggctttgtgtcacccgttt
ctaaatctcgtttctgaattttcacaccgccacggataaccttatctgatacagaaaact
ggttacttccagtcaatacggcaaggtcgccgtcctcggtaatctgtgtaagatataagc
ccttaatctgttcggacttgtcgccagcctgcatatatgcaccgtctaacaagtagccgt
ttggagctttcgtttcctcaacggttaatgttcctaaaggaagaacggcttttccgtcct
gcatatagaagctgtcgccagataccttgtatgcgtccgctaattttgtgatgtagtggg
ttgtcccgtcgctgtctgtttcagcgattgtctttgtaacccatgtacgagtagcttcgg
caggaagattgtctttattgtagaagccagcataatatttccatgtaaattccgcacctg
ctagagaagcgttcccctgcggattgtctttctgtgtttccatgtcaatcttgaaaagct
caactaaagtgtctgttacttttggcgtatctgatactttcaaggtcgctgtttcgccag
ctttgattgtcaatggatagattgttttatccactttatatcctgctggtgcagataatt
ccttgatatagactgtgccagcttttacctctataacatctgtatttccgtttttatcag
tcgtaagggtggcaagctgttttgtgcagtccttatcagaaaagacaccgtaggttgcac
cagcgatagagtaattcccgttaccgtctgtaatgctggtattactggaggttttttgca
gttttgcatttccaacattcagcttcgcccagaattgtcccaattcctgcccctcgccag
agtagatataaccgccacattcatagcgtcctttattttctttgacaaaggcttttgcac
cagcaaaaacttcgtcctgcgttgcctttggaatttcatcataagaagctcgcacgttgt
cgcattgccagccaagatgtacgcttaatctctgccagacaacacattgttccaacagat
agacttgtttgtagttcaattccttgtgagcttcgccatactgtttgacatactctaagg
ataacgccacatctgaaatctggtcggcactcatgcgtgagcttgcgtcagctctggtct
tgtaaccattcttaaagtcagtattgatgtcaatacaataggcagtttcgccctcaactt
tcatcatgccctcattgaatgtagaaccgatagaaccgtcattcattactttttcaatga
taccgactcgctctgcactttccgtccagtattgcttactttctgcatgaacgggtgtac
tcggtaaagcggtaacgacagttgcaaaagctaagaagcccgtacacaatcgttttaat