Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00058_1A_022457.fasta |
contig | u00000crpx_c_022457 |
start | 3666444 |
length | 13644 |
strand | - |
type | core |
seq | aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta aatattaatgcagaaattgaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta tatttggaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccctatccccaaaaaa gctattacaaaaaaggctggaactataaaaaaacctctagttgattttagtactgactta caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttct agagcatactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtgttggatatggaattggt aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat catttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac tcaacaaaaggtagacctgaaagggtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttatgatatttaataatattt aataatattttatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatga gcaaataaagctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgc ataccaaaattatatccctgactaacacttcccattccaatccataaaaatactcctgga acccttagtaaaatctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattaca ttttcatttcctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatca tttataactgcaggagtccccattttaaattccactttagcatttcctccaaatgattta gctattcctgtagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtca aatgttcttaaagttcctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgtttcct gcattaaacataccaatagttaaaactacaggttctttctgaggtttttctcttgaaagt atagtgtttaatgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattca gggcttgctccatgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgcc atagctggaccacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactg tgaaatgccatagctgcatcaacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgat tttgcacctctggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagt aagtgcttattatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcg tgtccacaactatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctcc ataataggaagtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccatttttactg tctaaaacagctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttct aaagtactggtaacaaaggttactgttttcggtagattgcaaccaatttcgggattttca tgtaaatatcttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaa tttttcatattccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaat gaaatgatgctgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaagga gttggaatatcatctggaataggagatttatatgttttaccattcatagatttatcaaat tcttcttttgcctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagcc ataatttttgatgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgta aactgccagctatgacctggtgcacctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtc ggaactatatgcattacatctccaatatcagtagagccataactattaaagtttgtaaca tttcctccaccataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagcc ttatattgttgtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtc caaggctcttgtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattg tttaaagtattataacatcctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcatt gcagctccttttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctactt aaagctcttgtataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcct ccatctgtaattgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataatta gctcccacattagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgac cctgcatgtgcagtctttcccttaaaatgaaactttacagaattaacagctgttgaagta ccaattgtagcttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttca aacgctccacctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgca taaaatactatagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactact gcccctacatgtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaat tcaaatgcttcttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaactct cccataaaacctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaa cctcctacacctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttca catgctttaaattctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatca tcaagtttgaatctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcatttcctat tcctcctataagtatatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaat gccactgatgcaatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataa tctgttgccctttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcgttggaa attatctgtgttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattctt ggagaatatcccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagaacct acaacaagtattcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttacctta gcaagtcctccaggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagat ttatctaaaattcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaa catgctatattaggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagcc aatcctacaaaattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactagagta gatgattttttacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactt tttgactcatctttcaaaaaatccccgttatctcttttaaattttaattctttatttata caatatgtagttatcggaatgccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaat gcagcaagttcaggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataataccagcaaca gtagaacccgctattggaggtgctgctattaaagcatactctctgccaaataacatacta cccactgttaaacagccaacacctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgtt ttccattcatgacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaa gctataccaaagttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggt aaaatatttgtccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaatt gcaccttttgttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagta aagcaagtaagtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattt tttatcaataaaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatg gtatagcttgatattttttgatgatattatatacgtcctaaattattcctaaaatatcta aataaatataactagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatt tctttttgatttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactattct ctatattagtatacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatatat ttttataaacgtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccatt aaaccaatattatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatcta ttagtgcatcccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattc ctaggaactattactagaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatac tttaaaattctttctatacaagtatgatttatcatataatgacatctatacctttatctt tatagtagtcctaaattattcttaaatttacaataaaaataatttcactatttataaaaa tacttgtttttatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctt tgtcaatatattctgacatttttctagaaaatttataaagttatatagtaagtaaatcat actatttttatataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatattgacttaagtat aaacataaaaaatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaaga agaatacacactttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacacta attaacattagttcctaacttctatttatcttattcttaccctactactatatccgtaga aaaatctaaaacttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgatttttt cttatatctcttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccata tctcttactcatctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaata tccaaaacattcaacattatcttcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttact taaatattcaattctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgc ccctaaaccattttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaa ggtaaatcttaaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatgg attttgaatcccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatac acttgaaaaataataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgctttttt gtcttcatcagtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattg tggaaacttcccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaa tgcatttaacacattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatac acatccaactttattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgc caaagtcatattataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactata cttaatacctgctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatg gttcatctcattaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagt ctcactgtactttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatg tactaaattcataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttc tattaatgtatctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatc atctccatttggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccat ttctttaaataaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgaga tggataatccaatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcc cttagttacaaaatccataattgcaggtcctttgttatcactatcccatgaaccttcaca ttgatgggctgcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttcc ctcctaaaatttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagatta catctaaataatcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcct ctataattttatcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgatttt gtgttacaagactttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaa ttaatatttctaatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatacta tagttatagttccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactc caacccctttacctaatgctccagaggaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaa ttacctgaccttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgatta ttagttctaattctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattc ctagtaaataggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataa atgtaaagttagatacctctcctccaacaagatatgttggtaatgcagctaatccccaaa ccattccatatgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccaccta tcattactgctacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctg taactcccataagtgcactaaaacttactgtaccaaataattgtttttgttctttattcc tagtttttaagaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcag cacccataaaaattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatag taaagtttgctgcaccaaagactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaa cactccaattacccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaa tccacataccaataggtccaaatatagttaatgtaactgatagagttattattaaagata atactggaactaaaaaatagtgtagtgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaatta taattcccattgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtag cctgtaaatttataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataata acgtaactgctaacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgcta ttgcaattaatactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgat atgtaggactgtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaa gtataccagctgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaa agatggaattaaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatac tcgattcacttgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacat gagtacctattataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactcctttta attttttaatttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgag taacacaatgcgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatatttt catttaaatctttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttata tgcaacattaaataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttata tattttcttatcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgttta tataaatctatagaattatcttcatctattgaagcttcatccgacataattctttggata aagtactgtagatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctaca ttaaaatgatattttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgta ctatcatgagactctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcc tcatcatcaggaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattcca atttcaaaatgctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaat tgattcttttcacatcttttaagtaaaaactctagatggtctagtaaggttaagcttaga taatcacttgactttatatttaaagctttctcaccatattcaattatttcattaataaga actatattattggagtctgagttttgtagtagataactaaaatgttctagcatatcatat gaatctagtatatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactcttttt ttaaagccaattcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggct acattattatttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactc aagcatatatgtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgct aatcagtaacatactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgttta atttcatattctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatattt ttttattctataactacaagctctgttatgcgattatctgacaaggtttatatactaaat tgatactattttaccgtcactaatatttataatattgtctgaaccattatctattttact attatgaattatcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtatgttaacaaataaatt cttaagatatattaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagata tattaataggtaaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatat ataaatacttaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatact taaatttagttttatttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttaa ttttgtttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttaattttgttta aacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttagttttatttaaacgctcta gtgatatttttaaataaattttaataaaaatcattctattttgtcataaatcatttatct ggcttatatttaagatatattggtggatactttacactttttaattcctcattacttctt aaaagtttattattattttccatatcataaatttgtaacattactttatttacatataga gcataataattatcactataaaaatattgatactcatatcgagggtcatctttgtaatac actttgtatagtattccttcgtaacttgccttcttggctttttcttttgtaatacttttt atattatcttttgaaatatcttgttttaccatatacttatcaatatatgtttcagcatct ttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaaaccctgttacacttataatacctata attaatactataaaaataactttatattttttcatattgatcctccttcatttattattt aaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgttatcttttttattaaaatataacatcc ctcatatttagcatcaatatatatgccccaactggtaggttaaaagaccccactgtcagt actttgattaaattacatgtatgtatatatatttttaacaaatctattatatgtcaactt gtctactattacatataatctgtaatattacatctgctgctttttttgagcctcctgcat tataaaagctttttgatagtttagttgcattttctttatattcattgtcatttataactt gaaatactgcttttttaatactttctgacttatcctcttttaacataattcctgctccca aatgaacaactctcttagctaccattctctgctccgaatgttgaggaaataataccatag gtactccataatataaactttcattaacactattcatcccagaatgagtaacaaacacat cagttttttgaagtatagcaatctgttcaacactatttttgacctcaaaattatttggta tatttcctaaacttttaatatcagtacttctaccaacagacataatcacatcaacatcag aatctttaaatgcacttatacagtttttataaaagctaacatttttattattaattgtac caagcgaaatatatattagctttctttttctctctttaggttcaataatcaactttgata ctgatggacctacaaatgaatacttactagagaaggtttctaccattggttgaaattctt ttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatcattagaaactatagaaataaaatttt ttacttcatacccttttctttgtaaaagctttatttttttattaatgcgtcttacaccaa aaatcatacgtataatttctataaagttttgtttcatcaactttgctgtatgtttattaa atgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaatattaagtttttgtgcaaataactttc cccaaaaacttaatgaatctgatacaatgcaatctggattaaaatctttaagttctctac aaactttttcatctaaagaaatagtagtatctactatcatctcaattaatccaggaaaat ccttaccaatttttttctcatctccagggagtaattctggaaggtatttatcacaacaaa taaattttgctccagcaccttcaattttatctttaaattcattaaaagaataatacaata cctcatttcctctatccactaattcacgaactacttcaatagtaggattagtatgaccat atgcaggaatgctaaaaaatactattttactcatatttcatacctccttttataattttt ttaaatcattcttctttacgtactactcccacatgacctataaaatttatcaaatcacgt tgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctccaagtaccaataatttatctcctgca tttatattaaatacttctcttgcttcttttggaatgacaatctgaccacgttcaccaact acaactgctccaaagaaaaactttcctttaggaggtactataatacctgttttttcttct gaatgattaactaagtcatctagtttgacattgtacaattttgcaagtttaatgcaacta catatatcaggaatagattctccac |