Block details
fasta C_difficile_CD00035_1A_022456.fasta
contig u00000crpx_c_022456
start 3587247
length 13481
strand -
type core
seq aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt
aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa
atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta
aatattaatgcagaaattgaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta
tatttggaaatagaggataggtttgatggatttgcagttagtggccctatccccaaaaaa
gctattacaaaaaaggctggaactattaaaaaacctctagttgattttggtactgactta
caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttct
agagcgtactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta
tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt
ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat
gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat
gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat
aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat
ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta
aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt
aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat
ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtgttggatatggaattggt
aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat
catttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt
gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt
tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga
gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat
agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac
tcaacaaaaggtagacctgaaagggtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa
aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt
ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttatgatatttaataatattt
tatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatgagcaaataaag
ctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgcataccaaaat
tatatccctgactaatacttcccattccaatccataaaaatactcctggaacccttagta
aaatctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattacattttcatttc
ctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatcatttataactg
caggagtccccattttaaattccactttagcatttcctccaaatgatttagctattcctg
tagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtcaaatgttctta
aagttcctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgtttcctgcattaaaca
taccaatagttaaaactacaggttctttctgaggtttttctcttgaaagtatagtgttta
atgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattcagggcttgctc
catgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgccatagctggac
cacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactgtgaaatgcca
tagctgcatcgacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgattttgcacctc
tggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagtaagtgtttat
tatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcgtgtccacaac
tatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctccataataggaa
gtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccattttcactgtctaaaacag
ctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttctaaagtactgg
taacaaaggttactgttttcggtatattgcaaccaatttcgggattttcatgtaaatatc
ttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaatttttcatat
tccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaatgaaatgatgc
tgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaaggagttggaatat
catctggaataggacatttatatgttttaccattcatagatttatcaaattcttcttttg
cctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagccataatctttg
atgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgtaaactgccagc
tatgacctggtgctcctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtcggaactatat
gcattacatctccaatatcagtagaaccataactattaaagtttgtaacatttcctccac
cataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagccttatattgtt
gtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtccaaggctctt
gtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattgtttaaagtat
tataacaacctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcattgcagctcctt
ttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctacttaaagctcttg
tataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcctccatctgtaa
ttgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataattagctcccacat
tagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgagcctgcatgcg
cagtctttcccttaaagtgaaactttacagagttaacagctgttgaagtaccaattgtag
cttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttcaaacgctccac
ctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgcataaaatacta
tagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactactgcccctacat
gtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaattcaaatgctt
cttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaattctcccataaaac
ctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaacctcctacac
ctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttcacatgctttaa
attctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatcatcaagtttga
atctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcatttcctattcctcctata
agtatatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaatgccactgatg
caatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataatctgttgccc
tttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcgttggaaattatctgtg
ttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattcttggagaatatc
ccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagagcctacaacaagta
ttcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttaccttagcaagtcctc
caggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagatttatctaaaa
ttcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaacatgctatat
taggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagccaatcctacaa
aattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactagagtagatgattttt
tacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactttttgactcat
ctttcaaaaaatccccattatctcttttaaattttaattctttatttatacaatatgtag
ttatcggaatgccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaatgcagcaagtt
caggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataataccagcaacagtagaacccg
ctattggaggtgctgctattaaagcatactctctaccaaataacatactacccactgtta
aacagccaacccctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgttttccattcat
gacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaagctataccaa
agttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggtaaaatatttg
tccaaaatcctattaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaattgcaccttttg
ttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagtaaagcaagtaa
gtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattttttatcaata
aaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatggtatagcttg
atattttttgatgatattatatgcgtcctaaattattcctaaaatatctaaataaatata
actagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatttctttttgat
ttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactactctctatattagt
atacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatacatttttgcaaac
gtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccattaaaccaatat
tatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatctattagtgcatc
ccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattcctaggaacta
ttactagaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatactttaaaattc
tttctatacaagtatgatttatcatataatgacatctatacctttatctttatagtagtc
ctaaattattcttaaatttacaataaaaataatttcactatttataaaaatacttgtttt
tatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctttgtcaatata
ttctgacatttttccagaaaatttataaagttatatagtgagtaaatcatactattttta
tataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatatttacttaagtataaacataaaa
aatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaagaagaatacaca
ctttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacactaattaacatta
gttcctaacttctatttatcttattcctaccctactactatatccgtagaaaaatctaaa
acttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgattttttcttatatctc
ttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccatatctcttactc
atctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaatatccaaaacat
tcaacattatcctcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttacttaaatattca
attctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgcccctaaacca
ttttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaaggtaaatctt
aaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatggattttgaatc
ccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatacacttgaaaaa
taataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgcttttttgtcttcatca
gtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattgtggaaacttc
ccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaatgcatttaac
acattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatacacatccaact
ttattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgccaaagtcata
ttataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactatacttaatacct
gctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatggttcatctca
ttaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagtctcactgtac
tttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatgtactaaattc
ataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttctattaatgta
tctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatcatctccattt
ggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccatttctttaaat
aaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgagatggataatcc
aatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcccttagttaca
aaatccataattgcaggtcctttgttatcactatcccatgaaccttcacattgatgggct
gcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttccctcctaaaat
ttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagattacatctaaata
atcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcctctataatttt
atcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgattttgtgttacaag
actttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaattaatatttc
taatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatactatagttatagt
tccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactccaaccccttt
acctaatgctccagatgaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaattacctgacc
ttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgattattagttctaa
ttctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattcctagtaaata
ggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataaatgtaaagtt
agatacctctcctccaacaagatatgttggtaatgcagctaatccccaaaccattccata
tgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccacctatcattactgc
tacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctgtaactcccat
aagtgcactaaaacttactgtaccaaataattgtttttgttctttattcctagtttttaa
gaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcagcgcccataaa
aattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatagtaaagtttgc
tgcaccaaagactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaacactccaatt
acccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaatccacatacc
aataggtccaaatacagttaatgtaattgatagagttattattaaagataatactggaac
taaaaaatagtgtaatgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaattataattcccat
tgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtagcctgtaaatt
tataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataataacgtaactgc
taacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgctattgcaattaa
tactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgatatgtaggact
gtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaacatacttgcaagtataccagc
tgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaaagatggaatt
aaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatacttgattcact
tgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacatgagtacctat
tataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactccttttaattttttaat
ttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgagtaacacaatg
cgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatattttcatttaaatc
tttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttatatgcaacatta
aataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttatatattttctta
tcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgtttatataaatcta
tagaattatcttcatctattgaagcttcatccgacataattctttggataaagtactgta
gatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctacattaaaatgat
attttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgtactatcatgag
actctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcctcatcatcag
gaagattaagtcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattccaatttcaaaat
gctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaattgattctttt
cacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagtaaggttaagcttagataatcacttg
actttatatttaaagctttctcaccatattcaattatttcattaataagaactatattat
tggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgttctagcatatcgtatgaatctagta
tatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactctttttttaaagccaa
ttcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggctacattattat
ttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactcaagcatatat
gtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgctaatcagtaac
atactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgtttaatttcatatt
ctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatatttttttattcta
taactacaagctctgttatgcgattatctgacaaggtttatatactaaattgatactatt
ttaccgtcactaatatttataatattgtctgaaccattatctattttactattatgaatt
atcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtatgttaacaaataaattcttaagatat
attaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagatatattaatagg
taaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatactt
aaatttagttttatttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttagt
tttatttaaacgctctagtgatatttttaaataaattttaataaaaatcattctattttg
tcataaatcatttatctggcttatatttaagatatattggtggatactttacacttttta
attcctcattacttcttaaaagtttattattattttccatatcataaatttgtaacatta
ctttatttacatatagagcataataattatcactataaaaatattgatactcatatcgag
ggtcatctttgtaatacactttgtatagtattccttcgtaacttgccttcttggcttttt
cttttgtaatactttttatattatcttttgaaatatcttgttttaccatatacttatcaa
tatatgtttcagcatctttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaaaccctgtta
cacttataatacctataattaatactataaaaataactttatattttttcatattgatcc
tccttcatttattatttaaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgttatctttttt
attaaaatataacatccctcatatttagcatcaatatatatgccccaactggtaggttaa
aagaccccactgtcagtactttgattaaattacatgtatgtatatatatttttaacaaat
ctattatatgtcaacttgtctactattacatataatctgtaatattacatctgctgcttt
ttttgagcctcctgcattataaaagctttttgatagtttagttgcattttctttatattc
attgtcatttataacttgaaatactgcttttttaatactttctgacttatcctcttttaa
cataattcctgctcccaaatgaacaactctcttagctaccattctctgctccgaatgttg
aggaaataataccataggtactccataatataaactttcattaacactattcatcccaga
atgagtaacaaacacatcagttttttgaagtatagcaatctgttcaacactatttttgac
ctcaaaattatttggtatatttcctaaacttttaatatcagtacttctaccaacagacat
aatcacatcaacatcagaatctttaaatgcacttatacagtttttataaaagctaacatt
tttattattaattgtaccaagcgaaatatatattagctttctttttctctctttaggttc
aataatcaactttgatactgatggacctacaaatgaatacttactagagaaggtttctac
cattggttgaaattcttttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatcattagaaac
tatagaaataaaattttttacttcatacccttttctttgtaaaagctttatttttttatt
aatgcgtcttacaccaaaaatcatacgtataatttctataaagttttgtttcatcaactt
tgctgtatgtttattaaatgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaatattaagttt
ttgtgcaaataactttccccaaaaacttaatgaatctgatacaatgcaatctggattaaa
atctttaagttctctacaaactttttcatctaaagaaatagtagtatctactatcatctc
aattaatccaggaaaatccttaccaatttttttctcatctccagggagtaattctggaag
gtatttatcacaacaaataaattttgctccagcaccttcaattttatctttaaattcatt
aaaagaataatacaatacctcatttcctctatccactaattcacgaactacttcaatagt
aggattagtatgaccatatgcaggaatgctaaaaaatactattttactcatatttcatac
ctccttttataatttttttaaatcattcttctttacgtactactcccacatgacctataa
aatttatcaaatcacgttgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctccaagtacca
ataatttatctcctgcatttatattaaatacttctcttgcttcttttggaatgacaatct
gaccacgttcaccaactacaactgctccaaagaaaaactttcctttaggaggtactataa
tacctgttttttcttccgaatgattaactaagtcatctagtttaacattgtacaattttg
caagtttaatgcaactacatatatcaggaatagattctccac