Block details
fasta C_difficile_CD00084_1A_020911.fasta
contig u00000crpx_c_020911
start 3525147
length 14125
strand +
type core
seq ttggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctaca
tgcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgct
tagccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccctaaagtagttccctgcataa
tgacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctat
cgcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaa
cacgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagt
ttatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtat
atataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaattt
tattctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatac
gtctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttg
ctaaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtg
aatacccctttatagtagttgctccaataagttttcttatttcatgcttatgaagtaata
attttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatat
gaacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaa
ctttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataag
tttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccag
ccatataaatctcaccttctttgctagaaatttcttccataaatgttagaaatttactaa
atatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttag
tcaatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgt
atgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagta
atactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctatcttctat
cttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttc
tatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatc
ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctaaataattttaaca
tgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaaaatatctattgaaataa
ctatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaacttcttaaaaatat
gtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaatatagagttatatc
ttataatattttagagataaattttatcatagtggggagaaatttgtatggatttaagca
aaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcgaatttgagatattagaat
ttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatgggattatattttgctagag
aagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataattcatcaataaaaacag
aagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctgaaactaagattggtggtg
ttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatgaatcaatgatgaaac
ctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttttagacattatttattta
tgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattattctattgttgctctgata
caatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgctttacttggtggtgaag
gcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttctggaatgtgttgtacctc
aaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggtgaagaattaaaggtagatggtaact
ttgcaatagcaagaacatctggtgttaatttttctgttacaaaatcagataaatctttaa
ttggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactggtaatggtacagttt
ggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagcaatgcctactaatg
ataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataaatatttattaaatc
attattgattttataaagtcactataaattttattagattattattataaaatcagagtg
tggaaatgtttatgtgtattctttaaataaaaatttccacattctgtaaggttattatac
ttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttataaacatattaaggtaat
gatttctcttagtaattattctcatatcttattctttgattatatttatcttattcctag
cccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataattagcattaacttatctaaa
atcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaaaaagtttacatctatatta
atttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttgattttaaaaatttaa
gtgaatttgttcttatacacacctttttaaaattatatctgtagaaaatatcatttagag
ctataattaaattaacttattaaattttagaaaatttattaaaaaatataagttaaatta
atgtttttaaagattcttttttgtaactactagaatactaatttagtagttattgtatct
ctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctataatttacctactact
tggattattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaaaaccaataaattaact
aatacacataaagatattgatgttggttatacaactataagaaacggatttaacagaatt
taatcaagctaagaaattatatatatatcgtgatatttttgaattagaaggtaattcaaa
attagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattgttagtaa
aatttttaaagattttatggataaatataaatagttttactcattgtctaaaactttaaa
ataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaa
tttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaata
tacaatctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcactagcaaaagaagat
aaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaac
ttattagatgaaggaagctctgtattctttggtattggtatgaaaccgaattattgtgga
atgggaattggtaaagaaataattggcctaggattacaagaatgtagaaataaatatagt
actaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttatgag
tctcaaggatttaaaatagttgagactaaggtacagaaaacgcatttaggagatggagaa
ttttttgttatgaggtatcaatagtttataacaatagtcttattgttaatacaacaatta
aaatgaaaaaatacatatgtgtaggccatagcaataagtgtctttgaaatataaatttga
gagcttttgataaaatttggtatacatatatattttatactacggatatataaatctatc
tacatatataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaatagatttatatttcata
aatgtactttttatttgtattacctttattttatctaagctctcattttattatctaatc
ttcctttttactggttttattaatagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatc
agccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaaaattttccaaca
tacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatcatataacctatg
attgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgat
gcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaaca
tttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagtatcctaattaat
tgtacaataacttgagataatgcttttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgc
tctagcgaaaatacaggtaccaacattactatccctattattgcaacataattttctaaa
catatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacat
agcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttatt
agaactaaatagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctc
atataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgcttccaagcttatcacaattctatt
aatcataatttgattgaagttttgtataataatatctccatttaatacactattatgtct
tatcattagtcccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaatttatactgtaaaa
ccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcat
tcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaa
tgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatc
tttcatacctaaaattaatacaggcaatatcatcataaagacaagtgcaaaatatcttga
taaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacg
cttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacc
tatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtata
gttgtaattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaatctttgtaactt
gtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattatttcttc
aaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaag
tgaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatatttttctatggtctt
cgttttattttggtctaattttatatacttaactacccctgttggatacgttgtatatgt
gtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatgactttttctgtttt
catagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaatattcctcaatatt
ctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatc
atttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaat
ataatatatcatactctttaatatatttttacattcttttataaatagattcatatatta
tctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtc
tcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacatt
cctataactataaatctactttttatattttcaatatcttttttatctacttcaatacta
tatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgactttt
ccactattcaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgta
gataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgt
tcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatctactattaaaactctaggattatgaatt
aatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagattttactttcaca
ttttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatttttcttcttttt
cttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgtta
ggatacattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattc
tcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaa
attctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactg
tcgatttcaagatttatattatcaagtgcttgttttttcccaaatcttttgctaagattg
gatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaacaattttatagaattt
tatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaacttaagatattattta
taaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtat
ctttgtttctgaaattttttaagtttatgaagttataatttaatatatatttattttatt
tgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattactggat
ataataagatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctgcaactatatattg
caaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaagacataagacaaa
tttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatataatatgtatttt
cttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgtgatgacactaatattcacaatt
tttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcattagatgcttcttgt
ataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcactc
tcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaatattaaatcttttt
ctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgct
gtaatcaacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtact
aatttgctaaatatattatcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtga
atggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaaca
aaatcttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttatttta
gtataacatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcgtttttttaattgta
acttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaaa
tttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattattttt
tcctaaaaatcaaatgaatcagaagttctataggcaatattgactataaataagaactat
tacttttaaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctacttattagcttca
aataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataaatttaaattttaa
actataagagtttctgaagtgttaataagcataccaataattatatgtgtaagaatttga
tttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaacctattgttataaat
tctaaaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgatac
acttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattaggtatttttaaa
ttatctgtttacattaaatatttcttaattacttatctttcagctagctttttctattaa
atgtttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattactt
atttttcaattagtcacttctattaaacatttcttaattatttatttttcaattagccac
ttctattaagcatttcttaattatttatttttcaattagccacttctattaagcatttct
taattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttctcaattacttatttttca
attagccacttctattaagcatttctcaattacttatttttcaattagccacttctatta
agcatttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattatt
tatttttcagttggctttttctattaaatgtttcttaattacttatctttcagttagctc
tttctattaaacatttctcaattacttatttttcaattagctactttcattaaatatttc
ttaattatttatctttcagttaactatttccattagatatttctcaattacctattttta
tcatttattttatagagtattgtgcactatatatttatacatatcataaatactacaact
tgttatctcttattttagctgttttatctactcctctattttttcaactatctcaaagtc
aatttctttaaaatctacattaacactttcaacctttatcttaacaaggtctcctatctt
atatgacttcttagttctttctcctaaaacactataagaactctcatcataaatatagta
atcatcattcatatttgcaagtcttatcaatccttctatagtattatctaactcaacaaa
tattccaaatgaagttacgctagatacaacaccctcaaattcttgaccaactttatcctt
catataaagagccttatagaaatcatgtacatctctttcagctaactctgcctttctttc
tttctcggatgattgaacagatgcataatccactatagtagtaagctgttcttgtctttt
tccacttattttattatttaaagattcttttattattctatgaatttgaaggtcaggata
tcttcttattggtgaagtaaagtgacagtagaatttagctgctaatccaaaatgtccact
acattctggtgagtacttagcttgttttaaagaacgaagcattatagtactgatagctcc
ttcttcttttttgccctttattttctctattataccttgtaatgcttttggatgtacttc
ctctttatcaccttttattatatatccaaatgtagatataaacttactcaattcttccat
tttttccaaagatggtgtctcatgtattctatacacaaacggtattcccatccagtaaaa
atgttcggcaattgtctcattacttataagcataaattcttctattatcttattagatat
tcttctttcatatggctttatatctacaacttcgccttttccatttagaattatctttgc
ctctggaaaattgaagtctatagctcctcttttttcccttcttgacataagaatcctagc
taaaatttcagcatttttaaaatcttcaacaacatgttcaaaagtctttttaagtttttc
atcatctttttctaatatatcagatacttctgtataagtcattctagcttttgaatttat
tacagattcacatatttcatgtttaaccacatttcctttatggtctatttccataaatat
agaaagagttaacttatcttcaaatggatttaagctacatactccatttgaaagagtttt
tggcaacattggaattactttatctactaaataaactgatgtagctctttttaaggcttc
cttgtcaagtttatttttctctcttacataatgtgtaacatcagctatgtgaactcctag
tttgaagtttccattaggtaatacttctattgatatggcatcatctaagtcttttgcgtc
atctccatctatagtaaatatgtttaaatctcttaaatctcttcttctttttatctcttc
ttgaggaatctcaacagctacagcttctgcttcttgcaatactttctttggaaattcttc
tggaagaccatgttctcttattatagaatctatttctacgcctctttcacctttttgacc
tagtatctctataattttgccttccggttttctatcctcttgtggccatactgtaatttc
acatactaccttatcattatctactgctccactaaaatgttttttaggtatatatatatc
tttagtaaatttcttgttgtctggtgttacaaatccaaaagttttacttgattggaaggt
acctactattctagttatttctctctttattacttttactattcttccttctgctctctt
ttcttcagttgcaggtactactatttctgccataactctatcattatgcatagcaccatt
tatattgtcacttgagataaataaatcctgtgtatattcaacatcagattctacaaatcc
aaaaccctttttgtgtgatacaaattttccaacaaagtatcccatttgattgggagatac
tatttttccttttttagtaaagcagatataaccatcttcttctaattcatttaaaaaatt
ataaaacattggcatttctgatgaatgtatatcaaatatttctgctaattcttctttttt
tagaggattatatgcactttcatttattaatcctagcaaactttctttaagtcctggtat
catttttccctcctgttttacttttcattatattattatttatattgtcttttatatttc
ttcagacaaaacattttttacttatcacataattttctatatttccttattattattaca
agttaaaattacttatttatatttttgatttaatgtaagctttgtcatactaacttcaaa
caaattattatgttttataaattatttgtaaatatcattataattacttaagttattctt
tatcataattgcttaaattactctttatcacctaattatacaccatcaaataggattggt
aaaatattcatctcatataagtattactatataataatttattctattagtatactcaaa
tcatgtaaaatttatataactcaattaattttttaaatacaactttataatataaaactt
ataataaaagtaaatttatatgttaaatgaggttgattttttattattttttatttatgc
tagtactaaagacttgcaaacgttttttgacaagtctttattttgtctaaattaaacaaa
cttttttacaaataaatacataaaatttaaactaatctatttattggaggagataaaatt
ggaagaagtaattgcaaaaattattactatagaaaatggattcaaagaaattgaaaacat
tgctaaaaaaattgtaaaaaataatgactcaaaaaagtgttattatctatcaatctactt
atataggtcagaatattatcaagtaagagaattggctgtgtttatacttggttttatatc
agtaactatttctgaagctttgttatttttaaaagataatgtgagtaaagatgaaaactg
gagagtacaagaaatactagctaaatcatttgattattattgcagtgaagtaggatatga
aaaggctcttcctgttataaaagaatggcttaattctgatagtccaaacataaaaagggc
tgtgacagaaggtcttcgaatttggactagtagagactattttaaatctaatcctgacgt
tgctatatcactactttctagtttaaaagaagatgatagcgaatacttgagaaagtctgt
aggtaatgctcttagagatataagtaaaaaatatccagatttagtaaaaaaagaattaga
ttcatgggatatatcaaataaaaaagttgagtttgtatataagcttgcttcaaaatgtat
cttggcaaagtaaaatggaggtgaacttatttgaaacttcgtgatgagtatacttgccca
ttagaactaacacatgatatgataaaaggcaaatggaaatctattatattatggagatta
cgcataggaccaacttccttatcaaaacttgaaaaggaaatcaatggtattaatcaaaag
atgttacttgaacaacttaaagaattaattgaatttggtcttgtagataaaaagacatat
gaaggttacccacttaaagtcgaatactcacttacacctattcgagggaaacaaatattg
gatgctttggctataatgcaagatataggaattagctttatgttggataatggtatggaa
gatattcttaaggaaaaaggtgttttaaagtaaatagatacccacaaaaaagtaagtaat
ttaccattattttcaactggtatataattaaattatagatatattctattaatttattat
aataggaggtaaattattatgaaagtaactagtacaggtatagtaaatggtgttatagaa
gataaatacggtaaaagaggaactcagttcaatgaaggtggtatgcctacctattcacta
cctctaaagtttgaagatgctccaaagaatacagtatcctttgctgtatttttagaagat
aaagactctgttcctgtatgtgggtttgcatggatacattggttagctgtaaatataaca
aaagatgagttaaatgaaaatgaaagtgtaacagctactgattttgtacaagggactact
agttggcatggtaaactaggaggtcttgacagattagaggccagtgtatatggtggaatg
gctcctccagacagacctcatgtctatgaaatacatgtatttgcacttgatactatcctt
gaccttgaaaaaggattctatatgaatgaatttttcaaagctattgaagggcatgtttta
gatacatttacactaaaaggaagttattctaattaattaggttgactatagctaatcatt
aattaaatgctacatttaattgatgattagcttaattgttattagaatattttctgcact
ttatcttaatatatattttagttgactggtattttaatttatattagattattatcaatt
tatataaattgattttagcttaaaacttacttatctatttcagtttctattagaattatt
attagactcattaaaataaaagcattaatataactaataatatatgttaaattcattaac
tctacataaagttttataatctaaatgaaatacaataatctgcataaaattcaatagctt
atataaaatttaataatttatataaatattatcaacctatataaaatttaataacttata
taaatattatcaacctatataaaatttaataacttatataaaatttaataacttatataa
aatttaataacttatataaatattatcaacctatataaaatttagtaatttatataaata
ttatcaacctatataaaatttaataa