Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00126_2A_027655.fasta |
contig | u00000crpx_c_027655 |
start | 3506127 |
length | 13852 |
strand | + |
type | core |
seq | tggtggagacgaggggagtcgaacccctgtccgcaaatcttttccttgctgcatctacat gcttagccaacttcactaatatctcacctcacatagcgccaagtggcaggctctatgctt agccagtcccaattaatctacttcaggtcgagacacccctaaagtagttccctgcataat gacgtccagtcttagtcggcaggaggactaagagggacgagcagcaactaggctgctatc gcgaaattatcgtctgcgtttattttaaagttccccagtttttacgtgacccagagtaac acgacatgcagcctcaagttccaaacccacgtcgaaacctttacgcccccttgagtagtt tatagtccagtagacttttcgcaaactttatcaccatttttattaaatttttaatgtata tataatataatacttttaagaataaaaatcaatgttatgttctagataataaagaatttt attctaaaaaatacagttttatctagtttaatacttacctgtcatttctctttctatacg tctttgtgcatctttcttagccatatcttgacgtttatcatatagttttttaccttttgc taaggcaatctctactttaactttaccgttttttagatacaaactaagtggtataagtga atacccctttatagtagttgctccaataagttttcttatttcatgcttatgaagtaatag ttttctaactcttaaagaatcaacattgaatatatttccttgctcatatggacttatatg aacttgttttaaaaatacttcactattatctacagatgcaaatccatcacttaggttaac tttgccttgtcttattgattttacttctgttccttttaattcaattccacattcataagt ttcttctataaaatattcatgtcttgctcttttgtttgttgctaatatttttttaccagc catataaatctcaccttctttgttagaaatttattccataaatgttagaaatttactaaa tatttaatgttgccaaattatttgactaacttgtatgataacatatttaggcattttagt caatatttcactgatatattaagttagttaggctatatataattaagtaatataaagata tgaaaatagctaaaaaactacttcgaatatacttaatactaaactaactttaaccagtaa cactgatttctaaatttcaaaacaaaaatattacatattataaattttctatcttctatc ttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttctatcttct atcttctatcttctatcttctatcttctatcttctaaataattttaacatgcccataaaa tataatacccacaaatgataaataatactcaaaatatctattgaaataactatacatcct taaataacttaacttaaatctaaacatttcaaaaacttcttaaaaatatgtaaaaatttg atgataaagtagcgattttttcaaaaaaaatgtaatatagagttatatcttataatattt tagagataaattttatcatagttgggagaaatttgtatggatttaagcaaaaaagtaaaa attttagaaaatgcatcagatggcaaaagcgaatttgaaatattagaatttgaaaaactt gagggagcttctagcccattaatggcaatgggattatattttgctagagaagctggtttg aaagctagacaaattaagataaaattaaataattcatcaataaaaacagaagctggtgca ttatactattataaaggaaatatatcttctgaaactaagattggtggtgttggaggtctt tttaaaaaaggaatatcaggagcacttactaatgaatcaatgatgaaacctgtatacaaa ggtactggagaagtttatttggaaccttcttttagacattatttatttatgagtcttgat aatgattctataattgttgataaaggattattctattgttgctctgatacaatagaagta aaagcatttacacaaaagaacttctcatctgctttacttggtggtgaaggcttcttccaa atagaattaagtggtactggtgtaatcgttctggaatgtgttgtacctcaaagtgaaatt gtagagtatgaattgaaaaatggagaagaattaaaggtagatggtaactttgcaatagca agaacatctggggttaatttttctgttacaaaatcagataaatctttaattggttctgct ttaaatggtgaaggtttcttaaatacatttactggtaatggtacagtttggctagctcca actcaagtaatgtatgaaaaactaagttttggagcaatgcctactaatgataatatgaat aataaagtttctaagcaaaaatagttgttttataaatatttattaaatcattattgattt tataaagtcactataaattttattagattattattataaaatcagagtgtggaaatgttt atgtgtattctttaaataaaaatttccacattctgtaaggttattatacttgatatataa aattcaatttaggaacatagtctaacatttataaacatattaaggtaatgatttctcttg gtaattattctcatatcttattctttgattatatttatcttattcctagcccttatgtca tattatatttcttatcttattatttataattagcattaacttatctaaaatcttgtattt ttttaatagtaaagtttacatctatattaaaaagtttacatctatattaatttcataaaa caatcaaggtagtcaagagattcaactttatttgattttaaaaatttaagtgaatttgtt cttatacacatctttttaaaattatatctgtagaaaatatcatttagagctataattaaa ttattaaattttagaaaatttattaaaaaatataagttaaattaatatttttaaagattc ttttttataactactagaatactaatttagtagttattgtatctctaaagtttaagcatg gatagatatacatttgataatttgcctataatttacctactacttggagtattggagcaa atacaatatattaataataagttcctaaaaccaataaattaactaatacacataaagata ttgatgttgattatacaactataagaaacagatttaacagaatttaatcaagctaagaaa ttacatatatcgtgatgtttttgaattagaaggtaattcaaaattagtttatagtcttct gtgaatccaataaaaagtacagggtacaagaattgttagtaaaatttttaaagattttat ggatagatataaatagttttacttattttgtaaaatttaaaataccattaattaccttaa atattttaataggaggacatatgaatttaaataaagttaaatttactgaagaacatgcta ttgaagttactaattggaaatatgaaggtaaatattcaatatacaacctacctccatggg aggaaattaaaaagaagaatttttcactatcaaaagaagataaaagaaaaaattttataa gttttataaatgacaataaagaattgataggttttataaacttattggatgaaggaagtt atgtattctttggtattggtataaaaccagattattgtggaatgggaattggcaaagaaa taattagcctaggattacaagaatgtagaaataaatatagtactaaaccaattgtattaa atgtaagaacctggaacatgagagctgtaaaatgttataagtctcaaggatttaaaatag ttgagactcaggtacagaaaacgcatttaggggatggagaattttttgttatgaggtatc aatagtttataacactagtcatattgctaatatgacaattaaaatgaaaaaatacatgtg tgtatgtcatagcaataagtgtctttgaaatataaatttgagagcctttgataaaattcg gtatacatatatattttatactacagatatataaatctatctacatacataaagagattg taagtaggtttgtgtatataaaaataaatttatatttcataaatgtactttttatttgta ttacctttattttatctaagctctcattttattacctaatcttcctttttattggtttta ttaagagagatgcaattatcaacacaacacttccaagtatcagccaatatttctcatcaa aactaccttgactcatagacattataaaaaattttccaacatacttgcctttagtcatca tatttaaaattaaatatcctatagatatcatgtaacctatgattgtattattaaataaat ttgagaaaaacattcctaaacttcctataaacatagctgatgcgaaacttccaataatat actcaactactggaaaattacatccaagatatattaaaacatttacaaaacctatgatta ataccactatacctataattgacatcagtatcctaattaattgtacaataacttgagata atgattttgaagatactatctcatcaatttcttttgattgctctagcgaaaatacaggta ccaacattactatccctattattgcaacataattttctaaacatatagctgttgaaattc tgtctaaattagctactccttgtattagaggaatcatacatagcaatataattgaacata ttaaattagttaaagtgcttaatttgaagttttcttttattagaactaaacagttttgaa aactttgcccaaacatcaagattcccccttcttttttgctcatataagaatatagctaac aaaacaagcaccaatgctcccaagcttatcacaattctattaatcataatttgattgaag ttttgtataataatatccccatttaatacactattatgtcttatcattagccccattgtt gaataatcacctttgagtcctgtagaatttatactgtaaagccaccaaattaattgcaca ataattgctactggtgtatctgttaatatagtaatactcattcctacagctgtaactatc ataagagttggtagtatccaccataatgtatattttataaatgctaagttatcaatagat atacctttatctttagcaaagaaaatcaaaggaagtaaatctttcatacctaaaattaat acaggcaatatcattataaagacaagtgcaaaatatcttgataaaactattttgcatgaa gatacttgttttgaataaataatctctctcattcttgaacgcttatctttaagtgacata aaaactgccacaaatactggaaatatacttaaaactatacctatataatcgcaaaaaatt cttgcatacccattactaactttatctttttgtattgtatagttgtaattcttcatagct tcatcataggtaactggaactactccaaatctttgtaacttgtcaaaagcatatgcagac cctcctcctaaaatgtcgtctactctttgcattatttcttcaaatctttcaagagatact ttagaataatctatttttatactttcatcagttttccaaattaaatttatttcgctaata cttttaccagttatttcttctatatatttttctatggtcttcgttttattttggtctaat tttatatacttaactacccctgttggatacgttgtatatgtgtttttttgatattctcta attaggtttatagttgcatttggaatgaccttttctgttttcatagattctttttgacca tatggatattgattgtgtacagagtaatattcgtcaatattctctactttttgtggagca actaatggatttccatcattaggaatatttttacttacatcatttgaaactgaacttcca agttgagaaatatagaaaaaaactaaaactacaataaaaatataatataccatactcttt aatatatttttacattcttttataaatagattcatatattatctcctcccattataagca tatagccatcttcaatagttggattacaatttactgctgtctcaaaaggtttatcatctg atataatcctaagtatagcctttccaccatgagtcaacattcctataactataaatctac tttttatattttcaatgtcttttttatctacttcaatactatatactttcccttcagcta gttttgctaatgcttctgttgagccattgtatatgacttttccactatccaatatagcta cgttttcacatgtagcttctatatctccaacaatatgtgtagataaaataacgattctat catttgcaatttcgcatagtaaatttctaaatcttatacgttcttctgggtcaagacctg ctgtcggctcatccactattaaaactctgggattatgaattaatgcttgtgctatcccaa gccttctattcatacctccagataaagattttactttcacattttgataattagtaaggt ttactttgcttaataactttgctataatttttcttctttttcttagtggtatatccgata aaactgctaaataatccattgctttatatactgtcatgttaggatacattgaaaaatctt gtggcaaataaccaaccatatttctaatttccttagtattctcaataggaactccacaca tatgtattgaaccttctgtttttgataataaagtggctaaaattctcataaatgtggttt ttcctgctccatttcttcctaaaagaccaaacataccactgtcgatttcaagatttatat tatcaagagcttgttttttcccaaatcttttactaagattggatactgctattttcattt ccatatataaatacacccccagaaataattttatagaattttatttttataaatttttac tgtattttcataataaattctaaaacttaagatattatttataaatttctaaattttttc taaagattttaatttttctgtttttaattaaattaaagtatctttgtttctgaaattttt taagtttatgaagctataatttaatatatatttattttatttgtgagtctatttttatat ataatgaaaaatgtgataagtatccaaaagaattactggatataataagatagggtattt agccttttaagataaataaaaatatctgcaactatatattgcaaaaatttaaaactaatt tatatatgctaatataaatatttataaagacataagacaaatttacctacagatttaaat ttaacttatatattttaaaaggctaatataatatgtattttcttctatacaatcaaaagg cttcatatctaagatatgttatgacactaatattcacaattttttagtaattatcacatt ataaaaaatattacagctagtccatcatcagatgcttcttgtataaactttttaagctca attagatttgcccatacatattcaaaaaaatcatcttcactctcatcattcataacagga taaatattattttctaacatctcattaatattaaatctttttctaaatgcttgttcttcc aaactgttcattgcttttgatagtttttttacatcatttgctgtaatcaacatgacagga aattctccatcaatttccataagtatgtttccacttagtactaatttgctaaatatattc tcatcatctccaccaaaaggacaacctgtcaaagtaaagtgaatggcatgccatgcttta tcaatattgatagtactattttcgttggcatcttcaaaaacaaaatcttgtaaattttct tctgcttgctgtaatttaaaaacattctcttcacttattttagtataacatcctatcatc cccataattacattcctcctaagtagcgtttttttaattgtaacttataattaaacttag ttacaataaaatatattgagaaaagtattatttcatcttaaatttaaatacctatattat caactaaaattctgtgtttatagcgtaagtattattattttttcctaaaaattaaatgaa tcagaagttctataggcaatattgactataaataagaactattacttttaaaaaaaattt aagaaattatactgtagaatcatgctctacttattagcttcaaataaaaaataaatcatg ttctcaaattaaataataaataacaataaatttaaattttaaactataagagtttctgaa gtgttaataagcataccaataattatatgtgtaagaatttgatttaatagatatgaataa tttttacattaattataaatatattaacctattattataaattctataaaaagaaaagtt atcttaaataaaaaataagtgtatcttaaattttaaatgatacacttatttttatattga aattatattttttaatatctattcttaattaggtatttttaaattatctgtttacattaa atatctcttaattacttatctttcagctagcttcttctattaaatgtttctcaattactt atttttcaattagccacttctattaaacatttcttaattacttatttttcaattagccac ttctattaaacatttcttaattacttatttttcaattagccacttctattaagcatttct taattacttatttttcaattagtcacttccattaaacatttcttaattatttatttttca gttggctttttctattaaatgtttcttaattacttatctttcagttagctctttctatta aatatttctcaattacttatttttcaattagctactttcattaaatatttcttaattatt tatctttaagttaactatttccattagatatttcttaattacctatttttatcatttatt ttatagagtattgtgcactatatatttatacatatcataaatactacaacttgttatctc ttattttagctgttttatctactcctctattttttcaactatctcaaagtcaatttcttt aaaatctacattaacactttcaacctttatcttaacaaggtctcctatcttatatgactt cttagttctttctcctaaaacactataagaactctcatcataaatatagtaatcatcatt catatttgcaagtcttatcaatccttctatagtattatctaactcaacaaatattccaaa tgaagttacgctagatacaacaccctcaaattcttgaccaactttatccttcatataaag agccttatagaaatcatgtacatctctttcagctaactctgcctttctttctttctcgga tgattgaacagatgcataatccactatagtagtaagctgttcttgtctttttccacttat tttattatttaaagattcttttattattctatgaatttgaaggtcaggatatcttcttat tggtgaagtaaagtgacagtagaatttagctgctaatccaaaatgtccactacattctgg tgagtacttagcttgttttaaagaacgaagcattatagtactgatagctccttcttcttt tttgccctttattttctctattataccttgtaatgcttttggatgtacttcctctttatc accttttattatatatccaaatgtagatataaacttactcaattcttccattttttccaa agatggtgtctcatgtattctatacacaaacggtattcccatccagtaaaaatgttcggc aattgtctcattacttataagcataaattcttctattatcttattagatattcttctttc atatggctttatatctacaacttcgccttttccatttagaattatctttgcctctgggaa attgaagtctatagctcctcttttttctcttcttgacataagaatcttagctaaaatttc agcatttttaaaatcttcaacaacatgttcaaaagtctttttaagtttttcatcatcctt ttctaatatatcagatacttctgtataagtcattctagcttttgaatttattacagattc acatatttcatgtttaaccacatttcctttatggtctatttccataaatatagaaagagt taacttatcttcaaatggatttaagctacatactccatttgaaagagtttttggcaacat tggaattactttatctactaaataaactgatgtagctctttttaaggcttccttatcaag tttatttttctctcttacataatgtgtaacatcagctatgtgaactcctagtttgaagtt tccattaggtaatacttctattgatatggcatcatctaagtcttttgcgtcatctccatc tatagtaaatatgtttaaatctcttaaatctcttcttctttttatctcttcttgaggaat ctcaacagctacagcttctgcttcttgcaatactttctttggaaattcttctggaagacc atgttctcttattatagaatctatttctacgcctctttcacctttttgacctagtatctc tataattttgccttctggttttctatcctcttgtggccatactgtaatttcacatactac cttatcattatctactgctccactaaaatgttttttaggtatatatatatctttagtaaa tttcttgttgtctggtgttacaaatccaaaagttttacttgattggaaagtacctactat tctagttatttctctctttattacttttactattcttccttctgctctcttttcttcagt tgcaggtactactatttctgccataactctatcgttatgcatagcaccatttatattgtc acttgagataaataaatcctgtgtatattcaacatcagattctacaaatccaaaaccctt tttgtgtgatacaaattttccaacaaagtatcccatttgattgggagatactatttttcc ttttttagtaaagcagatataaccatcttcttctaattcatttaaaaaattataaaacat tggcatttctgatgaatgtatatcaaatatttctgctaattcttctttttttagaggatt atatgcactttcatttattaatcctagcaaactttctttaagtcctggtatcatttttcc ctcctgttttacttttcattatattattatttatattgtcttttatatttcttcagataa aacattttttacttatcacataattttctatattttcttattattattacaagttaaaat tacttatttatatttttgatttaatgtaagctttgtcatactaacttcaaacaaattatg atgttttataaattatttgtaaatatcattataattacttaagttattctttatcataat tgcttaaattactctttatctcataattatacaccatcaaataggattggtaaaatattc atctcatataagtattactatataataatttattctattagtatactcaaatcatgtaaa atttatataactcaattaattttttaaatacaactttataatataaaacttataataaaa gtaaatttatatgttaaatgaggttgattttttattattttttatttatgctagtactaa agacttgcaaacgttttttgacaagtctttattttgtctaaattaaacaaacttttttac aaataaatacataaaatttaaactaatctatttattggaggagataaaattggaagaagt aattgcaaaaattattactatagaaaatggattcaaagaaattgaaaacattgctaaaaa aattgtaaaaaataatgactcaaaaaagtgttattatctatcaatctacttatataggtc agaatattatcaagtaagagaattggctgtgtttatacttggttttatatcagtaactat ttctgaagctttgttatttttaaaagacaatgtgagtaaagatgaaaactggagagtaca agaaatactagctaaatcatttgattattattgcagtgaagtaggatatgaaaaggcact tcctgttataaaagaatggcttaattctgatagtccaaacataaaaagggctgtgacaga aggtcttagaatttggactagtagagactattttaaatctaatcctgacgttgctatatc actactttctagtttaaaagaagatgatagcgaatacttgagaaagtctgtaggtaatgc tcttagagatataagtaaaaaatatccagatttagtaaaaaaagaattagattcatggga tatatcaaataaaaaagttgagtttgtatataagcttgcttcaaaatgtatcttggcaaa gtaaaatggaggtgaacttatttgaaacttcgtgatgagtatacttgcccattagaacta acacatgatatgataaaaggcaaatggaaatctattatattatggagattacgcatagga ccaacctccttatcaaaacttgaaaaggaaatcaatggtattaatcaaaagatgttactt gaacaacttaaagaattaattgaatttggtcttgtagataaaaagacatataaaggttac ccacttaaagttgaatactcacttacacctattcgagggaaacaaatattggatgctttg gctataatgcaagatataggaattagctttatgttggataatggtatggaagatattctt aaggaaaaaggtgttttaaaataaatagatacccacaaaaaagtaagtaatttaccatta ttttcaactggtatataattaaattatagatatattctattaatttattataataggagg taaattattatgaaagtaactagtacaggtatagtaaatggtgttatagaagataaatac ggtaaaagaggaactcagttcaatgaaggtggtatgcctacatattcactacctctaaag tttgaagatgctccaaagaatacagtatcctttgctgtatttttagaagataaagactct gttcctgtatgtgggtttgcatggatacattggttagctgtaaatataacaaaagatgag ttaaatgaaaatgaaagtgtaacagctactgattttgtacaagggactactagttggcat ggcaaactaggaggtcttgacagattagaggccagtgtatatggtggaatggctcctcca gacagacctcatgtctatgaaatacatgtatttgcacttgatactatccttgaccttgaa aaaggattctatatgaatgaatttttcaaagctattgaagggcatgttttagatacattt acactaaaaggaagctattctaattaattaggtttactatagctaatcattaattaaatg ctacatttaattgatgattagcttaattgttattagaatattttctgcactttatcttaa tatatattttagttgactggtattttaatttctattagattattatcaatttatataaat tgattttagcttaaaacttacttatctatttcagtttctattagaattattattagactc attaaaataaaagcattaatataactaataatatatgttaaattcattaactctacataa agttttataatctaaatgaaatacaataatctgcataaaattcaatagcttatataaaat ttagtaatttatataaatattatcaatctatataaaatttaataacttatataaatttaa ctaatttatataaaatcttaaggagttgccatgataaaaaaaatagagcatgtggtcatt actaataataatatagaaaattatatcaatttttataaaaaatttggtttttc |