Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00145_1A_021022.fasta |
contig | u00000crpx_c_021022 |
start | 3596289 |
length | 13679 |
strand | + |
type | core |
seq | tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt agccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt tatagtccagtagacttttctcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga atacccctttatagtagttgctccaataagctttcttatttcatgcttatgaagtaatag ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg aacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc catataaatctcaccttctttgctagaaatttgttccataaatgttagaaatttactaaa tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgta tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagtaa tactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctatcttctatc ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct atcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatct tctatcttctatcttctatcttctaaataattttaacatgcccataaaatataataccca caaatgataaataatactcaaaatgtctattgaaataactatacatccttaaataactta acttaaatctaaacatttcaaaaacttcttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagta gcgattttttcaaaaaaaatgtaatatagagttatatcttataatattttagagataaat tttatcatagtggggagaaatttgtatggatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaa tgcatcagatggcaaaagcgaatttgagatattagaatttgaaaaacttgagggagcttc tagcccattaatggcaatgggattatattttgctagagaagctggtttgaaagctagaca aattaagataaaattaaataattcatcaataaaaacagaagctggtgcattatactatta taaaggaaatatatcttctgaaactaagattggtggtgttggaggtctttttaaaaaagg aatatcaggagcacttactaatgaatcaatgatgaaacctgtatacaaaggtactggaga agtttatttggaaccttcttttagacattatttatttatgagtcttgataatgattctat aattgttgataaaggattattctattgttgctctgatacaatagaagtaaaagcatttac acaaaagaacttctcatctgctttacttggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaag tggtactggtgtaatcgttctggaatgtgttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatga attgaaaaatggtgaagaattaaaggtagatggtaactttgcaatagcaagaacatctgg tgttaatttttctgttacaaaatcagataaatctttaattggttctgctttaaatggtga aggtttcttaaatacatttactggtagtggtacagtttggctagctccaactcaagtaat gtatgaaaaactaagttttggagcaatgcctactaatgataatatgaataataaagtttc taagcaaaaatagttgttttataaatatttattaaatcattattgattttataaagtcac tataaattttattagattattataaaatcagagtgtggaaatatttatgtgtattcttta aataaaaatttccacattctgtaaagttattatacttgatatataaaattcaatttagga acatagtctaacatttataaacatattaaggtaatgatttctcttggtagttattctcat atcttattctttgattatatttatcttattcctagcccttatgtcatattatatttctta tcttattatttataattagcattaacttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaag tttacatctatattaatttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttg attttaaaaatttaagtgaatttgttcttatacacacctttttaaaattatatctgtaga aaatatcatttagagctataattaaattaacttattaaattttagaaaatttattaaaaa atataagttaaattaatatttttaaagattcttttttgtaactactagaacactaattta gtagttattgtatctctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctat aatttacctactacttggattattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaaa accaataaattaactaatacacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaac ggatttaacagaatttaatcaagctaagaaattatatatatcgtgatgtttttgaattag aaggtgattcaaaattagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtacaa gaattgttagtaaaatttttaaagattttatggataaatataaatagttttacttatttt ctaaaactttaaaataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaattt aaataaagttaaatttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaagg taaatattcaatatacaatctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcact agcaaaagaagataaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgat aggttttataaacttattagatgaaggaagctctgtattctttggtattggttgaaaccg aattattgtggaatgggaattggtaaagaaataattagcctaggattacaagaatgtaga aataaatatagtactaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgta aaatgttatgagtctcaaggatttaaaatagttgagactaaggtacaaaaaacgcattta ggagatggagaattttttgttatgaggtatcaatagtttataacaatagtcctattgtta atacaacaattaaaatgaaaaaatacatatgtgtaggtcatagcaataagtgtctttgaa atataaatttgagagcttttgataaaattcggtatacatatatattttatactacggata tataaatctatctacatacataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaatagat ttatatttcataaatgtactttttatttgcattacctttattttatctaagctctcattt tattatctaatcttcctttttactggttttattaagagagatgcaattatcaacacaaca cttccaagtatcagccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaa aattttccaacatacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatc atataacctatgattgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctata aacatagctgatgcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaaga tatattaaaacatttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagt atcctaattaattgtacaataacttgagataatgcttttgaagatactatctcatcaatt tcttttgattgctctagcgaaaatacaggtaccaacattactatccctattattgcaaca taattttctaaacatatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattaga ggaatcatacatagcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaag ttttcttttattagaactaaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattccccct tcttttttgctcatataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaaacttat cacaattctattaatcataatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaatac actattatgtcttatcattagccccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaatt tatactgtaaagccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatat agtaatactcattcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgt atattttataaatgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaa aggaagtaaatctttcatacctaaaattaatacaggcaatatcatcataaagacaagtgc aaaatatcttgataaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctct cattcttgaacgcttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatact taaaactatacctatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatcttt ttgtattgtatagttgtaattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaa tctttgtaacttgtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactctttg cattatttcttcaaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatc agttttccaaagtgaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatattt ttctatggtcttcgttttattttggtctaattttatatacttaactacccctgttggata cgttgtatatgtgtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatgac tttttctgttttcatagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaata ttcctcaatattctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatt tttacttacatcatttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaac tacaataaaaatataatatatcatactctttaatatatttttacattcttttataaatag attcatatattatctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaa tttactgctgtctcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccacca tgagtcaacattcctataactataaatctactttttatattttcaatatcttttttatct acttcaatactatatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattg tatatgacttttccactattcaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctcca acaatatgtgtagataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttcta aatcttatacgttcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatctactattaaaactctg ggattatgaattaatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagat tttactttcacattttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatt tttcttctttttcttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatat actgtcatgttaggatacattgaaaagtcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatt tccttagtattctcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataat aaagtggctaaaattctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagacca aacataccactgtcgatttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatctt ttactaagattggatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaacaat tttatagaattttatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaactta agatattatttataaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaatt aaattaaagtatctttgtttctgaaattttttaagtttatgaagttataatttaatatat atttattttatttgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaa gaattactggatataataggatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctgc aactatatattgcaaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaag acataagacaaatttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatat aatatgtattttcttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgtgatgacacta atattcacaatttttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcatta gatgcttcttgtataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaa tcatcttcactctcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaata ttaaatctttttctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagttttttt acatcatttgctgtaatcaacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgttt ccacttagtactaatttgctaaatatattatcatcatctccaccaaaaggacaacctgtc aaagtaaagtgaatggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggca tcttcaaaaacaaaatcttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctct tcacttattttagtataacatcctatcattcccataattacattcctcctaagtagcgtt tttttaattgtaacttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtatta tttcatcttaaatttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagt attattttttcctaaaaattaaatgaatcagaggttctataggcaatattgactataaat aagaactattactttttaaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctactt attagctttaaataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataaatt taaattttaaactataagagtttctgaagtgttaataagcataccaataattatatgtgt aagaatttgatttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaacctat tgttataaattctaaaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaattt taaatgatacacttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattagg tatttttaaattatctgtttacattaaatatttcttaattacttatctttcagctagctt tttctattaaatgtttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttc ttaattacttatttttcaattagtcacttctattaaacatttcttaattatttatttttc aattagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagccacttctatt aagcatttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattac ttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagcc acttctattaaacatttcttaattatttatttttcagttggctttttctattaaatgttt cttaattacttatctttcagttagctctttctattaaacatttctcaattacttattttt caattagctactttcattaaatatttcttaattatttatctttcagttaactatttccat tagatatttctcaattacctatttttatcatttattttatagagtattgtgcactatata tttatacatatcataaatactacaacttgttatctcttattttagctgttttatctactc ctctattttttcaactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacattaacactttcaac ctttatcttaacaaggtcacctatcttatatgacttcttagttctttctcctaaaacact ataagaactctcatcataaatatagtaatcatcattcatatttgcaagtcttatcaaccc ttctatggtattatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgctagatacaacacc ctcaaattcttgaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaatcatgtacatc tctttcagctaactctgcctttctttctttctcggatgattgaacagatgcataatccac tatagtagtaagctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaagattcttttat tattctatgaatttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaagtgacagtagaa tttagctgctaatccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagcttgttttaaaga acgaagcattatagtactgatagctccttcttcttttttgccctttattttctctattat accttgtaatgcttttggatgtacttcctctttatcaccttttattatatatccaaatgt agatataaacttactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctcatgtattctata cacaaacggtattcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcattacttataagcat aaattcttctattatcttattagatattcttctttcatatggctttatatctacaacttc gccttttccatttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctatagctcctctttt ttcccttcttgacataagaatcctagctaaaatttcagcatttttaaaatcttcaacaac atgttcaaaagtctttttaagtttttcatcatccttttctaatatatcagatacttctgt ataagtcattctagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgtttaaccacatt tcctttatggtctatttccataaatatagaaagagttagcttatcttcaaatggatttaa gctacatactccatttgaaagagtttttggcaacattggaattactttatctactaaata aactgatgtagctctttttaaggcttccttgtcaagtttatttttctctcttacataatg tgtaacatcagctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaatacttctattga tatggcatcatctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatgtttaaatctct taaatctcttcttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctacagcttctgcttc ttgcaatactttctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttattatagaatctat ttctacgcctctttcacctttttgacctagtatctctataattttgccttctggttttct atcctcttgtggccatactgtaatttcacatactaccttatcattatctactgctccact aaaatgttttttaggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtctggtgttacaaa tccaaaagttttacttgattggaaggtacctactattctagttatttctctctttattac ttttactattcttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactactatttctgccat aactctatcattatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaataaatcctgtgt atattcaacatcagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgatacaaattttccaac aaagtatcccatttgattgggagatactatttttccttttttagtaaagcagatataacc atcttcttctaattcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgatgaatgtatatc aaatatttctgctaattcttctttttttagaggattatatgcactttcatttattaatcc tagcaaactttctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttacttttcattatat tattatttatattgtcttttatatttcttcagacaaaacattttttacttatcacataat tttctatattttcttattattataagttaaaattacttatttatatttttgatttaatgt aatctttgtcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattatttgtaaatatc attataattacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctttatcacctaat tatacaccatcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtattactatataata atttattctattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaattaattttttaa atacaactttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgttaaatgaggttga ttttttattattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttttttgacaagtc tttattttgtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaatttaaactaat ctatttattggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattattactatagaaaa tggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataatgactcaaaaaa gtgttattatctatcaatctacttatataggtcagaatattatcaagtaagagaattggc tgtgtttatacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgttatttttaaaaga taatgtgagtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaatcatttgatta ttattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcacttcctgttataaaagaatggcttaattc tgatagtccaaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttcgaatttggactaatagaga ctattttaaatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagtttaaaagaagatga tagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagtaaaaaatatcc agatttagtaaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaagttgagtttgt atataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaacttatttgaaa cttcgtgatgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataaaaggcaaatgg aaatctattatattatggagattacgcataggaccaacttccttatcaaaacttgaaaag gaaatcaatggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaattaattgaattt ggtcttgtagataaaaagacatatgaaggttacccacttaaagtcgaatactcacttaca cctattcgagggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagatataggaattagc tttatgttggataatggtatggaagatattcttaaggaaaaaggtgttttaaaataaata gatacccacaaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtatataattaaattat agatatattctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaagtaactagtaca ggtatagtaaatggtgttatagaagataaatatggtaaaagaggaactcagttcaatgaa ggtggtatgcctacatattcactacctctaaagtttgaagatgctccaaagaatacagta tcctttgctgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtgggtttgcatggata cattggttagctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaaagtgtaacagct actgattttgtacaagggactactagttggcatggtaaactaggaggtcttgacagatta gaggccagtgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtctatgaaatacat gtatttgcacttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatgaatgaatttttc aaagctattgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagttattctaattaa ttaggttgactatagctaatcattaattaaatgatacatttaattgatgattagcttaat tgttattagaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttgactggtatttta atttctattagattattatcaatttatataaattgattaaaaaatagctacgcacactcg |