Block details
fasta C_difficile_CD00314_1A_020711.fasta
contig u00000crpx_c_020711
start 3531743
length 13824
strand +
type core
seq tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat
gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt
agccagtcccaattaatctacttcaggtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat
gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc
gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac
acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt
tatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata
tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt
attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg
tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc
taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga
atacccctttatagtagttgctccaataagttttcttatttcatgcttatgaagtaatag
ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg
aacttgttttaaaaatacttcactattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac
tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt
ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc
catataaatctcaccttctttgttagaaatttattccataaatgttagaaatttactaaa
tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt
caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaagata
tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactttaaccagtaa
cactgatttctaaatttcaaaacaaaaatattacatattataaattttctatcttctatc
ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct
atcttctaaataattttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatac
tcaaaatatctattgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatt
tcaaaaacttcttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaa
aatgtaatatagagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagttgggag
aaatttgtatggatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaa
gcgaatttgaaatattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaa
tgggattatattttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaa
ataattcatcaataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatctt
ctgaaactaagattggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcactta
ctaatgaatcaatgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaacctt
cttttagacattatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggat
tattctattgttgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcat
ctgctttacttggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcg
ttctggaatgtgttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggagaag
aattaaaggtagatggtaactttgcaatagcaagaacatctggggttaatttttctgtta
caaaatcagataaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacat
ttactggtaatggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagtt
ttggagcaatgcctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgt
tttataaatatttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagat
tattattataaaatcagagtgtggaaatgtttatgtgtattctttaaataaaaatttcca
cattctgtaaggttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacat
ttataaacatattaaggtaatgatttctcttggtaattattctcatatcttattctttga
ttatatttatcttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttata
attagcattaacttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatatt
aaaaagtttacatctatattaatttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactt
tatttgattttaaaaatttaagtgaatttgttcttatacacatctttttaaaattatatc
tgtagaaaatatcatttagagctataattaaattattaaattttagaaaatttattaaaa
aatataagttaaattaatatttttaaagattcttttttataactactagaatactaattt
agtagttattgtatctctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgccta
taatttacctactacttggagtattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaa
aaccaataaattaactaatacacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaa
cagatttaacagaatttaatcaagctaagaaattacatatatcgtgatgtttttgaatta
gaaggtaattcaaaattagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtaca
agaattgttagtaaaatttttaaagattttatggatagatataaatagttttacttattt
tgtaaaatttaaaataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaattt
aaataaagttaaatttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaagg
taaatattcaatatacaacctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcact
atcaaaagaagataaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgat
aggttttataaacttattggatgaaggaagttatgtattctttggtattggtataaaacc
agattattgtggaatgggaattggcaaagaaataattagcctaggattacaagaatgtag
aaataaatatagtactaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgt
aaaatgttataagtctcaaggatttaaaatagttgagactcaggtacagaaaacgcattt
aggggatggagaattttttgttatgaggtatcaatagtttataacactagtcatattgct
aatatgacaattaaaatgaaaaaatacatgtgtgtatgtcatagcaataagtgtctttga
aatataaatttgagagcctttgataaaattcggtatacatatatattttatactacagat
atataaatctatctacatacataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaataaa
tttatatttcataaatgtactttttatttgtattacctttattttatctaagctctcatt
ttattacctaatcttcctttttattggttttattaagagagatgcaattatcaacacaac
acttccaagtatcagccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaa
aaattttccaacatacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatat
catgtaacctatgattgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctat
aaacatagctgatgcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaag
atatattaaaacatttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcag
tatcctaattaattgtacaataacttgagataatgattttgaagatactatctcatcaat
ttcttttgattgctctagcgaaaatacaggtaccaacattactatccctattattgcaac
ataattttctaaacatatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattag
aggaatcatacatagcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaa
gttttcttttattagaactaaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattccccc
ttcttttttgctcatataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagctta
tcacaattctattaatcataatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaata
cactattatgtcttatcattagccccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaat
ttatactgtaaagccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaata
tagtaatactcattcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatg
tatattttataaatgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatca
aaggaagtaaatctttcatacctaaaattaatacaggcaatatcattataaagacaagtg
caaaatatcttgataaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctc
tcattcttgaacgcttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatac
ttaaaactatacctatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctt
tttgtattgtatagttgtaattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaa
atctttgtaacttgtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactcttt
gcattatttcttcaaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcat
cagttttccaaattaaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatatt
tttctatggtcttcgttttattttggtctaattttatatacttaactacccctgttggat
acgttgtatatgtgtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatga
ccttttctgttttcatagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaat
attcgtcaatattctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatat
ttttacttacatcatttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaa
ctacaataaaaatataatataccatactctttaatatatttttacattcttttataaata
gattcatatattatctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattaca
atttactgctgtctcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccacc
atgagtcaacattcctataactataaatctactttttatattttcaatgtcttttttatc
tacttcaatactatatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccatt
gtatatgacttttccactatccaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctcc
aacaatatgtgtagataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttct
aaatcttatacgttcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatccactattaaaactct
gggattatgaattaatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaaga
ttttactttcacattttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataat
ttttcttctttttcttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttata
tactgtcatgttaggatacattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaat
ttccttagtattctcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataa
taaagtggctaaaattctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagacc
aaacataccactgtcgatttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatct
tttactaagattggatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaataa
ttttatagaattttatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaactt
aagatattatttataaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaat
taaattaaagtatctttgtttctgaaattttttaagtttatgaagctataatttaatata
tatttattttatttgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaa
agaattactggatataataagatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctg
caactatatattgcaaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaa
gacataagacaaatttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaata
taatatgtattttcttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgttatgacact
aatattcacaattttttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcat
cagatgcttcttgtataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaa
aatcatcttcactctcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaa
tattaaatctttttctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagttttt
ttacatcatttgctgtaatcaacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgt
ttccacttagtactaatttgctaaatatattctcatcatctccaccaaaaggacaacctg
tcaaagtaaagtgaatggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttgg
catcttcaaaaacaaaatcttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattct
cttcacttattttagtataacatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcg
tttttttaattgtaacttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtat
tatttcatcttaaatttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaa
gtattattattttttcctaaaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgacta
taaataagaactattacttttaaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctct
acttattagcttcaaataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaata
aatttaaattttaaactataagagtttctgaagtgttaataagcataccaataattatat
gtgtaagaatttgatttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaac
ctattattataaattctataaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatctta
aattttaaatgatacacttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaa
ttaggtatttttaaattatctgtttacattaaatatctcttaattacttatctttcagct
agcttcttctattaaatgtttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaaac
atttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattacttat
ttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagtcactt
ccattaaacatttcttaattatttatttttcagttggctttttctattaaatgtttctta
attacttatctttcagttagctctttctattaaatatttctcaattacttatttttcaat
tagctactttcattaaatatttcttaattatttatctttaagttaactatttccattaga
tatttcttaattacctatttttatcatttattttatagagtattgtgcactatatattta
tacatatcataaatactacaacttgttatctcttattttagctgttttatctactcctct
attttttcaactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacattaacactttcaaccttt
atcttaacaaggtctcctatcttatatgacttcttagttctttctcctaaaacactataa
gaactctcatcataaatatagtaatcatcattcatatttgcaagtcttatcaatccttct
atagtattatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgctagatacaacaccctca
aattcttgaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaatcatgtacatctctt
tcagctaactctgcctttctttctttctcggatgattgaacagatgcataatccactata
gtagtaagctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaagattcttttattatt
ctatgaatttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaagtgacagtagaattta
gctgctaatccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagcttgttttaaagaacga
agcattatagtactgatagctccttcttcttttttgccctttattttctctattatacct
tgtaatgcttttggatgtacttcctctttatcaccttttattatatatccaaatgtagat
ataaacttactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctcatgtattctatacaca
aacggtattcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcattacttataagcataaat
tcttctattatcttattagatattcttctttcatatggctttatatctacaacttcgcct
tttccatttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctatagctcctcttttttct
cttcttgacataagaatcttagctaaaatttcagcatttttaaaatcttcaacaacatgt
tcaaaagtctttttaattttttcatcatccttttctaatatatcagatacttctgtataa
gtcattctagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgtttaaccacatttcct
ttatggtctatttccataaatatagaaagagttaacttatcttcaaatggatttaagcta
catactccatttgaaagagtttttggcaacattggaattactttatctactaaataaact
gatgtagctctttttaaggcttccttatcaagtttatttttctctcttacataatgtgta
acatcagctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaatacttctattgatatg
gcatcatctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatgtttaaatctcttaaa
tctcttcttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctacagcttctgcttcttgc
aatactttctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttattatagaatctatttct
acgcctctttcacctttttgacctagtatctctataattttgccttctggttttctatcc
tcttgtggccatactgtaatttcacatactaccttatcattatctactgctccactaaaa
tgttttttaggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtctggtgttacaaatcca
aaagttttacttgattggaaagtacctactattctagttatttctctctttattactttt
actattcttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactactatttctgccataact
ctatcgttatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaataaatcctgtgtatat
tcaacatcagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgatacaaattttccaacaaag
tatcccatttgattgggagatactatttttccttttttagtaaagcagatataaccatct
tcttctaattcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgatgaatgtatatcaaat
atttctgctaattcttctttttttagaggattatatgcactttcatttattaatcctagc
aaactttctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttacttttcattatattatt
atttatattgtcttttatatttcttcagataaaacattttttacttatcacataattttc
tatattttcttattattattacaagttaaaattacttatttatatttttgatttaatgta
agctttgtcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattatttgtaaatatca
ttataattacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctttatctcataatt
atacaccatcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtattactatataataa
tttattctattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaattaattttttaaa
tacaactttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgttaaatgaggttgat
tttttattattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttttttgacaagtct
ttattttgtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaatttaaactaatc
tatttattggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattattactatagaaaat
ggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataatgactcaaaaaag
tgttattatctatcaatctacttatataggtcagaatattatcaagtaagagaattggct
gtgtttatacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgttatttttaaaagac
aatgtgagtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaatcatttgattat
tattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcacttcctgttataaaagaatggcttaattct
gatagtccaaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttagaatttggactagtagagac
tattttaaatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagtttaaaagaagatgat
agcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagtaaaaaatatcca
gatttagtaaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaagttgagtttgta
tataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaacttatttgaaac
ttcgtgatgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataaaaggcaaatgga
aatctattatattatggagattacgcataggaccaacctccttatcaaaacttgaaaagg
aaatcaatggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaattaattgaatttg
gtcttgtagataaaaagacatataaaggttacccacttaaagttgaatactcacttacac
ctattcgagggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagatataggaattagct
ttatgttggataatggtatggaagatattcttaaggaaaaaggtgttttaaaataaatag
atacccacaaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtatataattaaattata
gatatattctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaagtaactagtacag
gtatagtaaatggtgttatagaagataaatacggtaaaagaggaactcagttcaatgaag
gtggtatgcctacatattcactacctctaaagtttgaagatgctccaaagaatacagtat
cctttgctgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtgggtttgcatggatac
attggttagctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaaagtgtaacagcta
ctgattttgtacaagggactactagttggcatggcaaactaggaggtcttgacagattag
aggccagtgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtctatgaaatacatg
tatttgcacttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatgaatgaatttttca
aagctattgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagctattctaattaat
taggtttactatagctaatcattaattaaatgctacatttaattgatgattagcttaatt
gttattagaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttgactggtattttaa
tttctattagattattatcaatttatataaattgattttagcttaaaacttacttatcta
tttcagtttctattagaattattattagactcattaaaataaaagcattaatataactaa
taatatatgttaaattcattaactctacataaagttttataatctaaatgaaatacaata
atctgcataaaattcaatagcttatataaaatttagtaatttatataaatattatcaatc
tatataaaatttaataacttatataaatttaactaatttatataaaatcttaaggagttg
ccatgataaaaaaaatagagcatgtggtcattactaataataatatagaaaattatatca
atttttataaaaaatttggtttttc