Block details
fasta C_difficile_CD00275_1A_021018.fasta
contig u00000crpx_c_021018
start 3442769
length 11675
strand -
type core
seq cttccatttccattgttatctatatccacatatataaatccatatcttttttccatttct
tgagatgaacaacttactatatctattggcgaccacatacaataagctaatatttcggtt
ccatcagctatagcttcacctatttgttctatatgttttcctaaataatctattctgtaa
ctatcatgaacttttccatcttcaaatttatcatgcattccaaatccattttcagctatc
attattggcttttggtatctatcataatattgagataaagtattgtataatccttttggg
tcaattgcccacccccaaggatttgcttttaaatatggattctttatattatcagttgga
ttcatggtgtttttacttgctgatactgttgtagaataatagtatgataaagctagaaaa
tccatagtattttcttttaagattttatcatctccttcctctataactatatttatgtta
ttttctttgaaaaatctcttaatatagactggatactctcccctaaaacttacatcagtg
aaaaaatattgtattctatttctttttaaagcaaacaccacattttcagggtcgcaatct
tctggataagatgtacaatctgccatcatcatccctatcatcatatctgaatttatttct
tttccaagcttcttagttaaagctgtagccatgaattgatgatgaatagcttgatatttg
gcctcttctacatcatctacctggtctacacaaaatgcaactgaattaaatgattcataa
tgtattaaatttatttgatttataactatccaatatttaactttatttttatatctattt
agtattaattctgcatatctaacaaagaaatctaccacttttctattagaccatccttta
tattttaatactaaattcaaaggagtctcatagtgaagtagtgttacaataggttccata
ccattatctattacttcatttataagattatcataaaactttaatccctcttcattaggc
tctaaatcatctccatttggaaatattctagcccaatttattgaaaatctaaaacacttt
aaccctagctctttcaaaagctttaaatcttctttgtatgtatgataaaagtctattcca
ctacgcttaggataatatccattattatctttcatagcaaactttattctttctatagtc
atatcagactcataaggtttagatatatctctatctttatcatacatatgtacatcagct
aaacaccaacctttgccaccttcattccatgcaccttctaattgattagctgctacagct
cctccccataaaaaacctttaggaaacttacccaatttaatcactccttattttatttat
ttaaatcatttactattatttaccttatattctatagactttactattcctactaaagac
atagttatatttaactcgctgaatatggtcataagagtatcttgagcatgtgcaaataac
agcgaatgtgctcttttctctccatcagcttccccttgtataatcttggtttgagctcta
tgtgcttctgtcataaacccttttgctttagctagttttaaatcagcatttctataatca
aacttttccaaatcattaagagcatgtttaatttctgttctagcctcacctgcacgaagt
attatttgcattgccacctctactaattcttcatctattatatgttcttcaattgtcata
tttataatttcctttcaatttctaaatttaaacctcttggctctctaattttatctcttc
tttctcataagctttaaaaaatggataccatatcataaatagcaatactatatttattgc
taaaacaataagacctctaacatcttgatttaccataaaagtagatataccaaaaggaac
ataccataaattaaacaccttacttggaattgtaacaaatcccatactcattgataaata
agtagttattgatattactattgtacctatccacataggtaacattaaaaatgggttcca
tgccactggagctccaaatattactggttcatttatattcattatagaagggacaataca
tgctcttcctattgcttttattcttccaactctggataaacacatcattataactaatgg
taatgtagcacccaaccctcctaaagttatccaacctgtttgaataacttcgtaaacata
tatattagttgctactcctcctgatgctactgctgctgcattagctgcaattgcaccaag
ttgaattgaataagttataggggatagtacccacccacttattcctaaagaatatataaa
tactactaaaaagtttaagagtacaaatccaggtaatgtctgtgctatatctgatactgg
tttaaatactctaactattatttcaaacatgtcaaagttgagtccataaattaatcccca
gcctacaaacattatcactgttataggtaacatattatcaaaccacttgcttacaaaatc
cggaagtgctgaatcttctccgaaaaatgaaaaagaaccaaataaggacattattaatcc
agagaataatcctgcaactagcgatacaagcattccttctcctccaaacctgttgaagtt
aaatatagctccttcattcgtaatctctggacgaatcatcattaacattaatccagcacc
tgcaagaccagcgactacactcatactttcaaatttcttattcttcattatttccatagg
caataaaaatgctataaataatcctaaaagtccaaatgtatattgatttattggacttaa
atcaggtaaaaagcttatgtaattcttcaagacagaaactatagttactaatgagcctac
aaataccattggcaaaactttcattatagttgattgaactgattgtacccatatattctt
agtcatattatttacaacaggagtaaatttttcacttaaaaaatctataaatttattcat
aaacactctccctataaatattttatttgtttgatattagttctagtgcttcttccaaag
cctttgcaccatctagtcttccatatgcagttttagatatacatgctactggaacgttat
attcattagccttttgttgaatttcttccttcatataatctaaatgtggtcctagtaata
aacaatctatttctgataaatacttatctatctctgactcacttctcgcttttatatctg
cttctataccttttttctttgcactctttctcatactagttgccataaaacctgtacttg
ctcctgaaccacacgccaaaagcactcttatatttttcataataatacctccaatatttt
tatccattaatttatttcttaatgaactttttattttattatgtttatattgtacttacc
aaataagttcatttcacataaatatatttcctaataataggaaatcagttactcttaatt
aaacatattaatatagtataatgtatcttataatacgtacattcaattatataattatca
tatcatccagattttattttaaaactatgcgagggaatctaatgaaaacatctaaaaaag
aactatttttaaatttcataaaaacacaacatgattggatagattcatctacattggcta
attatcttaatgtctcaacgcgttcaattagaaaatatgtaaacgaaattaattccaatg
gtgaatttatattatcctctaaaaaaggatataaagtaaatctcaataataattgtcaaa
ccaaggttgatagttcagaaaatatatcacctgataacaggttaaatttaattttaaaag
aacttatagttaatagtaatggaattaatatatttgatttaagtgaagaattgtttgtta
gcccagctactattgaaggggatatagtcaaagctaataaatttataggaagttataatt
taaagataaagcaatcgaaatttttattgaaactaattggaaatgagtctgcaaagcgca
aattaatgagctctataatatttaaagaaacgggaagtgattttttaagcttatttgatg
tacaaaaaatatatcaagagtataatttgaccaaactgaaagaaaatataatatatatat
taaaaaaatacaatttgtttataaatgagtatgctataaataacatacttcttcatttaa
tgataactatagacagaataaaaaagaataactacatagaatctgtcgaagtagtaaact
acatagataataataatgatataagcatttcaagagatatatcaaattttttagagtctg
aatacaatataactttaactagtgcagaattatactacttagtatttcagttaacaaaca
aaaccacagtcttaaattatcatgaaatggatactaagtcattgccaaattatatagatg
atcactttgttaaattaactaaaaaaataattaaaaatgtatatgacttatatcttatag
atttatctgatgaggaatttgttgtaaaatttactcttcatgtaaaaaatttaatcagta
gagccaaaaataatcaagttttaagaaatcaaatacctcaaaagttaaaagattcctacc
ctttgatatatgatatatctgtttatatttgcaatcagattcaaactttagaaaatgtag
atatagacgaagatgaaatatcttatatatctcttcatgtaggttcattctttgatagac
aaaaattattagaagataaagttctatgtgcattaattactccaaattactatgatttac
aattcaaaatagtaagagacctcgagaagagatttaatgaatccatagaaattattcaga
ttttttcagatactcataatcttgattttgacaataaggtagacatggttattactactt
taccaattaacgatagatgccctataccttttgtttatgtaaatccttacctaaatagaa
aggattatgataatatccaaagtaaatttattcagattaaagataaaaaaaatatactta
ctgtacaaaatcatttagaaatgtactttagtgaatctttgtttatgaaaaatatatatt
tagatagtgctaaagattatataaaatttatgggaaatattctgtacgaaaataaatatg
tcaaacccaattatatagatgatgttcttataagagaaaaaatgtcttcaactgcattta
ataacaatgtagcaattcctcatagcatgaaaatggatgctttaaaaactggagtatgtt
taattgttaacgataaaccagttaaatggggtgaggaaaaagttcagattatagctatga
tacctataaatgaaaaagaaaaagaaaaattcaattacatatttgaaagctttattgaaa
tattatctgagtggaataatgttaaagaacttactaaggcagataactatagtagtttta
tgaatagaatagcttatcttattcaaaatatctaaatccgttaatttatttccaatatat
gtttcttaagttattaacataaaatagataagctgtcacactaaaaagtctaaattaata
tgtgacagctttttacctaatataccttgttttaatactacatattttttgactgttgta
tactagttataagattgaatatttgtgttgttgtagatgtcatattctcactagcagttg
ctttatccattgcttcttctattgtcatagctctatttactatagaaaaataagcatcta
taccctcttcattacatttaactgcatcttctgttgtggctccagccaaacctattactt
ttaccccatatttttttgccagttttgcaactcctattggagccttgcccatagcagttt
gattgtccaatctaccttcaccagttatgacaaaatctgcatcttttaactcttcctcta
atttaatttcttctaatattatttttattccagattctaattttgaatttaaaaatgcta
aaaaagcaaaacctaatcctcctgctgctcctgctccttctacattagctacatctttac
ttaagtaacttttaactactttggaaaaatttctaagcccattatctaactcctcaatta
tttctgatgttgcacctttttgagacccgtatatgtatgcagctccatttttcccaaaca
gcggattatttacatcacaggctattttaaacttacattcatctaattcctttaatctat
tttctatttttatatgtcttatttcatttaaaacttttccacctaatcctactaacttgt
tattttcatcataaaactcaaaccctaaggcttgaagcatacctatcccagcatcattag
tagcacttccacctatcccaactataaaatttctatagcctttatttattgcttctttta
ttatttccccaacaccataagttgtagtgtataaaggatttctaagttcagtcggaacca
atgttagtcctgatgcttgagctatttctattattgctgtacttgtattttttaataatc
catatgttgcatccacttttttagctattggtccagtaacttctatagtctcttttttac
cattcatcccttgaactaaagcatctactgtcccttcaccaccatcagcaagtggcaata
tctttacttgcgcatcttctttaaccttcaatatccccttttttattgcatttcctgcct
ctattgaagataagcttcctttcaaagaatctatagaaattaatattttcatacttatct
actcctttttattactccttattttaaacatataattttataagcttaatttatctttta
ttttatactctacatctctctttgtatacaacttataccattaatattcttttatcttat
aaaaagggagtgtctcaaaataaatttcttagttcatgagacactctttttgtataaaat
caaatatatgtttattatttcaacaatgataaggaggattatctctattttaagacaatt
cctttttagcactatttaaccaatatagttttaacttggttcattaagcactctacattt
acaaagttattatctattgatatagattctaattctttttcatttaggttaatccattta
gctgttttaatatttttgttaaatactatgttagctgattttgtttcttctttagaattg
taaaatctaactactaatgcctcttgtttttcagccttttttacaacacttaacacaagg
tccttattagtttccttaagtaaactatatgaataatctacttctatttctgattgattc
aatttcatagcattatatggcattttattataagtttgtatttttgttaaatactcttta
gccatatttgcaacatttgcttctagtgtagatttttcatgagtaactattgctaagtct
atttttatatctcctatcatttgagaatctggagtaggcaactttattcctgatggacga
cctgggcgtcttgccatttcttctttacctaggaatcctacacttctaaataatgttata
gctattgtgtcaaatttttcccctactatttcaaactctcttgtactgtttgtaagaaca
gctactccatgctctttgtcagacaatccaacgaatgttagcattggatatatagaatct
ggtctttcactccattcttcctgttgccaaacttccatagcatcatcatacacacttctc
tttatatgtccaaactgattatcagacacagaaaactttgaagctatatttgttggtata
taagttctaaccctacaatctcttgcttggttatttatgttgaatactacatctattata
gctttatcatttggaacatttataactatatcaaagtcaataaatgaatctgctctatta
ttttttctagcttgtatatcttttggtacttttaatctataatttatctttatctcatta
ttaaatctatttttctttatagtggaatttgctactatattatcgttaaatattaatttc
tcatttggaagtggtgaaaaatcatactcatctccttcatctcctccattttccatcaat
aatacattttcaaaagttttatttaattttttatcaaatatctttaatgtcccgttttca
ttaacttgaatagtataaaagtcattatctaccatgtcacatacttcataagctttttct
aacatatgtccaatttcttttatcatatacgccttataccccattgcaggtattttatct
ttaaagtttattgtatataccataaatgaatcatagtttccataatgaacaatttgacgg
tctattaatcctgcatctattacttctttatgtaccacttcaaaatccaacttattatta
tctttatcaaatatttcaaatgctttcattttagttataacttgggcgttcactatttca
ttcctatcgtaaggcattaagttaaatgctactaacttatctaaagccatttcacaactc
attgcatcaactattcttcttttgtaaaatgttattaattggtctactttttcctcagct
aagaaaaatctattcattatttcatggtgaactttatctgaacaacaacatccaatgctg
tcatgagcatgatttttcattatttctttccaaattaactctattaatccatgatgatat
tcaaatcctagagaatatgcaatagaagctagtggctccaatatgttggttatctttgat
tctattctagcatttgctgattttatatccattcttgttgagaatatacttctatgaacc
ctcatatatttcccatctaaaaattccccttttattgtatctatatcctcatttttttct
agctctttaaatatgttttcatatctacttaagaaaaattttctctctggataacattct
tttaatttatatataacttcaaatatattcttttgaattggcatctggtcatgtccattt
ggaagtattatatggtcagtagttgcacccttatcaagaaccggtaaatatttatccatt
cttgttcttagctcatcttcattcattggtagatattttcctattgcataacctaatgga
agtatttgaaccaaaacagaagacccatcatcactcttccaattaaactctgttttatta
gttccttttctttcagaacatcctctccaaaacattgagtattttatatcaaacccattt
agtatttgtggcatttgagcactttgaccaaatgaatctggtaaatatcctattttcata
tattctccaaattcatcacaatcttttattccatatagtaaatttctaagtatggattct
ccaccaactaccatttcatcagtttgagtataccaaggacctattattagccttccttct
tgaactaatttttttattctctccttacattcaggcttaactgctaaataatcttctaat
atagcagtttgaccatccatcacataatatggatagttatgattattttctaacatatcc
attatttcttccatattatttacaagtaatattctagattcctcagttgagaagtaccat
tctctatcccaatgcatatgaggaactatgtgtacattttttttcattgcttatcctcca
aaacttatctgataatattttctgtctaattaaaaatccaataaaaatactactgagttt
acaaaattttttaatatttattttatcactataattaaacctttgatttaaatatctaat
aacgtatctttttatgtatctttctttgatttttttgtttcctagttattattaataata
ttgctgatattatagctccaagtactgccgcaaagaaccatattgatgctataataaatc
ctgacatacttccctctaaaagcgccaatgagaatatccccgctccaggcacttgaagac
ctatattgaagaatgctactatagacccagttatggctgaaccagctaccaatgatggta
taacacggattgggtcctctatcataaatggtattgcaccttcagttattccagccaatc
ctaatatccaagtttgctttcctatttccttttctgattctgaaaataaatctctgccta
aaacagtagctattgtaactccaaaagctgaaaccatcttaactgatgcaaatattgcat
aaggtataaaatttccacttgctattgctcctattgcaaatgtataggctgctttattta
ttggtccacctaagtcaaatgaaaccatagctcctattattgcacctagtagtattgcat
ttactccagtcatcccatttaaccaatttataagaccattgttaagtgctgctacaggct
ttcctactacaaataacatcaataaacctactaccaaagaaccaactactggatataccc
aaaaacttacgaatccagctaatgtgcctttggctggtatattcttctttaaaaatttta
ctatataaccagcaagtaaacctcctaacatacctccaagaaatccactacctattaaat
cagctgctagacctgctgcaaatcctggtccaagacctggtttttcagctagtgagtaag
acatatatgctgataatactggaaccatcaatgtacctaacatacctccagaaagctttc
ttaattgccataaccaagaaccttcttggttgtatagttcttgtagaccaaatgcttgag
atgctaatactgcaaatgcaagtatcatacctcctgccacaataagtggtattatatgag
atactcctgtaagtattgctgattttacatcttttttccatgatgatttttcacaatatg
atatatcagatgatttttctatataatcacctttaccttgtttttgtgctacttctaaag
cttcgtatattatttcttttgctctttttagtggagctgctactgacgtttttatgtttg
gcaaatgttcaaatctttctgtatttttaggtgctacatctgttgcatatattattgcat
ctgccctttttattatatctggtgtatgagggtccaccataccattagctccttgctttt
ctacatacacatccacaccgatttctttaccagctttaattaatgcttctgctgacatat
atgtatgtgctatacctgcagggcatgctgttattgctaatataattttttttgattcat
tttgaatcctaatctcttcttttatttgttctttcttttcttttatatctaagttattaa
ataactctttcttagtttttgaatttaacaacatattcatataatcttcatttgacagtc
tagtaactaactcagaaagtatttgtatgtgtgtatttccaccttcattttctggtactg
ctattaaaaatattatctctactttattatttgggtctacgctttcccaattttctattg
gtgtctctaaggtcatagctgcaaatgcagcttctttaactgacttagattttccatgag
gaattgcaagccctctttcaaaacctgttggagataaagtttctctgtacattacagctt
ctaaatattcctcataagatgttaacttgccttcatcatatagctttcttgctaagaact
ttattgcgtctttctttgtttttattttttgtttta