Block details
fasta C_difficile_CD00077_4A_024066.fasta
contig u00000crpx_c_024066
start 3505202
length 13078
strand +
type core
seq catctcaccagtagatgcacttactaaatctatacatccccatggagtatatccaaataa
atcaacgccatcttctacagcttccttcatttgctctatatgtgcttttaaatactctat
acgatagtcatcatttatcactccattagattcttttttatcataagctcctaaaccatt
ttcaactaccatcataggtattctatatctatcataaatttcatttagtgcatatctaag
cccttcagggtctatttgccatccccattcactagacttaagatatggatttttcactcc
acctaatatgttgccacttgtattatcttctttagaatcactacttacacatgtagacat
ataataactaaatgtataaaaatctacacaaccttcttttaaaatttctaaatctccttt
ttccatttttatttcaatattattttctccaaaatatctattcatataagttggatattc
gccacgcacttgtacatctccacagaaataattcattactctactatctctttgagtttt
aactgcatcatctggattacaagtataaggatacattgttgcaaatatttgcatacatcc
aacttgataatttgaatctatttcatgagctaacttaacagccttagcacttgctacaaa
ttgatgatgtaacccttgaaaacgaagttgaggtatatctacttggtttataaaatctgt
agtcccttcatttaatattccttgtgataagtagcctcccataggcattgtagctgaatt
tatttcattaaatgtcagccaatattttacttttcctttatatcttttaaatattgtttc
acagtaattcatatacaagtctattacatctcttgaaacccatccattgtatttctctgt
tattgcaaatggtatttcatagtgagatattgttattaatggttctatattatattttaa
acattcatctatcacattttcataaaatttaagtcctgcttcatttggttctttctccat
tccagttggaaatattctagtccatgctattgaaaatctaaataccttaaatcccatttc
tgcaaataaagctatatcttctttgtatctgtgataaaaatctattgcttcatgacttgg
ataaaatgttcctttttctataactctcgttattcttttacttactttttgagaacctcc
agtacacatatctgaacaagaaggacctttcccatctaaattccatgctccttcacattg
atttgctgctgttgctccaccccataaaaaatcttttctaagtgccataattctacctcc
aataatttatttatagtaactttattttaaaataaaaatacatatatataattcttaatt
aatagaactctcttttacgctaaaacagttatcaatttctgactattatttacatgcttt
tgtgtattttctacaatatccacataatcagaataattagtaacaactactggtgtttct
aagcaatatccttcttttgaaatactttctatgtcaaaagttattaatgtctgacctttt
ttaatcttatccccttgattaacaaaagatttgaaatatttaccttccaactgaatagta
tttaaccctatatgtatcaatagttcacaaccattatcagatataattcctattgcatgt
tttgttggaaataaagtcattacagtcccatcaaatggtgccactacttttccttcttta
ggtgttattgctacaccttttcccaatatacctgttgaaaacgctgcatcttgtatctgc
tccaaagcctttacttcaccttttattgggctatatactacttctcttttgtttttttct
ataacgccttgcccattatcatctttagaaatttctactatagcatcatctttccaaaaa
aataatgttaaaacaaatcctactacaatagctactattattgctattatagttgcataa
acacctttcatatctccagttgttggatttatataattaggtataccaaatattccaagt
ccacccattacataactttttacattcattatccccattacagctcctgccacagcacca
cctacacaactatatatgaatggtgtttttcttggtaaagttattccatatattgcaggc
tctgttacaccacatatccctgaaataactgcaggtatacacagctcttttatcttctta
tcttttaatttaaagtacattgctgctactactgctgtttgtgcaaaagatggtacaaat
gctcccactaatattgtgtcaaaccccatagtcataaggtttgacatagctattggtact
aatccccaatgtagaccaaatattacaagcacttgccacaataaaccagttaatgcacca
cataaaattggtgaaaagttaaataaagctaaaaatccatttccaactatattagaagca
taggtagctataggccctataaccataaatcccaatggtaaagaaactaataaaactgcc
attggtacaaagaaattctttactacatctggtattattttagcaaacactttctccaac
ttagctactaataatactattaaaattactggtactactgttgaagtgtagttcattgct
attactggtaatcctaagaaagttatatatactggtgattcaaatattgttccagtaaat
agattgtataaaggttgacctgtagatgctagagtatctaattgaatacctgaatagcat
aaaactgcacctataagcattccaataaatggttttaatttgaatttcttagcagctgta
tatccaagaattattggcatatactggaacattgcatctccaattgcatttaacataata
tatgcaccatcagtttctccatacaaacccaatgctgtaaatactgcattaaatcctttt
atcataccagcagcacacagaactcctaatattggttgaaaaactcctgatattatgtct
ataaacttattaagtaatccttttggcgcatctgagtctgaattatctattgtatctcct
cctaatccagccaaatcgcacacaacttcataaacatctggaacatgattaccaataact
acttggtattgacctgcacttttcattacagtaactataccatccattttttttagcaca
tcatcatttgctattgactcatcttttaatttaaaacgtagcctcgttatacagtgagat
aaactgctaatattatcctttcctcctacattcgcaatgatttcttttgatagttgttca
tactttctcattttttctcctccattttctttttgaaatatgaaggtttggccaacttaa
tgtcaccacccaatatatataaacctaattattaggatttatatctgacttaatactttt
acttaccactctttcaacgtgaatagttaagtataatttttcctcatctgttaaatcgta
gttgtattttttatgtataaattcatccaacttttctatgaatttataagcatttttata
tttaacttttattacatttaataaatcatcttcattattttcatgtaaattattactaac
aattcgttctgcaaaatactttaagtgagtaataaatctatgataataaactgaatcttc
atcaaatactattctgtaatggtatttaaccatatttgaaatttcttgtattatttgtgt
aatctcatatatagtttttatactttgatccatttgtgcattaactatatgcagtgctat
aaatccagcttcatcttctgatagtctaatttcaaattttttttctatataatccaatgc
ctctaaccctattttaaattcactcttataaaatctttttatatcccaaagtaatacatt
ttttacacttactccttcacgagctctttctattgcagtatacatatggtctgttaaaga
aatataaatactatcatttaatcttttccctagtttttctttagcatataaaattatttc
atctgataattccatatatcttataggaatatctgctattagttctttaaatttatcaga
tatatttgggtctgaaagtttgaatatcttatcaattttatcctttgatatatgctctcc
tgtacgttttttataagctaaacctctccccataactactatttccttatgattttcatc
agttgtaataattacattattattgagtattttttcaataatcattgtgatgcccccttt
attagcattaagttaaaataaatcttttttaattatttagaatatttaaaatgtaattta
ttacataaaaaaaaacctatttattacacattaaatagactcccatgagtcctgagtaat
aaataggtttagcttgtatttaaacaatcactatccgtttgtattttattttaattatta
tttattatatgttagcaaatttattttttagtgtcaactttttctcaatattttaatttt
aaataaattatataaattgaatcttcaaagtaatatttttatcaataaacaaaataaaaa
aggtattactttctttaagtaatacccatttatttttaatttaagtggtttttcttaatc
tcatcaagtagtccatcttctaaataaatttctaatgcacatcctaccattgcctttact
gctttgtgaagtttatcataagcttcctcagaatttgcataatttagaaattctttttca
tgaacatataccattggacttatatctaaggctatttctgtatacatagtagggcaaact
tgacttacattacctatatctgtagaacctactggaccatctttaccttctaatatatct
gttatacctgcctcaatcaaattattctttgttatcttttgaagtactttgttatttatt
atgttgtcaaaagaattttcaaagtatctataagaaagcttagctcctgtcattaactct
gcaccttttgcacagtttataacttttttagttacttcatctaaataacttctttcagca
gctcttacgaaaaacttacaggctgctttttctggaactatatttggagcctctcctcca
tttgaaactataccatgtattctaacatctgattttacatgttgtcttagtgcatttatc
ccagcaaaagtaagttgtactgcatctagtgcattaactcccatatgagggtgactagct
gcatgtgctgataccccttcaaaactaaactctaatgaatctatcgccaaagccttacag
tttatattattaaaagcttctatatgcatttgataacttacatcaacatcatcaaaagct
cctgccttaactaaatcacattttcctcctgttgtttcttcagctggtgttcctattagt
acaatttttcctttaaaattttcttttaacttacttaatactatacaagctcctagtgta
gatgctgcaatccagttatgtccacaagcatgagctggttctttattttctccatatcca
ggaagtgcatcatactcagctaaaaatgctatggtaggtccatcattatctcctaattca
gctctaaaagcagtctccatattacaatatggataaactgtatcaaatccatattccttc
attttttctactaagtattttgatgatatgtattcttcttcccctaattcaggattgtta
aatataaaattacaaacttcttcaatttcttttccaagtccattctctatctcataagct
ctcttctttatactctctatcataatttacctcctactagaatcctagatataatcctat
tgtcaaaaatgccattacaagaattgttaatactaccattaaaggaattacgaatctaac
ccactttgaccaaggaatattggctactgctagtgctcccattaaaacacctgatgtagg
tgttatcaagttagttacacctataccaaattgataagctgtaactatcatttgtcttga
tacatctactaagtcgccaagtggtgcaagtacaggtattgtaagtgatgcaagccctga
tgctgatggtattaaaaatgctattaatccttctattaagaaagttaaatttataaatat
agtttttggtaatccatttaataaatttgctgcagaatttaaaattgtatctattataaa
tccattttctgctattattacgattccacgtgcaaatgctatacacaatcctgctgtaat
taaatctcctgctccacttataaatgaattaactatctcatcttgtttaagccctgatgc
tattcctgatattatacctatagctgtaaatatcattgcaatttcagttatgtaccattc
tagtcttaaaactccatatatcataatcgccatacctattgtgaaaatggctattaccat
ggcttctctttttgtaaattcctttatatttgtatcactattaaccattaattcttgatt
tagtgatatatcatgtactaaagattttttagggtcttttttaactttattggcatacat
cataacaaatcctatagatatagccatatatattataaacataacaactctaaactctat
tccagaacctggtactatttgtgataatgcttgtgctattcctacagagaaaggattcgt
agtagctgctccaaatccagctgttgctcctataaatactgtggccactgctgtcaatga
atcatatcccatactggtcataagtggaataaatatcatataaaaaggtagtgtctcttc
actcattccaaacgtcgtcccacctagtccaaatagaatcattgaaatcggtattattaa
aaattgaaacttcttcattttatttacagtatgagctataacagcttctatagctcctgt
tttattaactatcccaaaagctcctccaactattaaaacaaatccaactacttcagctgc
atctataaacccgtttataggtgctgtaaatacatcagtaattccttgtggatttgatgg
tgctttttcataagttccagctacaacaactgaccttccgtctatatctactctttcaaa
atttccacttggcactatccaagtaagaattgccattaacactattagcaaaaatattat
tgtaagtgtctgtggcatagtaaactttttcttttttaaactgctcatttttaatctccc
cactttttaaattaaatattttattattgcatccctttatcctattttgtatagatgtaa
aaaagctcaacatggatacatgttgagctaaatgtgctaaatacaacatacctgcatctt
ccctttatcttgtttaagatagctctccatcaaaattcgggataattttgatgacagtac
tgtacctattaaatacagtcccagcactagcttcggacactagcacttcggcacttactc
cttttatattgcctcattggtttccaacctcttcaatattaatcttagtaaatgcaacct
ctacctcaatctgtttgttagatgaggtaattcttattaatttttattaattcaaagtaa
ttgtagcataatatgtcgagattgtaaatattttcagtataataattcttactttatgat
ttcattccatttttcacaaataattttttctccatataatttaaatactgtagtatattt
taaatacacacaaactttccacaaattttaaattattataatacctttataataaaaaat
aaaagctatgtaaacttatcaatttacatagctttatatacattaatctactccaagtac
agctttaagctttgatgctattgtaataactcgtggaccaaatataacttgaactgagtt
tttctttttaacaactccacttgcacccaattcatttacccagaagccatcttcatagaa
tccatcaattgaatttagctctaccctaagtctagttgcacagtttgtaacattttttat
attattacttcctcctaaaccttctattatagaatgtacaagctttgtatctttatcatc
tacttcctcttctactgcattgttgtatgctgttttaccagcatctacagattgtctttc
tctatattctttcttactataaagcttaacttcttctgagcttcttcctggtgtttttat
atcaaacttcttgattgcccatgtaaatattatataagtaactataaaaaatattggtat
caaaaataataatggtaacgcatccactttttgtggttgtaataaattaggaaacatatt
tctaaatgattctcccattatagaaacattaaacatttctgtaaatacatacgtcaatcc
tgccagtggtacatatgctacaaaatataataatggtgcaacaaataggaatgtatactc
tattggttccgttacccctaccaacatggctgttactattgctggtatcaatatacttat
tgcttttttcttattagcattatcagccaacttatacatagctaaagctgctgctggtaa
tattgcaaaatgtattaataaacgacctgttgtgaagttacgagttatataagatagtgt
atctgggtctcccatttgagctaatcttatattattaacaccctcgtaaattgctccacc
tacttccattgttccacctactcttgtatattctatagggaatgcaattaagtgatgtat
accaaatggtaataatgctttatccattgctccaaaagtaaatgttcctaataatccact
agaacctatccaattaccaagtttagataatgccaaccctactggtggccatataaagta
cattgctgtacctaatactattgatgctataaacatcataatcattgaaaatcttggacc
tgagaaaaaagataatgcactaggaagttctatgtcaacaaatttgttatgtactgcact
agctacaaatccagctattatagctccaaatatactacaatcatatgaaaagattcctaa
gaaagaaccatataaagaacttcgactatatgcttctgcctctcctaatccagatgccat
aaacgcttctgctgtaactgtatctgaatttataccatttgctgctaacaatgtacttat
aactgtgtgcattcctataaataaaacaattcctcctaatgcaccccatcctttttcctt
tttagataatccaaaggctatacctgtaacaaagaatattggtaagtatctcattaccat
aaatcctaaatcgtttattactttaaagaatacatttataaatgacccttcttttattag
tccgctaagccctaatgcagaaacgttttccatatttgcaaaagctgaccctaatcctat
aaatactcctgctacaacaagtaatataacaggtatcatcattgctccagaaagtacttg
taatttatccttcatagtattatttcctccatttttattgaaatgccaggctatataatg
catatatatatacttctattgctttgtataatgtatctatacttatattttcatttgcct
gatgtgaatttggattatccccctctattgtgggtccaaatgcaactccattttttaaca
ctcttgcataagatgcagctccttttgtaaaaagttcagcttcttttccaaaaccttgtt
tatatgcatttgataatttatttattaattcactatctggttttacatacagtaatttta
aatccttatatatatcaactattaaattttctttttttccaatttcattaattctattag
ttataaactcccaacttatacccttaggatatctaaagtctattttcatattcaattcat
ttttctctaagaagatactcattatacatattgtagaaacccccatatctacatcttctt
tatatatccctaatttttttccatgattatcatctgtaaagtatgaatttaaaatatccc
ttattataacgcctttatcatttagttttttaattttctctaaatcttttgctaaactaa
atgcacagttatatgacctgtgtggatttctcgataaagccctttctcctgtatatctta
ctaatactttaccttcttctagttcttctatctctgtataataagctaatgattctacta
aatctttcttatcattagttttaaaaacagcctcaattttgttacatacaaatccatctt
ctttgtttgactttatatcaactaaattgtgatttctaaatttatctttatctattttct
ttcttagattgaagtataaaatacctttttctccatttactattgggaagtttccatctg
gagaaaatgcaaattttggctgttcattgacactaaagtaatgctccatacattcccaag
tcgtctcttcagctccacccactatcaatctaatctttctcttcggcttttcattaagtt
ctcttaagaaaagtaatgcatataaaatccctatcaaaggtcctttgttgtcattaactc
ctctaccataaagatagttatctttttgacatactttaaaaggtttactcttccaaagtt
ctttattatatattggcaccacatctatatgattaagcacccctactacttcttctcctt
ctccatattctatatgaattgcatatccatcaaagtcttttacaacaaaatctttgtctt
ttgctatttgaataagcttatcgaaggcatttcttatttctatcccaaatggttgattta
tatctgttgtactttcatctctaattgaaggtatttcaactaaacttctaatatcattta
tgatattttcttgattggattttaaataatcaataattagttctttgtttactatcatct
taattatttatcacccctttatattaattttacaaagcatttcagttcatatctacatta
taaattttgaatattattttttcaatatttcaaatacttctctaagttaccataatgata
cggtaaacaatcaacagattatgacaaaatcatactatacctattactaatattttaact
tatctattacgtcttttttaatgtaagtttattccaaaaatacataaaaaaagatgtagc
cttagctacatcttcttatatctattcaacttccattattatgctattaatatctacatt
tccaggttctatcctatcttttactgttctcttaacagaatcagcatcatccattataac
tacaggagttattatatttaaatcatttgacgttataaaatctaaatctacttccattat
taaatctttagcttttaccttatctcctgcctttaccttaacatcaaacggctttccttc
tagtgacattgtctctaaacctacatgtattaatatatttgtattatcattactcttaat
cattattgcatgctttgtatcaaatacattgactatttcaccatcaacaggagaatataa
cttaccttcacttggtattattgctactccatctcccatcatcttttgggcaaaaactgc
atctggaacatcttctaagttcactaaatttcccttaaaagggctatatattttctcaat
cttattttcttttttcttaaatatattaaacataacacactctccacattataaaatttt
atgataatatttttcttaaagcttttgctacaccatcatttacattagtatcagttacaa
aatctgccatagattttacttcatctgtagcatttcccatagcaataccaagacctgcaa
atttaatcatggatatatcattttcattatcacctatacaaataacttcttcgctatcta
tacctaatatatcacaaaattttttaactgcaataccttttgaagtacctttgctcataa
cttcaaaatttatctttccagaacttactacttctaaatcttcttgttttttaaattctt
cctttgcttctctcaaagaatctacgttttctgagaaaagtatacattttaaaatttcat
tatcagctttttctaataaagtttcacaacttgcattttctattatttcaattctgtctt
cttctttatttttactatttattaatctatatggatgttcttcacctatttcattgttgg
atataactattttacagcctttaaaatgtttgtttaaattatacttttcacctattgtat
agattttctttagagtttctttgctcaaaaccttcttatactcatatcccagtaatttaa
aatatgtcccattagttgatataatatatatatcatcccctaaaacacttgtaaaatatt
tcatagcattataaggtcttcccgtaactaaggctaccttgatacccttttccatgactt
cttttagtgctttaatattttcttctgatacttcaaatcctttacccatcaaagtaccat
ccatatcagtacaaattaatttatatcgcatttgtatcacatcctagtaagatttttcta
atatttcaacaaggtcttctttctttccaaaaggtaaaaatcctaaaactggacagcttg
ttatttgttctaattgttcctttgttacattaaactcagacatttttgtcttaagtccca
ctctctttaaaaaactttctatttcatttcctaaagttttagctgcttcatcatcttcca
ctttttctaattcttggtttagcattctcgctactttggcaaatttctctatattatcct
tatagaacttttctgcaaattttgggaacactatagccaaagcctcaccatgaggaatat
gtgtaactcctcctattatttcacttagtggatgtggtgctgctgctccagcatttgcca
gtgaacttcctcctaatgtatctgctactgctaactttgttctgtattctatattatttt
tatcttccattactttaggtagatagttaatgactaattccatagatttttcagacatta
tctctgtaaaatcattagcatttggatttatataactttcaaatgcatgggtaaaagcat
caaatgctgttgatgcagtaattctctctggcagagttaacataagctctgggtcaact