Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00002_4A_024063.fasta |
contig | u00000crpx_c_024063 |
start | 477575 |
length | 11760 |
strand | + |
type | noncore |
seq | gcgaccaactaagagtggctgggaacttaatataaagttccagaaaagtaaatcttcaaa ataatttgttgaaggaaacatcactcaaagttaagtaaaatatgtttccttgcttttatt atatcacaaattaaaaatattaacacaaaattttgtgaatatatacttattattgttcta aaaaaaatatgtaaataattgatttgatttcatagaattattgttgtaatgtttagttaa atatacacaatctcaattaaagaagataagtactataaattcatatcaaaaaaatacata aacttttaagttataaatttataaaaagtcttttagtatcattatttcaagaggaattaa catatgaaaaaataacttcattagaaaagtggataaaaaaactggtaagaagatgactaa agattacatatactattacttaaattaaaaatttaatataaacaacacaagatatatcaa ttattctaaagttaagttaagtagtcttactgaatcatctttgggaataattgtttcaat gtctaatagaaataccacttgtttataacatctttagctactataatcgaaatatgtttt tagtttttcacagaacaattatcacatagactagaggtttttaggaatcacttatctttt ttatacaaaaaggagataattcaaatttttattttgatatatccccattttgtgatttat aataatttttgtccttattttaaataaaacatagatttaagttctatagatacagggcta ttatcctcattagtttccattatatcagacatataattccactattttttgcagattgct gtctctgaacttttatcccatagtttggcatctttaagttctatatatccatataaataa ttagtttcttcatctagaaaaatagaatagttactaccaccatattcatgaatcatatct atcatctcagaccataattcatcatgacgtttcttgtattcattttcaaatcctttaaaa agcttcatcttgaaacatttgcgtactgtattcataaaaaaatacctcctaaattttaag tatttacctataaatgtattttaaaacaaaaaaaggtatttttaaatgtcataatttaac attattactgtcaaaaactaatatgatacaattagataaagaatatttgtaatataattt aaaactgtaataaagtatagctaaatctggggggatataaatgaaagatgaaacgctaga ggatatacttaaacaaaaaacacaagcagaaaggtacatcttagaatacatagttactaa gaatgtaaaaaaactagataataaaaaaatagtgtctatattgcatactattttatgttg ggaagaaataaatggaactatagtactaacagataaaaatatactttctttagatgaaga cattatgatatctaaacaccgtagatttatagatatacccaaacataaacataactttat agagtttcatctaatgagttaatatataattttttattaggaactatacacaaaggaaaa agatgtgataattattatatatttaatgctaaaaataattttaaattgaaacaactagta gttgaactaactaaggaggtagctcatgagacaatatattcatgataagttgagggaaat aacagaagaagaaaaaaatatattagaaggaaattatataatagataaaagtatttatac tgataattctcaatttataatagatagcaacaaattattgaatatagatgagttgataca tataagaaaacatacaagatttgcacaatttccaaaacataagcataattatatagaatt taattatgtttatagaggaaagttagtacaaactatagatgaatataaaattaatttaaa acaaggagaattaatatttttaaatcagcatgttattcatgaaatagaagctagtgacga agaagatataataattaattttataataaaaccagagttttttgattatattatatcttt gttggaaaatgataataaaataatgaactttttaatgactacattatatactaattataa tcttggagaatatatatattttaaagtatctgagaaagaagagattcaagatataataga aaaaattataatagaattgtatgaaccaagtgtggttaataaggtaaagattaaattatt agtaggattattattagtagaattagttaaaaattctgaagatgtagaaaatcatgcagt agataattatgaaaagatgatgattatagaaatactaaaatatattgataaggactacaa gaaaggtagtttatctgaaattgcaagtaatttgaatcaaggtgattataaaataagtaa actagtaaaaaaacatcttggatatacttttaaagatttagtgcaagaaaaaaggttaag taaagcatgtgaattattagtatctactaatttatcaatagctgaaattatagaaaatgt aggttatgaaaatttaacttatttttataaaatatttaaaaataagtatggtattacacc aaaagaatacaaaaaaaatataaaaaatagtcaatagtaaaattagaatctataaaatag attcttttttattattaaataaaccattttaatagctctgaagatattatattttgaaaa ttattattgagaataaagttatattgcaaattaggttaataaatatgacaaatttagata ttaaatgaatatactaacatcttgtataattcaattaataaataaatctaaggaggaaaa gtcttgagatactatttagcaattgatataggggcatctagtggaagacatattatctct tatataaataatggaaaattggaaatagaagaagtatatagatttaagaataatttgatt aaaaaagatggtcatttttgttgggatatatcaaagctattttctgaaataaaaaatggg ataaaaaaatgtataaaaataaataaaattccagtaagtgtggctatagacacatgggct gtagattttgtgttacttgatgaaaaagacaatatattaggtaactgtgtatcatacaga gataatagaactgatggaattatggaagaagcctttaaaataattgataaaaaggaacta tatttaaaaacgggaatacaatttcaaaagtttaatactatatatcaattattatcaata aaaaatcaacagccagatttattagaaaaggcaaaaagctttctaatgattcctgattat tttaactttttattaactgggaaaaaagttacagaatatacaaatgcaacaactacacaa ttagtaaatacaacaacaaataattgggatgaagaaataataaataaacttggatttgac aagatgttatttgctaaaataaaaactcccaaaacaatactaggtagtttaaagaaagaa ttagtagaagagttaggatgtgatttagaagtcattttaccagttactcatgatacaggt tcagctttcatgtctactcctgtaaaaaatagaagcattttattgagttcaggaacatgg tctttattaggagtagagttagaaagaccaaagtgcaaattagaggctttagattataat tttactaatgaaggtggatatgaatatagatatagatttttaaaaaatataatgggttta tggatgatacaagaagctagaaagtgttatgacagtaagcactcttttacagaactagta gagcatgcaagactatcagaaggatttaaatcaatagtagatgtaaatgatgatagattt ttaaatcctgaaaatatggtacaagaaataataaaatactgtatagaaactaatcaaaca gaaccacaaacagttggagaagtagcatattgtatttttaacagtttagcaaaaagttat agtaaatctataaatgaaatagaagaaatcataggagaaaaattagaaactataagtgta tttggtggaggatgtcaaaatgaactgttaaatgaacttatagcaaaagaaagtggtaaa aaggtattagcaggacctgttgaagctacagcattaggtaatatagtatgtcaattaatt gctaagaatgagctaaatgatttagaacaggcgagagatataataagaaattcatttgat ataattcaatataattaatctgaaaaaggagataagtgatggaattaaagcaaaggtatg aagtagctaaaaaagaatatgaaaaatggggaataaatgtagaggaagtattaagagttt tatctaaagttaaaatatctattcattgttggcaaggtgatgatgtaacagggtttgaag gaaatcaacaaagactatcaggaggaattgcatctacaggaaattatcctggaaaggcta gaaatcctcaggagttaagacgagatttggataaggctttaagtttaataccagggaaac ataaagttaacttacatgctatatatgcagaaactggtggaagctttgtggatagagatg agctaaaaccagagtattttgaaaattgggtaaaatgggctaaagaaagaggattgggat tagattttaacccaacaatattctctcatccaaaatcaagtgatgggttaacattgtcac acccagataaaaaaatacgtgatttttggataaagcattgcatagcttctagaaaaatag gcgaatactttggaaaggagcttggtcagacttgtttaacaaacatatggataccagatg gatacaaagatataccaagtgatagattaggtcctagaagacgcttaaaggaatcactag aagaaatattaaaggtagagataaacagagaatataatttagattgtgtcgaatcaaaag tttttggattaggtgtagaatcttatacagttgggtcaaatgagttttacttaaattttg ctagtaaaaacaacataatttcattattagatacagggcactatcatcctacagaacttg tttcagataaattatcatcaatgctattattttcagataaagttgcacttcatgtaagtc gtccagtgcgttgggatagtgaccatgtagttatattagatgatgaactaaaagaaatag ccaaggaaatagtaagaaatgatgctttggataaagtaataataggactagacttctttg atgcaagtataaatcgtatagcagcatggataattggaactagaaatatgataaaagcat tgttatcagctatgttaatgcctcatgaagaattaagaaaattacaagacgaaggcgatt ttacaaaaagattggctataatggaagagttcaaaacatatccaatgggagacatatgga actattattgtaaaattaataatgttgctgttaaagaagattggatagaagtagtaaaag agtacgaattaacagaattattaaatagaaagtaggtaagggtatatgtctataatggaa atgaactttatcaaagattttatgaaaataacttatgatgcttggttaaagggatggcat gagcgtaatggggggaatataacatatagattaacacctgaagaaatatctggaataaaa gaatttataacagaagaaatagaatatattccaattggtgtaacagtcgaaaatttagct aatgaatatttcttagttacaggaagtggcaaattcatgagaaatatttctataaatact gttcaaaatgtaggaattgttaaaatagatgaaaaaggtgaaaattatgcaatagtttgg ggattagataaggctaaaccaacaagtgaatttccatctcacttaatgagtcattctata aaaaaagacaaaacaaatggattacatagagtaataatgcattcacatacaactaatctc atagcattaacttttatactgcctcttgagggtaaagtatttacaagagaattatgggag atggctacagaatgtccagttgtatttccagaaggaattggaatcgtaccttggatggtg ccaggtggtatagagatagcaaaagctacacaaaatctaatggaaaaacataacatagta atctgggctcatcatggaacgttctgctcaggagaaactttggacttaacatttggtctt atggatacagtagaaaaatcggctgagatattagtaaaagtaatatctatgggagggaaa aaacaaacaataacaggagataactttagagacttatcaaaaaattttaaggtttcaata tcagaggattatttgtactagataagataaaagataaacaaagctatgataacttattat gtgcaattaataaaacactatgagagaggaggtgattaaaagatatagaaagtaaattca cttaagaaaatagtttaagaataaactggagtttataataaaatattcaacaatatattt atatatataaatatattgttgaatataaatataagatagtaaattttattgttagataag ggaaaacgttattaaaaattgaattaatgagtaaataaaagtgggaggaaataataaatg aagagagaagttacaattcaaaagcaggctatatctatagttttgtttatggcagtttta ttttgtgggctattacttccaatgattaacaataagccggaatatagtttgccaatagag tcaataatgtttatttcagcatcaataatatcgctatttatagtggttacaacaaataaa acgtgggaagaagtatttgaaagtggattagatggtgtaaaaggagctttaccaggatta ataatattattagtaataggtccacttattgcaggatttattatgagtggattaatgcct atgttagtatattatggagttaaattgataaatccaagatttgtatatgctacagcatta atattgtcagcattgttttcttcatttacaggaacttcctggggatcagcagcaactata ggagttgtaatgatgggggtaggtaatgcaataggagcaaacaatgctattatagcaggt gctatagtaggtggagcttactttggtgataaaatgtcacccctatcagatacaacaaat atagctgcaatagcgtcaaaagttaatttatatgaccatgttgcatctatgttatggaca acaggtccagcaactataatagctttagttatatatattgcttgtgggtttatattccca gcaacaaatacaaatttaaatagtccagaaataactagattattggcagatttatcagga atgttcaatttcaatataattttatttatacctcttttaatagtattagtaggttcagca atgaaaaaacctgcaataccagtaatgacaatagcagcatttttatcacttgcatttgca gtaatctttcaaggtttttctttggcagatattcttataggacttaacagtggattctca ctagatatggtaacttggcatgaatatgcaaaacctatagaaggacaagcttatatatta ggttttttccaaaaaggtggcttctgggaattaggtaaattattgccaatatcaacatct atattatttgttgttggagtacttggaagtattgatgctatgccagcaacggtaaatgtg atatttgggtgggttaagtctagaacggctataatatgttcttcattattaacaggaata gcaatgatagcaatgactgcaaatggtatagcatgtagttttgtaacagcaggtatattt ggagataaatatgatgagaataatatagatcgtagggtactatcaagaactacagaagat acaggtacattgttagaagttttatttccttggacaccagcagcaatatttttcactcag acactaggagttaatgttggagaatacgcactttggtctatagtgaactggggaactcca attatagcagtaatcttagcagttacagggataggtacatataaaaattcaaaggataaa aaacaatctaataaagtatcataatgaatattttaactttattacctaacatagcttata aaaaataagctatgttaaatgtatttttcatatataaaaatatttcataaggagatttag aacatggataaaaataaatataagatagagacattaatgaatcatgtaggagaaaatttg gatggcgattatggagctgtaaacccacctatatatcaatcatcaatattcgcaagaagt acatatgaagatatagaagcatattttgaaggttcaaaagatggatatctttattcaaga actaaaaatcctactaatgatattttagaagcaaagttatctgcattagctaatgctgaa gcaagtataacctttggttcaggaatgggtgctatatcaagtgctatacttcattttgta aaaaatggtgaccatataatagcttcaaataatttatacaatcctacaatgaactttata acgaaggaattgaaggagaaaggaaatatagaaaatacaatagttgaaggtgatagaata gaagattttgaaaatgctataaaacaaaatacaactttaatatacctagagtgtccatca acagcagtatttaaaatgcaagatataaaggcaattgtagcactagcaaaaacacacaat ataaaaacagtaatagataatacttgggctacaccattatatcaaagatgtattgagatg ggaattgatttagaagttcattctttatctaaatatttaaatggacattcagatgtggta ggtggatgtattattggaagtaaaaaagatatagaagaaataagagggagtgaattagct ttatatggtgcaaaattagcaccatttgaagcatttttagttataagaggtttgagaact ttacacgctagattatcagtacataccaaaaatgctaaggaagtagttgaatttttagat aatcattcagcagttactaaggtatatcatccattatctaaatattttaatcaaaaagaa ctagcaaagaaacagttgcttaattatactgcgttattaagttttgaaatagacgcaaag gatgtaaatgatgttaaaaaatttgtaaataaattagatttatttaaaataggagtgagt tggggaggccatgaaagtttagtatttgctccaaatatagctatattaaatgaaatgact ttagaacaagccaaagcattaaatgtgtcaccatacacaattagaataagtttaggtctt gaaaatagtgaagatttaatcaatgatttaaatgatgcgctatccattttataatataat aagcatatatggaaaaaacatattaactaaatagtttataatgtacttagcaaagaaaaa ttattatcaaagtaccatacataaacatatctatgtagtgtatttataaagtataggagt caagttttagactgtaggatagatgtaggctataaaatgaatattagatataaaggggga agatgtatgaaaagagcatattattcaagtagtataaatgaatttatagtcaaagatatt tttactatatttggtgagataacgtgtaatgatcaatttgcggctgatgacttacaaaag aatacatggaaaaaggaaattggaatattaaaaagagagctctcaactttcaaagatgga cacttattatttgagtatacaataccacgaataggcagtagaattgacaatgtgttaatt tacaagggcattgtttttctccttgaatttaaagttgatgaagacacttatcctaggcat gcaattgaacaagttacagactatgcccttgaccttaattgttttcacaaagaaagtcat gataaacttttagtaccaatacttatttgtacaaaagcccctcaaaaagaccaaagaata agaatgatgaaggaaaatattttagaaacttattgttgtaatgagtttaatataggaaaa tacataaagaagatttgtactacatataatagaagttcatttaattcagacacttggata aactcgttatacatgccaactccaacaattattgaagctgcacaagctttatatatgggc cataatgttgaagatatttcaagaaatgatgcaagtgctaaaaatttaaatcaaacaact aaagctataaataaaattatagactatagtaagactcataacagaaaatcaatatgtttt atcacaggagttccaggagcaggtaaaacacttgctggccttaatattgccattgagcga caaaaagtagatgaaaatgaacatgcagtcttcctttctggaaatggtccattagttgat gttttacaagaagcactagctcgtgatgatgtaaccagaaatggaatacgaaaatctgaa gcgattcgaaaagcgaaagaatttattcagataattcatcattttagagatgaagctata tctgttgatacaccacctattgaaagagtcacaatttttgatgaagcacaacgtgcgtgg gatgaacctaatttgactaactttatgaaaagaaaaaaaggcgtattagactttaatatg tcagagcctgaatttcttattagtattttaaatcgtcatataggatgggcgactattgtt tgtttgattggtggaggtcaagagataaataaaggtgagtcagatggaatatcaggttgg tttgaatcactaagaaataattattctgattgggatgtttacatatcaaataaaattatt gatgaagaatattctaaaggtaattcttttgatgagttaacagaaggtgttaattataga ataattgatgatttgcacttatctgtatcgttacgttcttttagaagtgaaaatgtatca acctttgttaaagctgttttggatgtagataaagttgctgcaaaggacttatataatcaa tttaaaaaagattaccctatatgtgttactagggatttggaattagctaaaaagtgggtg agagataaatcaaaaggttcacagcgttatggaatgactgcaagttctggagctaaacgg cttcgaaagtatggagtgtgggtacaaaataaaattgatgctacaaactggtttcttaat ggtaaggatgatgtacgagcttcatattttttagaagaaactgcaacagagtttgatatc caaggtttagagctagactggacaattgtctgttgggatgggaacttaagatttaagaat aaccattttgaatactataacttcaatggaactaaatggcagaacatcaataaagaagat aatatactatacttaaaaaatgcatatagagttcttcttacaagggcaaggcaaggcttt attatatttgtcccaataggtgatgagagtgatattacaatgcagccaaatttttataat ggtgtgtatgaatacttaaaagaaattggaatagaggaactttaggtttaaagtaaggat gctattaagtggattatttgtaaaaaattattttcctttataatatatgagaaagtaaaa ctttttaactaaagaatacattcaagagataataagaaaaaggagagtaccaatttgagt ttataaataatcttaataattttcatccaacctaaaatttaaatgtggtttttactataa acaggacattggattatattgtaagttatatattagagtaattctaatttagagtttaaa a |