Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00314_1A_020711.fasta |
contig | u00000crpx_c_020711 |
start | 3531743 |
length | 13824 |
strand | + |
type | core |
seq | tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt agccagtcccaattaatctacttcaggtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt tatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga atacccctttatagtagttgctccaataagttttcttatttcatgcttatgaagtaatag ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg aacttgttttaaaaatacttcactattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc catataaatctcaccttctttgttagaaatttattccataaatgttagaaatttactaaa tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaagata tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactttaaccagtaa cactgatttctaaatttcaaaacaaaaatattacatattataaattttctatcttctatc ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct atcttctaaataattttaacatgcccataaaatataatacccacaaatgataaataatac tcaaaatatctattgaaataactatacatccttaaataacttaacttaaatctaaacatt tcaaaaacttcttaaaaatatgtaaaaatttgatgataaagtagcgattttttcaaaaaa aatgtaatatagagttatatcttataatattttagagataaattttatcatagttgggag aaatttgtatggatttaagcaaaaaagtaaaaattttagaaaatgcatcagatggcaaaa gcgaatttgaaatattagaatttgaaaaacttgagggagcttctagcccattaatggcaa tgggattatattttgctagagaagctggtttgaaagctagacaaattaagataaaattaa ataattcatcaataaaaacagaagctggtgcattatactattataaaggaaatatatctt ctgaaactaagattggtggtgttggaggtctttttaaaaaaggaatatcaggagcactta ctaatgaatcaatgatgaaacctgtatacaaaggtactggagaagtttatttggaacctt cttttagacattatttatttatgagtcttgataatgattctataattgttgataaaggat tattctattgttgctctgatacaatagaagtaaaagcatttacacaaaagaacttctcat ctgctttacttggtggtgaaggcttcttccaaatagaattaagtggtactggtgtaatcg ttctggaatgtgttgtacctcaaagtgaaattgtagagtatgaattgaaaaatggagaag aattaaaggtagatggtaactttgcaatagcaagaacatctggggttaatttttctgtta caaaatcagataaatctttaattggttctgctttaaatggtgaaggtttcttaaatacat ttactggtaatggtacagtttggctagctccaactcaagtaatgtatgaaaaactaagtt ttggagcaatgcctactaatgataatatgaataataaagtttctaagcaaaaatagttgt tttataaatatttattaaatcattattgattttataaagtcactataaattttattagat tattattataaaatcagagtgtggaaatgtttatgtgtattctttaaataaaaatttcca cattctgtaaggttattatacttgatatataaaattcaatttaggaacatagtctaacat ttataaacatattaaggtaatgatttctcttggtaattattctcatatcttattctttga ttatatttatcttattcctagcccttatgtcatattatatttcttatcttattatttata attagcattaacttatctaaaatcttgtatttttttaatagtaaagtttacatctatatt aaaaagtttacatctatattaatttcataaaacaatcaaggtagtcaagagattcaactt tatttgattttaaaaatttaagtgaatttgttcttatacacatctttttaaaattatatc tgtagaaaatatcatttagagctataattaaattattaaattttagaaaatttattaaaa aatataagttaaattaatatttttaaagattcttttttataactactagaatactaattt agtagttattgtatctctaaagtttaagcatggatagatatacatttgataatttgccta taatttacctactacttggagtattggagcaaatacaatatattaataataagttcctaa aaccaataaattaactaatacacataaagatattgatgttgattatacaactataagaaa cagatttaacagaatttaatcaagctaagaaattacatatatcgtgatgtttttgaatta gaaggtaattcaaaattagtttatagtcttctgtgaatccaataaaaagtacagggtaca agaattgttagtaaaatttttaaagattttatggatagatataaatagttttacttattt tgtaaaatttaaaataccattaattaccttaaatattttaataggaggacatatgaattt aaataaagttaaatttactgaagaacatgctattgaagttactaattggaaatatgaagg taaatattcaatatacaacctacctccatgggaggaaattaaaaagaagaatttttcact atcaaaagaagataaaagaaaaaattttataagttttataaatgacaataaagaattgat aggttttataaacttattggatgaaggaagttatgtattctttggtattggtataaaacc agattattgtggaatgggaattggcaaagaaataattagcctaggattacaagaatgtag aaataaatatagtactaaaccaattgtattaaatgtaagaacctggaacatgagagctgt aaaatgttataagtctcaaggatttaaaatagttgagactcaggtacagaaaacgcattt aggggatggagaattttttgttatgaggtatcaatagtttataacactagtcatattgct aatatgacaattaaaatgaaaaaatacatgtgtgtatgtcatagcaataagtgtctttga aatataaatttgagagcctttgataaaattcggtatacatatatattttatactacagat atataaatctatctacatacataaagagattgtaagtaggtttgtgtatataaaaataaa tttatatttcataaatgtactttttatttgtattacctttattttatctaagctctcatt ttattacctaatcttcctttttattggttttattaagagagatgcaattatcaacacaac acttccaagtatcagccaatatttctcatcaaaactaccttgactcatagacattataaa aaattttccaacatacttgcctttagtcatcatatttaaaattaaatatcctatagatat catgtaacctatgattgtattattaaataaatttgagaaaaacattcctaaacttcctat aaacatagctgatgcgaaacttccaataatatactcaactactggaaaattacatccaag atatattaaaacatttacaaaacctatgattaataccactatacctataattgacatcag tatcctaattaattgtacaataacttgagataatgattttgaagatactatctcatcaat ttcttttgattgctctagcgaaaatacaggtaccaacattactatccctattattgcaac ataattttctaaacatatagctgttgaaattctgtctaaattagctactccttgtattag aggaatcatacatagcaatataattgaacatattaaattagttaaagtgcttaatttgaa gttttcttttattagaactaaacagttttgaaaactttgcccaaacatcaagattccccc ttcttttttgctcatataagaatatagctaacaaaacaagcaccaatgctcccaagctta tcacaattctattaatcataatttgattgaagttttgtataataatatccccatttaata cactattatgtcttatcattagccccattgttgaataatcacctttgagtcctgtagaat ttatactgtaaagccaccaaattaattgcacaataattgctactggtgtatctgttaata tagtaatactcattcctacagctgtaactatcataagagttggtagtatccaccataatg tatattttataaatgctaagttatcaatagatatacctttatctttagcaaagaaaatca aaggaagtaaatctttcatacctaaaattaatacaggcaatatcattataaagacaagtg caaaatatcttgataaaactattttgcatgaagatacttgttttgaataaataatctctc tcattcttgaacgcttatctttaagtgacataaaaactgccacaaatactggaaatatac ttaaaactatacctatataatcgcaaaaaattcttgcatacccattactaactttatctt tttgtattgtatagttgtaattcttcatagcttcatcataggtaactggaactactccaa atctttgtaacttgtcaaaagcatatgcagaccctcctcctaaaatgtcgtctactcttt gcattatttcttcaaatctttcaagagatactttagaataatctatttttatactttcat cagttttccaaattaaatttatttcgctaatacttttaccagttatttcttctatatatt tttctatggtcttcgttttattttggtctaattttatatacttaactacccctgttggat acgttgtatatgtgtttttttgatattctctaattaggtttatagttgcatttggaatga ccttttctgttttcatagattctttttgaccatatggatattgattgtgtacagagtaat attcgtcaatattctctactttttgtggagcaactaatggatttccatcattaggaatat ttttacttacatcatttgaaactgaacttccaagttgagaaatatagaaaaaaactaaaa ctacaataaaaatataatataccatactctttaatatatttttacattcttttataaata gattcatatattatctcctcccattataagcatatagccatcttcaatagttggattaca atttactgctgtctcaaaaggtttatcatctgatataatcctaagtatagcctttccacc atgagtcaacattcctataactataaatctactttttatattttcaatgtcttttttatc tacttcaatactatatactttcccttcagctagttttgctaatgcttctgttgagccatt gtatatgacttttccactatccaatatagctacgttttcacatgtagcttctatatctcc aacaatatgtgtagataaaataacgattctatcatttgcaatttcgcatagtaaatttct aaatcttatacgttcttctgggtcaagacctgctgtcggctcatccactattaaaactct gggattatgaattaatgcttgtgctatcccaagccttctattcatacctccagataaaga ttttactttcacattttgataattagtaaggtttactttgcttaataactttgctataat ttttcttctttttcttagtggtatatccgataaaactgctaaataatccattgctttata tactgtcatgttaggatacattgaaaaatcttgtggcaaataaccaaccatatttctaat ttccttagtattctcaataggaactccacacatatgtattgaaccttctgtttttgataa taaagtggctaaaattctcataaatgtggtttttcctgctccatttcttcctaaaagacc aaacataccactgtcgatttcaagatttatattatcaagagcttgttttttcccaaatct tttactaagattggatactgctattttcatttccatatataaatacacccccagaaataa ttttatagaattttatttttataaatttttactgtattttcataataaattctaaaactt aagatattatttataaatttctaaattttttctaaagattttaatttttctgtttttaat taaattaaagtatctttgtttctgaaattttttaagtttatgaagctataatttaatata tatttattttatttgtgagtctatttttatatataatgaaaaatgtgataagtatccaaa agaattactggatataataagatagggtatttagccttttaagataaataaaaatatctg caactatatattgcaaaaatttaaaactaatttatatatgctaatataaatatttataaa gacataagacaaatttacctacagatttaaatttaacttatatattttaaaaggctaata taatatgtattttcttctatacaatcaaaaggcttcatatctaagatatgttatgacact aatattcacaattttttagtaattatcacattataaaaaatattacagctagtccatcat cagatgcttcttgtataaactttttaagctcaattagatttgcccatacatattcaaaaa aatcatcttcactctcatcattcataacaggataaatattattttctaacatctcattaa tattaaatctttttctaaatgcttgttcttccaaactgttcattgcttttgatagttttt ttacatcatttgctgtaatcaacatgacaggaaattctccatcaatttccataagtatgt ttccacttagtactaatttgctaaatatattctcatcatctccaccaaaaggacaacctg tcaaagtaaagtgaatggcatgccatgctttatcaatattgatagtactattttcgttgg catcttcaaaaacaaaatcttgtaaattttcttctgcttgctgtaatttaaaaacattct cttcacttattttagtataacatcctatcatccccataattacattcctcctaagtagcg tttttttaattgtaacttataattaaacttagttacaataaaatatattgagaaaagtat tatttcatcttaaatttaaatacctatattatcaactaaaattctgtgtttatagcgtaa gtattattattttttcctaaaaattaaatgaatcagaagttctataggcaatattgacta taaataagaactattacttttaaaaaaaatttaagaaattatactgtagaatcatgctct acttattagcttcaaataaaaaataaatcatgttctcaaattaaataataaataacaata aatttaaattttaaactataagagtttctgaagtgttaataagcataccaataattatat gtgtaagaatttgatttaatagatatgaataatttttacattaattataaatatattaac ctattattataaattctataaaaagaaaagttatcttaaataaaaaataagtgtatctta aattttaaatgatacacttatttttatattgaaattatattttttaatatctattcttaa ttaggtatttttaaattatctgtttacattaaatatctcttaattacttatctttcagct agcttcttctattaaatgtttctcaattacttatttttcaattagccacttctattaaac atttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattacttat ttttcaattagccacttctattaagcatttcttaattacttatttttcaattagtcactt ccattaaacatttcttaattatttatttttcagttggctttttctattaaatgtttctta attacttatctttcagttagctctttctattaaatatttctcaattacttatttttcaat tagctactttcattaaatatttcttaattatttatctttaagttaactatttccattaga tatttcttaattacctatttttatcatttattttatagagtattgtgcactatatattta tacatatcataaatactacaacttgttatctcttattttagctgttttatctactcctct attttttcaactatctcaaagtcaatttctttaaaatctacattaacactttcaaccttt atcttaacaaggtctcctatcttatatgacttcttagttctttctcctaaaacactataa gaactctcatcataaatatagtaatcatcattcatatttgcaagtcttatcaatccttct atagtattatctaactcaacaaatattccaaatgaagttacgctagatacaacaccctca aattcttgaccaactttatccttcatataaagagccttatagaaatcatgtacatctctt tcagctaactctgcctttctttctttctcggatgattgaacagatgcataatccactata gtagtaagctgttcttgtctttttccacttattttattatttaaagattcttttattatt ctatgaatttgaaggtcaggatatcttcttattggtgaagtaaagtgacagtagaattta gctgctaatccaaaatgtccactacattctggtgagtacttagcttgttttaaagaacga agcattatagtactgatagctccttcttcttttttgccctttattttctctattatacct tgtaatgcttttggatgtacttcctctttatcaccttttattatatatccaaatgtagat ataaacttactcaattcttccattttttccaaagatggtgtctcatgtattctatacaca aacggtattcccatccagtaaaaatgttcggcaattgtctcattacttataagcataaat tcttctattatcttattagatattcttctttcatatggctttatatctacaacttcgcct tttccatttagaattatctttgcctctgggaaattgaagtctatagctcctcttttttct cttcttgacataagaatcttagctaaaatttcagcatttttaaaatcttcaacaacatgt tcaaaagtctttttaattttttcatcatccttttctaatatatcagatacttctgtataa gtcattctagcttttgaatttattacagattcacatatttcatgtttaaccacatttcct ttatggtctatttccataaatatagaaagagttaacttatcttcaaatggatttaagcta catactccatttgaaagagtttttggcaacattggaattactttatctactaaataaact gatgtagctctttttaaggcttccttatcaagtttatttttctctcttacataatgtgta acatcagctatgtgaactcctagtttgaagtttccattaggtaatacttctattgatatg gcatcatctaagtcttttgcgtcatctccatctatagtaaatatgtttaaatctcttaaa tctcttcttctttttatctcttcttgaggaatctcaacagctacagcttctgcttcttgc aatactttctttggaaattcttctggaagaccatgttctcttattatagaatctatttct acgcctctttcacctttttgacctagtatctctataattttgccttctggttttctatcc tcttgtggccatactgtaatttcacatactaccttatcattatctactgctccactaaaa tgttttttaggtatatatatatctttagtaaatttcttgttgtctggtgttacaaatcca aaagttttacttgattggaaagtacctactattctagttatttctctctttattactttt actattcttccttctgctctcttttcttcagttgcaggtactactatttctgccataact ctatcgttatgcatagcaccatttatattgtcacttgagataaataaatcctgtgtatat tcaacatcagattctacaaatccaaaaccctttttgtgtgatacaaattttccaacaaag tatcccatttgattgggagatactatttttccttttttagtaaagcagatataaccatct tcttctaattcatttaaaaaattataaaacattggcatttctgatgaatgtatatcaaat atttctgctaattcttctttttttagaggattatatgcactttcatttattaatcctagc aaactttctttaagtcctggtatcatttttccctcctgttttacttttcattatattatt atttatattgtcttttatatttcttcagataaaacattttttacttatcacataattttc tatattttcttattattattacaagttaaaattacttatttatatttttgatttaatgta agctttgtcatactaacttcaaacaaattatgatgttttataaattatttgtaaatatca ttataattacttaagttattctttatcataattgcttaaattactctttatctcataatt atacaccatcaaataggattggtaaaatattcatctcatataagtattactatataataa tttattctattagtatactcaaatcatgtaaaatttatataactcaattaattttttaaa tacaactttataatataaaacttataataaaagtaaatttatatgttaaatgaggttgat tttttattattttttatttatgctagtactaaagacttgcaaacgttttttgacaagtct ttattttgtctaaattaaacaaacttttttacaaataaatacataaaatttaaactaatc tatttattggaggagataaaattggaagaagtaattgcaaaaattattactatagaaaat ggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaaaaattgtaaaaaataatgactcaaaaaag tgttattatctatcaatctacttatataggtcagaatattatcaagtaagagaattggct gtgtttatacttggttttatatcagtaactatttctgaagctttgttatttttaaaagac aatgtgagtaaagatgaaaactggagagtacaagaaatactagctaaatcatttgattat tattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcacttcctgttataaaagaatggcttaattct gatagtccaaacataaaaagggctgtgacagaaggtcttagaatttggactagtagagac tattttaaatctaatcctgacgttgctatatcactactttctagtttaaaagaagatgat agcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatgctcttagagatataagtaaaaaatatcca gatttagtaaaaaaagaattagattcatgggatatatcaaataaaaaagttgagtttgta tataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaaagtaaaatggaggtgaacttatttgaaac ttcgtgatgagtatacttgcccattagaactaacacatgatatgataaaaggcaaatgga aatctattatattatggagattacgcataggaccaacctccttatcaaaacttgaaaagg aaatcaatggtattaatcaaaagatgttacttgaacaacttaaagaattaattgaatttg gtcttgtagataaaaagacatataaaggttacccacttaaagttgaatactcacttacac ctattcgagggaaacaaatattggatgctttggctataatgcaagatataggaattagct ttatgttggataatggtatggaagatattcttaaggaaaaaggtgttttaaaataaatag atacccacaaaaaagtaagtaatttaccattattttcaactggtatataattaaattata gatatattctattaatttattataataggaggtaaattattatgaaagtaactagtacag gtatagtaaatggtgttatagaagataaatacggtaaaagaggaactcagttcaatgaag gtggtatgcctacatattcactacctctaaagtttgaagatgctccaaagaatacagtat cctttgctgtatttttagaagataaagactctgttcctgtatgtgggtttgcatggatac attggttagctgtaaatataacaaaagatgagttaaatgaaaatgaaagtgtaacagcta ctgattttgtacaagggactactagttggcatggcaaactaggaggtcttgacagattag aggccagtgtatatggtggaatggctcctccagacagacctcatgtctatgaaatacatg tatttgcacttgatactatccttgaccttgaaaaaggattctatatgaatgaatttttca aagctattgaagggcatgttttagatacatttacactaaaaggaagctattctaattaat taggtttactatagctaatcattaattaaatgctacatttaattgatgattagcttaatt gttattagaatattttctgcactttatcttaatatatattttagttgactggtattttaa tttctattagattattatcaatttatataaattgattttagcttaaaacttacttatcta tttcagtttctattagaattattattagactcattaaaataaaagcattaatataactaa taatatatgttaaattcattaactctacataaagttttataatctaaatgaaatacaata atctgcataaaattcaatagcttatataaaatttagtaatttatataaatattatcaatc tatataaaatttaataacttatataaatttaactaatttatataaaatcttaaggagttg ccatgataaaaaaaatagagcatgtggtcattactaataataatatagaaaattatatca atttttataaaaaatttggtttttc |