Block details
fasta C_difficile_CD00246_1A_020486.fasta
contig u00000crpx_c_020486
start 3492717
length 11700
strand -
type core
seq cttccatttccattgttatctatatctacatatataaatccgtatcttttttccatttct
tgagatgaacaacttactatatctattggcgaccacatacaataagctaatatttcggtt
ccatcagctatagcttcacctatttgttctatatgttttcctaaataatctattctataa
ttatcatgaacttttccatcttcaaatttatcatgcattccaaatccattttcagctatc
attattggcttttggtatctatcataatattgagataaagtattgtataatcctttagga
tcaattgcccacccccaaggatttgcttttaaatatggattctttatattatcagttgga
ttcatggtgtttttacttgctgatactgttgtagaataatagtatgataaagctagaaaa
tccatagtattttcttttaagattttatcatctccttcctctataactatatttatgtta
ttttctttgaaaaatctcttaatatagactggatactctcccctaaaacttacatcagtg
aaaaaatattgtattctatttctttttaaagcaaacaccacattttcagggtcgcaatct
tctggataagatgtacaatctgccatcattatccctatcatcatatctgaatttatttct
tttccaagcttcttagttaaagctgtagccatgaattgatgatgaatagcttgatatttg
gcctcttctacatcatctacctggtctacacaaaatgcaactgaattaaatgattcatga
tacattaaatttatttgatttataactatccaatatttaactttatctttgtatctattt
aatattaattctgcatatctaacaaagaaatccactacttttctattagaccatccttta
tattttaatactaaattcaaaggagtttcataatggagtagtgttacaataggttccata
ccattatctattacttcatttataagattatcataaaactttaatccctcttcattaggc
tctaaatcatctccatttggaaatattctagcccaatttattgaaaatctaaaacacttt
aaccctagttctttcaaaagctttaaatcttctttgtatgtatgataaaagtctattcca
ttacgcttaggataatacccattattatctttcatagcaaactttattttatctacagtc
atatcagactcgtaatgtttagatatatctctatctttatcatacatatgtacatcagct
aagcaccaccctttgccaccttcattccaagcaccttctaattgattagctgctacagct
ccaccccacaaaaaatctttaggaaacttactcaatttaatcactccttattttatttat
ttaaatcatttactattatttaccttatattctatagactttactattcctactaaagac
atagttatatttaactcgctgaatatggtcataagagtatcttgagcatgtgcaaataaa
agtgaatgtgctcttttttctccactagcttccccttgtataatattagtttgagctcta
tgtgcttctgtcataaactcttttgctttagctagttttaaatcagcatttttataatca
aacctttctaaatcattaagagcatgtttaatttctgttctagcctcacctgcacgaagt
attatttgcattgctacttctactaattcttcatctattacatgttcttcagttgtcata
tttataatttcctttcaacatctaaatttaagcttcttgactctctaattttagttcttc
tttttcataagctttaaaaaatggataccatatcatgaatagcaatactatatttattgc
taaaacaataagccctctaacatcttgatttaccataaaagtagatataccaaaaggaac
ataccataaattaaacaccttactcggaattgtcacaaatcccatactcattgataaata
agtagttattgatattactactgttcctatccacataggtaacattaaaaatgggttcca
tgctactggagctccaaacattactggttcatttatgttcattatagaaggaacgataca
ggctcttccgattgcttttattcttccagctctagataaacacatcattagcactagtgg
taatgttgctccccacccacctaaagttatccaacctgtttgaacaacttcataagtata
tatattagttgcaagccctcctgatgctacagctgctgcattagctgcaattgcactaag
ctgaattgcataagttattggggataatacccatccacttatacctaaagaatataaaaa
tactactaagaagtttaatagtacaaatccaggcaatgtttgtgctatatctgatactgg
tttaaatatcctaactattatttcaaacatatcaaagttaagtccataaattagtcccca
acctataaacattattactgctataggtaacatactatcaaaccacttacttacaaaatc
aggaagtgctgaatcttcaccaaaaaatgagaaagacccaaataaagacattattaatcc
ggagaataatcctgcaactagtgctacaagcattccttctcctccaaatctattgaagtt
aaatatagctccttcattcgtaatctctggacgaatcatcattaacattaatccagcacc
tgcaagaccagctactacactcatactttcaaatttcttattcttcattatttccatagg
taataaaaatgctataaatagtcctaaaagtccaaatgtatattgatttattggacttaa
atcaggtaagaaacttatgtaattcttcaagacagaaactatagttactaaagaacctac
aaataccataggcaaaactttcattatagttgattgaactgattgtacccatatattctt
agttatcttatttacaacaggagtaaacttttcacttaacaaatctataaatttattcat
aaacaatctccccatagatattttatttgtttaatattaattctaatgcttcttctaaag
cctttacaccatctaatcttccatatgctgttttagatatacatgctactggaacattat
attcatcagcttttttttgtatttcatctttcatataatctaaatgtggtcctaataata
aacaatctatttctggtaaatatttatctatctctgactcacttctagcttttatatctg
cttctatgccttttttctttgcactctttctcatactagttgccataaaacctgtacttg
ctcctgagccacatgccaacaacacttttatattcttcataacaatacctccagtatttt
tatccattaatttatttcttaatgaatttttatttgatttgattgtatttatattgtact
tcctaaataatttcctttcacataaatatatttcctaataataggaaatcatttactctt
aaccagacacataaatatatagtataatgtacattataatacgtacattcaattatataa
atatcatatcatacagattttattttaaaactatgagagggaatctaatgaaaacatcta
aaaaagagttatttttaaacttcataaaaacgcaacatgattggatagattcatccacat
tagctaattatcttaatgtatcaacacgttcgattcgaaaatatgtaaatgaaattaatt
ctactggtgaatttatattatcctctaaaaaaggatataaagtaaatctcaataataatt
gtcaaaccaaggttgatagttcagaaaatatatcacctgataacaggttaaatttaattt
taaaagaacttatagttaatagtaatggaattaatatatttgatttaagtgaagacttgt
ttgttagtccagctactattgaaggagatatagtcaaagctaataaatttataggaagtt
ataatttaaagataaagcaatcgaaatttttattgaaactaattggaaatgagtctgcaa
aacgcaaattaatgagctctataatatttaaagaaacgggaagtgattttttaagcttat
ttgatgtacaaaaaatatatcaagagtataatttgaccaaactgaaagaaaatataatat
atatattaaaaaaatacaatttgtttataaatgagtatgctataaataacatacttcttc
atttaatgataactatagacagaataaaaaagaataactacatagaatctgtcgaagtag
taaactacatagataataataatgatataagcatttcaagagatatatcaaattttttag
agtctgaatacaatataactttaactagtgcagaattatactacttagtatttcagttaa
caaacaaaaccacagtcttaaattatcatgaaatggatactaagtcattgccaaattata
tagatgaacattttgttaaattaactaaaaaaataattaaaaatgtatatgacttatact
ttatagatttatctgatgatgaatttgttgtaaaatttactcttcatgtaaaaaatttaa
tcagtagggctaaaaataatcaagttttgagaaatcaaatacctcagaagttaaaagatt
cctaccctctgatatatgatatatctgtttatatttgtaatcagattcaaattttagaaa
acatagaaatagatgaagatgaaatatcgtatatatctcttcatgtaggttcattttttg
atagacaaaaattactagaagataaaattctctgtgcattaattactccaaattactatg
atttacaattcaaaatagtaagagaccttgagaagagatttaatgaatccatagaaatta
ttcagattttttcagatactcataatcttgattttgacaataaggtagacatggttatta
ctactttaccaattaacgatagatgccctataccttttgtttatgtaaatccttacctaa
atagaaaggattatgataatattcaaagtaaatttattcagattaaagatagaaaaaata
tacttactgtacaaaatcatttagaaatgtattttagtgaatctttgtttatgaaaaata
tatatttagatagtgctaaagattatataagatttatgggaaatattctgtacgaaaata
aatatgtcaaacccaattatatagatgatgttcttataagagaaaaaatgtcttcaactg
catttaataacaatgtagcaattcctcatagcatgaaaatggatgctttaaaaaccggag
tatgtttaattgttaacgataaaccagttaaatggggtgaggaaaaagttcaaattatag
ctatgatacctataaatgaaaaagaaaaagaaaagttcaattacatatttgaaagcttta
ttgaaatattatctgagtggaataatgttaaagaacttactaaggcagataactatagta
gttttatgaatagaatagcttatcttattcaaaatatctaaatcaattaatttatttcca
atatatgtttcttaagttattaacataaaatagataagctgtcacactaaaaagtctaaa
ttaatatgtgacagctttttacctaatataccttgttttaatactacatattttttgact
gttgtatactagttataagattgaatatttgtgttgttgtagctgtcatattctcactag
cagttgctttatccattgcttcttctattgtcatagctctatttactatagaaaaataag
catctataccctcttcattacatttaactgcatcttctgttgtggctccagccaaaccta
ttacttttaccccatatttttttgccagttttgcaactcctattggagccttgcccatag
cagtttgattgtccaatctaccttcaccagttataacaaaatctgcatcttttaactctt
cctctaatttaatttcttctaatattatttttattccagattctaattttgaatttaaaa
atgctaaaaaagcaaaacctaatcctcctgctgctcctgctccttctacattagctacat
ctttacttaagtaatttttaactactttggaaaaatttctaagcccattatctaactcct
caattatttctgatgttgcacctttttgagacccgtatatgtatgcagctccatttttcc
caaacagcggattatttacatcacaggctattttaaacttacattcatctaattccttta
atctattttctatttttatatgtcttatttcatttaaaacttttccacctaatcctacta
acttgttattttcatcataaaactcaaaccctaaggcttgaagcatacctatcccagcat
cattagtagcacttccacctattccaactataaaatttctatagcctttatttattgctt
cctttattatttccccaacaccataagttgtagtgtataaaggatttctaagttcagtcg
gaaccaatgttaatcctgatgcttgagctatttctattattgctgtacttgtatttttta
ataatccatatgttgcatccacttttttagctattggtccagtaacttctatagtctctt
ttttaccattcatccattgaactaaagcatctactgtcccttcaccaccatcagcaagtg
gcaatatctttacttgcgcatcttctttaaccttcaatatccccttttttattgcatttc
ctgcctctattgaagataagcttcctttcaaagaatctatagaaattaatattttcatat
ttatctactcctttttattactccttattttaaacatataattttataagcttaatttat
cttttattttatactctacatctctctttgtatacaacttataccattaatattctttta
tcttataaaaagggagtgtctcaaaataaatttcttagttcatgagacactcttttgtat
aaaatcaaatatatgtttattatttcaacaatgataaggaggattatctctattttaaga
taattcctttttagcactatctaatcatttttagcactatttaaccagtatagttttaac
ttggttcattaagcactctacatttacagagttattatctattgatatagattctaattc
tttttcatttaggttaatccatttagctgttttaatatttttgttaaatactatgttagc
tgattttgtttcttctttagaattataaaatctaactactaatgcctcttctttttcagc
cttttttacaacacttaacacaaggtccttattagtttccttaagtaaactatatgaata
atctacttctatttctgattgattcaatttcatagcattatatggcattttattataagt
ttgtatttttgttaaatactctttagccatatttgcaacatttgcttctagtgtagattt
ttcatgagtaactattgctaagtctatttttatatctcctatcatttgagaatctggagt
aggcaactttattcctgatggacgacctgggcgtcttgccatttcttctttacctaggaa
tcctacacttctaaataatgttatagctattgtgtcaaattttttccctactatttcaaa
ctctcttgtactgtttgtaagaacagctactccatgctctttgtcagacaatccaacgaa
tgttagcattggatatatagaatctggtctttcactccattcttcttgttgccaaacttc
catagcatcatcatacacacttctctttatatgtccaaactgattatcagacacagaaaa
ctttgaagctatatttgttggtatataagttctaaccctacaatctcttgcttggttatt
tatgttgaatactacatctattataactttatcatttggaacatttataactatatcaaa
gtcaataaatgaatctgctctattattttttctagcttgtatatcttttggtacttttaa
tctataatttatctttatctcattattaaatctatttttctttatagtggaatttgctac
tatattatcgttaaatattaatttctcatttggaagtggtgaaaaatcatactcatctcc
ttcatctcctccattttccatcaataatacattttcaaaagttttatttaattttttatc
aaatatctttaatgtcccgttttcattaacttgaatagtataaaagtcattatctaccat
gtcacatacttcataagctttttctaacatatgttcaacttcttttatcatatacgcctt
ataccccattgcaggtattttatctttaaagtttattgtatataccataaatgaatcata
gtttccataatgaacaatttgacggtctattaatcctgcatctattacttctttatgtac
cacttcaaaatccaacttattattatctttatcaaatatttcaaatgctttcattttagt
tataacttgagcgcttactatttcattcctatcgtaaggcattaagttaaatgctactaa
cttatctaaagccatttcacaactcattgcatcaactattcttcttttgtaaaatgttat
taattggtctactttttcctcagctaagaaaaatctattcattatttcatggtgaacttt
atctgaacaacaacatccaatgctgtcatgagcatgatttttcattatttctttccaaat
taactctattaatccatgatgatattcaaatcctagagaatatgcaatagaagctagtgg
ctccaatatgttggttatctttgattctattctagcatttgctgattttatatccattct
tgttgagaatatacttctatgaaccctcatatatttcccatctaaaaattccccttttat
tgtatctatatcctcatttttttctagctctttaaatatgttttcatatctacttaagaa
aaattttctctctggataacattcttttaatttatatataacttcaaatatattcttttg
aattggcatttggtcatgtccatttggaagtattatatggtcagtagttgcacccttatc
aagaaccggtaaatatttatccattcttgttcttagctcatcttcattcattggtagata
ttttcctattgcataacctaatggaagtatttgaaccaaaacagaagacccatcatcact
cttccaattaaactctgttttattagttccttttctttcagaacatcctctccaaaacat
tgagtattttatatcaaacccatttagtatttgtggcatttgagcactttgaccaaatga
atctggtaaatatcctattttcatatattctccaaattcatcacaatcttttattccata
tagtaaatttctaagtatggattctccaccaactaccatttcatcagtttgagtatacca
gggacctattattagccttccttcttgaactaatttttttattctctccttacattcagg
cttaactgctaaataatcttctaatatagcagtttgaccatccatcacataatatggata
gttatgattattttctaacatatccattatttcttccatattatttacaagtaatattct
agattcctcagttgagaagtaccattctctatcccaatgcatatgaggaactatgtgtac
attttttttcattgcttatcctccaaaacttatctgataatattttctgtctaattaaaa
atccaataaaaatactactgagtttacaaaattttttaatatttattttatcactataat
taaacctttgatttaaatatctaataacgtatcttttaatgtatctttctttgatttttt
tgtttcctagttattattaataatattgctgatattatagctccaagtactgccgcaaag
aaccatattgatgctataataaatcctgacatacttccctctaaaagcgccaatgagaat
atccccgctccaggcacttgaagacctatattgaagaatgctactatagacccagttatg
gctgaaccagctaccaatgatggtataacacggattgggtcctctatcataaatggtatt
gcaccttcagttattccagccaatcctaatatccaagtttgctttcctatttccttttct
gattctgaaaataaatctctgcctaaaacagtagctattgtaactccaaaagctgaaacc
atcttaactgatgcaaatattgcataaggtataaaatttccacttgctattgctcctatt
gcaaatgtataggctgctttatttattggtccacctaagtcaaatgaaaccatagctcct
attattgcacctagtagtattgcatttactccagtcatcccatttaaccaatttataaga
ccattgttaagtgctgctacaggctttcctactacaaataacatcaataaacctactacc
aaagaaccaactactggatatacccaaaaacttacgaatccagctaatgtgcctttggct
ggtatattcttctttaaaaattttactatatagccagcaagtaaacctcctaacatacct
ccaagaaatccactacctattaaatcagctgctagacctgctgcaaatcctggtccaaga
cctggtttttcagctagtgagtaagacatatatgctgataatactggaaccatcaatgta
cctaacatacctccagaaagctttcttaattgccataaccaagaaccttcttgattgtat
agttcttgtagaccaaatgcttgagatgctaatactgcaaatgcaagtatcatacctcct
gccacaataagtggtattatatgagatactcctgtaagtattgctgattttacatctttt
ttccatgatgatttttcacaatatgatatatcagatgatttttctatataatcaccttta
ccttgtttttgtgctacttctaaagcttcgtatattatttcttttgctctttttagtgga
gctgctactgacgtttttatgtttggcaaatgttcaaatctttctgtatttttaggtgct
acatctgttgcatatattattgcatctgccctttttattatatctggtgtatgagggtcc
accataccattagctccttgcttttctacatacacatccacaccgatttctttaccagct
ttaattaatgcttctgctgacatatatgtatgtgctatacctgcagggcatgctgttatt
gctaatataattttttttgattcattttgaatcctaatctcttcttttatttgttctttc
ttttcttttatatctaagttattaaataactctttcttagtttttgaatttaacaacata
ttcatataatcttcatttgacagtctagtaactaactcagaaagtatttgtatgtgtgta
tttccaccttcattttctggtactgctattaaaaatattagctctactttattatttggg
tctacgctttcccaattttctattggtgtctctaaggtcatagctgcaaatgcagcttct
ttaactgacttagattttccatgaggaattgcaagccctctttcaaaacctgttggagat
aaagtttctctgtacattacagcttctaaatattcctcataagatgttaacttgccttca
tcatatagctttcttgctaagaactttattgcgtcttcctttgtttttattttttgtttt
a