Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00003_1A_021026.fasta |
contig | u00000crpx_c_021026 |
start | 3344377 |
length | 11306 |
strand | + |
type | core |
seq | aaaaaaacaaggttttcatttgtgattttcttaaattccaaaattacgacctccttaaat catttaatgttatgaatatagcataaaataaatcatgaaaatgtttttttgaaattatac acacaatttcttcttaaaaaataaggatttgtgtatttatacacaaatctctatcttaac cagtattgttctattattgctctcataatcatcataattggaaccttatctgatatattg tacccatttacttgtttaattgttgaatagcaatataaacttatatctgcaatttgttgc aattgattttcacatatatgtgttagagctactaccttacaacccttattaactgctgtc tttgctgcttctataacttctttcgtttctccacttaaactaagcgcgaaaaacatatct tgttcacctaattttcctatatcatgaagtacttcatgtctttggctatagtaagttata ttatcatgcccacctctaatttcttttactaatatctcacataaaggaatgttttgacct attccataaactataatactcctagatttttgaattatatctgctactttatttattttt tcataatctattagctctaatgtcttttttatatctgattcaaaaccattttttggctct ttatcctcattttttaactcttcttttaaattgttttttagttgagagaaaccatcatac tccatttttttacatagcctaactatggtatttgggacagtaaaaaatttatctgctaaa gattgtattgataattttactatttcttctttgttttttctcatatactcaattatcatg tcttctgtatctgtaaatttatactcatatttttttgctctttcataaaattccatagtt tctcctccatctattttattattcataagtaaaattcaaaaatattagctaaaattttcg ttaatataattataatttaatatttttaatttattaatgcatactactctttttattata cataaaaaatgtgtacttcctatattgatagagatgattcaggtttttattttgatacat ctctatcaatatttttttagaaaatacacatttttttcaaatacttatttttaattaaaa ctttaggtaatctattctttatatataattattagacttgaaaatatctttaaaatcaac caattcaatattatttctttttaaccacattttaacttccttatcacatagcattgcatg ttcatatactctctcttgaataagagaagatgattttataagactataatctataaatcc tggatgagtaaccatcaatgttatatctttatctaaatttatatatttttcttcaaataa tttaacaaaagatttatttaacttgtaaaaatcattctgaggatatttacttggcatgct aatacatgaatctaaataatagggacaacttggtataccgtattcttttgcagcatcaca cattgctgatattgatacatcttcttctataccatgtatatcaatatactcaggcaattt actcatatacaacttgtaagtttcaatttgagcacaaacttcttcatatacttcttcata attaaaaacctctttacctgtcagtagttgcgttcttcttattttgctagaaacaaattt tccaccttcatctaacaaattctttatcttaatatgttctttacaacaaggttctcctat tactaaattaacatgtaaaccaaaacatacatcatcattttttaccatttctatagcttg tcttgaaaaaggcatattcaccatgattccagcacttgtaacaataccgttcttataaga agatattatccctagtgtaacaccttctgaatatcctatatcatctgccctaactactaa tttcttcattttatgcatctgcctgctttctcaactcatcaagttgcatttccatctcat cctttactttaacaacatccgttcctatgatgatttgaactgatgtattactcaatttaa ttacccctttggctcctgtttttttaatattatcatcattcaaaatagtggcatccttca cttctaaacgtaacctcgtcatacaattattaagagtcactatattttcataaccaccac aatttttaattatctgcttagccatatatgaaaaattaccatgagaaagttttaaattct tttctttttcactaactttatcacctatctctatctcaacttcatgtcctggtgtttgta cattatcttttattattatatatttaaatgttacataatataatacaaagaatacaactc ctacaggtataactaaccacgctttatctccataactaaaacttaagacatagtcaatta tacttgctccattaaatgaacccaagcgagcacccagtaaatatagtacaactccaccta gaccagaataaaaagaatgaattatatataactttggagatgcaaataaaaacgaaaatt ctattggttcagttactgttgccataaaagaagtcaatgctccagcggtcattgcacctt ttacttcttgcttctttttatcttgtgctgttttatatatagcataagaaatagcaggta ttgaaaacatcataattatgtaaaatcctgtccagaagaatcctgcatttgggtctcctg ccataaatctaggaatttctcctcttataacttctcctgttgatgttgtatattcaccca tttcaaataatatgtaagcatttaaaacttgatgtaacccagttggtattagtgcacggt tacagaataaaaacaagaatattcctattgcaccagctcctcccaaccaaaaaccaaatt gattcattgcagcttgtggatatatccataataaactaaatatatatgataaaattaaag caaccactggtgatagtgtaattacacatttttctcctgcaaagaagcttaaaaatgctg gaactttaactttatatgttttattgtaagtccatgctatacaagctccaacaattatcc caccaaatacacctgcatttaatgtatcattcaataactctaaatttgacttaaatatca tatatgcaactacggctgcaaccattacacttgtcttgtctttagactttgaataagcac taactgctcctaataaaaataagtagtccacatttgaaaatactatattagatatattag atatagctggcacattaagcatatttggaccaaataataatcctaatatacctgctgctg gcattacagctattggcaccagcatagtctttcctaaaagtgacagttgttgcatcattt tgtttaagaacctcttcatatccaatcccctttctatttcggtttaattttttgtgaaaa cgatttattcacattttatattttaaatattatatttgtttaaacaaattgtcaatattt tttattcattttatttttatcatttagtttcatatctaaatccttttaagtatattgcta tatctagcctattttttaaatttattttttttatttttaaaatatgtttaaccatgtatt tgaaacaacccacaaaatagttcaaatttatcctttttatggtttatataattctatttt cactatacatgtctaaacacatttgatataatttgttcatatcagttcaataatattact aaagacctttaaggagggataggggtatatggctaaaaataaattttcagagatatatga agtattgaaagaggaaatacttgatggtaaatatacaagtaatatgatgctgcctactga acttcaacttattgaaaggttttcatgtagcagaaacactgtacgtagagcaatttctca attaaacacagaaggatatgttcaaagtataaaaggcaagggtgttgtagtgttagaaaa tagttgttctaatgatttttttctaaatatgcacaatttcaaaggtgtagaatcgattgt agaagataaaaaggttaatactgctactagtgttctccacttcagcaaaatcttaattga taataagttatctaaaaagacaggttttaaagttggtagtgaagtatattaccttcacag actaagatatattgataacatacctaaaattctcgacattaactattttctatgtagtat agttaaagaccttgatgtttctatagcacaaggctctatttataaatatatagaagagtg tataggtacaaaaattgtttcatccagaaagatatttaaaattgaaaaagctacagagct tgagttaaaaacgctacctctaaatgattataattgtgttggtgttattaaaaatagtgt atatactgatgatggaaagctctttgaatatacagaatcaaagcatacacctgaaacatt tgtattcatggatgttactcaaagatattaaaaaaattatgtttaattaaacataatttt tttacgtttagacactttatcccatactaacctcactattctatatacaattatatgttt atacaaataattatttattgtatattttagctttaatattagtttaatacttgacaattt gtttaaacatattataattaacttataaattacaggaggtatcaattatgaaaaattggt ggaaaaaagcaactgtctatcaaatatatccaaaaagtttcaaagatagcaacaatgatg gtataggtgatataaatggtattatagaaaaattagattatctgtattctttaggtgttg atttattatggttgactcctatgtacgtttctcctcaaagagataatggatatgatatag aagattattataatatagacccaaaatatgggacaatgagtgactttgaaaaactcttaa aagaagctcataaaagagacataaaaataatgatggatatggtcctaaaccatacatcta ctgaacataaatggtttaaagaatctaaaaaaagcaaagacaatccatatcgtgattatt atttctggaaagatgctaaacctgatggttctgttcctaataactggatatccagattta gtggaactgcttggaaatatgatgaaactactaaccaatattatttacatttatttgaag aaactcaagctgatttaaatttggaaaatgaaaaggttcgtgaagaatgttacaaagtac tagaattttgggctgataaaggtattgatggttttcgtttagatgtagtcaacctactct ccaaaacacctggattacctgatgaccctataacagggccaaaaggagatggaagaactc attacgctgatggtcctcgtatacacgaatatttacataatatgaatcaaaaagttttca aacctaaaaatatagttactgtaggtgaaatgtcatctactacacctgaagagtgtatca actatactagagaaaatcgagaagaactatctatggtttttagcttccatcatatgaaaa cagattataaaggaggcgcaaaatggactaatgaaatgttctctctggataaattaaaaa aagcacaatctgactttcaatataaaatgtatgaaggaaagggatggaatgctctatttt actctaatcacgaccaacctagagctttatctcgatttggagatgatagattttttcgtc aagaaagtgctaagatgttagccataacactatttggtctacaaggtactacatacatat atcaaggtgaagaaataggtatgacaaatgcctactttactaaaatagatgaatatgatg atgctgaaagtaagaatgcatactatcatatgattaaatctggtattgatgaaaaggagg cattgcttatacttcaacaaaaatccagagataatgcccgtactcctatgcaatgggata atactatttataaggggttttctaatcataaaccgtggttaaaagttaataatgacaata ttagtgtagaaaatgagcttaatgattctcgttcagtattttatacttatcaaagattaa tcaaatatcgtaaacaatatgatatttttacagaaggtacttatagattgttagatgaaa atcataaaaatctatttgtttatgaaagagagtataaaaaccaaaatcttcttgttataa gtaattttactcatgataatgtagtatataaattacctgaaacttatttgaataaattaa actacacaatacttgaaaccaattacactagagatataattgaaaataaaatggaaataa aaccttacgaaagtataatgatatattataaataaagttatttatataaaaattggtata acaccagggtgttataccaattttactaaattcaaaataacatttatagaatatctatag attacaataattatttgacttctacatcattatatttctttgaatatactttagtcatat agaaatatataggaactacaattatcatcccacctaatccccaaactatcttcataggtt catcaatacctgcttttatcagtaataatatacttataataactgcaaatattggtataa ttgctcctccaggtattctaaaatttacatctttatcagcatacttctttctcaatatta gtacagctaaacatgtaggaatatattgaataaatctagatacaacacttatttgagata atgttgtgaatgaacccgaccatgctattagtaaagttcctatgacagatactataattg ctatataaggagctccatttttattagtttttcttatagacttaggcattaatccttgtt caaccaaagcagcagcagaccttggtgtaaatatggatgatgcaatatttatacctccaa cagatactatagttcctattgtaattatatacccacctataggacctagcatcttaatgg cagcatctgcaacaggagtagctgaccctgccaagccattacccaacacccctatactta ttcccagtataagcatatatattactgatactacaaacattaccattaccaatgctttag gtacatttttcttagggttctccatatcttttgctgcaacagctaaagattcaaatcctg taaaagcataaaataaagttatagatactgctacaaaagctgatgacgcactttgaccct tttgtattattacaaatggggtaaaattagaaccctttataaagaataatcctacagcta taaataaaactattggtaataattttcctatagtcatgatattatttaagtgcttagatt gtttcattcccataaaatttataatcccaagtcctacaactaatataccaattattatat ttttaataagtggttctgctgcttgtggccatacagatgatagtgttacagcaaaaaaat ttgccatagtagcccaagcaatcatactaactatccacttcataaatccaacttcaaatc caacaaaatctccaaatgcctcttttgcataaagataaggccctccatcagtatcaaacc aactacctgcttcagcaaaacataaagcaatagaaacagctaaaagcatacaaaaaacta atactaatatacttgctggacctatatctgtataagcatcaccaggtaacccgaatatac ctgaccctattattgcattgattcctaatagtacaatactccaaaaacctaacttaatgc ctttttccattgttattccccccaaagccaacttaatatatttatattttttatttagat gcttctttaactattgccataaatatttttttcatattatcataatctctagtcatcatt tctggatgccattgtatccctattacaaactcacttccttccttttctatagcttcaatt aaaccgtctttagatgtagctgaaacaatatatcctggtgctactttgttgacaactaag tgatgaaaactattaactaaaacttctttttctcctaatatttcatataattttgtcccc tcctttatctgtactgtatgtgtaggtacattagatagatgttgctgattgtgtttaata taagcaccttcaattaaagataaatcttgatacaaactacctccttcagttacatttata atttgttctcctctacatatacctaaaactggttttttcatatctaaagcatgttttaat aatttcatatcaaaactatctctctttggtgatattgccccaacttattatgaggttctt ctttccatatgagtggatttacatcttgtcccccagatagtataagcgcatctatattag atacctgctcctttataatctcatcatcatatacaatcggtacaatatatggtatagctt tacacataactactgattgtatataatcattatttacataagccctttcatagccaggaa acattcctccttcatcaattagtaaattacctgatattcctattattggatatttctttt taaccaatttcttcaccccttaacttatttgtgaacaataaaaaatgctacttctcttaa agagcaagtagcataccaagattttatttatttgaacattataattcattttagaaatac tttttttgaatacaagtaatataaataactttatttacttatattttattttaatcctgt ttagtttgacttttttaaattgttttaagtacaactaataggtaaaataggcatttagat tttcctttttatcaacctattaaatactgtttaatatattttttccccttctatttaatt cacttccctttctaccagattcacatattatcaaatccagctcttttaacatattaagta ttccccttacctcaccttctgttatactgtagcctaattcatttattgaattaacaatac catttctacctatatttttattaagattattggcattttttaaacactccattactaact ttactttctctatagatgttctatcctttaatatgcttatttctttactaaaatcttcag ttatatttaataagttatgaggtaaatcatttattaaaataacatcctcagaactcataa tgttaatatacatagcagtattttttaattctcttatattacctggccattcatatgcat taataatgtcttgaacaccttgactaattgctctcttccttttcataaaatgctttaaca taacttctatatcttcttttcgctctcttaaaggtggtatatttatgggcaatacattta tcctatagtataaatctgctctaaatctatctccttttatcatttctaataaatttttat ttgtagccgcaattactctaacatctatatctattacattttctcctccaaccctcatta cttgattctcttgtaatactctaagtaatttgctttgtaagtatataggcatgtctccta tttcatccaaaaatatagttccattgttagcctgttcaaataatccttttttacctcctt ttaaagctcctgtaaaagcaccttcttcatatccaaaaagttcactttcaagtaaatttt ctggcatagctgcacagtttatcgctataaatgactgactatgtcttggtgatgcattat gaatagactgagccataagttcttttcctgttccactttctcccgttataagaattgtat aatcagattcagctattttcatacctaatttcttagttctttccatcttcgttgaaactg tttttatatcatcaaaagtatatctagcaacttgtcccttttctctaagcttctttgata ggttttgctccaattttcttatataagttatttcttgaatacaaaaataatacccagtaa cccttccaaaactctctatattatacttatttacgtttaagtacttattattaaatttta taacttcatcatgtgccttactcaaactaaaaatctttttaatattctcattctctaatt catctatatttttccctataatattactttgaatatctagtatatcccttaaactattat tgcaaataattatgtttcccttatctgataccattgccatacctaagtttgataaattta ttatagaatttaattcatctgcttttatagtaagttctttgtatttagtatttattcctg aatataaactaattatttcatctgtatacttaattagcctctcagtaatttctttatcat ccagtttgagttttgctattatttgaataaacgttgaactatcaatatacctatggccta aatcaataacttcttctatatattttggaactaaacttgactctcctggcgttatagcta tcttaatatttctatattcttcattgggattgtatggtataaaattcaaatggtttattc ctatattgtataaattagatattgtttccaatacagtatgcttattatcgtttactacta atacatctatttcttctggcaatgaaaataacttatatatatccttttgctttatgctcc tatttatagttattatctttgagacatcttctacatatttttttatttttaatactctat catctatcattaccaatattatgtcatcttttattaattccttctctgttattttattta aataataattttttatcattactttatctttaaatatcatttctagatttttatttaaga aacattctaatttagacaacccatcagttactactgctattgttttcatttgattactcc ttttaaaatatactctactcttttataatatacatctgattttcactttaatagcacaaa aaattgtacatttagtatactaacatattcctttattagttttatgtccctaaatatcat agttgcaatatctatcatatttcttaaacttctataaagcaaaaattgtgccaaattaat aattttcttaattttattctaaagttcctcaatagtatttacagacttagcacttatagc ttataagtctttatattattaatctatttttataggttaattgtacaaatcatatatcac ttttacctattaaatgcattataaaaaagatggaataacgattcgtcactccaccttttt tgtaataaaaaattgtatatataaacactatttactactcttctaagtacaaacagtatc tacatactataacctttcaccattagattctattacttgtttataccagtcaaaactctt tttcttaatcctagacaagtctccact |