Block details
fasta	C_difficile_CD00076_1A_020700.fasta
contig	u00000crpx_c_020700
start	542493
length	15825
strand	+
type	noncore
seq	ctcatcttcaggaggaagttcttctaatcaaacatcagtaaataatgaagcagcaaaaat aacaagcgtgcctacaccagcaaaagatgcaactagattaactatgccatcagtatcaag tggatatactatagcaataaaaacatcaagtaatgagagtgttataaaaaaagatggaac aataatacctccaaatacagcaacaacagtaaaattagtatttacggtaacacatacatc aagtggtaaaacagcagatacaaaagaattatctgtaacagtaccagctaaatcaacaga tgaagaattacaagcagcattagacaatgaagtggcaaaaataacaagcgttcctgcacc agcaaaagatgcaactaaattaactatgccatcagtatcaagtggatatactatagcaat aaaaacatcaagcaataagagtgttataaaggaagatggaacaataatacctccaaatac agaggaaacagtaacattggtatttacagtaacacaagaatcaagtggtaaaacagcaga tacaggagaaatagatgtagtagtaccagccaaatcaacagatggggaaatacaagcaga agtacaagctgaggcggataaaataacaagtgtaactcagccaacacaagatgcaacaac actaactatgccaacagtagcaagtggatacacaataaagataaaatcatcaacaaatga aagtgttatagcaaaagatggaacaatagtgccaccagatacagaaacaaaagtaacatt agtatttacagtgacacacacatcaagtggtaaaacagcagatacaggagaaatagaagt aacagtaccagccagaacagctatagatacagaacaattggcagtacaagctgaggcaga taaaataacaagtgtaactcagccaacacaagatgcaacaacactaactatgccaacagt agcaagtggatacacaataaagataaaatcatcaacaaatgaaagtgttatagtgaaaga tggaacaatagtgccaccagatacagaaacaaaagtaacattagtatttacagtgacaca cacatcaagtggtaaaacagcagatacaggagaaatagaagtaacagtaccagccagaac agctatagatacagaacaattggcagtacaagctgaggcagataaaataacaagtgtaac tcagccaacacaagatgcaacaacactaactatgccaacagtagcaagtggatacacaat aaagataaaatcatcaacaaatgaaagtgttatagcaaaagatggaacaatagtgccacc agatacagaaacaaaagtaacattagtatttacagtgacacacacatcaagtggtaaaac agcagatacaggagaaatagaagtaacagtaccagccagaacagctatagatacagaaca attggcagtacaagctgaggcagataaaataacaagtgtaactcagccaacacaagatgc aacaacactaactatgccaacagtagcaagtggatacacaataaagataaaatcatcaac aaatgaaagtgttatagcgaaagatggaacaatagtgccaccagatacagaaacaaaagt aacattagtatttacagtgacacacacatcaagtggtaaaacagcagatacaggagaaat agaagtaacagtaccagccagaacaacaacagtatcatctttattgggtagaatagcagt aaatatttttaattttaataaatagaattaatgtgtaaaagagattgtgggtaagtttgc ataaaagtgaacttacttacagtctttttggtatattagatgagtaagattagaatacta cttatataaaaaatacataaaacttcacataaattaggtttaaaaatatttatgtgtgtt ctttaaataaaaatttattgataaggctatagttttaaaaatcatagtcttattttgata tttttccatttttacaaaacctattacttatttaagaaaattttttgatttttttaaata tttctttattaacttagaatcaaatttcttttttgaaaataaatacttaaatcatctaaa acctgattctattttctaattttttgagtctatttttcctcgaagaatgctagttcactt aacattacatcttctgcaattgaagtatatatgttctttaaatcttttgaaaattctttt ctatttttatgtgataactataactaatttttagaataatacatactctattttaaagac cttaaattatatatttgtgtaaacatgtttttacttgttaaatgctattgtagattttta atttcagtaatattttttattagaaaatactaaacgatattttgtatacatgtcatcaca aattcagcatgattaatatatactaaaagatagatttatgttaaaattcaagtaaataga tcgaaaataaaaaataaaaggttagatgttagttttctatttattcttagattttatata gaaaaatcttgaataagagagaagtctaattaaaaatttttgatatcattaattatatat tactatcaatataatagttcttaaacatcaataattttaatgtttaaaatgatataaaaa attacctataaatagtatacaaaactacattaagtattaattgtttttaaaaatctaaga tatcttcttattttgttgttaacatactaaaaatagggggtgattttttaagtgaataat agtatttgatgaccatgttagttgtataactaaataattatttataaattgatattttat ttgttttcagatctaatgtctaaggaggggtgtttatgtatagaatagttatctgtgagg atgatattacacaaatagcttttttaagagagtgtatattaaagtccttagagggtattt ctagtcaaattgaactatttgagtttaattcaggagaagaattattggaaacaaatttag aaggtattgatatattttttttagatattaaaatgcttcaactaacaggcatggatgtgg ctaaaataattagagaaactaatgatacttctgaaataatatttataacttcaatagttg attacatacaggaaggctataaggtaagggcttatagatatttattaaagcctatagatt ttggagatttaaatgaaagtattttgagttgtatatcggatattataaaaaaaagagaaa attttatgctgatagaaaataaaggtataatcaataaaattttaattaatagtattatgt atatagaggttaggaaaaaggttttgactatacatactaaaaatgatacttattatacta aaaatagtatggataaaatagaattagagctagaaaaatataatttttttagatgtcata agagctatttaattaatttggagtatattcaatttatatgtaaaaagactgtggttatta atgatgaagatgtaccagttagtaaatatagaatggctgatttaaagaaaaaattaacat atgtattgggagatgtattatgttagatataaatgtattttggatttttttacctatatt ttctacggcgatagaatgaattgtattaaaatttttatcaaatgaattcagtgatttaag aaagaataaatttttaaaaatgttacaagagctatttaattaatttggagtatattcaat ttatatgtaaaaatactgtagttattaatggtaaagatataccagttagtaaatatagaa tggctaatttaaagaaaaaattaacatatgtattgggagatgtattatgttaaatataaa tgtattttggatttttttacctatattttctacggcgatagaatggattgtattaaaatt tttattaaatgaatttagtgagttaagaaagaatagattaaccctaaatagtagcatagt aattgctattatgataattactatgttgaatacaattgagtttaatataaatattaaatt atttatatgtatatttattacatatgtattgtataaaataaattatgtagtggataaatg gaaaagtgtatttataagtttgctatattggatgttattaattggatttgatagtattgg attaagtatagtaatgacacttaattctataaaaaatatgaatgatttattagaggataa tttgttgaagttagagttaataatgatatctaaatcattactaatagtattaataccatt gcttaagtttatcagattaaaaacaaaaataaacaagagggattgtatatatttatctat tccattaatagcaaacattattggtgtaatagtaatatttgaatttatttttaaagataa gattatcgattctaaagagagtttaataatacttacaatatcaactgtatttttactatc aaatctttcattagtaagcataataggaagaataataaaagataatagtttaaagataga atatgaaattacaaaaaaaagaatgaatatgcaatataaatattatttaaatttacagga atatcagttgaaaataagaaaactatatcatgatatgaataatcatatcatttgtattca gaatgtttatgggaaaaatgagtttgcagataagtatattaaagatataaataagcaaat aaaagaatgtaatactatatttaatactcagaatatgattctagatgttattttaagtga taaaaaatctatttgtgatatgaataatatatattttctagtagatattaattttttaga atgtaattttatagagatgccagatatatgtagtatattttcaaatataatagataatgc aatagaagcttgtattaagattaaggacacaagtatacaaaaaaagattaaattaagagg aactgttataaataggttatttgtaataaaatgtgaaaatacaaagataaatgaagttgt attaaaaaataataaggttattacaagtaagaaagattcctttttacatggaataggaat aagtagtgtaaaaagttcagtagaaaaatataatggaaatgtggaaatatactcagataa aaacaagtttacaattactatttatataccattaactaggaactaattctagttggggct ctaaattgcccagttggagcagtagtattgaaagataaaatagaagatgctatctttaag gcataggatatttggaggtgataaaaatggttgaatgctatgctaataagataacatcct ttttagtactcaataaaataatagaacaaaaaatgtgatttatatttgtttgaatttaaa atgttgataggttttatagttatattatttgcatgatatatcttaaataaatttagaaaa atagagttatttttatctgcaaatgcgaccttagtatggtaacattattgaccaaaagtt ctatatagtataaaaaaataaaatgtaaatttgataaactttataactaggaacataaaa acaacaattaaataactaattagatagtaaagttgatattagtaataaatattaaagaaa aatattttactaatttgaggaggacttagttgtgatagattctgaagaaatgatttttaa tgtagaagatttaattatttatagaaaaaatcaactagtaattatttataataagaaatt tagaaaatatattaaattgtctgaagaaatatataagtattttcttttaggacaagaaaa taaaataaaaatttatgattttgtaaattattttgatgatgaaagtgacaaaaaatatat tattaatcttatagatattatgaacaaaaatcaaatttttaaaagtaacaatttaaactt tgatatgttaagcaatggtgttgcaatttatttttgtttgacaaatagatgcaatttatt ttgtaaacattgttgtgttgaatcttcttctaataagaaagatttacttagtacatatga tttaaaaaatatcgtagatataatatcagttttaaatactcctcatataattataactgg tggagaaccattgataagagaagatttttttgaaataattaaatatataaaacaaaaatt acctgataccaaattaatattatccacaaatggaactttaatagatgaacataatgttga ttttattataactaattttgaaaaaatagatattagtattgatggagtagatgaaaatac ttgtagtgaaacacgaggaaaaggtgtatttaataaagtaataagctctgttaatctgct aaaagacaatggattcagtaatataaagctgtctatggtatttggacaaaaaaattctca tttaaataaacaatttaaagatttaaataaaaagcttggaacagaatttgttgaaagata ttttattccaacaggaagaggcctagaaaataaagaaagctatttaattgaagatacagt tcttccaattacaattccgtatattttagataatgaattaaaaatgtgtaaagataaaaa aaataaaaaaatgggatgttgtgcatgtaatgcaggaaactctcaaatatttataaatta tgatggagatgtatatccttgtccttcactgataaaggatgactataaaatgggaaatat atttgacaatgaatttgtaaaagttataaaagaaaataaaacaagagatctaaagtcttt gattaaattagaaagtatttatccatataactttgaaaaatgtaaagattgtgatgtaaa tattttttgttggcattgcccagcgatattagattcagttaaggataatgaattggaatt ggatagatggtgtagtatgatgaaacacaatttaaatacagctgtatggggagatgaaaa agttaattgaaatttactatatttgtaactgaagactgcaatttgagatgtacatattgt tatgaaggtaatgataaaaaaaaagaaaatatgagttatgaaactgctgataaaacaata gattttatttgtaataaagaattagaaagtaatagtgattatacaacaattgttttacat ggaggagaaccatttataaattttgatttgattaaatatatacatagggatttagtagat agattgagtgacaaaaagatattatttgatataactacaaatggaactattataaatgat gaaataatagagtttatagcaaagaatgtaaaaaacatatcgataagtattgatggaaaa aagaatatacatgatataaatagaatagatgctaacggagtaggtacttatgaaaaagta atggaaaatggaaaaagacttatagataaaggtatatatgttagggcaagaatgacatat aactcaaatactgttaagtatctttatgagagtgtatatgatatagcaaaacaagggttt aaaaatatcgcaccaatttcagattttatggataaaaattgggataattctcatattaaa atattaaatgaacaaattagtaaaattatgaatattaaaaaggattatcctgatatagat atatctattttagataaacaatttataaataagaaaaaaggagattgttttggagggata aatagttatgcaatagatactagaggagatgtatatccatgtacagtatgtgtaggagat aaagatattttactaggaaatatatatgatggattagatgataaaaaaattaagaacctt ataaaaatttatatatctaagaatgaagagtgtgatggatgtactagacttgattattgt atgtcaaccagatgtaaacttatcaataaaaaggtaacaggtaaattccaaagtgcagta ccaatttattgtggattagaaagagtttatgtggaaacaacaaaaaaactatgtagttta taatctagtttaactagttataataaatataaaacaaaagtaaagggggatatgtattat gatacatataaaaaaaatcgaagaaaaaatagaacttcaagatgttgaggtgcaagcaga tccatgtaaatggtattatgataagcatggaataatttcacaaatagactgtatggtgga ttgtgcaggatcaactccaaaaggaacagtagcttattaaaaaatactaatcagtctatt aaatatgttgaaagtactagatgtagttttttacaaatgaaatgtgattttctcaactct agtatttttaataattaaatttaactagcacaacgagttagttagtatttaatgaatagt gctctataacctactattttaggttatagagtttttcttgtaaatatgaataaggaggat tctgattatgataaatattaaacttgcggtgtcatatttaaagagacaaaaaggaaaaac tttatcattaatacttagtatagggattgctgttatgctagttttttcattaagtgttat taatgaatctcaaggacaatcagatataaatcatgcatacaaaaactcgggagattatca tgctttttatgaagatataaatagtgatatagtaaaagaacttaatggtgaagaagatat aaaagaattcaatgatgtacttaaatttggagaaattataagtaaagataatggagcatc tctaaatttatgctcttacaataaagattttttagattctactagatataagttagttaa aggtagagagcctagaacttctaatgaattagtaatagaacaaaaagttttagacaaaat ggaattagatgtcaaattaaatcaaactattgattttcagattgttaatgagcatataaa taaaaataatgaaaattctatttatagtaaagataagcaatttaaaatagttggtatttt aagtaaatctgatgaatactatgaaaatttaaataaatataaggtaagagcttttacata ttcaaacaatggcaaagatattgttccatatgaattaataactcatatgggtacattaaa attgaatacaaaagatttagattctcaaaaagtagtgaatctagggagaaaatataagtt aacaagtaatcaattttatccaaatacagaagtaagtatgtctatgtatatgaaaaatat ttcaaaaaaaacaacttattcaataaagcaaagcttactccctttattatgtgcaacatt agtaatatacaatatgtttaacataataatactagatatgaccaagcaaattggtttact tagagctgttggagctagcaagagaaatattagacaggtattttttattcagagtattgt agttttatctgtaggtatagtaattggtttacttggaggtatagttttttcttacttagg tctcatgatagtatatgataaaagtgcagaattaactataaatacaaactctataattga atctatcatcatgtcaattatagcagttatattagcctctgtagtaccaatatataaagc tggaaatttatctataattgatgctataaaaaagacagataagttaaattatattcctag gcttttgttgttaaaatcacataaaaaagttgttggaattataaatgagatagcttttaa aaatatatttaggaataaggttacatcaataataataataattacgatatcactatgtgg ggttttatttataggcagactaacttctacaaaattcatatatggaaaagagtcagattc agctaatataacaagtaaatcatatggcaattttgatatttatttgggatattcaccaat aaatgcaaattatacattttctaaatatgataattctttattaaatgaaataaaagctat tgaagatgtaacagatgttgaacccaatatttatttaaaaggatatctaagaaatgctga cttagaagaagattatttagatgagctaaaaagaactgaaataaataataataatgagtc tacagttttaattcgaggttacaataaagagctattaaataatatagataaatatataga taaaggcgaaaatgtttatagttatacagacagggattataaaaatgttttattggtaaa taatttttattctagaattaaattgtcaaataatactcagattataaaatcacctaaaat aggagacttaatagatataaaaattcctgtatataaagatggagagtataaatatataaa tacaaaagtaagaatcgctggaataatgaaaaatagctatatatcagagcaagatggaga atctcaatcaggtggaattcaaattatatttaatgaaaaggatttaaaagaattaacagg gataagtgattataataaagtttttgtgaagataaaaaaagaaacagataaaaaagtaat aaaagaaataaataatataatagaaaaaagtggattttcagatatagagggaagatatgt acgtaatcattttggagaccattataataaatcctcatataaattagcaatgatttgtgt atttggagttttattaatatcatctataaacattatttttatagttagatcaaatataat tgtgaggttgagtgagatatgtacatttagagcaatagggatgtccaaaaaaaatgtaaa aagaatgttaataaaagaaaatatgatatatggggtattaagtatgattgtagctggaat tatatctagtttcaattattataaaatagtttctgaaactaacaaacttaatcaacaggt atatggtataaataactctattaaatttgaaattccaatatatgaaattctaatatttgg atctatatctgtttttgtttgtgtcattgcagtttatttttctaataaaatgataaataa acttagtatagtaagtggtataaaagaaaattaatgaaatttctaatttaaatatatagg aaggaaataaaataaatgaatagctcaaacaaatattttttagattgtatatgtgaaaaa ataataaataataatcaagttattcttagtaataaagtaaatggaagatgggttaaaatt ccaatagaatgttatgaagttctaaagtattcagtagataatgcattacaacttggtaat ttgtatgatgtattccaagaaaatgaagataaaaaatattatgaacgagttatagataag ttagagcatataggacttctaagtgattctattctaagtgaatttagactagagagaata aacaaaatttcattttctccaactaatagatgtaatctaagttgtgattattgctgtgta gattctaaaatagataataacgattatttagatacatctcaagtaagaaaagtaatagat aatatagttaaattaaatccaaggatattaaccattacaggtggagagccattgatgaga aatgatttcttagagctgttggattatataaaagaaaaatttaaaggtaaaataattctg tctacaaatgcaactttaattaaagaaaaacagattgatgatataattaatggtttatat gcaatagaaattagtttagatggttatgatgaattaagttgtagtgaagtaagaggtaaa ggagtattctgtaaagtattaaatgtgattagacttataaaactaaaaaaattcgagaac gtaggtttgtctatggtggtaggaaagaataatgagaaagacatagagaaattcaataaa ttaaatgaagatttaggtacaacgcctataataagaaattttatgaatattggtagaggt aatgagaactatagcaaatatcttaatgataaacttgatattgattacatttgcaaagat gattatgtggatgaaagtagtttatgttcaaatatgtgtaaagcaggtgttaatcagata agtatagatcataaaggagatgtatatccgtgtccaaacttagagtataaggatttaaag atattcaatatattagaatttaatgaaaacatattagagaggattcttaatagagaaatg gatatatttaatatatttgataaattaaaaccagtaaatattgagagttgtaaagaatgt aaagtaaatttattttgtacaacttgtccatcgaaaatatatactttaaaaaataacaaa aaaatgtttgatgcaaattgtaaaaaaatgaaaaacatcttggaacctatattatggtaa ggattagttttatattcaaggtaatttattttagaggtgattattaattgactaaagtaa gaatagcagtcttagacacaggattagatgtaaatgatgatgatattaatggaaattatg tttatgattcaaattttcaattgaaagatttgggggggaaggaaataaatgacataaatg gacatggaacttttgtatcgaaaaccatattaaatataagtaaaaatacccaaatttatc ctattaatatatttaatgattctggaaaaacaagttctttaaatcttcttagtacactga gcaagttgactatgtcggatatacagataataaacatttcagctgcatctattaatagta tgtatgaaaaagaattagaaaaggtttgtaatattttaaatagtcaaggtagatttatta tttgttcaaaacataataaatatgaagataaagaaagtattcctactatatttgaaagtg ttattggtgtagtaggtaatgaaaatatatataaaaataatcaatatatatacgaaccag aaaataagattcaaatgtatgcaaattcaaaagataattttattaaatttaaagataaag taactcattttggtaaaaatagtaaggcttgtgcagtggcaactggcattgttgcaaata tattaaaaaacaatccatatattaagtttaatgaattggaagaaatacttattcaaaaaa gcaaaagtaaagaagatttaaaaatagaaaacttgaacactccaagttataaatctaatt tgataagattggatatagcaaggaaaataataaatgtgataaatagaaacttttctaaaa taaaaatagactttgaatttgtaagtgaatattctttatttaacaattttacatgtattg gaaattataatgcatataattttttaactattttaaataaagagtttaatattagtattg actacaaagaagtatacttatatcaattagagaatttagatatggcagtagatcttattt acgaaaatttaatttaaaaatatatgttttttaaatgggaatggagatacgttatgaaaa tacttaaggtaaaagatttaaaaaaaatatatggaaaatatgagaatgaagttagagctc ttgatggtattgatttagatatagagccacataaatttacagctattgtaggtgcaagtg gttctggtaaaagtacactacttcactgtgttgcaggcttagacaagccaactttaggga atgtgtacttagatgatgtagatttatatacattaaatgatgataagctgtctgaaataa gaagacaggaatttggcttcatatttcaaagttacaatttaataccagttataaatgtat atgataatatagtacttcctgtgttgcttgatgggaaaaaagaagataaagaatatgtta tgagattaattaataagttggggattgaaaaacaaataaagaaatatccgaatgaactat caggaggtcaacaacaaagagttgcaatagctagagctttagccaatagaccgtcagtaa tatttgcagatgaacctactggcaacttagatagtaagactacaaatgaagttatgaata tgcttgaatggtgtgttaaagagtacaaacaaacactagttatgataactcataatgata atattgcaaagacagctgatagaattataactataaaagatggaaaaatagatgaaaaaa actattaataataatttatttagaatactaaatataatagtatataagaataagactaag ttgatagtatcatttataatggtttttataattgctggcgtaaatattgtaatacctcaa ctaattagatgtataatagatgatggaataggaaataaaaatatttttctgcttataaat ttaatattgatatatatttttataaggatattatcagctacatttgatgttatattatca tatttatatacttcaataaaaaataaagttactataaatctaaaagtaaagttgcttaac catatatcaaaactttctggtagatattattcaagtaagaaaacaggtaatattttatcc attatggaaagtgatatatttatgatagaaaactttggagcagagattatatttgatatt attgtaaatgtgtttacagctataatatcgttaattttcttaattaatttgcagtttgat ttatttttagtagttttatttttacagttgatattaacattttctcaaaataaaatgaca aaacttatatctaagaaaatttctgaaataagaagtgattcaggcagtttatcaaatttg attcaagagtacgtatctaatattatggatattgttatattaaattcaaaaaagaatttc tttaataagtatttaaagagagagagagatttgataaaaaaagatttgaatttgaacatc attatgagtagtaatatagcaatatctcaaatactaacaggattgataacaatattaata tatggaattgggggatataaaataataaataataagatgacgatgggggagttaatagca tttcaacaatatacaggaatgttaattggaccatgtatagctatagtaagggcgaatact agaatagcacaatcaaaagtgtctatcaatagagtattttcagtaatagatgaaaagata gatattaaagttgataataatggatatagaatagataacagtgaaattaagaaaatagat tttaaaaatgtatcttttagatatggtgaggatttaaaccttgttttaaatgatataaat ttacaatttgagaaaggggaagtaacaggaattgttggtggaagtggatgtggcaaatca acaataacaaatctaatataccgactttgggatataaatgaaggtgatatattaatagat ggtgttaatataaaggatattaatttaaaatcactaagaaataatattgatatagtaact caagatcaatttgtatttgatgacacaataaaaaataatatagtattaaataataaaata agtgataaagaattagatgagatattagaagttacttgtttagatgattttataaaaaat ctagataagggattggacgaagtagtaggagaaaaaggtgtcaaaatatcaggaggtcaa aaacaacgtatatcaatagctagagctttagtaagtaataaaaaggtacttattctggac gaagcaacttcagctctagataatatttcacaaaaagagatattgaacaacttgaaagag tacatacaagataagatagttattataatagctcatagactttcaacaattaagagtgct gataatatatatgtattagataaaggtagagtaatagaatctggaaatgatgctgaactt ctacataaagatggtttatataataagttagttgaaactgcagattttgcataagcatga ctttgtatgtacatatatgattattagggtatttaatggaatctataagttatataacta atttagttatataaaagtttgcaaatcaatctcagataatgttaaacaaatgattagtat atccagtagaaaaattataatagtagtagaatatattacaaataaa