Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00028_1A_020475.fasta |
contig | u00000crpx_c_020475 |
start | 3576830 |
length | 13817 |
strand | + |
type | core |
seq | tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt agccagtcccaattaatctacttcaggtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt tatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga atacccctttatagtagttgctccaataagttttcttatttcatgcttatgaagtaatag ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg aacttgttttaaaaatacttcactattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc catataaatctcaccttctttgttagaaatttattccataaatgttagaaatttactaaa tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaagata tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactttaaccagtaa cactgatttctaaatttcaaaacaaaaatattacatattataaattttctatcttctatc ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct aaataattttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaaaat atctattgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaa cttcttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaa tatagagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagttgggagaaatttg tatggatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcgaatt tgaaatattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatgggatt atattttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataattc atcaataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctgaaac taagattggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatga atcaatgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttttag acattatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattattcta ttgttgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgcttt acttggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttctgga atgtgttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggagaagaattaaa ggtagatggtaactttgcaatagcaagaacatctggggttaatttttctgttacaaaatc agataaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactgg taatggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagc aatgcctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataa atatttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattattatt ataaaatcagagtgtggaaatgtttatgtgtattctttaaataaaaatttccacattctg taaggttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttataaa catattaaggtaatgatttctcttggtaattattctcatatcttattctttgattatatt tatcttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataattagca ttaacttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaaaaagt ttacatctatattaatttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttga ttttaaaaatttaagtgaatttgttcttatacacatctttttaaaattatatctgtagaa aatatcatttagagctataattaaattattaaattttagaaaatttattaaaaaatataa gttaaattaatatttttaaagattcttttttataactactagaatactaatttagtagtt attgtatctctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctataattta cctactacttggagtattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaaaaccaat aaattaactaatacacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaacagattt aacagaatttaatcaagctaagaaattacatatatcgtgatgtttttgaattagaaggta attcaaaattagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattg ttagtaaaatttttaaagattttatggatagatataaatagttttacttattttgtaaaa tttaaaataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaatttaaataaa gttaaatttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatat tcaatatacaacctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcactatcaaaa gaagataaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgataggtttt ataaacttattggatgaaggaagttatgtattctttggtattggtataaaaccagattat tgtggaatgggaattggcaaagaaataattagcctaggattacaagaatgtagaaataaa tatagtactaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgt tataagtctcaaggatttaaaatagttgagactcaggtacagaaaacgcatttaggggat ggagaattttttgttatgaggtatcaatagtttataacactagtcatattgctaatatga caattaaaatgaaaaaatacatgtgtgtatgtcatagcaataagtgtctttgaaatataa atttgagagcctttgataaaattcggtatacatatatattttatactacagatatataaa tctatctacatacataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaataaatttatat ttcataaatgtactttttatttgtattacctttattttatctaagctctcattttattac ctaatcttcctttttattggttttattaagagagatgcaattatcaacacaacacttcca agtatcagccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaaaatttt ccaacatacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatcatgtaa cctatgattgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacata gctgatgcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaagatatatt aaaacatttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagtatccta attaattgtacaataacttgagataatgattttgaagatactatctcatcaatttctttt gattgctctagcgaaaatacaggtaccaacattactatccctattattgcaacataattt tctaaacatatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattagaggaatc atacatagcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttct tttattagaactaaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattcccccttctttt ttgctcatataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagcttatcacaat tctattaatcataatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaatacactatt atgtcttatcattagccccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaatttatact gtaaagccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatatagtaat actcattcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgtatattt tataaatgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaag taaatctttcatacctaaaattaatacaggcaatatcattataaagacaagtgcaaaata tcttgataaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctctcattct tgaacgcttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaac tatacctatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctttttgtat tgtatagttgtaattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaatctttg taacttgtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattat ttcttcaaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatcagtttt ccaaattaaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatatttttctat ggtcttcgttttattttggtctaattttatatacttaactacccctgttggatacgttgt atatgtgtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatgaccttttc tgttttcatagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaatattcgtc aatattctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatttttact tacatcatttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaat aaaaatataatataccatactctttaatatatttttacattcttttataaatagattcat atattatctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaatttact gctgtctcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccaccatgagtc aacattcctataactataaatctactttttatattttcaatgtcttttttatctacttca atactatatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatg acttttccactatccaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctccaacaata tgtgtagataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatctt atacgttcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatccactattaaaactctgggatta tgaattaatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagattttact ttcacattttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatttttctt ctttttcttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatatactgtc atgttaggatacattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatttcctta gtattctcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtg gctaaaattctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacata ccactgtcgatttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatcttttacta agattggatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaataattttata gaattttatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaacttaagatat tatttataaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaattaaatta aagtatctttgtttctgaaattttttaagtttatgaagctataatttaatatatatttat tttatttgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaatta ctggatataataagatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctgcaactat atattgcaaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaagacataa gacaaatttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatataatatg tattttcttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgttatgacactaatattc acaattttttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcatcagatgc ttcttgtataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatc ttcactctcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaatattaaa tctttttctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagtttttttacatc atttgctgtaatcaacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgtttccact tagtactaatttgctaaatatattctcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagt aaagtgaatggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggcatcttc aaaaacaaaatcttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcact tattttagtataacatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcgttttttt aattgtaacttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtattatttca tcttaaatttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattat tattttttcctaaaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgactataaataa gaactattacttttaaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctacttatt agcttcaaataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataaatttaa attttaaactataagagtttctgaagtgttaataagcataccaataattatatgtgtaag aatttgatttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaacctattat tataaattctataaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaatttta aatgatacacttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattaggta tttttaaattatctgtttacattaaatatctcttaattacttatctttcagctagcttct tctattaaatgtttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttctt aattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattacttatttttcaa ttagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagtcacttccattaa acatttcttaattatttatttttcagttggctttttctattaaatgtttcttaattactt atctttcagttagctctttctattaaatatttctcaattacttatttttcaattagctac tttcattaaatatttcttaattatttatctttaagttaactatttccattagatatttct taattacctatttttatcatttattttatagagtattgtgcactatatatttatacatat cataaatactacaacttgttatctcttattttagctgttttatctactcctctatttttt caactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacattaacactttcaacctttatcttaa caaggtctcctatcttatatgacttcttagttctttctcctaaaacactataagaactct catcataaatatagtaatcatcattcatatttgcaagtcttatcaatccttctatagtat tatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgctagatacaacaccctcaaattctt gaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaatcatgtacatctctttcagcta actctgcctttctttctttctcggatgattgaacagatgcataatccactatagtagtaa gctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaagattcttttattattctatgaa tttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaagtgacagtagaatttagctgcta atccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagcttgttttaaagaacgaagcatta tagtactgatagctccttcttcttttttgccctttattttctctattataccttgtaatg cttttggatgtacttcctctttatcaccttttattatatatccaaatgtagatataaact tactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctcatgtattctatacacaaacggta ttcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcattacttataagcataaattcttcta ttatcttattagatattcttctttcatatggctttatatctacaacttcgccttttccat ttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctatagctcctcttttttctcttcttg acataagaatcttagctaaaatttcagcatttttaaaatcttcaacaacatgttcaaaag tctttttaattttttcatcatccttttctaatatatcagatacttctgtataagtcattc tagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgtttaaccacatttcctttatggt ctatttccataaatatagaaagagttaacttatcttcaaatggatttaagctacatactc catttgaaagagtttttggcaacattggaattactttatctactaaataaactgatgtag ctctttttaaggcttccttatcaagtttatttttctctcttacataatgtgtaacatcag ctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaatacttctattgatatggcatcat ctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatgtttaaatctcttaaatctcttc ttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctacagcttctgcttcttgcaatactt tctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttattatagaatctatttctacgcctc tttcacctttttgacctagtatctctataattttgccttctggttttctatcctcttgtg gccatactgtaatttcacatactaccttatcattatctactgctccactaaaatgttttt taggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtctggtgttacaaatccaaaagttt tacttgattggaaagtacctactattctagttatttctctctttattacttttactattc ttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactactatttctgccataactctatcgt tatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaataaatcctgtgtatattcaacat cagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgatacaaattttccaacaaagtatccca tttgattgggagatactatttttccttttttagtaaagcagatataaccatcttcttcta attcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgatgaatgtatatcaaatatttctg ctaattcttctttttttagaggattatatgcactttcatttattaatcctagcaaacttt ctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttacttttcattatattattatttata ttgtcttttatatttcttcagataaaacattttttacttatcacataattttctatattt tcttattattattacaagttaaaattacttatttatatttttgatttaatgtaagctttg tcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattatttgtaaatatcattataat tacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctttatctcataattatacacc atcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtattactatataataatttattc tattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaattaattttttaaatacaact ttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgttaaatgaggttgattttttat tattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttttttgacaagtctttatttt gtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaatttaaactaatctatttat tggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattattactatagaaaatggattca aagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataatgactcaaaaaagtgttatt atctatcaatctacttatataggtcagaatattatcaagtaagagaattggctgtgttta tacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgttatttttaaaagacaatgtga gtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaatcatttgattattattgca gtgaagtaggatatgaaaaggcacttcctgttataaaagaatggcttaattctgatagtc caaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttagaatttggactagtagagactatttta aatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagtttaaaagaagatgatagcgaat acttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagtaaaaaatatccagatttag taaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaagttgagtttgtatataagc ttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaacttatttgaaacttcgtga tgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataaaaggcaaatggaaatctat tatattatggagattacgcataggaccaacctccttatcaaaacttgaaaaggaaatcaa tggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaattaattgaatttggtcttgt agataaaaagacatataaaggttacccacttaaagttgaatactcacttacacctattcg agggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagatataggaattagctttatgtt ggataatggtatggaagatattcttaaggaaaaaggtgttttaaaataaatagataccca caaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtatataattaaattatagatatat tctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaagtaactagtacaggtatagt aaatggtgttatagaagataaatacggtaaaagaggaactcagttcaatgaaggtggtat gcctacatattcactacctctaaagtttgaagatgctccaaagaatacagtatcctttgc tgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtgggtttgcatggatacattggtt agctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaaagtgtaacagctactgattt tgtacaagggactactagttggcatggcaaactaggaggtcttgacagattagaggccag tgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtctatgaaatacatgtatttgc acttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatgaatgaatttttcaaagctat tgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagctattctaattaattaggttt actatagctaatcattaattaaatgctacatttaattgatgattagcttaattgttatta gaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttgactggtattttaatttctat tagattattatcaatttatataaattgattttagcttaaaacttacttatctatttcagt ttctattagaattattattagactcattaaaataaaagcattaatataactaataatata tgttaaattcattaactctacataaagttttataatctaaatgaaatacaataatctgca taaaattcaatagcttatataaaatttagtaatttatataaatattatcaatctatataa aatttaataacttatataaatttaactaatttatataaaatcttaaggagttgccatgat aaaaaaaatagagcatgtggtcattactaataataatatagaaaattatatcaattttta taaaaaatttggtttttc |