Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00133_1A_020483.fasta |
contig | u00000crpx_c_020483 |
start | 3645388 |
length | 13801 |
strand | + |
type | core |
seq | tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt agccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt tatagtccagtagacttttctcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga atacccctttatagtagttgctccaataagctttcttatttcatgcttatgaagtaatag ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg aacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc catataaatctcaccttctttgctagaaatttgttccataaatgttagaaatttactaaa tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgta tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagtaa tactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctatcttctatc ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct atcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatct tctaaataattttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaa aatgtctattgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaa aaacttcttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatg taatatagagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagtggggagaaat ttgtatggatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcga atttgagatattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatggg attatattttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataa ttcatcaataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctga aactaagattggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaa tgaatcaatgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttt tagacattatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattatt ctattgttgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgc tttacttggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttct ggaatgtgttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggtgaagaatt aaaggtagatggtaactttgcaatagcaagaacatctggtgttaatttttctgttacaaa atcagataaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttac tggtagtggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttgg agcaatgcctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgtttta taaatatttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattatt attataaaatcagagtgtggaaatatttatgtgtattctttaaataaaaatttccacatt ctgtaaagttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttat aaacatattaaggtaatgatttctcttggtagttattctcatatcttattctttgattat atttatcttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataatta gcattaacttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaatt tcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttgattttaaaaatttaagtg aatttgttcttatacacacctttttaaaattatatctgtagaaaatatcatttagagcta taattaaattaacttattaaattttagaaaatttattaaaaaatataagttaaattaata tttttaaagattcttttttgtaactactagaacactaatttagtagttattgtatctcta aagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctataatttacctactacttgg attattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaaaaccaataaattaactaat acacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaacggatttaacagaatttaa tcaagctaagaaattatatatatcgtgatgtttttgaattagaaggtgattcaaaattag tttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattgttagtaaaattt ttaaagattttatggataaatataaatagttttacttattttctaaaactttaaaatacc attaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaatttac tgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaatatacaa tctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcactagcaaaagaagataaaag aaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaacttatt agatgaaggaagctctgtattctttggtattggtatgaaaccgaattattgtggaatggg aattggtaaagaaataattagcctaggattacaagaatgtagaaataaatatagtactaa accaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttatgagtctca aggatttaaaatagttgagactaaggtacaaaaaacgcatttaagagatggagaattttt tgttatgaggtatcaatagtttataacaatagtcttattgttaatacaacaattaaaata aaaaaatacatatgtgtaggccatagcaataagtgtctttgaaatataaatttgagagct tttgataaaattttgtatacatatatattttatactacggatatataaatctatctacat atataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaatagatttatatttcataaatgt actttttatttgtattacctttattttatctaagctctcattttattatctaatcttcct ttttactggttttattaagagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatcagcca atatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaaaattttccaacatactt gcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatcatataacctatgattgt attattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgatgcgaa acttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaacatttac aaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagtatcctaattaattgtac aataacttgagataatgcttttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgctctag cgaaaatacgggtaccaacattactatccctattattgcaacataattttctaaacatat agctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacatagcaa tataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttattagaac taaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctcatata agaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagcttatcacaattctattaatca taatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaatacactattatgtcttatca ttagtcccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaatttatactgtaaagccacc aaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcattccta cagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaatgcta agttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatctttca tacctaaaattaatacaggcaatatcatcataaagacaagtgcaaaatatcttgataaaa ctattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacgcttat ctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacctatat aatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtatagttgt aatttttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaatctttgtaacttgtcaa aagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattatttcttcaaatc tttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaagtgaat ttatttcgctaataattttaccagttatttcttctatatatttttctatggtcttcgttt tattttggtctaattttatatacttaactacacctgttggatacgttgtatatgtgtttt tttgatattctctaattaggtttatagttgcatttgaaatgactttttctgttttcatag attctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaatattcctcaatattctcta ctttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatcatttg aaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaatataat ataccatactctttaatatatttttacattcttttataaatagattcatatattatctcc tcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtctcaaa aggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacattcctat aactataaatctactttttatattttcaatgtcttttttatctacttcaatactatatac tttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgacttttccact attcaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgtagataa aataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgttcttc tgggtcaagacctgctgtcggctcatctactattaaaactctgggattatgaattaatgc ttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagattttactttcacattttg ataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatttttcttctttttcttag tggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgttaggata cattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattctcaat aggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaaattct cataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactgtcgat ttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatcttttactaagattggatac tgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaataattttatagaattttattt ttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaacttaagatattatttataaat ttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtatctttg tttctgaaattttttaagtttatgaagttataatttaatatatatttattttatttgtga gtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattactggatataat aagatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctgcaactatatattgcaaaa atttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaagacataagacaaatttgc ctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatataatatgtattttcttct atacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgtgatgacactaatattcacaatttttag taattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcattagatgcttcttgtataaa atttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcactctcatc attcataacaggataaatattattttctaacatctcattaatattaaatctttttctaaa tgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgctgtaat caacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtactaattt gctaaatatattatcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtgaatggc atgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaacaaaatc ttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttattttagtata acatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcgtttttttaattgtaactta taattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaaatttaa atacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattattttttccta aaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgactataaataagaactattactt tttaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctatttattagcttcaaataa aaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataaatttaaattttaaactat aagagtttctgaagtgttaataagcatatcaataattatatgtgtaagaatttgatttaa tagatattaataatttttacattaattataaatatattaacctattgttataaattctat aaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgatacactt atttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattaggtatttttaaattat ctgtttacattaaatatctcttaattacttatctttcagctagcttcttctattaaatgt ttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttattt ttcaattagccacttctattaaacatttcttaattatttatttttcagttggctttttct attaaatgtttcttaattacttatctttcagttagctctttctattaaacatttctcaat tacttatttttcaattagctactttcattaaatatttcttaattatttatctttcagtta actatttccattagatatttctcaattacctatttttatcatttattttatagagtattg tgcactatatatttatacatatcataaatactacaacttgttatctcttattttagctgt tttatctactcctctattttttcaactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacatta acactttcaacctttatcttaacaaggtctcctatcttatatgacttcttagttctttct cctaaaacactataagaactctcatcataaatatagtagtcatcattcatatttgcaagt cttatcaatccttctatagtattatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgcta gatacaacaccctcaaattcttgaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaa tcatgtacatctctttcagctaactctgcctttctttctttctcggatgattgaacagat gcataatccactatagtagtaagctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaa gattcttttattattctatgaatttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaag tgacagtagaatttagctgctaatccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagct tgttttaaagaacgaagcattatagtactgatagctccttcttcttttttgccctttatt ttctctattataccttgtaatgcttttggatgtacttcctctttatcaccttttattata tatccaaatgtagatataaacttactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctca tgtattctatacacaaatggtattcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcatta cttataagcataaattcttctattatcttattagatattcttctttcatatggctttata tctacaacttcgccttttccatttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctata gctcctcttttttcccttcttgacataagaatcctagctaaaatttcagcatttttaaaa tcttcaacaacatgttcaaaagtctttttaagtttttcatcatccttttctaatatatca gatacttctgtataagtcattctagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgt ttaaccacatttcctttatggtctatttccataaatatagaaagagttaacttatcttca aatggatttaagctacatactccatttgaaagagtttttggcaacattggaattacttta tctactaaataaactgatgtagctctttttaacgcttccttgtcaagtttatttttctct cttacataatgtgtaacatcagctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaat acttctattgatatggcatcatctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatg tttaaatctcttaaatctcttcttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctaca gcttctgcttcttgcaatactttctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttatt atagaatctatttctacgcctctttcacctttttgacctagtatctctataattttgcct tctggttttctatcctcttgtggccatactgtaatttcacatactaccttatcattatct actgctccactaaaatgttttttaggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtct ggtgttacaaatccaaaagttttacttgattggaaggtacctactattctagttatttct ctctttattacttttactattcttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactact atttctgccataactctatcattatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaat aaatcctgtgtatattcaacatcagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgataca aattttccaacaaagtatcccatttgattgggagatactatttttccttttttagtaaag cagatataaccatcttcttctaattcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgat gaatgtatatcaaatatttctgctaattcttctttttttagaggattatatgcactttca tttattaatcctagcaaactttctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttact tttcattatattattatttatattgtcttttatatttcttcagacaaaacattttttact tatcacataattttctatattttcttattattataagttaaaattacttatttatatttt tgatttaatgtaagctttgtcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattat ttgtaaatatcattataattacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctt tatcacctaattatacaccatcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtatt actatataataatttattctattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaat taattttttaaatacaactttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgtta aatgaggttgattttttattattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttt tttgacaagtctttattttgtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaa tttaaactaatctatttattggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattatt actatagaaaatggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataat gactcaaaaaagtgttattatctatcaatctacttatataggtcagagtattatcaagta agagaattggctgtgtttatacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgtta tttttaaaagataatgtgagtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaa tcatttgattattattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcacttcctgttataaaagaa tggcttaattctgatagtccaaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttcgaatttgg actaatagagactattttaaatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagttta aaagaagatgatagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagt aaaaaatatccagatttagtaaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaa gttgagtttgtatataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaa cttatttgaaacttcgtgatgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataa aaggcaaatggaaatctattatattatggagattacgcataggaccaacttccttatcaa aacttgaaaaggaaatcaatggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaat taattgaatttggtcttgtagataaaaagacatatgaaggttacccacttaaagttgaat actcacttacacctattcgagggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagata taggaattagctttatgttggataatggtatggaagatattcttaaggaaaaaggtgttt taaagtaatatagatacccacaaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtata taattaaattatagatatattctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaa gtaactagtacaggtatagtaaatggtgttatagaagataaatacggtaaaagaggaact cagttcaatgaaggtggtatgcctacctattcactacctctaaagtttgaagatgctcca aagaatacagtatcctttgctgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtggg tttgcatggatacattggttagctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaa agtgtaacagctactgattttgtacaagggactactagttggcatggtaaactaggaggt cttgacagattagaggccagtgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtc tatgaaatacatgtatttgcacttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatg aatgaatttttcaaagctattgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagt tattctaattaattaggttgactatagctaatcattaattaaatgctacatttaattgat gattagcttaattgttattagaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttg actggtattttaatttctattagattattatcaatttatataaattgattttagcttaaa acttacttatctatttcagtttctattagaattattattagactcattaaaataaaagca ctaatataactaataatatatgttaaattcattaactctacataaagttttataatctaa atgaaatacaataatctgcataaaattcaatagcttatataaaatttagtaatttatata aatattatcaacctatataaaatttaataatttatataaatatcatcaatctatataaaa tttaataacttatataaatattatcaacctatataaaatcttaaggagttgccatgataa aaaaaatagagcatgtggtcattactaataataatatagaaaattatatcaatttttata aa |