Block details
fasta C_difficile_CD00121_1A_020916.fasta
contig u00000crpx_c_020916
start 3591780
length 13707
strand +
type core
seq tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat
gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt
agccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat
gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc
gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac
acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt
tatagtccagtagacttttctcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata
tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt
attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg
tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc
taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga
atacccctttatagtagttgctccaataagctttcttatttcatgcttatgaagtaatag
ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg
aacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac
tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt
ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc
catataaatctcaccttctttgctagaaatttgttccataaatgttagaaatttactaaa
tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt
caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgta
tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagtaa
tactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctatcttctatc
ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct
atcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatct
tctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctaaataatt
ttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaaaatgtctattg
aaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaacttcttaa
aaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaatatagagt
tatatcttataatattttagagataaattttatcatagtggggagaaatttgtatggatt
taagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcgaatttgagatat
tagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatgggattatattttg
ctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataattcatcaataa
aaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctgaaactaagattg
gtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatgaatcaatga
tgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttttagacattatt
tatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattattctattgttgct
ctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgctttacttggtg
gtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttctggaatgtgttg
tacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggtgaagaattaaaggtagatg
gtaactttgcaatagcaagaacatctggtgttaatttttctgttacaaaatcagataaat
ctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactggtagtggta
cagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagcaatgccta
ctaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataaatatttat
taaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattattataaaatcaga
gtgtggaaatatttatgtgtattctttaaataaaaatttccacattctgtaaagttatta
tacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttataaacatattaaggt
aatgatttctcttggtagttattctcatatcttattctttgattatatttatcttattcc
tagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataattagcattaacttatct
aaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaatttcataaaacaatca
aggtagtcaagagattcaactttatttgattttaaaaatttaagtgaatttgttcttata
cacacctttttaaaattatatctgtagaaaatatcatttagagctataattaaattaact
tattaaattttagaaaatttattaaaaaatataagttaaattaatatttttaaagattct
tttttgtaactactagaacactaatttagtagttattgtatctctaaagtttaagcatgg
atagatatacatttgataatttgcctataatttacctactacttggattattggagcaaa
tacaatatattaataataagttcctaaaaccaataaattaactaatacacataaagatat
tgatgttgattatacaactataagaaacggatttaacagaatttaatcaagctaagaaat
tatatatatcgtgatgtttttgaattagaaggtgattcaaaattagtttatagtcttctg
tgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattgttagtaaaatttttaaagattttatg
gataaatataaatagttttacttattttctaaaactttaaaataccattaattaccttaa
atattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaatttactgaagaacatgcta
ttgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaatatacaatctacctccatggg
aggaaattaaaaagaagaatttttcactagcaaaagaagataaaagaaaaaattttataa
gttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaacttattagatgaaggaagct
ctgtattctttggtattggttgaaaccgaattattgtggaatgggaattggtaaagaaat
aattagcctaggattacaagaatgtagaaataaatatagtactaaaccaattgtattaaa
tgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttatgagtctcaaggatttaaaatagt
tgagactaaggtacaaaaaacgcatttaggagatggagaattttttgttatgaggtatca
atagtttataacaatagtcctattgttaatacaacaattaaaatgaaaaaatacatatgt
gtaggtcatagcaataagtgtctttgaaatataaatttgagagcttttgataaaattcgg
tatacatatatattttatactacggatatataaatctatctacatacataaagagattgt
aagtaggtttgtgtatataaaaatagatttatatttcataaatgtactttttatttgcat
tacctttattttatctaagctctcattttattatctaatcttcctttttactggttttat
taagagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatcagccaatatttctcatcaaa
actaccttgactcatagacattataaaaaattttccaacatacttgcctttagtcatcat
atttaaaattaaatatcctatagatatcatataacctatgattgtattattaaataaatt
tgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgatgcgaaacttccaataatata
ctcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaacatttacaaaacctatgattaa
taccactatacctataattgacatcagtatcctaattaattgtacaataacttgagataa
tgcttttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgctctagcgaaaatacaggtac
caacattactatccctattattgcaacataattttctaaacatatagctgttgaaattct
gtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacatagcaatataattgaacatat
taaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttattagaactaaacagttttgaaa
actttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctcatataagaatatagctaaca
aaacaagcaccaatgctcccaaacttatcacaattctattaatcataatttgattgaagt
tttgtataataatatccccatttaatacactattatgtcttatcattagccccattgttg
aataatcacctttgagtcctgtagaatttatactgtaaagccaccaaattaattgcacaa
taattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcattcctacagctgtaactatca
taagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaatgctaagttatcaatagata
tacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatctttcatacctaaaattaata
caggcaatatcatcataaagacaagtgcaaaatatcttgataaaactattttgcatgaag
atacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacgcttatctttaagtgacataa
aaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacctatataatcgcaaaaaattc
ttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtatagttgtaattcttcatagctt
catcataggtaactggaactactccaaatctttgtaacttgtcaaaagcatatgcagacc
ctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattatttcttcaaatctttcaagagatactt
tagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaagtgaatttatttcgctaatac
ttttaccagttatttcttctatatatttttctatggtcttcgttttattttggtctaatt
ttatatacttaactacccctgttggatacgttgtatatgtgtttttttgatattctctaa
ttaggtttatagttgcatttggaatgactttttctgttttcatagattctttttgaccat
atggatattgattgtgtacagagtaatattcctcaatattctctactttttgtggagcaa
ctaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatcatttgaaactgaacttccaa
gttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaatataatatatcatactcttta
atatatttttacattcttttataaatagattcatatattatctcctcccattataagcat
atagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtctcaaaaggtttatcatctga
tataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacattcctataactataaatctact
ttttatattttcaatatcttttttatctacttcaatactatatactttcccttcagctag
ttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgacttttccactattcaatatagctac
gttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgtagataaaataacgattctatc
atttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgttcttctgggtcaagacctgc
tgtcggctcatctactattaaaactctgggattatgaattaatgcttgtgctatcccaag
ccttctattcatacctccagataaagattttactttcacattttgataattagtaaggtt
tactttgcttaataactttgctataatttttcttctttttcttagtggtatatccgataa
aactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgttaggatacattgaaaagtcttg
tggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattctcaataggaactccacacat
atgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaaattctcataaatgtggtttt
tcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactgtcgatttcaagatttatatt
atcaagagcttgttttttcccaaatcttttactaagattggatactgctattttcatttc
catatataaatacacccccagaaacaattttatagaattttatttttataaatttttact
gtattttcataataaattctaaaacttaagatattatttataaatttctaaattttttct
aaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtatctttgtttctgaaatttttt
aagtttatgaagttataatttaatatatatttattttatttgtgagtctatttttatata
taatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattactggatataataggatagggtattta
gccttttaagataaataaaaatatctgcaactatatattgcaaaaatttaaaactaattt
atatatgctaatataaatatttataaagacataagacaaatttacctacagatttaaatt
taacttatatattttaaaaggctaatataatatgtattttcttctatacaatcaaaaggc
ttcatatctaagatatgtgatgacactaatattcacaatttttagtaattatcacattat
aaaaaatattacagctagtccatcattagatgcttcttgtataaactttttaagctcaat
tagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcactctcatcattcataacaggata
aatattattttctaacatctcattaatattaaatctttttctaaatgcttgttcttccaa
actgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgctgtaatcaacatgacaggaaa
ttctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtactaatttgctaaatatattatc
atcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtgaatggcatgccatgctttatc
aatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaacaaaatcttgtaaattttcttc
tgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttattttagtataacatcctatcattcc
cataattacattcctcctaagtagcgtttttttaattgtaacttataattaaacttagtt
acaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaaatttaaatacctatattatca
actaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattttttcctaaaaattaaatgaatcaga
ggttctataggcaatattgactataaataagaactattactttttaaaaaaaatttaaga
aattatactgtagaatcatgctctacttattagctttaaataaaaaataaatcatgttct
caaattaaataataaataacaataaatttaaattttaaactataagagtttctgaagtgt
taataagcataccaataattatatgtgtaagaatttgatttaatagatatgaataatttt
tacattaattataaatatattaacctattgttataaattctaaaaaagaaaagttatctt
aaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgatacacttatttttatattgaaatta
tattttttaatatctattcttaattaggtatttttaaattatctgtttacattaaatatt
tcttaattacttatctttcagctagctttttctattaaatgtttctcaattacttatttt
tcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagtcacttcta
ttaaacatttcttaattatttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaatt
acttatttttcaattagccacttctattaagcatttctcaattacttatttttcaattag
ccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaagcat
ttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattatttattt
ttcagttggctttttctattaaatgtttcttaattacttatctttcagttagctctttct
attaaacatttctcaattacttatttttcaattagctactttcattaaatatttcttaat
tatttatctttcagttaactatttccattagatatttctcaattacctatttttatcatt
tattttatagagtattgtgcactatatatttatacatatcataaatactacaacttgtta
tctcttattttagctgttttatctactcctctattttttcaactatctcaaagtcaattt
ctttaaaatctacattaacactttcaacctttatcttaacaaggtcacctatcttatatg
acttcttagttctttctcctaaaacactataagaactctcatcataaatatagtaatcat
cattcatatttgcaagtcttatcaacccttctatggtattatctaactcaacaaatattc
caaatgaagttacgctagatacaacaccctcaaattcttgaccaactttatccttcatat
aaagagccttatagaaatcatgtacatctctttcagctaactctgcctttctttctttct
cggatgattgaacagatgcataatccactatagtagtaagctgttcttgtctttttccac
ttattttattatttaaagattcttttattattctatgaatttgaaggtcaggatatcttc
ttattggtgaagtaaagtgacagtagaatttagctgctaatccaaaatgtccactacatt
ctggtgagtacttagcttgttttaaagaacgaagcattatagtactgatagctccttctt
cttttttgccctttattttctctattataccttgtaatgcttttggatgtacttcctctt
tatcaccttttattatatatccaaatgtagatataaacttactcaattcttccatttttt
ccaaagatggtgtctcatgtattctatacacaaacggtattcccatccagtaaaaatgtt
cggcaattgtctcattacttataagcataaattcttctattatcttattagatattcttc
tttcatatggctttatatctacaacttcgccttttccatttagaattatctttgcctctg
ggaaattgaagtctatagctcctcttttttcccttcttgacataagaatcctagctaaaa
tttcagcatttttaaaatcttcaacaacatgttcaaaagtctttttaagtttttcatcat
ccttttctaatatatcagatacttctgtataagtcattctagcttttgaatttattacag
attcacatatttcatgtttaaccacatttcctttatggtctatttccataaatatagaaa
gagttagcttatcttcaaatggatttaagctacatactccatttgaaagagtttttggca
acattggaattactttatctactaaataaactgatgtagctctttttaaggcttccttgt
caagtttatttttctctcttacataatgtgtaacatcagctatgtgaactcctagtttga
agtttccattaggtaatacttctattgatatggcatcatctaagtcttttgcgtcatctc
catctatagtaaatatgtttaaatctcttaaatctcttcttctttttatctcttcttgag
gaatctcaacagctacagcttctgcttcttgcaatactttctttggaaattcttctggaa
gaccatgttctcttattatagaatctatttctacgcctctttcacctttttgacctagta
tctctataattttgccttctggttttctatcctcttgtggccatactgtaatttcacata
ctaccttatcattatctactgctccactaaaatgttttttaggtatatatatatctttag
taaatttcttgttgtctggtgttacaaatccaaaagttttacttgattggaaggtaccta
ctattctagttatttctctctttattacttttactattcttccttctgctctcttttctt
cagttgcaggtactactatttctgccataactctatcattatgcatagcaccatttatat
tgtcacttgagataaataaatcctgtgtatattcaacatcagattctacaaatccaaaac
cctttttgtgtgatacaaattttccaacaaagtatcccatttgattgggagatactattt
ttccttttttagtaaagcagatataaccatcttcttctaattcatttaaaaaattataaa
acattggcatttctgatgaatgtatatcaaatatttctgctaattcttctttttttagag
gattatatgcactttcatttattaatcctagcaaactttctttaagtcctggtatcattt
ttccctcctgttttacttttcattatattattatttatattgtcttttatatttcttcag
acaaaacattttttacttatcacataattttctatattttcttattattataagttaaaa
ttacttatttatatttttgatttaatgtaatctttgtcatactaacttcaaacaaattat
gatgttttataaattatttgtaaatatcattataattacttaagttattctttatcataa
ttgcttaaattactctttatcacctaattatacaccatcaaataggattggtaaaatatt
catctcatataagtattactatataataatttattctattagtatactcaaatcatgtaa
aatttatataactcaattaattttttaaatacaactttataatataaaacttataataaa
agtaaatttatatgttaaatgaggttgattttttattattttttatttatgctagtacta
aagacttgcaaacgttttttgacaagtctttattttgtctaaattaaacaaactttttta
caaataaatacataaaatttaaactaatctatttattggaggagataaaattggaagaag
taattgcaaaaattattactatagaaaatggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaa
aaattgtaaaaaataatgactcaaaaaagtgttattatctatcaatctacttatataggt
cagaatattatcaagtaagagaattggctgtgtttatacttggttttatatcagtaacta
tttctgaagctttgttatttttaaaagataatgtgagtaaagatgaaaactggagagtac
aagaaatactagctaaatcatttgattattattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcac
ttcctgttataaaagaatggcttaattctgatagtccaaacataaaaagggctgtgacag
aaggtcttcgaatttggactaatagagactattttaaatctaatcctgacgttgctatat
cactactttctagtttaaaagaagatgatagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatg
ctcttagagatataagtaaaaaatatccagatttagtaaaaaaagaattagattcatggg
atatatcaaataaaaaagttgagtttgtatataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaa
agtaaaatggaggtgaacttatttgaaacttcgtgatgagtatacttgcccattagaact
aacacatgatatgataaaaggcaaatggaaatctattatattatggagattacgcatagg
accaacttccttatcaaaacttgaaaaggaaatcaatggtattaatcaaaagatgttact
tgaacaacttaaagaattaattgaatttggtcttgtagataaaaagacatatgaaggtta
cccacttaaagtcgaatactcacttacacctattcgagggaaacaaatattggatgcttt
ggctataatgcaagatataggaattagctttatgttggataatggtatggaagatattct
taaggaaaaaggtgttttaaaataaatagatacccacaaaaaagtaagtaatttaccatt
attttcaactggtatataattaaattatagatatattctattaatttattataataggag
gtaaattattatgaaagtaactagtacaggtatagtaaatggtgttatagaagataaata
tggtaaaagaggaactcagttcaatgaaggtggtatgcctacatattcactacctctaaa
gtttgaagatgctccaaagaatacagtatcctttgctgtatttttagaagataaagactc
tgttcctgtatgtgggtttgcatggatacattggttagctgtaaatataacaaaagatga
gttaaatgaaaatgaaagtgtaacagctactgattttgtacaagggactactagttggca
tggtaaactaggaggtcttgacagattagaggccagtgtatatggtggaatggctcctcc
agacagacctcatgtctatgaaatacatgtatttgcacttgatactatccttgaccttga
aaaaggattctatatgaatgaatttttcaaagctattgaagggcatgttttagatacatt
tacactaaaaggaagttattctaattaattaggttgactatagctaatcattaattaaat
gatacatttaattgatgattagcttaattgttattagaatattttctgcactttatctta
atatatattttagttgactggtattttaatttctattagattattatcaatttatataaa
ttgattaaaaaatagctacgcacactcg