Block details
fasta C_difficile_CD00133_1A_020483.fasta
contig u00000crpx_c_020483
start 3645388
length 13801
strand +
type core
seq tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat
gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt
agccagtcccaattaatctacttcaagtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat
gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc
gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac
acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt
tatagtccagtagacttttctcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata
tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt
attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg
tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc
taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga
atacccctttatagtagttgctccaataagctttcttatttcatgcttatgaagtaatag
ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg
aacttgttttaaaaatacttcgctattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac
tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt
ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc
catataaatctcaccttctttgctagaaatttgttccataaatgttagaaatttactaaa
tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt
caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaatgta
tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactctaaccagtaa
tactaatttataaatttcaaaacaaaaatattacatattataaatcttctatcttctatc
ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct
atcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatct
tctaaataattttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaa
aatgtctattgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaa
aaacttcttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatg
taatatagagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagtggggagaaat
ttgtatggatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcga
atttgagatattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatggg
attatattttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataa
ttcatcaataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctga
aactaagattggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaa
tgaatcaatgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttt
tagacattatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattatt
ctattgttgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgc
tttacttggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttct
ggaatgtgttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggtgaagaatt
aaaggtagatggtaactttgcaatagcaagaacatctggtgttaatttttctgttacaaa
atcagataaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttac
tggtagtggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttgg
agcaatgcctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgtttta
taaatatttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattatt
attataaaatcagagtgtggaaatatttatgtgtattctttaaataaaaatttccacatt
ctgtaaagttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttat
aaacatattaaggtaatgatttctcttggtagttattctcatatcttattctttgattat
atttatcttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataatta
gcattaacttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaatt
tcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttgattttaaaaatttaagtg
aatttgttcttatacacacctttttaaaattatatctgtagaaaatatcatttagagcta
taattaaattaacttattaaattttagaaaatttattaaaaaatataagttaaattaata
tttttaaagattcttttttgtaactactagaacactaatttagtagttattgtatctcta
aagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctataatttacctactacttgg
attattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaaaaccaataaattaactaat
acacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaacggatttaacagaatttaa
tcaagctaagaaattatatatatcgtgatgtttttgaattagaaggtgattcaaaattag
tttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattgttagtaaaattt
ttaaagattttatggataaatataaatagttttacttattttctaaaactttaaaatacc
attaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaatttac
tgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaatatacaa
tctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcactagcaaaagaagataaaag
aaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaacttatt
agatgaaggaagctctgtattctttggtattggtatgaaaccgaattattgtggaatggg
aattggtaaagaaataattagcctaggattacaagaatgtagaaataaatatagtactaa
accaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttatgagtctca
aggatttaaaatagttgagactaaggtacaaaaaacgcatttaagagatggagaattttt
tgttatgaggtatcaatagtttataacaatagtcttattgttaatacaacaattaaaata
aaaaaatacatatgtgtaggccatagcaataagtgtctttgaaatataaatttgagagct
tttgataaaattttgtatacatatatattttatactacggatatataaatctatctacat
atataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaatagatttatatttcataaatgt
actttttatttgtattacctttattttatctaagctctcattttattatctaatcttcct
ttttactggttttattaagagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatcagcca
atatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaaaattttccaacatactt
gcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatcatataacctatgattgt
attattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgatgcgaa
acttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaacatttac
aaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagtatcctaattaattgtac
aataacttgagataatgcttttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgctctag
cgaaaatacgggtaccaacattactatccctattattgcaacataattttctaaacatat
agctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacatagcaa
tataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttattagaac
taaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctcatata
agaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagcttatcacaattctattaatca
taatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaatacactattatgtcttatca
ttagtcccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaatttatactgtaaagccacc
aaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcattccta
cagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaatgcta
agttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatctttca
tacctaaaattaatacaggcaatatcatcataaagacaagtgcaaaatatcttgataaaa
ctattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacgcttat
ctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacctatat
aatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtatagttgt
aatttttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaatctttgtaacttgtcaa
aagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattatttcttcaaatc
tttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaagtgaat
ttatttcgctaataattttaccagttatttcttctatatatttttctatggtcttcgttt
tattttggtctaattttatatacttaactacacctgttggatacgttgtatatgtgtttt
tttgatattctctaattaggtttatagttgcatttgaaatgactttttctgttttcatag
attctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaatattcctcaatattctcta
ctttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatcatttg
aaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaatataat
ataccatactctttaatatatttttacattcttttataaatagattcatatattatctcc
tcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtctcaaa
aggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacattcctat
aactataaatctactttttatattttcaatgtcttttttatctacttcaatactatatac
tttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgacttttccact
attcaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgtagataa
aataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgttcttc
tgggtcaagacctgctgtcggctcatctactattaaaactctgggattatgaattaatgc
ttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagattttactttcacattttg
ataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatttttcttctttttcttag
tggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgttaggata
cattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattctcaat
aggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaaattct
cataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactgtcgat
ttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatcttttactaagattggatac
tgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaataattttatagaattttattt
ttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaacttaagatattatttataaat
ttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtatctttg
tttctgaaattttttaagtttatgaagttataatttaatatatatttattttatttgtga
gtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattactggatataat
aagatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctgcaactatatattgcaaaa
atttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaagacataagacaaatttgc
ctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatataatatgtattttcttct
atacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgtgatgacactaatattcacaatttttag
taattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcattagatgcttcttgtataaa
atttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcactctcatc
attcataacaggataaatattattttctaacatctcattaatattaaatctttttctaaa
tgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgctgtaat
caacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtactaattt
gctaaatatattatcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtgaatggc
atgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaacaaaatc
ttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttattttagtata
acatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcgtttttttaattgtaactta
taattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaaatttaa
atacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattattttttccta
aaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgactataaataagaactattactt
tttaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctatttattagcttcaaataa
aaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataaatttaaattttaaactat
aagagtttctgaagtgttaataagcatatcaataattatatgtgtaagaatttgatttaa
tagatattaataatttttacattaattataaatatattaacctattgttataaattctat
aaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgatacactt
atttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattaggtatttttaaattat
ctgtttacattaaatatctcttaattacttatctttcagctagcttcttctattaaatgt
ttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttattt
ttcaattagccacttctattaaacatttcttaattatttatttttcagttggctttttct
attaaatgtttcttaattacttatctttcagttagctctttctattaaacatttctcaat
tacttatttttcaattagctactttcattaaatatttcttaattatttatctttcagtta
actatttccattagatatttctcaattacctatttttatcatttattttatagagtattg
tgcactatatatttatacatatcataaatactacaacttgttatctcttattttagctgt
tttatctactcctctattttttcaactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacatta
acactttcaacctttatcttaacaaggtctcctatcttatatgacttcttagttctttct
cctaaaacactataagaactctcatcataaatatagtagtcatcattcatatttgcaagt
cttatcaatccttctatagtattatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgcta
gatacaacaccctcaaattcttgaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaa
tcatgtacatctctttcagctaactctgcctttctttctttctcggatgattgaacagat
gcataatccactatagtagtaagctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaa
gattcttttattattctatgaatttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaag
tgacagtagaatttagctgctaatccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagct
tgttttaaagaacgaagcattatagtactgatagctccttcttcttttttgccctttatt
ttctctattataccttgtaatgcttttggatgtacttcctctttatcaccttttattata
tatccaaatgtagatataaacttactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctca
tgtattctatacacaaatggtattcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcatta
cttataagcataaattcttctattatcttattagatattcttctttcatatggctttata
tctacaacttcgccttttccatttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctata
gctcctcttttttcccttcttgacataagaatcctagctaaaatttcagcatttttaaaa
tcttcaacaacatgttcaaaagtctttttaagtttttcatcatccttttctaatatatca
gatacttctgtataagtcattctagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgt
ttaaccacatttcctttatggtctatttccataaatatagaaagagttaacttatcttca
aatggatttaagctacatactccatttgaaagagtttttggcaacattggaattacttta
tctactaaataaactgatgtagctctttttaacgcttccttgtcaagtttatttttctct
cttacataatgtgtaacatcagctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaat
acttctattgatatggcatcatctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatg
tttaaatctcttaaatctcttcttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctaca
gcttctgcttcttgcaatactttctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttatt
atagaatctatttctacgcctctttcacctttttgacctagtatctctataattttgcct
tctggttttctatcctcttgtggccatactgtaatttcacatactaccttatcattatct
actgctccactaaaatgttttttaggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtct
ggtgttacaaatccaaaagttttacttgattggaaggtacctactattctagttatttct
ctctttattacttttactattcttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactact
atttctgccataactctatcattatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaat
aaatcctgtgtatattcaacatcagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgataca
aattttccaacaaagtatcccatttgattgggagatactatttttccttttttagtaaag
cagatataaccatcttcttctaattcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgat
gaatgtatatcaaatatttctgctaattcttctttttttagaggattatatgcactttca
tttattaatcctagcaaactttctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttact
tttcattatattattatttatattgtcttttatatttcttcagacaaaacattttttact
tatcacataattttctatattttcttattattataagttaaaattacttatttatatttt
tgatttaatgtaagctttgtcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattat
ttgtaaatatcattataattacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctt
tatcacctaattatacaccatcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtatt
actatataataatttattctattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaat
taattttttaaatacaactttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgtta
aatgaggttgattttttattattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttt
tttgacaagtctttattttgtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaa
tttaaactaatctatttattggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattatt
actatagaaaatggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataat
gactcaaaaaagtgttattatctatcaatctacttatataggtcagagtattatcaagta
agagaattggctgtgtttatacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgtta
tttttaaaagataatgtgagtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaa
tcatttgattattattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcacttcctgttataaaagaa
tggcttaattctgatagtccaaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttcgaatttgg
actaatagagactattttaaatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagttta
aaagaagatgatagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagt
aaaaaatatccagatttagtaaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaa
gttgagtttgtatataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaa
cttatttgaaacttcgtgatgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataa
aaggcaaatggaaatctattatattatggagattacgcataggaccaacttccttatcaa
aacttgaaaaggaaatcaatggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaat
taattgaatttggtcttgtagataaaaagacatatgaaggttacccacttaaagttgaat
actcacttacacctattcgagggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagata
taggaattagctttatgttggataatggtatggaagatattcttaaggaaaaaggtgttt
taaagtaatatagatacccacaaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtata
taattaaattatagatatattctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaa
gtaactagtacaggtatagtaaatggtgttatagaagataaatacggtaaaagaggaact
cagttcaatgaaggtggtatgcctacctattcactacctctaaagtttgaagatgctcca
aagaatacagtatcctttgctgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtggg
tttgcatggatacattggttagctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaa
agtgtaacagctactgattttgtacaagggactactagttggcatggtaaactaggaggt
cttgacagattagaggccagtgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtc
tatgaaatacatgtatttgcacttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatg
aatgaatttttcaaagctattgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagt
tattctaattaattaggttgactatagctaatcattaattaaatgctacatttaattgat
gattagcttaattgttattagaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttg
actggtattttaatttctattagattattatcaatttatataaattgattttagcttaaa
acttacttatctatttcagtttctattagaattattattagactcattaaaataaaagca
ctaatataactaataatatatgttaaattcattaactctacataaagttttataatctaa
atgaaatacaataatctgcataaaattcaatagcttatataaaatttagtaatttatata
aatattatcaacctatataaaatttaataatttatataaatatcatcaatctatataaaa
tttaataacttatataaatattatcaacctatataaaatcttaaggagttgccatgataa
aaaaaatagagcatgtggtcattactaataataatatagaaaattatatcaatttttata
aa