Block details
fasta C_difficile_CD00058_1A_022457.fasta
contig u00000crpx_c_022457
start 3282965
length 12174
strand +
type repeat
seq taagattttacgaataatcgcttctttgataaaacctttcatttccaaatctaccgcaag
acgtaagttgttattatcgtcataaaacggacgcatacagcattgattgataaatgggtc
gtaaaactccaagatttttgaaatagccgtttcgtcgccgtcgcaggctttggaaataac
cgtgaaagtcggtgtcagctcttttggcatttttctttttcctcctcaatcagttgcttt
aacttgtctagtgcttgtattctgcacttcgttacattcgctctggaacagtcaagcatt
ttcccaatgtaagtgtccgtgtccccaatgaaaaaatactgtaaaacgatattacgcttt
cgttcttcaatagctttcaatgcacgagccagttgttcatcttcgattgatactttttct
ccacagacttcaaatactgcaacataatccgtagaatatgtatcttctgtacctatggaa
tttaagaggtcgtccataatttcggcgaatggcatttcttttttctctgaacgacgtatc
gctcgatagaagtcaatcgctctatgacgtataactgttttaatagcacaatcgaattga
tgacaggttttttcttgtagttctgacggtttcattttcctcacctcctttcgctagtcg
aaaagaggtgtctgccccttttcatatataccgcgttgaaagtggggtacagcgtaacca
aaatcaaaaaaaacttaaaaaatttttttctggcatgaaaaaagcccgcacaaaacatat
agtctgtacgagcctttgaaactgtattgtatttagttcttataaaaatgccgttagggt
caaattgattgtgtcgaggtatatctaaaatattccataatgacagctcctttacggcac
tattcttgtttattcagacagaaaagaaattgcaccgtttttaatttctaagatttcgtc
ggcttcttctgccaaatgcttactatgtgtaacgacaacaacacattttcctaattcatg
tgcagtctttttcagcaaagcaatgatttcatcagcggtagtttcatcaagatttcccgt
cggttcatctgccaaaagtacatgagcgtcgctggctaaagctcttgcaatcgccacacg
ctgttgttgtccaccagatagttgcaatacatttctctgccagtattcttttccaatgcc
gacttcttccaataatttttcagcatttccactaccacctaatttgacattttcaaccgt
tgtcaaataatcaatcagattataattttgaaataccaatgagatattatgctttctgtg
gtaattcagccctttttttgtaatgtcctcgccattgcaaagtacagtcccttttaccgc
tgtgtctaagcctgctaacaacgataagagtgttgtttttcctgcaccactcggaccgac
aatggtatagaagataccctcctcgaaagtagcagatacatgattcaaaatggttttatc
tttttttgttttgtaagcatagcttacattctttacttctaacattttcgtcgtcctcct
aactcatttccgataaaatatctttcgggtttctctttagtattacaattccagatacca
gaacagaagccgttatcaacacaagaacacttacaccgtccagtagatacatttctggtg
taacctctacgctgatactctgcacgtcctgctttggtgcaacgtattctgtggatactt
ttccctcattattcttttcttcctcctgcatttgctgaacctgctgtgataccagataat
ttgcagttgctttggaaacggcaggagcgacagcaaaggataacataagggaaagaacag
caatcataatcgcttcgctccaaatttgtccgataattctaaatttcggaacaccgagag
ataagaaaataccgacttcctgcacccgatttttcaaccagaaaagaaatactaaaacaa
ggataacaaaacttgcaacagagattaccaatatcatcatttcgcttacttttgctaaat
cattgaagtttgaggacatggtttcggaatttccgttattgtcaatcaaatcatattgct
cccaattgatgtctactttttgcagattttcttttacttcgtcgtaagcttccacatctt
ccactttgaaataggctctttcatataatggacttgtttcaccctctgccttttctggaa
atctcaaatctgtaaatattacattttccgaacggtaagtatctccctgcataagtgggg
acatcttttgatccacttgataaattccaacaatctcagcttctgatacctttgaatttt
cagtatcgtggtaatcattaaaagaaatcttatcgccgattttcagattattttgctttg
ccagttcctctgaaatgacacacatatctttatcctctggggttatcattcgtccctctt
tgatatgcaggtttccagataaaacatttctgtctagtttcatatctttgtttccaatta
aacttacaccgccaacatctgcattctggtctacatctttatcttcaatccttttgaaat
ttacagggtttacgggagttgttactgttgtaatattgtaatcagcaattccttttgctt
ttgccaatttctcaatgtcttttatatctaagctttcaaattcatttgttgtccagcctg
tccaagtctccacaccattgataatctctttttcctgatggtagccaccaaaactacctt
ccttatcattaccaatcttttctgagtattcacgaactcgctttgttcggtactctgcat
ttctttctaaaagaaagcctgcacctatggcttgtctggttttgtcctgcacctcaatac
tggcatttttgctcgccacacctgcaagaagcaaggtactgattgcaaaaacaatcaaca
ataagagaatactttttacgggctttctgaacacagaacgccttgccaatccaaaaaaat
tcatgtactatccctccatttttgctaatatatcttttgggtttgctcgtaatatcggaa
gaatggaacagcacaatgccaccaaaataactgcaccgcctaaaaggaacaacattccaa
tatcttgtatctgcaaaaccactttcagattttctgttactgtttctgaaccggtaatga
cgttttgcaaaacgcccgagaacaatttaccaatggctgttgctcctaaaaccgaaagtg
taaatacactgcctgcttctaataaagtttgcaggaaaatttcactttttgtcttgccga
ggctcataaagattgccacctctttttgccttgtccgcatccacatacataacagcaggg
aaacaacaacagtaccagttaccaatgtaagtaccagcataagatttgccaccttactga
tttgctctaatggagcagacatctgttgataaagggtatcagacgtgctaagtgctacat
catttccgaatatcttttgcaggctggtttccagcacatctaatttttctggtctttttg
agtaaatgcagattttttcaaattcagcttctttgaacaattctttataagtactgttgt
caataaagatttgattttctattcgattgactgcggtagtttctgacggctggtcttttt
ccgcatttcctgcggacatgaaaattccaataatctgaacagatacttttgttccgtttt
ctgtacttaattcaatcgtatctccaacttttagctcattttgatttgcaaggttcgcat
tgataacagcaccctttttctcacgcttgatataatcgccagaagctaagcggtactgca
tttctgaaaaagggctgtccttttccaaatcatcataggaaagcagtgctattttcaaat
tttcctcattcgtagaagtattgagcgtaacgggagcaaaattattcggaaatacctctt
gtctaccaatgcggttgatagacgaaacatcttctagcgtttcaatcttgtttacttcat
tctctgttatcttgctgtccttacttgtaatttcagccacaatcttagagtttgtctttt
cctgcatggcttgtttggactcatttgtagtccttaaaatcatgcttgtacctaaaatca
tactgtttacaagtatcaaaacaatcaacagaagaatggttttccctttttttcgctgta
aatagcgaaaaccaagttgataaaacttcatacttcacacctctattcccaatgggctat
gacaacctttgttgcattgaaatgatttgtgtctgcaaactctccatagagatatacttc
agattgctttttcacatcggatatagaacccgttgttacatttgtaacaccagactgtgc
atttactgtggcaatgacaaattcacaatctgggttataggttacagaaacagcattctc
ttttttttccattcccggtgcttctatttttatcccagctcccccctcaatatcttttgc
ttgatttaccaagcaaccattgtctgtaaattccaaaacacttcctatcaaattagcaga
atctaatatgtcgtttcctttattttctgaagaaccatttgcattttcttcattcgtatt
agaattgacaataggattagacgtatctggtttctcatctggacttgcaccacaccccgt
caatgcacagatacataatccaactgctatgaatttactgatgtttgtctttttcatttt
tgtattccacctttcttgttcgatatgcccctattgtaaaagcaaaccattctaaaaatc
ctgtaaaaaagtaagaaaatcatcatcattttttagaggatttttacagacttttctgtt
atactgtctataatttatatagaaaaggattgatacattatgaaaatacttcttctggaa
gatgatttagaattatgtaaaaatataaaaaattcgctggaaaaagaaaactatatggtt
gattgttgcaatgacggggaaaccgctatgctgtatgccttaaatacagactatgcttat
gacattgccattgtagaccgtatgctaccgattattgacggcttaacaatcataaaatct
atgcgtagaaaaggaatatctattcctatccttatcattacagccatgagtacccttgat
aatcgggtggagggtttagacggcggtgctgatgattacttagtaaagccatttcatatc
aaagaattgcttgcaagggttcgggcattgacaaggcgacctgccaatatccagttatcg
tctaaattacaatatggagatttaacttttgataaagacagccgaaccttatctacaccc
gtcaattctattttattaacttcaaaggaaaccgaattgacttttgtatttatgcagaac
ccagaaacactattttcccgtgaacagctaatccttaaaatctggggcagttcttccgag
gtagaaactggcaatgtagacagttacatttcttttctgcgaaaacgcctaaaagagtta
aaaagttcctgtaaaataacaacggtctacggggcagggtacaaactggagaaagaaaca
tgttaaataatttataccgaaaacttcatattctgtttgcaagttctgttatgctgatta
ttacccttgtgattttctttgttgttgcgaatacggtttatacggagaaaatcaacgaaa
gtaccttgtttcaaagattaacaaccttgctgatttatcaagcggaaagtgattcttcgg
atatggataaagcactcaaagcctacgaagaaagttatcatattttttccttgattagcg
atacaaaagggaataccgtttatcaaagtgattttccatttccaacttctgcggacaagt
tgttgcatgatgtagaaaaacagatttctacacagccattatcacaaacagaaagcacca
caacttcacaaggcggttttctggaaataaaaggaaaacatcacgatacttattttgtta
ttcctgctacaattatgacagcaaatgataccgtatatcatgggacttttctttatcaga
cagctggcttgacggatattttacaaaagacattaccgatatatcttcttatctggcttt
tggcttgtatcgttgttatcatactaacccgttatctgctgaaaaagtcttttgccccaa
cagaacgaatattgcaaagccaaaaagattttgttgcaacagcgtcccatgaattaaaat
ctccacttgctgttatgatttccaacacggatatgcttcttgataatgttcccttaaacg
aacaggcaaggcaagccgtacagaccatagattttgaatgtatgcggttatcccgtttag
tcaaagatatgttacttttagcttcttctgacgcaaaaacatggacattgcataaaagca
caatcaatgtagataccttgctcattacgttatatgaaacctacgaacccgtctgcatga
agcagaatttagaactaaaactacatttatccgaagaaagttatcctgccatgcttactg
acaaagacagactgtttcaaatcttgtgtgtctttatggataatgccattcaacattcca
agaataattctttgatagagatagaagtaatcgccaccgaaaagaatattgctttttctg
tggtagaccacgggcacggtatctctgatgaagataagcactatgtctttgaccgctttt
atagtggcgataagtcccatacaaacaaatcgaattttggactgggactaagtatcgcta
aagaattaacccaaatgctgaacggtactatcactatcaatgatactgctggtggcggtg
ctacttttactgttaaatttcctctgaaatagattaaggcttgcagatcatacaaaatgt
atggagcaagccctttttcaaatctttgtctttttggtaatcttgtaaatatattcttct
ggggtagggcgtttattaccaaaatatcttttgaaatttgcctgcacctctgggtctgga
ctattcatagcttcatcaatagtcgtttcaatatttgctcgaatatcagccaacgacaca
ccgccagcttttgcacctgctttcaacgctttttttatatctcgttttcttaaccctatc
atatttcaaataacctttcgcatgaaattttcacatcaaattcttttttgatgtatctat
gatttgtaatgtacctcgttttaattgaaaaaccacatcagcacgtttcgcaatttcatt
agaatgtgtaacaataatcgcacatttattcaaatgatgtacactttcttctaaaattct
cataattgacattgccgtatcttcatcaagatttcccgtcggttcatctgccaaaataat
aggtgcttcgctggctaatgctcttgcaatcgctacacgttgctgttgaccgccagaaag
ctgtaacacatttcgtttcatttcttcttttgtcaatcccattttttctaaaatcggttc
gggtggtaatttacttgtcaacttcacattttccaatggtgtcatataatcaatcagatt
atatgcttgaaagataaaagaaacgtgattacgacgatgattttccaatcccttttcagc
aatatcttttccattaaataaaatcttaccttttgaagcactatccagtccaccaagtaa
agaaagtaatgtcgttttcccacaaccagacgttcccaaaatgacatatatctttcctag
ttccatttgagcattgataccatttagtacatttttatttaaatcataagaatattttaa
atcttgtatttccaaaacacccatattgtctcctttctactttgtaggtgtaaattcaaa
tataaagtcattcgtatttgcattatcttttaattcccaatcatattcatttatatcttc
cgtattatttgttgtgtcctcagtttctaaagtacagccacaaaacattacagaacaaac
gcatatcaatagaactattcctattttcttcatcacaaactacctttcattaactcattt
ttgtcaatatttcacggggctttaatcgcatggttgaaatcgaagatatacctgctgaaa
tgacaacaattccaattcccagaataaataacataaccatttcttctgattgaacttgaa
tatctaaatctggcacagttatagttttgtccgatacatcatcacttgtaccgtttctat
tatcggcaaccaatccctcggtatcttctgatatttcaatttgctctggtgcattttgta
aataacttcctacttgatctgcaacaacagtagcagggaagtaggaaaggaaaaacgcaa
tgactgcaataagaagtacctctgtaatatattgactgataattgatgttttccttattc
cgacagaaagcaaaattcccgtttcgtgaacacgagttcttgaccacattgttaaaatga
gagaaagaataataacacttacaatgaaaataataactaaaaatgtggatacaagattag
aaatctgttgtaatgagcttgttgccttatcatagttttcattattttctataatagaaa
agcctttccaatcaaccgtctttatgtcttttatggtagaaataattttctgcatacttt
gagggtcagaaatagaaactgtcatttcattaaaaccttgaatagctggactgttttcta
aagcaatgagtgtagctaaatcagcaatcattaaattctgaattttgtcataagaagtaa
cttgttcattgatactttccgtttcattttgctgaaacaaaccgacgatttctaggtcaa
ttcctttatctgttttaagaatatctcccacttgtacttgattttttacagctaaatctt
tgcttaatatcactttgcctttatcttttggggtaatatgcctgccctcaactaaatgta
tctgtttagaagtaaaatgtttattttcttcgcttttccaaacacctaaaatcttagtcg
tattcctaaattcttcttctatcggtatgtttcccttaaagaaatcaatcgtagaaaatg
ctgtaagtgtttcagttgttgcactacaatactgtacgccttttattttacttatttctt
caatcaactctggagtaatttgctgggtagaatacataattgtaccaccatctaccgctt
ctacattcaaataaggattagcttgcgaataatcatatccgattgtaaattcgcccccta
aacttttgcgtaggttatcttgtgctaatgacgaagccttatcaatagccaatgcactca
aaacaaatactgcaataagaaaaagaatacaaaataacaagaaactttttcccttttttc
tagtggtatatagccagccacgcttgatacagttcataaaaacgcctcctaatttcataa
tatctgttgcaacaactataaaataacatctcaatatggaagcaatatgaaatttcaagt
aaaatcaaaaaaacctctcacaacgagaggtttctaaaaatataatgtaaaacacatacc
ttgcaaaacgtccatttccttaaatgtataggtcagatttaatgactttgctatcatatc
aacgatatataaaccaagaccatttccaccgtcttttctatctctggcaaaatctggacg
gtaaaatggttcaaacaaatgcggaattatactctctggaataggtgtacattcattttt
aaccataattttgtttttttgcaaaaccaccgaaacactatgccccaattcagtataaga
aacagcatttgataatacatttgagagtagtttctccatgtgcttttttgaagtatttac
aaggcaagtattttgaacagttacttgaaaatcaattccttttgactgtgaaattagctg
gtatggttcacatattttattaagcatttccgctaaatcaaattcttcggttttttcact
ttcagctaaaaagtctaatctggaagtatctaaaatttctttaatcatgtgagaaagtct
atctgcaatttctttacactccaacaaataaacatctttatttttatattttccaactcc
caaaatcatattttctaaaattgcatttaaagcagttacgggagttttcaattcatgcga
agcagaacgcagaaaatcaacttttaattgttcagcttcattactctttatcttttcatc
ttctaaattgttaatcgtcgtgattagatttttatataatgtatttacatttgtagccaa
gacacctatttcatcaaatgaataaacaggacatgatacctctttctttaatcttgccat
tttttccgtcgtatcagaaatttctttaatcggagttgtaattactcttgaaaataaaaa
agagcaaatgaaagcgattattatgctaagtataaaagagaacggaaacgcccgcaaaat
tgcttcagaaacaaacctctctgtatttagagcattttcaatcataattccattttctga
tatgctgtttatactggataacatttgcggagcaaaagtataaatcattatatgtgcaat
cataatgataaatagcattacagaaaatgtataaagaaaaattttagggaataatttcag
ctttttcataatcatataacttcctcatatttgtagcctacaccctttacagtaataata
ttatctatatcaagtttttttcttaggttcttaatataagtatcaattattctgtctgca
ataggatagccgtacccccataaatcatcaataatctgatttctcgtcagtacaagccct
ttatgctctacaagcaattttaacaaatcaaattcttttggagtaaggtctattttctcg
ttatcttttttctttgcagtatatccagcaaaatctaccacaatatcatttatctgtaat
tgtttcatatcacagtttttcccactgcgacgcaataacgcttttactcttttttcaagc
aaaatcatagaaaatggttttgtaatatagtcgtctacttctgcgtcaaaacaagaaact
tgtgtatgttcattttcgattgcagttaatacaagaacgggaatagagctgttttcccga
atttctttcaatacactaataccgtcttttttaggtagcataatatccaatattactagg
tcaacattattttcttgtaacgtaattattgcttgtactccatcaaaaacagataaagtg
ctatgtccgaccattttcatatattcacagattgcttcatttgtattgtaatcatcttca
actactaataaatttgccatgttctcacctcaacgtatattatacaaaatgaatgtggaa
taaatatgaaatttgttcagaaaataaatttcgagtatttatgtttctcttttaaatatt
gtaaaagcgtgcaaatctccatagaaatgcacgctatatcatttatcctactatcttcca
gttgctatccttatgtagtacaagctcatattgcgatacctgcgtagcctttgtttgatt
atcaaggaatttcacagctactttcactttcacattgtccccgtcctttgtaaagatagg
gtttaccaattcagaatacagatagtccctgccgataggttcaagtacattaccagatac
ataataggcaagttctttttctgtggctgttgggtacagcttaaagaatgtttccagaaa
tgcggtagcgtcgtttacagtatcagcgtctacacttgcgtctgcttctggtgtcttagg
ctcatagtctgatttttcgattgctggtgcaagggtagggttctgaacgattaccatatc
cccgtcagcgtctatatggacttttacggtataggttgctttcacattgcttgtcttttc
tccctcttttatctgctgatctacttcgtaggtagcagaaaaagtgtccgttcccgattg
ttcgatactccatacaatcacatctgtaactgtggagctggtcggtatatccgttctaat
ggtatcaacattcaagtcctgcaattcctttgtcagataaccgttgattgcctgcgtcct
tgattcaatcgcttctttactgttattccatgtgtaataggacttcgcaaaattcttcac
gaaattttctatcccgttggtgtcctgcaagcgaagttcaatgatttctttttcg