Block details
fasta C_difficile_CD00084_1A_020911.fasta
contig u00000crpx_c_020911
start 2519302
length 9008
strand +
type noncore
seq gagaattaaggtaaataattccatccaatttttaccatattattcttttaggttttataa
tacttatctaatgagattgacattttactcattttaggatattatgaagttaacttcaca
tgaagttagcttcatatagaaagaggttatggaatgaaaacaaaagtacgagaatttcga
acaaatatgggtctaacacagcaacaactcgctgatttagtccatgtatcaaacagaaca
attatttctattgaaaaagagcaatatagcccttctcttatgcttgcctatcgtatggca
caagtgtttggtacaacgattgaagaactatgttgtttaaaagaaaataaagaaatggag
gataaaaaacatgaaagtaaagagtaaacgaagttttatagtgggtattatagtttgtat
gttatgttgtgctagtttagttatttattgcattttaaaagataaaagattcctaatttc
atcatttcttttaattgtaatagcaatctttaatttttgtaatgctttttcaagaaaagg
cattgttgaagaattacacgatagtgcagatgaaagagacttgtacttaacaatgaaaac
aagtcatatcttagttaaaattatgaattatacattatttacttttacatttcttttcat
catagcttatagtgcatggaaaaatcaatcacttctagttatagctataacactatgtgt
cattgagatttttttatttgttgcatatttacttatcaatatatttttagagaaaaaaga
gtaaatacaaggggtgatataaatgtattttaaaacttatatactaaaaagagaagtaaa
taacaaacaactagagataactcgaagttttgacttagataatctaatttgtactgcaac
agaaattttagaagatattgaaattgatttgataattattgatgaaaaaaataatgttgt
ttggagaaatgaaaaaaacactcccgctcatgagaatgcttagttataactatagaagtg
tactgcgaatacacttctatttttttattatatcatataaattatgctatcaaaaagagc
tatttaaatcgattttaaggtgtgttgaataagattcttgatagtttatatattgatgaa
tttcaaaaaaataagcactctttattataaggagtgctttggtgtatgttaatcttctat
ctaatacaattataacatgtcttatgttttagtatgataattttcgttcgctttattatt
acaatttttactatagttttatctatcctgttaatatttgtaatattttatatactcttt
gtacttgtgttactgatatactttgactaagaaaagcaaatttaataggaggtatctgct
atggattttggaaatatcaatcttatacttattggaataatagttataataggaactaca
ataatatatttaattaaacctaaaactgctttttgtagtaaaaaatattttaataaatta
gaatcaatatatggaaatatagataagaaaaaaactgttaaactagaagtactttatcgt
tatgtaacaggtcttgagtatatagcaataggcttatttacaagaagattagatattaca
atactagcaataatattagtagccattataacaacagcattatattatctaattagaaag
aaatatataactatataaaaaataatatcttataaataataagcctatcattatactcta
tttttagctaaaattgttcgacaaattgctgatataagttcttaaatatgctataaatta
aagtatactatataacattgtaggagagattttatggattttggggaagttaaatcagag
ttaagtgacaaagaccttaaagataatgaagaagctttaaacaagtataaaaaatattat
ttaaaagtttataagtattatagtgaaatggattccataaaaagtattcaagatatagaa
atagagcaatctaggcttaaaggacagttacaaaaaaatagtaaccccatttttgctttg
tatatatctattatggctgttgtattttctacaacaattaacttaacatttgatttatca
gatatcactaattattttattagaatgattatgacacttttatttattgtacttcttatt
tttttagttaacaagggcattcttccaatagctataccttatagaaataatatacaattt
tatactactgcattagatgtattagaagatatgaaaaagaaaatacttagagagagaaag
tataaaaaaagaaggtaacaaccaactctagttgctaccttctaatctatttaactaagt
tttctacttcactaaatgctttctcatttccatttccaccaatttgagttatatttctaa
attctcttttatttattaaacttttttgagtatcacttattccatttccaactaatagta
ctagagattctgtcttacctgcaagtactcctactgataaagcgtcaactaaatcatctt
ctctattttctccatttttgggttaatataattctctatctccattataccattttatac
caaacaaagcacttgaaacagtagaatatccaagtgctttatatgtctatttattatttt
tctctaattttttctcagaaagtttatatactatactttctaacttattatatatatcta
tatctgtttctcttattttcaaaagtttaattctatattcttcttttctcttttcaatat
acatattatcaagtaaattctcacacattgtattaatccccccaaaactaaactaaatta
tttaatacaactgataaatttactcaattttgtaagatacatgataattcttcttctcac
ctgcaatcttggtaggtctattattttcctctatccaagttctcaccttatctattacac
tctttgtatatttatttacagtaccagtccaagaaccattagtttaccaaacacctttaa
cttcaccatcttctaaatcaatctttttaataatctcacaaacagccatctgagctggtt
tattactcttagaatatattttcagtttagatgctatttgttttgtatcaaaataatgtt
cttcttcgtttatctctattggtaaatcaattcctgctttcttatataatgttttagctg
ttaatagttttgatttattgtcaaagcctgcatcatctaacaattcttttaacatagatg
tactgttataagcaactgtaatttttcaatctcacttgctttttctctcaacttttcggg
attgcattattagttatgtatgcaccagtttgtcttatgcttggtaaaacttcatcactt
atccagtcttggaatctctcagcttcttcttttcttgatttaaagattaatttatacact
ccactttcagtaagaaaattttctccagcattattaagttttcggatgtcagtattactg
atatccgaatttcttaactttacaacttgctttttattcataagtcttatattctcatta
acattttttatgtctaaacagtttgctacatcttttgagttgaataaaattcttccttca
aattcaaatacttcaatctcttttccttcaaacatcattaattcatttttcataatatta
cactccttaataattgattttttttaaggaatgacatatactataattgatatatgatag
tatacgtcataggggttactcaaactttggtcggtgggagtgacccttattttttattcc
ttttgttccagttcctcgtcgattttttcttctagccattctttcttggttagattcttt
tcctctaatacttcatcaaatttatctaacttttctttgtctaaaagtacactaaaacct
cttttatcttttcgacgatttttcatatactctgccctacttttagttgctattttattc
acctcttttctgtaactcgttacattaataataatattgtaacgagttacagaaaagagg
tttttactaattttttctaattattttacccaaccgaccaattttgaacagaataaaagc
acctacatatttgtaagtgctttctttgtttatttaattttgaatccacataattaatct
aaaacacaattattaattgttttattagtgaaatcacagcaatttacattccatatagtt
aatctaaaacatataaaatgggattagtaaaaaacacaacaggaacatttacattccata
tagttaatctaaaactttcttcgtctttagatgattgttttattgttcatcatttacatt
ccatatagttaatctaaaacgctttgcttataaagtagtagacgaagctaaaaagctatt
tacattccatatagttaatctaaaactatgaaagaactaggattaagtgcttttgattct
aaatttacattccatatagttaatctaaaacgtatgcttgtttattatatttattcaata
gtcatgagaatttacattccatatagttaatctaaaacccacgcattttagttcaaattc
gaagtttttggctgatttacattccatatagttaatctaaaacctatcctttcattcatt
taaaatttattcctttcaaatatttacattccatatagttaatctaaaacacgacgttga
gattgcggagcttctcaaccttgtacgcatttacattccatatagttaatctaaaacgtt
catcagatggatatgcaaatggagatataaagttatttacattccatatagttaatctaa
aactttatatcagtctttttagtcgctgtctgaatctcctcatttacattccatatagtt
aatctaaaacaaacagttcgctcagaaattttattaaaaatatcttgatttacattccat
atagttaatctaaaacgggaaagatgaaagttctatattgatattgaaaaatatttacat
tccatatagttaatctaaaacaaagaagtcatcaaagcaatgcaaattaaatgtaatatt
tacattccatatagttaatctaaaactataattagtattaaaaaaattcttaattctata
caatttacattccatatagttaatctaaaactgtcataaaaatcatcaaaatttttaccc
atgtaatatttacattccatatagttaatctaaaaccccaaaataaacttagcatttcca
atacctacatatatacaatactcttaaaattgcagtgagcgggcaatagtgcaattgata
acacttatcacgcaccctcaacatcttagatttcaagtattaagccctactttgtaacaa
atatcgcacactgcaaaacttctatatttttattatatcataaaatctaaactataaaat
taaaatggaatactttgtaaatttaaaagcacctacatacttgtaagtgcttactatatt
atctattctaataattcttttttctttttattatattcttcctgtgtaattgctcctgaa
tctagcaactcttttagtttctttattctatctagtgggtcaaccactctgttttgaatg
tagttattataactgtttttttcttgttctattttctcttgttctcgcttctcttcttct
tcggttttaagttcaaactcattgaattctaaattttcaacattatctacattattttgt
atgtttctaaaataatcaatataaacagaattatatataccgccgtcatcttttgaatga
aacttaaagtacgccttgcttattttaatttttttaagatcattagcaatttcttttaca
aattttttacattcttcagaattactaaatttttcattttgtacagttaaatcaaaatac
atactatatcttttaaattttcctacttttaattcatatttcttccccttatattcttga
ggtactaaagcctctagcttaacttttaaatcattttctgatatttccattccatgtttt
tcaatatatctttctttgtctacttcttcttgtattcttcttctttccatttctttttct
ctttctacagtttctctttgtgccctaacagtctcaactttattatctgctatcaaggat
ttatcttcccaagttgcacaaagataaattgaataagtgaaaaaaagaactgacacaaga
cccataactattttcttttctataaaagaatatataatcaacaaaaaagctatcataact
aaaatatattgcatagaagaaacagctattataagtaatactattgttattattggtact
aatatccacattataaaattcccccacaaattactcatctcactcaatattatagcataa
tttggcaaaacaaaagcacctaccatttaagtaagtactttcttatttacaattaaattt
attcatctagttagattcatcatcattgtgtataaaaaatttcatatttttattgactat
aaaaaatattatatgcaatattttttctaatttgtggtataataaaaacaagaagaacta
caatctatttgcggtagagtgaagttctataactgaaagttattttttacgatgatattt
aaaatttatatcaatctttaagtcactctttgcggtagagtggctttttacttttttgat
taacttgctaatcaaataaactatgtaactagctgttacactagctaacacattaaataa
aaaattatccatgtatattcacctcccttcttatcgttgggaggataattttttaataca
tgaactccactctataaattgtagattacatcttcttgctacaattattataacatataa
ttcttacatatttttcctatatcttactttttattttattttctattttttcaataaaaa
gcacctacatatttgtaagtgctttctatgtttatttagttttattgattacttaatagg
ttagtacaaattccataccaacctaagaatatctacataaaataattaaataatataatc
aataagtattttttttactcttttaatcaaattattacctgttccccaatcaatctgaaa
tagtccaattgcactaccagttgaggtaattttaacaagtgtttttcctgtagtattttc
acaaatcactaccaaacctgcatcactattgcttcttgcataatatttttcaaagattgt
aactattatagacttattattttctaggttataaatatcaacagaaactaaatctgcttc
caaatttttttctaccattttctgtgcttctagtggtgtcatctttacactaaatacatc
tcttgccatatcattcatcacatcctaaataaaaatatacttttttagtattttctgaca
cttttatcaaacagtattcctattcctcctagtaaaaccagtatagaaccaaaatttcta
tattgtgaaatagattgttctaaatatatgttgtattgttcggtagctattgacccacca
ttttgttttataatacaatccatattaaattgacctagacctatacagcaaaataacact
attattccaattacaaaagcaaatatacatattgtaagtttaatatctttattttccacc
cctcataatttagatttatttgttgttttttacttggtgatatattatctacattatact
atacaacatatatatccatctatttccaaatttgtaacattttcatatattagcaatgta
actattttaactttaaattctaccttcttctacctctctttttctctctttcagcttctt
tcattgtttcttcttcatcttcaattttaataagtattgagtcggctgctaatgctctct
cattaacttctaaattcatatattcactaggtttccactttagcttttgaatacaataat
gagtaatactagcctgaacctcccatgactaaagtcacaggtttcctgcttcacagaatt
ttgcatactaacatatgtcttactaattctccacaggctatccccgtagttcctacggtt
cttacatacgttatttattttgaattgttattagtcttaatccttcttttaatatattta
tacttgcatttatatctctatcgtgagtttcattacaactaggataaatccattctctta
tatttaagtccttcacttcctcgtttttatacccacatttattgcatatttgtgaacttg
caaagaatttacccacctttacaatttgtctaccatgccaattagccttgtattctaatt
gacgaataaactctgaccatgacacatcagaaattgagcgagatagtttacgattcctaa
tcatattctttacttgtaaatcttctatgcaaataatatcgttctcttttattaatttag
tagatagtttttgtagaaaatcatttctttgattagctatatgttcttgaagtcttgcaa
cttttaatcttgctttatttctatttaaactaccgattgtttttcttgataattctcttt
gtaatttagcaagtttgtttaatgacttcttaagatttgagataaattgaggtttatttg
aataaattgatttgaattatgttattttcagattacttttatttaagtattttgattgga
ttcagctgaattaatgtatattaattcttattgaacagtttttatttttatacattctat
ctactatatactatacatattctattaaaatttatataaataaaatacaaacttatttca
ttttcttaacatgttcagaataataaacaaaatgaaggtagaaaaagttataatttcata
ccttcattttatttattatgtatcaatttgtcattttcttatttcaaattcttaaaatat
tcttctaataaatttaaaatatcaccatctacttcatcatccttactacatagtgctgac
attaaacttaatattgaatttttatgtgtattctttaaaaattcttttgtttaaaatctc
tgatattat