Block details
fasta C_difficile_CD00314_1A_020711.fasta
contig u00000crpx_c_020711
start 3443941
length 13172
strand -
type core
seq gggaggttcagtttggtactgacttacaaagttactatgatatgtttctaaagcttatct
ttaaatataatacattagatttttctagagcatactttgacttaacagactgggcagata
atccaaaagatatatcatattatttatcaaatggcacatttggagacttaatggatagta
ttgatgaaaatgcatctaaaatgagtttatctgacatagcaaaacttgaaaaaaagattg
caaaaaaacatattaatctatggaatgaagggaaaatcgatttttctactactcgtttta
gtagtattgttcctatgttacaaaatgcaggagtaaactttcatttcatataccctgata
tagatttattaaaaaatacttttaataacttaataaaagatattcatttacatagaatga
agggaaatcaaccaagtgtaatatatataacagttaaagatacaaattatgatgactcta
ctctagaccaagtttataaaatattaaatagtattaaaaaagataaattaaccgatttta
taattgaaaaaaatagtaattcttttaaaattttcactaaatgtgaaacgattaaatcat
taactaaaaattttactgcatgttatataaaagaatctattgaaaatagtacaaatatta
aagtatgtgttggatatggaattggtaatgatataaagcaagctatgtctagtgccataa
gtgctaataaggaatctaaaataaatcctttaaattacagtttcttagtcaacgaaaatt
atgagacaataggacctttactgtgtgataagttacttactgtttcaaataaagtaactc
cacatataaatacaattgccaaaagttctaaattgtctactcttactattcaaaagatta
tatctgttactgaaattctacaaagagatgaagttactcctaaggaattatcttcatgtt
taaatgtaacagttagaactgctaatagatttctaagtagtctcttaaagtctggaaacg
ctactatattatatgaaaaacaaaactcaacaaaaggtagacctgaaagggtatacaaat
tatttatatcagaaaataaatattaaaatccaaaatgcataaaaatattttatcatctaa
tattaagtaaaattatatatgactttctaaaaggtatatctttgcatctttttaagatat
accttttatgatatttaataatattttatgttattatctactaaaattattttctaacca
ttttactgcacaatgagcaaataaagctgaaccataaactaatccctcttcattaaaaat
tgctttaggattatgcataccaaaattatatccctgactaatacttcccattccaatcca
taaaaatactcctggaacccttagtaaaatctctgaaaaatcttctgaacccattgcaga
tggaaagtctattacattctcatttcctataatttctttaacataagatacaatctcatc
tcctacatccaaatcatttataactgcgggagtccccattttaaattccactttagcatt
tcctccaaatgatttagctattcctgtagatatttcaataattctattttttaatttttc
tctaacaaattggtcaaatgttcttaaagttcctgacatagatgctttatttggtatagc
atttggtacgtttcctgcattaaacataccaatagttaaaactacaggctctttctgagg
tttttctcttgaaagtatagtgtttaatgctatttgtatatgcgacattatgtttattgg
gtccactccaaattcagggcttgctccatgagttgcttttccttctactgttatttcaaa
tatatccgcagatgccatagctggaccacgtgaataagctacttgacctgtgttaagaaa
tttacccaccatactgtgaaatgccatagctgcatcgacctgaggattttctaatatacc
atcatcaatcattgattttgcacctctggtactctcttcatctggttcaaatacaaactt
tactctacctttaagtaagtgcttattatccataagtattttagctgctcctaagagcat
tgctgtgtgattatcgtgtccacaactatgagatgcatctttattcttacttttaaaagg
taaatccgtctcctccataataggaagtgcatccatatctgcccttaataataaggtctt
tccaccattttcactgtctaaaacagctactattccattattagacgtcaatttcggaga
atatcccattttttctaaagtactggtaacaaaggttactgttttcggtagattgcaacc
aatttcgggattttcatgtaaatatcttctccatctaataatttccccttctattgactg
cgcttctttaaaaaaatttttcatattccttcctcctaatcagatagtcagcaaaatctc
actttcttttagtaatgaaatgatgctgatataaaaattataattttatatattaaactt
catgtctttttaaggagttggaatatcatctggaataggacatttatatgttttaccatt
catagatttatcaaactcttcttttgcctttttagctatctctggattatttaatatttt
ggctccaaacatagccatgatttttgatgcatatatcatacctttttctcctatagaact
tcctgcacaagatgtaaactgccagctatgacctggtgcacctagattcgtacaccctgt
aaaaaagtatgctgtcggaactatatgcattacatctccaatatcagtagaaccataact
attaaagtttgtaacatttcctccaccataatatagatgagttccttctggcaaattata
tttacttatcatagccttatattgttgtgggctttgtctatctaattcagctgcaaaatc
caattcctctcgagtccaaggctcttgtttaatctcattcatacattctgatacaagatt
tgctaaaacatgattatttaaagtattataacaacctcctaaaaactctacttcaacttc
agtttcagtcatcattgcagctccttttgctacctttacaagtctttcatatgtactttc
tacagcttctctacttaaagctcttgtataataccatactgatgctttatcaggaactat
gttgggtgctactcctccatctgtaattgtataatgaatccttacatcagaagtaacatg
ttctctcaaataattagctcccacattagtaagttccacagcatctagtgcacttcttcc
attttgagggtctgagcctgcatgtgcagtctttcccttaaagtgaaattttacagagtt
aacagctgttgaagtaccaattgtagcttcactaattttatttggatgaaaatttatagc
taagtctaacccttcaaatgctccacctctagccataaatcctttacctgttaattgttc
ttctcctggacatgcataaaatactatagtcccacttaagttattttctagcatctctct
tttaagtcctactactgcccctacatgtgctgtacataataaattatgcccacatccatg
accatatgcactcaattcaaatgcttcttgctttgttgaaactttttgatttaaaccagg
taatgcatcaaattctcccataaaacctataactggtttacctgaaccaaaactagctct
aatagccgtggctaaacctcctacacctacttccacatcaaatccttcacttcttagaaa
gtttgctgtattttcacatgctttaaattctttaaatgctttttctgggttttcccatat
tttcttacttaaatcatcaagtttgaatctttttttatctatctcatttatagatatact
tcctatcatttcttattcctcctataagtatatttactatcaaccaaatataattggacc
tattatactagcaaatgccactgatgcaatggttacagtaacaaatcctcctataatcat
ctttggtaataaataatctgttgccctttgtttttcttcttcagttccttccatagcatc
aataccttcgttggaaattatctgtgttgcaggataagctagcatacaagttacaccaat
tgcagctgacattcttggagaatatcccaatagttttcctacaattgcagtaaataatat
tataaatacagaacctacaacaagtattcctatagttggaacaatcatcccaaacaatgc
tgttggagttaccttagcaagtcctccaggtaacatcaacatacaaccaaacattataat
tccattagattgagatttatctaaaattcctttttctaaaaaacctattcgtgtaaaaat
caaccctactaacaaacatgctatattaggatttaaataatagtttgcaggggtaaatcc
tggtattaaagtagccaatcctacaaaattaccaatcatagcaacaaatgaaagctttgc
aagatacactagagtagatgattttttacctaaatcttctttaaaaattctcatacttgg
aagtctaaaattactttttgactcatctttcaaaaaatccccgttatctcttttaaattt
taattctttatttatacaatatgtagttatcggaatgccaaagaacttttgaaatgataa
tactagaattacaaatgcagcaagttcaggtctatttgcagcttctgcaacagttgttac
gataataccggcaacagtagaacctgctattggaggtgctgctattaaagcatactctct
accaaataacatactacccactgttaaacagccaacccctattcctacaatacctactaa
tgcaattacaaccgttttccattcatgacataagtcttcaagatttataagtgttcctaa
gttagttattaataaagctataccaaagttgctcattgcagctaatatccctgatgctcc
tgtaatgtcttttggtaaaacatttgtccaaaatcctagtaaaaatataatacatacaaa
taacaatgttgaaattgcaccttttgttttcttagataaaaactcactaaaagcataaat
cattacacatacagtaaagcaagtaagtggattccaaaaattttccattgttgtttcctc
ctaaatataataattttttatcaataaaacaataattataaaatgtatattatgcagtta
ttcttaactacatatggtatagcttgatattttttgatgatattatatacgtcttaaatt
attcctaaaatatctaaataaatataactagagttaactctctaaatattaactataatt
atcaacttactagatttctttttgatttttactttctacataattttacaagttagaatt
gtacttcaactactttctatcttagtatacatgttggaagacttatatttatttaaatat
tagatatagaatacatttttacaaacgtcttaaattattcttaaaatatctaaaacgaaa
taataatataaccattaaaccaatattatcagaatatactccactttaagtcttctttat
ataaaaattttatctactagtgcatcccctcctttgtaaattagactatttctaagcgaa
tttagatatcttattcctatgaactattactagaaacaaaaattatttattatattaaat
caatgataagcatactttaaaattctttctatacaagtatgatttatcatataatgacat
ctataccttcatctttatagtagtcctaaattattcttaaattgacaataaaaataattt
cactatttgtaaaaatacttgtttttatattgtcaaactattctcaatatagattataat
ttcaaatcttttttttgtcaatatattctgacatttttctagaaaatttataaagttata
tagtgagtaaatcatactatttttatataatgagtaaattatactatgaatatgtctaaa
tatttacttaagtataaacataaaaaatgtgtattctcctttttatagtaattttagttg
ccattacttttaataagaatacacactttactttaaagaccctatactctattttaaatg
ctttactagacactaattaacattagttcctaacttctatttatcttattactaccctac
tactatatccgtagaaaaatctaaaacttctccattagattttattacttctttgtacca
atcaaatgattttttcttatatctcttaaaacttcctttgccttcatcatctaagtcaac
atatataaatccatatctcttactcatctgacctgtagttgcactgactaaatcaattgg
tccccacatcaaatatccaaaacattcaacattatcctcttcaattgcagacttcatttg
agatagatgcttacttaaatattcaattctataatcatcatttatagttccatcttcttc
gattttatcatatgcccctaaaccattttctgtaattaagataggtaattgatactttct
gtaaatatagttcaaggtaaatcttaaacctatagggtctattgcccatccccacttact
ttgttccaaatatggattttgaatcccaccaaataaagatttatcacctgataaattttc
ttttggagtagatacacttgaaaaataataattaagacctataaaatctaacttaccttc
tttaaatgcttttttgtcttcatcagtcacttcaatagttatattatttttttcatattc
ttttaatttatattggggaaacttcccattgcacattgcatcaatttgataataatcacg
atcattatctaaaaatgcatttaacacattactaggattacaattgtatggataaattgg
atttagtccaaatacacatccaactttattgttgggattgatttctctagccaactttgc
aacctttacacccgccaaagtcatattataccctacatttgccaatgtttgaaccttatt
ttctatttcactatacttaatacctgctatcatataagtaaaaatatccgagtgctctgt
ttgagggtcaatatggttcatctcattaaatgtaatccagtactttactttatcatcaaa
ccttcttattacagtctcactgtactttaaatacaaatccataagttttctgttattcca
tgaaccatatttatgtactaaattcataggtaattcaaaatgatatagtgttacaatagg
ttctatattattttctattaatgtatctatcagaccttcatagtatttaatccctaattc
attaggattttcatcatctccatttggaaaaattcttgaccaatctatagatattcttaa
tgcactaaatcccatttctttaaataaagctatatcttctttatatctattataaaaatc
tattccattatgagatggataatccaatttttcttctattttatcagtaattactcttgg
cgtttcataagagcccttagttacaaaatccataattgcaggtcctttgttatcactatc
ccatgaaccttcacattgatgggctgcaatacttcctccccagaaaaatgtatctttaat
attcatgaattttccctcctaaaatttatactattacagttaataattcttctgattcat
catttgatgagattacatctaaataatcgctagtatttgtaactacagttattatagtag
aatcaaagccttcctctataattttatcagattcaaatactgctaaagcatctccttttt
taaccctttgattttgtgttacaagactttcaaagaattttccatctaagtttacagtat
ctataccaatatgaattaatatttctaatccttcatcagtcactataccatatgcatgtt
tagttggaaatactatagttatagttccatctacaggagatataacagttgattttgatt
cactaggtataactccaacccctttacctaatgctccagaggaaaatgctttgtcattaa
cttccccaagtgcaattacctgaccttttgcaacatttccaatactaatagttcttgaat
tgttctcgttgattattagttctaattctttttcattatcacccttaacttcttcttttt
catctgaaggtattcctagtaaataggaagctgctgttgctgctacaaatgatactacta
cacttattatcataaatgtaaagttagatgcctctcctccaacaagatatgttggtaatg
cagctaatccccaaaccattccatatgttttaacttgagctaaacctgctattaaaccac
ctatacctccacctatcattactgctacaaatggtcttctatatttcataaacacaccaa
acactgaaggctctgtaactcccataagtgcactaaaacttactgtcccaaataattgtt
tttgttctttattcctagtttttaagaaatatccaaacattgcaccacaaactgcaatat
cagatattgttgcagcgcccataaaaattgggtcataccccaatgttgtcacagaattta
aagatataggcatagtaaagtttgctgcaccaaaaactattaagagtggttgtaaagctg
catacagtgcaacaacactccaattacccaatgtatcaattaaaaacatacatgcatagt
ttaatccatcaccaatccacataccaataggtccaaatacagttaatgtaactgataggg
ttattattaaagataacactggaactaaaaaatagtgtagtgctttaggtaatatttttt
tcaaaccttcaattataattcccattgcccatactcctaaaagtattggaataaaactgt
ttgcataagttgtagcctgtaaatttataccaaataaacttaatccttctacaccatcta
ttgatgacgataataacgtaactgctaacactactgctatatagggatttacattaagtc
tttttgctgatgctattgcaattaatactggtaagaagtgaaatgtagcacttcttaatg
tatctaatatttgatatgtagggctatcactctgaagtatgccagacatatttaaaagtg
ctaatatacttgcgagtataccagctgcaagtagtacttcaattactgaagtcatagtct
ctgagactaccacaaagatggaattaaatatacctttgatacctctaattcccttttttc
tttcactttttatacttgattcacttgaacttaaacctatcatagacataaactcgttat
atacatctacaacatgagtacctattataatttgataagcaacatcattagaaactacat
caattactccttttaattttttaatttcttctgtttgagcgatacttctatcatttaaag
taagtcttaaacgagtaacacaatgcgctaccgactttatattttcttttccccctataa
gttttattatattttcatttaaatctttatatttcatctgattttgcctccagtctttga
gtcaccctatttatatgcaacattaaataagtttcttcacttatagatatatcgacatta
aattgtgattttatatattttcttatcttttgaacacttccaaatgactttggataaagt
tgacttacttgtttatataaatctatagaattatcttcatctattgaagcttcatctgac
ataattctttggataaagtactgtagatgagtagtaaatctcatataatttgttgaagtt
tcatctagctctacattaaaatgatattttattatagaaactatatctgctaaagttctc
aactctacaattgtactatcatgagactctttatttacctccatatttacaaaatgaagt
gctattgatactgcctcatcatcaggaagattaattcccttactatcaccaattaatttt
agtgcatgcattccaatttcaaaatgctttggataaaatcttttaacattccataccaaa
ggactttttataaattgattcttttcacatcttttaagtaaaaactctaaatggtctagt
aaggttaagcttagataatcacttgactttatatttaaagctttctcaccatattcaatt
atttcattaataagaactatattattggagtctgagttttgtagtagataactaaagtgt
tctagcatatcgtatgaatctagtatatatgttctctctatttcattttcatttattact
tgtcccactctttttttaaagccaattcctttaacaaatacaataatttcatttttacct
ctttttactaaggctacattattatttaaaatctgaattattttcatatattcctccttt
caataaaaagaactcaagcatatatgtatagagtatccctctatttttcacatatatact
tgagttctgcctgctaatcagtaacatactcaaaattatgactacgtcgccataattaaa
attcttttttgtttaatttcatattctatatgttatactatccatataaatctgtcaacg
gtttcctagatatttttttattctataactacaagctctgttatgcgattatctggcaaa
gtttatatactaaattgatactattttactgtcactaatatttacaatattgtctgaacc
attatctattttactattatgaattatcatagtaatgattttaaatataatgaactgtat
gttaataaataaattcttaagtttagttttatttaatcactattaagatatattaatagg
taaagcttcaaatttagttttatttaaatgctattaagatatactaatatataaatactt
aaatttagttttatttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttaat
tttatttaaacactagtaagatatactaatatataaatacttaaatttagttttatttaa
acactctagtgatatttttaaataaattttaataaaaatcattctattttgtcataaatc
atttatctggcttatatttaagatatattggtggatactttacactttttaattcctcat
tacttcttaaaagtttattattattttccacatcataaatttgtaacattactttattta
catatagagcatgataattatcactataaaaatattgatactcatatcgagggtcatctt
tgtaatacactttgtatagtattccttcgtaacttgccttcttggctttttcttttgtaa
tactttttatattatcttttgaaatatcttgttttaccatatacttatcaatatatgttt
cagcatctttccatggtttaatgcagtttttatatacaacaaaccctgttacacttataa
tacctataattaatactataaaaataactttatattttttcatattaatcctccttcatt
tattatttaaaacttgatataacgcactaaaaaaaggatgttatcttttttattaaaata
taacatccctcatatttagcatcaatatatatgccccaactggtaggttaaaagacccca
ctgtcagtactttgattaaattgcatgtatgtatatatatttttaacaaatctattatat
gtcaacttgtctactattacatataatctgtaatattacatctgctgctttttttgagcc
tcctgcattataaaagctttttgatagtttagttgcattttctttatattcattgtcatt
tataacttgaaatactgcttttttaatactttcggacttatcctcttttaacataattcc
tgctcccaaatgaacaactctcttagctaccattctctgctccgaatgttgaggaaataa
taccatgggtactccataatataaactttcattaacactattcatcccagaatgagtaat
aaacacatcagttttttgaagtatagcaatctgttcaacactatttttaacctcaaaatt
atttggtatatttcctaaacttttaatatcagtacttctaccaacagacataatcacatc
aacatcagaatctttaaatgcatttatacagtttttataaaagctaacatttttattatt
aattgtaccaagcgaaatatatattaactttctttttctctctttaggtttaataatcaa
ctttgatactgatggacctacaaatgaatacttactagagaaggtttctaccattggttg
aaattcttttgatgtatatacaatggtatccgtatcattatcattagaaactatagaaat
aaaattttttacttcatacccttttctttgtaaaagctttatttttttattaatgcgtct
tacaccaaaaatcatacgtataatttctataaagttttgtttcatcaactttgctgtatg
tttattaaatgcaaaagttgttgtagagcatacatatggaatattaagtttttgtgcaaa
taactttccccaaaaacttaatgaatctgatacaatgcaatctggattaaaatctttaag
ttccctacaaactttttcatctaaagaaatagtagtatctactatcatctcaattaatcc
aggaaaatccttaccaatttttttctcatctccagggagtaattctggaaggtatttatc
acaacaaataaattttgctccagcaccttcaattttatctttaaattcattaaaagaata
atacaatacctcatttcctctatccactaattcacgaactacttcaatagtaggattagt
atgaccatatgcaagaatgctaaaaaatactattttactcacatttcatacctcctttta
taattttttaaaatcattcttctttacgtactactcccatatgacctataaaatttatca
aatcacgttgatgaacaattcctaatcctctttcctcatctccaagtaccaataatttat
ctcctgcatttatattaaatacttctcttgcttcttttggaatgacaatctgaccacgtt
caccaactactactgctccaaagaaaaactttcctttaggaggtactataatacctgttt
tttcttccgaatgattaactaagtcatctagtttgaccttgtacaattttgcaagtttaa
tgcaactacctatatcaggaatagattctccag