Block details
fasta C_difficile_CD00129_1A_020478.fasta
contig u00000crpx_c_020478
start 3284217
length 9441
strand +
type noncore
seq ccgatttagtcattttttatttacataccacttagttaatataaaacttgaccctcctgc
tcctgttcttcctagcatagattaatttacataccacttagttaatataaaaccccaaaa
taggtatatttgaatacattgaaaacacttcaatcaagcaattataattcaataaaaaca
tcaaaatttgcagtgagcgagcagtagtgcaattgataacagttatcatacaccttcaat
cccttatattccaactgttaacacctattttagcataaatatcgctcactgcaaacctat
ataaacatttcatcagaatacttatcaatcccataacatttctttttaattgaattagga
ttttttatctcataaacatagattgaatcctcgctattatcaataatattttctatttca
gaaatacatttatgtaactttccttcagtaatattgccttcaaaaacagaattttgcgtc
caagtcaaatattttctaagtatccttctaattctatttaacgaccttgcttcaacaata
tcataagtaacaataacaaacatacttaccaccacacctttaaaactttgtacctttcat
catttataaaatgtttaattaatttataacactctaaccttataaacattctatatgaaa
cttttctatttagatttctatgttttatagttatctgcatcttattttcaaattcttgca
aaaatttcttctttcctttttcacttaaataacaaattttgtcttgatattcaaaatcat
tcttattaattcttttattattaatcaggctaaaaattattgtgtcaattataattggct
taaaaatttctgcaatatctaaacttaaagaaaatctctttgttgatggttcatgtaaaa
agcttattgtagggtcaagttgtgtcttatatatctcacttaaaacattcgtatacatta
tgctatttccaaaagacataagagcatttactgggtctttgggaggtcttttttctcttt
tataaaattcaaaatcatcttttaatatttgattaaatgatttatagtatgtttttctta
ttctgccttctttacccataagttctgatatttctttgacatcattcaaatcatttagtt
catcctttatagtatcaattaaactttcatcaactttgtaatatctcatatttcttaaaa
tatggtatgatgcactttccacaaaggattttgctaagtataatctttcatttttatcta
aatagcaggctgattgacatactaaactgaatcctgatacatttttcttccttggataat
atgtacctgaataatatccatagtaattgtagaaatgaagcatcaccccatatttgctta
tgtaatttataagttttgtgtttaaatctacttctccatatatatgaatatcatcaactt
gttctactggtaatatttttttctcaccttctaaattgtaatagtaaatcgtattttctt
tcctttttatatccccattacttataatataatagtctttatacattgttactcctcctt
cacaaaacaaaattcataataagcacattttgtacaataatgttttttctcaattttggg
aggagataactgcgtatttatttcatttatatttataagtgtgttttcaataattctttc
tttttcttctgtcaatatcaattcttcttgtttcttttccttaacataatttatagttcc
ttttttctctatacccatactattctttaaatagtataagtaatagtataactgcatttc
atctgcttctttcatctttgaacttatttttacttcttttacatactcatcctttattat
atctagcttcaagatatcatcaatcaatatttctttatttttcattcttttatatgaatc
ttcatgtactatcttcccagacaatactctactactattttgttccatggttattccttt
agaaaatagccatagttttcttttacatacataataataatttatttttacaccttgaac
ttttaatacttctaaatctattggcacaaaatcaccttctttagtaaattttagccacat
tgttaatataaaaatcaaataaattggtctatttcattacttataagcacacctttacca
aatatctgttttgtatgcttattttcgtatatatcatatttatataaaagtatttttaaa
tcttcaagacctttcacctgtatgtcaattacattttgtttagctttatatattggtaaa
tttacagtttttttaactatctctcttcttgctttttttctcttagactttattttattt
atcaattgtctatcatcattactatatgcatttataagctcttgtcccaactcttcataa
tctttgattaaagtttcttcaattttattatatatatcctctggaattactgtatatcct
tcaatatttctaagtatattttgtgcatctttagaacctaaactatatggcgttatagta
tctaaaatatttaaagcactggtaaatctcttttcaaaagctgtaccttctagactttct
ttagagtatagtatcttaaccatttctaccttatatttttctttcatcttcacacattct
tttccatttataaaagttttcagtagctcaagtcctttttctacaatatccttatcataa
atactacctattcctgtagctttttctgtatatataaatatatttgggctattttcttca
tactcacgacttctataacatctaccaaatcgttgaaatagactgtcaagtgttgaattt
tctgtatgaagctcatcaaaatcaatatcaagggatgcttccactaattgtgtagtaatc
caaataccattactatcactatctgcaaattcttttatatatttttctaattttgctcta
tcttcttgtatatacatagaatgtaaaagatttaagttgacatctattccttttggctta
actatttcttctattaactcatatttttctacagcacttttaactgtatttactattaca
agaacttttttattcattccactttgtattattttacctaagttttcatctattgaattt
tctacaatagacacacaatgtcttattttttctgtgttacatgtcaagtcagctaagtta
ctattcattacacctcttttttttaattcatctatatatatggttggcatagtagctgtc
attatcataaatctgccacctatcttatgtatcatttctataccttttaccaatacagct
gctatttctggtgaatatgcttgtatctcatctattactacttttgaatatgctaatgtt
gagtacactttttcatagcctctatacaaaaaaggaaatttaaatatttggtctattgtg
gaaaatgtcagtttacaagataataactttgctaaatctacaatctcatttgaattttcc
tgattactttcttctaaataatctattgctgttgaatgtaacagacctaagaatgtatca
tttgcttctcctactccaattatatttttagccctatcaaataacgcatttatacttact
cttaatggtagtgtaaaaaatgctttatccttatctatccaaatcaaagcagtttctgtt
tttcccatccctgtagatgcaattagtattatattcttgtttctattcgatttagcaaat
gactgaacttctcttaaactaccaaactcttttactaaatgtttttctgtgtattcgcct
atattcatattactattgcactctacaatctcatgggcagaagcactgtggtctaatcta
tgtagtattccttttaacataatatataaattatagtacttgtgatttttatctattctt
ttttctacactttgtagatatactttactcaatttttctgtttttattggatatctaact
ttaaattcatgctgtagttcataaactttatttattaaatcttcatctaatattttttgt
attaaatttttaaaatctttatctataaagatatctctttcatgatgatatacaataact
tgatttaatactgctctaagttctttattttttttcctgtctatataactataatcaata
aatgcaggagaaagataattatggcctacattattttctaaatgagttactattttaggt
tcatttattttagtatccattctgctttttattaactcttgaaacggtgaaaatgccttt
ccaatatcatgaaattctataacaaagtcaagtaattgccaaaatatctcctcttctaga
aaatctaagctatttatattttttccataactttctcttaatacattcatttgttttaaa
agttcatcagtatgttctctaagtgtttccactggattagatttagcatataacataatc
tccctcctaatttatattattaaaatataataaatctccttcattatctaataatatatc
tccaattgatatagtatttccatcctcaacataataactatctaccttattccaaaccct
ttttttatcttccacagcattattatcatagtaattattgagtctgtaacttataccatc
tatatctgtatcttgtaaacttgtttttggtatatatataggcattcttatattacattc
tgataacttataattttcataatcatctaattgtatatcctcatctacttcaaatttatt
gacttctacaaatctaatatcattaattcttactaaatcttcttttctacctaatgataa
gtgctcgtcataatttaataaactatcatatatttcttccaataaatcaaaatccccacc
tatatgaattatcaaatttacattcaatagcatatgactattcattggcatagatgtaat
actatcttttttataaaaatatgttgtctggtaattattaaatatactttcatatgttcc
ctgtacacttatattaaatggtatatattctgtagcatttaatattttgtgaattaatcc
atttattgtagaatatggaggcagtggatatgtctctgtaatcttcatagcaaatggttt
tttgtagcatgcagtttcttgaaataaatctaatttcaaaaccttcatattaattcaccc
cataatattcctttacttctttaactagttgtccaaaaaatttatctacacttaaaaaat
tatcttcaaacaatcccttaaattcttctttatttataaataccccatctaccattccaa
cataggtaaattcttttaaatcttttcctaaaaaagtaccttgaattacttcttctatag
cttgcttatttattttaaatccatttttatctccttttaatttaattctacccaagaaaa
atggatttgctatttcatatactcctcctactacaaatagaggagataaattttcttgtc
tacctctaatatttctattcaatacttttattatttctaaaaattctactactcttctac
atttctctttattatcaagttctatatctccatccttacctattttagataaatctatag
tcactgtatatgtataataacttaaatgttgctctatgttagcaagattaggatgttctc
ctattctatctgctaatcctttattatttaaaaagtccatatcacttctatatggctcaa
gggaaattgcattacttaatcttacagtagcttctctagtcaaagaacctccttttttat
ctttctcatcttttttatttgttttcatatatccaaataaatccatttcttctgattctc
ttatacttatattgtctttaaattgaatagtgcctttttctttatcgacaacctgtaaat
tccaattaaacaattctgctgctaatcgtactatgtcatatcttaaacactggcgagatg
caaatgtatatatatttccatcatctctacttaatttttttaattctgatatattaccta
tcccttccccatagtttaaactttgagcctgtgctattactgtaaatgttaaccctcttt
tcatcttatttttcctccttttcgtttggtagtttatcttttccttcatattttccagaa
attaatcctgttacaaatgcataccctacagattcaaaatctaaatcttcttcaacaaat
atctgtaaaatttcttctggtggtgttttttcacttggtgaaaaaattcttaaaattgtt
tgcataaaatcatttttattaccaaccttaattaaatttaaaattttatatgttattcct
tctattttatttttagcattcttatcaatataataatcatgtatttcacaacctgactca
taaatctttctcaactttttatagtccattttatacactcctctcttatagttatttaat
attgttcttaattgaacaacattgaaacaagataaccctgatatgtttgatttattattg
ctttctaaattactcttaactatattccttaaagtgttattaattaaatgttttaagtct
ttactttttaaaattaaatctaacacatttgatttaagtttataatcatatatactttgt
atttttttattttcttttacaaaaaactttgctaaataagttggaatattaaaataattt
attttacattttttagaatctatacttgctttaaattccacaaaaagtatattacgaagt
tgccattcactttttaatgtattttcttctactatactttttataagctgattaaaagga
ttttcatctttggaatctgaatactcacttttttgagcttttaaactattatttctttca
aaaagctcatttatacaagtatccatgttaacaaataaataaaactcattttcttcatta
attaaataattctttcttgtataagtagcccctgctggagtacagaacaatattagctta
caaatatcacatattgatggtacatacgcctgattccaaaacatattcctagcattattg
gtgcttactccaagtggagcaaaattactttctgagtattcatctaatattcccttatat
aaaccacacatttcacatacttctagactatccatatacttttttatatcttctatgctt
ttatttttctttataaagtttttatttatttccttcataattttttctatagtatttata
ctagacttactaacttttttttcatttatatccttagctatactatttaatctatcattt
aaatagtttttcaacttatcatagtcattctcttctaacaaatcttctaactctccaaaa
tatataatttgtcttaaataatcattaaacattacctgttttaatccatctaaatctaat
ttcgccttagcaacattaaaaaaactaacttgtccaaaataattatcttgaactacatat
ttataaagatttgctgtaagcctgtcatttattgattttattttaaatatatctatagtc
tcatctactaaagcttctaaactgtcaaattcatcataactttttatcttagacatacta
tctagcttctcttttatcaggttaaatttttcttcatcaaattttttaatcttatcattt
tgttgtttcacactatctttaatttttttaattccatctttgattctatcaggcttagat
ttaataaaatttatactataatcaatattttttttaattctttttgatacatcatattca
tccataaagtaattaaaataatactcatgaaagttttcaagaaataagctatcaaattcg
atataatcttccataataaatatttcagcttgtttatctgctttctttattatatttaaa
aatccaactatacccatattaaaaaaccaatctcctctataaactcttaacttcatttat
ctcacctccattctaaaatatctacatctccaaatccctgagcacgtctaaaaccaattc
ctagattgtagataagatttaaatcatcaatatcacctttcaatataaatttacctttgt
aaccattaatatattgatactctttacctgttatttttttaaattctcttaaactctctt
taactactacctttttgagacctatattttcaaattctaactttctttttaatccattcc
ccctataatttttaaccacttcattagttatatagtttagttcttctatgtatctatcat
cagttatctccaagaattttccttctttagactttacacagattggagacaatgcattaa
atagtaccctttcttctgttaccttcttttctcttgataaatcgattctaattcttgtaa
gttcatagtctttatataaacattttttagaagtcattaacccattgtatatatgaaaac
ccaattctaaatctggagtacttatatttaatattactttatcttctataataaaattgt
caccttcaatactatacttttttatataaaccgaaaatgtaaaatttttagtctttttat
tattcttttctttataatagtacatgtttttatagtaatcttcattagattttcttattg
cttcttttataatactcataaagagcgaattataagatattggtatacaacctgtactaa
attcaattttcattttcataatatcacctctctcaattaatatattaacactagaccggg
aagtatattggtccaagtataaattatttgaaaaaatcagtaaatttttttcattttttc
aatctctgacaatatatcatttctaagtctatctggttctacaacctcaacataagctcc
catacttaaaatccaactttttatctcctcataacctctcattttagctttaaacattat
agatttatcatcatattctatgatttgttgattattaacccaaactttttcctttataat
tgttgaaaatggatgactaatttttataacaacactaatttcttctcccttataaattcc
tatactatttttactatattcatcccaactaaaacttttatctacattatatttttcttc
taaaaccttataatctttaattctacataatttaaagtctataaacttaaatcttttttc
acaaaaagctaccatataagtatctgatttataattaaataaaccatatggatgaacaat
tctttcactatttcctgaatttaatgaataatattctatccaaaatttgtgttttgtggt
atatgctctaattatttcattacacttatttttttcagactcataatcacaattacgttg
tgcttgaactgtaaaataatccatatatgtatcgcttttttctcctgtatttaatactgc
ttttattttttctacaatattattaaattcatttttgtaaatatcattattatactctaa
ctgtgaatttatcatatctaga