Block details
fasta C_difficile_CD00077_4A_024066.fasta
contig u00000crpx_c_024066
start 3482199
length 11694
strand -
type core
seq cttccatttccattgttatctatatccacatatataaatccatatcttttttccatttct
tgagatgaacaacttactatatctattggtgaccacatacaataagctaatatttcggtt
ccatcagctatagcttcacctatttgttctatatgttttcctaaataatctattctgtaa
ctatcatgaacttttccatcttcaaatttatcatgcattccaaatccattttcagctatc
attattggcttttggtatctatcataatattgagataaagtattgtataatccttttggg
tcaattgcccacccccaaggatttgcttttaaatatggattctttatattgtcagttgga
ttcatggtgtttttacttgctgatactgttgtagaataatagtatgataaagctagaaaa
tccatagtattttcttttaagattttatcatcaccttcctccataactatatttatgtta
ttttctttgaaaaatctcttaatatatactggatactctcccctaaaacttacatcagtg
aaaaaatattgtagcctatttctttttaaagcaaatactacattttcagggtcacaatct
tctggataagatgtacaatctgccatcatcatccctatcatcatatctgaatttatttct
tttccaagcttcttagtcaaagctgtagctatgaattgatgatgaatagcttgatatcta
gcctcttctacattatctacttggtctacacaaaatgcaactgaattaaatgattcataa
tgtattaaatttatttgatttataactatccaatatttaactttatttttatatctattt
agtattaattctgcatatctaacaaagaaatctaccacttttctattagaccatccttta
tattttaatactaaattcaaaggagtctcatagtgaagtagtgttacaataggttccata
ccattatctattacttcatttataagattatcataaaactttaatccctcttcattaggc
tctaaatcatctccatttggaaatattctagcccaatttattgaaaatctaaaacacttt
aaccctagcgctttcaaaagctttaaatcttctttgtatgtatgataaaagtctattcca
ctacgcttaggatagtacccatttttatctttcatagcaaactttattctttctatagtc
atatcagactcataaggtttagatatatctctatctttatcatacatatgtacatcagct
aaacaccaacctttgccaccttcattccatgcaccttctaattgattagctgctacagct
cctccccataaaaaacctttaggaaacttacccaatttaatcactccttattttatttat
ttaaatcatttactattatttaccttatattctatagactttactattcctactaaagac
atagttatatttaactcgctgaatatggtcataagagtatcttgagcatgtgcaaataac
agcgaatgtgctcttttctctccaccagcttccccttgtataatcttggtttgagctcta
tgtgcttctgtcataaacccttttgctttagctagttttaaatcagcatttctataatca
aacttttccaaatcattaagagcatgtttaatttctgttctagcctcacctgcacgaagt
attatttgcattgccacctctactaattcttcatctattatatgttcttcaattgtcata
tttataatttcctttcaatttctaaatttaaacctcttggctctctaattttatctcttc
tttctcataagctttaaaaaatggataccatatcataaatagcaatactatatttattgc
taaaacaataagacctctaacatcttgatttaccataaaagtagatataccaaaaggaac
ataccataaattaaacaccttacttggaattgtcacaaatcccatactcattgataagta
agtagttattgatattactactgttcctatccacataggtaacattaaaaatgggttcca
tgccactggagctccaaatattactggttcatttatattcattatagaagggacaataca
tgctcttcctattgcttttattcttccaactctggataaacacatcattataactaatgg
taatgtagcacccaaccctcctaaagttatccaacctgtttgaataacttcgtaaacata
tatattagttgctactcctcctgatgctactgctgctgcattagctgcaattgcaccaag
ttgaattgaataagttataggagatagtacccacccacttattcctaaagaatatataaa
tactactaagaagtttaagagtacaaatccaggtaatgtctgtgctatatctgatactgg
tttaaatactctaactattatttcaaacatgtcaaagttgagtccataaattaatcccca
gcctacaaacattatcactgttataggtaacatattatcaaaccacttgcttacaaaatc
cggaagtgctgaatcttctccgaaaaatgaaaaagaaccaaataaagacattattaatcc
agagaataatcctgcaactagcgatacaagcattccttctcctccaaacctgttgaagtt
aaatatagctccttcattcgtaatctctggacgaatcatcattaacattaatccagcacc
tgcaagaccagctactacactcatactttcaaatttcttattcttcattatttccatagg
caataaaaatgctataaataatcctaaaagtccaaatgtatattgatttattggacttaa
atcaggtaaaaagcttatgtaattcttcaagacagaaactatagttactaatgagcctac
aaataccattggcaaaactttcattatagttgattgaactgattgtacccatatattctt
agtcatattatttacaacaggagtaaatttttcacttaaaaaatctataaatttattcat
aaacactctccccataaatattttatttgtttgatattagttctagtgcttcttccaaag
cctttgcaccatctagtcttccatatgcagttttagatatacatgctactggaacgttat
attcattagccttttgttgaatttcttccttcatataatctaaatgtggtcctagtaata
aacaatctatttctgataaatacttatctatctctgactcacttctcgcttttatatctg
cttctataccttttttctttgcactctttctcatactagttgccataaaacctgtacttg
ctcctgaaccacacgccaaaagcactcttatatttttcataataatacctccaatatttt
tatccattaatttatttcttaatgaactttttattttattatgtttatattgtacttacc
aaataagttcatttcacataaatatatttcctaataataggaaatcagttactcttaatt
aaacatattaatatagtataatgtatcttataatacgtacattcaattatataattatca
tatcatccagattttattttaaaactatgcgagggaatctaatgaaaacatctaaaaaag
aactatttttaaatttcataaaaacacaacatgattggatagattcatctacattggcta
attatcttaatgtctcaacgcgttcaattagaaaatatgtaaacgaaattaattccaatg
gtgaatttatattatcctctaaaaaaggatataaagtaaatctcaataataattgtcaaa
ccaaggttgatagttcagaaaatatatcacctgataacaggttaaatttaattttaaaag
aacttatagttaatagtaatggaattaatatatttgatttaagtgaagaattgtttgtta
gcccagctactattgaaggagatatagtcaaagctaataaatttataggaagttataatt
taaagataaagcaatcgaaatttttattgaaactaattggaaatgagtctgcaaagcgca
aattaatgagctctataatatttaaagaaacgggaagtgattttttaagcttatttgatg
tacaaaaaatatatcaagagtataatttgactaaactaaaagaaaatataatatatatat
taaaaaaatacaatttgtttataaatgagtatgctataaacaacatacttcttcatttaa
tgataactatagacagaataaaaaagaataactacatagaatctgtcgaagtagtaaact
acatagataataataatgatataagtatttcaagagatatatcaaattttttagagtctg
aatacaatataactttaactagtgcagaattatactacttagtatttcagttaacaaaca
aaaccacagtcttaaattatcatgaaatggatactaagtcattgccaaattatatagatg
aacattttgttaaattaactaaaaaaataattaaaaatgtatatgacttatatcttatag
atttatctgatgaggaatttgttgtaaaatttactcttcatgtaaaaaatttaatcagta
gagccaaaaataatcaagttttaagaaatcaaatacctcaaaagttaaaagattcctacc
ctttgatatatgatatatctgtttatatttgcaatcagattcaaactttagaaaatgtag
atatagacgaagatgaaatatcttatatatctcttcatgtaggttcattctttgatagac
aaaaattattagaagataaagttctatgtgcattaattactccaaattactatgatttac
aattcaaaatagtaagagacctcgagaagagatttaatgaatccatagaaattattcaga
ttttttcagatactcataatcttgattttgacaataaggtagacatggttattactactt
taccaattaacaatagatgccctataccttttgtttatgtaaatccttacctaaatagaa
aggattatgataatattcaaagtaaatttactcaaattaaagatagaaaaaatatactta
ctgtacaaaatcatttagaaatgtactttagtgaatctttgtttatgaaaaatatatatt
tagatagtgctaaagattatataaaatttatgggaaatattctgtacgaaaataaatatg
tcaaacccaattatatagatgatgttcttataagagaaaaaatgtcttcaactgcattta
ataacaatgtagcaattcctcatagcatgaaaatggatgctttaaaaactggagtatgtt
taattgttaacgataaaccagttaaatggggtgaggaaaaagttcagattatagctatga
tacctataaatgaaaaagaaaaagaaaaattcaattacatatttgaaagctttattgaaa
tattatctgagtggaataatgttaaagaacttactaaggcagataactatagtagtttta
tgaatagaatagcttatcttattcaaaatatctaaatcaattaatttatttccaatatat
gtttcttaagttattaacataaaatagataagctgtcacactaaaaagtctaaattaata
tgtgacagctttttacctaatataccttgttttaatactacatattttttgactgttgta
tactagttataagattgaatatttgtgttgttgtagctgtcatattctcactagcagttg
ctttatccattgcttcttctattgtcatagctctatttactatagaaaaataagcatcta
taccctcttcattacatttaactgcatcttctgttgtggctccagccaaacctattactt
ttacctcatatttttttgccagttttgcaactcctattggagccttgcccatagcagttt
gattgtccaatctaccttcaccagttatgacaaaatctgcatcttttaactcttcctcta
atttaatttcttctaatattatttttattccagattctaattttgaatttaaaaatgcta
aaaaagcaaaacctaatcctcctgctgctcctgctccttctacattagctacatctttac
ttaagtaatttttaactactttggaaaaatttctaagcccattatctaactcctcaatta
tttctgatgttgcacctttttgagacccgtatatgtatgcagctccatttttcccaaaca
gcggattatttacatcacaggctattttaaacttacattcatctaattcctttaatctat
tttctatttttatatgtcttatttcatttaaaacttttccacctaatcctactaacttgt
tatttttatcataaaactcaaaccctaaggcttgaagcatacctatcccagcatcattag
tagcacttccacctatcccaactataaaatttctatagcctttatttattgcttccttta
ttatttccccaacaccataagttgtagtgtataaaggatttctaagttcagtcggaacca
atgttaatcctgatgcttgagctatttctattattgctgtacttgtattttttaataatc
catatgttgcatccacttttttagctattggtccagtaacttctatagtctcttttttac
cattcatcccttgaactaaagcatctactgtcccttcaccaccatcagcaagtggcaata
tctttacttgcgcatcttctttaaccttcaatatccccttttttattgcatttcctgcct
ctattgaagataagcttcctttcaaagaatctatagaaattaatattttcatacttatct
actcctttttattactccttattttaaacatataattttataagcttaatttatctttta
ttttatactctacatctctctttgtatacaacttataccattaatattcttttatcttat
aaaaagggagtgtctcaaaataaatttcttagttcatgagacactcttttgtataaaatc
aaatatatgtttattatttcaacaatgataaggaggattatctctattttaagataattc
ctttttagcactatctaatcatttttagcactatttaaccagtatagttttaacttggtt
cattaagcactctacatttacagagttattatctattgatatagattctaattctttttc
atttaggttaatccatttagctgttttaatatttttgttaaatactatgttagctgattt
tgtttcttctttagaattataaaatctaactactaatgcctcttctttttcagccttttt
tacaacacttaacacaaggtccttattagtttccttaagtaaactatatgaataatctac
ttctatttctgattgattcaatttcatagcattatatggcattttattataagtttgtat
ttttgttaaatactctttagccatatttgcaacatttgcttctagtgtagatttttcatg
agtaactattgctaagtctatttttatatctcctatcatttgagaatctggagtaggcaa
ctttattcctgatggacgacctgggcgtcttgccatttcttctttacctaggaatcctac
acttctaaataatgttatagctattgtgtcaaatttttcccctactatttcaaactctct
tgtactgtttgtaagaacagctactccatgctctttgtcagacaatccaacgaatgttag
cattggatatatagaatctggtctttcactccattcttcctgttgccaaacttccatagc
atcatcatacacacttctctttatatgtccaaactgattatcagacacagaaaactttga
agctatatttgttggtatataagttctaaccctacaatctcttgcttggttatttatgtt
gaatactacatctattatagctttatcatttggaacatttataactatatcaaagtcaat
aaatgaatctgctctattattttttctagcttgtatatcttttggtacttttaatctata
atttatctttatctcattattaaatctatttttctttatagtggaatttgctactatatt
atcgttaaatattaatttctcatttggaagtggtgaaaaatcatactcatctccttcatc
tcctccattttccatcaataatacattttcaaaagttttatttaattttttatcaaatat
ctttaatgtcccgttttcattaacttgaatagtataaaagtcattatctaccatgtcaca
tacttcataagctttttctaacatatgttcaacttcttttatcatatacgccttataccc
cattgcaggtattttatctttaaagtttattgtatataccataaatgaatcatagtttcc
ataatgaacaatttgacggtctattaatcctgcatctattacttctttatgtaccacttc
aaaatccaacttattattatctttatcaaatatttcaaatgctttcattttagttataac
ttgggtgctcactatttcattcctatcgtaaggcattaagttaaatgctactaacttatc
taaagccatttcacaactcattgcatcaactattcttcttttgtaaaatgttattaattg
gtctactttttcctcagctaagaaaaatctattcattatttcctggtgaactttatctga
acaacaacatccaatgctgtcatgagcatgatttttcattatttctttccaaattaactc
tattaatccatgatgatattcaaatcctagagaatatgcaatagaagctagtggctccaa
tatgttagttatctttgattctattctagcatttgctgattttatatccattcttgttga
gaatatacttctatgaaccctcatatatttcccatctaaaaattccccttttattgtatc
tatatcctcatttttttctagctctttaaatatgttttcatatctacttaagaaaaattt
tctctctggataacattcttttaatttatatataacttcaaatatattcttttgaattgg
catttggtcatgtccatttggaagtattatatggtcagtagttgcacccttatcaagaac
cggtaaatatttatccattcttgttcttagctcatcttcattcattggtagatattttcc
tattgcataacctaatggaagtatttgaaccaaaacagaagacccatcatcactcttcca
attaaactctgttttattagttccttttctttcagaacatcctctccaaaacattgagta
ttttatatcaaacccatttagtatttgtggcatttgagcactttgaccaaatgaatctgg
taaatatcctattttcatatattctccaaattcatcacaatcttttattccatatagtaa
atttctaagtatggattctccaccaactaccatttcatcagtttgagtataccaaggacc
tattattagccttccttcttgaactaatttttttattctctccttacattcaggcttaac
tgctaaataatcttctaatatagcagtttgaccatccatcacataatatggatagttatg
attattttctaacatatccattatttcttccatattatttacaagtaatattctagattc
ctcagttgagaagtaccattctctatcccaatgcatatgaggaactatgtgtacattttt
tttcattgcttatcctccaaaacttatctgataatattttctgtctaattaaaaatccaa
taaaaatactactgagtttacaaaattttttaatatttattttatcactataattaaacc
tttgatttaaatatctaataacgtatcttttaatgtatctttctttgatttttttgtttc
ctagttattattaataatattgctgatattatagctccaagtactgccgcaaagaaccat
attgatgctataataaatcctgacatacttccctctaaaagcgccaatgagaatatcccc
gctccaggcacttgaagacctatattgaagaatgctactatagacccagttatggctgaa
ccagctaccaatgatggtataacacggattgggtcctctatcataaatggtattgcacct
tcagttattccagccaatcctaatatccaagtttgctttcctatttccttttctgattct
gaaaataaatctctgcctaaaacagtagctattgtaactccaaaagctgaaaccatctta
actgatgcaaatattgcataaggtataaaatttccacttgctattgctcctattgcaaat
gtataggctgctttatttattggtccacctaagtcaaatgaaaccatagctcctattatt
gcacctagtagtattgcatttactccagtcatcccatttaaccaatttataagaccattg
ttaagtgctgctacaggctttcctactacaaataacatcaataaacctactaccaaagaa
ccaactactggatatacccaaaaacttacgaatccagctaatgtgcctttggctggtata
ttcttctttaaaaattttactatatagccagtaagtaaacctcctaacatacctccaaga
aatccactacctattaaatcagctgctagacctgctgcaaatcctggtccaagacctggt
ttttcagctagtgagtaagacatatatgctgataatactggaaccatcaatgtacctaac
atacctccagaaagctttcttaattgccataaccaagaaccttcttggttgtatagttct
tgtagaccaaatgcttgagatgctaatactgcaaatgcaagtatcatacctcctgccaca
ataagtggtattatatgagatactcctgtaagtattgctgattttacatcttttttccat
gatgatttttcacaatatgatatatcagatgatttttctatataatcacctttaccttgt
ttttgtgctacttctaaagcttcgtatattatttcttttgctctttttagtggagctgct
actgacgtttttatgtttggcaaatgttcaaatctttctgtatttttaggtgctacatct
gttgcatatattattgcatctgccctttttattatatctggtgtatgagggtccaccata
ccattagctccttgcttttctacatacacatccacaccgatttctttaccagctttaatt
aatgcttctgctgacatatatgtatgtgctatacctgcagggcatgctgttattgctaat
ataattttttttgattcattttgaatcctaatctcttcttttatttgttctttcttttct
tttatatctaagttattaaataactctttcttagtttttgaatttaacaacatattcata
taatcttcatttgacagtctagtaactaactcagaaagtatttgtatgtgtgtatttcca
ccttcattttctggtactgctattaaaaatattagctctactttattatttgggtctacg
ctttcccaattttctattggtgtctctaaggtcatagctgcaaatgaagcttctttaact
gacttagattttccatgaggaattgcaagccctctttcaaaacctgttggagataaagtt
tctctgtacattacagcttctaaatattcctcataagatgttaacttgccttcataatat
agctttcttgctaagaactttattgcgtcttcctttgtttttattttttgtttta