Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD01322_2A_024609.fasta |
contig | u00000crpx_c_024609 |
start | 1332339 |
length | 16416 |
strand | - |
type | noncore |
seq | ctttgataaactatagcctgaccttctatgttattattataagtattagcaggtgcgaaa tattcaaatccattagagccactaaacacacctattttcactacacaatcactatcaaaa taaaagtgtttaccatcaatagttttataaccattaaaggcaatagcggtatcagtatca aagtagtatctactaccattaacagtctgccaaccttttgagatgatagcagtgtcagga ttgaaataatacttattattgtcaattacttgcaatccgactgcagcaatagcattatta ggattaaagtaatatttctcattgttaataatcctccatccagtgactgcttttgagtca ttatcaaaataatattttttgccattcaaagttaagaatttactttgataaactatagcc tgaccttctatgttattattctgagtattggcaggtgcaaaatactcaaatccatcaggt cctttaaatactcctaactgcatcacaccattattattaaaataaaagtgtttaccatta ataattttataactagttgaagctgctccagtatttatatcaaaataatattttttacca ttgatagtttgccatccagttactaagttagattctataggatcaaaatagaataatgaa ttatttatattgattaatcctttaactaatttactatcttcatcatagtaataagtttta ttatctattattttaaatcctaaatgatctctatctaattcattttcagaattaaatgat ttaaaattactcattatatatcctaatgatagttttttaatatctttaaaatctatactc attttattaaatgattgagtattagataagatacctttgattcttattttttgtaatatt tttttattactttcttctaagtatctaactaaaataaagtcacttccttctgtagaccat ttatactcaaaagaagaactatctaaatttatatttacttttttgtggaatgtatttggg ttaagaactataatctcagggtagtactcatttgaataataattggtattaatatttatt aaacttgtatataaatcaggtgctatcaatactttattgatatatctatctattccatag agaggttcataggaaaaatctagtgaagtagatatatcttcacccgtatcaggattatat ataggctctactacaacatttctaccatttccgctaaatatagtgcttttagatgacgat gttttccattcaccaaaatatatatctatatttttattattgtcacaaataaattctaca tatccaagattagttttaccaacaagggtaaagtatttatcgattacaaaatttatattt tcaaacccaaacaatttccagaaacttatattgttcaaaaataaattcataaaattagaa gtattatggtgtccatctgaatttttcacaaaatcaaggtaagatgagtatacggattca tttaaatataatccatttacttttacttgatttttactaactaaagaaatagagaaatct atacttttatcagtattattatcaacatagtattttcctgttatagtattaatatcatct ttcataaatacatttatatcttcagcaataaagtctttactgttaaattctaatgtactg ccattataaaattctaatatatttttactgtcttttttataatgtattatgcttttttga cttgttttagatatagctccaaaatatttattattagattcatcagtgtaattgtaagct atatttttactatctaggcctaaagtattgattttctcaatagtattagataaattggat atcaaataatttttatccccagacaataacaaactataagattttgcaacaagatttatt tctattattaaactaattttatcatctaactcacaagtcaagaatatatatctatctttg ttatctatatcacctgaaaaatctattgtttgattgcctataataagtttatttttattt atatcaattttacttaaaacatcttctattaaatttccttttttaatagtaccattttct atagatatttctcttacttcattatcaatattaaatatccataaatcatctttagataaa tttatattcattgatattggatatgaagataataataaagagtaagttcctcctgctcca tcaaatgaataagataatttgtttctaatttcgtcagtagttatagttggcattataaag tttctagtatctttatctagtttaattttagtattagtgtcttcatacactggttttaat gtagttattgcataatcgaaaaaggcatagaatctccagtaaaatttgcctgggtataaa tctcttattgaatcaagcaatttagtcccattattttccaatgatcttaaacctggaact gctccagtttcccaccaaaacactcttgaaggagcatttggtaacatcattatttttttt gaaaaatctagattttctgtttttatacctattgcagaataaactgataatgaaggaata tgagagcttatatatggagatgagaaaaagtgatctatattaccagtcactgtgtgtcct gatcccccctccattgctaatatattacatgttcctagttttatcgaattattattaaaa tctatttctgatattactaaatcatcaataggaactaaaattttatcatcttctgtttta agagggccatattctttagattcagacaaatgattaaaatagtttaccactgaagttgcc ttatcatgcaatattaattcattattaactaatgaaggtattcccgcagatataccagct ataggtaataagaaaatagtaacttcagcacctattccaacaattgaagctaccgttgca gctatagataatgacatatttattgctaaaacacccaccttagcttctagttcttttttt agtaatgggtcatgttcgtctagtaattccttaattgctgcacctaagtttattccgtct aatatagtagatacaataggtatcccctctgttattgtaggtagtacatttatagtatca tttactgcatttgatattaaatttactaattggatagagtcatatatagtatttaaacct gtactaaatagttgagcataaagttgaaccttaactgaggtacttaaatcattcagtaca tctttattgctactataatctattaatgattgaataaagaatgctgcgtttaatgtatta acttgagaagtatgatctaactgtatattatccaataaattaccattaacatctgtaatt atactattctttatagtacttatttcttttgtaatatgttcgctatattttgaaaaaatt tctttttctgtctctacataaactgattcaccattacttttgttaataaatcttacagaa taagttgaattattttttgagatatcttcaaaagatattaaatacttctcatctagatta tttaatttttttaattcatataattcatcagatacattttcaagtagattgaactcatct attaaatcatctatagaattgtggattatatttttaacaggttctaatttttcataataa atgtaatcaccaatagaagattcaatattaagcttaagattatttaaaataaattttgta tcaggactaacacttgcatcaagtaataatgtttttatatcttctgatattgacgctaaa cctggaatattcttggactttgcttttagcttattatctatggaatcaaaaaaaatgtat tctttactagataaatcgctcataatagcttcctctttatttatccatttacctgagtga gctagaagttcttttcttccctcactattaattcttacttcatattgatttgctcctata gtaatagaatctttatttacatcaggtaaagtggaagtaattttgtccataatacttaat agtaacttaccaggataagtttcttcaacattaaaatcataactaaacatattacatcca agcaagtttacttctacatttttaggtgatatatctaattttatggtatctaaaaatgaa cttatctcattggaaagtgaatctacacttaatctagcaaattcgcttgtgttgaattca tctttaccatgtccaataaaggttacttttactttttccttattttttaatctttcaggt atcctatatttatttaattctaaaatagattctccatcatcacttaaaaagtaacttttt gcactttcattcatatttcgttgtataataatactatttttaggatttttagaaaataaa ttgcatgttgcttcataacttatatcatctccttgtaactgtatgatataatgaacataa tttttacttccagcttcttctacattgtttgatggaattttattatttaataaatagttt ttgtcgagggcagtatttttattaaagtctaccccattgtcttcagaaagagatccacca gtataatctcttacatatttctcaaattgatattttgcacttgcttgatcaaagctccat agactatttatttcttgttctgtcaattgagatagattattttctgggaatttaaattct attaaatctgatgcttttaaagttttttctatagtattttcttgtaaatttatgaaatca tagtaagctgatgcataagctcctggaccacttaaacttattgtggagcgagcttctggc ataaaacctacttgtaagtatggtgctatttttgttaaaaacatagagttttctgcggta gctgaattaaatagtgaatcatgaaaaatcttagtagtatctgtgaagttattgtcagac tctatggctgggttaaggtgttggtttaaaaattgatatctattttttacttgttctatt actaggttagtaagatatgaaccttgttttgatatcaaggcttgatttataacactgcct aaagcgaaagctattttaatttcaagatcagatacatttaaattttctaatttagaaaat atctcagatttttcacttttactttctataatgagtttaaaattatcttttaattgttga tcaagtttatcaaagttttctgatgtataattatttatatattttttatacttcataata gcctctaattttatcatttcccaacggtctagtccaatagagctaggtctaggtattgtt ttaaataaatcagagtgaatacctggaagcatatcaacatctaaatatactccgccaaaa ttttttagggctaataatcttactatgtcagatgctgcagctaaattcccacgatttaac aactcctgactataaatatttaataactcttgttctgtaaacaaactattagccctgata tctatcccatgattactatttatttttctcaaagaatttgttctatatgattctaataaa gtttcatctctattatattcagatactagatgagactttataatatcatctattgtaggt actgtaggtttattgatttgagatttataataatttataaaccttttttgtctatcatat ataaattccatcctttttttgtaaaatttcatattatcaaattgaggattttgaatctct tcctctagtagctgtaatgcttcagtggtagaagattcaactatagccttttttagtgta ttgactaagaatgcttcactatcataccacagtttaatattatattctgcattaatatca gcccattgttttatgtattcaagagcaatatcactgacttctccacctatccatacaaaa tgtaaatttttttctacaggacttgtattggaatttttaataagaattacttcttttaat atatctttttttagattagagagtgctctatttctgcttgaatttttatatttattcata aaaacatcaattgattcatttagtttttttaattgtaaatatttattttcattattgttt gtagttaacttattatattcgtctaaattagttagtatagttttatactcattttctctt ggtctaatgctatatgcgagttttattaactcttctttagatattaaagacataaaaacc tcctagtactattatttttgataataaatccacttctataaccacatttattccttctga aatttaaattgattttcttgtttttaaactttgaaaataaatcttatacactcctttcta ttttttaaagataaattaatattgattttttataatttaagttttcatatttaaatcact tcctaacatttcaatttaaagatactcaattagttaattgactcttctattagataagga gattgtctgatagtaatttgtaaacatatcttatatttttttaatgtttttatttcttta tatatttttcctataacttttaaactatcaattaaatcatttattaaggtttgatactta ttttctctatcattttgtccttcatcacgtatttttgtgtttttgaataatttccatcac aatttacacatatttctatgtttaactattatagtttgtgatatctgtaactaatgtagc ttaatagattttaccaactgaccatgcaccatctttgtgaaccaatgtttgatatactac cttgtcatccatatagtaatgaacacttgcttcgaaattatatgtatttaatacttgtgt gtctcttggcatctgctccctcgttttcattatcagtttcatgaattatgataactttca gctattcttatttggataacactttttatttgttaatatttttattatatctaccattac ttacttttcatccttagcattcatttcatctgtcattgcatctagtaaaactgctatttt ttcctttaatctcttaggtactggtaatccacataagcacatattttttaatatgcttac actttcatataaaataaataaaatagagaaaaattcagatattccaagatgttttagtct taaaaaattgatacaatcttgtggtaacataaataaaaagttaaactttgtaagaatgtc aactactgataaaaaaaatatacatgctatcattgctacttttctgattcctccatctat tccaaaactagaattaaatttacgactttttattgcacttaaacatcctaataatgtatc aaatgatatagttaaaattactaactttataaatatatgctctgataaaaaagatattgt catattcataacgcctcctaggtttatataaaaaaatattttgttaccattagaaatata aaaaggtgaactactgtgcattcatcatagttcacctttttattggtaaatcttcatatt agatagaacactttatgtagtgtatcattttgtttatttttatatatttaagtataagag gatatatttaacgtatttttatctattcactaatcactaattgagctgtatcaggatcaa aataatactcctcaccatcaataataactgaaccagttgctgcaatatattcatctgtaa aataatatctcttttcatctaaatctaaccaaccagtatagtttattgattctccctcaa aattctcatctaaagtattttgatgtgcaaaatatttaaatccatctggtgtattaaata ctccaatctgcataataccatcttcactaaagtagaacgtcttatcttctatatttagat aaccatattgcataataccatcttcattaaaatagtaatgattatcttcaaatgttataa gacctgttctcattattccattctcatcaaaatagtattttatatcatcaattacattaa tacctttatatgcttttttagtttctggatcgaaataatatttatcactttcattttcca tatcatatatccaaccagtctcaattgtatatgtttctccaaaataatatacatcttcac caactctaactaaaccactatattcaactgcttgtccatagatattatcatttacagtat tagctggtgcaaagtatttatatccatctgaagtgtcaaatacaccaatttgaactagac cattttcgtctatatagaaataattatcatctatattttgcattccagattctactattc cagaatcagagaaataaaatacttcattatttattgtgacaaatccaatttgcatgattc cagaatcattaaaataatatttaccatcattaattattgagatacctatatatgcttctg ctgtatcttcatcaaagtaatattttgaaccatcttctaaatccttccatccaactactg ctgtaaatgaatcatcaaaataataaatcttattgttaaaattaagtataccagaatatg aaagtgcttcaccttcttcatttcctaaatcttcatcatgatgagcaaaatatttaaatc catctgctgtattaaatactcctatttgcatttctccattctcagcaaagtaaaaatatt ttccatctatttcagtatatcctgacttcatcacaccagaatcatcaaaatagaatgtct tatcatttatattaacaaatcctttttgcataataccatcagagttgaaatagaatttat catcacctatttgatttagccctttaaaagctctacctgtatctgtactaaaatagtaca cttcatcatctaatgtttgccattctatagctgctctataattatctccaaaataataaa cattttcatcaatagttagtttgccagtaaaatcaattgcttccccctctagattttcat caagtgtatctgctggagcaaaatatttaaatccatcttctgtactaaatacacctgttt gtaacactccattttggctgaagtagtagtttttgccatcaattattgtttctccgactg aagcagctccaccattatctggattaaagtagtatttatcatcacctatagttgtaaatc cagttatcaagttctttattggtggcttgaaataatataatgaatcattaatatatacta atccagacaccatcattccaaagttattaatataaaatttctcattgtataaagaaatca gacctaaatcataattaagtaatccttccacataatatgaaggtgtaaatgttgaaataa ctttatttatagatacatcttgcttatcactaaaattaaaagatatcttatctgatatag tattacctttaaaaacattagtaaatcttattttaacttgtgataccttgttctcttcat cagttgacataagaataaaatcacttccatcattactccatacatatcgtatagataaat cattgatattaatattgattttttcacttatataatttgtatctaatacaatcacttctg gataagtattatttgcttcatatataggtgttatgtttatttcatctgtatatatatttg gcgaaattataactttattaacacaactgtctattccataaaggtatttctgagaaaaat taatgacagttgaagatatatctccagaatcatctaaatcataatttggttctactatca tattttgtctattacctacatatagagtatatttagtttctagtgtattaaacttaatga aatatggttgtatattattatctttatcacaaataaactcaaattgaccaatagaagtag taccacttattataaaattagtatctaatataagcttagtattagattgtaaggaattta tgaaaatactttttatattcatactttctaaaaagctcattaaagaatctgaagtatttg tactaccttttttattcataaatttcaatatttcagctactccattttcatctaaatata ctccatttaattttatagtattttcatcttgtatagtaaaagaaagagagatttttatat catcttttaaataatatcctgttaatataataacgtcatctttagttatgactttaacat ctttcaaatcattactacaatatccaaatagaggtttactattgtccatataaactttac ttataagaactacatcagataattcagatacaaataaaccttcttttgtagaacaattaa taaatccattttcttttcctttatcatccataaaactataaggtatatttttttgtaatt cgctgttcaatcctatataatctattttctgttgaacagaatttgaatttgccatcaatg tttttagttcaccagaaataagaactttatatgatttagataataaatcaacttctataa ctgcatttattccttctaagattgagaatgttaaagatacaaatccattacctccattta atgttccagagaaattaatttcatgattatctaaaataattttattgtcttcaatactta atttagataaaatattctctattaaatctccttttttaattttatcagattctatagtga catctcttacgacattgtcgacatctataacccaagtatcattttcatttaattctatgt ttatattcatattgtattgagaaagagataatgcataagttcctccagaaccataaaaag aatatgataatttctctcttatatattctgtagttatcactgggactataaagcttctag tattactatctaaatttattcttatattagtatcttcatatcttggttttaatgttgtta ttaaagcatcagctataaaagcaaaatatctccaataaaactcaccttcatagttatctc ttatacggtctaacagttttgtgccatcattttctaagcttcttaaacctggtgtccatc ctgtttcccaagcaaatactctatttggagcattaggtaataccattaaatcttttgaca aatcaagttcttctttttgtacttccaatacgtcatatatagataagtgtggctctctat atgttattgatggtgctgaaaagaagtgatctatatcatcagttacagtatgacctgagc caccttccattctccagatttcacatttacctaaagttattgaattgttattaaagtcta tctcagatattactaaatcatcttgtggcatcattattttatcatctaatgaagtaaatg ctccttcagactcagctaatgatatatgactaaaataatctacaacttttgttgctttat ctcttaggataagctcattgtttactaaacttggtatacctgctgaaattcctgctaaag gaactaaaagtatactaaatccactagctattcctaaagatgaagtaatgattgcagttg tagctgctgttaaatttactgccattatacctatcttagcttctatttcttgtcttaata atgggtcacttgtttcacttagctctttgattgctgcacctaaacttacaccatctatga tagttgcaattacaggtaatccttcagataatgtaggaagtaaatctatagtttcatcta atgcagttgatactaattcaacaactttggctgcatctgtaatagtatttaaaccagtac taaataattgagcataaacttgaactttcattgctacacttaaattactaagagattctt tagaactattatattctattaatgattgtataaaaaatgcagcatttaaagtattcactt catgtgtagcatctaaatttactttttttactaacttaccatttacagtatcaaatatag taccttttatcttagaaatctcttcagttatatgattagcatattcagagaatattgcct tttcagtttctacaaatatagattctccagtttctttatcaataaatcttatactaaagc cttcatcagtctccaatatatcctcaaaagatataaaatgagactcttctaattcattct gttgttttaaatcgtatagtgcatcagaaatagattctattagtttaaattcattcttta tataattaatagagtcagaagttaagcttttagcttcttcaatccttccttctaccactt gtgtatctatatttgaaataacatttatctcacattctgctaacattactttttcttcta gttcaatatcacttgaattagaattgtttctaatttcttgtaataatgtagataattcag gtaaatttttagattttactataattttattttctttaggattaaatgatatatattctt ttgatgaaatatcctttataatactttcttctttatttatccattcaccagaatgatcca ataattctcttcttccttcactatttattctaacttcatattgatttgcacttactataa tagagtcttgacttatagatggcattaattctgatactttatctttaactctaagtaata atttcccaggataagtctcctctacatttacagaatagctaaacatgttacatcccagta agtttatttctattgacttaggagaaatatcctctttagctaaatctattgctgtttcta tttctgtggataatgaatctacatcaagacctgcaaatatatcagtattaaattcatctt taccatgaccaataaatgttaatttaatcttaggtctatcagaaattatacttggaattt tatacttgtctatttcttgtatttcaccatctccaggattataataatatgcaatttctg aatcttctatatttttctgaaacagtacactatcataaggagtctttgcaaataagttac atgctgcttcataactaattttatctccttgtaactgaacaatatagtgtatatatcctc tctctgaacttcttgctaatgaagatattttttctaaaagatactccttgtcaactactg tattttgagaaaagtcaagattgtcatcttctccaagagaaccttcaaagtaattttttt tgtattcttcaaattgagctttagctcttgcatcgtcaaatgaccataagctagccattt cttgttcagttgattgagaaatattagttttagagatttcaaagtttcttaagtcagctt ctatcaaatggatattcatactaccttctttaaacattaataaatcttgataagctgccg catatgcttcagggccacttaagttaatagtagttttaacatctgggaagaaaccaactc ttaaatactttcctagttccatcataaatctaccattatctgcattagcttcagccatta tactatcaataaaagcattcgttgtagtattgaaatcgttatcctcgctaatagctggat ttaaactattattcaatatcttatatctgttctcgatttgttttactattaaattgctac aatatgagtctttcacagaaattagtccttgatttataatacctttactattaaatgcaa ttttaacttctagtggtgatgcctccatatcgccaagtgatgagaatatttctgacttat ctgacttagaagctagaacagattcaaaactactttgaacttcttcatccaacatatcaa aatgctctgaagtatatcctggtatgtattctttgtatttcattatagcttctaatttta ccatttcccaaaaatccactgttactgaactaggtttctctatagactcaaataggtctg gttgtattcctggtaacatatcaacatctaaatatacaccaccaacttcttttaaggcag atattcttaatatgtcagaagcagctgccaaattccatctttctaccaactcttgttcat ataatttgaatgactctccacctttaaattcttcaaagtttctaacatcattcccactat tttctgtaactttatttaatgactcttcaatataggaattaagttcatctatatcctttg aatactcgtttgaaagatatatctttacaatatcatcaattataaggtcaggattttctt ctctttgagttttatagtaatttatgaaatttttctgcttatcatagattatctccatac gttttctgtaaaatttattatagtcaaatctagggtcatttaagttttctctaaatgatt caagtgtatcatttgttgctgattctactatagtttttttcaatgtgtttatcaaaaatg cattactatcataaaaaacattaacattataatcactatttacatctttccattgattta tataattaatagcagtgtcatttatttgacctccaatccaaacaaaatgtaaatttttct caactggagttaaattattattctttagctctaatacttctgtaactaggtattccttaa atttttttaaggctttatttctaccagactttttatatgtatctatataaatatctgtta aactatttatatcttttaattttaaatatttttcgactacagtattctctgacatattat gatattcttctaaagcatccaatattgctacatattcatcttcctgaacacgaaatctta catttgccattttttctaactgttttctattaactaaactcataaaattttctcctttac tataatatttttattgaatatttttacatctaaatgctaaaactcttttatatatcctcc tttctatttataaaatatactaatatctacttaggttttcatatacattcacttcctaac attttaaattgaagacactcagttgattaatttgctcttcgattgaataaagacgttgtc tgaaataaatatgtaaactttgttctatataaaatataaaaattaagatattcttagatt aagttattgattttacaataaagttaattctaaaatttgatttctattgtaaatatttct ttaaattcattaattacaagttaaaataattttcatagtctttttttatttttttaaatg ctctatttttagccttattaacagcttgtctagatatttttaatttcactgatatttctc tatcagaatatccttttaaatatttataaaaaataacttttctttgaataccagataatt ctttcaaaatatattcgaaaaaacaaatatcttcctcaaaaacagacttactttgataat tatttttcatatttaagatattttcatcaaattctacaaaattaaacttcattttagaat atcttctagacaactcaaaagtcttattcagtaatgatttatgaatatatttgactataa tagcatcgcttttttctgaaaagctacttaatttaatattttttattaattcaataaaaa atattattaaatctgtttctccctcttcataatgtaaaactctactaagtttttttacta atggcttaaacataaataaaatttcttgcaaatcatctactgagttatttcttgctaaaa caattaattcataaaaagacttttgcataaaatcatcctctcttatatttataatgatga tttatttaaaaattttgacaacattggaattaaatcagtcattataattatataatcggc aaataaattaaattttatatgaaaatacgcattataaatacattaattttaataattaat tagtaatttttttctaataaataaagtattttagcaataaactttatattaataaagtat tgtaaaaacaaatcattttattaaagtaaaataaaaaaaatctatatgatatatttttat acttatatttcttttttcttaattttcagtctttttcgaagttataactagattttaaaa tagatcaatttttaagtaacaattacataattattaaataattatgtaaactttataatt tagtcaataaataaaataaaatttattacatgcacatttttaacttaatcaatcattaaa ttaaaatcttttcaaactaaatattttcaagactaaaatagtatcttttatgaaatctag aaacctttttatattttagaacattctcctctcttaagataatttttttttttgtttatt aatattttttattatttttttaacaaactatcagagtagaattatttaatattttgttat ttttaatcaaatgaacgaatattatatatatcattcataaaaactttatataaagaatag aaacaagttctagattactatagagatgacatatcaaaatatttttaaaaagtaatctaa gtattagaagtgattgaagttagtaaatataaatgcgtttacttttaagtattgcttaag ggaataaaaaataaaaataagctctgcaaccatctaaaaatagttgcagagcttacaaaa ccaaaattatctaaattgtaataaaaataataacatt |