Block details
fasta C_difficile_CD00246_1A_020486.fasta
contig u00000crpx_c_020486
start 3379980
length 9371
strand +
type noncore
seq ttagttaatataaaaccccaaaataggtatatttgaatacattgaaaacacttcaatcaa
gcaattataattcaataaaaacatcaaaatttgcagtgagcgagcagtagtgcaattgat
aacagttatcatacaccttcaatcccttatattccaactgttaacacctattttagcata
aatatcgctcactgcaaacctatataaacatttcatcagaatacttatcaatcccataac
atttctttttaattgaattaggattttttatctcataaacatatattgaatcctcgctat
tatcaataatattttctatttcagaaatacatttatgtaactttccatcagtaatattgc
cttcaaaaacagaattttgtgtccaagtcaaatattttctaagtatctttctaattctat
ttaacgaccttgcttcaacaatatcataagtaacaataacaaacatacttaccaccacac
ctttaaaactttgtacctttcatcatttataaaatgtttaattaatttgtaacactctaa
ccttataaacattctatatgaaacttttctatttagatttctatgctttatagttgtctg
catcttattttcaaattcttgcaaaaatttcttctttcctttttcacttaaataacaaat
tttgtcttgatattcaaaatcattcttattaattcttttattattaatcaggctaaaaat
tattgtgtcaactataattggcttaaaaatttctgcaatatctaaacttaaagaaaatct
ctttgttgatggttcatgtaaaaagcttattgtagggtcaagttgtgtcttatatatctc
acttaaaacattcgtatacattatgctatttccaaaagacataagagcatttactgggtc
tttgggaggtcttttttctcttttataaaattcaaaatcatcttttaatatttgattaaa
tgatttatagtatgtttttcttattctgccttctttacccataagttctgatatttcttt
gacatcattcaaatcatttagttcatcctttatagtatcaattaaactttcatcaacttt
gtaatatctcatatttcttaaaatatggtatgatgcactttccacaaaggattttgctaa
gtataatctttcatttttatctaaatagcaggctgattgacatactaaactgaatcctga
tacatttttcttccttggataatatgtacctgaataatatccatagtaattgtagaaatg
aagcatcaccccatatttacttatgtaatttataagttttgtgtttaaatctacttctcc
atatatatgaatatcatcaacttgttctactggtaatatttttttctcaccttctaaatt
gtaatagtaaatcgtattttctttcctttttatatccccattacttataatataatagtc
tttatacattgttactcctccttcacaaaacaaaattcataataagcacattttgtacaa
taatgttttttctcaattttgggaggagataactgcatatttatttcatttatatttata
agtgtgttttcaataattctttctttttcttctgtcaatatcaattcttcttgtttcttt
tccttaacataatttatagttccttttttctctatacccatactattctttaaatagtat
aagtaatagtataactgcatttcatctgcttctttcatctttgaacttatttttacttct
tttacatactcatcctttattatatctagcttcaagatatcatcaatcaatatttcttta
tttttcattcttttatatgaatcttcatgtactatcttcccagacaatactctactacta
ttttgttccatggttattcctttagaaaatagccatagttttcttttacatacataataa
taatttatttttacaccttgaacttttaatacttctaaatctattggcacaaaatcacct
tctttagtaaattttagccacattgttaatataaaaatcaaataaattggtctatttcat
tacttataagcacacctttaccaaatatctgttttgtatgcttattttcgtatatatcat
atttatataaaagtatttttaaatcttcaagacctttcacctgtatgtcaattacatttt
gtttagctttatatattggtaaatttacagtttttttaattatctctcttcttgcttttt
ttctcttagactttattttatttatcaattgtctatcatcattactatatgcatttataa
gctcttgtcccaactcttcataatctttgattaaagtttcttcaattttattatatatat
cctctggaattactgtatatccttcaatatttctaagtatattttgtgcatctttagaac
ctaaactatatggcgttatagtatctaaaatatttaaagcactggtaaatctcttttcaa
aagctgtaccttctagactttctttagagtatagtatcttaaccatttctaccttatatt
tttctttcatcttcacacattcttttccatttataaaagttttcagtagctcaagtcctt
tttctacaatatccttatcataaatactacctattcctgtagctttttctgtatatataa
atatatttgggctattttcttcatactcacgacttctataacatctaccaaatcgttgaa
atagactgtcaagtgttgaattttctgtatgaagctcatcaaaatcaatatcaagagatg
cttccactaattgtgtagtaatccaaataccattactatcactatctgcaaattctttta
tatatttttctaattttgctctatcttcttgtatatacatagaatgtaaaagatttaagt
tgacatctattccttttggcttaactatttcttctattaactcatatttttctacagcac
ttttaactgtatttactattacaagaacttttttattcattccactttgtattattttac
ctaagttttcatctattgaattttctacaatagacacacaatgtcttattttttctgtgt
tacatgtcaagtcagctaagttactattcattacacctcttttttttaattcatctatat
atatggttggcatagtagctgtcattatcataaatctgccacctatcttatgtatcattt
ctataccttttaccaatacagctgctatttctggtgaatatgcttgtatctcatctatta
ctacttttgaatatgctaatgttgagtacactttttcatagcctctatacaaaaaaggaa
atttaaatatttggtctattgtggaaaatgtcagtttacaagataataactttgctaaat
ctacaatctcatttgaattttcctgattactttcttctaaataatctattgctgttgaat
gtaacagacctaagaatgtatcatttgcttctcctactccaattatatttttagccctat
caaataacgcatttatacttactcttaatggtagtgtaaaaaatgctttatccttatcta
tccaaatcaaagcagtttctgtttttcccatccctgtagatgcaattagtattatattct
tgtttctattcgatttagcaaatgactgaacttctcttaaactaccaaactcttttacta
aatgtttttctgtgtattcgcctatattcatattactattgcactctacaatctcatggg
cagaagcactgtggtctaatctatgtagtattccttttaacataatatataaattatagt
acttgtgatttttatctattcttttttctacactttgtagatatactttactcaattttt
ctgtttttattggatatctaactttaaattcatgctgtagttcataaactttatttatta
aatcttcatctaatattttttgtattaaatttttaaaatctttatctataaagatatctc
tttcatgatgatatacaataacttgatttaatactgctctaagttctttattttttttcc
tgtctatataactataatcaataaatgcaggagaaagataattatgtcctacattatttt
ctaaatgagttactattttaggttcatttattttagtatccattctgctttttattaact
cttgaaacggtgaaaatgcttttccaatatcatgaaattctataacaaagtcaagtaatt
gccaaaatatctcctcttctagaaaatctaagctatttatattttttccataactttctc
ttaatacattcatttgttttaaaagttcatcagtatgttctctaagtgtttccactggat
tagatttagcatataacataatctccctcctaatttatattattaaaatataataaatct
ccttcattatctaataatatatctccaattgatatagtatttccatcctcaacataataa
ctatctaccttattccaaaccctttttttatcttccacagcattattatcatagtaatta
ttgagtctgtaacttataccatctatatctgtatcttgtaaacttgtttttggtatatat
ataggcattcttatattacattctgataacttataattttcataatcatctaattgtata
tcctcatctacttcaaatttattgacttctacaaatctaatatcattaattcttactaaa
tcttcttttctacctaatgataaatgctcgtcataatttaataaactatcatatatttct
tccaataaatcaaaatccccacctatatgaattatcaaatttacattcaatagcatatga
ctattcattggcatagatgtaatactatcttttttataaaaatatgttgtctggtaatta
ttaaatatactttcatatgttccctgtacacttatattaaatggtatatattctgtagca
tttaatattttgtgaattaatccatttattgtagaatatggaggcagtggatatgtctct
gtaatcttcatagcaaatggttttttgtagcatgcagtttcttgaaataaatctaatttc
aaaaccttcatattaattcaccccataatattcctttacttctttaactagttgtccaaa
aaatttatctacacttaaaaaattatcttcaaacaatcccttaaattcttctttatttat
aaataccccatctaccattccaacataggtaaattcttttaaatcttttcctaaaaaagt
accttgaattacttcttctatagcttgcttatttattttaaatccatttttatctccttt
taatttaattctacccaagaaaaatggatttgctatttcatatactcctcctactacaaa
tagaggagataaattttcttgtctacctctaatatttctattcaatacttttattatttc
taaaaattctactactcttctacatttctctttattatcaagttctatatctccatcttt
acctattttagataaatctatagtcactgtatatgtataataacttaaatgttgctctat
gttagcaagattaggatgttctcctattctatctgcaaatcctttattatttaaaaaatc
catatcacttctatatggctcaagagaaatcgcattacttaatcttacagtagcttctct
agtcaaagaacctccttttttatctttctcatcttttttatttgttttcatatatccaaa
taaatccatttcttctgattctcttatacttatattatctttaaattgaatagtaccttt
ttctttatcgacaacctgtaaattccaattaaacaattctgctgctaatcgtactatgtc
atatcttaaacactggcgagatgcaaatgtatatatatttccatcatctctacttaattt
ttttaattctgatatattacctatcccttcaccatagtttaaactttgagcttgtgctat
tactgtaaatgttaaccctcttttcatcttatttttcctccttttcgtttggtagtttat
cttttccttcatatttcccagaaattaatccagatataaaagcatgacctatagattcaa
agtctaaatctttttcaatttctatatctaaaataaatgctggcatctgtttttcagctg
acataaaaactcttataattgtatccataaaatcacttttatttcctactttaactgaat
ttaaaagtttatagcttactccacctattttatttttagaatttttattaacaaaatagt
catgtatatcacaacctaaataataaattattctcagcttttcatcattcttctccaaat
ttttactatccattttatataccccctttttgtagctatttattaatgctcttaattgga
ctactctaaaacaatctattcctgatatatttgatttgttgttgctttccatatcatttt
taactttatttcttaaaatgttattaattagatgcttcaagtccctatttttcaagagta
aatctagtacatttgatttaagcttgtaatcatagatactttgtatttttttatttgcat
acttgtctgtaaaaaattttgctaaataagttggaatattaaaataatttattttacatt
ttttagaatctatacttgctttaaattccacaaaaagtatattacgaagttgccattcac
tttttaatgtattttcttctactatactttttataagctgattaaaaggattttcatctt
tggaatctgaatactcacttttttgatcttttaaactattatttctttcaaaaagctcat
ttatagaagtatccatgttaacaaataaataaaactcattttcttcattaattaaataat
tctttcttgtataagtagcccctgctggagtacagaacaatattagcttacaaatatcac
atattgatggtacatacgcctgattccaaaacatattcctagcattattggtgcttactc
caagtggagcaaaattactttctgagtattcatctaatattcccttatataaaccacaca
tttcacatacttctaaactatccatatactcttttatatcttctatgcttttatttttct
ttataaagtttttatttatttccttcataattttttctatagtatttatactagacttac
taacttttttttcatttatatccttagctatactatttaatctatcatttaaatagtttt
tcaacttatcatagtcattctcttctaataaatcttctaactctccaaaatatataattt
gtcttaaataatcattaaacattacctgttttaatccatctaaatctaatttcgccttag
caacattaaaaaaactaacttgtccaaaataattatcttgaactacatatttataaagat
ttgctgtaagcctgtcatttattgattttattttaaatatatctatagtctcatctacta
aagattctaaactgtcaaattcatcataactttttatcttagacatgctatctagcttct
tttttatcatgttaaatttttcttcatcaaattttttaatcttatcattttgttgtttca
cactatctttaattttcttaattccatctttgattctatcaggcttagatttaataaaat
ttatactgtaatcaatattttttttaattctttttgatacatcatattcatccataaagt
aattaaaataatactcatgaaagttttcaagaaataagctatcaaattcgatataatctt
ccataataaatatttcagcttgtttatctgctttctttattatatttaaaaatccaacta
tacccatattaaaaaaccaatctcctctataaactcttaacttcatttatctcacctcca
ttctaaaatatctacatctccaaatccctgagcacgtctaaaaccaattcctagattgta
gataagatttaaatcatcaatatcacctttcaatataaatttacctttgtaaccattaat
atattgatactctttacctgttatttttttaaattctcttaagctctctttaactactac
ctttttgagacctatattttcaaattctaactttctttttaatccattccccctataatt
tttaaccacttcattagttatatagtttagttcttctatgtatctatcatcagttatctc
caagaattttccttctttagactttacacagattggagacaatgcattaaatagtaccct
ttcttctgttaccttcttttctcttgataaatcgattctaattcttgtaagttcgtagtc
tttatataaacattttttagaagtcattaacccattgtatatatgaaaacccaattctaa
atctggagtacttatatttaatattactttatcttctataataaaattgtcaccttcaat
actatacttttttatataaaccgaaaatgtaaaatttttagtttttttattattcttttc
tttataatagtacatgtttttatagtaatcttcattagattttcttattgcttcttttat
aatactcataaagagcgaattataagatattggtatacaacctgtactaaattcaatttt
cattttcataatatcacctctctcaattaatatattaacactagaccgtgaagtatattg
gtccaagtataaattatttgaaaaaatcagtaaatttttttcattttttcaatctctaac
aatatatcatttctaagtctatctggttctacaacctcaacataagctcccatacttaaa
atccaactttttatctcctcataacctctcattttagctttaaacattatagatttatca
tcatattctatgatttgttgattattaacccaaactttttcctttataattgttgaaaat
ggatgactaatttttataacaacactaatttcttctcccttataaattcctatactattt
ttactatattcatcccaactaaaacttttatctacattatatttttcttctaaaacctta
taatctttaattctacataatttaaagtctataaacttaaatcttttttcacaaaaagct
accatataagtatctgatttataattaaataaaccatatggatgaacaattctttcacta
tttcctgaatttaatgaataatattctatccaaaatttgtgttttgtggtatatgctcta
attatttcattacacttatttttttcagactcataatcacaattacattgtgcttgaact
gtaaaataatccatatatgtatcgcttttttctcctgtatttaatactgcttttattttt
tctacaatattattaaattcatttttgtaaatatcattattatactctaactgtgaattt
atcatatctaga