| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00058_1A_022457.fasta |
| contig | u00000crpx_c_022457 |
| start | 3512313 |
| length | 16898 |
| strand | + |
| type | core |
| seq | aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgagatgctattacatttatctatttc ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatataccagcttgctctaaatacat cttgtaactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt cattttgcctctgctttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat gagtaacccccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgt acatataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttacca tattatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaa aaaataaacatctataattccagtaatattaattaattttaaaccctttttattatcatt taataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttct tacaattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctga tgatgctacttctatatcaaaagaatttttaagtgcagtaagtgcaaatattgaatgtat aacagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagctttttt aatctcattatatgtcatacccaatttatttaactgttcatactttttcttatcaacttg gcaatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtagtaacaaagaaaattaaacc tataaatattgctaaaaatataaatgtagaatacattaatttcccagttcctatcattaa ttctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaa ttctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatc cactataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatattttt gtaatatgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattccc tacaataatattttctttgacgttcttatttcctggtaaacttgatgataataatgatat acattcattatcttcaaaacttataggcttaatccctatagtttctgtaatttctaagta cttagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaa ttcaccattaatccttgtatagtctacattctctttttttagattattttctataaacat cattctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagtgtcattatgcaatgtcat tgttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttcca aaaggaataaactgtacctatagcagtaaatgccactgcagaagttatagttatcaagaa aaatattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgt attttttctataaaatctcttgtttaattttagcttcttcataaaaaatacactaaattg agaaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagata tgttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaat acttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctggttttggagtttttgtaccttt aagtaacttcaacacctgattttctttaactataaaagaagtaaatattgatgttaatac agctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaattt taatggcgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaa gcctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagat taatttcattacttggcgctttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttata tctacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgc aattatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaa atctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatact tgctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgttt tatattcattagttatcgcctcccaataatgtgagtacatccattatctcttgataaaac tgctctctactactacccttatatatttcattatatatagacccatcttttatgaataag attctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaacttta ttttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaa ttacctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaata gcagtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatctttt atacctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgacctta tctaatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaa tcctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaac aataaaggattcttgccctttaattccatagttcctgtagttggcttgtcaatagtagaa atcatatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattct ccatcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatat actttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaa tttttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttatag ataataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtac tacacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaatt cacgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaa agcaatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctga agaagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaatt aagtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgc agacaaaacttgtaatgtcccaacctttaaagcttgtattggagtaattttatctatatt atctgtggaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccacc cactataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcgtaaaa tagaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaa accaatctttccttcttttccaccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatc ttttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaac ctcaaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatg acctgtagatgaaactggaataaattctgtaagcccctctactatagctattatgactga tttcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaatt tctttttttatgttatttctcttatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaa aatttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaac tctcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaa agtacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacacctttattaaactattta catctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcctacttctgattttatactta ctttatgacctaaatcatcacataccttttttactagataaagacccatacctgtagatt ctccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatgggtcaaataccctttttaaatctt tagaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaattacatatttattattttctt cagattttatagttaggtagttactataatctttagaatatttcactccatttgtaatta attgacctattataaatttcatccattttacatctgtataaacataagtaaatttgtcta cttgaatcttaggaatcattccactttttataaataaccttttttcttcatttacaatac tagatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaagtctttctgaaaattatctg cccttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttatttaatctatctatttcttttctta tattttcagttacttcttctccctcataatcttgaagctgaaggcttataactgatattg gtgttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaatgttcactatgtatctttt tatgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgttttaaaataactgatatat ttctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcctccaaagaatgtactcctt tttcaaacagattatatacttctctatttttataatacttatatattaaaaaacataaca atataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctccaaaactaataaacttcataa gattacagtaaataattgtcataactatgcctatataatatataaaaatataacctttat aatcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattcttatttaatttatatccta accctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcctcaaatcttttccttatcc tgctaacatttacatttaaagtattttcctctacaaactcaatatcatcccatatctttt ctaaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttgataagacattcaatcagta taccttcttttttagttataattagattctcaccatttaattctagttctaacctttctg gataaaactttaatccatctagctccactattctttcgtctattttaggtgaatattcac catatacccttcttatatgactctttatttttgccattactacatcatagtaaaaaggtt ttgttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatttggtctacattaccatctc tagctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgcctaatacatctacaccagtaga aaccatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaagtgtggcttaaaactttcaa atgtaatcattatatcatcaaagttctcttcaacaatcacttcaaatccatatttctcaa tataatctttaagtaatgtacttatcgatatatcatcttccacaatatatactttataac tcatataattcctcctaatatacctatttactcatcatataacagtccaattttaatata ttataatctttttacaatatataaatttaatcatattactaacttcacaattactgactt cataagtataaccatattattagacatcttaataaaactctataaaaaagtatcttttta tgattaattaatcattattatcaactaatcattctaaaataaattgaaattactaattca aaatagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaacttttattatatttcttacttagta ttattttatcatagtttctacttagcattatagattaattcttttatgttcacttttttc tcttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttcaagcgaagatatgtcttta tctgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattctttagtttcttcaagactt aaatcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaaattattatttacatattct aaagtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttctggatgtttctctgcaaag tctgtgctaacagcagttactattataccatctactaaaccttcaccatttgctacaagt ttactacctgacttcatagctttaagagctgctggaccagcaatcaatgcagcatctacg ctgccatcagaaagagctgctgatgcctctggaatacccatattaacaaattccacatca tccatacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatacctgatgtaatatagtccct tttgggcctgccaccttcttacctactaaatctgctgctgattttattgaattattatta gtcaaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtttaatatctttaactctact ccattagatgcagctattaaagctgatgtaccacctagtgcatgtaagaagtctatttct ccagcagctaaagcttgtgtttgctctggacctgtagtaatttcgtggaagttaactttt atattatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctgtttctgaattatagaagga acatttaatggtgattttacataagttaaatttatttctgaaagtttttctccattattt tttttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaatatcgttatacctatcaat agcttttttaatttcatttactttactccttaaaatattattaatttctttaaatgcctt tatttgatttcattgtcattaaaatatctttttttaatttaatatagtaatctgaagtta aatctctattataaccatcttctatattaaattcttttacttttctttcgtctgtgaaaa caactattttcttgcctatctttaacgcttcatcaatatcatgagttacaaatatcacgc ctttattagttgacttatgtattcttataacttcattttgcatatcaatccttgtaaaat aatctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatctggattgaaagaaagagctc tagctatgcttactctctgcgccatacctcctgacaattcatttggataagagtttttaa atttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatcaatattacttttcctattat atttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagcttctaaaattatcatttataa ttttactcctaattcttttattgtgtttaaattttctaagcaccttgtttaaaatagtat tttttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgtttaaccaaggcattaatctac tctcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactctttattatcattaataaacctaa tttcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctctaagcaaggtagtctttccac aaccactttcacctaaaattactgttatatggtttctatctatgtttaaagagatatcac taagaactacatgttctttattgtcaactttataacttttatataaatttctaattatat atccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccatctttcccttacttaccttc ttcacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaaaagtccaattacgattatc cctacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatcagatatcaagtatccaaga ccagatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctctaaagctatatccaagagct aactttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtattattattttaaatattatc tgaagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcagttttgagtcacaattttta atccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaagatgctaaaactataattataatt tttgattcctctcctataccaaaccataatataagcattggtattaaagcaaggggaggt gtattccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcgtatactccactataaattcca aagaatatccctaaaggcacacctatagcagtacttattgcaaaacctatcaaaactctt ttcatacttgcatatacattaataaatattgaaccatcacttatcatatttaaaaatgta ctatataccttttcaggtgatggtaatatataatcactccaaataccaagataatttgta attttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacactctttactagccttaaaaac ttattattaaatttattgaccatttacaaaccatctccattattacaaccatctttacaa taaaacatttctactatgtcatacttatcttcaaaaccatttcttattttttgtatttca cttaatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttcaaaagtatctttgaaatat cctaatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattttacaccttcttgttcagca aactctttccatgtataaaacatagcattacccttatccttaaacttttcacttgcaaag tctcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatcatctttactttttatatat ttatcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttctatcataggtacttcaaaa ttatttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttctggacatctacaatccaac attgtattttcagtcttttttgtatactctttgtactgcttttttacatattctaactgt ggttcacattctgttattatgtaccccttttttatcaaatttgctttaataaggtgaaac ttttctccatacattctttctgccactggatttattagaagatatttattcataacgcct cctattatttaatattgaatattattatcaattaatagtttaaatgagcacttaaatttt gtcaatatattaattttttcttaataaaacaatttttatctacattttttaatattttaa atgaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaataatgcatacatcttactaat aatctatttatataataatctataaatattatataataatacttatataattagtattat tatttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaagtttttaaaatattatgaa acatcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtctcaacagacttcacttttt ataactcttataaattattcaaaatatttatacttccctttctacttcaaaacgtaaaac cgtcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcacttatataaatttcacgatgtgt gtaagattttcttataagtttattttttttgcaaaattcgttcataatgtcaaagctttc tggttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaacacatagcccttcattaataga cccaaatctaactttttcaagaagattatgaggttttttcttctttactatatcagtagc tttatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgtatcattatagtgtaaattaa atcttctttaataagtacatctaagcctttacttttttctcccttatcccatataccttc taaaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtacaattccttttttaggcatggt ttttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgcttcagtaaattctttagaatt tgggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttctggtatttcaactattacagg attctttttaggtaaatataactctttatctctttttctccattcatatttcataaaaat acctccatatatattttatacattgatattatcacgctaaaagtgacaacagtgtgtcat aattataaattatattataaaatcttcatcctctaattcctcatacactcctttttggta tccattacccttagttgaaaaaaaatcatgtgttttggtttcagtgctaagaccatttaa tacaattggatttatagcatctacagtatatagcttctcaaaccctagattttctaaagc tctattcgcattgtattttaaaaagttcacaacctctttttcaagcccactttctctgta tataacatttgtatactctatctcattctccataaggctataaagtatagaatacatctt ctcttctaacatctccttatccattttatcaaatgaatcgtatatttcttgtgctagcaa tcctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaataagcgatattatttctccact agctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataaaagaatcctgaataaaacaa gaaactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtataatccctcttgatttgtagt attttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgtaatgttggttctgtttctat ccattcaaataattcatctatttctaaattagaaagtagagtcataaatatagaagaata actttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagacaagacagcttttctttgtag gttttctgttaaactcatcatagatggtattccattattcccctgttttgtatccagtaa tgttaaaccacccaatacttttttatataattccttttctttattacttagttcattcca tacctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagccaaaattgttttacattttg ttcccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattccagttaactgcattatgtat tttatgtaaattaaatgtcatatatttctctccctatactgaacacactagacactcatg agtatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaacttttcaaaccttttttataggc atatatataatgtctagctatatctctagttgtcttttcatctgtaacaaacagtgttgt tgatataccttggtcaacatggttttgaactgttgccactaaatctatgacctttctcat atccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatcatttgttaaaaatggcattgg atatattgtagtagagtctccatatgttcttacttctactggctcagtaattggcattat acttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagttggtgctactgccattaaata tgcattatatatccctttttcttttacttcatccaataattttgtccagtcttcttttgt tggtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttctgacttaggtagataagattg ttcatagtattttgataaaaccttgctatttcttcccttaacatattctgatttatcaaa tccttcaaaagtttgatttctttctatggctattttcatagaagctttaattgaatagta tctaaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagcatcatctgaagtatataaaat attttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctcctaatcctatagaatgagactt gctgttactattgcttaccgttggcactggttttatatctgtgctatctgctacaaatga cagtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagttttattatccattacattagc tatgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtccccattcattttttcctccata cccctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctcacaacataagttagacatttt aataattccaacatcttttaatgtatgttctctattagctgtatctatgtacactacata tggatatccactttcttgttgcatctgtgctatttttgtcaacatctgcctaggatttat ttctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatcataccactcatccatttctat ctcatcaagagaaactccatatttcttatacacagtatgaggataaaatgcatatgctac ttcatttttttctgccaactccataaatttatctggtattatagctcctaatgataatgt agcaagccttattttttcatctgcatttatctttttagtatccatcaacaattcaaaatc aggatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgtctagctcccatttgattaaa gtaactaaatgattgttctaacattttagctactccaacaacacctccagctgcaccttc tatatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagataaatttagtgcaactcctcc accaatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatacgatataccttctgtactatc ttctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagccctttttcttccagcatttaa aaaagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactattttatctgccaagtttaaagc taaatctttattgccatttcctagtgtcaaagctacaattaacactttatcattatatgt ttctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataattttgataaaacttatttac actcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatcatatcatatatatttttaat aacatctatgctatactgatttattacttcttttgaataataaccttcatctattaaata cttcaatctttcttctaggttattaaattttctcaactttggctgtataaattcttctat gtaactacttaaggcttccttatccttttccaattggtacttgccttgttcatttttaat tatcacttgattgttaagctctatccaattcattatttaccgtccttttaacataatctt gtgccataatttcacttaatttgcttattatttcttttggtacttatcagttgaaatccc aaaattaatctataattatagaaatgcaataagtatttttcaaaaacaaaagcactacat atagtcagtgctttatctattatatactacatatagtatatacacaaatttttttatatc taaacttttattactttataattgacattatttttatttaaagaaatttttatcaactca aatataaaacaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaatttaaattatctctaaatag cttaaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttcaagatgatattttatatatta tttagaagttttttatttattgttatataattaaatatatgactattttgctactacata tataaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaactatttctaaacaagaattagaa aaaacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaataatgctggagaaaaggcagat ttaaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggatactgcttaagtaatattgac ttttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaagcagatttagaaaactctatt tttaataattcttatctttcggattgttcattaaaaaattctatattaaaaaatgcagac ttaagtggtgcaagttttagattttgtgacttatctaactcagatattagaggagctaat ttagaaaattccaatttagaatatgctactttaaatggagtaatatcagatgaaagtact cgtttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcatttataggctataaaaaatgtttt aattttagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaaaaagagtgtctgctacatca aatgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaattactagtgtagatggtaaagaa tcttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaattttatatatagagtaggagaaacg attgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaatcgactacagggattcacttt tttttaactagagaggaagctattggttatctataaaatgctaaagttttataaatatat aaatacataaacaaaataacaaaagagtatagattgtaatttcaaaaaaattataatcta tactcttttttctatagcacataagtacattttatttcataaattataataaattattta tatctgcactattgattatttgagaaactttatctatatgttctatcttattatccaaac tgtcataatacttcttactctcatctctatttctaaaagaataaacttttttatccaatt ttaaagcttcttttataatatctatattcctcttatttgtctctcctacactaaatcctg tatctattataatcttggaatcatttaaatttctaatagccaaatcgaaactctcatcac ttataggctcaaatggattttctgtaaacatctttatccccatagttctaccaatttcat aatcaatatcattttcatgtattattccagaatacagacctataccttttttagtaaaag ctctataaattggtgttgctttacccccaccaccaattataaaaacttcatttttagatt tattactaatttctactgaacctaaaagactattaaagtttttatcatccaattcataaa gcgaatttataatatcctcatctactacatcttcaggctgaccataagctatgactttat tattttttataagagcaactttatcacaactttttaatgctatgtctatttcatgcaatg aaagtattactgatattgacttttctttacttaattttttcagtatgtttatgagttcca atctatgttttatatccaagtgagttgtaggctcatctaatataattatttctggttctt gaacaagagcccttgcaaccaacaccttttgtttttctccatcacttagttcatcaaaat atcttttctttaaatgtaaggcatctacagactccaatgcttcatctaccattattaaat ctttcttagatagactcccaaaaaatcctgtatatggataccttcctatattgactatat cttgtacagtcattaaatcacctaataatctatttgtaagtactaaagccattttttttg ataatgcttttcttgatatacaatttatgtttacaccattcaaatatatttcacctttta ttggtgatataagtttagataaggaccttaatagggtagtttttccagctccattacttc ccaaaagacatagtatttctccattttttacttctacatttatattacttataacaactt tgttattgtatcctacacttaaattattagttttcaacatgtctaagccctatccttcct tttcaccaataacattactacaattggagctcctaataaagatgttatcgtacttattgg taattctactggtgataaaattactcttgatattaaatcacaaagagctgtaactatact gcctaaaaatattactactggtatcaaaactctattatctgatgttttaaatatcatttt tgaaatttgtggcactgcaagtccaataaaccctataggtcctgcaaatgctgatactat tgctgctaatatactagatataaatactatcaaaactctaaaaaatcttatatttatgcc aatactttttgcatactcttctcctagtaaaaaagcatttaaaggttttattatgaatac agtcatcaaaagacctaatataccaactattataagtatttctaccttttcccatgtaaa tccagaaaaacttcccatagaccacatagtaaattcttttaatttatcactatttgcaaa tgattgtaacacatttgttataccactacatacatatcc |