Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00121_1A_020916.fasta |
contig | u00000crpx_c_020916 |
start | 3481039 |
length | 13078 |
strand | + |
type | core |
seq | catctcaccagtagatgcacttactaaatctatacatccccatggagtatatccaaataa atcaacgccatcttctacagcttccttcatttgctctatatgtgcttttaaatactctat acgatagtcatcatttatcactccattagattcttttttatcataagctcctaaaccatt ttcaactaccatcataggtattctatatctatcataaatttcatttagtgcatatctaag cccttcagggtctatttgccatccccattcactagacttaagatatggatttttcactcc acctaatatgttgccacttgtattatcttctttagaatcactacttacacatgtagacat ataataactaaatgtataaaaatctacacaaccttcttttaaaatttctaaatctccttt ttccatttttatttcaatattattttctccaaaatatctattcatataagttggatattc gccacgcacttgtacatctccacagaaataattcattactctactatctctttgagtttt aactgcatcatctggattacaagtataaggatacattgttgcaaatatttgcatacatcc aacttgataatttgaatctatttcatgagctaacttaacagccttagcacttgctacaaa ttgatgatgtaacccttgaaaacgaagttgaggtatatctacttggtttataaaatctgt agtcccttcatttaatattccttgtgataagtagcctcccataggcattgtagctgaatt tatttcattaaatgtcagccaatattttacttttcctttatatcttttaaatattgtttc acagtaattcatatacaagtctattacatctcttgaaacccatccattgtatttctctgt tattgcaaatggtatttcatagtgagatattgttattaatggttctatattatattttaa acattcatctatcacattttcataaaatttaagtcctgcttcatttggttctttctccat tccagttggaaatattctagtccatgctattgaaaatctaaataccttaaatcccatttc tgcaaataaagctatatcttctttgtatctgtgataaaaatctattgcttcatgacttgg ataaaatgttcctttttctataactctcgttattcttttacttactttttgagaacctcc agtacacatatctgaacaagaaggacctttcccatctaaattccatgctccttcacattg atttgctgctgttgctccaccccataaaaaatcttttctaagtgccataattctacctcc aataatttatttatagtaactttattttaaaataaaaatacatatatataattcttaatt aatagaactctcttttacgctaaaacagttatcaatttctgactattatttacatgcttt tgtgtattttctacaatatccacataatcagaataattagtaacaactactggtgtttct aagcaatatccttcttttgaaatactttctatgtcaaaagttattaatgtctgacctttt ttaatcttatccccttgattaacaaaagatttgaaatatttaccttccaactgaatagta tttaaccctatatgtatcaatagttcacaaccattatcagatataattcctattgcatgt tttgttggaaataaagtcattacagtcccatcaaatggtgccactacttttccttcttta ggtgttattgctacaccttttcccaatatacctgttgaaaacgctgcatcttgtatctgc tccaaagcctttacttcaccttttattgggctatatactacttctcttttgtttttttct ataacgccttgcccattatcatctttagaaatttctactatagcatcatctttccaaaaa aataatgttaaaacaaatcctactacaatagctactattattgctattatagttgcataa acacctttcatatctccagttgttggatttatataattaggtataccaaatattccaagt ccacccattacataactttttacattcattatccccattacagctcctgccacagcacca cctacacaactatatatgaatggtgtttttcttggtaaagttattccatatattgcaggc tctgttacaccacatatccctgaaataactgcaggtatacacagctcttttatcttctta tcttttaatttaaagtacattgctgctactactgctgtttgtgcaaaagatggtacaaat actcccactaatattgtgtcaaaccccatagtcataaggtttgacatagctattggtact aatccccaatgtagaccaaatattacaagcacttgccacaataaaccagttaatgcacca cataaaattggtgaaaagttaaataaagctaaaaatccatttccaactatattagaagca taggtagctataggccctataaccataaatcccaatggtaaagaaactaataaaactgcc attggtacaaagaaattctttactacatctggtattattttagcaaacactttctccaac ttagctgctaataatactattaaaattactggtactactgttgaagtgtagttcattgct attactggtaatcctaagaaagttatatatactggtgattcaaatattgttccagtaaat agattgtataaaggttgacctgtagatgctagagtatctaattgaatacctgaatagcat aaaactgcacctataagcattccaataaatggttttaatttgaatttcttagcagctgta tatccaagaattattggcatatactggaacattgcatctccaattgcatttaacataata tatgcaccatcagtttctccatacaaacccaatgctgtaaatactgcattaaatcctttt atcataccagcagcacacagaactcctaatattggttgaaaaactcctgatattatgtct ataaacttattaagtaatccttttggcgcatctgagtctgaattatctattgtatctcct cctaatccagccaaatcgcacacaacttcataaacatctggaacatgattaccaataact acttggtattgacctgcacttttcattacagtaactataccatccattttttttagcaca tcatcatttgctattgactcatcttttaatttaaaacgtagcctcgttatacagtgagat aaactgctaatattatcctttcctcctacattcgcaatgatttcttttgatagttgttca tactttctcattttttctcctccattttctttttgaaatatgaaggtttggccaacttaa tgtcaccacccaatatatataaacctaattattaggatttatatccgacttaatactttt acttaccactctttcaacgtgaatagttaagtataatttttcctcatctgttaaatcgta gttgtattttttatgtataaattcatccaacttttctatgaatttataagcatttttata tttaacttttattacatttaataaatcatcttcattattttcatgtaaattattactaac aattcgttctgcaaaatactttaagtgagtaataaatctatgataataaactgaatcttc atcaaatactattctgtaatggtatttaaccatatttgaaatttcttgtattatttgtgt aatctcatatatagtttttatactttgatccatttgtgcattaactatatgcagtgctat aaatccagcttcatcttctgatagtctaatttcaaattttttttctatataatccaatgc ctctaaccctattttaaattcactcttataaaatctttttatatcccaaagtaatacatt ttttacacttactccttcacgagctctttctattgcagtatacatatggtctgttaaaga aatataaatactatcatttaatcttttccctagtttttctttagcatataaaattatttc atctgataattccatatatcttataggaatatctgctattagttctttaaatttatcaga tatatttgggtctgaaagtttgaatatcttatcaattttatcctttgatatatgctctcc tgtacgttttttataagctaaacctctccccataactactatttccttatgattttcatc agttgtaataattacattattattgagtattttttcaataatcattgtgatgcccccttt attagcattaagttaaaataaatcttttttaattatttagaatatttaaaatgtaattta ttacataaaaaaaaacctatttattacacattaaatagactcccatgagtcctgagtaat aaataggtttagcttgtatttaaacaatcactatccgtttgtattttattttaattatta tttattatatgttagcaaatttattttttagtgtcaactttttctcaatattttaatttt aaataaattatataaattgaatcttcaaagtactatttttatcaataaacaaaataaaaa aggtattactttctttaagtaatacccatttatttctaatttaagtggtttttcttaatc tcatcaagtagtccatcttctaaataaatttctaatgcacatcctaccattgcctttact gctttgtgaagtttatcataagcttcctcagaatttgcataatttagaaattctttttca tgaacatataccattggacttatatctaaggctatttctgtatacatagtagggcaaact tgacttacattacctatatctgtagaacctactggaccatctttaccttctaatatatct gttatacctgcctcaatcaaattattctttgttatcttttgaagtactttgttatttatt atgttgtcaaaagaattttcaaagtatctataagaaagcttagctcctgtcattaactct gcaccttttgcacagtttataacttttttagttacttcatctaaataacttctttcagca gctcttacgaaaaacttacaagctgctttttctggaactatatttggagcctctcctcca tttgaaactataccatgtattctaacatctgattttacatgttgtcttagtgcatttatc ccagcaaaagtaagttgtactgcatctagtgcattgactcccatatgagggtgactagct gcatgtgctgataccccttcaaaactaaactctaatgaatctatcgccaaagccttacag tttatattattaaaagcttctatatgcatttgataacttacatcaacatcatcaaaagct cctgccttaactaaatcacattttcctcctgttgtttcttcagctggtgttcctattagt acaatttttcctttaaaattttcttttaacttacttaatactatacaagctcctagtgta gatgctgcaatccagttatgtccacaagcatgagctggttctttattttctccatatcca ggaagtgcatcatactcagctaaaaatgctatggtaggtccatcattatctcctaattca gctctaaaagcagtctccatattacaatatggataaactgtatcaaatccatattccttc attttttctactaagtattttgatgatatgtattcttcttcccctaattcaggattgtta aatataaaattacaaacttcttcaatttcttttccaagttcattctctatctcataagct ctcttctttatactctctatcataatttacctcctactagaatcctagatataatcctat tgtcaaaaatgccattacaagaattgttaatactaccattaaaggaattacgaatctaac ccactttgaccaaggaatattggctactgctagtgctcccattaaaacacctgatgtagg tgttatcaagttagttacacctataccaaattgataagctgtaactatcatttgtcttga tacatctactaagtcgccaagtggtgcaagtacaggtattgtaagtgatgcaagccctga tgctgatggtattaaaaatgctattaatccttctattaagaaagttaaatttataaatat agtttttggtaatccatttaataaatttgctgcagaatttaaaattgtatctattataaa tccattttctgctattattacaattccacgtgcaaatgctatacacaatcctgctgtcat taaatctcctgctccacttataaatgaattaactatatcatcttgtttaagacctgatgc tatacctgatattatacctatagctgtaaatatcattgcaatttcagttatataccatcc caactttaaaactccatatatcataatcgccatacctattgtgaaaattgctattaccat ggcttctctttttgtaaattcctttatatttgtatcactattaaccattgattcttgatt tagtgatatatcgtgtactaaagattttttagggtcttttttaactttattggcatacat cataacaaatcctatagatatagccatatatattataaacataacaactctaaactctat tccagaacctggtgctatttgtgataatgcttgtgctattcctacagagaaaggattcgt agtagctgctccaaatccagctgttgctcctataaatactgtggccactgctgtcaatga atcatatcccatactggtcataagtggaataaatatcatataaaaaggtagtgtctcttc actcattccaaacgtcgtcccacctagtccaaatagaatcattgaaatcggtattattaa aaattgaaacttcttcattttatttacagtatgagctataacagcttctatagctcctgt tttattaactatcccaaaagctcctccaactattaaaacaaatccaactacttcagcagc atctataaacccgtttataggtgctgtaaatacatcagtaattccttgtggatttgatgg tgctttttcataagttccagctacaacaactgaccttccgtctatatctactctttcaaa atttccacttggcactatccaagtaagaattgccattaacactattagcaaaaatattat tgtaagtgtctgtggcatagtaaactttttcttttttaaactgctcatttttaatctccc cactttttaaattaaatattttattattgcatccctttatcctattttgtatagatgtaa aaaagctcaacatggatacatgttgagctaaatgtgctaaatacaacatacctgcatctt ccctttatcttgtttaagatagctctccatcaaaattcgggataattttgatgacagtac tgtacctattaaatacagtcccagcactagcttcggacactagcacttcggcacttactc cttttatattgcctcattggtttccaacctcttcaatattaatcttagtaaatgcaacct ctacctcaatctgtttgttagatgaggtaattcttattaatttttattaattcaaaataa ttgtagcataatatgtcgagattgtaaatattttcagtataataattcttactttatgat ttcattccatttttcacaaataattttttctccatataatttaaatactgtagtatattt taaatacacacaaactttccacaaattttaaattattataatacctttataataaaaaat aaaagctatgtaaacttatcaatttacacagctttatatacattaatctactccaagtac agctttaagctttgatgctattgtaataactcgtggaccaaatataacttgaactgagtt tttctttttaacaactccacttgcacccaattcatttacccagaagccatcttcatagaa tccatcaattgaatttagctctaccctaagtctagttgcacagtttgtaacattttttat attattacttcctcctaaaccttctattatagaatgtacaagctttgtatctttatcatc tacttcctcttctactgcattgttgtatgctgttttaccagcatctacagattgtctttc tctatattctttcttactataaagcttaacttcttctgaacttcttcctggtgtttttat atcaaacttcttgattgcccatgtaaatattatataagtaactataaaaaatattggtat caaaaataataatggtaacgcatccactttttgtggttgtaataaattaggaaacatatt tctaaatgattctcccattatagaaacattaaacatttctgtaaatacatacgtcaatcc tgccagtggtacatatgctacaaaatacaataatggtgcaacaaataggaatgtatactc tattggttccgttacccctaccaacatggctgttactattgctggtatcaatatacttat tgcttttttcttattagcattatcagccaacttatacatagctaaagctgctgctggtaa tattgcaaaatgtattaataaacgacctgttgtgaagttacgagttatataagatagtgt atctgggtctcccatttgagctaatcttatattattaacaccctcgtaaattgctccacc tacttccattgttccacctactcttgtatattctatagggaatgcaattaagtgatgtat accaaatggtaataatgctttatccattgctccaaaagtaaatgttcctaataatccact agaacctatccaattaccaagtttagataatgccaaccctactggtggccatataaagta cattgctgtacccaatactattgatgctataaacatcataatcattgaaaatcttggacc tgagaaaaaagataatgcactaggaagttctatgtcaacaaatttgttatgtactgcact agctacaaatccagctattatagctccaaatatactacaatcatatgaaaagattcctaa gaaagaaccatataaagaacttcgactatatgcttctgcctctcctaatccagatgccat aaacgcttctgctgtaactgtatctgaatttataccatttgctgctaacaatgtacttat aactgtgtgcattcctataaataaaacaattcctcctaatgcaccccatcctttttcctt tttagataatccaaaggctatacctgtaacaaagaatattggtaagtatctcattaccat aaatcctaaatcgtttattactttaaagaatacatttataaatgacccttcttttattag tccgctaagccctaatgcagaaacgttttccatatttgcaaaagctgaccctagtcctat aaatactcctgctacaacaagtaatataacaggtatcatcattgctccagaaagtacttg taatttatccttcatagtattatttcctccatttttattgaaatgccaggctatataatg catatatatatacttctattgctttgtataatgtatctatacttatattttcatttgcct gatgtgaatttggattatccccctctattgtgggtccaaatgcaactccattttttaaca ctcttgcataagatgcagctccttttgtaaaaagttcggcttcttttccaaaaccttgtt tatatgcatttgataatttatttattaattcactatctggttttacatacagtaatttta aatccttatatatatcaactattaaattttctttttttccaatttcattaattctattag ttataaactcccaacttatacccttaggatatctaaagtctattttcatattcaattcat ttttctctaagaagatactcattatacatattgtagaaactcccatatctacatcttctt tatatatccctaatttttttccatgattatcatctgtaaagtatgaatttaaaatatccc ttattataacgcctttatcatttagttttttaattttctctaaatcttttgctaaactaa atgcacagttatatgacctgtgtggatttctcgataaagccctttctcctgtatatctta ctaatactttaccttcttctagttcttctatctctgtataataagctaatgattctacta aatctttcttatcattagttttaaaaacagcctcaattttgtcacatacaaatccatctt ctttgtttgactttatatcaactaaattgtgatttctaaatttatctttatctattttct ttcttagattgaagtataaaatacctttttctccatttactattgggaagtttccatctg gagaaaatgcaaattttggctgttcattgacactaaagtaatgctccatacattcccaag tcgtctcttcagctccacccactatcaatctaatctttctcttcggcttttcattaagtt ctcttaagaaaagtaatgcatataaaatccctatcaaaggtcctttgttgtcattaactc ctctaccataaagatagttatctttttgacatactttaaaaggtttactcttccaaagtt ctttattatatattggcaccacatctatatgattaagcacccctactacttcttctcctt ctccatattctatatgaattgcatatccatcaaagtcttttacaacaaaatctttgtctt ttgctatttgaataagcttatcgaaggcatttcttatttctatcccaaatggttgattta tatctgttgtactttcatctctaattgaaggtatttcaactaaacttctaatatcattta tgatattttcttgattggattttaaataatcaataattagttctttgtttactatcatct taattatttatcacccctttatattaattttacaaagcatttcagttcatatctacatta taaattttgaatattattttttcaatatttcaaatacttctctaagttaccataatgata cggtaaacaatcaacagattatgacaaaatcatactatacctattactaatattttaact tatctattacgtcttttttaatgtaagtttattccaaaaatacataaaaaaagatgtagc cttagctacaccttcttatatctattcaacttccattattatgctattaatatctacatt tccaggttctatcctatcttttactgttctcttaacagaatcagcatcatccattataac tacaggagttattatatttaaatcatttgacgttataaaatctaaatctacttccattat taaatctttagcttttaccttatctcctgcctttaccttaacatcaaacggctttccttc tagtgacattgtctctaaacctacatgtattaatatatttgtattatcattactcttaat cattattgcatgctttgtatcaaatacattgactatttcaccatcaacaggagaatataa cttaccttcacttggtattattgctactccatctcccatcatcttttgggcaaaaactgc atctggaacatcttctaagttcactaaatttcccttaaaagggctatatattttctcaat cttattttcttttttcttaaatatattaaacataacacactctccacattataaaatttt atgataatatttttcttaaagcttttgctacaccatcatttacattagtatcagttacaa aatctgccatagattttacttcatctgtagcatttcccatagcaataccaagacctgcaa atttaatcatggatatatcattttcattatcacctatacaaataacttctttgctatcta tacctaatatatcacaaaattttttaactgcaataccttttgaagtacctttactcataa cttcaaagtttatctttccagaacttactacttctaaatcttcttgttttttaaattctt cctttgcttctctcaaagaatctacgttttctgagaaaagtatacattttaaaatttcat tatcagctttttctaataaagtttcacaacttgcattttctattatttcaattctgtctt cttctttatttttactatttattaatctatatggatgttcttcacctatttcattgttgg atataactattttacagcctttaaaatgtttgcttaaattatacttttcacctattgtat agattttctttagagcttctttgctcaaaaccttcttatactcatatcccagtaatttaa aatatgtcccattagttgatataatatatatatcatcccctaaaacacttgtaaaatatt tcatagcattataaggtcttcccgtaactaaggctaccttgatacccttttccatgactt cttttagtgctttaatattttcttctgatacttcaaatcctttacccatcaaagtaccat ccatatcagtacaaattaatttatatcgcatttgtatcacatcctagtaagatttttcta atatttcaacaaggtcttctttctttccaaaaggtaaaaatcctaaaactggacagcttg ttatttgttctaattgttcctttgttacattaaactcagacatttttgtcttaagtccca ctctctttaaaaaactttctatttcatttcctaaagttttagctgcttcatcatcttcca ctttttctaattcttggtttagcattctcgctactttggcaaatttctctatattatcct tatagaacttttctgcaaattttgggaacactatagccaaagcctcaccatgaggaatat gtgtaactcctcctattatttcacttagtggatgtggtgctgctgctccagcatttgcca gtgaacttcctcctaatgtatctgctactgctaactttgttctgtattctatattatttt tatcttccattactttaggtagatagttaatgactaattccatagatttttcagacatta tctctgtaaaatcattagcatttggatttatataactttcaaatgcatgagtaaaagcat caaatgctgttgatgcagtaattctctctggcagagttaacataagctctgggtcaact |