Block details
fasta C_difficile_CD00133_1A_020483.fasta
contig u00000crpx_c_020483
start 3549455
length 15070
strand +
type core
seq tttttgtaataaaaaattgtatatataaacactatttactactcttctaagtacaaacag
tatctacatactataacctttcaccattagattctattacttgtttataccagtcaaaac
tctttttcttaatcctagacaagtctccacttccatcatcatacttatccacgtatataa
acccatatctcttggccatctcaccagtagatgcacttactaaatctatacatccccatg
gagtatatccaaataaatcaacaccatcttctacagcttccttcatttgctctatatgtg
cttttaaatactctatacgatagtcatcatttatcactccattagattcttttttatcat
aagctcctaaaccattttcaactaccatcataggtattctatatctatcataaatttcat
ttagtgcatatctaagcccttcagggtctatttgccatccccattcactagacttaagat
atggatttttcactccacctaatatgttgccacttgtattatcttctttagaatcactac
ttacacatgtagacatataataactaaatgtataaaaatctacacaaccttcttttaaaa
tttctaaatctcctttttccatttttatttcaatattattttctccaaaatatctattca
tataagttggatattcgccacgcacttgtacatctccacagaaataattcattactctac
tatctctttgagttttaactgcatcatctggattacaagtataaggatacattgttgcaa
atatttgcatacatccaacttgataatttgaatctatttcatgagctaacttaacagcct
tagcacttgctacaaattgatgatgtaacccttgaaaacgaagttgaagtatatctactt
ggtttataaaatctgtagtcccttcatttaatattccttgtgataagtagcctcccatag
gcattgtagctgaatttatttcattaaatgtcagccaatattttacttttcctttatatc
ttttaaatattgtttcacagtaattcatatacaagtctattacatctcttgaaacccatc
cattgtatttctctgttattgcaaatggtatttcatagtgagatattgttattaatggtt
ctatattatattttaaacattcatctatcacattttcataaaatttaagtcctgcttcat
ttggttctttctccattccagttggaaatattctagtccatgctattgaaaatctaaata
ccttaaatcccatttctgcaaataaagctatatcttctttgtatctgtgataaaaatcta
ttgcttcatgacttggataaaatgttcctttttctataactctcgttattcttttactta
ctttttgagaacctccagtacacatatctgaacaagaaggacctttcccatctaaattcc
atgctccttcacattgatttgctgctgttgctccaccccataaaaaatcttttttaaatg
acatacctatatcctcctattataattcttcaccatttgattctattacttttttatacc
aggcaaaactcttctttttactgcgttttaaagttccatttccatcattatctttatcca
catatataaatccatagcgcttcttcatttctccagtacttgcacttactaagtcaatac
atccccatggtgtgtacccccataaatcaacaccatctaactcaacagcatctatcatgg
cttttatatgagcacgtaaataatcaattctataatcatcatttatatttccattttcat
ctggattatctactgctcctagtccattttcaactataaataatggtttttgataacggt
tatataaagagttcatagttattctaagccctaatgggtctatttgccatccccactcac
ttgcatctagatatggatttttaagacttgcaaaaacatttccttctgttaaaatattta
cttttgggtctgcacttgtaagtcttgatgagtaatatgagaacgaaataaaatctactg
tgttctctttaagtatctttttatcatcttcttccatcactatatttattccttttctct
ccaattcttttaatgcatatgttggatattctccacgagattgtacatctataaaaaagt
aattttccctatctttttctatagatttccatacatctagtgggttacaagtattaggat
aagtatttcctgctgctaacatacaccctattttaaattcttgatttatgttatgtgcta
gtttagtaactaacgcactcgcaactaattgatgatgtgcagcttggtattttatttgtt
cttcattttctccctcttcaatatagagacctgcacctataaatggtaaatgaagtatca
tgtttatttcattaaatgttagccaatactttaccttacctttaaaccttgtaaaaataa
cttcacagtattttacatataagtctactagcttacgatttctccatgctccatattttt
ttaccaaatacatgggaacatcaaaatgacagattgttactactggttctattccatact
ttaaacactcatcaaataaatcttcatagaattttagtccctcttcatttggaacatcct
caactcctgttggaaatatcctagtccatgctattgacatacgatagcatttaaatccca
tctcagcaaataattttatatcttctttataattgtgatacatatctattgcttcatgag
ctgggtaatagtgttcatcatcacattcaaacattttcattttcccagccaaaactggaa
atctatcttttccttgcggtgtaacgtcaacattagctagacctctaccatcttctttat
atccaccttcacattgatttgctgctgttgctccaccccataaaaaatcttttctaagtg
ccataattctacctccaataatttatttatagtaactttattttaaaataaaaatacata
tatataattcttaattaatagaactctcttttacgctaaaacagttatcaatttctgact
attatttacatgcttttgtgtattttctacaatatccacataatcagaataattagtaac
aactactggtgtttctaagcaatatccttcttttgaaatactttctatgtcaaaagttat
taatgtctgaccttttttaatcttatccccttgattaacaaaagatttgaaatatttacc
ttccaactgaatagtatttaaccctatatgtatcaatagttcacaaccattatcagatat
aattcctattgcatgttttgttggaaataaagtcattacagtcccatcaaatggtgccac
tacttttccttctttaggtgttattgctacaccttttcccaatatacctgttgaaaacgc
tgcatcttgtatctgctccaaagcctttacttcaccttttattgggctatatactacttc
tcttttgtttttttctataacgccttgcccattatcatctttagaaatttctactatagc
atcatctttccaaaaaaataatgttaaaacaaatcctactacaatagctactattattgc
tattatagttgcataaacacctttcatatctccagttgttggatttatataattaggtat
accaaatattccaagtccacccattacataactttttacattcattatccccattacagc
tcctgccacaccaccacctacacagctatatatgaatggtgtttttcttggtaaagttat
tccatatattgcaggctctgttacaccacatatccctgaaataactgcaggtatacacag
ctcttttatcttcttatcttttaatttaaagtacattgctgctactactgctgtttgtgc
aaaagatggtacaaatgctcccactaatattgtgtcaaaccccatagtcataaggtttga
catagctattggtactaatccccaatgtagaccaaatattacaagcacttgccacaataa
accagttaatgcaccacataaaattggtgaaaagttaaataaagctaaaaatccatttcc
aactatattagaagcataggtagctataggccctataaccataaatcccaatggtaaaga
aactaataaaactgccattggtacaaagaaattctttactacatctggtattattttagc
aaacactttctccaacttagctgctaataatactattaaaattactggtactactgttga
agtgtagttcattgctattactggtaatcctaagaaagttatatatactggtgattcaaa
tattgttccagtaaatagattgtataaaggttgacctgtagatgctagagtatctaattg
aatacctgaatagcataaaactgcacctataagcattccaataaatggttttaatttgaa
tttcttagcagctgtatatccaagaattattggcatatactggaacattgcatctccaat
tgcatttaacataatatatgcaccatcagtttctccatacaaacccaatgctgtaaatac
tgcattaaatccttttatcataccagcagcacacagaactcctaatattggttgaaaaac
tcctgatattatgtctataaacttattaagtaatccttttggcgcatctgaatctgaatt
atctattgtatctcctcctaatccagccaaatcgcacacaacttcataaacatctggaac
atgattaccaataactacttggtattgacctgcacttttcattacagtaactataccatc
cattttttttagcacatcatcatttgctattgactcatcttttaatttaaaacgtagcct
cgttatacagtgagataaactgctaatattatcctttcctcctacattcgcaatgatttc
ttttgatagttgttcatactttctcattttttctcctccattttctttttgaaatatgaa
ggtttggccaacttaatgtcaccacccaatatatataaacctaattattaggatttatat
ctgacttaatacttttacttaccactctttcaacgtgaatagttaagtataatttttcct
catctgttaaatcgtagttgtattttttatgtataaattcatccaacttttctatgaatt
tataagcatttttatatttaacttttattacatttaataaatcatcttcattattttcat
gtaaattattactaacaattcgttctgcaaaatactttaagtgagtaataaatctatgat
aataaactgaatcttcatcaaatactattctgtaatggtatttaaccatatttgaaattt
cttgtattatttgtgtaatctcatatatagtttttatactttgatccatttgtgcattaa
ctatatgcagtgctataaatccagcttcatcttctgatagtctaatttcaaatttttttt
ctatataatccaatgcctctaaccctattttaaattcactcttataaaatctttttatat
cccaaagtaatacattttttacacttactccttcacgagctctttctattgcagtataca
tatggtctgttaaagaaatataaatactatcatttaatcttttccctagtttttctttag
catataaaattatttcatctgataattccatatatcttataggaatatctgctattagtt
ctttaaatttatcagatatatttgggtctgaaagtttgaatatcttatcaattttatcct
ttgatatatgctctcctgtacgttttttataagctaaacctctccccataactactattt
ccttatgattttcatcagttgtaataattacattattattgagtattttttcaataatca
ttgtgatgccccctttattagcattaagttaaaataaatcttttttaattatttagaata
tttaaaatgtaatttattacataaaaaaaaacctatttattacacattaaatagactccc
atgagtcctgagtaataaataggtttagcttgtatttaaacaatcactatccgtttgtat
tttattttaattattatttattatatgttagcaaatttattttttagtgtcaactttttc
tcaatattttaattttaaataaattatataaattgaatcttcaaagtactatttttatca
ataaacaaaataaaaaaggtattactttctttaagtaatacccatttatttttaatttaa
gtggtttttcttaatctcatcaagtagtccatcttctaaataaatttctaatgcacatcc
taccattgcctttactgctttgtgaagtttatcataagcttcctcagaatttgcataatt
tagaaattctttttcatgaacatataccattggacttatatctaaggctatttctgtata
catagtagggcaaacttgacttacattacctatatctgtagaacctactggaccatcttt
accttctaatatatctgttatacctgcctcaatcaaattattctttgttatcttttgaag
tactttgttatttattatgttgtcaaaagaattttcaaagtatctataagaaagcttagc
tcctgtcattaactctgcaccttttgcacagtttataacttttttagttacttcatctaa
ataacttctttcagcagctcttacgaaaaacttacaggctgctttttctggaactatatt
tggagcctctcctccatttgaaactataccatgtattctaacatctgattttacatgttg
tcttagtgcatttatcccagcaaaagtaagttgtactgcatctagtgcattgactcccat
atgagggtgactagctgcatgtgctgataccccttcaaaactaaactctaatgaatctat
cgccaaagccttacagtttatattattaaaagcttctatatgcatttgataacttacatc
aacatcatcaaaagctcctgccttaactaaatcacattttcctcctgttgtttcttcagc
tggtgttcctattagtacaatttttcctttaaaattttcttttaacttacttaatactat
acaagctcctagtgtagatgctgcaatccagttatgtccacaagcatgagctggttcttt
attttctccatatccaggaagtgcatcatactcagctaaaaatgctatggtaggtccatc
attatctcctaattcagctctaaaagcagtctccatattacaatatggataaactgtatc
aaatccatattccttcattttttctactaagtattttgatgatatgtattcttcttcccc
taattcaggattgttaaatataaaattacaaacttcttcaatttcttttccaagttcatt
ctctatctcataagctctcttctttatactctctatcataatttacctcctactagaatc
ctagatataatcctattgtcaaaaatgccattacaagaattgttaatactaccattaaag
gaattacgaatctaacccactttgaccaaggaatattggctactgctagtgctcccatta
aaacacctgatgtaggtgttattaagttagttacacctataccaaattgataagctgtaa
ctatcatttgtcttgatacatctactaagtcgccaagtggtgcaagtacaggtattgtaa
gtgatgcaagccctgatgctgatggtattaaaaatgctattaatccttctattaagaaag
ttaaatttataaatatagtttttggtaatccatttaataaatttgctgcagaatttaaaa
ttgtatctattataaatccattttctgctattattacgattccacgtgcaaatgctatac
acaatcctgctgtaattaaatctcctgctccacttataaatgaattaactatctcatctt
gtttaagccctgatgctattcctgatattatacctatagctgtaaatatcattgcaattt
cagttatgtaccattctagtcttaaaactccatatatcataatcgccatacctattgtga
aaatggctattaccatggcttctctttttgtaaattcctttatatttgtatcactattaa
ccattaattcttgatttagtgatatatcgtgtactaaagattttttagggtcttttttaa
ctttattggcatacatcataacaaatcctatagatatagccatatatattataaacataa
caactctaaactctattccagaacctggtactatttgtgataatgcttgtgctattccta
cagagaaaggattcgtagtagctgctccaaatccagctgttgctcctataaatactgtgg
ccactgctgtcaatgaatcatatcccatactggtcataagtggaataaatatcatataaa
aaggtagtgtctcttcactcattccaaacgtcgtcccacctagtccaaatagaatcattg
aaatcggtattattaaaaattgaaacttcttcattttatttacagtatgagctataacag
cttctatagctcctgttttattaactatcccaaaagctcctccaactattaaaacaaatc
caactacttcagctgcatctataaatccgtttataggtgctgtaaatacatcagtaattc
cttgtggatttgatggtgctttttcataagttccagctacaacaactgaccttccgtcta
tatctactctttcaaaatttccacttggcactatccaagtaagaattgccattaacacta
ttagcaaaaatattattgtaagtgtctgtggcatagtaaactttttcttttttaaactgc
tcatttttaatctccccactttttaaattaaatattttattattgcatctctttatccta
ttttgtatagatgtaaaaaagctcaacatggatacatgttgagctaaatgtgctaaatac
aacatacctgcatcttccctttatcttgtttaagatagctctccatcaaaattcgggata
attttgatgacagtactgtacctattaaatacagtcccagcactagcttcggacactagc
acttcggcacttactccttttatattgcctcattggtttccaacctcttcaatattaatc
ttagtaaatgcaacctctacctcaatctgtttgttagatgaggtaattcttattaatttt
tattaattcaaagtaattgtagcataatatgtcgagattgtaaatattttcagtataata
attcttactttatgatttcattccatttttcacaaataattttttctccatataatttaa
atactgtagtatattttaaatacacacaaactttccacaaattttaaattattataatac
ctttataataaaaaataaaagctatgtaaacttatcaatttacatagctttatatacatt
aatctactccaagtacagctttaagctttgatgctattgtaataactcgtggaccaaata
taacttgaactgagtttttctttttaacaactccacttgcacccaattcatttacccaga
agccatcttcatagaatccatcaattgaatttagctctaccctaagtctagttgcacagt
ttgtaacattttttatattattacttcctcctaaaccttctattatagaatgtacaagct
ttgtatctttatcatctacttcctcttctactgcattgttgtatgctgttttaccagcat
ctacagattgtctttctctatattctttcttactataaagcttaacttcttctgaacttc
ttcctggtgtttttatatcaaacttcttgattgcccatgtaaatattatataagtaacta
taaaaaatattggtatcaaaaataataatggtaacgcatccactttttgtggttgtaata
aattaggaaacatatttctaaatgattctcccattatagaaacattgaacatttctgtaa
atacatacgtcaatcctgccagtggtacatatgctacaaaatacaataatggtgcaacaa
ataggaatgtatactctattggttccgttacccctaccaacatggctgttactattgctg
gtatcaatatacttattgcttttttcttattagcattatcagccaacttatacatagcta
aagctgctgctggtaatattgcaaaatgtattaataaacgacctgttgtgaagttacgag
ttatataagatagtgtatctgggtctcccatttgagctaatcttatattattaacaccct
cgtaaattgctccacctacttccattgttccacctactcttgtatattctatagggaatg
caattaagtgatgtataccaaatggtaataatgctttatccattgctccaaaagtaaatg
ttcctaataatccactagaacctatccaattaccaagtttagataatgccaaccctactg
gtggccatataaggtacattgctgtacccaatactattgatgctataaacatcataatca
ttgaaaatcttggacctgagaaaaaagataatgcactaggaagttctatgtcaacaaatt
tgttatgtactgcactagctacaaatccagctattatagctccaaatatactacaatcat
atgaaaagattcctaagaaagaaccatataaagaacttcgactatatgcttctgcctctc
ctaatccagatgccataaacgcttctgctgtaactgtatctgaatttataccatttgctg
ctaacaatgtacttataactgtgtgcattcctataaataaaacaattcctcctaatgcac
cccatcctttttcctttttagataatccaaaggctatacctgtaacaaagaatattggta
aatatctcattaccataaatcctaaatcgtttattactttaaagaatacatttataaatg
acccttcttttattagtccgctaagccctaatgcagaaacgttttccatatttgcaaaag
ctgaccctaatcctataaatactcctgctacaacaagtaatataacaggtatcatcattg
ctccagaaagtacttgtaatttatccttcatagtattatttcctccatttttattgaaat
gccaggctatataatgcatatatatatacttctattgctttgtataatgtatctatactt
atattttcatttgcctgatgtgaatttggattatccccctctattgtgggtccaaatgca
actccattttttaacactcttgcataagatgcagctccttttgtaaaaagttcggcttct
tttccaaaaccttgtttatatgcacttgataatttatttattaattcactatctggtttt
acatacagtaattttaaatccttatatatatcaactattaaattttctttttttccaatt
tcattaattctattagttataaactcccaacttatacccttaggatatctaaagtctatt
ttcatattcaattcatttttctctaagaagatactcattatacatattgtagaaactccc
atatctacatcttctttatatatccctaatttttttccatgattatcatctgtaaagtat
gaatttaaaatatcccttattataacgcctttatcatttaattttttaattttctctaaa
tcttttgctaaactaaatgcacagttatatgacctgtgtggatttctcgataaagccctt
tctcctgtatatcttactaatactttaccttcttctagttcttctatctctgtataataa
gctaatgattctactaaatctttcttatcattagttttaaaaacagcctcaattttgtca
catacaaatccatcttctttgtttgactttatatcaactaaattgtgatttctaaattta
tctttatctattttctttcttagattgaagtataaaatacctttttctccatttactatt
gggaagtttccatctggagaaaatgcaaattttggctgttcattgacactaaagtaatgc
tccatacattcccaagtcgtctcttcagctccacccactatcaacctaatctttctcttc
ggcttttcattaagttctcttaagaaaagtaatgcatataaaatccctatcaaaggtcct
ttgttgtcattaactcctctaccataaagatagttatctttttgacatactttaaaaggt
ttactcttccaaagttctttattatatattggcaccacatctatatgattaagcacccct
actacttcttctccttctccatattctatatgaattgcatatccatcaaagtcttttaca
acaaaatctttgtcttttgctatttgaataagcttatcgaaggcatttcttatttctatc
ccaaatggttgatttatatctgttgtactttcatctctaattgaaggtatttcaactaaa
cttctaatatcatttatgatattttcttgattggattttaaataatcaataattagttct
ttgtttactatcatcttaattatttatcacccctttatattaattttacaaagcatttca
gttcatatctacattataaattttgaatattattttttcaatatttcaaatacttctcta
agttaccataatgatacggtaaacaatcaacagattatgacaaaatcatactatatctat
tactaatattttaacttatctattacgtcttttttaatgtaagtttattccaaaaataca
taaaaaaagatgtagccttagctacaccttcttatatctattcaacttccattattatgc
tattaatatctacatttccaggttctatcctatcttttactgttctcttaacagaatcag
catcatccattataactacaggagttattatatttaaatcatttgatgttataaaatcta
aatctacttccattattaaatctttagcttttaccttatctcctgcctttaccttaacat
caaacggctttccttctagtgacattgtctctaaacctacatgtattaatatatttgtat
tatcattactcttaatcattattgcatgctttgtatcaaatacattgactatttcaccat
caacaggagaatataacttaccttcacttggtattattgctactccatctcccatcatct
tttgggcaaaaactgcatctggaacatcttctaagttcactaaatttcccttaaaagggc
tatatattttctcaatcttattttcttttttcttaaatatattaaacataacacactctc
cacattataaaattttatgataatatttttcttaaagcttttgctacaccatcatttaca
ttagtatcagttacaaaatctgccatagattttacttcatctgtagcatttcccatagca
ataccaagacctgcaaatttaatcatggatatatcattttcattatcacctatacaaata
acttcttcgctatctatacctaatatatcacaaaattttttaactgcaataccttttgaa
gtacctttgctcataacttcaaaatttatctttccagaacttactacttctaaatcttct
tgttttttaaattcttcctttgcttctctcaaagaatctacgttttctgagaaaagtata
cattttaaaatttcattatcagctttttctaataaagtttcacaacttgcattttctatt
atttcaattctgtcttcttctttatttttactatttattaatctatatggatgttcttca
cctatttcattgttggatataactattttacagcctttaaaatgtttgtttaaattatac
ttttcacctattgtatagattttctttagagcttctttgctcaaaaccttcttatactca
tatcccagtaatttaaaatatgtcccattagttgatataatatatatatcatcccctaaa
acacttgtaaaatatttcatagcattataaggtcttcccgtaactaaggctaccttgata
cccttttccatgacttcttttagtgctttaatattttcttctgatacttcaaatccttta
cccatcaaagtaccatccatatcagtacaaattaatttatatcgcatttgtatcacatcc
tagtaagatttttctaatatttcaacaaggtcttctttctttccaaaaggtaaaaatcct
aaaactggacagcttgttatttgttctaattgttcctttgttacattaaactcagacatt
tttgtcttaagtcccactctctttaaaaaactttctatttcatttcctaaagttttagct
gcttcatcatcttccactttttctaattcttggtttagcattctcgctactttggcaaat
ttctctatattatccttatagaacttttctgcaaattttgggaacactatagccaaagcc
tcaccatgaggaatatgtgtaactcctcctattatttcacttagtggatgtggtgctgct
gctccagcatttgccagtgaatttcctcctaatgtatctgctactgctaactttgttctg
tattctatattatttttatcttccattactttaggtagatagttaatgactaattccata
gatttttcagacattatctctgtaaaatcattagcatttggatttatataactttcaaat
gcatgagtaaaagcatcaaatgctgttgatgcagtaattctctctggcagagttaacata
agctctgggtcaactatacattcttttgagaaacaattttgatgaaatattgtatttttc
tcgcttcctctcgatattactgctgcttgtgtaacttggcttcctgttccagaagtagtt
gatacagctattaatggtaattctttttcacttaccttatcgtatattttaaatggattt
gtatatgtactaaacatataatcccaatctatcttttctaaaccaaaagtcaatgctaat
acttttgcagtatctatacttgaacctcctccaacagctaaaacaacatctacagattct
tttttagctaattcaaacccttcatttattaattctacagttgggtttggctctactctc
tgaacctccca