Block details
fasta C_difficile_CD00058_1A_022457.fasta
contig u00000crpx_c_022457
start 3666444
length 13644
strand -
type core
seq aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt
aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa
atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta
aatattaatgcagaaattgaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta
tatttggaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccctatccccaaaaaa
gctattacaaaaaaggctggaactataaaaaaacctctagttgattttagtactgactta
caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttct
agagcatactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta
tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt
ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat
gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat
gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat
aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat
ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta
aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt
aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat
ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtgttggatatggaattggt
aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat
catttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt
gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt
tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga
gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat
agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac
tcaacaaaaggtagacctgaaagggtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa
aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt
ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttatgatatttaataatattt
aataatattttatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatga
gcaaataaagctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgc
ataccaaaattatatccctgactaacacttcccattccaatccataaaaatactcctgga
acccttagtaaaatctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattaca
ttttcatttcctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatca
tttataactgcaggagtccccattttaaattccactttagcatttcctccaaatgattta
gctattcctgtagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtca
aatgttcttaaagttcctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgtttcct
gcattaaacataccaatagttaaaactacaggttctttctgaggtttttctcttgaaagt
atagtgtttaatgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattca
gggcttgctccatgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgcc
atagctggaccacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactg
tgaaatgccatagctgcatcaacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgat
tttgcacctctggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagt
aagtgcttattatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcg
tgtccacaactatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctcc
ataataggaagtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccatttttactg
tctaaaacagctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttct
aaagtactggtaacaaaggttactgttttcggtagattgcaaccaatttcgggattttca
tgtaaatatcttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaa
tttttcatattccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaat
gaaatgatgctgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaagga
gttggaatatcatctggaataggagatttatatgttttaccattcatagatttatcaaat
tcttcttttgcctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagcc
ataatttttgatgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgta
aactgccagctatgacctggtgcacctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtc
ggaactatatgcattacatctccaatatcagtagagccataactattaaagtttgtaaca
tttcctccaccataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagcc
ttatattgttgtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtc
caaggctcttgtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattg
tttaaagtattataacatcctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcatt
gcagctccttttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctactt
aaagctcttgtataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcct
ccatctgtaattgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataatta
gctcccacattagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgac
cctgcatgtgcagtctttcccttaaaatgaaactttacagaattaacagctgttgaagta
ccaattgtagcttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttca
aacgctccacctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgca
taaaatactatagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactact
gcccctacatgtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaat
tcaaatgcttcttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaactct
cccataaaacctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaa
cctcctacacctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttca
catgctttaaattctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatca
tcaagtttgaatctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcatttcctat
tcctcctataagtatatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaat
gccactgatgcaatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataa
tctgttgccctttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcgttggaa
attatctgtgttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattctt
ggagaatatcccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagaacct
acaacaagtattcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttacctta
gcaagtcctccaggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagat
ttatctaaaattcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaa
catgctatattaggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagcc
aatcctacaaaattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactagagta
gatgattttttacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactt
tttgactcatctttcaaaaaatccccgttatctcttttaaattttaattctttatttata
caatatgtagttatcggaatgccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaat
gcagcaagttcaggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataataccagcaaca
gtagaacccgctattggaggtgctgctattaaagcatactctctgccaaataacatacta
cccactgttaaacagccaacacctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgtt
ttccattcatgacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaa
gctataccaaagttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggt
aaaatatttgtccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaatt
gcaccttttgttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagta
aagcaagtaagtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattt
tttatcaataaaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatg
gtatagcttgatattttttgatgatattatatacgtcctaaattattcctaaaatatcta
aataaatataactagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatt
tctttttgatttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactattct
ctatattagtatacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatatat
ttttataaacgtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccatt
aaaccaatattatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatcta
ttagtgcatcccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattc
ctaggaactattactagaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatac
tttaaaattctttctatacaagtatgatttatcatataatgacatctatacctttatctt
tatagtagtcctaaattattcttaaatttacaataaaaataatttcactatttataaaaa
tacttgtttttatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctt
tgtcaatatattctgacatttttctagaaaatttataaagttatatagtaagtaaatcat
actatttttatataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatattgacttaagtat
aaacataaaaaatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaaga
agaatacacactttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacacta
attaacattagttcctaacttctatttatcttattcttaccctactactatatccgtaga
aaaatctaaaacttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgatttttt
cttatatctcttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccata
tctcttactcatctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaata
tccaaaacattcaacattatcttcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttact
taaatattcaattctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgc
ccctaaaccattttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaa
ggtaaatcttaaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatgg
attttgaatcccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatac
acttgaaaaataataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgctttttt
gtcttcatcagtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattg
tggaaacttcccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaa
tgcatttaacacattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatac
acatccaactttattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgc
caaagtcatattataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactata
cttaatacctgctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatg
gttcatctcattaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagt
ctcactgtactttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatg
tactaaattcataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttc
tattaatgtatctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatc
atctccatttggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccat
ttctttaaataaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgaga
tggataatccaatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcc
cttagttacaaaatccataattgcaggtcctttgttatcactatcccatgaaccttcaca
ttgatgggctgcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttcc
ctcctaaaatttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagatta
catctaaataatcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcct
ctataattttatcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgatttt
gtgttacaagactttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaa
ttaatatttctaatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatacta
tagttatagttccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactc
caacccctttacctaatgctccagaggaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaa
ttacctgaccttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgatta
ttagttctaattctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattc
ctagtaaataggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataa
atgtaaagttagatacctctcctccaacaagatatgttggtaatgcagctaatccccaaa
ccattccatatgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccaccta
tcattactgctacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctg
taactcccataagtgcactaaaacttactgtaccaaataattgtttttgttctttattcc
tagtttttaagaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcag
cacccataaaaattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatag
taaagtttgctgcaccaaagactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaa
cactccaattacccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaa
tccacataccaataggtccaaatatagttaatgtaactgatagagttattattaaagata
atactggaactaaaaaatagtgtagtgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaatta
taattcccattgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtag
cctgtaaatttataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataata
acgtaactgctaacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgcta
ttgcaattaatactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgat
atgtaggactgtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaa
gtataccagctgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaa
agatggaattaaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatac
tcgattcacttgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacat
gagtacctattataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactcctttta
attttttaatttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgag
taacacaatgcgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatatttt
catttaaatctttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttata
tgcaacattaaataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttata
tattttcttatcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgttta
tataaatctatagaattatcttcatctattgaagcttcatccgacataattctttggata
aagtactgtagatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctaca
ttaaaatgatattttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgta
ctatcatgagactctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcc
tcatcatcaggaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattcca
atttcaaaatgctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaat
tgattcttttcacatcttttaagtaaaaactctagatggtctagtaaggttaagcttaga
taatcacttgactttatatttaaagctttctcaccatattcaattatttcattaataaga
actatattattggagtctgagttttgtagtagataactaaaatgttctagcatatcatat
gaatctagtatatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactcttttt
ttaaagccaattcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggct
acattattatttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactc
aagcatatatgtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgct
aatcagtaacatactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgttta
atttcatattctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatattt
ttttattctataactacaagctctgttatgcgattatctgacaaggtttatatactaaat
tgatactattttaccgtcactaatatttataatattgtctgaaccattatctattttact
attatgaattatcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtatgttaacaaataaatt
cttaagatatattaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagata
tattaataggtaaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatat
ataaatacttaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatact
taaatttagttttatttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttaa
ttttgtttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttaattttgttta
aacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttagttttatttaaacgctcta
gtgatatttttaaataaattttaataaaaatcattctattttgtcataaatcatttatct
ggcttatatttaagatatattggtggatactttacactttttaattcctcattacttctt
aaaagtttattattattttccatatcataaatttgtaacattactttatttacatataga
gcataataattatcactataaaaatattgatactcatatcgagggtcatctttgtaatac
actttgtatagtattccttcgtaacttgccttcttggctttttcttttgtaatacttttt
atattatcttttgaaatatcttgttttaccatatacttatcaatatatgtttcagcatct
ttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaaaccctgttacacttataatacctata
attaatactataaaaataactttatattttttcatattgatcctccttcatttattattt
aaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgttatcttttttattaaaatataacatcc
ctcatatttagcatcaatatatatgccccaactggtaggttaaaagaccccactgtcagt
actttgattaaattacatgtatgtatatatatttttaacaaatctattatatgtcaactt
gtctactattacatataatctgtaatattacatctgctgctttttttgagcctcctgcat
tataaaagctttttgatagtttagttgcattttctttatattcattgtcatttataactt
gaaatactgcttttttaatactttctgacttatcctcttttaacataattcctgctccca
aatgaacaactctcttagctaccattctctgctccgaatgttgaggaaataataccatag
gtactccataatataaactttcattaacactattcatcccagaatgagtaacaaacacat
cagttttttgaagtatagcaatctgttcaacactatttttgacctcaaaattatttggta
tatttcctaaacttttaatatcagtacttctaccaacagacataatcacatcaacatcag
aatctttaaatgcacttatacagtttttataaaagctaacatttttattattaattgtac
caagcgaaatatatattagctttctttttctctctttaggttcaataatcaactttgata
ctgatggacctacaaatgaatacttactagagaaggtttctaccattggttgaaattctt
ttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatcattagaaactatagaaataaaatttt
ttacttcatacccttttctttgtaaaagctttatttttttattaatgcgtcttacaccaa
aaatcatacgtataatttctataaagttttgtttcatcaactttgctgtatgtttattaa
atgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaatattaagtttttgtgcaaataactttc
cccaaaaacttaatgaatctgatacaatgcaatctggattaaaatctttaagttctctac
aaactttttcatctaaagaaatagtagtatctactatcatctcaattaatccaggaaaat
ccttaccaatttttttctcatctccagggagtaattctggaaggtatttatcacaacaaa
taaattttgctccagcaccttcaattttatctttaaattcattaaaagaataatacaata
cctcatttcctctatccactaattcacgaactacttcaatagtaggattagtatgaccat
atgcaggaatgctaaaaaatactattttactcatatttcatacctccttttataattttt
ttaaatcattcttctttacgtactactcccacatgacctataaaatttatcaaatcacgt
tgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctccaagtaccaataatttatctcctgca
tttatattaaatacttctcttgcttcttttggaatgacaatctgaccacgttcaccaact
acaactgctccaaagaaaaactttcctttaggaggtactataatacctgttttttcttct
gaatgattaactaagtcatctagtttgacattgtacaattttgcaagtttaatgcaacta
catatatcaggaatagattctccac