Block details
fasta C_difficile_CD00300_1A_020709.fasta
contig u00000crpx_c_020709
start 3534806
length 13739
strand +
type core
seq tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat
gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt
agccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccataaagtagttccctgcataat
gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc
gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac
acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt
tatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata
tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt
attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg
tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc
taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga
atacccctttatagtagttgctccaataagttttcttatttcatgcttatgaagtaataa
ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg
aacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac
tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt
ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc
catataaatctcaccttctttgctagaaatttgttccataaatgttagaaatttactaaa
tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt
caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgta
tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagtaa
tactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctatcttctatc
ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct
atcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctaaat
aattttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaaaatgttt
attgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaacttc
ttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaatata
gagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagtggggagaaatttgtatg
gatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggaaaaagcgaatttgag
atattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatgggattatat
tttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataattcatca
ataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctgaaactaag
attggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatgaatca
atgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttttagacat
tatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattattctattgt
tgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgctttactt
ggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttctggaatgt
gttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggtgaagaattaaaggta
gatggtaactttgcaatagcaagaacatctggtgttaatttttctgttacaaaatcagat
aaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactggtagt
ggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagcaatg
cctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataaatat
ttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattattattataa
aatcagagtgtggaaatgtttatgtgtattctttaaataaaaatttccacattctgtaag
gttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttataaacata
ttaaggtaatgatttctcttagtaattattctcatatcttattctttgattatatttatc
ttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataattagcattaa
cttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaaaaagtttac
atctatattaatttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttgatttt
aaaaatttaagtgaatttgttcttatacacatctttttaaaattatatctgtagaaaata
tcatttagagctataattaaattaacttattaaattttagaaaatttattaaaaaatata
agttaaattaatatttttaaagattcttttttataactactagaatagtaatttagtagt
tattgtatctctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctataattt
acctactacttggagtaaatacaatatattaataataagttcctaaagccaataaattaa
ctaatacacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaacggatttaacagaa
tttaatcaagctaagaaattatatatatcgtgatgtttttgaattagaaggtaattcaaa
attagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattgttagtaa
aatttttaaagattttatggataaatataagtagttttacttattgtctaaaactttaaa
ataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaa
tttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaata
tacaatctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcactagcaaaagaagat
aaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaac
ttattagatgaaggaagctctgtattctttggtattggtatgaaaccgaattattgtgga
atgggaattggtaaagaaataattagcctaagattacaagaatgtagaaataaatatagt
actaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttatgag
tctcaaggatttaaaatagttgagactaaggtacaaaaaacgcatttaggagatggagaa
ttttttgttatgaggtatcaatagtttataacaatagtcttattgttaatacaacaatta
aaataaaaaaatacatatgtgtaggtcatagcaataagtgtctttgaaatataaatttga
gagcttttgataaaatttggtatacatatatattttatactacggatatataaatctatc
tacatacataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaatagatttatatttcata
aatgtaccttttatttgtattaactttattttatctaagctctcattttattatctaatc
ttcctttttactggttttattaagagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatc
agccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaaaattttccaaca
tacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatcatataacctatg
attgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgat
gcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaaca
tttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagtatcctaattaat
tgtacaataacttgagataatgcttttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgc
tctagcgaaaatacaggtaccaacattactatccctattattgcaacataattttctaaa
catatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacat
agcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttatt
agaactaaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctc
atataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagcttatcacaattctatt
aatcataatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaatacactattatgtct
tatcattagccccattgttgaataatcgcctttgagtcctgtagaatttatactgtaaag
ccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcat
tcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaa
tgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatc
tttcatacctaaaattaatacaggcaatatcatcataaagacaagtgcaaaatatcttga
taaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacg
cttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacc
tatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtata
gttgtaattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaatctttgtaactt
gtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattatttcttc
aaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaag
tgaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatatttttctatggtctt
cgttttattttggtctaattttatatacttaactacacctgttggatacgttgtatatgt
gtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatgactttttctgtttt
catagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaatattcctcaatatt
ctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatc
atttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaat
ataatataccatactctttaatatatttttacattcttttataaatagattcatatatta
tctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtc
tcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacatt
cctataactataaatctactttttatattttcaatgtcttttttatctacttcaatacta
tatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgactttt
ccactattcaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgta
gataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgt
tcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatctactattaaaactctgggattatgaatt
aatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagattttactttcaca
ttttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatttttcttcttttt
cttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgtta
ggatacattgaaaagtcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattc
tcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaa
attctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactg
tcgatttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatcttttactaagattg
gatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaacaattttatagaattt
tatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaacttaagatattattta
taaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtat
ctttgtttatgaaatttttttaagtttatgaagttataatttaatatatatttattttat
ttgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattattgga
tataataggatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctgcaactatatatt
gcaaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaagacataagacaa
atttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatataatatgtattt
tcttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgtgatgacactaatattcacaat
ttttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcatcagatgcttcttg
tataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcact
ctcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaatattaaatctttt
tctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgc
tgtaatcaacataacaggaaattctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtac
taatttgctaaatatattatcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtg
aatggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaac
aaaatcttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttatttt
agtataacatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcgtttttttaattgt
aacttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaa
atttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattatttt
ttcctaaaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgactataaataagaacta
ttactttttaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctatttattagcttc
aaataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataagtttaaatttta
aactataagagtttctgaagtgttaataagcatatcaataattatatgtgtaagaatttg
atttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaacctattgttataaa
ttctataaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgat
acacttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattaggtattttta
aattatctgtttacattaaatatctcttaattacttatctttcagttaactatttccatt
agatatttctcaattacctatttttatcatttattttatagagtattgtgcactatatat
ttatacatatcataaatactacaacttgttatctcttattttagctgttttatctactcc
tctattttttcaactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacattaacactttcaacc
tttatcttaacaaggtctcctatcttatatgacttcttagttctttctcctaaaacacta
taagaactctcatcataaatatagtaatcatcattcatatttgcaagtcttatcaaccct
tctatagtattatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgctagatacaacaccc
tcaaattcttgaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaatcatgtacatct
ctttcagctaactctgcctttctttctttctcggatgattgaacagatgcataatccact
atagtagtaagctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaagattcttttatt
attctatgaatttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaagtgacagtagaat
ttagctgctaatccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagcttgttttaaagaa
cgaagcattatagtactgatagctccttcttcttttttgccctttattttctctattata
ccttgtaatgcttttggatgtacttcctctttatcaccttttattatatatccaaatgta
gatataaacttactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctcatgtattctatac
acaaacggtattcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcattacttataagcata
aattcttctattatcttattagatattcttctttcatatggctttatatctacaacttcg
ccttttccatttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctatagctcctcttttt
tcccttcttgacataagaatcctagctaaaatttcagcatttttaaaatcttcaacaaca
tgttcaaaagtatttttaagtttttcatcatccttttctaatatatcagatacttctgta
taagtcattctagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgtttaaccacattt
cctttatggtctatttccataaatatagaaagagttagcttatcttcaaatggatttaag
ctacatactccatttgaaagagtttttggcaacattggaattactttatctactaaataa
actgatgtagctctttttaaggcttccttgtcaagtttatttttctctcttacataatgt
gtaacatcagctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaatacttctattgat
atggcatcatctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatgtttaaatctctt
aaatctcttcttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctacagcttctgcttct
tgcaatactttctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttattatagaatctatt
tctacgcctctttcacctttttgacctagtatctctataattttgccttctggttttcta
tcctcttgtggccatactgtaatttcacatactaccttatcattatctactgctccacta
aaatgttttttaggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtctggtgttacaaat
ccaaaagttttacttgattggaaagtacctactattctagttatttctctctttattact
tttactattcttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactactatttctgccata
actctatcattatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaataaatcctgtgta
tattcaacatcagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgatacaaattttccaaca
aagtatcccatttgattgggagatactatttttccttttttagtaaagcagatataacca
tcttcttctaattcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgatgaatgtatatca
aatatttctgctaattcttctttttttagaggattatatgcactttcatttattaatcct
agcaaactttctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttacttttcattatatt
attatttatattgtcttttatatttcttcagacaaaacattttttacttatcacataatt
ttctatatttccttattattattacaagttaaaattacttatttatatttttgatttaat
gtaagctttgtcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattatttgtaaata
tcattataattacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctttatcaccta
attatacaccatcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtattactatataa
taatttattctattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaattaatttttt
aaatacaactttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgttaaatgaggtt
gattttttattattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttttttgacaag
tctttattttgtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaatttaaacta
atctatttattggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattattactatagaa
aatggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataatgactcaaaa
aagtgttattatctatcaatctacttatataggtcagaatattatcaagtaagagaattg
gctgtgtttatacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgttatttttaaaa
gataatgtgagtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaatcatttgat
tattattgcagtgaagtaggatatgaaaaggctcttcctgttataaaagaatggcttaat
tctgatagtccaaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttcgaatttggactagtaga
gactattttaaatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagtttaaaagaagat
gatagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagtaaaaaatat
ccagatttagtaaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaagttgagttt
gtatataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaacttatttga
aacttcgtgatgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataaaaggcaaat
ggaaatctattatattatggagattacgtataggaccaacttccttatcaaaacttgaaa
aggaaatcaatggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaattaattgaat
ttggtcttgtagataaaaagacatatgaaggttacccacttaaagttgaatactcactta
cacctattcgagggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagatataggaatta
gctttatgttggataatggtatagaagatattcttaaggaaaaaggtgttttaaagtaaa
tagatacccacaaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtatataattaaatt
atagatatattctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaagtaactagta
caggtatagtaaatggtgttatagaagataaatacggtaaaagaggaactcagttcaatg
aaggtggtatgcctacatattcactacctctaaagtttgaagatgctccaaagaatacag
tatcctttgctgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtgggtttgcatgga
tacattggttagctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaaagtgtaacag
ctactgattttgtacaagggactactagttggcatggtaaactaggaggtcttgacagat
tagaggccagtgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtctatgaaatac
atgtatttgcacttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatgaatgaatttt
tcaaagctattgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagttattctaatt
aattaggttgactatagctaatcattaattaaatgctacatttaattgatgattagctta
attgttattagaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttgactggtattt
taatttatattagattattatcaatttatataaattgattttaacttaaaacttacttat
ctatttcaatttctattagaattattattagactcattaaaataaaagcattaatataac
taataatatatgttaaattcattaactctacatgaagttttataatctaaatgaaataca
ataatctgcataaaattcaatagcttatataaattatcaacctatataaaatttaataac
ttatataaatattatcaatctatataaaatttaataatttatataaatatcatcaatcta
tataaaatttaataacttatataaatattatcaatctatataaaatttaataacttatat
aaatattatcaatctatataaaatttaataacttatataaatattatcaatctatataaa
atttaataatttatataaatatcatcaatctatataaaatttaataacttatataaatat
tatcaatctatataaaatttaataacttatataaaatcttaaggagttgccatgataaaa
aaaatagaacatgtggtcattactaataataatatagaaaattatatcaatttttataaa