Block details
fasta C_difficile_CD00129_1A_020478.fasta
contig u00000crpx_c_020478
start 3449781
length 13430
strand -
type core
seq aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt
aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa
atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta
aatattaatgcagaaattgaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta
tatttagaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccccatccccaaaaaa
gctattacaaaaaaggctggaactattaaaaaacctctagttgattttggtactgactta
caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttcc
agagcatactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta
tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt
ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat
gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat
gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat
aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat
ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta
aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt
aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat
ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtattggatatggaattggt
aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat
cctttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt
gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt
tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga
gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat
agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac
tcaacaaaaggcagacctgaaagggtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa
aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt
ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttatgatatttaataatattt
tatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatgagcaaataaag
ctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgcataccaaaat
tatatccctgactaatacttcccattccaatccataaaaatactcctggaacccttagta
aaacctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattacattttcatttc
ctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatcatttataactg
caggagtccccattttaaactccactttagcatttcctccaaatgatttagctattcctg
tagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtcaaatgttctta
aagttcctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgtttcctgcattaaaca
taccaatagttaaaactacaggctctttctgaggtttttctcttgaaagtatagtgttta
atgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattcagggcttgctc
catgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgccatagctggac
cacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactgtgaaatgcca
tagctgcatcgacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgattttgcacctc
tggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagtaagtgcttat
tatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcgtgtccacaac
tatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctccctaataggaa
gtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccattttcactgtctaaaacag
ctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttctaaagtactgg
taacaaaggttactgttttcggtagattgcaaccaatttcgggattttcatgtaaatacc
ttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaatttttcatat
tccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaatgaaatgatgc
tgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaaggagttggaatat
catctggaataggacatttatatgttttaccattcatagatttatcaaattcttcttttg
cctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagccataatctttg
atgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgtaaactgccagc
tatgacctggtgctcctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtcggaactatat
gcattacatctccaatatcagtagagccataactattaaagtttgtaacatttcctccac
cataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagccttatattgtt
gtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtccaaggctctt
gtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattgtttaaagtat
tataacaccctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcattgcagctcctt
ttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctacttaaagctcttg
tataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcctccatctgtaa
ttgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataattagctcccacat
tagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgaccctgcatgtg
cagtctttcccttaaagtgaaactttacagagttaacagctgttgaagtaccaattgtag
cttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttcaaacgctccac
ctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgcataaaatacta
tagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactactgcccctacat
gtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaattcaaatgctt
cttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaattctcccataaaac
ctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaacctcctacac
ctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttcacatgctttaa
attctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatcatcaagtttga
atctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcatttcctattcctcctata
agtatatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaatgccactgatg
caatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataatctgttgccc
tttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcgttggaaattatctgtg
ttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattcttggagaatatc
ccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagaacctacaacaagta
ttcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttaccttagcaagtcctc
caggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagatttatctaaaa
ttcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaacatgctatat
taggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagccaatcctacaa
aattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactagagtagatgattttt
tacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactttttgactcat
ctttcaaaaaatccccgttatctcttttaaattttaattctttatttatacaatatgtag
ttatcggaataccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaatgcagcaagtt
caggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataatcccagcaacagtagaacctg
ctattggaggtgctgctattaaagcatactctctgccaaataacatactacccactgtta
aacagccaactcctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgttttccattcat
gacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaagctataccaa
agttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggtaaaatatttg
tccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaattgcaccttttg
ttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagtaaagcaagtaa
gtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattttttatcaata
aaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatggtatagcttg
atattttttgatgatattatatacgtcctaaattattcctaaaatatctaaataaatata
actagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatttctttttgat
ttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactactctctatattagt
atacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatacatttttataaac
gtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccattaaaccaatat
tatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatctattagtgcatc
ccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattcctaggaacta
ttactagaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatactttaaaattc
tttctatacaagtataatttatcatataatgacatctatacctttatctttatagtagtc
ctaaattattcttaaattgacaataaaaataatttcactatttataaaaatacttgtttt
tatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctttgtcaatata
ttctgacatttttccagaaaatttataaagttatatagtgagtaaatcatactattttta
tataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatatttacttaagtataaacataaaa
aatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaagaagaatacaca
ctttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacactaattaacatta
gttcctaacttctatttatcttattcctaccctactactatatccgtagaaaaatctaaa
acttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgattttttcttatatctc
ttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccatatctcttactc
atctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaatatccaaaacat
tcaacattatcttcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttacctaaatattca
attctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgcccctaaacca
ttttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaaggtaaatctt
aaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatggattttgaatc
ccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatacacttgaaaaa
taataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgcttttttgtcttcatca
gtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattgtggaaacttc
ccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaatgcatttaac
acattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatacacatccaact
ctattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgccaaagtcata
ttataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactatacttaatacct
gctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatggttcatctca
ttaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagtctcactgtac
tttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatgtactaaattc
ataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttctattaatgta
tctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatcatctccattt
ggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccatttctttaaat
aaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgagatggataatcc
aatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcccttagttaca
aaatccataattgcaggtccttttttatcactatcccatgaaccttcacattgatgggct
gcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttccctcctaaaat
ttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagattacatctaaata
atcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcctctataatttt
atcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgattttgtgttacaag
actttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaattaatatttc
taatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatactatagttatagt
tccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactccaaccccttt
acctaatgctccagaggaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaattacctgacc
ttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgattattagttctaa
ttctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattcctagtaaata
ggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataaatgtaaagtt
agatacttctcctccaacaagatatgttggtaatgcagctaatccccaaaccattccata
tgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccacctatcattactgc
tacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctgtaactcccat
aagtgcactaaaacttactgtaccaaatagttgtttttgttctttattcctagtttttaa
gaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcagcgcccataaa
aattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatagtaaagtttgc
tgcaccaaaaactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaacactccaatt
acccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaatccacatacc
aataggtccaaatacagttaatgtaactgataaagttattattaaagataacactggaac
taaaaaatagtgtaatgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaattataattcccat
tgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtagcctgtaaatt
tataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataataacgtaactgc
taacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgctattgcaattaa
tactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgatatgtaggact
gtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaagtataccagc
tgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaaagatggaatt
aaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatacttgattcact
tgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacatgagtacctat
tataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactccttttaattttttaat
ttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgagtaacacaatg
cgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatattttcatttaaatc
tttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttatatgcaacatta
aataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttatatattttctta
tcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgtttatataaatcta
tagaattatcttcatctattgaagcttcctctgacataattctttggataaagtactgta
gatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctacattaaaatgat
attttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgtactatcatgag
actctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcctcatcatcag
gaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattccaatttcaaaat
gctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaattgattctttt
cacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagtaaggttaagcttagataatcacttg
cctttatatttaaagttttctcaccatattcaattatttcattaataagaactatattat
tggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgttctagcatatcgtatgaatctagta
tatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactctttttttaaagccaa
ttcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggctacattattat
ttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactcaagcatatat
gtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgctaatcagtaac
atactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgtttaatttcatatt
ctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatatttttttattcta
taactacaagctctgttatacgattatctgacaaggtttatatactaaattgatactatt
ttaccgtcactagtatttataatattgtctgaaccattatctattttactattatgaatt
atcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtattttaacaaataaattcttaagatat
attaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagatatattaatagg
taaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatactt
aaatttagttttatttaaacgctctagtgatatttttaaataaattttaataaaaattat
tctattttgtcataaatcatttatctggcttatatttaagatatattggtggatacttta
cactttttaattcctcattacttcttaaaagtttattattattttccatatcataaattt
gtaacattactttatttacatatagagcataataattatcactataaaaatattgatact
catatcgagggtcatctttgtaatacactttgtatagtattccttcgtaacttgccttct
tggctttttcttttgtaatactttttatattatcttttgaaatatcttgttttaccatat
acttatcaatatatgtttcagcatctttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaa
accctgttacacttataatacctataattaatactataaaaataactttatattttttca
tattaatcctccttcatttattatttaaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgtt
atcttttttattaaaatataacatccctcatatttagcatcaatatatatgccccaactg
gtaggttaaaagaccccactgtcagtactttgattaaattacatgtatgtatatatattt
ttaacaaatctattatatgtcaacttgtctactattacatataatctgtaatattacatc
tgctgctttttttgagcctcctgcattataaaagctttttgatagtttagttgcattttc
tttatattcattgtcatttataacttgaaatactgcttttttaatactttctgacttatc
ctcttttaacataattcctgctcccaaatgaacaactctcttagctaccattctctgctc
cgaatgttgaggaaataataccataggtactccataatataaactttcattaacactatt
catcccagaatgagtaacaaacacatcagttttttgaagtatagcaatctgttcaacact
atttttaacctcaaaattatttggtatatttcctaaacttttaatattagtacttctacc
aacagacataatcacatcaacatcagaatctttaaatgcatttatacagtttttataaaa
gctaacatttttattattaattgtaccaagcgaaatatatattagctttctttttctctc
tttaggttcaataatcaactttgatactgatggacctacaaatgaatacttactagagaa
ggtttctaccattggttgaaattcttttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatc
attagaaactatagaaataaaattttttacttcatacccttttctttgtaaaagctttat
ttttttattaatgcgtcttacaccaaaaatcatacgtataatttctataaagttttgttt
catcaactttgctgtatgtttattaaatgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaat
attaagtttttgtgcaaataactttccccaaaaacttaatgaatctgatacaatacaatc
tggattaaaatctttaagttctctacaaactttttcatctaaagaaatagtagtatctac
tatcatctcaattaatccaggaaaatccttaccaatttttttctcatctccagggagtaa
ttctggaaggtatttatcacaacaaataaattttgctccagcaccttcaattttatcttt
aaattcattaaaagaataatacaatacctcatttcctctatccactaattcacgaactac
ttcaatagtaggattagtatgaccatatgcaggaatgctaaaaaatactattttactcat
atttcatacctccttttataatttttttaaatcattcttctttacgtactactcccacat
gacctataaaatttatcaaatcacgttgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctc
caagtaccaataatttatctcctgcatttatattaaatacttctcttgcttcttttggaa
tgacaatctgaccacgttcaccaactacaactgctccaaagaaaaactttcctttaggag
gtactataatacctgttttttcttctgaatgattaactaagtcatctagtttgacattgt
acaattttgcaagtttaatgcaactacatatatcaagaatagattctccac