Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00133_1A_020483.fasta |
contig | u00000crpx_c_020483 |
start | 3572856 |
length | 11026 |
strand | - |
type | core |
seq | aagagttatttattttaattgaatttaattgaaatacgattttaactagaacaatagatt aatgtaatatttaatataaaataattataataattgaaaaggaagtaatctatgatgaaa atagcagtcataacaaccgaatttttaaaagagtttgtagataattctataaaaaagtta aatattaatgcagaaattaaaatatatatctatagagatttttctcatgttggagattta tatttagaaatagaagataggtttgatggatttgcagttagtggccctatccccaaaaaa gctattacaaaaaaggctggaactattaaaaaacctctagttgattttggtactgactta caaagttactatgatatgtttctaaagcttatctttaaatataatacattagatttttct agagcatactttgacttaacagactgggcagataatccaaaagatatatcatattattta tcaaatggcacatttggagacttaatggatagtattgatgaaaatgcatctaaaatgagt ttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattgcaaaaaaacatattaatctatggaat gaagggaaaatcgatttttctactactcgttttagtagtattgttcctatgttacaaaat gcaggagtaaactttcatttcatataccctgatatagatttattaaaaaatacttttaat aacttaataaaagatattcatttacatagaatgaagggaaatcaaccaagtgtaatatat ataacagttaaagatacaaattatgatgactctactctagaccaagtttataaaatatta aatagtattaaaaaagataaattaaccgattttataattgaaaaaaatagtaattctttt aaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcattaactaaaaattttactgcatgttat ataaaagaatctattgaaaatagtacaaatattaaagtatgtgttggatatggaattggt aatgatataaagcaagctatgtctagtgccataagtgctaataaggaatctaaaataaat catttaaattacagtttcttagttaacgaaaattatgagacaataggacctttactgtgt gataagttacttactgtttcaaataaagtaactccacatataaatacaattgccaaaagt tctaaattgtctactcttactattcaaaagattatatctgttactgaaattctacaaaga gatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtttaaatgtaacagttagaactgctaat agatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacgctactatattatatgaaaaacaaaac tcaacaaaaggtagacctgaaagagtatacaaattatttatatcagaaaataaatattaa aatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaatattaagtaaaattatatatgacttt ctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatataccttttataatatttaataatattt tatgttattatctactaaaattattttctaaccattttactgcacaatgagcaaataaag ctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaattgctttaggattatgcataccaaaat tatatccctgactaatacttcccattccaatccataaaaatactcctggaacccttagta aaatctctgaaaaatcttctgaacccattgcagatggaaagtctattacattttcatttc ctataacttctttaacataagatacaatctcatctcctacatccaaatcatttataactg caggagtccccattttaaattccactttagcatttcctccaaatgatttagctattcctg tagatatttcaataattctattttttaatttttctctaacaaattggtcaaatgttctta aagtacctgacatagatgctttatttggtatagcatttggtacgcttcctgcattaaaca taccaatagttaaaactacaggttctttctgaggtttttctcttgaaagtatagtgttta atgctatttgtatatgcgacattatgtttattgggtccactccaaattcagggcttgctc catgagttgcttttccttctactgttatttcaaatatatccgcagatgccatagctggac cacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaatttacccaccatactgtgaaatgcca tagctgcatcgacctgaggattttctaatataccatcatcaatcattgattttgcacctc tggtagtctcttcatctggttcaaatacaaactttactctacctttaagtaagtgcttat tatccataagtattttagctgctcctaagagcattgctgtgtgattatcgtgtccacaac tatgagatgcatctttattcttacttttaaaaggtaaatccgtctcctccataataggaa gtgcatccatatctgcccttaataataaggtctttccaccattttcactgtctaaaacag ctactattccattattagacgtcaatttcggagaatatcccattttttctaaagtactgg taacaaaggttactgttttcggtagattgcaaccaatttcgggattttcatgtaaatacc ttctccatctaataatttccccttctattgactgcgcttctttaaaaaaatttttcatat tccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctcactttcttttagtaatgaaatgatgc tgatataaaaattataattttatatattaaatttcatgtctttttaaggagttggaatat catctggaataggacatttatatgttttaccattcatagatttatcaaattcttcttttg cctttttagctatctctggattatttaatattttagctccaaacatagccataatctttg atgcatatatcatacctttttctcctatagaacttcctgcacaagatgtaaactgccagc tatgacctggtgctcctagattcgtacaccctgtaaaaaagtatgctgtcggaactatat gcattacatctccaatatcagtagagccataactattaaagtttgtaacatttcctccac cataatatagatgagttccttctggcaaattatatttacttatcatagccttatattgtt gtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatccaattcctctcgagtccaaggctctt gtttaatctcattcatacattctgatacaagatttgctaaaacatgattgtttaaagtat tataacatcctcctaaaaactctacttcaacttcagtttcagtcatcattgcagctcctt ttgctacctttacaagtctttcatatgtactttctacagcttctctacttaaagctcttg tataataccatactgatgctttatcaggaactatgttgggtgctactcctccatctgtaa ttgtataatgaatccttacatcagaagtaacatgttctctcaaataattagctcccacat tagtaagttccacagcatctagtgcacttcttccattttgagggtctgaccctgcatgtg cagtctttcccttaaaatgaaattttacagaattaacagctgttgaagtaccaattgtag cttcactaattttatttggatgaaaatttatagctaagtctaacccttcaaacgctccac ctctagccataaatcctttacctgttaattgttcttctcctggacatgcataaaatacta tagtcccacttaagttattttctatcatctctcttttaagccctactactgcccctacat gtgctgtacataataaattatgcccacatccatgaccatatgcacccaattcaaatgctt cttgctttgttgaaactttttgatttaaaccaggtaatgcatcaaactctcccataaaac ctataactggtttacctgaaccaaaactagctctaatagccgtggctaaacctcctacac ctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaagtttgctgtattttcacatgctttaa attctttaaatgctttttctggattttcccatattttcttacttaaatcatcaagtttga atctttttttatctatctcatttatagatatacttcctatcatttcctattcctcctata agtatatttactatcaaccaaatataattggacctattatactagcaaatgccactgatg caatggttacagtaacaaatcctcctataatcatctttggtaataaataatctgttgccc tttgtttttcttcttcagttccttccatagcatcaataccttcgttggaaattatctgtg ttgcaggataagctagcatacaagttacaccaattgcagctgacattcttggagaatatc ccaatagttttcctacaattgcagtaaataatattataaatacagagcctacaacaagta ttcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgctgttggagttaccttagcaagtcctc caggtaacatcaacatacaaccaaacattataattccattagattgagatttatctaaaa ttcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaatcaaccctactaacaaacatgctatgt taggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcctggtattaaagtagccaatcctacaa aattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgcaagatacactaaagtagatgattttt tacctaaatcttctttaaaaattctcatacttggaagtttaaaattactttttgactcat ctttcaaaaaatccccattatctcttttaaattttaattctttatttatacaatatgtag ttatcggaatgccaaagaacttttgaaatgataatactagaattacaaatgcagcaagtt caggtctatttgcagcttctgcaacagttgttacgataataccagcaacagtagaacccg ctattggaggtgctgctattaaagcatactctctaccaaataacatactacccactgtta aacagccaacccctattcctacaatacctactaatgcaattacaaccgttttccattcat gacataagtcttcaagatttataagtgttcctaagttagttattaataaagctataccaa agttgctcattgcagctaatatccctgatgctcctgtaatgtcttttggtaaaatatttg tccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaataacaatgttgaaattgcaccttttg ttttcttagataaaaactcactaaaagcataaatcattacacatacagtaaagcaagtaa gtggattccaaaaattttccattgttgtttcctcctaaatataataattttttatcaata aaacaataattataaaatgtatattatgcagttattcttaactacatatggtatagcttg atattttttgatgatattatatacgtcctaaattattcctaaaatatctaaataaatata actagagttaactctctaaatattaactatagttatcaacttactagatttctttttgat ttttactttctacataattttacgagttagaattgtacttcaactactctctatattagt atacatgttggaagacttatatttatttaaatattagatatagaatacatttttataaac gtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaataataatatacccattaaaccaatat tatcagaatatacttcactttaagtcttctttatatagaaattttatctattagtgcatc ccctcctttgtaaattagactatttctaaacgaatttagatatcttattcctaggaacta ttactagaaacaaaaattatttattatattaaatcaatgataagccatactttaaaattc tttctatacaagtatgatttatcatataatgacatctatacctttatctttatagtagtc ctaaattattcttaaatttacaataaaaataatttcactatttataaaaatacttgtttt tatattgtcaaactattcttaatatagattataattttaaatcttttctttgtcaatata ttctgacatttttccagaaaatttataaagttatatagtgagtaaatcatactattttta tataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaatatttacttaagtataaacataaaa aatgtgtattctcctttttatagtaattttagttgccattacttttaagaagaatacaca ctttactttaaagaccctatactctattttaaatgctttactagacactaattaacatta gttcctaacttctatttatcttattcttaccctactactatatccgtagaaaaatctaaa acttctccattagattttattacttctttgtaccaatcaaatgattttttcttatatctc ttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaacatagataaatccatatctcttactc atctgacctgtagttgcactgactaaatcaattggtccccacatcaaatatccaaaacat tcaacattatcctcttcaattgcagacttcatttgagatagatgcttacttaaatattca attctataatcatcatttatagttccatcttcttcgattttatcatatgcccctaaacca ttttctgtaattaagataggtaattgatactttctataaatatagttcaaggtaaatctt aaacctatagggtctattgcccacccccacttactttgttccaaatatggattttgaatc ccaccaaataaagatttatcacctgataaattttcttttggagtagatacacttgaaaaa taataattaagacctataaaatctaacttaccttctttaaatgcttttttgtcttcatca gtcacttcaatagttatattatttttttcatattcttttaatttatattgtggaaacttc ccattgcacattgcatcaatttgataataatcacggtcattatctaaaaatgcatttaac acattactaggattacaattgtatggataaattggatttagtccaaatacacatccaact ttattgttgggattgatttctctagccaactttgcaacctttacacccgccaaagtcata ttataccctacatttgccaatgtttgaaccttattttctatttcactatacttaatacct gctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgtttgagggtcaatatggttcatctca ttaaatgtaacccagtactttaccttatcatcaaatcttcttattacagtctcactgtac tttaaatacaaatctataagttttctgttattccatgaaccatatttatgtactaaattc ataggtaattcaaaatgatatagtgttacaataggttctatattattttctattaatgta tctatcagaccttcatagtatttaatccctaattcattaggattttcatcatctccattt ggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaatgcactaaatcccatttctttaaat aaagctatatcttctttatatctattataaaaatctattccattatgagatggataatct aatttttcttctattttatcagtaattactcttggcgtttcataagagcccttagttaca aagtccataattgcaggtcctttgttatcactatcccatgaaccttcacattgatgggct gcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaatattcatgaattttccctcctaaaat ttatactattacagttaataattcttctgattcatcatttgatgagattacatctaaata atcgctagtatttgtaactacagttattatagtagaatcaaagccttcctctataatttt atcagattcaaatactgctaaagcatctccttttttaaccctttgattttgtgttacaag actttcaaagaattttccatctaagtttacagtatctatcccaatatgaattaatatttc taatccttcatcagtcactataccatatgcatgtttagttggaaatactatagttatagt tccatctacaggagatataacagttgattttgattcactaggtataactccaaccccttt acctaatgctccagatgaaaatgctttgtcattaacttccccaagtgcaattacctgacc ttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaattgttctcgttgattattagttctaa ttctttttcattatcacccttaacttcttctttttcatctgaaggtattcctagtaaata ggaagctgctgttgctgctacaaatgatactactacacttattatcataaatgtaaagtt agatacctctcctccaacaagatatgttggtaatgcagctaatccccaaaccattccata tgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccacctatacctccacctatcattactgc tacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaaacactgaaggctctgtaactcccat aagtgcactaaaacttactgtaccaaataattgtttttgttctttatttctagtttttaa gaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatatcagatattgttgcagcgcccataaa aattgggtcataccccaatgttgtcacagaatttaaagatataggcatagtaaagtttgc tgcaccaaaaactattaagagtggttgtaaagctgcatacagtgcaacaacactccaatt acccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagtttaatccatcaccaatccacatacc aataggtccaaatacagttaatgtaattgatagagttattattaaagataatactggaac taaaaaatagtgtaatgctttaggtaatatttttttcaaaccttcaattataattcccat tgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgtttgcataagttgtagcctgtaaatt tataccaaataaacttaatccttctacaccatctattgatgaagataataacgtaactgc taacactactgctatatagggatttacattaagtctttttgctgatgctattgcaattaa tactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatgtatctaatatttgatatgtaggact atcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtgctaatatacttgcaagtataccagc tgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtctctgagactaccacaaagatggaatt aaatatacctttgatacctctaattcccttttttctttcactttttatacttgattcact tgaacttaaacctatcatagacataaactcgttatatacatctacaacatgagtacctat tataatttgataagcaacatcattagaaactacatcaattactccttttaattttttaat ttcttctgtttgagcgatactcctatcatttaaagtaaatcttaaacgagtaacacaatg cgctaccgactttatattttcttttccccctataagttttattatattttcatttaaatc tttatatttcatctgattttgcctccagtctttgagtcaccctatttatatgcaacatta aataagtttcttcacttatagatatatcgacattaaattgtgattttatatattttctta tcttttgaacacttccaaatgactttggataaagttgacttacttgtttatataaatcta tagaattatcttcatctattgaagcttcatccgacataattctttggataaagtactgta gatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtttcatctagctctacattaaaatgat attttattatagaaactatatctgctaaagttctcaactctacaattgtactatcatgag actctttatttacctccatatttacaaaatgaagtgctattgatactgcctcatcatcag gaagattaattcccttactatcaccaattaattttagtgcatgcattccaatttcaaaat gctttggataaaatcttttaacattccataccaaaggactttttataaattgattctttt cacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagtaaggttaagcttagataatcacttg cctttatatttaaagctttctcaccatattcaattatttcattaataagaactatattat tggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgttctagcatatcgtatgaatctagta tatatgttctctctatttcattttcatttattacttgtcccactctttttttaaagccaa ttcctttaacaaatacaataatttcatttttacctctttttactaaggctacattattat ttaaaatctgaattattttcatatattcctcccttcaataaaaagaactcaagcatatat gtatagagtatccctctatttttcacatatatacttgagttctgcctgctaatcagtaac atactcaaaattatgactacgtcgccataattaaaattcttttttgtttaatttcatatt ctatatgttatactatccatataaatctgtcaacggtttcctagatatttttttattcta taactacaagctctgttatgcgattatctgacaaggtttatatactaaattgatactatt ttaccgtcactaatatttataatattgtctgaattattagctatttc |