Block details
fasta C_difficile_CD00002_4A_024063.fasta
contig u00000crpx_c_024063
start 3293214
length 9576
strand +
type core
seq cggtcataattcctattattaaaagagttgttatattctttaccttatttgcaaataaaa
tgactatagacattacaattaaagctcctataaaagctgctacaaatatactcattgaat
ttacactctcaaatcccaatgtgtatcctcccaaaatcatgagagctactgataaagtag
aacctgaagatactcctaatatatacggttcaactattgggtttttaaaaaatatctgta
ataaaatacctgatactgctaggcatgctccacctaccatggttgcaagtactctaggga
ttcttatattgtatattattttataatgttctgtattatccatacctcttaatacaacat
ctattacttctttaaattcaatttttacagagccaaatgctacacacactaaaaaagtaa
gtatcatacttataattaatactataaatattgtcgtattccttattctcattttattga
taaaatccatttgtatactcctcttagcaaagctatattaactaaaatctataaaaccta
tctttttgtgtcctctctgtactatttatcataatttatataatgtttgattttttcacc
tgtagtacctgggtggaacatctcaactaaatctactattaattcgtctgtcttatctac
tgattgataataatctggagcaaacacccataagtttccgttttttacaacatccaaatc
agccaatacaggtgcactagattttatagaatctaaatttggtgcataatctgaacttga
tgagtatacaaatatatctgcatcttttgcaacttcatgcaattgttcaatacttactcg
cccttcatttgaatctattgaagcacatgcatttattccaccagccatttttatcatatt
atccacatatgaatctttaggagctatataagcacttccttcatatacagatgcccatac
aactttaggtttagctttgttttttatttttttacttacttcttctaccttttgtacagt
tttatttagttcactagtagccatatcttctttatcataaaatgctgctattaaacttgt
ccactccattcttccaaatggattttgctctttatactcattgtctacaacataattaag
ccctaattcttttaatttgtcaataaattttgtatcagcctctgataaaccactactcac
tatagttaagtcaggatttaagtctactattttttcataatctggtgctaaatttgaacc
aacgtaatgtatttttccatctttcattaaatctttaatttctttaatagtccagtactg
ctcttctgttgttacggcttttatactatctagttcatctattgttctcagagaacaagc
ctgtgttgtagatgctattaatacattgtccacaggcgttctaactatattagcattttt
atatttttcaggaattttaatcttctttgggattaaaatcagttctcgattatctccatc
agttacttttttaattccatcttctaaatcttcaacactaaatccactagcatattttaa
ttctaatttcttaccagtactagcttgtttattctctttgtcacttttactacaccctat
aagacctcctaccataaaaattaccatagcaattaaaaaaaactgctttaaaacatttga
tttaaatttcatctctttcactccaatatcttattttttatgagtggctaaaaaacttta
ataatatatgctttttaaagtatacttattaaagttatcctaaagtcatctttaataagt
ataaccttttaataaaataaaaaacttctcctaatttaataaggagaagttcatatatca
actttacaaaaacgaattgatacttcattttattataaattacaatctccaccctaaatt
gaacttatataatactgggcaggtctcctgactcacggcttttcctccatcacccttccc
aaaatttttataaatttcagtggattttgatttcgtatccgtatacagtagcgggggctg
tagtgaattttcatcactttccctattaaactaatatagtaccctagtattattttaatt
taatttttattaagataattgtaatttattgttgacctctttgcaaggttgatttaacat
atatttaattcattcatcaattttttaatttcacatacttgtttttcatttggttttaca
aatggagcagtcatataatcgcttatttgtaaccctctgatattcatagcttttttcatt
gctggtataaatggattggttattaagtaaaaatccattgctttattaatatatttttga
atttctataaccttctccatatctctattattgtaagcttcagcccatttggagcaaact
tctggaattaaatttgataacccccctatacaacctgctcccccagacattagattatgt
ataaagttttcatcataaccactataaaccttaaattctgggaactctattttcatagta
tttattaaatctctggtatgtcccatcaaagttactgtatccttatatccaactatgttt
ttatgttttcttgcaagtcttaatgtaagttctggacttaaatcataaccagttctatct
ggataattgtacaaatatatttcagcctctgtattcttagctatttcactataaaataac
tcaatgctatcatcatcaagagagaaataataaggacttattatcataacgccatctgct
ccactattatgtgcatagtttgaaagttctatagattcatttatacacatacgacttgta
cctataaacacttttactctcttatttacatgactagttactaaatctataagttctttt
tgcatatccatagacatattaaagaactctccagtacttcccattatgactagtccatct
acacctccatctataagatggtcatacacttttttattaccttctttatctaaatttcct
tcttcatcaaatattgtaacaactggtgtcaaaaattctgctttcataatttaaactcct
aaaatttattttaatatgttcattaatacatcagatttagctttaatattaattatatta
aaacagttacttaatgtaattttttaaaattccaatactctcaatctcacattcaactac
atctccactactcatatatcgaggaggtgaaaatcccatccctactccagaaggtgttcc
agtagctataatgtctccagcctctaaggtcataccttttgaaagttctgaaactatgtc
tgaaacgtctgatatgaataatcctgtattagaactttgtctttcttcaccatttaccct
actacatactttaagttttataggaaaaggaactgcacttttatgtaaaatacatggacc
taaagaggtaaatgtatctaatccttttcctctaaaccattgaacatgttctttttgcaa
ctttctagcagaaatatcatttataacagtgtaaccaaagatataatcttctacctcttc
ttttctaatattaacacctgttttacctattactactccaagttcaacttcatagtctaa
ttgattatttatctcaaaatgaccatctatctcatcttctggacctattgcctttgtcac
acgttttgtaaaataaaccgttttttgtggttcttcaaaactatcatcaaagtgagtttg
agtttcttcaagatggtctttatagttcactcccacacataagatatcatgtattggttt
ttctataggaacatgtacagtacatctctctcttttaaaaacatcataattatagaatgt
actttcatttataatagttttcaacttaataatatcttcactagatacattttgaattaa
ttcatttaaatccttaaaatttctactgagatttaaagagttaacatctataataaataa
ttcatctttagaaaaaactccagttcttttacattcattttctccttcagtaaaacttac
aaacttcataatctcaacctttattaaaattctatgtatttattttcttacttaaagatt
atacatagttgcatactctagctattgccatttcagtatatccaagggactctgcttttg
attgttttccatttgctacatctacaaccatatttaacaaatcatctgttaattcttcca
ttgtttgtggaccatagataactggactagcatcaaaatccatattatcttccatatttg
caaaagttattttatttccagttatttttattactggtgctattggatttcctgatggtg
ttcctcttcctgtactaaataccactatttgtgctcctcctgctaccataccagcaacag
atgaagcatcatttccaggggtatccattataacaagacctttcttatcaatttgtttgg
cataatcatatacttcacttatttgtctatgaccacctttatgtatacaaccaagtgatt
tttcttctaaacttgttaaaccaccagctatatttccaggagatggattaccttctctaa
cttcttctccaaccaattttaatgaattttcatatctatgtactatatgtaatatttttt
cttttacttcttcatttactgctctcctagctagtatatgctctgcacctataaattcag
tagtttcacttaaaattgatgttgctcctaaatcgacaagtttatcacttaattcaccta
ttaatggatttgctgctaatccacttgttgggtcagacccaccacattcagttcctagta
taagttcagatattggaaattcttcttttctaagcaaagaagcttcttgtgccatttctc
tagcataacgaacagctttttctatagtttttaaagttccatgttcttcttgtattacaa
gagtttttattggcttatttgttctctcttttattgcatcaactaccaaatcattttggc
aattttcgcatcccaaagatacaactattacaccatatacatttggatttgctgcataac
cagccataacatccatagttaattgttggtctgaatgtacttgtgaacatccattctgat
tattaaaggtaactgccccttgaacttgtgatgctattattctagttgtatctgatgcac
acacactcgtaggcaatattaatatgtggtttcttataccaactcttccatctggtcttt
tatatccataaaatttcatactgatttcctcctaaaatagtctatatactttctataatt
tttatatattataatttttattacactcactaatcaaacagctaaaaacctatttaaaaa
ctatttgacactaaaagcaatgaatacaacttttataactctataaaattattttatata
ttagtcataacttgtttatccaaatcctctctaacacttctaacattatgaatatgtaca
tgttgaccactttttatttcctgatttgcttctcctatatgttcaccatatttagtaact
ttatcaccttgggccatatcttttatagccaatttatgataaatagttatatcatctagt
gctgtaatcgtttttactgttttgtcttttaatttaaaactaatttcactacctttagct
attgcttcaatagctactgcaacattatctttttcatcaattatcactgcatttatcatt
attcttgctctcctttataaataatataattttattaatatcctaaaatctaattaaaga
atttattattttaccaacaactcactgtaatataaattaagctgttattgtaccatcctc
attttgttttgggaacttaggacatccatacttcttagcccaccaactagttataagagg
tactaatattgcagtgacaactactgcggctgccacttgtgttgtagctgttgcaacata
tggttgccatgatgggtcaactaatgcaacagcagcaggtacagcaattgcatttccagc
agttgtagctacagcccatcctgcatatcctggacgttttcctataaatttatcacagaa
tactataaatatacctcctacaaatacagatattaatccaagtaatactcctgataaacc
tccttttagtatacttgcaagatttatgctactaccaagtgcaaaccctacaaaaggtac
gagtaaattacaccctggctctaaaaactctttcatttttttgtcaaaatttcctattat
cataccaacaagtattggcactattgcagccaataatgacaacaatggtacatttgcaag
acctgaagtcccaagagctattaatgtaaaaaatggtccatcatttaaagtaagtaaact
catagttgcacaatctgtttcatctccatatgaagtcatcaatgaaagatatatactacc
attactatttgtaactgcacttataacagccaatgttgtcagaccaaggacaccatccat
tccaaatagctttcctataagtatacctatcaaagcacctatagcaaatttagaaccaag
aagtataccacctctctttaaaacttttggcatttctctaaattgaagctgagttcccaa
gcataccagttgaaccccaattatagttgcagacccaacacttgaaaatactgctgtcgt
aaacgaacctatttgtacaatatctgggcaaaaggtattaatgaaagctgctataaacat
tggcactatcatcatacctgcaggaatttttttaataaaatccattatcataaagttaat
cctcctaaaacatgatatttaattactcttattaagtttttagctttaattctaacggcc
gtttcggttcgtatttaagaactaagtttttaattacgaatctttgaattaatgatagca
ttttcctatttatgagtcaataaaaaaaataaatttttgtcaaaattttttcaaactttc
tgataataccttgtatattatcaaatgacttccttatatgcaaaaatacagcgtatttaa
aattatatagtattcaaaactataaagtttttatacagtgtaaaaaatagataaaatata
agttcataatattttgatatttacatataaaaataactattgcatatatttacttaaatt
atataactaaatatcacttactttctttaggtatattttggaaattagttattccttaat
gtacagtctaaaaaaatatctatctgtatctaaatcaagagcttatttatatataaattt
acatatttattttctacattgtaaaatatcgtatagtgtgctaaaatcaacatattctaa
tactttaaattaataaaaagagggggaaatttatgacttcagataatcatcgcccaacag
ctaggatattagatattttagaagcattagcagaatccgaaaatggatatactcttacag
aaatagcagatgttatcaatgctccaaaaagtagcatctttcctatagttcatacactta
atgctagaaaatacattactattgataaaaacacatccaaatattctatagggatacgtt
cttacacattagggtcttcattttttgaaaaaagaactatttttaactatataattgacg
aaatgactaatatagttaattcctgttctgaaacttgtcagcttggtatacttgacaata
atgaagttctttatattggaaaagtagattctccagaaccaattagacttatttcttatg
ttggaaaaaaaatacctgctaattgtacaggtcttggaaaagctcttttatgtgattttg
acaaggaaaaactaataagcttatatccagatggtctaaaaggttttacagaaaaatcaa
ttacagattttgatgttttatacgaccagcttcttgaagttcaaagaacacaaatagctt
cagagtgtgaggaatcaatggaacacctaaaatgtcttgccgtaccaataagaaaaaatg
gatgtataagagctgctgttagtgtaacactgcctttatttagagctaatgacgaaaaaa
tagaactgataaaaaaattactcttaaatgctcagaaaaatattcaatcaatgatggaag
aacgtaatgaagacattgtaataaattagattaatattctgtatatggaagatatcaaaa
cataataattaaaaattttgttttaaactaatgtatttatttgatttatactataaaaac
aaagttgctgatttaactacagtaactttgtttttttttataatattttttatattttta
ttgacatgataaaaatactatgttaaattctaatcataatcgtaattacgaattaagttc
ttatataagaaccagcaaccctatctcaatctaagatacgatatattatgagtaaattag
tgaaaattgttagatatatatttttacataaaaatcaatgaaaataaaaggagattttag
ttatgagcatttattatgtaccaccaataaatttacttgggaaaggatgtcttaatgaag
ctaaagattcaattaaatcattaggaactaaaaaagcatttattgttagtgataaatttc
tagtttcaaatggtactgtaaaaaaagtaacagatattttatctcagatagatgtagact
ttgttgtttatgatgaagttaaacaaaatccaactgtaactaatgtgaataaaggactta
aaatattaaaatcagaaaattgcgacttcgttataactataggaggtggttctccacaag
actgtggtaaagctatctctatattagccactaatggaggagatattagagactatgaag
gtatcaacaaaacttctaaaaaatgtcttcctatcatagctataactactactgctggta
catctgctgaagttacaataaactatgttataactgatgaagacagacatgtaaagatga
taatggttgataccaattcactagccacaatgacagtaaatgacccagaattaatgatta
gcaaaccatctaatttaacagcagcaactggtatggatgcactaactcatgctatagaag
ctgtagtagctaatggtgcttatgatgttacagattcaactgccttatatgctataaagc
agatatttaaataccttccaagagctgttaaaaatggtaatgacatagaagctagagaac
aaatgtgttatgcttgttttttaaatggaattgcctttagtaatgcaggtcttggaaatg
tacatgctatggctcatcaattaggaggtttatatgatttacctcatggagtatgtaatg
ccatgctacttccaatagttgaggaggaaaatgctaaatcagcccctgccaaattccgac
caatagctgaagttattggaatggatgtaaataataaatcagataaagagtgtgttgact
ttgtaatagataagataaaagctctttctgaagaggttggaatcccaaaatctttaaaag
atgtaggtgttgataatcctaattttgaattgcttgcagaaaactctatgaaagatgctt
gtgctggtgctaatcctgttttctttgataaagataa