Block details
fasta C_difficile_CD00028_1A_020475.fasta
contig u00000crpx_c_020475
start 3576830
length 13817
strand +
type core
seq tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat
gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt
agccagtcccaattaatctacttcaggtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat
gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc
gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac
acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt
tatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata
tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt
attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg
tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc
taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga
atacccctttatagtagttgctccaataagttttcttatttcatgcttatgaagtaatag
ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg
aacttgttttaaaaatacttcactattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac
tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt
ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc
catataaatctcaccttctttgttagaaatttattccataaatgttagaaatttactaaa
tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt
caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaagata
tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactttaaccagtaa
cactgatttctaaatttcaaaacaaaaatattacatattataaattttctatcttctatc
ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct
aaataattttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatactcaaaat
atctattgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaa
cttcttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaa
tatagagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagttgggagaaatttg
tatggatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaagcgaatt
tgaaatattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaatgggatt
atattttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaaataattc
atcaataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatcttctgaaac
taagattggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatga
atcaatgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaaccttcttttag
acattatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggattattcta
ttgttgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcatctgcttt
acttggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcgttctgga
atgtgttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggagaagaattaaa
ggtagatggtaactttgcaatagcaagaacatctggggttaatttttctgttacaaaatc
agataaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactgg
taatggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagc
aatgcctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataa
atatttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagattattatt
ataaaatcagagtgtggaaatgtttatgtgtattctttaaataaaaatttccacattctg
taaggttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacatttataaa
catattaaggtaatgatttctcttggtaattattctcatatcttattctttgattatatt
tatcttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttataattagca
ttaacttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatattaaaaagt
ttacatctatattaatttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactttatttga
ttttaaaaatttaagtgaatttgttcttatacacatctttttaaaattatatctgtagaa
aatatcatttagagctataattaaattattaaattttagaaaatttattaaaaaatataa
gttaaattaatatttttaaagattcttttttataactactagaatactaatttagtagtt
attgtatctctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgcctataattta
cctactacttggagtattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaaaaccaat
aaattaactaatacacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaacagattt
aacagaatttaatcaagctaagaaattacatatatcgtgatgtttttgaattagaaggta
attcaaaattagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattg
ttagtaaaatttttaaagattttatggatagatataaatagttttacttattttgtaaaa
tttaaaataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaatttaaataaa
gttaaatttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatat
tcaatatacaacctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcactatcaaaa
gaagataaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgataggtttt
ataaacttattggatgaaggaagttatgtattctttggtattggtataaaaccagattat
tgtggaatgggaattggcaaagaaataattagcctaggattacaagaatgtagaaataaa
tatagtactaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgt
tataagtctcaaggatttaaaatagttgagactcaggtacagaaaacgcatttaggggat
ggagaattttttgttatgaggtatcaatagtttataacactagtcatattgctaatatga
caattaaaatgaaaaaatacatgtgtgtatgtcatagcaataagtgtctttgaaatataa
atttgagagcctttgataaaattcggtatacatatatattttatactacagatatataaa
tctatctacatacataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaataaatttatat
ttcataaatgtactttttatttgtattacctttattttatctaagctctcattttattac
ctaatcttcctttttattggttttattaagagagatgcaattatcaacacaacacttcca
agtatcagccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaaaaatttt
ccaacatacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatatcatgtaa
cctatgattgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacata
gctgatgcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaagatatatt
aaaacatttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcagtatccta
attaattgtacaataacttgagataatgattttgaagatactatctcatcaatttctttt
gattgctctagcgaaaatacaggtaccaacattactatccctattattgcaacataattt
tctaaacatatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattagaggaatc
atacatagcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttct
tttattagaactaaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattcccccttctttt
ttgctcatataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagcttatcacaat
tctattaatcataatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaatacactatt
atgtcttatcattagccccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaatttatact
gtaaagccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaatatagtaat
actcattcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatgtatattt
tataaatgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaag
taaatctttcatacctaaaattaatacaggcaatatcattataaagacaagtgcaaaata
tcttgataaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctctcattct
tgaacgcttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaac
tatacctatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctttttgtat
tgtatagttgtaattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaaatctttg
taacttgtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattat
ttcttcaaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcatcagtttt
ccaaattaaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatatttttctat
ggtcttcgttttattttggtctaattttatatacttaactacccctgttggatacgttgt
atatgtgtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatgaccttttc
tgttttcatagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaatattcgtc
aatattctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatatttttact
tacatcatttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaat
aaaaatataatataccatactctttaatatatttttacattcttttataaatagattcat
atattatctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattacaatttact
gctgtctcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccaccatgagtc
aacattcctataactataaatctactttttatattttcaatgtcttttttatctacttca
atactatatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatg
acttttccactatccaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctccaacaata
tgtgtagataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatctt
atacgttcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatccactattaaaactctgggatta
tgaattaatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaagattttact
ttcacattttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataatttttctt
ctttttcttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttatatactgtc
atgttaggatacattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaatttcctta
gtattctcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtg
gctaaaattctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacata
ccactgtcgatttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatcttttacta
agattggatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaataattttata
gaattttatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaacttaagatat
tatttataaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaattaaatta
aagtatctttgtttctgaaattttttaagtttatgaagctataatttaatatatatttat
tttatttgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaatta
ctggatataataagatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctgcaactat
atattgcaaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaagacataa
gacaaatttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaatataatatg
tattttcttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgttatgacactaatattc
acaattttttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcatcagatgc
ttcttgtataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatc
ttcactctcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaatattaaa
tctttttctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagtttttttacatc
atttgctgtaatcaacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgtttccact
tagtactaatttgctaaatatattctcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagt
aaagtgaatggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttggcatcttc
aaaaacaaaatcttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcact
tattttagtataacatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcgttttttt
aattgtaacttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtattatttca
tcttaaatttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattat
tattttttcctaaaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgactataaataa
gaactattacttttaaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctctacttatt
agcttcaaataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaataaatttaa
attttaaactataagagtttctgaagtgttaataagcataccaataattatatgtgtaag
aatttgatttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaacctattat
tataaattctataaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatcttaaatttta
aatgatacacttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaattaggta
tttttaaattatctgtttacattaaatatctcttaattacttatctttcagctagcttct
tctattaaatgtttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttctt
aattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattacttatttttcaa
ttagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagtcacttccattaa
acatttcttaattatttatttttcagttggctttttctattaaatgtttcttaattactt
atctttcagttagctctttctattaaatatttctcaattacttatttttcaattagctac
tttcattaaatatttcttaattatttatctttaagttaactatttccattagatatttct
taattacctatttttatcatttattttatagagtattgtgcactatatatttatacatat
cataaatactacaacttgttatctcttattttagctgttttatctactcctctatttttt
caactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacattaacactttcaacctttatcttaa
caaggtctcctatcttatatgacttcttagttctttctcctaaaacactataagaactct
catcataaatatagtaatcatcattcatatttgcaagtcttatcaatccttctatagtat
tatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgctagatacaacaccctcaaattctt
gaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaatcatgtacatctctttcagcta
actctgcctttctttctttctcggatgattgaacagatgcataatccactatagtagtaa
gctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaagattcttttattattctatgaa
tttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaagtgacagtagaatttagctgcta
atccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagcttgttttaaagaacgaagcatta
tagtactgatagctccttcttcttttttgccctttattttctctattataccttgtaatg
cttttggatgtacttcctctttatcaccttttattatatatccaaatgtagatataaact
tactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctcatgtattctatacacaaacggta
ttcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcattacttataagcataaattcttcta
ttatcttattagatattcttctttcatatggctttatatctacaacttcgccttttccat
ttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctatagctcctcttttttctcttcttg
acataagaatcttagctaaaatttcagcatttttaaaatcttcaacaacatgttcaaaag
tctttttaattttttcatcatccttttctaatatatcagatacttctgtataagtcattc
tagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgtttaaccacatttcctttatggt
ctatttccataaatatagaaagagttaacttatcttcaaatggatttaagctacatactc
catttgaaagagtttttggcaacattggaattactttatctactaaataaactgatgtag
ctctttttaaggcttccttatcaagtttatttttctctcttacataatgtgtaacatcag
ctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaatacttctattgatatggcatcat
ctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatgtttaaatctcttaaatctcttc
ttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctacagcttctgcttcttgcaatactt
tctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttattatagaatctatttctacgcctc
tttcacctttttgacctagtatctctataattttgccttctggttttctatcctcttgtg
gccatactgtaatttcacatactaccttatcattatctactgctccactaaaatgttttt
taggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtctggtgttacaaatccaaaagttt
tacttgattggaaagtacctactattctagttatttctctctttattacttttactattc
ttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactactatttctgccataactctatcgt
tatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaataaatcctgtgtatattcaacat
cagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgatacaaattttccaacaaagtatccca
tttgattgggagatactatttttccttttttagtaaagcagatataaccatcttcttcta
attcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgatgaatgtatatcaaatatttctg
ctaattcttctttttttagaggattatatgcactttcatttattaatcctagcaaacttt
ctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttacttttcattatattattatttata
ttgtcttttatatttcttcagataaaacattttttacttatcacataattttctatattt
tcttattattattacaagttaaaattacttatttatatttttgatttaatgtaagctttg
tcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattatttgtaaatatcattataat
tacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctttatctcataattatacacc
atcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtattactatataataatttattc
tattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaattaattttttaaatacaact
ttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgttaaatgaggttgattttttat
tattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttttttgacaagtctttatttt
gtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaatttaaactaatctatttat
tggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattattactatagaaaatggattca
aagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataatgactcaaaaaagtgttatt
atctatcaatctacttatataggtcagaatattatcaagtaagagaattggctgtgttta
tacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgttatttttaaaagacaatgtga
gtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaatcatttgattattattgca
gtgaagtaggatatgaaaaggcacttcctgttataaaagaatggcttaattctgatagtc
caaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttagaatttggactagtagagactatttta
aatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagtttaaaagaagatgatagcgaat
acttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagtaaaaaatatccagatttag
taaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaagttgagtttgtatataagc
ttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaacttatttgaaacttcgtga
tgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataaaaggcaaatggaaatctat
tatattatggagattacgcataggaccaacctccttatcaaaacttgaaaaggaaatcaa
tggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaattaattgaatttggtcttgt
agataaaaagacatataaaggttacccacttaaagttgaatactcacttacacctattcg
agggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagatataggaattagctttatgtt
ggataatggtatggaagatattcttaaggaaaaaggtgttttaaaataaatagataccca
caaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtatataattaaattatagatatat
tctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaagtaactagtacaggtatagt
aaatggtgttatagaagataaatacggtaaaagaggaactcagttcaatgaaggtggtat
gcctacatattcactacctctaaagtttgaagatgctccaaagaatacagtatcctttgc
tgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtgggtttgcatggatacattggtt
agctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaaagtgtaacagctactgattt
tgtacaagggactactagttggcatggcaaactaggaggtcttgacagattagaggccag
tgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtctatgaaatacatgtatttgc
acttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatgaatgaatttttcaaagctat
tgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagctattctaattaattaggttt
actatagctaatcattaattaaatgctacatttaattgatgattagcttaattgttatta
gaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttgactggtattttaatttctat
tagattattatcaatttatataaattgattttagcttaaaacttacttatctatttcagt
ttctattagaattattattagactcattaaaataaaagcattaatataactaataatata
tgttaaattcattaactctacataaagttttataatctaaatgaaatacaataatctgca
taaaattcaatagcttatataaaatttagtaatttatataaatattatcaatctatataa
aatttaataacttatataaatttaactaatttatataaaatcttaaggagttgccatgat
aaaaaaaatagagcatgtggtcattactaataataatatagaaaattatatcaattttta
taaaaaatttggtttttc