| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00111_1A_020922.fasta |
| contig | u00000crpx_c_020922 |
| start | 3441526 |
| length | 13481 |
| strand | - |
| type | core |
| seq | aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta aatattaatgcagaaattgaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta tatttagaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccctatccccaaaaaa gctattacaaaaaaggctggaactattaaaaaacctctagttgattttggtactgactta caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttcc agagcatactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtgttggatatggaattggt aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat catttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac tcaacaaaaggtagacctgaaagggtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttatgatatttaataatattt tatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatgagcaaataaag ctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgcataccaaaat tatatccctgactaatacttcccattccaatccataaaaatactcctggaacccttagta aaatctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattacattttcatttc ctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatcatttataactg caggagtccccattttaaattccactttagcatttcctccaaatgatttagctattcctg tagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtcaaatgttctta aagttcctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgtttcctgcattaaaca taccaatagttaaaactacaggttctttctgaggtttttctcttgaaagtatagtgttta atgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattcagggcttgctc catgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgccatagctggac cacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactgtgaaatgcca tagctgcatcgacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgattttgcacctc tggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagtaagtgtttat tatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcgtgtccacaac tatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctccataataggaa gtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccattttcactgtctaaaacag ctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttctaaagtactgg taacaaaggttactgttttcggtatattgcaaccaatttcgggattttcatgtaaatatc ttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaatttttcatat tccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaatgaaatgatgc tgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaaggagttggaatat catctggaataggacatttatatgttttaccattcatagatttatcaaattcttcttttg cctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagccataatctttg atgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgtaaactgccagc tatgacctggtgctcctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtcggaactatat gcattacatctccaatatcagtagaaccataactattaaagtttgtaacatttcctccac cataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagccttatattgtt gtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtccaaggctctt gtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattgtttaaagtat tataacaacctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcattgcagctcctt ttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctacttaaagctcttg tataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctacgcctccatctgtaa ttgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataattagctcccacat tagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgagcctgcatgcg cagtctttcccttaaagtgaaactttacagagttaacagctgttgaagtaccaattgtag cttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttcaaacgctccac ctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgcataaaatacta tagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactactgcccctacat gtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaattcaaatgctt cttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaattctcccataaaac ctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaacctcctacac ctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttcacatgctttaa attctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatcatcaagtttga atctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcattttctattcctcctata aatctatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaatgccactgatg caatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataatctgttgccc tttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcattggaaattatctgtg ttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattcttggagaatatc ccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagaacctacaacaagta ttcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttaccttagcaagtcctc caggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagatttatctaaaa ttcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaacatgctatgt tgggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagccaatcctacaa aattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactaaagtagatgattttt tacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactttttgactcat ctttcaaaaaatccccattatctcttttaaattttaattctttatttatacaatatgtag ttatcggaataccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaatgcagcaagtt caggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataatcccagcaacagtagaacctg ctattggaggtgctgctattaaagcatactctctgccaaataacatactacccactgtta aacagccaacacctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgttttccattcat gacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaagctataccaa agttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggtaaaatatttg tccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaattgcaccttttg ttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagtaaagcaagtaa gtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattttttatcaata aaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatggtatagcttg atattttttgatgatattatatacgtcctaaattattcctaaaatatctaaataaatata actagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatttctttttgat ttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactactctctatattagt atacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatacatttttataaac gtcttaaattattcttaaaatatctaaaatgaaataataatatacccattaaaccaatat tatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatctattagtgcatc ccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattcctaggaacta ttactaaaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatactttaaaattc tttctatacaagtataatttatcatataatgacatctatacctttatctttatagtagtc ctaaattattcttaaatttacaataaaaataatttcactatttataaaaatacttgtttt tatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctttgtcaatata ttctgacatttttccagaaaatttataaagttatatagtgagtaaatcatactattttta tataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatatttacttaagtataaacataaaa aatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaataagaatacaca ctttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacactaattaacatta gttcctaacttctatttatcttattcctaccctactactatatccgtagaaaaatctaaa acttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgattttttcttatatctc ttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccatatctcttactc atctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaatatccaaaacat tcaacattatcctcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttacttaaatattca attctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgcccctaaacca ttttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaaggtaaatctt aaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatggattttgaatc ccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatacacttgaaaaa taataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgcttttttgtcttcatca gtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattgtggaaacttc ccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaatgcatttaac acattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatacacatccaact ttattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgccaaagtcata ttataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactatacttaatacct gctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatggttcatctca ttaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagtctcactgtac tttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatgtactaaattc ataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttctattaatgta tctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatcatctccattt ggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccatttctttaaat aaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgagatggataatcc aatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcccttagttaca aaatccataattgcaggtcctttgttatcactatcccatgaaccttcacattgatgggct gcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttccctcctaaaat ttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagattacatctaaata atcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcctctataatttt atcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgattttgtgttacaag actttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaattaatatttc taatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatactatagttatagt tccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactccaaccccttt acctaatgctccagatgaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaattacctgacc ttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgattattagttctaa ttctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattcctagtaaata ggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataaatgtaaagtt agatacttctcctccaacaagatatgttggtaatgcagctaatccccaaaccattccata tgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccacctatcattactgc tacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctgtaactcccat aagtgcactaaaacttactgtaccaaatagttgtttttgttctttattcctagtttttaa gaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcagcgcccataaa aattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatagtaaagtttgc tgcaccaaaaactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaacactccaatt acccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaatccacatacc aataggtccaaatacagttaatgtaactgatagagttattattaaagataatactggaac taaaaaatagtgtagtgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaattataattcccat tgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtagcctgtaaatt tataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataataacgtaactgc taacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgctattgcaattaa tactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgatatgtaggact gtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaagtataccagc tgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaaagatggaatt aaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatacttgattcact tgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacatgagtacctat tataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactccttttaattttttaat ttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgagtaacacaatg cgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatattttcatttaaatc tttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttatatgcaacatta aataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttatatattttctta tcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgtttatataaatcta tagaattatcttcatctattgaagcttcatccgacataattctttggataaagtactgta gatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctacattaaaatgat attttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgtactatcatgag actctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcctcatcatcag gaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattccaatttcaaaat gctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaattgattctttt cacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagtaaggttaagcttagataatcacttg actttatatttaaagctttctcaccatattcaattatttcattaataagaactatattat tggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgttctagcatatcgtatgaatctagta tatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactctttttttaaagccaa ttcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggctacattattat ttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactcaagcatatat gtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgctaatcagtaac atactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgtttaatttcatatt ctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatatttttttattcta taactacaagctctgttatgcgattatctgacaaggtttatatactaaattgatactatt ttaccgtcactaatatttataatattgtctgaaccattatctattttactattatgaatt atcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtatgttaacaaataaattcttaagatat attaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagatatattaatagg taaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatactt aaatttagttttatttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttagt tttatttaaacactctagtgatatttttaaataaattttaataaaaatcattctattttg tcataaatcatttatctggcttatatttaagatatattggtggatactttacacttttta attcctcattacttcttaaaagtttattattattttccatatcataaatttgtaacatta ctttatttacatatagagcataataattatcactataaaaatattgatactcatatcgag ggtcatctttgtaatacactttgtatagtattccttcgtaacttgccttcttggcttttt cttttgtaatactttttatattatcttttgaaatatcttgttttaccatatacttatcaa tatatgtttcagcatctttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaaaccctgtta cacttataatacctataattaatactataaaaataactttatattttttcatattaatcc tccttcatttattatttaaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgttatctttttt attaaaatataacatccctcatatttagcatcaatatatatgccccaactggtaggttaa aagaccccactgtcagtactttgattaaattacatgtatgtatatatatttttaacaaat ctattatatgtcaacttgtctactattacatataatctgtaatattacatctgctgcttt ttttgagcctcctgcattataaaagctttttgatagtttagttgcattttctttatattc attgtcatttataacttgaaatactgcttttttaatactttctgacttatcctcttttaa cataattcctgctcccaaatgaacaactctcttagctaccattctctgctccgaatgttg aggaaataataccataggtactccataatataaactttcattaacactattcatcccaga atgagtaacaaacacatcagttttttgaagtatagcaatctgttcaacactatttttgac ctcaaaattatttggtatatttcctaaacttttaatatcagtacttctaccaacagacat aatcacatcaacatcagaatctttaaatgcacttatacagtttttataaaagctaacatt tttattattaattgtaccaagcgaaatatatattagctttctttttctctctttaggttc aataatcaactttgatactgatggacctacaaatgaatacttactagagaaggtttctac cattggttgaaattcttttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatcattagaaac tatagaaataaaattttttacttcatacccttttctttgtaaaagctttatttttttatt aatgcgtcttacaccaaaaatcatacgtataatttctataaagttttgtttcatcaactt tgctgtatgtttattaaatgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaatattaagttt ttgtgcaaataactttccccaaaaacttaatgaatctgatacaatgcaatctggattaaa atctttaagttctctacaaactttttcatctaaagaaatagtagtatctactatcatctc aattaatccaggaaaatccttaccaatttttttctcatctccagggagtaattctggaag gtatttatcacaacaaataaattttgctccagcaccttcaattttatctttaaattcatt aaaagaataatacaatacctcatttcctctatccactaattcacgaactacttcaatagt aggattagtatgaccatatgcaggaatgctaaaaaatactattttactcatatttcatac ctccttttataatttttttaaatcattcttctttacgtactactcccacatgacctataa aatttatcaaatcacgttgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctccaagtacca ataatttatctcctgcatttatattaaatacttctcttgcttcttttggaatgacaatct gaccacgttcaccaactacaactgctccaaagaaaaactttcctttaggaggtactataa tacctgttttttcttctgaatgattaactaagtcatctagtttgacattgtacaattttg caagtttaatgcaactacatatatcaggaatagattctccac |