Block details
fasta C_difficile_CD00005_1A_020472.fasta
contig u00000crpx_c_020472
start 3376125
length 16242
strand +
type core
seq aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgagatgctattacatttatctatttc
ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatataccagcttgctctaaatacat
cttgtaactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt
cattttgcctctgctttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat
gagtaaccccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgta
catataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttaccat
attatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaaa
aaataaacatctataattccagtaatattaattaattctaaaccctttttattatcattt
aataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttctt
acaattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctgat
gatgctacttctatatcaaaagaatttttcagtgcagtaagtgcaaatattgaatgtata
acagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagctttttta
atctcattatatgtcatacccaatttatttaactgttcatactttttcttatcaacttgg
caatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtagtaacaaagaaaattaaacct
ataaatattgctaaaaatataaatgtagaatacattaatttcccagttcctatcattaat
tctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaat
tctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatcc
actataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatatttttg
taatacgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattccct
acaataatattttctttgacgttcttatttcctggtaaacttgatgataataatgatata
cattcattatcttcaaaacttataggcttaacccctatagtttctgtaatttctaagtac
ttagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaat
tcaccattaatccttgtatagtctacattctctttttttagattattttctataaacatc
attctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagggtcattatgcaatgtcatt
gttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttccaa
aaggaataaactgtacctatagcagtaaatgccactgcagaagttatagttatcaagaaa
aatattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgta
ttttttctataaaatctcttgtttaattttagcttcttcataaaaaatacactaaattga
gaaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagatat
gttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaata
cttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctggttttggagtttttgtaccttta
agtaacttcaacacctgattttctttaactataaaagaagtaaatattgatgttaataca
gctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaatttt
aatggtgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaag
cctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagatt
aatttcattacttggcgctttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttatat
ctacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgca
attatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaaa
tctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatactt
gctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgtttt
atattcattagttatcgcctcccaataatgtaagtacatccattatctcttgataaaact
gctctctactactacccttatatatttcattatatatagacccatcttttatgaataaga
ttctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaactttat
tttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaat
tacctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaatag
cagtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatctttta
tacctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgaccttat
ctaatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaat
cctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaaca
ataaaggattcttgccctttaattccatagttcctgtagttggcttgtcaatagtagaaa
tcatatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattctc
catcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatata
ctttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaat
ttttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttataga
taataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtact
acacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaattc
acgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaaa
gcaatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctgaa
gaagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaatta
agtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgca
gacaaaacttgtaatgtcccaacctttaaagcttgtattggagtaattttatctatatta
tctgtggaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccaccc
actataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcgtaaaat
agaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaaa
ccaatctttccttcttttccaccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatct
tttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaacc
tcaaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatga
cctgtagatgaaactggaataaattctgtaagcccctctactatagctattatgactgat
ttcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaattt
ctttttttatgttatttctcttatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaaa
atttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaact
ctcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaaa
gtacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacatctttatcaaactatttac
acctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcctacttctgattttatacttac
tttatgacctaaatcatcacataccttttttactagataaagacccatacctgtagattc
tccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatggggcaaataccctttttaaatcttt
agaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaattacatatttattattttcttc
agattttatagttaggtagttactataatctttagaatatttcactccatttgtaattaa
ttgacctattataaatttcatccattttacatctgtataaacataagtaaacttgtctac
ttgaatcttaggaatcattccactttttataaataaccttttttcttcatttacaatact
agatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaagtctttctgaaaattatctgc
ccttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttattcaatctatctatttcttttcttat
attttcagttacttcttctccctcataatcttggagctgaaggcttataactgatattgg
tgttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaatgttcactatgtatcttttt
atgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgttttaaaataactgatatatt
tctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcctccaaagaatgtactccttt
ttcaaacagattatatacttctctatttttataatacttatatattaaaaaacataacaa
tataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctccaaaactaataaacttcataag
attacagtaaataattgtcataactatgcctatataatatataaaaatataacctttata
atcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattcttatttaatttatatcctaa
ccctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcctcaaatcttttccttatcct
gctaacatttacatttaaagtattttcctctacaaactcaatatcatcccatatcttttc
taaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttgataagacattcaatcagtat
accttcttttttagttataattagattctcaccatttaattctagttctaacctttctgg
ataaaattttaatccatctagctccactattctttcgtctattttaggtgaatattcacc
atatacccttcttatatgactctttatttttgccattactacatcatagtaaaaaggttt
tgttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatttggtctacattaccatctct
agctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgcctaatacatctacaccagtagaa
accatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaagtgtggcttaaaactttcaaa
tgtaatcattatatcatcaaagttctcttcaacaatcacttcaaatccatatttctcaat
ataatctttaagtaatgtacttattgatatgtcatcttccacaatatatactttataact
catataattcctcctaatatacctatttactcatcatataacagtccaattttaatatat
tataatctttttacaatatataaatttaatcatattactaacttcacaattactgacttc
ataagtataaccatattattagacatcttaataaaactctataaaaaagtatctttttat
gattaattaatcattattatcaactaatcattctaaaataaattgaaattactaattcaa
aatagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaacttttattatatttcttacttagtat
tattttatcatagtttctacttagcattatagattaattcttttatgttcacttttttct
cttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttcaagcgaagatatgtctttat
ctgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattctttagtttcttcaagactta
aatcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaaattattatttacatattcta
aagtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttctggatgtttctctgcaaagt
ctgtgctaacagcagttactattataccatctactaaaccttcaccatttgctacaagtt
tactacctgacttcatagctttaagagctgctggcccagcaatcaatgcagcatctacgc
tgccatcagaaagagctgctgatgcctctggaatacccatattaacaaattccacatcat
ccatacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatacctgatgtaatatagtccctt
ttgggcctgccaccttcttacctactaaatctgctgctgattttattgaattattattag
tcaaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtttaatatctttaactctactc
cattagatgcagctattaaagctgatgtaccacctagtgcatgtaagaagtctatttctc
cagcagctaaagcttgtgtttgctctggacctgtagtaatttcgtggaagttaactttta
tattatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctgtttctgaattatagaaggaa
catttaatggtgattttacataagttaaatttatttctgaaagtttttctccattatttt
ttttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaatatcgttatacctatcaata
gcttttttaatttcatttactttactccttaaaatattattaatttctttaaatgccttt
atttgacttcattgtcattaaaatatctttttttaatttaatatagtaatctgaagttaa
atctctattataaccatcttctatattaaattcttttacttttctttcgtctgtgaaaac
aactattttcttgcctatctttaacgcttcatcaatatcatgagttacaaatatcacgcc
tttattagttgacttatgtattcttataacttcattttgcatatcaatccttgtaaaata
atctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatctggattgaaagaaagagctct
agctatgcttactctctgcgccatacctcctgacaattcatttggataagagtttttaaa
tttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatcaatattacttttcctattata
tttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagcttctaaaattatcatttataat
tttactcctaattcttttattgtgtttaaattttctaagcaccttgtttaaaatagtatt
ttttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgtttaaccaaggcattaatctact
ctcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactctttattatcattaataaacctaat
ttcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctctaagcaaggtagtctttccaca
accactttcacctaaaattactgttatatggtttctatctatgtttaaagagatatcact
aagaactacatgttctttattgtcaactttataacttttatataaatttctaattatata
tccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccatctttcccttacttaccttct
tcacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaaaagtccaattacgattatcc
ctacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatcagatatcaagtatccaagac
cagatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctctaaagctatatccaagagcta
actttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtattattattttaaatattatct
gaagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcagttttgagtcacaatttttaa
tccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaagatgctaaaactataattataattt
ttgattcctctcctataccaaaccataatataagcattggtattaaagcaaggggaggtg
tattccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcgtatactccactataaattccaa
agaatatccctaaaggcacacctatagcagtacttattgcaaaacctatcaaaactcttt
tcatacttgcatatacattaataaatattgaaccatcacttatcatatttaaaaatgtac
tatataccttttcaggtgatggtaatatataatcactccaaataccaagataatttgtaa
ttttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacactctttactagccttaaaaact
tattattaaatttattgaccatttacaaaccatctccattattacaaccatctttacaat
aaaacatttctactatgtcatacttatcttcaaaaccatttcttattttttgtatttcac
ttaatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttcaaaagtatctttgaaatatc
ctaatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattttacaccttcttgttcagcaa
actctttccatgtataaaacatagcattacccttatccttaaacttttcacttgcaaagt
ctcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatcatctttactttttatatatt
tatcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttctatcataggtacttcaaaat
tatttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttctggacatctacaatccaaca
ttgtattttcagtcttttttgtatactctttgtactgcttttttacatattctaactgtg
gttcacattctgttattatgtaccccttttttatcaaatttgctttaataaggtgaaact
tttctccatacattctttctgccactggatttattagaagatatttattcataacgcctc
ctattatttaatattgaatattattatcaattaatagtttaaatgagcacttaaattttg
tcaatatattaattttttcttaataaaacaatttttatctacattttttaatattttaaa
tgaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaataatgcatacatcttactaata
atctatttatataataatctataaatattatataataatacttatataattagtattatt
atttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaagtttttaaaatattatgaaa
catcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtctcaacagacttcacttttta
taactcttataaattattcaaaatatttatacttccctttctacttcaaaacgtaaaacc
gtcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcacttatataaatttcacgatgtgtg
taagattttcttataagtttattttttttgcaaaattcgttcataatgtcaaagctttct
ggttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaacacatagcccttcattaatagac
ccaaatctaactttttcaagaagattatgaggttttttcttctttactatatcagtagct
ttatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgtatcattatagtgtaaattaaa
tcttctttaataagtacatctaagcctttacttttttctcccttatcccatataccttct
aaaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtacaattccttttttaggcatggtt
tttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgcttcagtaaattctttagaattt
gggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttctggtatttcaactattacagga
ttctttttaggtaaatataactctttatctctttttctccattcatatttcataaaaata
cctccatatatattttatacattgatattatcacgctaaaagtgacaacagtgtgtcata
attataaattatattataaaatcttcatcctctaattcctcatacactcctttttggtat
ccattacccttagttgaaaaaaaatcatgtgttttggtttcagtgctaagaccatttaat
acaattggatttatagcatctacagtatatagcttctcaaaccctagattttctaaagct
ctatttgcattgtattttaaaaagttcacaacctctttttcaagcccactttctctgtat
ataacatttgtatactctatctcattctccataaggctataaagtatagaatacatcttc
tcttctaacatctccttatccattttatcaaatgaatcgtatatttcttgtgctagcaat
cctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaataagcgatattatttctccacta
gctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataaaagaatcctgaataaaacaag
aaactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtataatccctcttgatttgtagta
ttttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgtaatgttggttctgtttctatc
cattcaaataattcatctatttctaaattagaaagtagagtcataaatatagaagaataa
ctttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagacaagacagcttttctttgtagg
ttttctgttaaactcatcatagatggtattccattattcccctgttttgtatccagtaat
gttaaaccacccaatacttttttatataattccttttctttattacttagttcattccat
acctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagccaaaattgttttacattttgt
tcccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattccagttaactgcattatgtatt
ttatgtaaattaaatgtcataatttctctccctatactgaacacactagacactcatgag
tatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaacttttcaaaccttttttataggcat
atatgtaatgtctagctatatctctagttgtcttttcatctgtaacaaacagtgttgttg
atataccttggtcaacatggttttgaactgttgccactaaatctatgacctttctcatat
ccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatcatttgttaaaaatggcattggat
atattgtagtagagtctccatatgttcttacttctactggctcagtaattggcattatac
ttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagttggtgctactgccattaaatatg
cattatatatccctttttcttttacctcatccaataattttgtccagtcttcttttgttg
gtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttctgacttaggtagataagattgtt
catagtattttgataaaaccttgctatttcttcccttaacatattctgatttatcaaatc
cttcaaaagtttgatttctttctatagctattttcatagaagctttaattgaatagtatc
taaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagcatcatctgaagtatataaaatat
tttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctcctaatcctatagaatgagacttgc
tgttactattgcttaccgttggcactggttttatatctgtgctatctgctacaaatgaca
gtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagttttattatccattacattagcta
tgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtccccattcattttttcctccatacc
cctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctcacaacataagttagacattttaa
taattccaacatcttttaatgtatgttctctattagctgtatctatgtacactacatatg
gatatccactttcttgttgcatctgtgctatttttgtcaacatctgcctaggatttattt
ctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatcataccactcatccatttctatct
catcaagagaaactccatatttcttatacacagtatgaggataaaatgcatatgctactt
catttttttctgccaactccataaatttatctggtattatagctcctaatgataatgtag
caagccttattttttcatctgcatttatctttttagtatccatcaacaattcaaaatcag
gatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgtctagctcccatttgattaaagt
aactaaatgattgttctaacattttagctactccaacaacacctccagctgcaccttcta
tatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagataaatttagtgcaactcctccac
caatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatatgatataccttctgtactatctt
ctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagccctttttcttccagcatttaaaa
aagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactattttatctgccaagtttaaagcta
aatctttatcaccatttcctagtgtcaaagctacaattaacactttatcattatatgttt
ctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataattttgataaaacttatttgcac
tcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatcatatcatatatatttttaataa
catctatgctatactgatttattacttcttttgaataataaccttcatctattaaatact
tcaatctttcttctaggttattaaattttctcaactttggctgtataaattcttctatgt
aactacttaaggcttccttatccttttccaattggtacttgccttgttcatttttaatta
tcacttgattgttaagctctatccaattcattatttaccgtccttttaacataatcttgt
gccataatttcacttaatttgcttattatttcttttggtacttatcagttgaaatcccaa
aattaatctataattatagaaatgcaataagtatttttcaaaaacaaaagcactacatat
agtcagtgctttatctattatatactacatatagtatatacacaaatttttttatatcta
aacttttattactttataattgacattatttttatttaaagaaatttttatcaactcaaa
tataaaacaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaatttaaattatctctaaatagct
taaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttcaagatgatattttatatattatt
tagaagttttttatttattgttatataattaaatatatgactattttgctactacatata
taaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaactatttctaaacaagaattagaaaa
aacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaataatgctggagaaaaggcagattt
aaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggatactgcttaagtaatattgactt
ttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaagcagatttagaaaactctatttt
taataattcttatctttcggattgttcattaaaaaattctatattaaaaaatgcagactt
aagtggtgcaagttttagattttgtgacttatctaactcagatattagaggagctaattt
agaaaattcaaatttagaacatgctactttaaatggagtaatatcagatgaaagtacccg
tttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcatttataggctataaaaaatgttttaa
ttttagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaaaaagagtgtctgctacatcaaa
cgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaattactagtatagatggtaaagaatc
ttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaattttatatatagagtaggagaaacgat
tgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaatcgactacagggattcacttttt
tttaactagagaggaagctattggttatctataaaatgctaaagttttataaatatataa
atacataaacaaaataacaaaagagtatagattgtaatttcaaaaaaattataatctata
ctcttttttctatagcacataagtacattttatttcataaattataataaattatttata
tctgcactattgattatttgagaaactttatctatatgttctatcttactatccaaactg
tcataatacttcttactctcatctctatttctaaaagaataaacttttttatccaatttt
aaagcctcttttataatatctatattcctcttatttgtctctcctacactaaatcctgta
tctattataatcttggaatcatttaaatttctaatagccaaattgaaactctcatcactt
ataggctcaaatggattttctgtaaacatctttatccccatagttctaccaatttcataa
tcaatatcattttcatgtattattccagaatacagacctataccttttttagtaaaagct
ctataaattggtgttgctttacccccaccaccaattataaaaacttcatttttagattta
ttactaatttctactgaacctaaaagactattaaagtttttatcatccaattcataaagc
gaatttataatatcctcatctactacatcttcaggctgaccataagctatgactttatta
ttttttataagagcaactttatcacaactttttaatgctatgtctatttcatgcaatgaa
agtattactgatattgacttttctttacttaattttttcagtatgtttatgagttccaat
ctatgttttatatccaagtgagttgtaggctcatctaatataattatttctggttcttga
acaagagcccttgcaaccaacaccttttgtttttctccatcacttagttcatcaaaatat
cttttctttaaatgtaaggcatctacagactccaatgcttcatctaccattattaaatct
ttcttagatagactcccaaaaaatcctgtatatggataccttcctatattgactatatct
tgtacagtcattaaatcacctaataatctatttgtaagtactaaagccattttttttgat
aatgcttttcttgatatacagtttatgtttacaccattcaaatatatttcaccttttatt
ggtgatataagtttagataaggaccttaatagggtagtttttc