Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00121_1A_020916.fasta |
contig | u00000crpx_c_020916 |
start | 3591780 |
length | 13707 |
strand | + |
type | core |
seq | tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt agccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt tatagtccagtagacttttctcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga atacccctttatagtagttgctccaataagctttcttatttcatgcttatgaagtaatag ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg aacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc catataaatctcaccttctttgctagaaatttgttccataaatgttagaaatttactaaa tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgta tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagtaa tactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctatcttctatc ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct atcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatct tctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctaaataatt ttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaaaatgtctattg aaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaacttcttaa aaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaatatagagt tatatcttataatattttagagataaattttatcatagtggggagaaatttgtatggatt taagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcgaatttgagatat tagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatgggattatattttg ctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataattcatcaataa aaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctgaaactaagattg gtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatgaatcaatga tgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttttagacattatt tatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattattctattgttgct ctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgctttacttggtg gtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttctggaatgtgttg tacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggtgaagaattaaaggtagatg gtaactttgcaatagcaagaacatctggtgttaatttttctgttacaaaatcagataaat ctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactggtagtggta cagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagcaatgccta ctaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataaatatttat taaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattattataaaatcaga gtgtggaaatatttatgtgtattctttaaataaaaatttccacattctgtaaagttatta tacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttataaacatattaaggt aatgatttctcttggtagttattctcatatcttattctttgattatatttatcttattcc tagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataattagcattaacttatct aaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaatttcataaaacaatca aggtagtcaagagattcaactttatttgattttaaaaatttaagtgaatttgttcttata cacacctttttaaaattatatctgtagaaaatatcatttagagctataattaaattaact tattaaattttagaaaatttattaaaaaatataagttaaattaatatttttaaagattct tttttgtaactactagaacactaatttagtagttattgtatctctaaagtttaagcatgg atagatatacatttgataatttgcctataatttacctactacttggattattggagcaaa tacaatatattaataataagttcctaaaaccaataaattaactaatacacataaagatat tgatgttgattatacaactataagaaacggatttaacagaatttaatcaagctaagaaat tatatatatcgtgatgtttttgaattagaaggtgattcaaaattagtttatagtcttctg tgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattgttagtaaaatttttaaagattttatg gataaatataaatagttttacttattttctaaaactttaaaataccattaattaccttaa atattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaatttactgaagaacatgcta ttgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaatatacaatctacctccatggg aggaaattaaaaagaagaatttttcactagcaaaagaagataaaagaaaaaattttataa gttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaacttattagatgaaggaagct ctgtattctttggtattggttgaaaccgaattattgtggaatgggaattggtaaagaaat aattagcctaggattacaagaatgtagaaataaatatagtactaaaccaattgtattaaa tgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttatgagtctcaaggatttaaaatagt tgagactaaggtacaaaaaacgcatttaggagatggagaattttttgttatgaggtatca atagtttataacaatagtcctattgttaatacaacaattaaaatgaaaaaatacatatgt gtaggtcatagcaataagtgtctttgaaatataaatttgagagcttttgataaaattcgg tatacatatatattttatactacggatatataaatctatctacatacataaagagattgt aagtaggtttgtgtatataaaaatagatttatatttcataaatgtactttttatttgcat tacctttattttatctaagctctcattttattatctaatcttcctttttactggttttat taagagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatcagccaatatttctcatcaaa actaccttgactcatagacattataaaaaattttccaacatacttgcctttagtcatcat atttaaaattaaatatcctatagatatcatataacctatgattgtattattaaataaatt tgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgatgcgaaacttccaataatata ctcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaacatttacaaaacctatgattaa taccactatacctataattgacatcagtatcctaattaattgtacaataacttgagataa tgcttttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgctctagcgaaaatacaggtac caacattactatccctattattgcaacataattttctaaacatatagctgttgaaattct gtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacatagcaatataattgaacatat taaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttattagaactaaacagttttgaaa actttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctcatataagaatatagctaaca aaacaagcaccaatgctcccaaacttatcacaattctattaatcataatttgattgaagt tttgtataataatatccccatttaatacactattatgtcttatcattagccccattgttg aataatcacctttgagtcctgtagaatttatactgtaaagccaccaaattaattgcacaa taattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcattcctacagctgtaactatca taagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaatgctaagttatcaatagata tacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatctttcatacctaaaattaata caggcaatatcatcataaagacaagtgcaaaatatcttgataaaactattttgcatgaag atacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacgcttatctttaagtgacataa aaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacctatataatcgcaaaaaattc ttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtatagttgtaattcttcatagctt catcataggtaactggaactactccaaatctttgtaacttgtcaaaagcatatgcagacc ctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattatttcttcaaatctttcaagagatactt tagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaagtgaatttatttcgctaatac ttttaccagttatttcttctatatatttttctatggtcttcgttttattttggtctaatt ttatatacttaactacccctgttggatacgttgtatatgtgtttttttgatattctctaa ttaggtttatagttgcatttggaatgactttttctgttttcatagattctttttgaccat atggatattgattgtgtacagagtaatattcctcaatattctctactttttgtggagcaa ctaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatcatttgaaactgaacttccaa gttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaatataatatatcatactcttta atatatttttacattcttttataaatagattcatatattatctcctcccattataagcat atagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtctcaaaaggtttatcatctga tataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacattcctataactataaatctact ttttatattttcaatatcttttttatctacttcaatactatatactttcccttcagctag ttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgacttttccactattcaatatagctac gttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgtagataaaataacgattctatc atttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgttcttctgggtcaagacctgc tgtcggctcatctactattaaaactctgggattatgaattaatgcttgtgctatcccaag ccttctattcatacctccagataaagattttactttcacattttgataattagtaaggtt tactttgcttaataactttgctataatttttcttctttttcttagtggtatatccgataa aactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgttaggatacattgaaaagtcttg tggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattctcaataggaactccacacat atgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaaattctcataaatgtggtttt tcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactgtcgatttcaagatttatatt atcaagagcttgttttttcccaaatcttttactaagattggatactgctattttcatttc catatataaatacacccccagaaacaattttatagaattttatttttataaatttttact gtattttcataataaattctaaaacttaagatattatttataaatttctaaattttttct aaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtatctttgtttctgaaatttttt aagtttatgaagttataatttaatatatatttattttatttgtgagtctatttttatata taatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattactggatataataggatagggtattta gccttttaagataaataaaaatatctgcaactatatattgcaaaaatttaaaactaattt atatatgctaatataaatatttataaagacataagacaaatttacctacagatttaaatt taacttatatattttaaaaggctaatataatatgtattttcttctatacaatcaaaaggc ttcatatctaagatatgtgatgacactaatattcacaatttttagtaattatcacattat aaaaaatattacagctagtccatcattagatgcttcttgtataaactttttaagctcaat tagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcactctcatcattcataacaggata aatattattttctaacatctcattaatattaaatctttttctaaatgcttgttcttccaa actgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgctgtaatcaacatgacaggaaa ttctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtactaatttgctaaatatattatc atcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtgaatggcatgccatgctttatc aatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaacaaaatcttgtaaattttcttc tgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttattttagtataacatcctatcattcc cataattacattcctcctaagtagcgtttttttaattgtaacttataattaaacttagtt acaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaaatttaaatacctatattatca actaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattttttcctaaaaattaaatgaatcaga ggttctataggcaatattgactataaataagaactattactttttaaaaaaaatttaaga aattatactgtagaatcatgctctacttattagctttaaataaaaaataaatcatgttct caaattaaataataaataacaataaatttaaattttaaactataagagtttctgaagtgt taataagcataccaataattatatgtgtaagaatttgatttaatagatatgaataatttt tacattaattataaatatattaacctattgttataaattctaaaaaagaaaagttatctt aaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgatacacttatttttatattgaaatta tattttttaatatctattcttaattaggtatttttaaattatctgtttacattaaatatt tcttaattacttatctttcagctagctttttctattaaatgtttctcaattacttatttt tcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagtcacttcta ttaaacatttcttaattatttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaatt acttatttttcaattagccacttctattaagcatttctcaattacttatttttcaattag ccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaagcat ttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattatttattt ttcagttggctttttctattaaatgtttcttaattacttatctttcagttagctctttct attaaacatttctcaattacttatttttcaattagctactttcattaaatatttcttaat tatttatctttcagttaactatttccattagatatttctcaattacctatttttatcatt tattttatagagtattgtgcactatatatttatacatatcataaatactacaacttgtta tctcttattttagctgttttatctactcctctattttttcaactatctcaaagtcaattt ctttaaaatctacattaacactttcaacctttatcttaacaaggtcacctatcttatatg acttcttagttctttctcctaaaacactataagaactctcatcataaatatagtaatcat cattcatatttgcaagtcttatcaacccttctatggtattatctaactcaacaaatattc caaatgaagttacgctagatacaacaccctcaaattcttgaccaactttatccttcatat aaagagccttatagaaatcatgtacatctctttcagctaactctgcctttctttctttct cggatgattgaacagatgcataatccactatagtagtaagctgttcttgtctttttccac ttattttattatttaaagattcttttattattctatgaatttgaaggtcaggatatcttc ttattggtgaagtaaagtgacagtagaatttagctgctaatccaaaatgtccactacatt ctggtgagtacttagcttgttttaaagaacgaagcattatagtactgatagctccttctt cttttttgccctttattttctctattataccttgtaatgcttttggatgtacttcctctt tatcaccttttattatatatccaaatgtagatataaacttactcaattcttccatttttt ccaaagatggtgtctcatgtattctatacacaaacggtattcccatccagtaaaaatgtt cggcaattgtctcattacttataagcataaattcttctattatcttattagatattcttc tttcatatggctttatatctacaacttcgccttttccatttagaattatctttgcctctg ggaaattgaagtctatagctcctcttttttcccttcttgacataagaatcctagctaaaa tttcagcatttttaaaatcttcaacaacatgttcaaaagtctttttaagtttttcatcat ccttttctaatatatcagatacttctgtataagtcattctagcttttgaatttattacag attcacatatttcatgtttaaccacatttcctttatggtctatttccataaatatagaaa gagttagcttatcttcaaatggatttaagctacatactccatttgaaagagtttttggca acattggaattactttatctactaaataaactgatgtagctctttttaaggcttccttgt caagtttatttttctctcttacataatgtgtaacatcagctatgtgaactcctagtttga agtttccattaggtaatacttctattgatatggcatcatctaagtcttttgcgtcatctc catctatagtaaatatgtttaaatctcttaaatctcttcttctttttatctcttcttgag gaatctcaacagctacagcttctgcttcttgcaatactttctttggaaattcttctggaa gaccatgttctcttattatagaatctatttctacgcctctttcacctttttgacctagta tctctataattttgccttctggttttctatcctcttgtggccatactgtaatttcacata ctaccttatcattatctactgctccactaaaatgttttttaggtatatatatatctttag taaatttcttgttgtctggtgttacaaatccaaaagttttacttgattggaaggtaccta ctattctagttatttctctctttattacttttactattcttccttctgctctcttttctt cagttgcaggtactactatttctgccataactctatcattatgcatagcaccatttatat tgtcacttgagataaataaatcctgtgtatattcaacatcagattctacaaatccaaaac cctttttgtgtgatacaaattttccaacaaagtatcccatttgattgggagatactattt ttccttttttagtaaagcagatataaccatcttcttctaattcatttaaaaaattataaa acattggcatttctgatgaatgtatatcaaatatttctgctaattcttctttttttagag gattatatgcactttcatttattaatcctagcaaactttctttaagtcctggtatcattt ttccctcctgttttacttttcattatattattatttatattgtcttttatatttcttcag acaaaacattttttacttatcacataattttctatattttcttattattataagttaaaa ttacttatttatatttttgatttaatgtaatctttgtcatactaacttcaaacaaattat gatgttttataaattatttgtaaatatcattataattacttaagttattctttatcataa ttgcttaaattactctttatcacctaattatacaccatcaaataggattggtaaaatatt catctcatataagtattactatataataatttattctattagtatactcaaatcatgtaa aatttatataactcaattaattttttaaatacaactttataatataaaacttataataaa agtaaatttatatgttaaatgaggttgattttttattattttttatttatgctagtacta aagacttgcaaacgttttttgacaagtctttattttgtctaaattaaacaaactttttta caaataaatacataaaatttaaactaatctatttattggaggagataaaattggaagaag taattgcaaaaattattactatagaaaatggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaa aaattgtaaaaaataatgactcaaaaaagtgttattatctatcaatctacttatataggt cagaatattatcaagtaagagaattggctgtgtttatacttggttttatatcagtaacta tttctgaagctttgttatttttaaaagataatgtgagtaaagatgaaaactggagagtac aagaaatactagctaaatcatttgattattattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcac ttcctgttataaaagaatggcttaattctgatagtccaaacataaaaagggctgtgacag aaggtcttcgaatttggactaatagagactattttaaatctaatcctgacgttgctatat cactactttctagtttaaaagaagatgatagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatg ctcttagagatataagtaaaaaatatccagatttagtaaaaaaagaattagattcatggg atatatcaaataaaaaagttgagtttgtatataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaa agtaaaatggaggtgaacttatttgaaacttcgtgatgagtatacttgcccattagaact aacacatgatatgataaaaggcaaatggaaatctattatattatggagattacgcatagg accaacttccttatcaaaacttgaaaaggaaatcaatggtattaatcaaaagatgttact tgaacaacttaaagaattaattgaatttggtcttgtagataaaaagacatatgaaggtta cccacttaaagtcgaatactcacttacacctattcgagggaaacaaatattggatgcttt ggctataatgcaagatataggaattagctttatgttggataatggtatggaagatattct taaggaaaaaggtgttttaaaataaatagatacccacaaaaaagtaagtaatttaccatt attttcaactggtatataattaaattatagatatattctattaatttattataataggag gtaaattattatgaaagtaactagtacaggtatagtaaatggtgttatagaagataaata tggtaaaagaggaactcagttcaatgaaggtggtatgcctacatattcactacctctaaa gtttgaagatgctccaaagaatacagtatcctttgctgtatttttagaagataaagactc tgttcctgtatgtgggtttgcatggatacattggttagctgtaaatataacaaaagatga gttaaatgaaaatgaaagtgtaacagctactgattttgtacaagggactactagttggca tggtaaactaggaggtcttgacagattagaggccagtgtatatggtggaatggctcctcc agacagacctcatgtctatgaaatacatgtatttgcacttgatactatccttgaccttga aaaaggattctatatgaatgaatttttcaaagctattgaagggcatgttttagatacatt tacactaaaaggaagttattctaattaattaggttgactatagctaatcattaattaaat gatacatttaattgatgattagcttaattgttattagaatattttctgcactttatctta atatatattttagttgactggtattttaatttctattagattattatcaatttatataaa ttgattaaaaaatagctacgcacactcg |