Block details
fasta C_difficile_CD00076_1A_020700.fasta
contig u00000crpx_c_020700
start 3397786
length 13478
strand +
type core
seq ccatcatcatacttatccacgtatataaacccatatctcttggccatctcaccagtagat
gcacttactaaatctatacatccccacggagtatatccaaataaatcaacaccatcttct
acagcttccttcatttgctctatatgtgcttttaaatactctatacgatagtcatcattt
atcactccattagattcttttttatcataagctcctaaaccattttcaactaccatcata
ggtattctatatctatcataaatttcatttagtgcatatctaagcccttcagggtctatt
tgccatccccattcactagacttaagatatggatttttcactccacctaatatgttgcca
cttgtattatcttctttagaatcactacttacacatgtagacatataataactaaatgta
taaaaatctacacaaccttcttttaaaatttctaaatctcctttttccatttttatttca
atattattttctccaaaatatctattcatataagttggatattcgccacgcacttgtaca
tctccacagaaataattcattactctactatctctttgagttttaactgcatcatctgga
ttacaagtataaggatacattgttgcaaatatttgcatacatccaacttgataatttgaa
tctatttcatgagctaacttaacagccttagcacttgctacaaattgatgatgtaaccct
tgaaaacgaagttgaggtatatctacttggtttataaaatctgtagtcccttcatttaat
attccttgtgataagtagcctcccataggcattgtagctgaatttatttcattaaatgtc
agccaatattttacttttcctttatatcttttaaatattgtttcacagtaattcatatac
aagtctattacatctcttgaaacccatccattgtatttctctgttattgcaaatggtatt
tcatagtgagatattgttattaatggttctatattatattttaaacattcatctatcaca
ttttcataaaatttaagtcctgcttcatttggttctttctccattccagttggaaatatt
ctagtccatgctattgaaaatctaaataccttaaatcccatttctgcaaataaagctata
tcttctttgtatctgtgataaaaatctattgcttcatgacttggataaaatgttcctttt
tctataactctcgttattcttttacttactttttgagaacctccagtacacatatctgaa
caagaaggacctttcccatctaaattccatgctccttcacattgatttgctgctgttgct
ccaccccataaaaaatcttttctaagtgccataattctacctccaataatttatttatag
taactttattttaaaataaaaatacatatatataattcttaattaatagaactctctttt
acgctaaaacagttatcaattcctgactattatttacatgcttttgtgtattttctaaaa
tatccacataatcagaataattagtaacaactactggtgtttctaagcaatatccttctt
ttgaaatactttctatgtcaaaagttattaatatctgaccttttttaatcttatcccctt
gattaacaaaagatttgaaatatttaccttccaactgaatagtatttaaccctatatgta
tcaatagttcacaaccattatcagatataattcctattgcatgttttgttggaaataaag
tcattacagtcccatcaaatggtgccactacttttccttctttaggtgttattgctacac
cttttcccaatatacctgttgaaaacgctgcatcttgtatctgctccaaagcctttactt
caccttttattgggctatatactacttctcttttgtttttttctataacgccttgcccat
tatcatctttagaaatttctactatagcatcatctttccaaaaaaataatgttaaaacaa
atcctactacaatagctactattattgctattatagttgcataaacacctttcatatctc
cagttgttggatttatataattaggtataccaaatattccaagtccacccattacataac
tttttacattcattatccccattacagctcctgccacaccaccacctacacagctatata
tgaatggtgtttttcttggtaaagttattccatatattgcaggctctgttacaccacata
tccctgaaataactgcaggtatacacagctcttttatcttcttatcttttaatttaaagt
acattgctgctactactgctgtttgtgcaaaagatggtacaaatgctcccactaatattg
tgtcaaaccccatagtcataaggtttgacatagctattggtactaatccccaatgtagac
caaatattacaagcacttgccacaataaaccagttaatgcaccacataaaattggtgaaa
agttaaataaagctaaaaatccatttccaactatattagaagcataggtagctataggcc
ctataaccataaatcccaatggtaaagaaactaataaaactgccattggtacaaagaaat
tctttactacatctggtattattttagcaaacactttctccaacttagctgctaataata
ctattaaaattactggtactactgttgaagtgtagttcattgctattactggtaatccta
agaaagttatatatactggtgattcaaatattgttccagtaaatagattgtataaaggtt
gacctgtagatgctagagtatctaattgaatacctgaatagcataaaactgcacctataa
gcattccaataaatggttttaatttgaatttcttagcagctgtatatccaagaattattg
gcatatactggaacattgcatctccaattgcatttaacataatatatgcaccatcagttt
ctccatacaaacccaatgctgtaaatactgcattaaatccttttatcataccagcagcac
acagaactcctaatattggttgaaaaactcctgatattatgtctataaacttattaagta
atccttttggcgcatctgagtctgaattatctattgtatctcctcctaatccagccaaat
cgcacacaacttcataaacatctggaacatgattaccaataactacttggtattgacctg
cacttttcattacagtaactataccatccattttttttagcacatcatcatttgctattg
actcatcttttaatttaaaacgtagcctcgttatacagtgagataaactgctaatattat
cctttcctcctacattcgcaatgatttcttttgatagttgttcatactttctcatttttt
ctcctccattttctttttgaaatatgaaggtttggccaacttaatgtcaccacccaatat
atataaacctaattattaggatttatatctgacttaatacttttacttaccactctttca
acgtgaatagttaagtataatttttcctcatctgttaaatcgtagttgtattttttatgt
ataaattcatccaacttttctatgaatttataagcatttttatatttaacttttattaca
tttaataaatcatcttcattattttcatgtaaattattactaacaattcgttctgcaaaa
tactttaagtgagtaataaatctatgataataaactgaatcttcatcaaatactattctg
taatggtatttaaccatatttgaaatttcttgtattatttgtgtaatctcatatatagtt
tttatactttgatccatttgtgcattaactatatgcagtgctataaatccagcttcatct
tctgatagtctaatttcaaattttttttctatataatccaatgcctctaaccctatttta
aattcactcttataaaatctttttatatcccaaagtaatacattttttacacttactcct
tcacgagctctttctattgcagtatacatatggtctgttaaagaaatataaatactatca
tttaatcttttccctagtttttctttagcatataaaattatttcatctgataattccata
tatcttataggaatatctgctattagttctttaaatttatcagatatatttgggtctgaa
agtttgaatatcttatcaattttatcctttgatatatgctctcctgtacgttttttataa
gctaaacctctccccataactactatttccttatgattttcatcagttgtaataattaca
ttattattgagtattttttcaataatcattgtgatgccccctttattagcattaagttaa
aataaatcttttttaattatttagaatatttaaaatgtaatttattacataaaaaaaaac
ctatttattacacattaaatagactcccatgagtcctgagtaataaataggtttagcttg
tatttaaacaatcactatccgtttgtattttattttaattattatttattatatgttagc
aaatttattttttagtgtcaactttttctcaatattttaattttaaataaattatataaa
ttgaatcttcaaagtactatttttatcaataaacaaaataaaaaaggtattactttcttt
aagtaatacccatttatttttaatttaagtggtttttcttaatctcatcaagtagtccat
cttctaaataaatttctaatgcacatcctaccattgcctttactgctttgtgaagtttat
cataagcttcctcagaatttgcataatttagaaattctttttcatgaacatataccattg
gacttatatctaaggctatttctgtatacatagtagggcaaacttgacttacattaccta
tatctgtagaacctactggaccatctttaccttctaatatatctgttatacctgcctcaa
tcaaattattctttgttatcttttgaagtactttgttatttattatgttgtcaaaagaat
tttcaaagtatctataagaaagcttagctcctgtcattaactctgcaccttttgcacagt
ttataacttttttagttacttcatctaaataacttctttcagcagctcttacgaaaaact
tacaagctgctttttctggaactatatttggagcctctcctccatttgaaactataccat
gtattctaacatctgattttacatgttgtcttagtgcatttatcccagcaaaagtaagtt
gtactgcatctagtgcattgactcccatatgagggtgactagctgcatgtgctgataccc
cttcaaaactaaactctaatgaatctatcgccaaagccttacagtttatattattaaaag
cttctatatgcatttgataacttacatcaacatcatcaaaagctcctgccttaactaaat
cacattttcctcctgttgtttcttcagctggtgttcctattagtacaatttttcctttaa
aattttcttttaacttacttaatactatacaagctcctagtgtagatgctgcaatccagt
tatgtccacaagcatgagctggttctttattttctccatatccaggaagtgcatcatact
cagctaaaaatgctatggtaggtccatcattatctcctaattcagctctaaaagcagtct
ccatattacaatatggataaactgtatcaaatccatattccttcattttttctactaagt
attttgatgatatgtattcttcttcccctaattcaggattgttaaatataaaattacaaa
cttcttcaatttcttttccaagttcattctctatctcataagctctcttctttatactct
ctatcataatttacctcctactagaatcctagatataatcctattgtcaaaaatgccatt
acaagaattgttaatactaccattaaaggaattacgaatctaacccactttgaccaagga
atattggctactgctagtgctcccattaaaacacctgatgtaggtgttatcaagttagtt
acacctataccaaattgataagctgtaactatcatttgtcttgatacatctactaagtcg
ccaagtggtgcaagtacaggtattgtaagtgatgcaagccctgatgctgatggtattaaa
aatgctattaatccttctattaagaaagttaaatttataaatatagtttttggtaatcca
tttaataaatttgctgcagaatttaaaattgtatctattataaatccattttctgctatt
attacgattccacgtgcaaatgctatacacaatcctgctgtaattaaatctcctgctcca
cttataaatgaattaactatctcatcttgtttaagccctgatgctattcctgatattata
cctatagctgtaaatatcattgcaatttcagttatgtaccattctagtcttaaaactcca
tatatcataatcgccatacctattgtgaaaatggctattaccatggcttctctttttgta
aattcctttatatttgtatcactattaaccattaattcttgatttagtgatatatcatgt
actaaagattttttagggtcttttttaactttattggcatacatcataacaaatcctata
gatatagccatatatattataaacataacaactctaaactctattccagaacctggtact
atttgtgataatgcttgtgctattcctacagagaaaggattcgtagtagctgctccaaat
ccagctgttgctcctataaatactgtggccactgctgtcaatgaatcatatcccatactg
gtcataagtggaataaatatcatataaaaaggtagtgtctcttcactcattccaaacgtc
gtcccacctagtccaaatagaatcattgaaatcggtattattaaaaattgaaacttcttc
attttatttacagtatgagctataacagcttctatagctcctgttttattaactatccca
aaagctcctccaactattaaaacaaatccaactacttcagctgcatctataaacccgttt
ataggtgctgtaaatacatcagtaattccttgtggatttgatggtgctttttcataagtt
ccagctacaacaactgaccttccgtctatatctactctttcaaaatttccacttggcact
atccaagtaagaattgccattaacactattagcaaaaatattattgtaagtgtctgtggc
atagtaaactttttcttttttaaactgctcatttttaatctccccactttttaaattaaa
tattttattattgcatccctttatcctattttgtatagatgtaaaaaagctcaacatgga
tacatgttgagctaaatgtgctaaatacaacatacctgcatcttccctttatcttgttta
agatagctctccatcaaaattcgggataattttgatgacagtactgtacctattaaatac
agtcccagcactagcttcggacactagcacttcggcacttactccttttatattgcctca
ttggtttccaacctcttcaatattaatcttagtaaatgcaacctctacctcaatctgttt
gttagatgaggtaattcttattaatttttattaattcaaagtaattgtagcataatatgt
cgagattgtaaatattttcagtataataattcttactttatgatttcattccatttttca
caaataattttttctccatataatttaaatactgtagtatattttaaatacacacaaact
ttccacaaattttaaattattataatacctttataataaaaaataaaagctatgtaaact
tatcaatttacacagctttatatacattaatctactccaagtacagctttaagctttgat
gctattgtaataactcgtggaccaaatataacttgaactgagtttttctttttaacaact
ccacttgcacccaattcatttacccagaagccatcttcatagaatccatcaattgaattt
agctctaccctaagtctagttgcacagtttgtaacattttttatattattacttcctcct
aaaccttctattatagaatgtacaagctttgtatctttatcatctacttcctcttctact
gcattgttgtatgctgttttaccagcatctacagattgtctttctctatattctttctta
ctataaagcttaacttcttctgaacttcttcctggtgtttttatatcaaacttcttgatt
gcccatgtaaatattatataagtaactataaaaaatattggtatcaaaaataataatggt
aacgcatccactttttgtggttgtaataaattaggaaacatatttctaaatgattctccc
attatagaaacattaaacatttctgtaaatacatacgtcaatcctgccagtggtacatat
gctacaaaatacaataatggtgcaacaaataggaatgtatactctattggttccgttacc
cctaccaacatggctgttactattgctggtatcaatatacttattgcttttttcttatta
gcattatcagccaacttatacatagctaaagctgctgctggtaatattgcaaaatgtatt
aataaacgacctgttgtgaagttacgagttatataagatagtgtatctgggtctcccatt
tgagctaatcttatattattaacaccctcgtaaattgctccacctacttccattgttcca
cctactcttgtatattctatagggaatgcaattaagtgatgtataccaaatggtaataat
gctttatccattgctccaaaagtaaatgttcctaataatccactagaacctatccaatta
ccaagtttagataatgccaaccctactggtggccatataaagtacattgctgtacccaat
actattgatgctataaacatcataatcattgaaaatcttggacctgagaaaaaagataat
gcactaggaagttctatgtcaacaaatttgttatgtactgcactagctacaaatccagct
attatagctccaaatatactacaatcatatgaaaagattcctaagaaagaaccatataaa
gaacttcgactatatgcttctgcctctcctaatccagatgccataaacgcttctgctgta
actgtatctgaatttataccatttgctgctaacaatgtacttataactgtgtgcattcct
ataaataaaacaattcctcctaatgcaccccatcctttttcctttttagataatccaaag
gctatacctgtaacaaagaatattggtaagtatctcattaccataaatcctaaatcgttt
attactttaaagaatacatttataaatgacccttcttttattagtccgctaagccctaat
gcagaaacgttttccatatttgcaaaagctgaccctaatcctataaatactcctgctaca
acaagtaatataacaggtatcatcattgctccagaaagtacttgtaatttatccttcata
gtattatttcctccatttttattgaaatgccaggctatataatgcatatatatatacttc
tattgctttgtataatgtatctatacttatattttcatttgcctgatgtgaatttggatt
atccccctctattgtgggtccaaatgcaactccattttttaacactcttgcataagatgc
agctccttttgtaaaaagttcggcttcttttccaaaaccttgtttatatgcatttgataa
tttatttattaattcactatctggttttacatacagtaattttaaatccttatatatatc
aactattaaattttctttttttccaatttcattaattctattagttataaactcccaact
tatacccttaggatatctaaagtctattttcatattcaattcatttttctctaagaagat
actcattatacatattgtagaaactcccatatctacatcttctttatacatccctaattt
ttttccatgattatcatctgtaaagtatgaatttaaaatatcccttattataacgccttt
atcatttagttttttaattttctctaaatcttttgctaaactaaatgcacagttatatga
cctgtgtggatttctcgataaagccctttctcctgtatatcttactaatactttaccttc
atctaattcttctatctctgtataataagctaatgattctactaaatctttcttatcatt
agttttaaaaacagcctcaattttgtcacatacaaatccatcttctttgtttgactttat
atcaactaaattgtgatttctaaatttatctttatctattttctttcttagattgaagta
taaaatacctttttctccatttactattgggaagtttccatctggagaaaatgcaaattt
tggctgttcattgacactaaagtaatgctccatacattcccaagtcgtctcttcagctcc
acccactatcaatctaatctttctcttcggcttttcattaagttctcttaagaaaagtaa
tgcatataaaatccctatcaaaggtcctttgttgtcattaactcctctaccataaagata
gttatctttttgacatactttaaaaggtttactcttccaaagttctttattatatattgg
caccacatctatatgattaagcacccctactacttcttctccttctccatattctatatg
aattgcatatccatcaaagtcttttacaacaaaatctttgtcttttgctatttgaataag
cttatcgaaggcatttcttatttctatcccaaatggttgatttatatctgttgtactttc
atctctaattgaaggtatttcaactaaacttctaatatcatttatgatattttcttgatt
ggattttaaataatcaataattagttctttgtttactatcatcttaattatttatcaccc
ctttatattaattttacaaagcatttcagttcatatctacattataaattttgaatatta
ttttttcaatatttcaaatacttctctaagttaccataatgatacggtaaacaatcaaca
gattatgacaaaatcatactatacctattactaatattttaacttatctattacgtcttt
tttaatgtaagtttattccaaaaatacataaaaaaagatgtagccttagctacatcttct
tatatctattcaacttccattattatgctattaatatctacatttccaggttctatccta
tcttttactgttctcttaacagaatcagcatcatccattataactacaggagttattata
tttaaatcatttgacgttataaaatctaaatctacttccattattaaatctttagctttt
accttatctcctgcctttaccttaacatcaaacggctttccttctagtgacattgtctct
aaacctacatgtattaatatatttgtattatcattactcttaatcattattgcatgcttt
gtatcaaatacattgactatttcaccatcaacaggagaatataacttaccttcacttggt
attattgctactccatctcccatcatcttttgggcaaaaactgcatctggaacatcttct
aagttcactaaatttcccttaaaagggctatatattttctcaatcttattttcttttttc
ttaaatatattaaacataacacactctccacattataaaattttatgataatatttttct
taaagcttttgctacaccatcatttacattagtatcagttacaaaatctgccatagattt
tacttcatctgtagcatttcccatagcaataccaagacctgcaaatttaatcatggatat
atcattttcattatcacctatacaaataacttctttgctatctatacctaatatatcaca
aaattttttaactgcaataccttttgaagtacctttactcataacttcaaagtttatctt
tccagaacttactacttctaaatcttcttgttttttaaattcttcctttgcttctctcaa
agaatctacgttttctgagaaaagtatacattttaaaatttcattatcagctttttctaa
taaagtttcacaacttgcattttctattatttcaattctgtcttcttctttatttttact
atttattaatctatatggatgttcttcacctatttcattgttggatataactattttaca
gcctttaaaatgtttgtttaaattatacttttcacctattgtatagattttctttagagc
ttctttgctcaaaaccttcttatactcatatcccagtaatttaaaatatgtcccattagt
tgatataatatatatatcatcccctaaaacacttgtaaaatatttcatagcattataagg
tcttcccgtaactaaggctaccttgatacccttttccatggcttcttttagtgctttaat
attttcttctgatacttcaaatcctttacccatcaaagtaccatccatatcagtacaaat
taatttatatcgcatttgtatcacatcctagtaagatttttctaatatttcaacaaggtc
ttctttctttccaaaaggtaaaaatcctaaaactggacagcttgttatttgttctaattg
ttcctttgttacattaaactcagacatttttgtcttaagccccactctctttaaaaaact
ttctatttcatttcctaaagttttagctgcttcatcatcttccactttttctaattcttg
gtttagtattctcgctactttggcaaatttctctatattatccttatagaacttttctgc
aaattttgggaacactatagccaaagcctcaccatgaggaatatgtgtaactcctcctat
tatttcacttagtggatgtggtgctgctgctccagcatttgccagtgaacttcctcctaa
tgtatctgctactgctaactttgttctgtattctatattatttttatcttccattacttt
aggtagatagttaatgactaattccatagatttttcagacattatctctgtaaaatcatt
agcatttggatttatataactttcaaatgcatgagtaaaagcatcaaatgctgttgatgc
agtaattctctctggcagagttaacataagctctgggtcaactatacattcttttgagaa
acaattttgatgaaatattgtatttttctcgcttcctctcgatattactgctgcttgtgt
aacttggcttcctgttccagaagtagttgatacagctattaatggtaattctttttcact
taccttatcgtatattttaaatggatttgtatatgtactaaacatataatcccaatctat
tttttctaaaccaaaagtcaatgctaatacttttgcagtatctatacttgaacctcctcc
aacagctaaaacaacgtctacagattcttttttagctaattcaaacccttcgtttattaa
ttctacagttgggtttggctctactctctgaacctccca