Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00107_1A_020266.fasta |
contig | u00000crpx_c_020266 |
start | 3449808 |
length | 13430 |
strand | - |
type | core |
seq | aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta aatattaatgcagaaattgaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta tatttagaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccccatccccaaaaaa gctattacaaaaaaggctggaactattaaaaaacctctagttgattttggtactgactta caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttcc agagcatactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtattggatatggaattggt aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat cctttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac tcaacaaaaggcagacctgaaagggtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttatgatatttaataatattt tatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatgagcaaataaag ctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgcataccaaaat tatatccctgactaatacttcccattccaatccataaaaatactcctggaacccttagta aaacctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattacattttcatttc ctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatcatttataactg caggagtccccattttaaactccactttagcatttcctccaaatgatttagctattcctg tagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtcaaatgttctta aagttcctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgtttcctgcattaaaca taccaatagttaaaactacaggctctttctgaggtttttctcttgaaagtatagtgttta atgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattcagggcttgctc catgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgccatagctggac cacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactgtgaaatgcca tagctgcatcgacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgattttgcacctc tggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagtaagtgcttat tatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcgtgtccacaac tatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctccctaataggaa gtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccattttcactgtctaaaacag ctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttctaaagtactgg taacaaaggttactgttttcggtagattgcaaccaatttcgggattttcatgtaaatacc ttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaatttttcatat tccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaatgaaatgatgc tgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaaggagttggaatat catctggaataggacatttatatgttttaccattcatagatttatcaaattcttcttttg cctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagccataatctttg atgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgtaaactgccagc tatgacctggtgctcctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtcggaactatat gcattacatctccaatatcagtagagccataactattaaagtttgtaacatttcctccac cataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagccttatattgtt gtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtccaaggctctt gtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattgtttaaagtat tataacaccctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcattgcagctcctt ttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctacttaaagctcttg tataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcctccatctgtaa ttgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataattagctcccacat tagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgaccctgcatgtg cagtctttcccttaaagtgaaactttacagagttaacagctgttgaagtaccaattgtag cttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttcaaacgctccac ctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgcataaaatacta tagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactactgcccctacat gtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaattcaaatgctt cttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaattctcccataaaac ctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaacctcctacac ctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttcacatgctttaa attctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatcatcaagtttga atctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcatttcctattcctcctata agtatatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaatgccactgatg caatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataatctgttgccc tttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcgttggaaattatctgtg ttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattcttggagaatatc ccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagaacctacaacaagta ttcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttaccttagcaagtcctc caggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagatttatctaaaa ttcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaacatgctatat taggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagccaatcctacaa aattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactagagtagatgattttt tacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactttttgactcat ctttcaaaaaatccccgttatctcttttaaattttaattctttatttatacaatatgtag ttatcggaataccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaatgcagcaagtt caggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataatcccagcaacagtagaacctg ctattggaggtgctgctattaaagcatactctctgccaaataacatactacccactgtta aacagccaactcctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgttttccattcat gacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaagctataccaa agttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggtaaaatatttg tccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaattgcaccttttg ttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagtaaagcaagtaa gtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattttttatcaata aaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatggtatagcttg atattttttgatgatattatatacgtcctaaattattcctaaaatatctaaataaatata actagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatttctttttgat ttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactactctctatattagt atacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatacatttttataaac gtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccattaaaccaatat tatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatctattagtgcatc ccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattcctaggaacta ttactagaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatactttaaaattc tttctatacaagtataatttatcatataatgacatctatacctttatctttatagtagtc ctaaattattcttaaattgacaataaaaataatttcactatttataaaaatacttgtttt tatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctttgtcaatata ttctgacatttttccagaaaatttataaagttatatagtgagtaaatcatactattttta tataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatatttacttaagtataaacataaaa aatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaagaagaatacaca ctttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacactaattaacatta gttcctaacttctatttatcttattcctaccctactactatatccgtagaaaaatctaaa acttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgattttttcttatatctc ttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccatatctcttactc atctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaatatccaaaacat tcaacattatcttcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttacctaaatattca attctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgcccctaaacca ttttctgtaattaagataggtaattgatactttctgtaaatatagttcaaggtaaatctt aaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatggattttgaatc ccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatacacttgaaaaa taataattaagtcctataaaatctaacttaccttctttaaatgcttttttgtcttcatca gtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattgtggaaacttc ccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaatgcatttaac acattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatacacatccaact ctattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgccaaagtcata ttataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactatacttaatacct gctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatggttcatctca ttaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagtctcactgtac tttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatgtactaaattc ataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttctattaatgta tctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatcatctccattt ggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccatttctttaaat aaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgagatggataatcc aatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcccttagttaca aaatccataattgcaggtccttttttatcactatcccatgaaccttcacattgatgggct gcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttccctcctaaaat ttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagattacatctaaata atcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcctctataatttt atcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgattttgtgttacaag actttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaattaatatttc taatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatactatagttatagt tccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactccaaccccttt acctaatgctccagaggaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaattacctgacc ttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgattattagttctaa ttctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattcctagtaaata ggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataaatgtaaagtt agatacttctcctccaacaagatatgttggtaatgcagctaatccccaaaccattccata tgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccacctatcattactgc tacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggttctgtaactcccat aagtgcactaaaacttactgtaccaaatagttgtttttgttctttattcctagtttttaa gaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcagcgcccataaa aattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatagtaaagtttgc tgcaccaaaaactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaacactccaatt acccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaatccacatacc aataggtccaaatacagttaatgtaactgataaagttattattaaagataacactggaac taaaaaatagtgtaatgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaattataattcccat tgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtagcctgtaaatt tataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataataacgtaactgc taacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgctattgcaattaa tactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgatatgtaggact gtcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaagtataccagc tgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaaagatggaatt aaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatacttgattcact tgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacatgagtacctat tataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactccttttaattttttaat ttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgagtaacacaatg cgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatattttcatttaaatc tttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttatatgcaacatta aataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttatatattttctta tcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgtttatataaatcta tagaattatcttcatctattgaagcttcctctgacataattctttggataaagtactgta gatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctacattaaaatgat attttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgtactatcatgag actctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcctcatcatcag gaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattccaatttcaaaat gctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaattgattctttt cacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagtaaggttaagcttagataatcacttg cctttatatttaaagttttctcaccatattcaattatttcattaataagaactatattat tggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgttctagcatatcgtatgaatctagta tatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactctttttttaaagccaa ttcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggctacattattat ttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactcaagcatatat gtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgctaatcagtaac atactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgtttaatttcatatt ctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatatttttttattcta taactacaagctctgttatacgattatctgacaaggtttatatactaaattgatactatt ttaccgtcactagtatttataatattgtctgaaccattatctattttactattatgaatt atcatagtaatgcttttaaatataatgaactgtattttaacaaataaattcttaagatat attaacatataaagtcttaagtttagttttatttaatcactattaagatatattaatagg taaagcttcaaatttagtttcatttaaatgctagtaagatatactaatatataaatactt aaatttagttttatttaaacgctctagtgatatttttaaataaattttaataaaaattat tctattttgtcataaatcatttatctggcttatatttaagatatattggtggatacttta cactttttaattcctcattacttcttaaaagtttattattattttccatatcataaattt gtaacattactttatttacatatagagcataataattatcactataaaaatattgatact catatcgagggtcatctttgtaatacactttgtatagtattccttcgtaacttgccttct tggctttttcttttgtaatactttttatattatcttttgaaatatcttgttttaccatat acttatcaatatatgtttcagcatctttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaa accctgttacacttataatacctataattaatactataaaaataactttatattttttca tattaatcctccttcatttattatttaaaactcgatataatgcactaaaaaaaggatgtt atcttttttattaaaatataacatccctcatatttagcatcaatatatatgccccaactg gtaggttaaaagaccccactgtcagtactttgattaaattacatgtatgtatatatattt ttaacaaatctattatatgtcaacttgtctactattacatataatctgtaatattacatc tgctgctttttttgagcctcctgcattataaaagctttttgatagtttagttgcattttc tttatattcattgtcatttataacttgaaatactgcttttttaatactttctgacttatc ctcttttaacataattcctgctcccaaatgaacaactctcttagctaccattctctgctc cgaatgttgaggaaataataccataggtactccataatataaactttcattaacactatt catcccagaatgagtaacaaacacatcagttttttgaagtatagcaatctgttcaacact atttttaacctcaaaattatttggtatatttcctaaacttttaatattagtacttctacc aacagacataatcacatcaacatcagaatctttaaatgcatttatacagtttttataaaa gctaacatttttattattaattgtaccaagcgaaatatatattagctttctttttctctc tttaggttcaataatcaactttgatactgatggacctacaaatgaatacttactagagaa ggtttctaccattggttgaaattcttttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatc attagaaactatagaaataaaattttttacttcatacccttttctttgtaaaagctttat ttttttattaatgcgtcttacaccaaaaatcatacgtataatttctataaagttttgttt catcaactttgctgtatgtttattaaatgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaat attaagtttttgtgcaaataactttccccaaaaacttaatgaatctgatacaatacaatc tggattaaaatctttaagttctctacaaactttttcatctaaagaaatagtagtatctac tatcatctcaattaatccaggaaaatccttaccaatttttttctcatctccagggagtaa ttctggaaggtatttatcacaacaaataaattttgctccagcaccttcaattttatcttt aaattcattaaaagaataatacaatacctcatttcctctatccactaattcacgaactac ttcaatagtaggattagtatgaccatatgcaggaatgctaaaaaatactattttactcat atttcatacctccttttataatttttttaaatcattcttctttacgtactactcccacat gacctataaaatttatcaaatcacgttgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctc caagtaccaataatttatctcctgcatttatattaaatacttctcttgcttcttttggaa tgacaatctgaccacgttcaccaactacaactgctccaaagaaaaactttcctttaggag gtactataatacctgttttttcttctgaatgattaactaagtcatctagtttgacattgt acaattttgcaagtttaatgcaactacatatatcaagaatagattctccac |