Block details
fasta C_difficile_CD01322_2A_024609.fasta
contig u00000crpx_c_024609
start 1332339
length 16416
strand -
type noncore
seq ctttgataaactatagcctgaccttctatgttattattataagtattagcaggtgcgaaa
tattcaaatccattagagccactaaacacacctattttcactacacaatcactatcaaaa
taaaagtgtttaccatcaatagttttataaccattaaaggcaatagcggtatcagtatca
aagtagtatctactaccattaacagtctgccaaccttttgagatgatagcagtgtcagga
ttgaaataatacttattattgtcaattacttgcaatccgactgcagcaatagcattatta
ggattaaagtaatatttctcattgttaataatcctccatccagtgactgcttttgagtca
ttatcaaaataatattttttgccattcaaagttaagaatttactttgataaactatagcc
tgaccttctatgttattattctgagtattggcaggtgcaaaatactcaaatccatcaggt
cctttaaatactcctaactgcatcacaccattattattaaaataaaagtgtttaccatta
ataattttataactagttgaagctgctccagtatttatatcaaaataatattttttacca
ttgatagtttgccatccagttactaagttagattctataggatcaaaatagaataatgaa
ttatttatattgattaatcctttaactaatttactatcttcatcatagtaataagtttta
ttatctattattttaaatcctaaatgatctctatctaattcattttcagaattaaatgat
ttaaaattactcattatatatcctaatgatagttttttaatatctttaaaatctatactc
attttattaaatgattgagtattagataagatacctttgattcttattttttgtaatatt
tttttattactttcttctaagtatctaactaaaataaagtcacttccttctgtagaccat
ttatactcaaaagaagaactatctaaatttatatttacttttttgtggaatgtatttggg
ttaagaactataatctcagggtagtactcatttgaataataattggtattaatatttatt
aaacttgtatataaatcaggtgctatcaatactttattgatatatctatctattccatag
agaggttcataggaaaaatctagtgaagtagatatatcttcacccgtatcaggattatat
ataggctctactacaacatttctaccatttccgctaaatatagtgcttttagatgacgat
gttttccattcaccaaaatatatatctatatttttattattgtcacaaataaattctaca
tatccaagattagttttaccaacaagggtaaagtatttatcgattacaaaatttatattt
tcaaacccaaacaatttccagaaacttatattgttcaaaaataaattcataaaattagaa
gtattatggtgtccatctgaatttttcacaaaatcaaggtaagatgagtatacggattca
tttaaatataatccatttacttttacttgatttttactaactaaagaaatagagaaatct
atacttttatcagtattattatcaacatagtattttcctgttatagtattaatatcatct
ttcataaatacatttatatcttcagcaataaagtctttactgttaaattctaatgtactg
ccattataaaattctaatatatttttactgtcttttttataatgtattatgcttttttga
cttgttttagatatagctccaaaatatttattattagattcatcagtgtaattgtaagct
atatttttactatctaggcctaaagtattgattttctcaatagtattagataaattggat
atcaaataatttttatccccagacaataacaaactataagattttgcaacaagatttatt
tctattattaaactaattttatcatctaactcacaagtcaagaatatatatctatctttg
ttatctatatcacctgaaaaatctattgtttgattgcctataataagtttatttttattt
atatcaattttacttaaaacatcttctattaaatttccttttttaatagtaccattttct
atagatatttctcttacttcattatcaatattaaatatccataaatcatctttagataaa
tttatattcattgatattggatatgaagataataataaagagtaagttcctcctgctcca
tcaaatgaataagataatttgtttctaatttcgtcagtagttatagttggcattataaag
tttctagtatctttatctagtttaattttagtattagtgtcttcatacactggttttaat
gtagttattgcataatcgaaaaaggcatagaatctccagtaaaatttgcctgggtataaa
tctcttattgaatcaagcaatttagtcccattattttccaatgatcttaaacctggaact
gctccagtttcccaccaaaacactcttgaaggagcatttggtaacatcattatttttttt
gaaaaatctagattttctgtttttatacctattgcagaataaactgataatgaaggaata
tgagagcttatatatggagatgagaaaaagtgatctatattaccagtcactgtgtgtcct
gatcccccctccattgctaatatattacatgttcctagttttatcgaattattattaaaa
tctatttctgatattactaaatcatcaataggaactaaaattttatcatcttctgtttta
agagggccatattctttagattcagacaaatgattaaaatagtttaccactgaagttgcc
ttatcatgcaatattaattcattattaactaatgaaggtattcccgcagatataccagct
ataggtaataagaaaatagtaacttcagcacctattccaacaattgaagctaccgttgca
gctatagataatgacatatttattgctaaaacacccaccttagcttctagttcttttttt
agtaatgggtcatgttcgtctagtaattccttaattgctgcacctaagtttattccgtct
aatatagtagatacaataggtatcccctctgttattgtaggtagtacatttatagtatca
tttactgcatttgatattaaatttactaattggatagagtcatatatagtatttaaacct
gtactaaatagttgagcataaagttgaaccttaactgaggtacttaaatcattcagtaca
tctttattgctactataatctattaatgattgaataaagaatgctgcgtttaatgtatta
acttgagaagtatgatctaactgtatattatccaataaattaccattaacatctgtaatt
atactattctttatagtacttatttcttttgtaatatgttcgctatattttgaaaaaatt
tctttttctgtctctacataaactgattcaccattacttttgttaataaatcttacagaa
taagttgaattattttttgagatatcttcaaaagatattaaatacttctcatctagatta
tttaatttttttaattcatataattcatcagatacattttcaagtagattgaactcatct
attaaatcatctatagaattgtggattatatttttaacaggttctaatttttcataataa
atgtaatcaccaatagaagattcaatattaagcttaagattatttaaaataaattttgta
tcaggactaacacttgcatcaagtaataatgtttttatatcttctgatattgacgctaaa
cctggaatattcttggactttgcttttagcttattatctatggaatcaaaaaaaatgtat
tctttactagataaatcgctcataatagcttcctctttatttatccatttacctgagtga
gctagaagttcttttcttccctcactattaattcttacttcatattgatttgctcctata
gtaatagaatctttatttacatcaggtaaagtggaagtaattttgtccataatacttaat
agtaacttaccaggataagtttcttcaacattaaaatcataactaaacatattacatcca
agcaagtttacttctacatttttaggtgatatatctaattttatggtatctaaaaatgaa
cttatctcattggaaagtgaatctacacttaatctagcaaattcgcttgtgttgaattca
tctttaccatgtccaataaaggttacttttactttttccttattttttaatctttcaggt
atcctatatttatttaattctaaaatagattctccatcatcacttaaaaagtaacttttt
gcactttcattcatatttcgttgtataataatactatttttaggatttttagaaaataaa
ttgcatgttgcttcataacttatatcatctccttgtaactgtatgatataatgaacataa
tttttacttccagcttcttctacattgtttgatggaattttattatttaataaatagttt
ttgtcgagggcagtatttttattaaagtctaccccattgtcttcagaaagagatccacca
gtataatctcttacatatttctcaaattgatattttgcacttgcttgatcaaagctccat
agactatttatttcttgttctgtcaattgagatagattattttctgggaatttaaattct
attaaatctgatgcttttaaagttttttctatagtattttcttgtaaatttatgaaatca
tagtaagctgatgcataagctcctggaccacttaaacttattgtggagcgagcttctggc
ataaaacctacttgtaagtatggtgctatttttgttaaaaacatagagttttctgcggta
gctgaattaaatagtgaatcatgaaaaatcttagtagtatctgtgaagttattgtcagac
tctatggctgggttaaggtgttggtttaaaaattgatatctattttttacttgttctatt
actaggttagtaagatatgaaccttgttttgatatcaaggcttgatttataacactgcct
aaagcgaaagctattttaatttcaagatcagatacatttaaattttctaatttagaaaat
atctcagatttttcacttttactttctataatgagtttaaaattatcttttaattgttga
tcaagtttatcaaagttttctgatgtataattatttatatattttttatacttcataata
gcctctaattttatcatttcccaacggtctagtccaatagagctaggtctaggtattgtt
ttaaataaatcagagtgaatacctggaagcatatcaacatctaaatatactccgccaaaa
ttttttagggctaataatcttactatgtcagatgctgcagctaaattcccacgatttaac
aactcctgactataaatatttaataactcttgttctgtaaacaaactattagccctgata
tctatcccatgattactatttatttttctcaaagaatttgttctatatgattctaataaa
gtttcatctctattatattcagatactagatgagactttataatatcatctattgtaggt
actgtaggtttattgatttgagatttataataatttataaaccttttttgtctatcatat
ataaattccatcctttttttgtaaaatttcatattatcaaattgaggattttgaatctct
tcctctagtagctgtaatgcttcagtggtagaagattcaactatagccttttttagtgta
ttgactaagaatgcttcactatcataccacagtttaatattatattctgcattaatatca
gcccattgttttatgtattcaagagcaatatcactgacttctccacctatccatacaaaa
tgtaaatttttttctacaggacttgtattggaatttttaataagaattacttcttttaat
atatctttttttagattagagagtgctctatttctgcttgaatttttatatttattcata
aaaacatcaattgattcatttagtttttttaattgtaaatatttattttcattattgttt
gtagttaacttattatattcgtctaaattagttagtatagttttatactcattttctctt
ggtctaatgctatatgcgagttttattaactcttctttagatattaaagacataaaaacc
tcctagtactattatttttgataataaatccacttctataaccacatttattccttctga
aatttaaattgattttcttgtttttaaactttgaaaataaatcttatacactcctttcta
ttttttaaagataaattaatattgattttttataatttaagttttcatatttaaatcact
tcctaacatttcaatttaaagatactcaattagttaattgactcttctattagataagga
gattgtctgatagtaatttgtaaacatatcttatatttttttaatgtttttatttcttta
tatatttttcctataacttttaaactatcaattaaatcatttattaaggtttgatactta
ttttctctatcattttgtccttcatcacgtatttttgtgtttttgaataatttccatcac
aatttacacatatttctatgtttaactattatagtttgtgatatctgtaactaatgtagc
ttaatagattttaccaactgaccatgcaccatctttgtgaaccaatgtttgatatactac
cttgtcatccatatagtaatgaacacttgcttcgaaattatatgtatttaatacttgtgt
gtctcttggcatctgctccctcgttttcattatcagtttcatgaattatgataactttca
gctattcttatttggataacactttttatttgttaatatttttattatatctaccattac
ttacttttcatccttagcattcatttcatctgtcattgcatctagtaaaactgctatttt
ttcctttaatctcttaggtactggtaatccacataagcacatattttttaatatgcttac
actttcatataaaataaataaaatagagaaaaattcagatattccaagatgttttagtct
taaaaaattgatacaatcttgtggtaacataaataaaaagttaaactttgtaagaatgtc
aactactgataaaaaaaatatacatgctatcattgctacttttctgattcctccatctat
tccaaaactagaattaaatttacgactttttattgcacttaaacatcctaataatgtatc
aaatgatatagttaaaattactaactttataaatatatgctctgataaaaaagatattgt
catattcataacgcctcctaggtttatataaaaaaatattttgttaccattagaaatata
aaaaggtgaactactgtgcattcatcatagttcacctttttattggtaaatcttcatatt
agatagaacactttatgtagtgtatcattttgtttatttttatatatttaagtataagag
gatatatttaacgtatttttatctattcactaatcactaattgagctgtatcaggatcaa
aataatactcctcaccatcaataataactgaaccagttgctgcaatatattcatctgtaa
aataatatctcttttcatctaaatctaaccaaccagtatagtttattgattctccctcaa
aattctcatctaaagtattttgatgtgcaaaatatttaaatccatctggtgtattaaata
ctccaatctgcataataccatcttcactaaagtagaacgtcttatcttctatatttagat
aaccatattgcataataccatcttcattaaaatagtaatgattatcttcaaatgttataa
gacctgttctcattattccattctcatcaaaatagtattttatatcatcaattacattaa
tacctttatatgcttttttagtttctggatcgaaataatatttatcactttcattttcca
tatcatatatccaaccagtctcaattgtatatgtttctccaaaataatatacatcttcac
caactctaactaaaccactatattcaactgcttgtccatagatattatcatttacagtat
tagctggtgcaaagtatttatatccatctgaagtgtcaaatacaccaatttgaactagac
cattttcgtctatatagaaataattatcatctatattttgcattccagattctactattc
cagaatcagagaaataaaatacttcattatttattgtgacaaatccaatttgcatgattc
cagaatcattaaaataatatttaccatcattaattattgagatacctatatatgcttctg
ctgtatcttcatcaaagtaatattttgaaccatcttctaaatccttccatccaactactg
ctgtaaatgaatcatcaaaataataaatcttattgttaaaattaagtataccagaatatg
aaagtgcttcaccttcttcatttcctaaatcttcatcatgatgagcaaaatatttaaatc
catctgctgtattaaatactcctatttgcatttctccattctcagcaaagtaaaaatatt
ttccatctatttcagtatatcctgacttcatcacaccagaatcatcaaaatagaatgtct
tatcatttatattaacaaatcctttttgcataataccatcagagttgaaatagaatttat
catcacctatttgatttagccctttaaaagctctacctgtatctgtactaaaatagtaca
cttcatcatctaatgtttgccattctatagctgctctataattatctccaaaataataaa
cattttcatcaatagttagtttgccagtaaaatcaattgcttccccctctagattttcat
caagtgtatctgctggagcaaaatatttaaatccatcttctgtactaaatacacctgttt
gtaacactccattttggctgaagtagtagtttttgccatcaattattgtttctccgactg
aagcagctccaccattatctggattaaagtagtatttatcatcacctatagttgtaaatc
cagttatcaagttctttattggtggcttgaaataatataatgaatcattaatatatacta
atccagacaccatcattccaaagttattaatataaaatttctcattgtataaagaaatca
gacctaaatcataattaagtaatccttccacataatatgaaggtgtaaatgttgaaataa
ctttatttatagatacatcttgcttatcactaaaattaaaagatatcttatctgatatag
tattacctttaaaaacattagtaaatcttattttaacttgtgataccttgttctcttcat
cagttgacataagaataaaatcacttccatcattactccatacatatcgtatagataaat
cattgatattaatattgattttttcacttatataatttgtatctaatacaatcacttctg
gataagtattatttgcttcatatataggtgttatgtttatttcatctgtatatatatttg
gcgaaattataactttattaacacaactgtctattccataaaggtatttctgagaaaaat
taatgacagttgaagatatatctccagaatcatctaaatcataatttggttctactatca
tattttgtctattacctacatatagagtatatttagtttctagtgtattaaacttaatga
aatatggttgtatattattatctttatcacaaataaactcaaattgaccaatagaagtag
taccacttattataaaattagtatctaatataagcttagtattagattgtaaggaattta
tgaaaatactttttatattcatactttctaaaaagctcattaaagaatctgaagtatttg
tactaccttttttattcataaatttcaatatttcagctactccattttcatctaaatata
ctccatttaattttatagtattttcatcttgtatagtaaaagaaagagagatttttatat
catcttttaaataatatcctgttaatataataacgtcatctttagttatgactttaacat
ctttcaaatcattactacaatatccaaatagaggtttactattgtccatataaactttac
ttataagaactacatcagataattcagatacaaataaaccttcttttgtagaacaattaa
taaatccattttcttttcctttatcatccataaaactataaggtatatttttttgtaatt
cgctgttcaatcctatataatctattttctgttgaacagaatttgaatttgccatcaatg
tttttagttcaccagaaataagaactttatatgatttagataataaatcaacttctataa
ctgcatttattccttctaagattgagaatgttaaagatacaaatccattacctccattta
atgttccagagaaattaatttcatgattatctaaaataattttattgtcttcaatactta
atttagataaaatattctctattaaatctccttttttaattttatcagattctatagtga
catctcttacgacattgtcgacatctataacccaagtatcattttcatttaattctatgt
ttatattcatattgtattgagaaagagataatgcataagttcctccagaaccataaaaag
aatatgataatttctctcttatatattctgtagttatcactgggactataaagcttctag
tattactatctaaatttattcttatattagtatcttcatatcttggttttaatgttgtta
ttaaagcatcagctataaaagcaaaatatctccaataaaactcaccttcatagttatctc
ttatacggtctaacagttttgtgccatcattttctaagcttcttaaacctggtgtccatc
ctgtttcccaagcaaatactctatttggagcattaggtaataccattaaatcttttgaca
aatcaagttcttctttttgtacttccaatacgtcatatatagataagtgtggctctctat
atgttattgatggtgctgaaaagaagtgatctatatcatcagttacagtatgacctgagc
caccttccattctccagatttcacatttacctaaagttattgaattgttattaaagtcta
tctcagatattactaaatcatcttgtggcatcattattttatcatctaatgaagtaaatg
ctccttcagactcagctaatgatatatgactaaaataatctacaacttttgttgctttat
ctcttaggataagctcattgtttactaaacttggtatacctgctgaaattcctgctaaag
gaactaaaagtatactaaatccactagctattcctaaagatgaagtaatgattgcagttg
tagctgctgttaaatttactgccattatacctatcttagcttctatttcttgtcttaata
atgggtcacttgtttcacttagctctttgattgctgcacctaaacttacaccatctatga
tagttgcaattacaggtaatccttcagataatgtaggaagtaaatctatagtttcatcta
atgcagttgatactaattcaacaactttggctgcatctgtaatagtatttaaaccagtac
taaataattgagcataaacttgaactttcattgctacacttaaattactaagagattctt
tagaactattatattctattaatgattgtataaaaaatgcagcatttaaagtattcactt
catgtgtagcatctaaatttactttttttactaacttaccatttacagtatcaaatatag
taccttttatcttagaaatctcttcagttatatgattagcatattcagagaatattgcct
tttcagtttctacaaatatagattctccagtttctttatcaataaatcttatactaaagc
cttcatcagtctccaatatatcctcaaaagatataaaatgagactcttctaattcattct
gttgttttaaatcgtatagtgcatcagaaatagattctattagtttaaattcattcttta
tataattaatagagtcagaagttaagcttttagcttcttcaatccttccttctaccactt
gtgtatctatatttgaaataacatttatctcacattctgctaacattactttttcttcta
gttcaatatcacttgaattagaattgtttctaatttcttgtaataatgtagataattcag
gtaaatttttagattttactataattttattttctttaggattaaatgatatatattctt
ttgatgaaatatcctttataatactttcttctttatttatccattcaccagaatgatcca
ataattctcttcttccttcactatttattctaacttcatattgatttgcacttactataa
tagagtcttgacttatagatggcattaattctgatactttatctttaactctaagtaata
atttcccaggataagtctcctctacatttacagaatagctaaacatgttacatcccagta
agtttatttctattgacttaggagaaatatcctctttagctaaatctattgctgtttcta
tttctgtggataatgaatctacatcaagacctgcaaatatatcagtattaaattcatctt
taccatgaccaataaatgttaatttaatcttaggtctatcagaaattatacttggaattt
tatacttgtctatttcttgtatttcaccatctccaggattataataatatgcaatttctg
aatcttctatatttttctgaaacagtacactatcataaggagtctttgcaaataagttac
atgctgcttcataactaattttatctccttgtaactgaacaatatagtgtatatatcctc
tctctgaacttcttgctaatgaagatattttttctaaaagatactccttgtcaactactg
tattttgagaaaagtcaagattgtcatcttctccaagagaaccttcaaagtaattttttt
tgtattcttcaaattgagctttagctcttgcatcgtcaaatgaccataagctagccattt
cttgttcagttgattgagaaatattagttttagagatttcaaagtttcttaagtcagctt
ctatcaaatggatattcatactaccttctttaaacattaataaatcttgataagctgccg
catatgcttcagggccacttaagttaatagtagttttaacatctgggaagaaaccaactc
ttaaatactttcctagttccatcataaatctaccattatctgcattagcttcagccatta
tactatcaataaaagcattcgttgtagtattgaaatcgttatcctcgctaatagctggat
ttaaactattattcaatatcttatatctgttctcgatttgttttactattaaattgctac
aatatgagtctttcacagaaattagtccttgatttataatacctttactattaaatgcaa
ttttaacttctagtggtgatgcctccatatcgccaagtgatgagaatatttctgacttat
ctgacttagaagctagaacagattcaaaactactttgaacttcttcatccaacatatcaa
aatgctctgaagtatatcctggtatgtattctttgtatttcattatagcttctaatttta
ccatttcccaaaaatccactgttactgaactaggtttctctatagactcaaataggtctg
gttgtattcctggtaacatatcaacatctaaatatacaccaccaacttcttttaaggcag
atattcttaatatgtcagaagcagctgccaaattccatctttctaccaactcttgttcat
ataatttgaatgactctccacctttaaattcttcaaagtttctaacatcattcccactat
tttctgtaactttatttaatgactcttcaatataggaattaagttcatctatatcctttg
aatactcgtttgaaagatatatctttacaatatcatcaattataaggtcaggattttctt
ctctttgagttttatagtaatttatgaaatttttctgcttatcatagattatctccatac
gttttctgtaaaatttattatagtcaaatctagggtcatttaagttttctctaaatgatt
caagtgtatcatttgttgctgattctactatagtttttttcaatgtgtttatcaaaaatg
cattactatcataaaaaacattaacattataatcactatttacatctttccattgattta
tataattaatagcagtgtcatttatttgacctccaatccaaacaaaatgtaaatttttct
caactggagttaaattattattctttagctctaatacttctgtaactaggtattccttaa
atttttttaaggctttatttctaccagactttttatatgtatctatataaatatctgtta
aactatttatatcttttaattttaaatatttttcgactacagtattctctgacatattat
gatattcttctaaagcatccaatattgctacatattcatcttcctgaacacgaaatctta
catttgccattttttctaactgttttctattaactaaactcataaaattttctcctttac
tataatatttttattgaatatttttacatctaaatgctaaaactcttttatatatcctcc
tttctatttataaaatatactaatatctacttaggttttcatatacattcacttcctaac
attttaaattgaagacactcagttgattaatttgctcttcgattgaataaagacgttgtc
tgaaataaatatgtaaactttgttctatataaaatataaaaattaagatattcttagatt
aagttattgattttacaataaagttaattctaaaatttgatttctattgtaaatatttct
ttaaattcattaattacaagttaaaataattttcatagtctttttttatttttttaaatg
ctctatttttagccttattaacagcttgtctagatatttttaatttcactgatatttctc
tatcagaatatccttttaaatatttataaaaaataacttttctttgaataccagataatt
ctttcaaaatatattcgaaaaaacaaatatcttcctcaaaaacagacttactttgataat
tatttttcatatttaagatattttcatcaaattctacaaaattaaacttcattttagaat
atcttctagacaactcaaaagtcttattcagtaatgatttatgaatatatttgactataa
tagcatcgcttttttctgaaaagctacttaatttaatattttttattaattcaataaaaa
atattattaaatctgtttctccctcttcataatgtaaaactctactaagtttttttacta
atggcttaaacataaataaaatttcttgcaaatcatctactgagttatttcttgctaaaa
caattaattcataaaaagacttttgcataaaatcatcctctcttatatttataatgatga
tttatttaaaaattttgacaacattggaattaaatcagtcattataattatataatcggc
aaataaattaaattttatatgaaaatacgcattataaatacattaattttaataattaat
tagtaatttttttctaataaataaagtattttagcaataaactttatattaataaagtat
tgtaaaaacaaatcattttattaaagtaaaataaaaaaaatctatatgatatatttttat
acttatatttcttttttcttaattttcagtctttttcgaagttataactagattttaaaa
tagatcaatttttaagtaacaattacataattattaaataattatgtaaactttataatt
tagtcaataaataaaataaaatttattacatgcacatttttaacttaatcaatcattaaa
ttaaaatcttttcaaactaaatattttcaagactaaaatagtatcttttatgaaatctag
aaacctttttatattttagaacattctcctctcttaagataatttttttttttgtttatt
aatattttttattatttttttaacaaactatcagagtagaattatttaatattttgttat
ttttaatcaaatgaacgaatattatatatatcattcataaaaactttatataaagaatag
aaacaagttctagattactatagagatgacatatcaaaatatttttaaaaagtaatctaa
gtattagaagtgattgaagttagtaaatataaatgcgtttacttttaagtattgcttaag
ggaataaaaaataaaaataagctctgcaaccatctaaaaatagttgcagagcttacaaaa
ccaaaattatctaaattgtaataaaaataataacatt