Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00133_1A_020483.fasta |
contig | u00000crpx_c_020483 |
start | 3473916 |
length | 11675 |
strand | - |
type | core |
seq | cttccatttccattgttatctatatccacatatataaatccatatcttttttccatttct tgagatgaacaacttactatatctattggcgaccacatacaataagctaatatttcggtt ccatcagctatagcttcacctatttgttctatatgttttcctaaataatctattctgtaa ctatcatgaacttttccatcttcaaatttatcatgcattccaaatccattttcagctatc attattggcttttggtatctatcataatattgagataaagtattgtataatccttttggg tcaattgcccacccccaaggatttgcttttaaatatggattctttatattatcagttgga ttcatggtgtttttacttgctgatactgttgtagaataatagtatgataaagctagaaaa tccatagtattttcttttaagattttatcatctccttcctctataactatatttatgtta ttttctttgaaaaatctcttaatatagactggatactctcccctaaaacttacatcagtg aaaaaatattgtattctatttctttttaaagcaaacaccacattttcagggtcgcaatct tctggataagatgtacaatctgccatcatcatccctatcatcatatctgaatttatttct tttccaagcttcttagttaaagctgtagccatgaattgatgatgaatagcttgatatttg gcctcttctacatcatctacctggtctacacaaaatgcaactgaattaaatgattcataa tgtattaaatttatttgatttataactatccaatatttaactttatttttatatctattt agtattaattctgcatatctaacaaagaaatctaccacttttctattagaccatccttta tattttaatactaaattcaaaggagtctcatagtgaagtagtgttacaataggttccata ccattatctattacttcatttataagattatcataaaactttaatccctcttcattaggc tctaaatcatctccatttggaaatattctagcccaatttattgaaaatctaaaacacttt aaccctagctctttcaaaagctttaaatcttctttgtatgtatgataaaagtctattcca ctacgcttaggataatatccattattatctttcatagcaaactttattctttctatagtc atatcagactcataaggtttagatatatctctatctttatcatacatatgtacatcagct aaacaccaacctttgccaccttcattccatgcaccttctaattgattagctgctacagct cctccccataaaaaacctttaggaaacttacccaatttaatcactccttattttatttat ttaaatcatttactattatttaccttatattctatagactttactattcctactaaagac atagttatatttaactcgctgaatatggtcataagagtatcttgagcatgtgcaaataac agcgaatgtgctcttttctctccatcagcttccccttgtataatcttggtttgagctcta tgtgcttctgtcataaacccttttgctttagctagttttaaatcagcatttctataatca aacttttccaaatcattaagagcatgtttaatttctgttctagcctcacctgcacgaagt attatttgcattgccacctctactaattcttcatctattatatgttcttcaattgtcata tttataatttcctttcaatttctaaatttaaacctcttggctctctaattttatctcttc tttctcataagctttaaaaaatggataccatatcataaatagcaatactatatttattgc taaaacaataagacctctaacatcttgatttaccataaaagtagatataccaaaaggaac ataccataaattaaacaccttacttggaattgtaacaaatcccatactcattgataaata agtagttattgatattactattgtacctatccacataggtaacattaaaaatgggttcca tgccactggagctccaaatattactggttcatttatattcattatagaagggacaataca tgctcttcctattgcttttattcttccaactctggataaacacatcattataactaatgg taatgtagcacccaaccctcctaaagttatccaacctgtttgaataacttcgtaaacata tatattagttgctactcctcctgatgctactgctgctgcattagctgcaattgcaccaag ttgaattgaataagttataggggatagtacccacccacttattcctaaagaatatataaa tactactaaaaagtttaagagtacaaatccaggtaatgtctgtgctatatctgatactgg tttaaatactctaactattatttcaaacatgtcaaagttgagtccataaattaatcccca gcctacaaacattatcactgttataggtaacatattatcaaaccacttgcttacaaaatc cggaagtgctgaatcttctccgaaaaatgaaaaagaaccaaataaggacattattaatcc agagaataatcctgcaactagcgatacaagcattccttctcctccaaacctgttgaagtt aaatatagctccttcattcgtaatctctggacgaatcatcattaacattaatccagcacc tgcaagaccagcgactacactcatactttcaaatttcttattcttcattatttccatagg caataaaaatgctataaataatcctaaaagtccaaatgtatattgatttattggacttaa atcaggtaaaaagcttatgtaattcttcaagacagaaactatagttactaatgagcctac aaataccattggcaaaactttcattatagttgattgaactgattgtacccatatattctt agtcatattatttacaacaggagtaaatttttcacttaaaaaatctataaatttattcat aaacactctccccataaatattttatttgtttgatattagttctagtgcttcttccaaag cctttgcaccatctagtcttccatatgcagttttagatatacatgctactggaacgttat attcattagccttttgttgaatttcttccttcatataatctaaatgtggtcctagtaata aacaatctatttctgataaatacttatctatctctgactcacttctcgcttttatatctg cttctataccttttttctttgcactctttctcatactagttgccataaaacctgtacttg ctcctgaaccacacgccaaaagcactcttatatttttcataataatacctccaatatttt tatccattaatttatttcttaatgaactttttattttattatgtttatattgtacttacc aaataagttcatttcacataaatatatttcctaataataggaaatcagttactcttaatt aaacatattaatatagtataatgtatcttataatacgtacattcaattatataattatca tatcatccagattttattttaaaactatgcgagggaatctaatgaaaacatctaaaaaag aactatttttaaatttcataaaaacacaacatgattggatagattcatctacattggcta attatcttaatgtctcaacgcgttcaattagaaaatatgtaaacgaaattaattccaatg gtgaatttatattatcctctaaaaaaggatataaagtaaatctcaataataattgtcaaa ccaaggttgatagttcagaaaatatatcacctgataacaggttaaatttaattttaaaag aacttatagttaatagtaatggaattaatatatttgatttaagtgaagaattgtttgtta gcccagctactattgaaggggatatagtcaaagctaataaatttataggaagttataatt taaagataaagcaatcgaaatttttattgaaactaattggaaatgagtctgcaaagcgca aattaatgagctctataatatttaaagaaacgggaagtgattttttaagcttatttgatg tacaaaaaatatatcaagagtataatttgaccaaactgaaagaaaatataatatatatat taaaaaaatacaatttgtttataaatgagtatgctataaataacatacttcttcatttaa tgataactatagacagaataaaaaagaataactacatagaatctgtcgaagtagtaaact acatagataataataatgatataagcatttcaagagatatatcaaattttttagagtctg aatacaatataactttaactagtgcagaattatactacttagtatttcagttaacaaaca aaaccacagtcttaaattatcatgaaatggatactaagtcattgccaaattatatagatg atcactttgttaaattaactaaaaaaataattaaaaatgtatatgacttatatcttatag atttatctgatgaggaatttgttgtaaaatttactcttcatgtaaaaaatttaatcagta gagccaaaaataatcaagttttaagaaatcaaatacctcaaaagttaaaagattcctacc ctttgatatatgatatatctgtttatatttgcaatcagattcaaactttagaaaatgtag atatagacgaagatgaaatatcttatatatctcttcatgtaggttcattctttgatagac aaaaattattagaagataaagttctatgtgcattaattactccaaattactatgatttac aattcaaaatagtaagagacctcgagaagagatttaatgaatccatagaaattattcaga ttttttcagatactcataatcttgattttgacaataaggtagacatggttattactactt taccaattaacgatagatgccctataccttttgtttatgtaaatccttacctaaatagaa aggattatgataatatccaaagtaaatttattcagattaaagataaaaaaaatatactta ctgtacaaaatcatttagaaatgtactttagtgaatctttgtttatgaaaaatatatatt tagatagtgctaaagattatataaaatttatgggaaatattctgtacgaaaataaatatg tcaaacccaattatatagatgatgttcttataagagaaaaaatgtcttcaactgcattta ataacaatgtagcaattcctcatagcatgaaaatggatgctttaaaaactggagtatgtt taattgttaacgataaaccagttaaatggggtgaggaaaaagttcagattatagctatga tacctataaatgaaaaagaaaaagaaaaattcaattacatatttgaaagctttattgaaa tattatctgagtggaataatgttaaagaacttactaaggcagataactatagtagtttta tgaatagaatagcttatcttattcaaaatatctaaatccgttaatttatttccaatatat gtttcttaagttattaacataaaatagataagctgtcacactaaaaagtctaaattaata tgtgacagctttttacctaatataccttgttttaatactacatattttttgactgttgta tactagttataagattgaatatttgtgttgttgtagatgtcatattctcactagcagttg ctttatccattgcttcttctattgtcatagctctatttactatagaaaaataagcatcta taccctcttcattacatttaactgcatcttctgttgtggctccagccaaacctattactt ttaccccatatttttttgccagttttgcaactcctattggagccttgcccatagcagttt gattgtccaatctaccttcaccagttatgacaaaatctgcatcttttaactcttcctcta atttaatttcttctaatattatttttattccagattctaattttgaatttaaaaatgcta aaaaagcaaaacctaatcctcctgctgctcctgctccttctacattagctacatctttac ttaagtaacttttaactactttggaaaaatttctaagcccattatctaactcctcaatta tttctgatgttgcacctttttgagacccgtatatgtatgcagctccatttttcccaaaca gcggattatttacatcacaggctattttaaacttacattcatctaattcctttaatctat tttctatttttatatgtcttatttcatttaaaacttttccacctaatcctactaacttgt tattttcatcataaaactcaaaccctaaggcttgaagcatacctatcccagcatcattag tagcacttccacctatcccaactataaaatttctatagcctttatttattgcttctttta ttatttccccaacaccataagttgtagtgtataaaggatttctaagttcagtcggaacca atgttagtcctgatgcttgagctatttctattattgctgtacttgtattttttaataatc catatgttgcatccacttttttagctattggtccagtaacttctatagtctcttttttac cattcatcccttgaactaaagcatctactgtcccttcaccaccatcagcaagtggcaata tctttacttgcgcatcttctttaaccttcaatatccccttttttattgcatttcctgcct ctattgaagataagcttcctttcaaagaatctatagaaattaatattttcatacttatct actcctttttattactccttattttaaacatataattttataagcttaatttatctttta ttttatactctacatctctctttgtatacaacttataccattaatattcttttatcttat aaaaagggagtgtctcaaaataaatttcttagttcatgagacactctttttgtataaaat caaatatatgtttattatttcaacaatgataaggaggattatctctattttaagacaatt cctttttagcactatttaaccaatatagttttaacttggttcattaagcactctacattt acaaagttattatctattgatatagattctaattctttttcatttaggttaatccattta gctgttttaatatttttgttaaatactatgttagctgattttgtttcttctttagaattg taaaatctaactactaatgcctcttgtttttcagccttttttacaacacttaacacaagg tccttattagtttccttaagtaaactatatgaataatctacttctatttctgattgattc aatttcatagcattatatggcattttattataagtttgtatttttgttaaatactcttta gccatatttgcaacatttgcttctagtgtagatttttcatgagtaactattgctaagtct atttttatatctcctatcatttgagaatctggagtaggcaactttattcctgatggacga cctgggcgtcttgccatttcttctttacctaggaatcctacacttctaaataatgttata gctattgtgtcaaatttttcccctactatttcaaactctcttgtactgtttgtaagaaca gctactccatgctctttgtcagacaatccaacgaatgttagcattggatatatagaatct ggtctttcactccattcttcctgttgccaaacttccatagcatcatcatacacacttctc tttatatgtccaaactgattatcagacacagaaaactttgaagctatatttgttggtata taagttctaaccctacaatctcttgcttggttatttatgttgaatactacatctattata gctttatcatttggaacatttataactatatcaaagtcaataaatgaatctgctctatta ttttttctagcttgtatatcttttggtacttttaatctataatttatctttatctcatta ttaaatctatttttctttatagtggaatttgctactatattatcgttaaatattaatttc tcatttggaagtggtgaaaaatcatactcatctccttcatctcctccattttccatcaat aatacattttcaaaagttttatttaattttttatcaaatatctttaatgtcccgttttca ttaacttgaatagtataaaagtcattatctaccatgtcacatacttcataagctttttct aacatatgtccaatttcttttatcatatacgccttataccccattgcaggtattttatct ttaaagtttattgtatataccataaatgaatcatagtttccataatgaacaatttgacgg tctattaatcctgcatctattacttctttatgtaccacttcaaaatccaacttattatta tctttatcaaatatttcaaatgctttcattttagttataacttgggcgttcactatttca ttcctatcgtaaggcattaagttaaatgctactaacttatctaaagccatttcacaactc attgcatcaactattcttcttttgtaaaatgttattaattggtctactttttcctcagct aagaaaaatctattcattatttcatggtgaactttatctgaacaacaacatccaatgctg tcatgagcatgatttttcattatttctttccaaattaactctattaatccatgatgatat tcaaatcctagagaatatgcaatagaagctagtggctccaatatgttggttatctttgat tctattctagcatttgctgattttatatccattcttgttgagaatatacttctatgaacc ctcatatatttcccatctaaaaattccccttttattgtatctatatcctcatttttttct agctctttaaatatgttttcatatctacttaagaaaaattttctctctggataacattct tttaatttatatataacttcaaatatattcttttgaattggcatctggtcatgtccattt ggaagtattatatggtcagtagttgcacccttatcaagaaccggtaaatatttatccatt cttgttcttagctcatcttcattcattggtagatattttcctattgcataacctaatgga agtatttgaaccaaaacagaagacccatcatcactcttccaattaaactctgttttatta gttccttttctttcagaacatcctctccaaaacattgagtattttatatcaaacccattt agtatttgtggcatttgagcactttgaccaaatgaatctggtaaatatcctattttcata tattctccaaattcatcacaatcttttattccatatagtaaatttctaagtatggattct ccaccaactaccatttcatcagtttgagtataccaaggacctattattagccttccttct tgaactaatttttttattctctccttacattcaggcttaactgctaaataatcttctaat atagcagtttgaccatccatcacataatatggatagttatgattattttctaacatatcc attatttcttccatattatttacaagtaatattctagattcctcagttgagaagtaccat tctctatcccaatgcatatgaggaactatgtgtacattttttttcattgcttatcctcca aaacttatctgataatattttctgtctaattaaaaatccaataaaaatactactgagttt acaaaattttttaatatttattttatcactataattaaacctttgatttaaatatctaat aacgtatctttttatgtatctttctttgatttttttgtttcctagttattattaataata ttgctgatattatagctccaagtactgccgcaaagaaccatattgatgctataataaatc ctgacatacttccctctaaaagcgccaatgagaatatccccgctccaggcacttgaagac ctatattgaagaatgctactatagacccagttatggctgaaccagctaccaatgatggta taacacggattgggtcctctatcataaatggtattgcaccttcagttattccagccaatc ctaatatccaagtttgctttcctatttccttttctgattctgaaaataaatctctgccta aaacagtagctattgtaactccaaaagctgaaaccatcttaactgatgcaaatattgcat aaggtataaaatttccacttgctattgctcctattgcaaatgtataggctgctttattta ttggtccacctaagtcaaatgaaaccatagctcctattattgcacctagtagtattgcat ttactccagtcatcccatttaaccaatttataagaccattgttaagtgctgctacaggct ttcctactacaaataacatcaataaacctactaccaaagaaccaactactggatataccc aaaaacttacgaatccagctaatgtgcctttggctggtatattcttctttaaaaatttta ctatataaccagcaagtaaacctcctaacatacctccaagaaatccactacctattaaat cagctgctagacctgctgcaaatcctggtccaagacctggtttttcagctagtgagtaag acatatatgctgataatactggaaccatcaatgtacctaacatacctccagaaagctttc ttaattgccataaccaagaaccttcttggttgtatagttcttgtagaccaaatgcttgag atgctaatactgcaaatgcaagtatcatacctcctgccacaataagtggtattatatgag atactcctgtaagtattgctgattttacatcttttttccatgatgatttttcacaatatg atatatcagatgatttttctatataatcacctttaccttgtttttgtgctacttctaaag cttcgtatattatttcttttgctctttttagtggagctgctactgacgtttttatgtttg gcaaatgttcaaatctttctgtatttttaggtgctacatctgttgcatatattattgcat ctgccctttttattatatctggtgtatgagggtccaccataccattagctccttgctttt ctacatacacatccacaccgatttctttaccagctttaattaatgcttctgctgacatat atgtatgtgctatacctgcagggcatgctgttattgctaatataattttttttgattcat tttgaatcctaatctcttcttttatttgttctttcttttcttttatatctaagttattaa ataactctttcttagtttttgaatttaacaacatattcatataatcttcatttgacagtc tagtaactaactcagaaagtatttgtatgtgtgtatttccaccttcattttctggtactg ctattaaaaatattatctctactttattatttgggtctacgctttcccaattttctattg gtgtctctaaggtcatagctgcaaatgcagcttctttaactgacttagattttccatgag gaattgcaagccctctttcaaaacctgttggagataaagtttctctgtacattacagctt ctaaatattcctcataagatgttaacttgccttcatcatatagctttcttgctaagaact ttattgcgtctttctttgtttttattttttgtttta |