Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00246_1A_020486.fasta |
contig | u00000crpx_c_020486 |
start | 3537129 |
length | 13429 |
strand | - |
type | core |
seq | aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta aatattaatgcagaaattaaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta tatttagaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccctatccccaaaaaa gctattacaaaaaaggctggaactataaaaaaacctctagttgattttggtactgactta caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttct agagcatactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtgttggatatggaattggt aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat cctttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac tcaacaaaaggtagacctgaaagggtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatatatcttttatgatatttaataatattt tatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatgagcaaataaag ctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgcataccaaaat tatatccctgactaatacttcccattccaatccataaaaatactcctggaacccttagta aaacctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattacattttcatttc ctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatcatttataactg caggagtccccattttaaactccactttagcatttcctccaaatgatttagctattcctg tagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtcaaatgttctta aagttcctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgtttcctgcattaaaca taccaatagttaaaactacaggttctttctgaggtttttctcttgaaagtatagtgttta atgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattcagggcttgctc catgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgccatagctggac cacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactgtgaaatgcca tagctgcatcaacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgattttgcacctc tggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagtaagtgcttat tatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcgtgtccacaac tatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctccataataggaa gtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccattttcactgtctaaaacag ctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttctaaagtactgg taacaaaggttactgttttcggtagattgcaaccaatttcgggattttcatgtaaatacc ttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaatttttcatat tccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaatgaaatgatgc tgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaaggagttggaatat catctggaataggacatttatatgttttaccattcatagatttatcaaattcttcttttg cctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagccataatctttg atgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgtaaactgccagc tatgacctggtgctcctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtcggaactatat gcattacatctccaatatcagtagagccataactattaaagtttgtaacatttcctccac cataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagccttatattgtt gtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtccaaggctctt gtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattgtttaaagtat tataacaccctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcattgcagctcctt ttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctacttaaagctcttg tataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcctccatctgtaa ttgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataattagctcccacat tagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgagcctgcatgtg cagtctttcccttaaagtgaaactttacagagttaacagctgttgaagtaccaattgtag cttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttcaaacgctccac ctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgcataaaatacta tagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactactgcccctacat gtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaattcaaatgctt cttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaattctcccataaaac ctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaacctcctacac ctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttcacatgctttaa attctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatcatcaagtttga atctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcatttcctattcctcctata agtatatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaatgccactgatg caatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataatctgttgccc tttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcgttggaaattatctgtg ttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattcttggagaatatc ccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagaacctacaacaagta ttcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttaccttagcaagtcctc caggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagatttatctaaaa ttcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaacatgctatat taggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagccaatcctacaa aattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactagagtagatgattttt tacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactttttgactcat ctttcaaaaaatccccattatctcttttaaattttaattctttatttatacaatatgtag ttatcggaatgccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaatgcagcaagtt caggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataatcccagcaacagtagaacctg ctattggaggtgctgctattaaagcatactctctgccaaataacatactacccactgtta aacagccaacacctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgttttccattcat gacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaagctataccaa agttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgttttttggtaaaatatttg tccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaattgcaccttttg ttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagtaaagcaagtaa gtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattttttatcaata aaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatggtatagcttg atattttttgatgatattatataagtcctaaattattcttaaaatatctaaataaatata actagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatttctttttgat ttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactactctctatattagt atacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatacatttttacaaac gtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccattaaaccaatat tatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatctattagtgcatc ccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattcctaggaacta ttactaaaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatactttaaaattc tttctatacaagtataatttatcatataatgacatctatacctttatctttatagtagtc ctaaattattcttaaattgacaataaaaataatttcactatttataaaaatacttgtttt tatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctttgtcaatata ttctgacattttcccagaaaatttataaagctatatagtaagtaaatcatactattttta tataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatatttacttaagtataaacataaaa aatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaagaagaatacaca ctttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacactaattaacatta gttcctaacttctatttatcttattcctaccctactactatatccatagaaaaatctaaa acttctccattagattttattacttctttataccaatcaaatgattttttcttatatctc ttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccatatctcttactc atctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaatatccaaaacat tcaacattatcctcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttacttaaatattca attctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgcccctaaacca ttttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaaggtaaatctt aaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatggattttgaatc ccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatacacttgaaaaa taataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgcttttttgtcttcatca gtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattgtggaaacttc ccattgcacattgcatcaattagataataatcacggtcattatctaaaaatgcatttaac acattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatacacatccaact ctattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgccaaagtcata ttataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactatacttaatacct gctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatggttcatctca ttaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagtctcactgtac tttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatgtactaaattc ataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttctattaatgta tctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatcatctccattt ggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccatttctttaaat aaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgagatggataatcc aatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcccttagttaca aaatccataattgcaggtcctttgttatcactatcccatgaaccttcgcattgatgggct gcaatacttcctccccagaaaaatgtctctttaatattcatgaattttccctcctaaaat ttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagattacatctaaata atcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcctctataatttt atcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgattttgtgttacaag actttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaattaatatttc taatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatactatagttatagt tccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactccaaccccttt acctaatgctccagaggaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaattacctgacc ttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgattattagttctaa ttctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattcctagtaaata ggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataaatgtaaagtt agatacctctcctccaacaagatacgttggtaatgcagctaatccccaaaccattccata tgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccacctatcattactgc tacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctgtaactcccat aagtgcactaaaacttactgtaccaaatagttgtttttgttctttattcctagtttttaa gaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcagcgcccataaa aattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatagtaaagtttgc tgcaccaaagactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaacactccaatt acccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaatccacatacc aataggtccaaatacagttaatgtaactgatagagttattattaaagataatactggaac taaaaaatagtgtagtgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaattataattcccat tgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtagcctgtaaatt tataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataataacgtaactgc taacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgctattgcaattaa tactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgatatgtaggact gtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaagtataccagc tgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaaagatggaatt aaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatacttgattcact tgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacatgagtacctat tataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactccttttaattttttaat ttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgagtaacacaatg cgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatattttcatttaaatc tttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttatatgcaacatta aataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttatatattttctta tcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgtttatataaatcta tagaattatcttcatctattgaagcttcatctgacataattctttggataaagtactgta gatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctacattaaaatgat attttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactccacaattgtactatcatgag actctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcctcatcatcag gaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattccaatttcaaaat gctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaattgattctttt cacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagtaaggttaagcttagataatcacttg actttatatttaaagctttctcaccatattcaattatttcattaataagaactatattat tggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgttctagcatatcgtatgaatctagta tatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactctttttttaaagccaa ttcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggctacattattat ttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactcaagcatatat gtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgctaatcagtaac atactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgtttaatttcatatt ctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatatttttttattcta taactacaagctctgttatacgattatctgacaaggtttatatactaaattgatactatt ttaccgtcactaatatttataatattgtctgaattattagctattttactattatgaatt atcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtatgttaacaaataaattcttaagatat attaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagatatattaatagg taaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatactt aagtttagttttatttaaacactctagtgatatttttaaataaattttaataaaatcatt ctattttgtcataaatcatttatctggcttatatttaagatatattggtggatactttac actttttaattcctcattacttcttaaaagtttattattattttccatatcataaatttg taacattactttatttacatatagagcataataattatcactataaaaatattgatactc atatcgagggtcatctttgtaatacactttgtatagtattccttcgtaacttgccttctt ggctttttcttttgtaatactttttatattatcttttgaaatatcttgttttaccatata cttatcaatatatgtttcagcatctttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaaa ccctgttacacttataatacctataattaatactataaaaataactttatattttttcat attaatcctccttcatttattatttaaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgtta tcttttttattaaaatataacatccctcatatttagcatcaatatatatgccccaactgg taggttaaaagaccccactgtcagtactttgattaagttacatgtatgtatatatatttt taacaaatctattatatgtcaacttgtctactattacatataatctgtaatattacatct gctgctttttttgagcctcctgcattataaaagctttttgatagtttagttgcattttct ttatattcattgtcatttataacttgaaatactgcttttttaatactttctgacttatcc tcttttaacataattcctgctcccaaatgaacaactctcttagctaccattctctgctcc gaatgttgaggaaataataccataggtactccataatataaactttcattaacactattc atcccagaatgagtaacaaacacatcagttttttgaagtatagcaatctgttcaacacta tttttaacctcaaaattatttggtatatttcctaaacttttaatattagtacttctacca acagacataatcacatcaacatcagaatctttaaatgcatttatacagtttttataaaag ctaacatttttattattaattgtaccaagcgaaatatatattagctttctttttctctct ttaggttcaataatcaactttgatactgatggacctacaaatgaatacttactagagaag gtttctaccattggttgaaattcttttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatca ttagaaactatagaaataaaattttttacttcatacccttttctttgtaaaagctttatt tttttattaatgcgtcttacaccaaaaatcatacgtataatttctataaagttttgtttc atcaactttgctgtatgtttattaaatgcaaaagttgttgtagagcatacatatgggata ttaagtttttgtgcaaataactttccccaaaaacttaatgaatctgatacaatgcaatct ggattaaaatctttaagttctctacaaactttttcatctaaagaaatagtagtatctact atcatctcaattaatccaggaaaatccttaccaatttttttctcatctccagggagtaat tctggaaggtatttatcacaacaaataaattttgctccagcaccttcaattttatcttta aattcattaaaagaataatacaatacctcatttcctctatccactaattcacgaactact tcaatagtaggattagtatgaccatatgcaggaatgctaaaaaatactattttactcata tttcatacctccttttataatttttttaaatcattcttctttacgtactactcccacatg acctataaaatttatcaaatcacgttgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctcc aagtaccaataatttatctcctgcatttatattaaatacttctcttgcttcttttggaat gacaatctgaccacgttcaccaactacaactgctccaaagaaaaactttcctttaggagg tactataatacctgttttttcttctgaatgattaactaagtcatctagtttgacattgta caattttgcaagtttaatgcaactacatatatcaggaatagattctccac |