Block details
fasta C_difficile_CD00148_1A_020479.fasta
contig u00000crpx_c_020479
start 3444550
length 14103
strand +
type core
seq tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat
gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt
agccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat
gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc
gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac
acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt
tatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata
tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt
attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg
tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc
taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga
atacccctttatagtagttgctccaataagctttcttatttcatgcttatgaagtaatag
ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg
aacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac
tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt
ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc
catataaatctcaccttctttgctagaaatttgttccataaatgttagaaatttactaaa
tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt
caatatttcactggtatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgta
taaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagtaa
tactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctaacttctaac
ttctaacttctaacttctaacttctaacttctaacttctaacttctaacttctaacttct
aacttctaacttctaacttctaacttctaacttctaacttctaacttctaacttctaact
aattttaacatgtccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaaaatatct
attgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaacttc
ttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaatata
gagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagtggggagaaatttgtatg
gatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcgaatttgag
atattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatgggattatat
tttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataattcatca
ataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctgaaactaag
attggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatgaatca
atgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttttagacat
tatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattattctattgt
tgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgctttactt
ggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttctggaatgt
gttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggtgaagaattaaaggta
gatggtaactttgcaatagcaagaacatctggtgttaatttttctgttacaaaatcagat
aaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactggtaat
ggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagcaatg
cctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataaatat
ttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattattattataa
aatcagagtgtggaaatgtttatgtgtattctttaaataaaaatttccacattctgtaag
gttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttataaacata
ttaaggtaatgatttctcttagtaattattctcatatcttattctttgattatatttatc
ttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataattagcattaa
cttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaaaaagtttac
atctatattaatttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttgatttt
aaaaatttaagtgaatttgttcttatacacatctttttaaaattatatctgtagaaaata
tcatttagagctataattaaattaacttattaaattttagaaaatttattaaaaaatata
agttaaattaatatttttaaagattcttttttataactactagaatagtaatttagtagt
tattgtatctctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctataattt
acctactacttggagtaaatataatatattaataataagttcctaaagccaataaattaa
ctaatacacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaacggatttaacagaa
tttaatcaagctaagaagttacatatatcgtgaggtttttgaattagaaggtaattcaaa
attagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaaatacagggtacaagaattgttagtaa
aatttttaaagattttatggataaatataaatagttttacttattgtctaaaactttaaa
ataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaa
tttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaata
tacaatctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcactagcaaaagaagat
aaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaac
ttattagatgaaggaagctctgtattctttggtattggtatgaaaccgaattattgtgga
atgggaattggtaaagaaataattagcctaagattacaagaatgtagaaataaatatagt
actaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttatgag
tctcaaggatttaaaatagttgagactaaggtacaaaaaacgcatttaggagatggagaa
ttttttgttatgaggtatcaatagtttataacaatagtcctattgttaatacaacaatta
aaatgaaaaaatacatatgtgtaggtcatagcaataagtgtctttgaaatataaatttga
gagcttttgataaaattttgtatacatatatattttatactacggatatataaatctatc
tacatatataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaatagatttatatttcata
aatgtactttttatttgcattacctttattttatctaagctctcattttattatctaatc
ttcctttttactggttttattaagagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatc
agccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaaaattttccaaca
tacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatcatataacctatg
attgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgat
gcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaaca
tttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagtatcctaattaat
tgtacaataacttgagataatgcttttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgc
tctagcgaaaatacgggtaccaacattactatccctattattgcaacataattttctaaa
catatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacat
agcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttatt
agaactaaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctc
atataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagcttatcacaattctatt
aatcataatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaatacactattatgtct
tatcattagtcccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaatttatactgtaaaa
ccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcat
tcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaa
tgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatc
tttcatacctaaaattaatacaggcaatatcatcataaagacaagtgcaaaatatcttga
taaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacg
cttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacc
tatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtata
gttataattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaatctttgtaactt
gtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgttgtctactctttgcattatttcttc
aaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaag
tgaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatatttttctatggtctt
cgttttattttggtctaattttatatacttaactacacctgttggatacgttgtatatgt
gtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatgaccttttctgtttt
catagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagaataatattcctcaatatt
ctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatc
atttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaat
ataatataccatactctttaatatatttttacattcttttataaatagattcatatatta
tctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtc
tcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacatt
cctataactataaatctactttttatattttcaatatcttttttatctacttcaatacta
tatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgactttt
ccactattcaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgta
gataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgt
tcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatctactattaaaactctgggattatgaatt
aatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagattttactttcaca
ttttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatttttcttcttttt
cttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgtta
ggatacattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattc
tcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaa
attctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactg
tcgatttcaagatttatattatcaagtgcttgttttttcccaaatcttttgctaagattg
gatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaacaattttatagaattt
tatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaacttaagatattattta
taaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtat
ctttgtttctgaaattttttaagtttatgaagttataatttaatatatatttattttatt
tgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattactggat
ataataggatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctacaactatatattg
caaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaagacataagacaaa
tttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatataatatgtatttt
cttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgtgatgacactaatattcacaatt
ttttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcatcagatgcttcttg
tataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcact
ctcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaatattaaatctttt
tctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgc
tgtaatcaacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtac
taatttgctaaatatattatcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtg
aatggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaac
aaaatcttgtaagttttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttatttt
agtataacatcctatcatccccataattacattcctcctaagtaacgtttttttaattgt
aacttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaa
atttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattatttt
ttcctaaaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgactataaataagaacta
ttacttttaaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctacttattagcttt
aaataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataaatttaaatttta
aactataagagtttctgaagtgttaataagcataccaataattatatgtgtaagaatttg
atttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaacctattgttataaa
ttctaaaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgata
cacttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattaggtatttttaa
attatctgtttacattaaatatttcttaattacttatctttcagctagctttttctatta
aatgtttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattact
tatttttcaattagtcacttctattaaacatttcttaattatttatttttcaattagcca
cttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttc
ttaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttc
agttggctttttctattaaatgtttcttaattacttatctttcagttagctctttctatt
aaacatttctcaattacttatttttcaattagctactttcattaaatatttcttaattat
ttatctttcagttaactatttccattagatatttctcaattacctatttttatcatttat
tttatagagtattgtgcactatatatttatacatatcataaatactacaacttgttatct
cttattttagctgttttatctactcctctattttttcaactatctcaaagtcaatttctt
taaaatctacattaacactttcaacctttatcttaacaaggtctcctatcttatatgact
tcttagttctttctcctaaaacactataagaactctcatcataaatatagtaatcatcat
tcatatttgcaagtcttatcaacccttctatagtattatctaactcaacaaatattccaa
atgaagttacgctagatacaacaccctcaaattcttgaccaactttatccttcatataaa
gagccttatagaaatcatgtacatctctttcagctaactctgcctttctttctttctcgg
atgattgaacagatgcataatccactatagtagtaagctgttcttgtctttttccactta
ttttattatttaaagattcttttattattctatgaatttgaaggtcaggatatcttctta
ttggtgaagtaaagtgacagtagaatttagctgctaatccaaaatgtccactacattctg
gtgagtacttagcttgttttaaagaacgaagcattatagtactgatagctccttcttctt
ttttgccctttattttctctattataccttgtaatgcttttggatgtatttcctctttat
caccttttattatatatccaaatgtagatataaacttactcaattcttccattttttcca
aagatggtgtctcatgtattctatacacaaacggtattcccatccagtaaaaatgttcgg
caattgtctcattacttataagcataaattcttctattatcttattagatattcttcttt
catatggctttatatctacaacttcgccttttccatttagaattatctttgcctctggga
aattgaagtctatagctcctcttttttcccttcttgacataagaatcctagctaaaattt
cagcatttttaaaatcttcaacaacatgttcaaaagtctttttaagtttttcatcatcct
tttctaatatatcagatacttctgtataagtcattctagcttttgaatttattacagatt
cacatatttcatgtttaaccacatttcctttatggtctatttccataaatatagaaagag
ttaacttatcttcaaatggatttaagctacatactccatttgaaagagtttttggcaaca
ttggaattactttatctactaaataaactgatgtagctctttttaaggcttccttgtcaa
gtttatttttctctcttacataatgtgtaacatcagctatgtgaactcctagtttgaagt
ttccattaggtaatacttctattgatatggcatcatctaagtcttttgcgtcatctccat
ctatagtaaatatgtttaaatctcttaaatctcttcttctttttatctcttcttgaggaa
tctcaacagctacagcttctgcttcttgcaatactttctttggaaattcttctggaagac
catgttctcttattatagaatctatttctacgcctctttcacctttttgacctagtatct
ctataattttgccttctggttttctatcctcttgtggccatactgtaatttcacatacta
ccttatcattatctactgctccactaaaatgttttttaggtatatatatatctttagtaa
atttcttgttgtctggtgttacaaatccaaaagttttacttgattggaaggtacctacta
ttctagttatttctctctttattacttttactattcttccttctgctctcttttcttcag
ttgcaggtactactatttctgccataactctatcattatgcatagcaccatttatattgt
cacttgagataaataaatcctgtgtatattcaacatcagattctacaaatccaaacccct
ttttgtgtgatacaaattttccaacaaagtatcccatttgattgggagatactatttttc
cttttttagtaaagcagatataaccatcttcttctaattcatttaaaaaattataaaaca
ttggcatttctgatgaatgtatatcaaatatttctgctaattcttctttttttagaggat
tatatgcactttcatttattaatcctagcaaactttctttaagtcctggtatcatttttc
cctcctgttttacttttcattatgttattatttatattgtcttttatatttcttcagaca
aaacattttttacttatcacataattttctatatttccttattattattacaagttaaaa
ttacttatttatatttttgatttaatgtaagctttgtcatactaacttcaaacaaattat
gatgttttataaattatttgtaaatatcattataattacttaagttattctttatcataa
ttgcttaaattactctttatcacctaattatacaccatcaaataggattggtaaaatatt
catctcatataagtattactatataataatttattctattagtatactcaaatcatgtaa
aatttatataactcaattaattttttaaatacaactttataatataaaacttataataaa
agtaaatttatatgttaaatgaggttgattttttattattttttatttatgctagtacta
aagacttgcaaacgttttttgacaagtctttattttgtctaaattaaacaaactttttta
caaataaatacataaaatttaaactaatctatttattggaggagataaaattggaagaag
taattgcaaaaattattactatagaaaatggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaa
aaattgtaaaaaataatgactcaaaaaagtgttattatctatcaatctacttatataggt
cagaatattatcaagtaagagaattggctgtgtttatacttggttttatatcagtaacta
tttctgaagctttgttatttttaaaagataatgtgagtaaagatgaaaactggagagtac
aagaaatactagctaaatcatttgattattattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcac
ttcctgttataaaagaatggcttaattctgatagtccaaacataaaaagggctgtgacag
aaggtcttcgaatttggactagtagagactattttaaatctaatcctgacgttgctatat
cactactttctagtttaaaagaagatgatagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatg
ctcttagagatataagtaaaaaatatccagatttagtaaaaaaagaattagattcatggg
atatatcaaataaaaaagttgagtttgtatataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaa
agtaaaatggaggtgaacttatttgaaacttcgtgatgagtatacttgcccattagaact
aacacatgatatgataaaaggcaaatggaaatctattatattatggagattacgtatagg
accaacttccttatcaaaacttgaaaaggaaatcaatggtattaatcaaaagatgttact
tgaacaacttaaagaattaattgaatttggtcttgtagataaaaagacatatgaaggtta
cccacttaaagttgaatactcacttacacctattcgagggaaacaaatattggatgcttt
ggctataatgcaagatataggaattagctttatgttggataatggtatggaagatattct
taaggaaaaaggtgttttaaagtaaatagatacccacaaaaaagtaagtaatttaccatt
attttcaactggtatataattaaattatagatatattctattaatttattataataggag
gtaaattattatgaaagtaactagtacaggtatagtaaatggtgttatagaagataaata
cggtaaaagaggaactcagttcaatgaaggtggtatgcctacatattcactacctctaaa
gtttgaagatgctccaaagaatacagtatcctttgctgtatttttagaagataaagactc
tgttcctgtatgtgggtttgcatggatacattggttagctgtaaatataacaaaagatga
gttaaatgaaaatgaaagtgtaacagctactgattttgtacaagggactactagttggca
tggtaaactaggaggtcttgacagattagaggccagtgtatatggtggaatggctcctcc
agacagacctcatgtctatgaaatacatgtatttgcacttgatactatccttgaccttga
aaaaggattctatatgaatgaatttttcaaagctattgaagggcatgttttagatacatt
tacactaaaaggaagttattctagttaattaggttgactatagctaatcattaattaaat
gctacatttaattgatgattagcttaattgttattagaatattttctgcactttatctta
atatatattttagttgactggtattttaatttatattagattattatcaatttatataaa
ttgattttagcttaaaacttacttatctatttcagtttctattagaattattattagact
cattaaaataaaagcactaatataactaataatatatgttaaattcattaactctacata
aagttttataatctaaatgaaatacaataatctgcataaaattcaatagcttatataaaa
tttaataatttatataaacattatcaacctatataaaatttaataacttatataaatatt
atcaacctatataaaatttagtaatttatataaatattatcaatctatataaaatttaat
aacttatataaatattatcaacctatataaaatttagtaatttatataaatattatcaac
ctatataaaatttaataatttatataaatattatcaatctatataaaatttgataactta
tataaatttaactaatttatataaaatcttaaggagttgccatgataaaaaaaatagagc
atgtggtcattactaataataatatagaaaattatatcaatttttataaaaaatttggtt
tttc