Block details
fasta C_difficile_CD00108_1A_020476.fasta
contig u00000crpx_c_020476
start 3211840
length 15180
strand +
type noncore
seq attcggtatcaaatcatcatactctctttgagcttcttctttttccttcttaatctgtgc
tatttcatactctacatcttctacaataggactatttttacatactgttttatcagaaac
aataccaacgctttttgcacatatctctgctaattctaaatcattggcaatagcatttct
tgtccatgtttgatttactatattacattccaaattcaaaaccttgcatatcattcttat
tagttttccaaaactcaatttaaactcagtctccataagacctgctttaagttccaaaag
tgagtataaatatttgagtgctacaccacttgcattaccaaagtcaattggttgtgggtc
aacaccttgtccttgctcaaatatagcctttcttgtcatcataagtaacttttctctagc
ttcaactggaatatcaattgtaagtgtgcttaaaccgcttttatcatccatcccattact
ttctacctcaacagttttatacttcttcatatcttccaagaagctttttaaatctgttcc
tccataattggttaaaataaatataatctcttgtatatcttctaaatcatttacaaaacc
actaaaaactttgtcgtaagtatcaattaacgattttacagtatccaaatcacttgtctt
tatattattattaaagaatggaatgaatggtaattctccaaaatcatgtttaagtgtatt
gctattgtctaatatatctccatttccatatgttatagagaacatattataaacttctag
ttcatctatatctaagtcatctagttttctatatgcttggcactctgtatctgtccaata
ttcatagattatatagttgtcaccattttcatctatttcatcatatactctaagtacccc
tataagttttttatttaaatcagaggaccataaaggtattacttgtttactgtcaaccac
accataatttaacttactgtttttatctttccatagatgtaaccatgatactccgctatt
acttgcatttatacataagtctttgcatattttgggatagatatcacctaaaacttctgt
aatagctttatttgttctattattagatacatcaaaagttggtggataagtaaataagta
tgatgccttttgattaactaacaagctatagaaactacttgatattctattgtcagcatt
tctgagtggattttcagtttcttcctcttccctattagaagttttaaataatatatcatt
tttattcttatagtatctttcagatataattgatttagatattacatcagaatgataggg
aacatgttttttaatcagcttcttaactacttctatgttcatctattcacctcactttta
tttaagtattgataatccctttcgttttaacattacatcttccataccatatctaacagc
atctatagtatgattatttttatctggatactcatctttaaaattaccttctttatcttt
ttcaagttcatatcctaaaaattctctcttagcatttggacatcttatagggtctattat
tatttcttctacttcctcacttaagaatttgattccatgttctacactatctggaccttt
tctagcaccaattatttttaaacctagctttttaaactcatttatacttctaggttctgc
actatctgcaattacttttttattgcttgtgttttcttttaaaataagctcaacagcttt
tgaatttcctaatgctactttataaagctcaaagaatatatataacctttttcttgtttt
atcatagttcataacaatataagataaagggtctttagcatatccaaagtcaagacctct
tcttactctatcaaatctatttatctcttcatttgatatttctcttaccgttacattagt
aaatacctctccacctgtaccagttacaacacccatataatcatgctcatacttagtagg
atttacttttttaagatgttcagcctccactataaattgttctcctaaccattcttttgg
tacagataaataattactatgatgaataaatttatcttctctcttttctatcacctccat
attagtccaatttctttgactttctggtggattaaatgagtaaaaaacattatatgtatt
cccacctctaagcaaagattgattaacattcctaattttatccataccttcaaattcatc
tacttcttcataccaaacatattttatataacctttagacactttagtagattttaattt
cttaggtttatcagctcctttaaataaaattacttgacctgttggtttataagtcatttg
aagcttagattctggtatttcccattcattttgaacccctaatgtgtaaatagcccactg
tatctgttcataaacagaacctctaagtgtgtctttaactcttctaattacaactgcatt
tgttaatttgccttgttgagcatctctcatcatacctaaaacaatttctaatgatataaa
agatgattttgtactacctctcccacctttaaaccaataatgagtataaacatcttgctt
aataagtttatgtacattatagaagcttggagctataatattttttaatctaatctcatt
catctatatcatctactatttgaactataccagtcccttcaacttctaccttatcagtga
acaacctatacctcttacctaataattcagcagctttgtttctatctcttatacttacgt
ctttttttattatttctggaccatattcagaaactacaaccacttcctcttttgcttcat
tccttactatcttagttaaatactccataacttcttttgcatctgctatcctatttgact
caagttgacctattctttcatcaatgtaactttttaggtatggttttgttaagttctcag
cacctattactttagcagtcttttcactatatcctgctcttattgctgcttctgttgcat
tgccagtttcaatgtagtaatcacaaaacctcttttgtttttcagttaatttagccacat
caccacctcactttgttttaaatataaaaaaggctaagtttggggtaaacttagcctttt
tcaaggggatatattatacacttgtttcatactaccattatatcttatctcatagtatat
tgatgtgacatgtttctatactaaatcaatcattaatcggtcataaatcggacacaaaca
agactttcatattagattatattttttagcaaagggaagtattttatctagtgctttttt
tctcttttttcctacatataattcgcttatatttaactcataacttatttgtttatattg
taattttttaaaataccttagttctattagatttttctcaaaatcatctaataaatttaa
catattattaatcgattcttttttaatttgtagatatattttctcattctccaatctttc
aacatatattaactcattttctattggtgaagaaacattatttcctttaggcattccatt
taattctattcctcttaaactactccctcttacttttaactctatttctctaatttcaat
atccaaattactatatgagtttaacaattcttctaatttttcatagtctgtcacttcatt
ttcacatccttgcaaattaacagaattttctttttaattattttgttaagttattaatga
aatatagcttattttttaaatatttttatattgtataacttcttaattaaacccagtccc
agatagtcccagatgtaaaatacatccgggactgctccaagtctagctatttcaatatat
ccagacaataacatttgttcagtcccatactattatatatatattctttatataaaggga
gcaaaatcatcacaaaaaattgatgattttttagttaaatatataaaaggtcaaaaacat
ctagggacatccgggacaacgttgaaattactatattacatctagggactacatccggga
ctatcccgggactgctctagtaaatactttatatttcttaccttgtattcttttatcttt
tacttcatatccaaactttttgactacttgtcttgaaaactcaatgtttgatataggttg
taatccatttaatatacaatactcttgatatttcctatatatttcttttgttgattcatt
ttctatcttatcaacttctttaaaaaatcctaaaataggattattgacttcttcatattc
aagtatttcttttttaaccttatctggtactgtaaattttctattcttcaatactctttt
taagccttctaatcctagatttattaaatattctatagcttcttgctctcttaatttgta
ctttatataagggtcaaaatccttatcatttactgaaaaactagcattaaaaggaataat
aattaatctatcaagtactgctccagtcttatcttttattctaggtatgttgttagctga
aaataaaaacttactatagttgttaaaatcaaatggattctgaccttttctttcaacatt
tactctatcgccacttactagctttttaaatatagcaggattagcaataaattcatctcc
tatatcatctcctatatttgcaagttttccaaataattcagcagttttaaatctatcact
taattcttttaaatcaagtgctgatgtattttcatcccctaataatgtctttatcatatc
aagataggtagatttaccatttgctttatctccagttaatataaaagcttttctaagctc
attacgtctataaaaacagtatcccactacttcttcaagtaacattctaatttcaaaatc
tccacatgataatttattcatagttttatcaactaactttgaatatgctcctggattata
gttccagttaactttatttgttataataaattctggtgaaaattctataaaagaatcatc
aactatgttatatataccattcttaaaagcgattaaattagcttctgacatacttgtgtt
ctcacttattaataaatttaaataactaagcacctcactcctcttagccttatttaaatt
gcttatattattaatcatttctgcttctattcttgcttgaccatctacatagataccatc
cttatataaatgtaactggtcatttatcttgattacatgattattattttttatgtattt
agcaaactcatcaaataaaaatgaaccttttgaattaaaaaatatcttcttttgaaagga
ttcgtctctcaaaattacttcaagttcattatcctgtaatggagtttttaaaacatattt
attaataactcttattgtttctcttatttcctcaacagtaaaatcattactctgtagagt
taaaatataattatataatgcttgatttctcccatctccttctccaagacttaaaaaatc
aattccgtttttaatcggtgttaaatacattggtatttcttgtatttctttactatcgta
taaaatttctctttcaatattgttgaacttcaaaattgaataggaatttttacatcctaa
ttttatatctgaatttaaacctatagctagtctacattttgttctattcttttctaaact
agtatttttaaatagaaaatgcttacctcgtgttgtcttgtaaactctacattttagctt
taaatcttgcactattttgtatagaatttcactactttcaaaatcatcaatatcaactaa
cacagtttcttctgctaaaacgcctgcaaactctggtaaattcttaatctgttcataagt
ttttaacttttttacatttttaaatttctcagctgcctttttattatttgtaattatata
tcctttaaatatgtcaaagctcaccaatcaccacctcaattacttaataataccccaaac
tgcttgagtctttcatttgctaaatctatataccaagttttatctagctttcttggtact
tttttacctataacacttccattttctataaaacatttatctggagtattagcaaatttt
tctggatttttttctttatttttgactttataaataccaccatcatttttattttttgaa
gcaaatactctaaaacatttatcatttaaaatcttaccgccaataaatactttttttgtt
tttccctctatagttggactatataaaccatgtgaatatttactacttatttttactatc
ttttgaaactctattaaatcattacatttatttatagtttcttcaataggtgtattgttt
accatataatttttaagtgctttatttataattggtaaatcatagtctagatttcctaaa
tctttgatatataatccttttgcttcaacttctccatcttctgttataactaaataattg
ttaacatccttttgaaatattttagtgtatacatcaaaacctaaacccatacctgtcctt
tgttcccactcataacatatatcatctattaattcgtaatcatctattgtatttaacttt
acaattaatccatctgtattgctctgaataagtttacaataaccttctaacttctctatt
aaatcaagtaataacagctgtccactaacacatacattattagcctgtcttgggtcatat
aaattattgtttttatctttcattcctccataagtcttattaactgccaatttgtaggct
ggtcttagaggtgatttttctttttttaactgtaagtttttgtcataaatttcaacgtat
ttttgaggattttttatatttcttgagtggtaattatatctaatcataagacttggatag
aaggaattaacatccacatgtaaaaaataaccttcaccatagtattttgttattgctcca
tgaacaccaccccaagcaaatacgtgaggtacattagaaatattaatttttagattttta
gaatagtcatgatttagtgggttcttataccagcttaaaacttccttatatttctcaatt
tttagagtatctggtatttgtaagtcaaattcatcatcatgttctttctttgtagcttct
aatataattgctgttagttgtgtttgagttttaccaatatatgatactggaagtttaaaa
gctttaattaatcccatatgtgcttcaaattcggattttctttcaataaaaacatctata
gtttgttcgacatcatatctacagtattttatagtttcttctatttcatcattagttaat
ggtctatcaatgttaaatgatacattagattcttttatactatgaccttgaaaaccttct
aattgttttaatccatgaaaactagtcataacatcatagttattaatttgtatgtttctt
aataagtttgaaaacttccaaccaggttgacctttaacaataatataatcatttatttct
tttgcattaaatccacataataatcctttaaaaatatattggtcataatgtctactgttg
taaccaataaaaatatcttctctatgctctatataaaatgaatttaacttatctatatca
tttacaataacttcttcttttttatttaaaacatctataaatacaactaaccagtcataa
gagaatacttcaaaatcataaaaaatcatttagaacacccctctcgcttttgctgcacat
tttctactacaatatatgactttagagttatctaacttgtaaaatctttttccacaccaa
acacatcttacaattttacctgggcttataagttccattttttctttttactctcatatt
aattacctacctttttaatattacagctagatgcatgtatacacctagctgtaataaaat
ttctaagctacttcaaatatatcttttattgtaaaggtattaaaacctttcttctcacca
tattcaatagcaaattcaagttctccatctatttcctcagctatatccattatgagttgt
gcatattggctgtatgattcaaattcaacttcaatatcagtttctaaacttcttaaaaat
tcatttactatatgaatttgaaaaccttgcttaactacttgattcatgaatattaatgaa
tctttatactctccttctagtattttaaaccaacatacaaacattgggtcacctttttta
gactcgcttaactccattttatttatttctacttcataagtgccatgtggcacatcttta
aatttaccactattttcagatgcttcttttatatcttcttttaatccttttacatctatt
gctttatcaaatttactaaaatccatatcacataccatccttttcttttaaatttttaat
taataatctttcttatataatcactcaaactaatttctcttttttctagttttcttgact
ggtttaattgcttcttcttgttcaattacttcttcctctgtttgttctttttcagttttc
tcacttgtttcttctactataggagtcatctctacttcttcattagttttagatttttta
ggcttacttgatttctttatttcatttttctctatactaatatcctcatatactttcatt
aattcattataatcaagtggaatttcattagattttacttttaatctaccccctccaaat
atcacttcattagtcttaaatgataatgttctaacgtctccatcagctactactcttgca
actatatcaaccatacctgctattttatttgctgctttttcttgtaaattaggtttgatt
gctgttatcttgtcaccaccttttttggtaatatctttcgatgtatcctcatgtgatatt
aatattatgtttttatagtcaaggttcataagtcgttttatagtgcttaaaaactccgtt
ctaaccttatcccatgctctaaaactatcatctgactcatgagttattcccatcttgtca
tacatgtaaaggcgacaagcttcgtatgtatcttctaacaagtcaacaattattgtttca
aaatcattttcttttttctctaattctcttatagcttctttaaatacatcccatgcaagt
tgtctctttgtcattctcccttcaactgttacaatatcttttatagaaatgtatggagca
tcaacaaactttatatttccatctgtattaagcattaaaggcttttcaaaatcatttgct
aatgtagttttgccactaaatggtgctccataaatccataaagtttttttattaattcct
tccacacttcttctttcactatttggtaataacatataatcaatccccttttcacagtat
tcttggtagtcacaccagttacataatttattttgatttttttcaaattccttgttttca
agacatctttttatatctacaagaaaattaataactttatttggttcgtactcaaccttc
actatttttatttcagatttatcaagctcattaagtaatctttgtctaaattgatgtaag
ttttctgttttcttctgtctaatctgaactttaggtacaaatacatagtacaaatctttt
atctcatgatttggatgttgcttttcataaaaatacttatatagatgaagttgctcactt
tctaaatatctatctatgttgtttgaatatttaaagtcataaatatcaaatactctttct
tcatcttcataatatatggttgtttcatttgtatttaagtttgtatcagtcatgtataca
tgtggtgctaacaaatctataaaccctataaaatcactagttgttatttgaacctcatta
aacccttttggtaaaatttcttttacttttggtattaaataatctaacttcatcacttca
ttaatgtgtaaatcggttatacttggataactaaaataatattcttttactgctgcatca
atatctttttcaataccagtatgaagtgatgttcctaatattaaagcattgttagaatct
gcatttaatattgttttcaccttgtcaatatactgtagcttatacttatatgggcaattc
ttaaatactcctatcctactatgtgagaactgcatttactcaccttctttctttatttct
aaaatcatctttttaaatctatcaaagtctttagggtatagaataattcctattccacct
gccttttcaatttctttaatattatacttttgtagttcgcttgcttttcctttttctccc
ttgacttcaatacctataaatttaccactacaacaaactaataaatctggtataccactt
tttgtatatgctgaacctccccaatatttaataaaccaacaaccttgttcttttaaaaac
tttttaactttattttcaaattgtttttctgcactcatataaccacctactttaaagata
tttttatatatgcctttttatttgatatcttagaacaatctgaataaatttctggatatt
tttctttaagtttcttactatcaatagtagttgtggtacttgcttcaatatatatcattt
ttaaaatatcattatcaaatgattttatattatagagttccattgatttttttaactctt
ctttcattttcttttcttctatctcaaggcttttcttttgttcacatatattaaatatat
ttttaaataaaacatagttattatctctgaattcctctaatcctgcatcatctgcaataa
ttgtcttcccacatgtactacattctaagccacatatattactacaagtctcgttatcgc
cacattcactacaacaaatattttcacctttaaaatcacaaatttcattacacttaatca
ttttaatttcctttctcaaacaaattatttgtatagtcaacaccactttgtaagctttta
tatatattttcttcaacactattcctacaaatcatataataataaaaacatgtgttttct
tgacctattctatgaattctctttttgctttgcataaataactcacaagataaagtaaga
ctaaaatatacaatcttattacacttttgaagatttaaacccatagctcctgcttgatat
tgtacaaatgtaattgagttattatgctcctcataattatttaaatcttttgtagagcca
tttactattgatattggtctatctcttgataattctattaatctgtctaactcttcgtta
aaattgtaaaatactattaatctgtcacctgttgagtttattaagtctccaaaagcttct
aatttaaatttattgtattgactacataattgtctttcatataacattttagttagtgta
gtatctccaacaagttcaacatcatctgaaatacttataattgaatcttttttaaacttc
ctatactctcttgtagtactaattttcattacattatctatttgttttggtaagtcaaat
acttcatctgacatcataaatactgctccataatctcttaacttcttttttaatctgtca
acattcttataacctgttacaaccttcattggaaaaccaccaatatctttgtactcaaca
tcaatatattgcttccaatataaatcttttgatatattccaccctagtagtttaatttga
gaatatagttgctcatatttaccactacatggagtaccagaaagtagtatcacattttta
gggtttaaacttagtacaaacttacttcttttagctttttcattttgaatcattgatgat
tcatctaacattaaagtaaaatcttttaaatctaataactcttttcttctaaaagctaat
tcataattaattactactataaatggaacttcaacaatcttaaaatactctatgccttca
ctaagtttctttgtaccattgattatccccatatctggataatatgttttaaagtgatat
acccaatcgttaatttttgatttctgacagattaataaatttgtattacttcctagattt
attaatttctcacttcctacaaatgtcttaccaagccccatgtcaaggtagtatgcacat
ttattattatattctgttagctttaaagcttcctcttgatgcttatatagttgcaactta
tatcaccttctttattcctggtctgataaatcttctgtttttaactttctactacgtcta
cttttatattcttgctctgcttttatctctgtcattgactcttcaccaaagctattaaat
atagctctaattgagtcaattatttcacttgcttcacctttgatttttatattaacttca
agcattttaaatctctcctttttatgttataattttattaactttttttattttgtgtgt
tggttactttgaccagcacttttttattgaaataatcctactaaacatattgcaaataaa
cctaccattattaaaactgctattttatttcctcctaacctagtctttgaagaatgtaat
caccatatctaatatcctctggtatcaatgcttgatactcaatacatcccttatctttgc
tataataagctaaatttagttcctcctcggttgctactactacaatacaattaatattga
acccaaacctcttagaacttacactcactacatttcctatttttaatttttctagattaa
aattcactttcaatagctccatctacatcaccccctctctctttatcaacataatagttc
tcaatgtatgtatgagttattagtaccccaaatttctctgtaagaattttagctaaagtt
tcgcctaatgcatctaaatttggttcaccaactgttgttactgtgtattcacttttttta
cccatttaaatcacccctctattttcaaaatattccgtatttaatcattgcaatttttac
tcttcatgtacttcataaaataacgtgtctagcatatataacaaaggactatccttatct
ataactaattcttcttcatctttaatgtagaattttattaaattttcatctatgcaataa
gttatataattatcttcaccgatacacatacctacttctttttctatcttattttggtct
gctatttttatatctgctattgtatcaagagtatctactattttataaaatatcctttct
ctatcattcaattcataactttcctcttcctctcctatataaacgagatatttgattaat
tcatcctcttctatatcaccaaaaaactttagcataaactcaaaagtaaaatcattaaat
agtttttcatctatttctgaatactcaaaattcatttttttatagttcaaagctgtactt
aatgcaattttctctaaaatatctctatccatttctaaaatagaataatcattagctatt
tcattgttaacaccatttataattttcttgaaatcatctatcatattcaattccttaact
gttaaatctatctcactttcagttccaacacttactattctgttattttctttcattttc
ttattcctccttaaatttaagtttctaaagttgtacttagcaacttctgaatttaatttt
caaaactacttaaagctttttctagaattggcattacattctcataatatctaaaattag
gcacttgtttatttgaatgtttagccttatcccaaactttaattccgaactcatctgttt
ttaaattataagcatttgctaatcctccaaccttattggctgaaatccctaatatcttac
ctatctctgtagcagaataagtttttttctccattttaggaagtggtattaatgtttctc
cagaaagtaattcagtagtttttgaatacataatctgtttatattcttttatatctactt
tgtcagctaactctaaatatatttttgcttctcttgcccttgcattttttaatcttgctt
gagcattcatatattttatttctgattcatccttaatatctttaggtttgctactattaa
atttattattttcttttaaactcttcctcatattaaaatatccatcaactattttctcat
attgctcccatgctttatcatcttctagtattttaagtaactttgcataacccctttcag
ataacaaatatatccctgtcaatagacccttattttttgaacctctataagaattaattg
cttgttgagtaaatccgaacttctttattttggtgtcgttcaaaccgacacctaacaaat
caattatatctatgtcattttgaaatctttttctattcttatttataagctcatttatat
gctttaactctttattatgtatttcagctatttctttaactaacattgcttttttgcatt
ctccaaaacctccttcgatatcatggaatttcataccatcaacttctgtaattcctatca
cttctatttcatttatattttctgcatttacaacttcgttcataatttcttcctccctag
ttttttgtattttttaaacagctcttgtttcatataagaaactttttaattaataaaaaa
ttcatctatacttatattatatgtctgtgatataattcttaaatcttcaacactaaaatc
acctccagttccatttatattttgatttatagcagatgctgactttccaagtattttaca
taactcagattgtttaattcctctttccattaaaaaaatcttaaatttgagatatgggtt
acgtttacttttcaagtttttcacccccttctttgtttcatatttgatacctaaattata
tattattgcaagtttcattgtcaataactttctttattttttttaaattaaatcattgac
aatgaaacctcatgttatataatttaagtatatctaaattataaagaggtgtaatccatg
aaaaatacaggtcatattataaagattttaagaattgaaaaaaaattaacgcaagatgaa
ctcgcaaagaatctaaattctagttttaatttaaaattaaataaaggtatgatttcaaaa
tgggaatcaaacaaagcagaacccagatttgaatatataaaatatatatcaaagtatttt
gatgtttcaatagactatttattaggaatgacagagtatagaaatatgtatgataacttt
gataagaaatatgattctaaaaaattaagtttagaagttaaagagattgaaaaaaacgga
gaaaagattaaagaaaaaaataaagtattagaaaataagcttttatctagctttagtgag
t