Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00145_1A_021022.fasta |
contig | u00000crpx_c_021022 |
start | 3529209 |
length | 13534 |
strand | - |
type | core |
seq | taaagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaataga ttaatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatga aaatagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagt taaatattaatgcagaaattgaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagatt tatatttagaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccccatccccaaaa aagctattacaaaaaaggctggaactattaaaaaacctctagttgattttggtactgact tacaaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagattttt ctagagcgtactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattatt tatcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatga gtttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatgga atgaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaa atgcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatactttta ataacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatat atataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatat taaatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctt ttaaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgtt atataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtgttggatatggaattg gtaatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataa atcatttaaattacagtttcttagtcaacgaaaattatgagacaataggacctttactgt gtgataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaa gttctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaa gagatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgcta atagatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaa actcaacaaaaggtagacctgaaagagtatacaaattatttatatcagaaaataaatatt aaaatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgact ttctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttataatatttaataatat tttatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatgagcaaataa agctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgcataccaaa attatatccctgactaatacttcccattccaatccataaaaatactcctggaacccttag taaaatctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattacattttcatt tcctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatcatttataac tgcaggagtccccattttaaattccactttagcatttcctccaaatgatttagctattcc tgtagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacagattggtcaaatgttct taaagtacctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgcttcctgcattaaa cataccaatagttaaaactacaggctctttctgaggtttttctcttgaaagtatagtgtt taatgctatttgtatatgtgacattatgtttattgggtccactccaaattcagggcttgc tccatgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatctgcagatgccatagctgg accacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactgtgaaatgc catagctgcatcgacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgattttgcacc tctggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagtaagtgctt attatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcgtgtccaca actatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctccataatagg aagtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccatttttactgtctaaaac agctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttctaaagtact ggtaacaaaggttactgttttcggtagattgcaaccaatttcgggattttcatgtaaata tcttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaatttttcat attccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaatgaaatgat gctgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaaggagttggaat atcatctggaataggacatttatatgttttaccattcatagatttatcaaattcttcttt tgcctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagccataatctt tgatgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgtaaactgcca gctatgacctggtgctcctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtcggaactat atgcattacatctccaatatcagtagagccataactattaaagtttgtaacatttcctcc accataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagccttatattg ttgtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtccaaggctc ttgtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattgtttaaagt attataacaccctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcattgcagctcc ttttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctacttaaagctct tgtataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcctccatctgt aattgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataattagctcccac attagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgagcctgcatg tgcagtctttcccttaaagtgaaactttacagagttaacagctgttgaagtaccaattgt agcttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttcaaacgctcc acctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgcataaaatac tatagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactactgcccctac atgtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaattcaaatgc ttcttgttttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaattctcccataaa acctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaacctcctac acctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttcacatgcttt aaattctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatcatcaagttt gaatctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcattttctattcctccta taaatctatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaatgccactga tgcaatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataatctgttgc cctttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcattggaaattatctg tgttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattcttggagaata tcccaatagttttcctacaattgcagtaaatagtattataaatacagagcctacaacaag tattcctatagttggaataatcatcccaaacaatgctgttggagttaccttagcaagtcc tccaggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagatttatctaa aattcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaacatgctat gttgggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagccaatcctac aaaattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatatactaaagtagatgattt tttacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactttttgactc atctttcaaaaaatccccgttatctcttttaaattttaattctttatttatacaatatgt agttatcggaatgccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaatgcagcaag ttcaggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataataccagcaacagtagaacc cgctattggaggtgctgctattaaagcatactctctaccaaataacatactacccactgt taaacagccaacccctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgttttccattc atgacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaagctatacc aaagttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggtaaaatatt tgtccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaattgcaccttt tgttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagtaaagcaagt aagtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattttttatcaa taaaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatggtatagct tgatattttttgatgatattatatacgtcctaaattattcctaaaatatctaaataaata taactagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatttctttttg atttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactattctctatatta gtatacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatatatttttataa acgtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccattaaaccaat attatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatctattagtgca tcccctcccttgtaaattagactatttctaagcgaatttagatatcttattcctagagac tattactaaaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatactttaaaat tctttctatacaagtataatttatcatataatgacatctatacctttatctttatagtag tcctaaattattcttaaattgacaataaaaataatttcactatttataaaaatacttgtt tttatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctttgtcaata tattctgacatttttccagaaaatttataaagttatatagtgagtaaatcatactatttt tatataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatatttacttaagtataaaaataa aaaatgtgtattctcctttttatagtaattttaattgccattatttttaagaagaataca cactttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacactaattaacat tagttcctaacttctatttatcttattcctaccctactactatatccgtagaaaaatcta aaacttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgattttttcttatatc tcttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccatatctcttac tcatctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaatatccaaaac attcaacattatcttcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttacttaaatatt caattctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgcccctaaac cattttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaaggtaaatc ttaaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatggattttgaa tcccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatacacttgaaa aataataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgcttttttgtcttcat cagtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattgtggaaact tcccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaatgcattta acacattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatacacatccaa ttttattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgccaaagtca tattataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactatacttaatac ctgctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatggttcatct cattaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagtctcactgt actttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatgtactaaat tcataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttctattaatg tatctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatcatctccat ttggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccatttctttaa ataaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgagatggataat ctaatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcccttagtta caaagtccataattgcaggtcctttgttatcactatcccatgaaccttcacattgatggg ctgcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttccctcctaaa atttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagattacatctaaa taatcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcctctataatt ttatcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgattttgtgttaca agactttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaattaatatt tctaatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatactatagttata gttccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactccaacccct ttacctaatgctccagaggaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaattacctga ccttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgattattagttct aattctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattcctagtaaa taggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataaatgtaaag ttagatacctctcctccaacaagatacgttggtaatgcagctaatccccaaaccattcca tatgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccacctatcattact gctacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctgtaactccc ataagtgcactaaaacttactgtaccaaatagttgtttttgttctttattcctagttttt aagaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcagcgcccata aaaattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatagtaaagttt gctgcaccaaaaactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaacactccaa ttacccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaatccacata ccaataggtccaaatacagttaatgtaactgatagagttattattaaagataacactgga actaaaaaatagtgtaatgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaattataattccc attgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtagcctgtaaa tttataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataataacgtaact gctaacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgctattgcaatt aatactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgatatgtagga ctgtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaagtatacca gctgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaaagatggaa ttaaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatacttgattca cttgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacatgagtacct attataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactccttttaatttttta atttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgagtaacacaa tgcgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatattttcatttaaa tctttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttatatgcaacat taaataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttatatattttct tatcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgtttatataaatc tatagaattatcttcatctattgaagcttcatccgacataattctttggataaagtactg tagatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctacattaaaatg atattttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgtactatcatg agactctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcctcatcatc aggaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattccaatttcaaa atgctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaattgattctt ttcacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagtaaggttaagcttagataatcact tgcctttatatttaaagctttctcaccatattcaattatttcattaataagaactatatt attggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgttctagcatatcgtatgaatctag tatatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactctttttttaaagcc aattcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggctacattatt atttaaaatctgaattattttcatatattcctcctttcaataaaaagaactcaagcatat atgtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgctaatcagta acatactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgtttaatttcata ttctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatatttttttattc tataactacaagctctgttatgcgattatctgacaaggtttatatactaaattgatacta ttttaccgtcactaatatttataatattgtctgaaccattatctattttactattatgaa ttatcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtatgttaacaaataaattcttaagat atattaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagatatattaata ggtaaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatac ttaaatttagttttatttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaattta attttgtttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttagttttattt aaacgctctagtgatatttttaaataaattttaataaaaatcattctattttgtcataaa tcatttatctggcttatatttaagatatattagtggatactttacactttttaattcctc attacttcttaaaagtttattattattttccatatcataaatttgtaacattactttatt tacatatagagcataataattatcactataaaaatattgatactcatatcgagggtcatc tttgtaatacactttgtatagtattccttcgtaacttgccttcttggctttttcttttgt aatactttttatattatcttttgaaatatcttgttttaccatatacttatcaatatatgt ttcagcatctttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaaaccctgttacacttat aatacctataattaatactataaaaataactttatattttttcatattaatcctccttca tttattatttaaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgttatcttttttattaaaa tataacatccctcatatttagcatcaatatatatgccccaactggtaggttaaaagaccc cactgtcagtactttgattaaattacatgtatgtatatatatttttaacaaatctattat atgtcaacttgtctactattacatataatctgtaatattacatctgctgctttttttgag cctcctgcattataaaagctttttgatagtttagttgcattttctttatattcattgtca tttataacttgaaatactgcttttttaatactttctgacttatcctcttttaacataatt cctgctcccaaatgaacaactctcttagctaccattctctgctccgaatgttgaggaaat aataccataggtactccataatataaactttcattaacactattcatcccagaatgagta acaaacacatcagttttttgaagtatagcaatctgttcaacactatttttgacctcaaaa ttatttggtatatttcctaaacttttaatatcagtacttctaccaacagacataatcaca tcaacatcagaatctttaaatgcacttatacagtttttataaaagctaacatttttatta ttaattgtaccaagcgaaatatatattagctttctttttctctctttaggttcaataatc aactttgatactgatggacctacaaatgaatacttactagagaaggtttctaccattggt tgaaattcttttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatcattagaaactatagaa ataaaattttttacttcatacccttttctttgtaaaagctttatttttttattaatgcgt cttacaccaaaaatcatacgtataatttctataaagttttgtttcatcaactttgctgta tgtttattaaatgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaatattaagtttttgtgca aataactttccccaaaaacttaatgaatctgatacaatgcaatctggattaaaatcttta agttctctacaaactttttcatctaaagaaatagtagtatctactatcatctcaattaat ccaggaaaatccttaccaatttttttctcatctccagggagtaattctggaaggtattta tcacaacaaataaattttgctccagcaccttcaattttatctttaaattcattaaaagaa taatacaatacctcatttcctctatccactaattcacgaactacttcaatagtaggatta gtatgaccatatgcaggaatgctaaaaaatactattttactcatatttcatacctccttt tataatttttttaaatcattcttctttacgtactactcccacatgacctataaaatttat caaatcacgttgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctccaagtaccaataattt atctcctgcatttatattaaatacttctcttgcttcttttggaatgacaatctgaccacg ttcaccaactacaactgctccaaagaaaaactttcctttaggaggtactataatacctgt tttttcttctgaatgattaactaagtcatctagtttgacattgtacaattttgcaagttt aatgcaactacatatatcaggaatagattctccac |